Abstract

Tapered optical fibers (TFs) were recently employed for depth-resolved monitoring of functional fluorescence in subcortical brain structures, enabling light collection from groups of a few cells through small optical windows located on the taper edge [Pisano et al., Nat. Methods 16, 1185 (2019) [CrossRef]  ]. Here we present a numerical model to estimate light collection properties of microstructured TFs implanted in scattering brain tissue. Ray tracing coupled with the Henyey–Greenstein scattering model enables the estimation of both light collection and fluorescence excitation fields in three dimensions, whose combination is employed to retrieve the volume of tissue probed by the device.

© 2020 Optical Society of America under the terms of the OSA Open Access Publishing Agreement

Full Article  |  PDF Article

References

  • View by:
  • |
  • |
  • |

  1. F. Pisano, M. Pisanello, S. Y. Lee, J. Lee, E. Maglie, A. Balena, L. Sileo, B. Spagnolo, M. Bianco, M. Hyun, M. De Vittorio, B. Sabatini, and F. Pisanello, Nat. Methods 16, 1185 (2019).
    [Crossref]
  2. Y. Yang, N. Liu, Y. He, Y. Liu, L. Ge, L. Zou, S. Song, W. Xiong, and X. Liu, Nat. Commun. 9, 1504 (2018).
    [Crossref]
  3. K. D. Piatkevich, S. Bensussen, H. Tseng, S. N. Shroff, V. G. Lopez-Huerta, D. Park, E. E. Jung, O. A. Shemesh, C. Straub, H. J. Gritton, M. F. Romano, E. Costa, B. L. Sabatini, Z. Fu, E. S. Boyden, and X. Han, Nature 574, 413 (2019).
    [Crossref]
  4. T. Patriarchi, J. R. Cho, K. Merten, M. W. Howe, A. Marley, W. H. Xiong, R. W. Folk, G. J. Broussard, R. Liang, M. J. Jang, H. Zhong, D. Dombeck, M. von Zastrow, A. Nimmerjahn, V. Gradinaru, J. T. Williams, and L. Tian, Science 360, eaat4422 (2018).
    [Crossref]
  5. T. Wang, C. Wu, D. G. Ouzounov, W. Gu, F. Xia, M. Kim, X. Yang, M. R. Warden, and C. Xu, eLife 9, e53205 (2020).
    [Crossref]
  6. H. Adelsberger, O. Garaschuk, and A. Konnerth, Nat. Neurosci. 8, 988 (2005).
    [Crossref]
  7. Y. Sych, M. Chernysheva, L. T. Sumanovski, and F. Helmchen, Nat. Methods 16, 553 (2019).
    [Crossref]
  8. S. J. Lee, Y. Chen, B. Lodder, and B. L. Sabatini, Front. Neurosci. 13, 766 (2019).
    [Crossref]
  9. F. Schmid, L. Wachsmuth, M. Schwalm, P.-H. Prouvot, E. R. Jubal, C. Fois, G. Pramanik, C. Zimmer, C. Faber, and A. Stroh, J. Cereb. Blood Flow Metab. 36, 1885 (2016).
    [Crossref]
  10. A. A. Patel, N. McAlinden, K. Mathieson, and S. Sakata, Front. Neurosci. 14, 148 (2020).
    [Crossref]
  11. M. Pisanello, F. Pisano, M. Hyun, E. Maglie, A. Balena, M. De Vittorio, B. L. Sabatini, and F. Pisanello, Front. Neurosci. 13, 82 (2019).
    [Crossref]
  12. L. Lu, P. Gutruf, L. Xia, D. L. Bhatti, X. Wang, A. Vazquez-Guardado, X. Ning, X. Shen, T. Sang, R. Ma, G. Pakeltis, G. Sobczak, H. Zhang, D.-O. Seo, M. Xue, L. Yin, D. Chanda, X. Sheng, M. R. Bruchas, and J. A. Rogers, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 115, E1373 (2018).
    [Crossref]
  13. F. Pisanello, G. Mandelbaum, M. Pisanello, I. A. Oldenburg, L. Sileo, J. E. Markowitz, R. E. Peterson, A. Della Patria, T. M. Haynes, M. S. Emara, B. Spagnolo, S. R. Datta, M. De Vittorio, and B. L. Sabatini, Nat. Neurosci. 20, 1180 (2017).
    [Crossref]
  14. F. Pisano, M. Pisanello, L. Sileo, A. Qualtieri, B. L. Sabatini, M. De Vittorio, and F. Pisanello, Microelectron. Eng. 195, 41 (2018).
    [Crossref]
  15. A. Rizzo, E. D. Lemma, F. Pisano, M. Pisanello, L. Sileo, M. De Vittorio, and F. Pisanello, Microelectron. Eng. 192, 88 (2018).
    [Crossref]
  16. G. Yona, N. Meitav, I. Kahn, and S. Shoham, eNeuro 3, 420 (2016).
    [Crossref]
  17. J. M. Stujenske, T. Spellman, and J. A. Gordon, Cell Rep. 12, 525 (2015).
    [Crossref]
  18. F. Pisanello, L. Sileo, I. A. Oldenburg, M. Pisanello, L. Martiradonna, J. A. Assad, B. L. Sabatini, and M. De Vittorio, Neuron 82, 1245 (2014).
    [Crossref]
  19. M. Pisanello, F. Pisano, L. Sileo, E. Maglie, E. Bellistri, B. Spagnolo, G. Mandelbaum, B. L. Sabatini, M. De Vittorio, and F. Pisanello, Sci. Rep. 8, 4467 (2018).
    [Crossref]
  20. J. P. Zinter and M. J. Levene, Opt. Express 19, 15348 (2011).
    [Crossref]
  21. E. Maglie, M. Pisanello, F. Pisano, A. Balena, B. Spagnolo, B. L. Sabatini, M. De Vittorio, and F. Pisanello, in 21st International Conference on Transparent Optical Networks (ICTON) (2019), pp. 1–7.
  22. P. R. Bargo, S. A. Prahl, and S. L. Jacques, Appl. Opt. 42, 3187 (2003).
    [Crossref]
  23. F. Pisanello, Microelectron. Eng. 215, 110979 (2019).
    [Crossref]

2020 (2)

T. Wang, C. Wu, D. G. Ouzounov, W. Gu, F. Xia, M. Kim, X. Yang, M. R. Warden, and C. Xu, eLife 9, e53205 (2020).
[Crossref]

A. A. Patel, N. McAlinden, K. Mathieson, and S. Sakata, Front. Neurosci. 14, 148 (2020).
[Crossref]

2019 (6)

M. Pisanello, F. Pisano, M. Hyun, E. Maglie, A. Balena, M. De Vittorio, B. L. Sabatini, and F. Pisanello, Front. Neurosci. 13, 82 (2019).
[Crossref]

Y. Sych, M. Chernysheva, L. T. Sumanovski, and F. Helmchen, Nat. Methods 16, 553 (2019).
[Crossref]

S. J. Lee, Y. Chen, B. Lodder, and B. L. Sabatini, Front. Neurosci. 13, 766 (2019).
[Crossref]

F. Pisano, M. Pisanello, S. Y. Lee, J. Lee, E. Maglie, A. Balena, L. Sileo, B. Spagnolo, M. Bianco, M. Hyun, M. De Vittorio, B. Sabatini, and F. Pisanello, Nat. Methods 16, 1185 (2019).
[Crossref]

K. D. Piatkevich, S. Bensussen, H. Tseng, S. N. Shroff, V. G. Lopez-Huerta, D. Park, E. E. Jung, O. A. Shemesh, C. Straub, H. J. Gritton, M. F. Romano, E. Costa, B. L. Sabatini, Z. Fu, E. S. Boyden, and X. Han, Nature 574, 413 (2019).
[Crossref]

F. Pisanello, Microelectron. Eng. 215, 110979 (2019).
[Crossref]

2018 (6)

M. Pisanello, F. Pisano, L. Sileo, E. Maglie, E. Bellistri, B. Spagnolo, G. Mandelbaum, B. L. Sabatini, M. De Vittorio, and F. Pisanello, Sci. Rep. 8, 4467 (2018).
[Crossref]

T. Patriarchi, J. R. Cho, K. Merten, M. W. Howe, A. Marley, W. H. Xiong, R. W. Folk, G. J. Broussard, R. Liang, M. J. Jang, H. Zhong, D. Dombeck, M. von Zastrow, A. Nimmerjahn, V. Gradinaru, J. T. Williams, and L. Tian, Science 360, eaat4422 (2018).
[Crossref]

Y. Yang, N. Liu, Y. He, Y. Liu, L. Ge, L. Zou, S. Song, W. Xiong, and X. Liu, Nat. Commun. 9, 1504 (2018).
[Crossref]

L. Lu, P. Gutruf, L. Xia, D. L. Bhatti, X. Wang, A. Vazquez-Guardado, X. Ning, X. Shen, T. Sang, R. Ma, G. Pakeltis, G. Sobczak, H. Zhang, D.-O. Seo, M. Xue, L. Yin, D. Chanda, X. Sheng, M. R. Bruchas, and J. A. Rogers, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 115, E1373 (2018).
[Crossref]

