Abstract

Advanced signal reconstruction in polarization-sensitive optical coherence tomography (OCT) frequently relies on an accurate determination of the signal noise floor. However, current methods for evaluating the noise floor are often impractical and subjective. Here we present a method using the degree of polarization uniformity and known speckle intensity statistics to model and estimate the OCT noise floor automatically. We establish the working principle of our method with a series of phantom experiments and demonstrate the robustness of our noise estimation method across different imaging systems and applications in vivo.

© 2020 Optical Society of America under the terms of the OSA Open Access Publishing Agreement

Full Article  |  PDF Article

References

  • View by:
  • |
  • |
  • |

  1. D. Huang, E. A. Swanson, C. P. Lin, J. S. Schuman, W. G. Stinson, W. Chang, M. R. Hee, T. Flotte, K. Gregory, C. A. Puliafito, and J. G. Fujimoto, Science 254, 1178 (1991).
    [Crossref]
  2. M. R. Hee, E. A. Swanson, J. G. Fujimoto, and D. Huang, J. Opt. Soc. Am. B 9, 903 (1992).
    [Crossref]
  3. J. F. de Boer, T. E. Milner, M. J. C. van Gemert, and J. S. Nelson, Opt. Lett. 22, 934 (1997).
    [Crossref]
  4. S. G. Adie, T. R. Hillman, and D. D. Sampson, Opt. Express 15, 18033 (2007).
    [Crossref]
  5. E. Götzinger, M. Pircher, W. Geitzenauer, C. Ahlers, B. Baumann, S. Michels, U. Schmidt-Erfurth, and C. K. Hitzenberger, Opt. Express 16, 16410 (2008).
    [Crossref]
  6. N. Lippok, M. Villiger, and B. E. Bouma, Opt. Lett. 40, 3954 (2015).
    [Crossref]
  7. W. C. Y. Lo, M. Villiger, A. Golberg, G. F. Broelsch, S. Khan, C. G. Lian, W. G. Austen, M. Yarmush, and B. E. Bouma, J. Invest. Dermatol. 136, 84 (2016).
    [Crossref]
  8. M. Villiger, K. Otsuka, A. Karanasos, P. Doradla, J. Ren, N. Lippok, M. Shishkov, J. Daemen, R. Diletti, R. J. van Geuns, F. Zijlstra, G. van Soest, P. Libby, E. Regar, S. K. Nadkarni, and B. E. Bouma, JACC Cardiovasc. Imaging 11, 1666 (2018).
    [Crossref]
  9. S.-W. Lee, J.-H. Kang, J.-Y. Yoo, M.-S. Kang, J.-T. Oh, and B.-M. Kim, J. Biomed. Opt. 13, 054032 (2008).
    [Crossref]
  10. S. Makita, Y. Hong, M. Miura, and Y. Yasuno, Opt. Lett. 39, 6783 (2014).
    [Crossref]
  11. D. Kasaragod, S. Makita, Y.-J. Hong, and Y. Yasuno, Biomed. Opt. Express 8, 653 (2017).
    [Crossref]
  12. K. A. Vermeer, J. Mo, J. J. A. Weda, H. G. Lemij, and J. F. de Boer, Biomed. Opt. Express 5, 322 (2014).
    [Crossref]
  13. N. Lippok, M. Villiger, A. Albanese, E. F. J. Meijer, K. Chung, T. P. Padera, S. N. Bhatia, and B. E. Bouma, Nat. Photonics 11, 583 (2017).
    [Crossref]
  14. J. W. Goodman, Speckle Phenomena in Optics: Theory and Applications (W. H. Freeman, 2006).
  15. A. Dvoretzky, J. Kiefer, and J. Wolfowitz, Ann. Math. Stat. 27, 642 (1956).
    [Crossref]
  16. N. Lippok, B. Braaf, M. Villiger, W. Y. Oh, B. J. Vakoc, and B. E. Bouma, J. Biophoton. 12, e201800156 (2019).
    [Crossref]

2019 (1)

N. Lippok, B. Braaf, M. Villiger, W. Y. Oh, B. J. Vakoc, and B. E. Bouma, J. Biophoton. 12, e201800156 (2019).
[Crossref]

2018 (1)

