Abstract

Knowledge of the sequence of different conformational states of a protein molecule is key to better understanding its biological function. A diffraction pattern from a single conformational state can be captured with an ultrafast X-ray Free-Electron Laser (XFEL) before the target is completely annihilated by the radiation. In this paper, we report the first experimental demonstration of conformation sequence recovery using diffraction patterns from randomly ordered conformations of a non-periodic object using the dimensional reduction technique Isomap and coherent diffraction imaging.

© 2014 Optical Society of America

Full Article  |  PDF Article

References

  • View by:
  • |
  • |
  • |

  1. H. N. Chapman, “X-ray imaging beyond the limits,” Nat. Mater. 8(4), 299–301 (2009).
    [CrossRef] [PubMed]
  2. H. N. Chapman, A. Barty, M. J. Bogan, S. Boutet, M. Frank, S. P. Hau-Riege, S. Marchesini, B. W. Woods, S. Bajt, W. H. Benner, R. A. London, E. Plönjes, M. Kuhlmann, R. Treusch, S. Düsterer, T. Tschentscher, J. R. Schneider, E. Spiller, T. Möller, C. Bostedt, M. Hoener, D. A. Shapiro, K. O. Hodgson, D. van der Spoel, F. Burmeister, M. Bergh, C. Caleman, G. Huldt, M. M. Seibert, F. R. N. C. Maia, R. W. Lee, A. Szöke, N. Timneanu, J. Hajdu, “Femtosecond diffractive imaging with a soft-X-ray free-electron laser,” Nat. Phys. 2(12), 839–843 (2006).
    [CrossRef]
  3. R. Neutze, R. Wouts, D. van der Spoel, E. Weckert, J. Hajdu, “Potential for biomolecular imaging with femtosecond X-ray pulses,” Nature 406(6797), 752–757 (2000).
    [CrossRef] [PubMed]
  4. B. Ziaja, N. Medvedev, “Modelling ultrafast transitions within laser-irradiated solids,” High Energy Density Phys. 8(1), 18–29 (2012).
    [CrossRef]
  5. M. M. Seibert, T. Ekeberg, F. R. N. C. Maia, M. Svenda, J. Andreasson, O. Jönsson, D. Odić, B. Iwan, A. Rocker, D. Westphal, M. Hantke, D. P. DePonte, A. Barty, J. Schulz, L. Gumprecht, N. Coppola, A. Aquila, M. Liang, T. A. White, A. Martin, C. Caleman, S. Stern, C. Abergel, V. Seltzer, J. M. Claverie, C. Bostedt, J. D. Bozek, S. Boutet, A. A. Miahnahri, M. Messerschmidt, J. Krzywinski, G. Williams, K. O. Hodgson, M. J. Bogan, C. Y. Hampton, R. G. Sierra, D. Starodub, I. Andersson, S. Bajt, M. Barthelmess, J. C. H. Spence, P. Fromme, U. Weierstall, R. Kirian, M. Hunter, R. B. Doak, S. Marchesini, S. P. Hau-Riege, M. Frank, R. L. Shoeman, L. Lomb, S. W. Epp, R. Hartmann, D. Rolles, A. Rudenko, C. Schmidt, L. Foucar, N. Kimmel, P. Holl, B. Rudek, B. Erk, A. Hömke, C. Reich, D. Pietschner, G. Weidenspointner, L. Strüder, G. Hauser, H. Gorke, J. Ullrich, I. Schlichting, S. Herrmann, G. Schaller, F. Schopper, H. Soltau, K. U. Kühnel, R. Andritschke, C. D. Schröter, F. Krasniqi, M. Bott, S. Schorb, D. Rupp, M. Adolph, T. Gorkhover, H. Hirsemann, G. Potdevin, H. Graafsma, B. Nilsson, H. N. Chapman, J. Hajdu, “Single mimivirus particles intercepted and imaged with an X-ray laser,” Nature 470(7332), 78–81 (2011).