F. Pisano, M. Pisanello, L. Sileo, A. Qualtieri, B. L. Sabatini, M. De Vittorio, and F. Pisanello, Microelectron. Eng. 195, 41 (2018).
[Crossref]

A. Rizzo, E. D. Lemma, F. Pisano, M. Pisanello, L. Sileo, M. De Vittorio, and F. Pisanello, Microelectron. Eng. 192, 88 (2018).
[Crossref]

2017 (1)

F. Pisanello, G. Mandelbaum, M. Pisanello, I. A. Oldenburg, L. Sileo, J. E. Markowitz, R. E. Peterson, A. Della Patria, T. M. Haynes, M. S. Emara, B. Spagnolo, S. R. Datta, M. De Vittorio, and B. L. Sabatini, Nat. Neurosci. 20, 1180 (2017).
[Crossref]

2016 (2)

G. Yona, N. Meitav, I. Kahn, and S. Shoham, eNeuro 3, 420 (2016).
[Crossref]

F. Schmid, L. Wachsmuth, M. Schwalm, P.-H. Prouvot, E. R. Jubal, C. Fois, G. Pramanik, C. Zimmer, C. Faber, and A. Stroh, J. Cereb. Blood Flow Metab. 36, 1885 (2016).
[Crossref]

2015 (1)

J. M. Stujenske, T. Spellman, and J. A. Gordon, Cell Rep. 12, 525 (2015).
[Crossref]

2014 (1)

F. Pisanello, L. Sileo, I. A. Oldenburg, M. Pisanello, L. Martiradonna, J. A. Assad, B. L. Sabatini, and M. De Vittorio, Neuron 82, 1245 (2014).
[Crossref]

2011 (1)

2005 (1)

H. Adelsberger, O. Garaschuk, and A. Konnerth, Nat. Neurosci. 8, 988 (2005).
[Crossref]

2003 (1)

Adelsberger, H.

H. Adelsberger, O. Garaschuk, and A. Konnerth, Nat. Neurosci. 8, 988 (2005).
[Crossref]

Assad, J. A.

F. Pisanello, L. Sileo, I. A. Oldenburg, M. Pisanello, L. Martiradonna, J. A. Assad, B. L. Sabatini, and M. De Vittorio, Neuron 82, 1245 (2014).
[Crossref]

Balena, A.

F. Pisano, M. Pisanello, S. Y. Lee, J. Lee, E. Maglie, A. Balena, L. Sileo, B. Spagnolo, M. Bianco, M. Hyun, M. De Vittorio, B. Sabatini, and F. Pisanello, Nat. Methods 16, 1185 (2019).
[Crossref]

M. Pisanello, F. Pisano, M. Hyun, E. Maglie, A. Balena, M. De Vittorio, B. L. Sabatini, and F. Pisanello, Front. Neurosci. 13, 82 (2019).
[Crossref]

E. Maglie, M. Pisanello, F. Pisano, A. Balena, B. Spagnolo, B. L. Sabatini, M. De Vittorio, and F. Pisanello, in 21st International Conference on Transparent Optical Networks (ICTON) (2019), pp. 1–7.

Bargo, P. R.

Bellistri, E.

M. Pisanello, F. Pisano, L. Sileo, E. Maglie, E. Bellistri, B. Spagnolo, G. Mandelbaum, B. L. Sabatini, M. De Vittorio, and F. Pisanello, Sci. Rep. 8, 4467 (2018).
[Crossref]

Bensussen, S.

K. D. Piatkevich, S. Bensussen, H. Tseng, S. N. Shroff, V. G. Lopez-Huerta, D. Park, E. E. Jung, O. A. Shemesh, C. Straub, H. J. Gritton, M. F. Romano, E. Costa, B. L. Sabatini, Z. Fu, E. S. Boyden, and X. Han, Nature 574, 413 (2019).
[Crossref]

Bhatti, D. L.

L. Lu, P. Gutruf, L. Xia, D. L. Bhatti, X. Wang, A. Vazquez-Guardado, X. Ning, X. Shen, T. Sang, R. Ma, G. Pakeltis, G. Sobczak, H. Zhang, D.-O. Seo, M. Xue, L. Yin, D. Chanda, X. Sheng, M. R. Bruchas, and J. A. Rogers, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 115, E1373 (2018).
[Crossref]

Bianco, M.

F. Pisano, M. Pisanello, S. Y. Lee, J. Lee, E. Maglie, A. Balena, L. Sileo, B. Spagnolo, M. Bianco, M. Hyun, M. De Vittorio, B. Sabatini, and F. Pisanello, Nat. Methods 16, 1185 (2019).
[Crossref]

Boyden, E. S.

K. D. Piatkevich, S. Bensussen, H. Tseng, S. N. Shroff, V. G. Lopez-Huerta, D. Park, E. E. Jung, O. A. Shemesh, C. Straub, H. J. Gritton, M. F. Romano, E. Costa, B. L. Sabatini, Z. Fu, E. S. Boyden, and X. Han, Nature 574, 413 (2019).
[Crossref]

Broussard, G. J.

T. Patriarchi, J. R. Cho, K. Merten, M. W. Howe, A. Marley, W. H. Xiong, R. W. Folk, G. J. Broussard, R. Liang, M. J. Jang, H. Zhong, D. Dombeck, M. von Zastrow, A. Nimmerjahn, V. Gradinaru, J. T. Williams, and L. Tian, Science 360, eaat4422 (2018).
[Crossref]

Bruchas, M. R.

L. Lu, P. Gutruf, L. Xia, D. L. Bhatti, X. Wang, A. Vazquez-Guardado, X. Ning, X. Shen, T. Sang, R. Ma, G. Pakeltis, G. Sobczak, H. Zhang, D.-O. Seo, M. Xue, L. Yin, D. Chanda, X. Sheng, M. R. Bruchas, and J. A. Rogers, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 115, E1373 (2018).
[Crossref]

Chanda, D.

L. Lu, P. Gutruf, L. Xia, D. L. Bhatti, X. Wang, A. Vazquez-Guardado, X. Ning, X. Shen, T. Sang, R. Ma, G. Pakeltis, G. Sobczak, H. Zhang, D.-O. Seo, M. Xue, L. Yin, D. Chanda, X. Sheng, M. R. Bruchas, and J. A. Rogers, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 115, E1373 (2018).
[Crossref]

Chen, Y.

S. J. Lee, Y. Chen, B. Lodder, and B. L. Sabatini, Front. Neurosci. 13, 766 (2019).
[Crossref]

Chernysheva, M.

Y. Sych, M. Chernysheva, L. T. Sumanovski, and F. Helmchen, Nat. Methods 16, 553 (2019).
[Crossref]

Cho, J. R.

T. Patriarchi, J. R. Cho, K. Merten, M. W. Howe, A. Marley, W. H. Xiong, R. W. Folk, G. J. Broussard, R. Liang, M. J. Jang, H. Zhong, D. Dombeck, M. von Zastrow, A. Nimmerjahn, V. Gradinaru, J. T. Williams, and L. Tian, Science 360, eaat4422 (2018).
[Crossref]

Costa, E.

K. D. Piatkevich, S. Bensussen, H. Tseng, S. N. Shroff, V. G. Lopez-Huerta, D. Park, E. E. Jung, O. A. Shemesh, C. Straub, H. J. Gritton, M. F. Romano, E. Costa, B. L. Sabatini, Z. Fu, E. S. Boyden, and X. Han, Nature 574, 413 (2019).
[Crossref]

Datta, S. R.

F. Pisanello, G. Mandelbaum, M. Pisanello, I. A. Oldenburg, L. Sileo, J. E. Markowitz, R. E. Peterson, A. Della Patria, T. M. Haynes, M. S. Emara, B. Spagnolo, S. R. Datta, M. De Vittorio, and B. L. Sabatini, Nat. Neurosci. 20, 1180 (2017).
[Crossref]

De Vittorio, M.

M. Pisanello, F. Pisano, M. Hyun, E. Maglie, A. Balena, M. De Vittorio, B. L. Sabatini, and F. Pisanello, Front. Neurosci. 13, 82 (2019).
[Crossref]

F. Pisano, M. Pisanello, S. Y. Lee, J. Lee, E. Maglie, A. Balena, L. Sileo, B. Spagnolo, M. Bianco, M. Hyun, M. De Vittorio, B. Sabatini, and F. Pisanello, Nat. Methods 16, 1185 (2019).
[Crossref]

M. Pisanello, F. Pisano, L. Sileo, E. Maglie, E. Bellistri, B. Spagnolo, G. Mandelbaum, B. L. Sabatini, M. De Vittorio, and F. Pisanello, Sci. Rep. 8, 4467 (2018).
[Crossref]

F. Pisano, M. Pisanello, L. Sileo, A. Qualtieri, B. L. Sabatini, M. De Vittorio, and F. Pisanello, Microelectron. Eng. 195, 41 (2018).
[Crossref]

A. Rizzo, E. D. Lemma, F. Pisano, M. Pisanello, L. Sileo, M. De Vittorio, and F. Pisanello, Microelectron. Eng. 192, 88 (2018).
[Crossref]

F. Pisanello, G. Mandelbaum, M. Pisanello, I. A. Oldenburg, L. Sileo, J. E. Markowitz, R. E. Peterson, A. Della Patria, T. M. Haynes, M. S. Emara, B. Spagnolo, S. R. Datta, M. De Vittorio, and B. L. Sabatini, Nat. Neurosci. 20, 1180 (2017).
[Crossref]

F. Pisanello, L. Sileo, I. A. Oldenburg, M. Pisanello, L. Martiradonna, J. A. Assad, B. L. Sabatini, and M. De Vittorio, Neuron 82, 1245 (2014).
[Crossref]

E. Maglie, M. Pisanello, F. Pisano, A. Balena, B. Spagnolo, B. L. Sabatini, M. De Vittorio, and F. Pisanello, in 21st International Conference on Transparent Optical Networks (ICTON) (2019), pp. 1–7.