M. Villiger, K. Otsuka, A. Karanasos, P. Doradla, J. Ren, N. Lippok, M. Shishkov, J. Daemen, R. Diletti, R. J. van Geuns, F. Zijlstra, G. van Soest, P. Libby, E. Regar, S. K. Nadkarni, and B. E. Bouma, JACC Cardiovasc. Imaging 11, 1666 (2018).
[Crossref]

2017 (2)

N. Lippok, M. Villiger, A. Albanese, E. F. J. Meijer, K. Chung, T. P. Padera, S. N. Bhatia, and B. E. Bouma, Nat. Photonics 11, 583 (2017).
[Crossref]

D. Kasaragod, S. Makita, Y.-J. Hong, and Y. Yasuno, Biomed. Opt. Express 8, 653 (2017).
[Crossref]

2016 (1)

W. C. Y. Lo, M. Villiger, A. Golberg, G. F. Broelsch, S. Khan, C. G. Lian, W. G. Austen, M. Yarmush, and B. E. Bouma, J. Invest. Dermatol. 136, 84 (2016).
[Crossref]

2015 (1)

2014 (2)

2008 (2)

2007 (1)

1997 (1)

1992 (1)

1991 (1)

D. Huang, E. A. Swanson, C. P. Lin, J. S. Schuman, W. G. Stinson, W. Chang, M. R. Hee, T. Flotte, K. Gregory, C. A. Puliafito, and J. G. Fujimoto, Science 254, 1178 (1991).
[Crossref]

1956 (1)

A. Dvoretzky, J. Kiefer, and J. Wolfowitz, Ann. Math. Stat. 27, 642 (1956).
[Crossref]

Adie, S. G.

Ahlers, C.

Albanese, A.

N. Lippok, M. Villiger, A. Albanese, E. F. J. Meijer, K. Chung, T. P. Padera, S. N. Bhatia, and B. E. Bouma, Nat. Photonics 11, 583 (2017).
[Crossref]

Austen, W. G.

W. C. Y. Lo, M. Villiger, A. Golberg, G. F. Broelsch, S. Khan, C. G. Lian, W. G. Austen, M. Yarmush, and B. E. Bouma, J. Invest. Dermatol. 136, 84 (2016).
[Crossref]

Baumann, B.

Bhatia, S. N.

N. Lippok, M. Villiger, A. Albanese, E. F. J. Meijer, K. Chung, T. P. Padera, S. N. Bhatia, and B. E. Bouma, Nat. Photonics 11, 583 (2017).
[Crossref]

Bouma, B. E.

N. Lippok, B. Braaf, M. Villiger, W. Y. Oh, B. J. Vakoc, and B. E. Bouma, J. Biophoton. 12, e201800156 (2019).
[Crossref]

M. Villiger, K. Otsuka, A. Karanasos, P. Doradla, J. Ren, N. Lippok, M. Shishkov, J. Daemen, R. Diletti, R. J. van Geuns, F. Zijlstra, G. van Soest, P. Libby, E. Regar, S. K. Nadkarni, and B. E. Bouma, JACC Cardiovasc. Imaging 11, 1666 (2018).
[Crossref]

N. Lippok, M. Villiger, A. Albanese, E. F. J. Meijer, K. Chung, T. P. Padera, S. N. Bhatia, and B. E. Bouma, Nat. Photonics 11, 583 (2017).
[Crossref]

W. C. Y. Lo, M. Villiger, A. Golberg, G. F. Broelsch, S. Khan, C. G. Lian, W. G. Austen, M. Yarmush, and B. E. Bouma, J. Invest. Dermatol. 136, 84 (2016).
[Crossref]

N. Lippok, M. Villiger, and B. E. Bouma, Opt. Lett. 40, 3954 (2015).
[Crossref]

Braaf, B.

N. Lippok, B. Braaf, M. Villiger, W. Y. Oh, B. J. Vakoc, and B. E. Bouma, J. Biophoton. 12, e201800156 (2019).
[Crossref]

Broelsch, G. F.

W. C. Y. Lo, M. Villiger, A. Golberg, G. F. Broelsch, S. Khan, C. G. Lian, W. G. Austen, M. Yarmush, and B. E. Bouma, J. Invest. Dermatol. 136, 84 (2016).
[Crossref]

Chang, W.