    [CrossRef] [PubMed]
  6. M. J. Bogan, D. Starodub, C. Y. Hampton, R. G. Sierra, “Single-particle coherent diffractive imaging with a soft x-ray free electron laser: towards soot aerosol morphology,” J. Phys. At. Mol. Opt. Phys. 43(19), 194013 (2010).
    [CrossRef]
  7. A. P. Mancuso, T. Gorniak, F. Staier, O. M. Yefanov, R. Barth, C. Christophis, B. Reime, J. Gulden, A. Singer, M. E. Pettit, T. Nisius, T. Wilhein, C. Gutt, G. Grübel, N. Guerassimova, R. Treusch, J. Feldhaus, S. Eisebitt, E. Weckert, M. Grunze, A. Rosenhahn, I. A. Vartanyants, “Coherent imaging of biological samples with femtosecond pulses at the free-electron laser FLASH,” New J. Phys. 12(3), 035003 (2010).
    [CrossRef]
  8. L. Redecke, K. Nass, D. P. DePonte, T. A. White, D. Rehders, A. Barty, F. Stellato, M. Liang, T. R. M. Barends, S. Boutet, G. J. Williams, M. Messerschmidt, M. M. Seibert, A. Aquila, D. Arnlund, S. Bajt, T. Barth, M. J. Bogan, C. Caleman, T. C. Chao, R. B. Doak, H. Fleckenstein, M. Frank, R. Fromme, L. Galli, I. Grotjohann, M. S. Hunter, L. C. Johansson, S. Kassemeyer, G. Katona, R. A. Kirian, R. Koopmann, C. Kupitz, L. Lomb, A. V. Martin, S. Mogk, R. Neutze, R. L. Shoeman, J. Steinbrener, N. Timneanu, D. Wang, U. Weierstall, N. A. Zatsepin, J. C. H. Spence, P. Fromme, I. Schlichting, M. Duszenko, C. Betzel, H. N. Chapman, “Natively inhibited Trypanosoma brucei Cathepsin B structure determined by using an X-ray laser,” Science 339(6116), 227–230 (2013).
    [CrossRef] [PubMed]
  9. S. Boutet, L. Lomb, G. J. Williams, T. R. M. Barends, A. Aquila, R. B. Doak, U. Weierstall, D. P. DePonte, J. Steinbrener, R. L. Shoeman, M. Messerschmidt, A. Barty, T. A. White, S. Kassemeyer, R. A. Kirian, M. M. Seibert, P. A. Montanez, C. Kenney, R. Herbst, P. Hart, J. Pines, G. Haller, S. M. Gruner, H. T. Philipp, M. W. Tate, M. Hromalik, L. J. Koerner, N. van Bakel, J. Morse, W. Ghonsalves, D. Arnlund, M. J. Bogan, C. Caleman, R. Fromme, C. Y. Hampton, M. S. Hunter, L. C. Johansson, G. Katona, C. Kupitz, M. Liang, A. V. Martin, K. Nass, L. Redecke, F. Stellato, N. Timneanu, D. Wang, N. A. Zatsepin, D. Schafer, J. Defever, R. Neutze, P. Fromme, J. C. H. Spence, H. N. Chapman, I. Schlichting, “High-resolution protein structure determination by serial femtosecond crystallography,” Science 337(6092), 362–364 (2012).
    [CrossRef] [PubMed]