Della Patria, A.

F. Pisanello, G. Mandelbaum, M. Pisanello, I. A. Oldenburg, L. Sileo, J. E. Markowitz, R. E. Peterson, A. Della Patria, T. M. Haynes, M. S. Emara, B. Spagnolo, S. R. Datta, M. De Vittorio, and B. L. Sabatini, Nat. Neurosci. 20, 1180 (2017).
[Crossref]

Dombeck, D.

T. Patriarchi, J. R. Cho, K. Merten, M. W. Howe, A. Marley, W. H. Xiong, R. W. Folk, G. J. Broussard, R. Liang, M. J. Jang, H. Zhong, D. Dombeck, M. von Zastrow, A. Nimmerjahn, V. Gradinaru, J. T. Williams, and L. Tian, Science 360, eaat4422 (2018).
[Crossref]

Emara, M. S.

F. Pisanello, G. Mandelbaum, M. Pisanello, I. A. Oldenburg, L. Sileo, J. E. Markowitz, R. E. Peterson, A. Della Patria, T. M. Haynes, M. S. Emara, B. Spagnolo, S. R. Datta, M. De Vittorio, and B. L. Sabatini, Nat. Neurosci. 20, 1180 (2017).
[Crossref]

Faber, C.

F. Schmid, L. Wachsmuth, M. Schwalm, P.-H. Prouvot, E. R. Jubal, C. Fois, G. Pramanik, C. Zimmer, C. Faber, and A. Stroh, J. Cereb. Blood Flow Metab. 36, 1885 (2016).
[Crossref]

Fois, C.

F. Schmid, L. Wachsmuth, M. Schwalm, P.-H. Prouvot, E. R. Jubal, C. Fois, G. Pramanik, C. Zimmer, C. Faber, and A. Stroh, J. Cereb. Blood Flow Metab. 36, 1885 (2016).
[Crossref]

Folk, R. W.

T. Patriarchi, J. R. Cho, K. Merten, M. W. Howe, A. Marley, W. H. Xiong, R. W. Folk, G. J. Broussard, R. Liang, M. J. Jang, H. Zhong, D. Dombeck, M. von Zastrow, A. Nimmerjahn, V. Gradinaru, J. T. Williams, and L. Tian, Science 360, eaat4422 (2018).
[Crossref]

Fu, Z.

K. D. Piatkevich, S. Bensussen, H. Tseng, S. N. Shroff, V. G. Lopez-Huerta, D. Park, E. E. Jung, O. A. Shemesh, C. Straub, H. J. Gritton, M. F. Romano, E. Costa, B. L. Sabatini, Z. Fu, E. S. Boyden, and X. Han, Nature 574, 413 (2019).
[Crossref]

Garaschuk, O.

H. Adelsberger, O. Garaschuk, and A. Konnerth, Nat. Neurosci. 8, 988 (2005).
[Crossref]

Ge, L.

Y. Yang, N. Liu, Y. He, Y. Liu, L. Ge, L. Zou, S. Song, W. Xiong, and X. Liu, Nat. Commun. 9, 1504 (2018).
[Crossref]

Gordon, J. A.

J. M. Stujenske, T. Spellman, and J. A. Gordon, Cell Rep. 12, 525 (2015).
[Crossref]

Gradinaru, V.

T. Patriarchi, J. R. Cho, K. Merten, M. W. Howe, A. Marley, W. H. Xiong, R. W. Folk, G. J. Broussard, R. Liang, M. J. Jang, H. Zhong, D. Dombeck, M. von Zastrow, A. Nimmerjahn, V. Gradinaru, J. T. Williams, and L. Tian, Science 360, eaat4422 (2018).
[Crossref]

Gritton, H. J.

K. D. Piatkevich, S. Bensussen, H. Tseng, S. N. Shroff, V. G. Lopez-Huerta, D. Park, E. E. Jung, O. A. Shemesh, C. Straub, H. J. Gritton, M. F. Romano, E. Costa, B. L. Sabatini, Z. Fu, E. S. Boyden, and X. Han, Nature 574, 413 (2019).
[Crossref]

Gu, W.

T. Wang, C. Wu, D. G. Ouzounov, W. Gu, F. Xia, M. Kim, X. Yang, M. R. Warden, and C. Xu, eLife 9, e53205 (2020).
[Crossref]

Gutruf, P.

L. Lu, P. Gutruf, L. Xia, D. L. Bhatti, X. Wang, A. Vazquez-Guardado, X. Ning, X. Shen, T. Sang, R. Ma, G. Pakeltis, G. Sobczak, H. Zhang, D.-O. Seo, M. Xue, L. Yin, D. Chanda, X. Sheng, M. R. Bruchas, and J. A. Rogers, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 115, E1373 (2018).
[Crossref]

Han, X.

K. D. Piatkevich, S. Bensussen, H. Tseng, S. N. Shroff, V. G. Lopez-Huerta, D. Park, E. E. Jung, O. A. Shemesh, C. Straub, H. J. Gritton, M. F. Romano, E. Costa, B. L. Sabatini, Z. Fu, E. S. Boyden, and X. Han, Nature 574, 413 (2019).
[Crossref]

Haynes, T. M.

F. Pisanello, G. Mandelbaum, M. Pisanello, I. A. Oldenburg, L. Sileo, J. E. Markowitz, R. E. Peterson, A. Della Patria, T. M. Haynes, M. S. Emara, B. Spagnolo, S. R. Datta, M. De Vittorio, and B. L. Sabatini, Nat. Neurosci. 20, 1180 (2017).
[Crossref]

He, Y.

Y. Yang, N. Liu, Y. He, Y. Liu, L. Ge, L. Zou, S. Song, W. Xiong, and X. Liu, Nat. Commun. 9, 1504 (2018).
[Crossref]

Helmchen, F.

Y. Sych, M. Chernysheva, L. T. Sumanovski, and F. Helmchen, Nat. Methods 16, 553 (2019).
[Crossref]

Howe, M. W.

T. Patriarchi, J. R. Cho, K. Merten, M. W. Howe, A. Marley, W. H. Xiong, R. W. Folk, G. J. Broussard, R. Liang, M. J. Jang, H. Zhong, D. Dombeck, M. von Zastrow, A. Nimmerjahn, V. Gradinaru, J. T. Williams, and L. Tian, Science 360, eaat4422 (2018).
[Crossref]

Hyun, M.

M. Pisanello, F. Pisano, M. Hyun, E. Maglie, A. Balena, M. De Vittorio, B. L. Sabatini, and F. Pisanello, Front. Neurosci. 13, 82 (2019).
[Crossref]

F. Pisano, M. Pisanello, S. Y. Lee, J. Lee, E. Maglie, A. Balena, L. Sileo, B. Spagnolo, M. Bianco, M. Hyun, M. De Vittorio, B. Sabatini, and F. Pisanello, Nat. Methods 16, 1185 (2019).
[Crossref]

Jacques, S. L.

Jang, M. J.

T. Patriarchi, J. R. Cho, K. Merten, M. W. Howe, A. Marley, W. H. Xiong, R. W. Folk, G. J. Broussard, R. Liang, M. J. Jang, H. Zhong, D. Dombeck, M. von Zastrow, A. Nimmerjahn, V. Gradinaru, J. T. Williams, and L. Tian, Science 360, eaat4422 (2018).
[Crossref]

Jubal, E. R.

F. Schmid, L. Wachsmuth, M. Schwalm, P.-H. Prouvot, E. R. Jubal, C. Fois, G. Pramanik, C. Zimmer, C. Faber, and A. Stroh, J. Cereb. Blood Flow Metab. 36, 1885 (2016).
[Crossref]

Jung, E. E.

K. D. Piatkevich, S. Bensussen, H. Tseng, S. N. Shroff, V. G. Lopez-Huerta, D. Park, E. E. Jung, O. A. Shemesh, C. Straub, H. J. Gritton, M. F. Romano, E. Costa, B. L. Sabatini, Z. Fu, E. S. Boyden, and X. Han, Nature 574, 413 (2019).
[Crossref]

Kahn, I.

G. Yona, N. Meitav, I. Kahn, and S. Shoham, eNeuro 3, 420 (2016).
[Crossref]

Kim, M.

T. Wang, C. Wu, D. G. Ouzounov, W. Gu, F. Xia, M. Kim, X. Yang, M. R. Warden, and C. Xu, eLife 9, e53205 (2020).
[Crossref]

Konnerth, A.