D. Huang, E. A. Swanson, C. P. Lin, J. S. Schuman, W. G. Stinson, W. Chang, M. R. Hee, T. Flotte, K. Gregory, C. A. Puliafito, and J. G. Fujimoto, Science 254, 1178 (1991).
[Crossref]

Chung, K.

N. Lippok, M. Villiger, A. Albanese, E. F. J. Meijer, K. Chung, T. P. Padera, S. N. Bhatia, and B. E. Bouma, Nat. Photonics 11, 583 (2017).
[Crossref]

Daemen, J.

M. Villiger, K. Otsuka, A. Karanasos, P. Doradla, J. Ren, N. Lippok, M. Shishkov, J. Daemen, R. Diletti, R. J. van Geuns, F. Zijlstra, G. van Soest, P. Libby, E. Regar, S. K. Nadkarni, and B. E. Bouma, JACC Cardiovasc. Imaging 11, 1666 (2018).
[Crossref]

de Boer, J. F.

Diletti, R.

M. Villiger, K. Otsuka, A. Karanasos, P. Doradla, J. Ren, N. Lippok, M. Shishkov, J. Daemen, R. Diletti, R. J. van Geuns, F. Zijlstra, G. van Soest, P. Libby, E. Regar, S. K. Nadkarni, and B. E. Bouma, JACC Cardiovasc. Imaging 11, 1666 (2018).
[Crossref]

Doradla, P.

M. Villiger, K. Otsuka, A. Karanasos, P. Doradla, J. Ren, N. Lippok, M. Shishkov, J. Daemen, R. Diletti, R. J. van Geuns, F. Zijlstra, G. van Soest, P. Libby, E. Regar, S. K. Nadkarni, and B. E. Bouma, JACC Cardiovasc. Imaging 11, 1666 (2018).
[Crossref]

Dvoretzky, A.

A. Dvoretzky, J. Kiefer, and J. Wolfowitz, Ann. Math. Stat. 27, 642 (1956).
[Crossref]

Flotte, T.

D. Huang, E. A. Swanson, C. P. Lin, J. S. Schuman, W. G. Stinson, W. Chang, M. R. Hee, T. Flotte, K. Gregory, C. A. Puliafito, and J. G. Fujimoto, Science 254, 1178 (1991).
[Crossref]

Fujimoto, J. G.

M. R. Hee, E. A. Swanson, J. G. Fujimoto, and D. Huang, J. Opt. Soc. Am. B 9, 903 (1992).
[Crossref]

D. Huang, E. A. Swanson, C. P. Lin, J. S. Schuman, W. G. Stinson, W. Chang, M. R. Hee, T. Flotte, K. Gregory, C. A. Puliafito, and J. G. Fujimoto, Science 254, 1178 (1991).
[Crossref]

Geitzenauer, W.

Golberg, A.

W. C. Y. Lo, M. Villiger, A. Golberg, G. F. Broelsch, S. Khan, C. G. Lian, W. G. Austen, M. Yarmush, and B. E. Bouma, J. Invest. Dermatol. 136, 84 (2016).
[Crossref]

Goodman, J. W.

J. W. Goodman, Speckle Phenomena in Optics: Theory and Applications (W. H. Freeman, 2006).

Götzinger, E.

Gregory, K.

D. Huang, E. A. Swanson, C. P. Lin, J. S. Schuman, W. G. Stinson, W. Chang, M. R. Hee, T. Flotte, K. Gregory, C. A. Puliafito, and J. G. Fujimoto, Science 254, 1178 (1991).
[Crossref]

Hee, M. R.

M. R. Hee, E. A. Swanson, J. G. Fujimoto, and D. Huang, J. Opt. Soc. Am. B 9, 903 (1992).
[Crossref]

D. Huang, E. A. Swanson, C. P. Lin, J. S. Schuman, W. G. Stinson, W. Chang, M. R. Hee, T. Flotte, K. Gregory, C. A. Puliafito, and J. G. Fujimoto, Science 254, 1178 (1991).
[Crossref]

Hillman, T. R.

Hitzenberger, C. K.

Hong, Y.

Hong, Y.-J.

Huang, D.