  10. J. Kern, R. Alonso-Mori, R. Tran, J. Hattne, R. J. Gildea, N. Echols, C. Glöckner, J. Hellmich, H. Laksmono, R. G. Sierra, B. Lassalle-Kaiser, S. Koroidov, A. Lampe, G. Han, S. Gul, D. Difiore, D. Milathianaki, A. R. Fry, A. Miahnahri, D. W. Schafer, M. Messerschmidt, M. M. Seibert, J. E. Koglin, D. Sokaras, T. C. Weng, J. Sellberg, M. J. Latimer, R. W. Grosse-Kunstleve, P. H. Zwart, W. E. White, P. Glatzel, P. D. Adams, M. J. Bogan, G. J. Williams, S. Boutet, J. Messinger, A. Zouni, N. K. Sauter, V. K. Yachandra, U. Bergmann, J. Yano, “Simultaneous femtosecond X-ray spectroscopy and diffraction of photosystem II at room temperature,” Science 340(6131), 491–495 (2013).
    [CrossRef] [PubMed]
  11. P. A. Penczek, M. Kimmel, C. M. T. Spahn, “Identifying conformational states of macromolecules by eigen-analysis of resampled cryo-EM images,” Structure 19(11), 1582–1590 (2011).
    [CrossRef] [PubMed]
  12. S. H. W. Scheres, H. Gao, M. Valle, G. T. Herman, P. P. B. Eggermont, J. Frank, J. M. Carazo, “Disentangling conformational states of macromolecules in 3D-EM through likelihood optimization,” Nat. Methods 4(1), 27–29 (2007).
    [CrossRef] [PubMed]
  13. P. Schwander, R. Fung, G. N. Phillips, A. Ourmazd, “Mapping the conformations of biological assemblies,” New J. Phys. 12(3), 035007 (2010).
    [CrossRef]
  14. P. Schwander, D. Giannakis, C. H. Yoon, A. Ourmazd, “The symmetries of image formation by scattering. II. Applications,” Opt. Express 20(12), 12827–12849 (2012).
    [CrossRef] [PubMed]
  15. C. H. Yoon, P. Schwander, C. Abergel, I. Andersson, J. Andreasson, A. Aquila, S. Bajt, M. Barthelmess, A. Barty, M. J. Bogan, C. Bostedt, J. Bozek, H. N. Chapman, J. M. Claverie, N. Coppola, D. P. DePonte, T. Ekeberg, S. W. Epp, B. Erk, H. Fleckenstein, L. Foucar, H. Graafsma, L. Gumprecht, J. Hajdu, C. Y. Hampton, A. Hartmann, E. Hartmann, R. Hartmann, G. Hauser, H. Hirsemann, P. Holl, S. Kassemeyer, N. Kimmel, M. Kiskinova, M. Liang, N. T. D. Loh, L. Lomb, F. R. N. C. Maia, A. V. Martin, K. Nass, E. Pedersoli, C. Reich, D. Rolles, B. Rudek, A. Rudenko, I. Schlichting, J. Schulz, M. Seibert, V. Seltzer, R. L. Shoeman, R. G. Sierra, H. Soltau, D. Starodub, J. Steinbrener, G. Stier, L. Strüder, M. Svenda, J. Ullrich, G. Weidenspointner, T. A. White, C. Wunderer, A. Ourmazd, “Unsupervised classification of single-particle X-ray diffraction snapshots by spectral clustering,” Opt. Express 19(17), 16542–16549 (2011).
    [CrossRef] [PubMed]
  16. J. B. Tenenbaum, V. de Silva, J. C. Langford, “A global geometric framework for nonlinear dimensionality reduction,” Science 290(5500), 2319–2323 (2000).