H. Adelsberger, O. Garaschuk, and A. Konnerth, Nat. Neurosci. 8, 988 (2005).
[Crossref]

Lee, J.

F. Pisano, M. Pisanello, S. Y. Lee, J. Lee, E. Maglie, A. Balena, L. Sileo, B. Spagnolo, M. Bianco, M. Hyun, M. De Vittorio, B. Sabatini, and F. Pisanello, Nat. Methods 16, 1185 (2019).
[Crossref]

Lee, S. J.

S. J. Lee, Y. Chen, B. Lodder, and B. L. Sabatini, Front. Neurosci. 13, 766 (2019).
[Crossref]

Lee, S. Y.

F. Pisano, M. Pisanello, S. Y. Lee, J. Lee, E. Maglie, A. Balena, L. Sileo, B. Spagnolo, M. Bianco, M. Hyun, M. De Vittorio, B. Sabatini, and F. Pisanello, Nat. Methods 16, 1185 (2019).
[Crossref]

Lemma, E. D.

A. Rizzo, E. D. Lemma, F. Pisano, M. Pisanello, L. Sileo, M. De Vittorio, and F. Pisanello, Microelectron. Eng. 192, 88 (2018).
[Crossref]

Levene, M. J.

Liang, R.

T. Patriarchi, J. R. Cho, K. Merten, M. W. Howe, A. Marley, W. H. Xiong, R. W. Folk, G. J. Broussard, R. Liang, M. J. Jang, H. Zhong, D. Dombeck, M. von Zastrow, A. Nimmerjahn, V. Gradinaru, J. T. Williams, and L. Tian, Science 360, eaat4422 (2018).
[Crossref]

Liu, N.

Y. Yang, N. Liu, Y. He, Y. Liu, L. Ge, L. Zou, S. Song, W. Xiong, and X. Liu, Nat. Commun. 9, 1504 (2018).
[Crossref]

Liu, X.

Y. Yang, N. Liu, Y. He, Y. Liu, L. Ge, L. Zou, S. Song, W. Xiong, and X. Liu, Nat. Commun. 9, 1504 (2018).
[Crossref]

Liu, Y.

Y. Yang, N. Liu, Y. He, Y. Liu, L. Ge, L. Zou, S. Song, W. Xiong, and X. Liu, Nat. Commun. 9, 1504 (2018).
[Crossref]

Lodder, B.

S. J. Lee, Y. Chen, B. Lodder, and B. L. Sabatini, Front. Neurosci. 13, 766 (2019).
[Crossref]

Lopez-Huerta, V. G.

K. D. Piatkevich, S. Bensussen, H. Tseng, S. N. Shroff, V. G. Lopez-Huerta, D. Park, E. E. Jung, O. A. Shemesh, C. Straub, H. J. Gritton, M. F. Romano, E. Costa, B. L. Sabatini, Z. Fu, E. S. Boyden, and X. Han, Nature 574, 413 (2019).
[Crossref]

Lu, L.

L. Lu, P. Gutruf, L. Xia, D. L. Bhatti, X. Wang, A. Vazquez-Guardado, X. Ning, X. Shen, T. Sang, R. Ma, G. Pakeltis, G. Sobczak, H. Zhang, D.-O. Seo, M. Xue, L. Yin, D. Chanda, X. Sheng, M. R. Bruchas, and J. A. Rogers, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 115, E1373 (2018).
[Crossref]

Ma, R.

L. Lu, P. Gutruf, L. Xia, D. L. Bhatti, X. Wang, A. Vazquez-Guardado, X. Ning, X. Shen, T. Sang, R. Ma, G. Pakeltis, G. Sobczak, H. Zhang, D.-O. Seo, M. Xue, L. Yin, D. Chanda, X. Sheng, M. R. Bruchas, and J. A. Rogers, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 115, E1373 (2018).
[Crossref]

Maglie, E.

M. Pisanello, F. Pisano, M. Hyun, E. Maglie, A. Balena, M. De Vittorio, B. L. Sabatini, and F. Pisanello, Front. Neurosci. 13, 82 (2019).
[Crossref]

F. Pisano, M. Pisanello, S. Y. Lee, J. Lee, E. Maglie, A. Balena, L. Sileo, B. Spagnolo, M. Bianco, M. Hyun, M. De Vittorio, B. Sabatini, and F. Pisanello, Nat. Methods 16, 1185 (2019).
[Crossref]

M. Pisanello, F. Pisano, L. Sileo, E. Maglie, E. Bellistri, B. Spagnolo, G. Mandelbaum, B. L. Sabatini, M. De Vittorio, and F. Pisanello, Sci. Rep. 8, 4467 (2018).
[Crossref]

E. Maglie, M. Pisanello, F. Pisano, A. Balena, B. Spagnolo, B. L. Sabatini, M. De Vittorio, and F. Pisanello, in 21st International Conference on Transparent Optical Networks (ICTON) (2019), pp. 1–7.

Mandelbaum, G.

M. Pisanello, F. Pisano, L. Sileo, E. Maglie, E. Bellistri, B. Spagnolo, G. Mandelbaum, B. L. Sabatini, M. De Vittorio, and F. Pisanello, Sci. Rep. 8, 4467 (2018).
[Crossref]

F. Pisanello, G. Mandelbaum, M. Pisanello, I. A. Oldenburg, L. Sileo, J. E. Markowitz, R. E. Peterson, A. Della Patria, T. M. Haynes, M. S. Emara, B. Spagnolo, S. R. Datta, M. De Vittorio, and B. L. Sabatini, Nat. Neurosci. 20, 1180 (2017).
[Crossref]

Markowitz, J. E.

F. Pisanello, G. Mandelbaum, M. Pisanello, I. A. Oldenburg, L. Sileo, J. E. Markowitz, R. E. Peterson, A. Della Patria, T. M. Haynes, M. S. Emara, B. Spagnolo, S. R. Datta, M. De Vittorio, and B. L. Sabatini, Nat. Neurosci. 20, 1180 (2017).
[Crossref]

Marley, A.

T. Patriarchi, J. R. Cho, K. Merten, M. W. Howe, A. Marley, W. H. Xiong, R. W. Folk, G. J. Broussard, R. Liang, M. J. Jang, H. Zhong, D. Dombeck, M. von Zastrow, A. Nimmerjahn, V. Gradinaru, J. T. Williams, and L. Tian, Science 360, eaat4422 (2018).
[Crossref]

Martiradonna, L.

F. Pisanello, L. Sileo, I. A. Oldenburg, M. Pisanello, L. Martiradonna, J. A. Assad, B. L. Sabatini, and M. De Vittorio, Neuron 82, 1245 (2014).
[Crossref]

Mathieson, K.

A. A. Patel, N. McAlinden, K. Mathieson, and S. Sakata, Front. Neurosci. 14, 148 (2020).
[Crossref]

McAlinden, N.

A. A. Patel, N. McAlinden, K. Mathieson, and S. Sakata, Front. Neurosci. 14, 148 (2020).
[Crossref]

Meitav, N.

G. Yona, N. Meitav, I. Kahn, and S. Shoham, eNeuro 3, 420 (2016).
[Crossref]

Merten, K.

T. Patriarchi, J. R. Cho, K. Merten, M. W. Howe, A. Marley, W. H. Xiong, R. W. Folk, G. J. Broussard, R. Liang, M. J. Jang, H. Zhong, D. Dombeck, M. von Zastrow, A. Nimmerjahn, V. Gradinaru, J. T. Williams, and L. Tian, Science 360, eaat4422 (2018).
[Crossref]

Nimmerjahn, A.

T. Patriarchi, J. R. Cho, K. Merten, M. W. Howe, A. Marley, W. H. Xiong, R. W. Folk, G. J. Broussard, R. Liang, M. J. Jang, H. Zhong, D. Dombeck, M. von Zastrow, A. Nimmerjahn, V. Gradinaru, J. T. Williams, and L. Tian, Science 360, eaat4422 (2018).
[Crossref]

Ning, X.

L. Lu, P. Gutruf, L. Xia, D. L. Bhatti, X. Wang, A. Vazquez-Guardado, X. Ning, X. Shen, T. Sang, R. Ma, G. Pakeltis, G. Sobczak, H. Zhang, D.-O. Seo, M. Xue, L. Yin, D. Chanda, X. Sheng, M. R. Bruchas, and J. A. Rogers, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 115, E1373 (2018).
[Crossref]

Oldenburg, I. A.

F. Pisanello, G. Mandelbaum, M. Pisanello, I. A. Oldenburg, L. Sileo, J. E. Markowitz, R. E. Peterson, A. Della Patria, T. M. Haynes, M. S. Emara, B. Spagnolo, S. R. Datta, M. De Vittorio, and B. L. Sabatini, Nat. Neurosci. 20, 1180 (2017).
[Crossref]

F. Pisanello, L. Sileo, I. A. Oldenburg, M. Pisanello, L. Martiradonna, J. A. Assad, B. L. Sabatini, and M. De Vittorio, Neuron 82, 1245 (2014).
[Crossref]

Ouzounov, D. G.

T. Wang, C. Wu, D. G. Ouzounov, W. Gu, F. Xia, M. Kim, X. Yang, M. R. Warden, and C. Xu, eLife 9, e53205 (2020).
[Crossref]

Pakeltis, G.