M. R. Hee, E. A. Swanson, J. G. Fujimoto, and D. Huang, J. Opt. Soc. Am. B 9, 903 (1992).
[Crossref]

D. Huang, E. A. Swanson, C. P. Lin, J. S. Schuman, W. G. Stinson, W. Chang, M. R. Hee, T. Flotte, K. Gregory, C. A. Puliafito, and J. G. Fujimoto, Science 254, 1178 (1991).
[Crossref]

Kang, J.-H.

S.-W. Lee, J.-H. Kang, J.-Y. Yoo, M.-S. Kang, J.-T. Oh, and B.-M. Kim, J. Biomed. Opt. 13, 054032 (2008).
[Crossref]

Kang, M.-S.

S.-W. Lee, J.-H. Kang, J.-Y. Yoo, M.-S. Kang, J.-T. Oh, and B.-M. Kim, J. Biomed. Opt. 13, 054032 (2008).
[Crossref]

Karanasos, A.

M. Villiger, K. Otsuka, A. Karanasos, P. Doradla, J. Ren, N. Lippok, M. Shishkov, J. Daemen, R. Diletti, R. J. van Geuns, F. Zijlstra, G. van Soest, P. Libby, E. Regar, S. K. Nadkarni, and B. E. Bouma, JACC Cardiovasc. Imaging 11, 1666 (2018).
[Crossref]

Kasaragod, D.

Khan, S.

W. C. Y. Lo, M. Villiger, A. Golberg, G. F. Broelsch, S. Khan, C. G. Lian, W. G. Austen, M. Yarmush, and B. E. Bouma, J. Invest. Dermatol. 136, 84 (2016).
[Crossref]

Kiefer, J.

A. Dvoretzky, J. Kiefer, and J. Wolfowitz, Ann. Math. Stat. 27, 642 (1956).
[Crossref]

Kim, B.-M.

S.-W. Lee, J.-H. Kang, J.-Y. Yoo, M.-S. Kang, J.-T. Oh, and B.-M. Kim, J. Biomed. Opt. 13, 054032 (2008).
[Crossref]

Lee, S.-W.

S.-W. Lee, J.-H. Kang, J.-Y. Yoo, M.-S. Kang, J.-T. Oh, and B.-M. Kim, J. Biomed. Opt. 13, 054032 (2008).
[Crossref]

Lemij, H. G.

Lian, C. G.

W. C. Y. Lo, M. Villiger, A. Golberg, G. F. Broelsch, S. Khan, C. G. Lian, W. G. Austen, M. Yarmush, and B. E. Bouma, J. Invest. Dermatol. 136, 84 (2016).
[Crossref]

Libby, P.

M. Villiger, K. Otsuka, A. Karanasos, P. Doradla, J. Ren, N. Lippok, M. Shishkov, J. Daemen, R. Diletti, R. J. van Geuns, F. Zijlstra, G. van Soest, P. Libby, E. Regar, S. K. Nadkarni, and B. E. Bouma, JACC Cardiovasc. Imaging 11, 1666 (2018).
[Crossref]

Lin, C. P.

D. Huang, E. A. Swanson, C. P. Lin, J. S. Schuman, W. G. Stinson, W. Chang, M. R. Hee, T. Flotte, K. Gregory, C. A. Puliafito, and J. G. Fujimoto, Science 254, 1178 (1991).
[Crossref]

Lippok, N.

N. Lippok, B. Braaf, M. Villiger, W. Y. Oh, B. J. Vakoc, and B. E. Bouma, J. Biophoton. 12, e201800156 (2019).
[Crossref]

M. Villiger, K. Otsuka, A. Karanasos, P. Doradla, J. Ren, N. Lippok, M. Shishkov, J. Daemen, R. Diletti, R. J. van Geuns, F. Zijlstra, G. van Soest, P. Libby, E. Regar, S. K. Nadkarni, and B. E. Bouma, JACC Cardiovasc. Imaging 11, 1666 (2018).
[Crossref]

N. Lippok, M. Villiger, A. Albanese, E. F. J. Meijer, K. Chung, T. P. Padera, S. N. Bhatia, and B. E. Bouma, Nat. Photonics 11, 583 (2017).
[Crossref]

N. Lippok, M. Villiger, and B. E. Bouma, Opt. Lett. 40, 3954 (2015).
[Crossref]

Lo, W. C. Y.