    [CrossRef] [PubMed]
  17. E. Allaria, R. Appio, L. Badano, W. A. Barletta, S. Bassanese, S. G. Biedron, A. Borga, E. Busetto, D. Castronovo, P. Cinquegrana, S. Cleva, D. Cocco, M. Cornacchia, P. Craievich, I. Cudin, G. D’Auria, M. Dal Forno, M. B. Danailov, R. De Monte, G. De Ninno, P. Delgiusto, A. Demidovich, S. Di Mitri, B. Diviacco, A. Fabris, R. Fabris, W. Fawley, M. Ferianis, E. Ferrari, S. Ferry, L. Froehlich, P. Furlan, G. Gaio, F. Gelmetti, L. Giannessi, M. Giannini, R. Gobessi, R. Ivanov, E. Karantzoulis, M. Lonza, A. Lutman, B. Mahieu, M. Milloch, S. V. Milton, M. Musardo, I. Nikolov, S. Noe, F. Parmigiani, G. Penco, M. Petronio, L. Pivetta, M. Predonzani, F. Rossi, L. Rumiz, A. Salom, C. Scafuri, C. Serpico, P. Sigalotti, S. Spampinati, C. Spezzani, M. Svandrlik, C. Svetina, S. Tazzari, M. Trovo, R. Umer, A. Vascotto, M. Veronese, R. Visintini, M. Zaccaria, D. Zangrando, M. Zangrando, “Highly coherent and stable pulses from the FERMI seeded free-electron laser in the extreme ultraviolet,” Nat. Photonics 6(10), 699–704 (2012).
    [CrossRef]
  18. F. Capotondi, E. Pedersoli, N. Mahne, R. H. Menk, G. Passos, L. Raimondi, C. Svetina, G. Sandrin, M. Zangrando, M. Kiskinova, S. Bajt, M. Barthelmess, H. Fleckenstein, H. N. Chapman, J. Schulz, J. Bach, R. Frömter, S. Schleitzer, L. Müller, C. Gutt, G. Grübel, “Invited article: Coherent imaging using seeded free-electron laser pulses with variable polarization: First results and research opportunities,” Rev. Sci. Instrum. 84(5), 051301 (2013).
    [CrossRef] [PubMed]
  19. en.wikipedia.org/wiki/File:Muybridge_race_horse_animated.gif .
  20. I. McNulty, J. Kirz, C. Jacobsen, E. H. Anderson, M. R. Howells, D. P. Kern, “High-resolution imaging by Fourier transform X-ray holography,” Science 256(5059), 1009–1012 (1992).
    [CrossRef] [PubMed]
  21. N. Davidson, “NADIA Software Project Page,” http://cxscode.ph.unimelb.edu.au/ .
  22. J. R. Fienup, “Phase retrieval algorithms: a comparison,” Appl. Opt. 21(15), 2758–2769 (1982).
    [CrossRef] [PubMed]
  23. S. Marchesini, H. He, H. N. Chapman, S. P. Hau-Riege, A. Noy, M. R. Howells, U. Weierstall, J. C. H. Spence, “X-ray image reconstruction from a diffraction pattern alone,” Phys. Rev. B 68(14), 140101 (2003).
    [CrossRef]
  24. H. N. Chapman, A. Barty, S. Marchesini, A. Noy, S. P. Hau-Riege, C. Cui, M. R. Howells, R. Rosen, H. He, J. C. H. Spence, U. Weierstall, T. Beetz, C. Jacobsen, D. Shapiro, “High-resolution ab initio three-dimensional x-ray diffraction microscopy,” J. Opt. Soc. Am. A 23(5), 1179 (2006).
    [CrossRef]
  25. K. V. Mardia, J. T. Kent, and J. M. Bibby, Multivariate Analysis (Academic, 1979).