L. Lu, P. Gutruf, L. Xia, D. L. Bhatti, X. Wang, A. Vazquez-Guardado, X. Ning, X. Shen, T. Sang, R. Ma, G. Pakeltis, G. Sobczak, H. Zhang, D.-O. Seo, M. Xue, L. Yin, D. Chanda, X. Sheng, M. R. Bruchas, and J. A. Rogers, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 115, E1373 (2018).
[Crossref]

Park, D.

K. D. Piatkevich, S. Bensussen, H. Tseng, S. N. Shroff, V. G. Lopez-Huerta, D. Park, E. E. Jung, O. A. Shemesh, C. Straub, H. J. Gritton, M. F. Romano, E. Costa, B. L. Sabatini, Z. Fu, E. S. Boyden, and X. Han, Nature 574, 413 (2019).
[Crossref]

Patel, A. A.

A. A. Patel, N. McAlinden, K. Mathieson, and S. Sakata, Front. Neurosci. 14, 148 (2020).
[Crossref]

Patriarchi, T.

T. Patriarchi, J. R. Cho, K. Merten, M. W. Howe, A. Marley, W. H. Xiong, R. W. Folk, G. J. Broussard, R. Liang, M. J. Jang, H. Zhong, D. Dombeck, M. von Zastrow, A. Nimmerjahn, V. Gradinaru, J. T. Williams, and L. Tian, Science 360, eaat4422 (2018).
[Crossref]

Peterson, R. E.

F. Pisanello, G. Mandelbaum, M. Pisanello, I. A. Oldenburg, L. Sileo, J. E. Markowitz, R. E. Peterson, A. Della Patria, T. M. Haynes, M. S. Emara, B. Spagnolo, S. R. Datta, M. De Vittorio, and B. L. Sabatini, Nat. Neurosci. 20, 1180 (2017).
[Crossref]

Piatkevich, K. D.

K. D. Piatkevich, S. Bensussen, H. Tseng, S. N. Shroff, V. G. Lopez-Huerta, D. Park, E. E. Jung, O. A. Shemesh, C. Straub, H. J. Gritton, M. F. Romano, E. Costa, B. L. Sabatini, Z. Fu, E. S. Boyden, and X. Han, Nature 574, 413 (2019).
[Crossref]

Pisanello, F.

M. Pisanello, F. Pisano, M. Hyun, E. Maglie, A. Balena, M. De Vittorio, B. L. Sabatini, and F. Pisanello, Front. Neurosci. 13, 82 (2019).
[Crossref]

F. Pisano, M. Pisanello, S. Y. Lee, J. Lee, E. Maglie, A. Balena, L. Sileo, B. Spagnolo, M. Bianco, M. Hyun, M. De Vittorio, B. Sabatini, and F. Pisanello, Nat. Methods 16, 1185 (2019).
[Crossref]

F. Pisanello, Microelectron. Eng. 215, 110979 (2019).
[Crossref]

A. Rizzo, E. D. Lemma, F. Pisano, M. Pisanello, L. Sileo, M. De Vittorio, and F. Pisanello, Microelectron. Eng. 192, 88 (2018).
[Crossref]

F. Pisano, M. Pisanello, L. Sileo, A. Qualtieri, B. L. Sabatini, M. De Vittorio, and F. Pisanello, Microelectron. Eng. 195, 41 (2018).
[Crossref]

M. Pisanello, F. Pisano, L. Sileo, E. Maglie, E. Bellistri, B. Spagnolo, G. Mandelbaum, B. L. Sabatini, M. De Vittorio, and F. Pisanello, Sci. Rep. 8, 4467 (2018).
[Crossref]

F. Pisanello, G. Mandelbaum, M. Pisanello, I. A. Oldenburg, L. Sileo, J. E. Markowitz, R. E. Peterson, A. Della Patria, T. M. Haynes, M. S. Emara, B. Spagnolo, S. R. Datta, M. De Vittorio, and B. L. Sabatini, Nat. Neurosci. 20, 1180 (2017).
[Crossref]

F. Pisanello, L. Sileo, I. A. Oldenburg, M. Pisanello, L. Martiradonna, J. A. Assad, B. L. Sabatini, and M. De Vittorio, Neuron 82, 1245 (2014).
[Crossref]

E. Maglie, M. Pisanello, F. Pisano, A. Balena, B. Spagnolo, B. L. Sabatini, M. De Vittorio, and F. Pisanello, in 21st International Conference on Transparent Optical Networks (ICTON) (2019), pp. 1–7.

Pisanello, M.

F. Pisano, M. Pisanello, S. Y. Lee, J. Lee, E. Maglie, A. Balena, L. Sileo, B. Spagnolo, M. Bianco, M. Hyun, M. De Vittorio, B. Sabatini, and F. Pisanello, Nat. Methods 16, 1185 (2019).
[Crossref]

M. Pisanello, F. Pisano, M. Hyun, E. Maglie, A. Balena, M. De Vittorio, B. L. Sabatini, and F. Pisanello, Front. Neurosci. 13, 82 (2019).
[Crossref]

M. Pisanello, F. Pisano, L. Sileo, E. Maglie, E. Bellistri, B. Spagnolo, G. Mandelbaum, B. L. Sabatini, M. De Vittorio, and F. Pisanello, Sci. Rep. 8, 4467 (2018).
[Crossref]

F. Pisano, M. Pisanello, L. Sileo, A. Qualtieri, B. L. Sabatini, M. De Vittorio, and F. Pisanello, Microelectron. Eng. 195, 41 (2018).
[Crossref]

A. Rizzo, E. D. Lemma, F. Pisano, M. Pisanello, L. Sileo, M. De Vittorio, and F. Pisanello, Microelectron. Eng. 192, 88 (2018).
[Crossref]

F. Pisanello, G. Mandelbaum, M. Pisanello, I. A. Oldenburg, L. Sileo, J. E. Markowitz, R. E. Peterson, A. Della Patria, T. M. Haynes, M. S. Emara, B. Spagnolo, S. R. Datta, M. De Vittorio, and B. L. Sabatini, Nat. Neurosci. 20, 1180 (2017).
[Crossref]

F. Pisanello, L. Sileo, I. A. Oldenburg, M. Pisanello, L. Martiradonna, J. A. Assad, B. L. Sabatini, and M. De Vittorio, Neuron 82, 1245 (2014).
[Crossref]

E. Maglie, M. Pisanello, F. Pisano, A. Balena, B. Spagnolo, B. L. Sabatini, M. De Vittorio, and F. Pisanello, in 21st International Conference on Transparent Optical Networks (ICTON) (2019), pp. 1–7.

Pisano, F.

F. Pisano, M. Pisanello, S. Y. Lee, J. Lee, E. Maglie, A. Balena, L. Sileo, B. Spagnolo, M. Bianco, M. Hyun, M. De Vittorio, B. Sabatini, and F. Pisanello, Nat. Methods 16, 1185 (2019).
[Crossref]

M. Pisanello, F. Pisano, M. Hyun, E. Maglie, A. Balena, M. De Vittorio, B. L. Sabatini, and F. Pisanello, Front. Neurosci. 13, 82 (2019).
[Crossref]

M. Pisanello, F. Pisano, L. Sileo, E. Maglie, E. Bellistri, B. Spagnolo, G. Mandelbaum, B. L. Sabatini, M. De Vittorio, and F. Pisanello, Sci. Rep. 8, 4467 (2018).
[Crossref]

F. Pisano, M. Pisanello, L. Sileo, A. Qualtieri, B. L. Sabatini, M. De Vittorio, and F. Pisanello, Microelectron. Eng. 195, 41 (2018).
[Crossref]

A. Rizzo, E. D. Lemma, F. Pisano, M. Pisanello, L. Sileo, M. De Vittorio, and F. Pisanello, Microelectron. Eng. 192, 88 (2018).
[Crossref]

E. Maglie, M. Pisanello, F. Pisano, A. Balena, B. Spagnolo, B. L. Sabatini, M. De Vittorio, and F. Pisanello, in 21st International Conference on Transparent Optical Networks (ICTON) (2019), pp. 1–7.

Prahl, S. A.

Pramanik, G.

F. Schmid, L. Wachsmuth, M. Schwalm, P.-H. Prouvot, E. R. Jubal, C. Fois, G. Pramanik, C. Zimmer, C. Faber, and A. Stroh, J. Cereb. Blood Flow Metab. 36, 1885 (2016).
[Crossref]

Prouvot, P.-H.

F. Schmid, L. Wachsmuth, M. Schwalm, P.-H. Prouvot, E. R. Jubal, C. Fois, G. Pramanik, C. Zimmer, C. Faber, and A. Stroh, J. Cereb. Blood Flow Metab. 36, 1885 (2016).
[Crossref]

Qualtieri, A.

F. Pisano, M. Pisanello, L. Sileo, A. Qualtieri, B. L. Sabatini, M. De Vittorio, and F. Pisanello, Microelectron. Eng. 195, 41 (2018).
[Crossref]

Rizzo, A.

A. Rizzo, E. D. Lemma, F. Pisano, M. Pisanello, L. Sileo, M. De Vittorio, and F. Pisanello, Microelectron. Eng. 192, 88 (2018).
[Crossref]

Rogers, J. A.