W. C. Y. Lo, M. Villiger, A. Golberg, G. F. Broelsch, S. Khan, C. G. Lian, W. G. Austen, M. Yarmush, and B. E. Bouma, J. Invest. Dermatol. 136, 84 (2016).
[Crossref]

Makita, S.

Meijer, E. F. J.

N. Lippok, M. Villiger, A. Albanese, E. F. J. Meijer, K. Chung, T. P. Padera, S. N. Bhatia, and B. E. Bouma, Nat. Photonics 11, 583 (2017).
[Crossref]

Michels, S.

Milner, T. E.

Miura, M.

Mo, J.

Nadkarni, S. K.

M. Villiger, K. Otsuka, A. Karanasos, P. Doradla, J. Ren, N. Lippok, M. Shishkov, J. Daemen, R. Diletti, R. J. van Geuns, F. Zijlstra, G. van Soest, P. Libby, E. Regar, S. K. Nadkarni, and B. E. Bouma, JACC Cardiovasc. Imaging 11, 1666 (2018).
[Crossref]

Nelson, J. S.

Oh, J.-T.

S.-W. Lee, J.-H. Kang, J.-Y. Yoo, M.-S. Kang, J.-T. Oh, and B.-M. Kim, J. Biomed. Opt. 13, 054032 (2008).
[Crossref]

Oh, W. Y.

N. Lippok, B. Braaf, M. Villiger, W. Y. Oh, B. J. Vakoc, and B. E. Bouma, J. Biophoton. 12, e201800156 (2019).
[Crossref]

Otsuka, K.

M. Villiger, K. Otsuka, A. Karanasos, P. Doradla, J. Ren, N. Lippok, M. Shishkov, J. Daemen, R. Diletti, R. J. van Geuns, F. Zijlstra, G. van Soest, P. Libby, E. Regar, S. K. Nadkarni, and B. E. Bouma, JACC Cardiovasc. Imaging 11, 1666 (2018).
[Crossref]

Padera, T. P.

N. Lippok, M. Villiger, A. Albanese, E. F. J. Meijer, K. Chung, T. P. Padera, S. N. Bhatia, and B. E. Bouma, Nat. Photonics 11, 583 (2017).
[Crossref]

Pircher, M.

Puliafito, C. A.

D. Huang, E. A. Swanson, C. P. Lin, J. S. Schuman, W. G. Stinson, W. Chang, M. R. Hee, T. Flotte, K. Gregory, C. A. Puliafito, and J. G. Fujimoto, Science 254, 1178 (1991).
[Crossref]

Regar, E.

M. Villiger, K. Otsuka, A. Karanasos, P. Doradla, J. Ren, N. Lippok, M. Shishkov, J. Daemen, R. Diletti, R. J. van Geuns, F. Zijlstra, G. van Soest, P. Libby, E. Regar, S. K. Nadkarni, and B. E. Bouma, JACC Cardiovasc. Imaging 11, 1666 (2018).
[Crossref]

Ren, J.

M. Villiger, K. Otsuka, A. Karanasos, P. Doradla, J. Ren, N. Lippok, M. Shishkov, J. Daemen, R. Diletti, R. J. van Geuns, F. Zijlstra, G. van Soest, P. Libby, E. Regar, S. K. Nadkarni, and B. E. Bouma, JACC Cardiovasc. Imaging 11, 1666 (2018).
[Crossref]

Sampson, D. D.

Schmidt-Erfurth, U.

Schuman, J. S.

D. Huang, E. A. Swanson, C. P. Lin, J. S. Schuman, W. G. Stinson, W. Chang, M. R. Hee, T. Flotte, K. Gregory, C. A. Puliafito, and J. G. Fujimoto, Science 254, 1178 (1991).
[Crossref]

Shishkov, M.

M. Villiger, K. Otsuka, A. Karanasos, P. Doradla, J. Ren, N. Lippok, M. Shishkov, J. Daemen, R. Diletti, R. J. van Geuns, F. Zijlstra, G. van Soest, P. Libby, E. Regar, S. K. Nadkarni, and B. E. Bouma, JACC Cardiovasc. Imaging 11, 1666 (2018).
[Crossref]

Stinson, W. G.