2013 (3)

L. Redecke, K. Nass, D. P. DePonte, T. A. White, D. Rehders, A. Barty, F. Stellato, M. Liang, T. R. M. Barends, S. Boutet, G. J. Williams, M. Messerschmidt, M. M. Seibert, A. Aquila, D. Arnlund, S. Bajt, T. Barth, M. J. Bogan, C. Caleman, T. C. Chao, R. B. Doak, H. Fleckenstein, M. Frank, R. Fromme, L. Galli, I. Grotjohann, M. S. Hunter, L. C. Johansson, S. Kassemeyer, G. Katona, R. A. Kirian, R. Koopmann, C. Kupitz, L. Lomb, A. V. Martin, S. Mogk, R. Neutze, R. L. Shoeman, J. Steinbrener, N. Timneanu, D. Wang, U. Weierstall, N. A. Zatsepin, J. C. H. Spence, P. Fromme, I. Schlichting, M. Duszenko, C. Betzel, H. N. Chapman, “Natively inhibited Trypanosoma brucei Cathepsin B structure determined by using an X-ray laser,” Science 339(6116), 227–230 (2013).
[CrossRef] [PubMed]

J. Kern, R. Alonso-Mori, R. Tran, J. Hattne, R. J. Gildea, N. Echols, C. Glöckner, J. Hellmich, H. Laksmono, R. G. Sierra, B. Lassalle-Kaiser, S. Koroidov, A. Lampe, G. Han, S. Gul, D. Difiore, D. Milathianaki, A. R. Fry, A. Miahnahri, D. W. Schafer, M. Messerschmidt, M. M. Seibert, J. E. Koglin, D. Sokaras, T. C. Weng, J. Sellberg, M. J. Latimer, R. W. Grosse-Kunstleve, P. H. Zwart, W. E. White, P. Glatzel, P. D. Adams, M. J. Bogan, G. J. Williams, S. Boutet, J. Messinger, A. Zouni, N. K. Sauter, V. K. Yachandra, U. Bergmann, J. Yano, “Simultaneous femtosecond X-ray spectroscopy and diffraction of photosystem II at room temperature,” Science 340(6131), 491–495 (2013).
[CrossRef] [PubMed]

F. Capotondi, E. Pedersoli, N. Mahne, R. H. Menk, G. Passos, L. Raimondi, C. Svetina, G. Sandrin, M. Zangrando, M. Kiskinova, S. Bajt, M. Barthelmess, H. Fleckenstein, H. N. Chapman, J. Schulz, J. Bach, R. Frömter, S. Schleitzer, L. Müller, C. Gutt, G. Grübel, “Invited article: Coherent imaging using seeded free-electron laser pulses with variable polarization: First results and research opportunities,” Rev. Sci. Instrum. 84(5), 051301 (2013).
[CrossRef] [PubMed]

2012 (4)

E. Allaria, R. Appio, L. Badano, W. A. Barletta, S. Bassanese, S. G. Biedron, A. Borga, E. Busetto, D. Castronovo, P. Cinquegrana, S. Cleva, D. Cocco, M. Cornacchia, P. Craievich, I. Cudin, G. D’Auria, M. Dal Forno, M. B. Danailov, R. De Monte, G. De Ninno, P. Delgiusto, A. Demidovich, S. Di Mitri, B. Diviacco, A. Fabris, R. Fabris, W. Fawley, M. Ferianis, E. Ferrari, S. Ferry, L. Froehlich, P. Furlan, G. Gaio, F. Gelmetti, L. Giannessi, M. Giannini, R. Gobessi, R. Ivanov, E. Karantzoulis, M. Lonza, A. Lutman, B. Mahieu, M. Milloch, S. V. Milton, M. Musardo, I. Nikolov, S. Noe, F. Parmigiani, G. Penco, M. Petronio, L. Pivetta, M. Predonzani, F. Rossi, L. Rumiz, A. Salom, C. Scafuri, C. Serpico, P. Sigalotti, S. Spampinati, C. Spezzani, M. Svandrlik, C. Svetina, S. Tazzari, M. Trovo, R. Umer, A. Vascotto, M. Veronese, R. Visintini, M. Zaccaria, D. Zangrando, M. Zangrando, “Highly coherent and stable pulses from the FERMI seeded free-electron laser in the extreme ultraviolet,” Nat. Photonics 6(10), 699–704 (2012).
[CrossRef]

P. Schwander, D. Giannakis, C. H. Yoon, A. Ourmazd, “The symmetries of image formation by scattering. II. Applications,” Opt. Express 20(12), 12827–12849 (2012).
[CrossRef] [PubMed]