L. Lu, P. Gutruf, L. Xia, D. L. Bhatti, X. Wang, A. Vazquez-Guardado, X. Ning, X. Shen, T. Sang, R. Ma, G. Pakeltis, G. Sobczak, H. Zhang, D.-O. Seo, M. Xue, L. Yin, D. Chanda, X. Sheng, M. R. Bruchas, and J. A. Rogers, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 115, E1373 (2018).
[Crossref]

Romano, M. F.

K. D. Piatkevich, S. Bensussen, H. Tseng, S. N. Shroff, V. G. Lopez-Huerta, D. Park, E. E. Jung, O. A. Shemesh, C. Straub, H. J. Gritton, M. F. Romano, E. Costa, B. L. Sabatini, Z. Fu, E. S. Boyden, and X. Han, Nature 574, 413 (2019).
[Crossref]

Sabatini, B.

F. Pisano, M. Pisanello, S. Y. Lee, J. Lee, E. Maglie, A. Balena, L. Sileo, B. Spagnolo, M. Bianco, M. Hyun, M. De Vittorio, B. Sabatini, and F. Pisanello, Nat. Methods 16, 1185 (2019).
[Crossref]

Sabatini, B. L.

K. D. Piatkevich, S. Bensussen, H. Tseng, S. N. Shroff, V. G. Lopez-Huerta, D. Park, E. E. Jung, O. A. Shemesh, C. Straub, H. J. Gritton, M. F. Romano, E. Costa, B. L. Sabatini, Z. Fu, E. S. Boyden, and X. Han, Nature 574, 413 (2019).
[Crossref]

M. Pisanello, F. Pisano, M. Hyun, E. Maglie, A. Balena, M. De Vittorio, B. L. Sabatini, and F. Pisanello, Front. Neurosci. 13, 82 (2019).
[Crossref]

S. J. Lee, Y. Chen, B. Lodder, and B. L. Sabatini, Front. Neurosci. 13, 766 (2019).
[Crossref]

F. Pisano, M. Pisanello, L. Sileo, A. Qualtieri, B. L. Sabatini, M. De Vittorio, and F. Pisanello, Microelectron. Eng. 195, 41 (2018).
[Crossref]

M. Pisanello, F. Pisano, L. Sileo, E. Maglie, E. Bellistri, B. Spagnolo, G. Mandelbaum, B. L. Sabatini, M. De Vittorio, and F. Pisanello, Sci. Rep. 8, 4467 (2018).
[Crossref]

F. Pisanello, G. Mandelbaum, M. Pisanello, I. A. Oldenburg, L. Sileo, J. E. Markowitz, R. E. Peterson, A. Della Patria, T. M. Haynes, M. S. Emara, B. Spagnolo, S. R. Datta, M. De Vittorio, and B. L. Sabatini, Nat. Neurosci. 20, 1180 (2017).
[Crossref]

F. Pisanello, L. Sileo, I. A. Oldenburg, M. Pisanello, L. Martiradonna, J. A. Assad, B. L. Sabatini, and M. De Vittorio, Neuron 82, 1245 (2014).
[Crossref]

E. Maglie, M. Pisanello, F. Pisano, A. Balena, B. Spagnolo, B. L. Sabatini, M. De Vittorio, and F. Pisanello, in 21st International Conference on Transparent Optical Networks (ICTON) (2019), pp. 1–7.

Sakata, S.

A. A. Patel, N. McAlinden, K. Mathieson, and S. Sakata, Front. Neurosci. 14, 148 (2020).
[Crossref]

Sang, T.

L. Lu, P. Gutruf, L. Xia, D. L. Bhatti, X. Wang, A. Vazquez-Guardado, X. Ning, X. Shen, T. Sang, R. Ma, G. Pakeltis, G. Sobczak, H. Zhang, D.-O. Seo, M. Xue, L. Yin, D. Chanda, X. Sheng, M. R. Bruchas, and J. A. Rogers, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 115, E1373 (2018).
[Crossref]

Schmid, F.

F. Schmid, L. Wachsmuth, M. Schwalm, P.-H. Prouvot, E. R. Jubal, C. Fois, G. Pramanik, C. Zimmer, C. Faber, and A. Stroh, J. Cereb. Blood Flow Metab. 36, 1885 (2016).
[Crossref]

Schwalm, M.

F. Schmid, L. Wachsmuth, M. Schwalm, P.-H. Prouvot, E. R. Jubal, C. Fois, G. Pramanik, C. Zimmer, C. Faber, and A. Stroh, J. Cereb. Blood Flow Metab. 36, 1885 (2016).
[Crossref]

Seo, D.-O.

L. Lu, P. Gutruf, L. Xia, D. L. Bhatti, X. Wang, A. Vazquez-Guardado, X. Ning, X. Shen, T. Sang, R. Ma, G. Pakeltis, G. Sobczak, H. Zhang, D.-O. Seo, M. Xue, L. Yin, D. Chanda, X. Sheng, M. R. Bruchas, and J. A. Rogers, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 115, E1373 (2018).
[Crossref]

Shemesh, O. A.

K. D. Piatkevich, S. Bensussen, H. Tseng, S. N. Shroff, V. G. Lopez-Huerta, D. Park, E. E. Jung, O. A. Shemesh, C. Straub, H. J. Gritton, M. F. Romano, E. Costa, B. L. Sabatini, Z. Fu, E. S. Boyden, and X. Han, Nature 574, 413 (2019).
[Crossref]

Shen, X.

L. Lu, P. Gutruf, L. Xia, D. L. Bhatti, X. Wang, A. Vazquez-Guardado, X. Ning, X. Shen, T. Sang, R. Ma, G. Pakeltis, G. Sobczak, H. Zhang, D.-O. Seo, M. Xue, L. Yin, D. Chanda, X. Sheng, M. R. Bruchas, and J. A. Rogers, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 115, E1373 (2018).
[Crossref]

Sheng, X.

L. Lu, P. Gutruf, L. Xia, D. L. Bhatti, X. Wang, A. Vazquez-Guardado, X. Ning, X. Shen, T. Sang, R. Ma, G. Pakeltis, G. Sobczak, H. Zhang, D.-O. Seo, M. Xue, L. Yin, D. Chanda, X. Sheng, M. R. Bruchas, and J. A. Rogers, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 115, E1373 (2018).
[Crossref]

Shoham, S.

G. Yona, N. Meitav, I. Kahn, and S. Shoham, eNeuro 3, 420 (2016).
[Crossref]

Shroff, S. N.

K. D. Piatkevich, S. Bensussen, H. Tseng, S. N. Shroff, V. G. Lopez-Huerta, D. Park, E. E. Jung, O. A. Shemesh, C. Straub, H. J. Gritton, M. F. Romano, E. Costa, B. L. Sabatini, Z. Fu, E. S. Boyden, and X. Han, Nature 574, 413 (2019).
[Crossref]

Sileo, L.

F. Pisano, M. Pisanello, S. Y. Lee, J. Lee, E. Maglie, A. Balena, L. Sileo, B. Spagnolo, M. Bianco, M. Hyun, M. De Vittorio, B. Sabatini, and F. Pisanello, Nat. Methods 16, 1185 (2019).
[Crossref]

M. Pisanello, F. Pisano, L. Sileo, E. Maglie, E. Bellistri, B. Spagnolo, G. Mandelbaum, B. L. Sabatini, M. De Vittorio, and F. Pisanello, Sci. Rep. 8, 4467 (2018).
[Crossref]

A. Rizzo, E. D. Lemma, F. Pisano, M. Pisanello, L. Sileo, M. De Vittorio, and F. Pisanello, Microelectron. Eng. 192, 88 (2018).
[Crossref]

F. Pisano, M. Pisanello, L. Sileo, A. Qualtieri, B. L. Sabatini, M. De Vittorio, and F. Pisanello, Microelectron. Eng. 195, 41 (2018).
[Crossref]

F. Pisanello, G. Mandelbaum, M. Pisanello, I. A. Oldenburg, L. Sileo, J. E. Markowitz, R. E. Peterson, A. Della Patria, T. M. Haynes, M. S. Emara, B. Spagnolo, S. R. Datta, M. De Vittorio, and B. L. Sabatini, Nat. Neurosci. 20, 1180 (2017).
[Crossref]

F. Pisanello, L. Sileo, I. A. Oldenburg, M. Pisanello, L. Martiradonna, J. A. Assad, B. L. Sabatini, and M. De Vittorio, Neuron 82, 1245 (2014).
[Crossref]

Sobczak, G.

L. Lu, P. Gutruf, L. Xia, D. L. Bhatti, X. Wang, A. Vazquez-Guardado, X. Ning, X. Shen, T. Sang, R. Ma, G. Pakeltis, G. Sobczak, H. Zhang, D.-O. Seo, M. Xue, L. Yin, D. Chanda, X. Sheng, M. R. Bruchas, and J. A. Rogers, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 115, E1373 (2018).
[Crossref]

Song, S.

Y. Yang, N. Liu, Y. He, Y. Liu, L. Ge, L. Zou, S. Song, W. Xiong, and X. Liu, Nat. Commun. 9, 1504 (2018).
[Crossref]

Spagnolo, B.