D. Huang, E. A. Swanson, C. P. Lin, J. S. Schuman, W. G. Stinson, W. Chang, M. R. Hee, T. Flotte, K. Gregory, C. A. Puliafito, and J. G. Fujimoto, Science 254, 1178 (1991).
[Crossref]

Swanson, E. A.

M. R. Hee, E. A. Swanson, J. G. Fujimoto, and D. Huang, J. Opt. Soc. Am. B 9, 903 (1992).
[Crossref]

D. Huang, E. A. Swanson, C. P. Lin, J. S. Schuman, W. G. Stinson, W. Chang, M. R. Hee, T. Flotte, K. Gregory, C. A. Puliafito, and J. G. Fujimoto, Science 254, 1178 (1991).
[Crossref]

Vakoc, B. J.

N. Lippok, B. Braaf, M. Villiger, W. Y. Oh, B. J. Vakoc, and B. E. Bouma, J. Biophoton. 12, e201800156 (2019).
[Crossref]

van Gemert, M. J. C.

van Geuns, R. J.

M. Villiger, K. Otsuka, A. Karanasos, P. Doradla, J. Ren, N. Lippok, M. Shishkov, J. Daemen, R. Diletti, R. J. van Geuns, F. Zijlstra, G. van Soest, P. Libby, E. Regar, S. K. Nadkarni, and B. E. Bouma, JACC Cardiovasc. Imaging 11, 1666 (2018).
[Crossref]

van Soest, G.

M. Villiger, K. Otsuka, A. Karanasos, P. Doradla, J. Ren, N. Lippok, M. Shishkov, J. Daemen, R. Diletti, R. J. van Geuns, F. Zijlstra, G. van Soest, P. Libby, E. Regar, S. K. Nadkarni, and B. E. Bouma, JACC Cardiovasc. Imaging 11, 1666 (2018).
[Crossref]

Vermeer, K. A.

Villiger, M.

N. Lippok, B. Braaf, M. Villiger, W. Y. Oh, B. J. Vakoc, and B. E. Bouma, J. Biophoton. 12, e201800156 (2019).
[Crossref]

M. Villiger, K. Otsuka, A. Karanasos, P. Doradla, J. Ren, N. Lippok, M. Shishkov, J. Daemen, R. Diletti, R. J. van Geuns, F. Zijlstra, G. van Soest, P. Libby, E. Regar, S. K. Nadkarni, and B. E. Bouma, JACC Cardiovasc. Imaging 11, 1666 (2018).
[Crossref]

N. Lippok, M. Villiger, A. Albanese, E. F. J. Meijer, K. Chung, T. P. Padera, S. N. Bhatia, and B. E. Bouma, Nat. Photonics 11, 583 (2017).
[Crossref]

W. C. Y. Lo, M. Villiger, A. Golberg, G. F. Broelsch, S. Khan, C. G. Lian, W. G. Austen, M. Yarmush, and B. E. Bouma, J. Invest. Dermatol. 136, 84 (2016).
[Crossref]

N. Lippok, M. Villiger, and B. E. Bouma, Opt. Lett. 40, 3954 (2015).
[Crossref]

Weda, J. J. A.

Wolfowitz, J.

A. Dvoretzky, J. Kiefer, and J. Wolfowitz, Ann. Math. Stat. 27, 642 (1956).
[Crossref]

Yarmush, M.

W. C. Y. Lo, M. Villiger, A. Golberg, G. F. Broelsch, S. Khan, C. G. Lian, W. G. Austen, M. Yarmush, and B. E. Bouma, J. Invest. Dermatol. 136, 84 (2016).
[Crossref]

Yasuno, Y.

Yoo, J.-Y.

S.-W. Lee, J.-H. Kang, J.-Y. Yoo, M.-S. Kang, J.-T. Oh, and B.-M. Kim, J. Biomed. Opt. 13, 054032 (2008).
[Crossref]

Zijlstra, F.