F. Pisano, M. Pisanello, S. Y. Lee, J. Lee, E. Maglie, A. Balena, L. Sileo, B. Spagnolo, M. Bianco, M. Hyun, M. De Vittorio, B. Sabatini, and F. Pisanello, Nat. Methods 16, 1185 (2019).
[Crossref]

M. Pisanello, F. Pisano, L. Sileo, E. Maglie, E. Bellistri, B. Spagnolo, G. Mandelbaum, B. L. Sabatini, M. De Vittorio, and F. Pisanello, Sci. Rep. 8, 4467 (2018).
[Crossref]

F. Pisanello, G. Mandelbaum, M. Pisanello, I. A. Oldenburg, L. Sileo, J. E. Markowitz, R. E. Peterson, A. Della Patria, T. M. Haynes, M. S. Emara, B. Spagnolo, S. R. Datta, M. De Vittorio, and B. L. Sabatini, Nat. Neurosci. 20, 1180 (2017).
[Crossref]

E. Maglie, M. Pisanello, F. Pisano, A. Balena, B. Spagnolo, B. L. Sabatini, M. De Vittorio, and F. Pisanello, in 21st International Conference on Transparent Optical Networks (ICTON) (2019), pp. 1–7.

Spellman, T.

J. M. Stujenske, T. Spellman, and J. A. Gordon, Cell Rep. 12, 525 (2015).
[Crossref]

Straub, C.

K. D. Piatkevich, S. Bensussen, H. Tseng, S. N. Shroff, V. G. Lopez-Huerta, D. Park, E. E. Jung, O. A. Shemesh, C. Straub, H. J. Gritton, M. F. Romano, E. Costa, B. L. Sabatini, Z. Fu, E. S. Boyden, and X. Han, Nature 574, 413 (2019).
[Crossref]

Stroh, A.

F. Schmid, L. Wachsmuth, M. Schwalm, P.-H. Prouvot, E. R. Jubal, C. Fois, G. Pramanik, C. Zimmer, C. Faber, and A. Stroh, J. Cereb. Blood Flow Metab. 36, 1885 (2016).
[Crossref]

Stujenske, J. M.

J. M. Stujenske, T. Spellman, and J. A. Gordon, Cell Rep. 12, 525 (2015).
[Crossref]

Sumanovski, L. T.

Y. Sych, M. Chernysheva, L. T. Sumanovski, and F. Helmchen, Nat. Methods 16, 553 (2019).
[Crossref]

Sych, Y.

Y. Sych, M. Chernysheva, L. T. Sumanovski, and F. Helmchen, Nat. Methods 16, 553 (2019).
[Crossref]

Tian, L.

T. Patriarchi, J. R. Cho, K. Merten, M. W. Howe, A. Marley, W. H. Xiong, R. W. Folk, G. J. Broussard, R. Liang, M. J. Jang, H. Zhong, D. Dombeck, M. von Zastrow, A. Nimmerjahn, V. Gradinaru, J. T. Williams, and L. Tian, Science 360, eaat4422 (2018).
[Crossref]

Tseng, H.

K. D. Piatkevich, S. Bensussen, H. Tseng, S. N. Shroff, V. G. Lopez-Huerta, D. Park, E. E. Jung, O. A. Shemesh, C. Straub, H. J. Gritton, M. F. Romano, E. Costa, B. L. Sabatini, Z. Fu, E. S. Boyden, and X. Han, Nature 574, 413 (2019).
[Crossref]

Vazquez-Guardado, A.

L. Lu, P. Gutruf, L. Xia, D. L. Bhatti, X. Wang, A. Vazquez-Guardado, X. Ning, X. Shen, T. Sang, R. Ma, G. Pakeltis, G. Sobczak, H. Zhang, D.-O. Seo, M. Xue, L. Yin, D. Chanda, X. Sheng, M. R. Bruchas, and J. A. Rogers, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 115, E1373 (2018).
[Crossref]

von Zastrow, M.

T. Patriarchi, J. R. Cho, K. Merten, M. W. Howe, A. Marley, W. H. Xiong, R. W. Folk, G. J. Broussard, R. Liang, M. J. Jang, H. Zhong, D. Dombeck, M. von Zastrow, A. Nimmerjahn, V. Gradinaru, J. T. Williams, and L. Tian, Science 360, eaat4422 (2018).
[Crossref]

Wachsmuth, L.

F. Schmid, L. Wachsmuth, M. Schwalm, P.-H. Prouvot, E. R. Jubal, C. Fois, G. Pramanik, C. Zimmer, C. Faber, and A. Stroh, J. Cereb. Blood Flow Metab. 36, 1885 (2016).
[Crossref]

Wang, T.

T. Wang, C. Wu, D. G. Ouzounov, W. Gu, F. Xia, M. Kim, X. Yang, M. R. Warden, and C. Xu, eLife 9, e53205 (2020).
[Crossref]

Wang, X.

L. Lu, P. Gutruf, L. Xia, D. L. Bhatti, X. Wang, A. Vazquez-Guardado, X. Ning, X. Shen, T. Sang, R. Ma, G. Pakeltis, G. Sobczak, H. Zhang, D.-O. Seo, M. Xue, L. Yin, D. Chanda, X. Sheng, M. R. Bruchas, and J. A. Rogers, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 115, E1373 (2018).
[Crossref]

Warden, M. R.

T. Wang, C. Wu, D. G. Ouzounov, W. Gu, F. Xia, M. Kim, X. Yang, M. R. Warden, and C. Xu, eLife 9, e53205 (2020).
[Crossref]

Williams, J. T.

T. Patriarchi, J. R. Cho, K. Merten, M. W. Howe, A. Marley, W. H. Xiong, R. W. Folk, G. J. Broussard, R. Liang, M. J. Jang, H. Zhong, D. Dombeck, M. von Zastrow, A. Nimmerjahn, V. Gradinaru, J. T. Williams, and L. Tian, Science 360, eaat4422 (2018).
[Crossref]

Wu, C.

T. Wang, C. Wu, D. G. Ouzounov, W. Gu, F. Xia, M. Kim, X. Yang, M. R. Warden, and C. Xu, eLife 9, e53205 (2020).
[Crossref]

Xia, F.

T. Wang, C. Wu, D. G. Ouzounov, W. Gu, F. Xia, M. Kim, X. Yang, M. R. Warden, and C. Xu, eLife 9, e53205 (2020).
[Crossref]

Xia, L.

L. Lu, P. Gutruf, L. Xia, D. L. Bhatti, X. Wang, A. Vazquez-Guardado, X. Ning, X. Shen, T. Sang, R. Ma, G. Pakeltis, G. Sobczak, H. Zhang, D.-O. Seo, M. Xue, L. Yin, D. Chanda, X. Sheng, M. R. Bruchas, and J. A. Rogers, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 115, E1373 (2018).
[Crossref]

Xiong, W.

Y. Yang, N. Liu, Y. He, Y. Liu, L. Ge, L. Zou, S. Song, W. Xiong, and X. Liu, Nat. Commun. 9, 1504 (2018).
[Crossref]

Xiong, W. H.

T. Patriarchi, J. R. Cho, K. Merten, M. W. Howe, A. Marley, W. H. Xiong, R. W. Folk, G. J. Broussard, R. Liang, M. J. Jang, H. Zhong, D. Dombeck, M. von Zastrow, A. Nimmerjahn, V. Gradinaru, J. T. Williams, and L. Tian, Science 360, eaat4422 (2018).
[Crossref]

Xu, C.

T. Wang, C. Wu, D. G. Ouzounov, W. Gu, F. Xia, M. Kim, X. Yang, M. R. Warden, and C. Xu, eLife 9, e53205 (2020).
[Crossref]

Xue, M.

L. Lu, P. Gutruf, L. Xia, D. L. Bhatti, X. Wang, A. Vazquez-Guardado, X. Ning, X. Shen, T. Sang, R. Ma, G. Pakeltis, G. Sobczak, H. Zhang, D.-O. Seo, M. Xue, L. Yin, D. Chanda, X. Sheng, M. R. Bruchas, and J. A. Rogers, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 115, E1373 (2018).
[Crossref]

Yang, X.

T. Wang, C. Wu, D. G. Ouzounov, W. Gu, F. Xia, M. Kim, X. Yang, M. R. Warden, and C. Xu, eLife 9, e53205 (2020).
[Crossref]

Yang, Y.

Y. Yang, N. Liu, Y. He, Y. Liu, L. Ge, L. Zou, S. Song, W. Xiong, and X. Liu, Nat. Commun. 9, 1504 (2018).
[Crossref]

Yin, L.

L. Lu, P. Gutruf, L. Xia, D. L. Bhatti, X. Wang, A. Vazquez-Guardado, X. Ning, X. Shen, T. Sang, R. Ma, G. Pakeltis, G. Sobczak, H. Zhang, D.-O. Seo, M. Xue, L. Yin, D. Chanda, X. Sheng, M. R. Bruchas, and J. A. Rogers, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 115, E1373 (2018).
[Crossref]

Yona, G.

G. Yona, N. Meitav, I. Kahn, and S. Shoham, eNeuro 3, 420 (2016).
[Crossref]

Zhang, H.