M. Villiger, K. Otsuka, A. Karanasos, P. Doradla, J. Ren, N. Lippok, M. Shishkov, J. Daemen, R. Diletti, R. J. van Geuns, F. Zijlstra, G. van Soest, P. Libby, E. Regar, S. K. Nadkarni, and B. E. Bouma, JACC Cardiovasc. Imaging 11, 1666 (2018).
[Crossref]

Ann. Math. Stat. (1)

A. Dvoretzky, J. Kiefer, and J. Wolfowitz, Ann. Math. Stat. 27, 642 (1956).
[Crossref]

Biomed. Opt. Express (2)

J. Biomed. Opt. (1)

S.-W. Lee, J.-H. Kang, J.-Y. Yoo, M.-S. Kang, J.-T. Oh, and B.-M. Kim, J. Biomed. Opt. 13, 054032 (2008).
[Crossref]

J. Biophoton. (1)

N. Lippok, B. Braaf, M. Villiger, W. Y. Oh, B. J. Vakoc, and B. E. Bouma, J. Biophoton. 12, e201800156 (2019).
[Crossref]

J. Invest. Dermatol. (1)

W. C. Y. Lo, M. Villiger, A. Golberg, G. F. Broelsch, S. Khan, C. G. Lian, W. G. Austen, M. Yarmush, and B. E. Bouma, J. Invest. Dermatol. 136, 84 (2016).
[Crossref]

J. Opt. Soc. Am. B (1)

JACC Cardiovasc. Imaging (1)

M. Villiger, K. Otsuka, A. Karanasos, P. Doradla, J. Ren, N. Lippok, M. Shishkov, J. Daemen, R. Diletti, R. J. van Geuns, F. Zijlstra, G. van Soest, P. Libby, E. Regar, S. K. Nadkarni, and B. E. Bouma, JACC Cardiovasc. Imaging 11, 1666 (2018).
[Crossref]

Nat. Photonics (1)

N. Lippok, M. Villiger, A. Albanese, E. F. J. Meijer, K. Chung, T. P. Padera, S. N. Bhatia, and B. E. Bouma, Nat. Photonics 11, 583 (2017).
[Crossref]

Opt. Express (2)

Opt. Lett. (3)

Science (1)

D. Huang, E. A. Swanson, C. P. Lin, J. S. Schuman, W. G. Stinson, W. Chang, M. R. Hee, T. Flotte, K. Gregory, C. A. Puliafito, and J. G. Fujimoto, Science 254, 1178 (1991).
[Crossref]

Other (1)

J. W. Goodman, Speckle Phenomena in Optics: Theory and Applications (W. H. Freeman, 2006).

Cited By

OSA participates in Crossref's Cited-By Linking service. Citing articles from OSA journals and other participating publishers are listed here.

Alert me when this article is cited.


Figures (4)

Fig. 1.
Fig. 1. (a) Linear scale gamma PDF of increasing order of shown noise image. (b)  ${\rm Log}_e$ transformed data of increasing order, where ${{I}_1}$ is a single channel, ${{I}_2}$ is two channels, and ${{I}_4}$ is four incoherently summed channels. (c) Linear and (d) logarithmic scale PDFs in highly correlated (high DOPU) areas shown in the red ROI from an intralipid sample.
Fig. 2.
Fig. 2. (a) Histogram from a tomogram of noise (blocked sample arm) and normalized PDFs from channel ${{ I}_{{ \nu }2}}$ . (b) PDFs of the pixels remaining after DOPU filtering compared to the PDF of all pixels in the noise tomogram.
Fig. 3.
Fig. 3. (a) Tomogram and noise ROI (red). (b) Binary image of noise pixels identified after DOPU thresholding. (c) PDFs of all polarization channels and associated shape parameters $\alpha$ compared to the PDF of the pixels in the red ROI. (d) Histogram and normalized PDFs from channel ${{ I}_{{\nu }2}}$ . (e) Plot of $\alpha$ and the number of pixels remaining versus DOPU threshold. The shaded region is the standard deviation. Scale ${\rm bar} = 1 \;{\rm mm}$ .
Fig. 4.
Fig. 4. (a) Tomogram of coronary artery and atherosclerotic plaque imaged in vivo. (b) PDFs of polarization channels using DOPU thresholding compared to the red reference ROI. (c) Tomogram of retinal data taken in vivo, and (d) PDFs. (e) Tomogram of airway taken in vivo, and (f) PDFs. Scale bar: 1 mm. Color bar: dB scale for associated tomogram.

Equations (2)

Equations on this page are rendered with MathJax. Learn more.

p s ( I s ) = e α I s e e I s β β α Γ ( α ) ,
I = log e ( α β ) ,

Metrics