L. Lu, P. Gutruf, L. Xia, D. L. Bhatti, X. Wang, A. Vazquez-Guardado, X. Ning, X. Shen, T. Sang, R. Ma, G. Pakeltis, G. Sobczak, H. Zhang, D.-O. Seo, M. Xue, L. Yin, D. Chanda, X. Sheng, M. R. Bruchas, and J. A. Rogers, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 115, E1373 (2018).
[Crossref]

Zhong, H.

T. Patriarchi, J. R. Cho, K. Merten, M. W. Howe, A. Marley, W. H. Xiong, R. W. Folk, G. J. Broussard, R. Liang, M. J. Jang, H. Zhong, D. Dombeck, M. von Zastrow, A. Nimmerjahn, V. Gradinaru, J. T. Williams, and L. Tian, Science 360, eaat4422 (2018).
[Crossref]

Zimmer, C.

F. Schmid, L. Wachsmuth, M. Schwalm, P.-H. Prouvot, E. R. Jubal, C. Fois, G. Pramanik, C. Zimmer, C. Faber, and A. Stroh, J. Cereb. Blood Flow Metab. 36, 1885 (2016).
[Crossref]

Zinter, J. P.

Zou, L.

Y. Yang, N. Liu, Y. He, Y. Liu, L. Ge, L. Zou, S. Song, W. Xiong, and X. Liu, Nat. Commun. 9, 1504 (2018).
[Crossref]

Appl. Opt. (1)

Cell Rep. (1)

J. M. Stujenske, T. Spellman, and J. A. Gordon, Cell Rep. 12, 525 (2015).
[Crossref]

eLife (1)

T. Wang, C. Wu, D. G. Ouzounov, W. Gu, F. Xia, M. Kim, X. Yang, M. R. Warden, and C. Xu, eLife 9, e53205 (2020).
[Crossref]

eNeuro (1)

G. Yona, N. Meitav, I. Kahn, and S. Shoham, eNeuro 3, 420 (2016).
[Crossref]

Front. Neurosci. (3)

S. J. Lee, Y. Chen, B. Lodder, and B. L. Sabatini, Front. Neurosci. 13, 766 (2019).
[Crossref]

A. A. Patel, N. McAlinden, K. Mathieson, and S. Sakata, Front. Neurosci. 14, 148 (2020).
[Crossref]

M. Pisanello, F. Pisano, M. Hyun, E. Maglie, A. Balena, M. De Vittorio, B. L. Sabatini, and F. Pisanello, Front. Neurosci. 13, 82 (2019).
[Crossref]

J. Cereb. Blood Flow Metab. (1)

F. Schmid, L. Wachsmuth, M. Schwalm, P.-H. Prouvot, E. R. Jubal, C. Fois, G. Pramanik, C. Zimmer, C. Faber, and A. Stroh, J. Cereb. Blood Flow Metab. 36, 1885 (2016).
[Crossref]

Microelectron. Eng. (3)

F. Pisano, M. Pisanello, L. Sileo, A. Qualtieri, B. L. Sabatini, M. De Vittorio, and F. Pisanello, Microelectron. Eng. 195, 41 (2018).
[Crossref]

A. Rizzo, E. D. Lemma, F. Pisano, M. Pisanello, L. Sileo, M. De Vittorio, and F. Pisanello, Microelectron. Eng. 192, 88 (2018).
[Crossref]

F. Pisanello, Microelectron. Eng. 215, 110979 (2019).
[Crossref]

Nat. Commun. (1)

Y. Yang, N. Liu, Y. He, Y. Liu, L. Ge, L. Zou, S. Song, W. Xiong, and X. Liu, Nat. Commun. 9, 1504 (2018).
[Crossref]

Nat. Methods (2)

F. Pisano, M. Pisanello, S. Y. Lee, J. Lee, E. Maglie, A. Balena, L. Sileo, B. Spagnolo, M. Bianco, M. Hyun, M. De Vittorio, B. Sabatini, and F. Pisanello, Nat. Methods 16, 1185 (2019).
[Crossref]

Y. Sych, M. Chernysheva, L. T. Sumanovski, and F. Helmchen, Nat. Methods 16, 553 (2019).
[Crossref]

Nat. Neurosci. (2)

H. Adelsberger, O. Garaschuk, and A. Konnerth, Nat. Neurosci. 8, 988 (2005).
[Crossref]

F. Pisanello, G. Mandelbaum, M. Pisanello, I. A. Oldenburg, L. Sileo, J. E. Markowitz, R. E. Peterson, A. Della Patria, T. M. Haynes, M. S. Emara, B. Spagnolo, S. R. Datta, M. De Vittorio, and B. L. Sabatini, Nat. Neurosci. 20, 1180 (2017).
[Crossref]

Nature (1)

K. D. Piatkevich, S. Bensussen, H. Tseng, S. N. Shroff, V. G. Lopez-Huerta, D. Park, E. E. Jung, O. A. Shemesh, C. Straub, H. J. Gritton, M. F. Romano, E. Costa, B. L. Sabatini, Z. Fu, E. S. Boyden, and X. Han, Nature 574, 413 (2019).
[Crossref]

Neuron (1)

F. Pisanello, L. Sileo, I. A. Oldenburg, M. Pisanello, L. Martiradonna, J. A. Assad, B. L. Sabatini, and M. De Vittorio, Neuron 82, 1245 (2014).
[Crossref]

Opt. Express (1)

Proc. Natl. Acad. Sci. USA (1)

L. Lu, P. Gutruf, L. Xia, D. L. Bhatti, X. Wang, A. Vazquez-Guardado, X. Ning, X. Shen, T. Sang, R. Ma, G. Pakeltis, G. Sobczak, H. Zhang, D.-O. Seo, M. Xue, L. Yin, D. Chanda, X. Sheng, M. R. Bruchas, and J. A. Rogers, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 115, E1373 (2018).
[Crossref]

Sci. Rep. (1)

M. Pisanello, F. Pisano, L. Sileo, E. Maglie, E. Bellistri, B. Spagnolo, G. Mandelbaum, B. L. Sabatini, M. De Vittorio, and F. Pisanello, Sci. Rep. 8, 4467 (2018).
[Crossref]

Science (1)

T. Patriarchi, J. R. Cho, K. Merten, M. W. Howe, A. Marley, W. H. Xiong, R. W. Folk, G. J. Broussard, R. Liang, M. J. Jang, H. Zhong, D. Dombeck, M. von Zastrow, A. Nimmerjahn, V. Gradinaru, J. T. Williams, and L. Tian, Science 360, eaat4422 (2018).
[Crossref]

Other (1)

E. Maglie, M. Pisanello, F. Pisano, A. Balena, B. Spagnolo, B. L. Sabatini, M. De Vittorio, and F. Pisanello, in 21st International Conference on Transparent Optical Networks (ICTON) (2019), pp. 1–7.

Cited By

OSA participates in Crossref's Cited-By Linking service. Citing articles from OSA journals and other participating publishers are listed here.

Alert me when this article is cited.


Figures (5)

Fig. 1.
Fig. 1. A, scanning electron microscope (SEM) image of µTF with a ${{45}}\;{\rm{\unicode{x00B5}{\rm m}}} \times {{45}}\;{\rm{\unicode{x00B5}{\rm m}}}$ optical window. B, optical setup implemented to measure the light collection properties of µTFs. C, representative data collected by a ${{45}}\;{\rm{\unicode{x00B5}{\rm m}}} \times {{45}}\;{\rm{\unicode{x00B5}{\rm m}}}$ optical window and detected by the fiber PMT, with the related signal on the µscope PMT at different values of ${{z}}$ .
Fig. 2.
Fig. 2. A, representative data collected by the fiber PMT. B, comparison between the intensity profile decay in brain slices and in solution.
Fig. 3.
Fig. 3. A (left), ray tracing layout used to estimate $\eta$ ; A (right), $\eta$ obtained by scanning the point source. B, convergence study as a function of ${{N}}$ (left) and $l$ (right). C, comparison between $\eta (x,y)$ for two values of $l$ (left and center) and their ratio (right). The ratio is computed only where a significative signal was found. D, comparison between experimental and numerical data along the profile lines in the inset.
Fig. 4.
Fig. 4. A, schematic representation of the 3D scanning (left) and reconstructed iso- $\eta$ surfaces used to estimate collection volumes. B and C, volumes contained within the iso- $\eta$ surfaces as a function of ${{W}}$ and ${{L}}$ .
Fig. 5.
Fig. 5. A, schematic representation of the ray tracing model used to estimate emission field. B, representative 2D emission field $\beta (x,y)$ acquired at ${{z}} = {{0}}\;{{\unicode{x00B5}{\rm m}}}$ above the optical window. C, $\eta (x,y)$ on the same plane as the data in panel B. D, photometry efficiency $\rho (x,y)$ resulting from data in panels B and C. E, volumes contained in the iso- $\eta$ and iso- $\rho$ surfaces at different percentages of the maximum value.

Equations (1)

Equations on this page are rendered with MathJax. Learn more.

ϕ ( θ ) = ( 4 π ) 1 ( 1 g 2 ) ( 1 + g 2 2 g cos θ ) 3 2 ,

Metrics