S. Boutet, L. Lomb, G. J. Williams, T. R. M. Barends, A. Aquila, R. B. Doak, U. Weierstall, D. P. DePonte, J. Steinbrener, R. L. Shoeman, M. Messerschmidt, A. Barty, T. A. White, S. Kassemeyer, R. A. Kirian, M. M. Seibert, P. A. Montanez, C. Kenney, R. Herbst, P. Hart, J. Pines, G. Haller, S. M. Gruner, H. T. Philipp, M. W. Tate, M. Hromalik, L. J. Koerner, N. van Bakel, J. Morse, W. Ghonsalves, D. Arnlund, M. J. Bogan, C. Caleman, R. Fromme, C. Y. Hampton, M. S. Hunter, L. C. Johansson, G. Katona, C. Kupitz, M. Liang, A. V. Martin, K. Nass, L. Redecke, F. Stellato, N. Timneanu, D. Wang, N. A. Zatsepin, D. Schafer, J. Defever, R. Neutze, P. Fromme, J. C. H. Spence, H. N. Chapman, I. Schlichting, “High-resolution protein structure determination by serial femtosecond crystallography,” Science 337(6092), 362–364 (2012).
[CrossRef] [PubMed]

B. Ziaja, N. Medvedev, “Modelling ultrafast transitions within laser-irradiated solids,” High Energy Density Phys. 8(1), 18–29 (2012).
[CrossRef]

2011 (3)

M. M. Seibert, T. Ekeberg, F. R. N. C. Maia, M. Svenda, J. Andreasson, O. Jönsson, D. Odić, B. Iwan, A. Rocker, D. Westphal, M. Hantke, D. P. DePonte, A. Barty, J. Schulz, L. Gumprecht, N. Coppola, A. Aquila, M. Liang, T. A. White, A. Martin, C. Caleman, S. Stern, C. Abergel, V. Seltzer, J. M. Claverie, C. Bostedt, J. D. Bozek, S. Boutet, A. A. Miahnahri, M. Messerschmidt, J. Krzywinski, G. Williams, K. O. Hodgson, M. J. Bogan, C. Y. Hampton, R. G. Sierra, D. Starodub, I. Andersson, S. Bajt, M. Barthelmess, J. C. H. Spence, P. Fromme, U. Weierstall, R. Kirian, M. Hunter, R. B. Doak, S. Marchesini, S. P. Hau-Riege, M. Frank, R. L. Shoeman, L. Lomb, S. W. Epp, R. Hartmann, D. Rolles, A. Rudenko, C. Schmidt, L. Foucar, N. Kimmel, P. Holl, B. Rudek, B. Erk, A. Hömke, C. Reich, D. Pietschner, G. Weidenspointner, L. Strüder, G. Hauser, H. Gorke, J. Ullrich, I. Schlichting, S. Herrmann, G. Schaller, F. Schopper, H. Soltau, K. U. Kühnel, R. Andritschke, C. D. Schröter, F. Krasniqi, M. Bott, S. Schorb, D. Rupp, M. Adolph, T. Gorkhover, H. Hirsemann, G. Potdevin, H. Graafsma, B. Nilsson, H. N. Chapman, J. Hajdu, “Single mimivirus particles intercepted and imaged with an X-ray laser,” Nature 470(7332), 78–81 (2011).
[CrossRef] [PubMed]

C. H. Yoon, P. Schwander, C. Abergel, I. Andersson, J. Andreasson, A. Aquila, S. Bajt, M. Barthelmess, A. Barty, M. J. Bogan, C. Bostedt, J. Bozek, H. N. Chapman, J. M. Claverie, N. Coppola, D. P. DePonte, T. Ekeberg, S. W. Epp, B. Erk, H. Fleckenstein, L. Foucar, H. Graafsma, L. Gumprecht, J. Hajdu, C. Y. Hampton, A. Hartmann, E. Hartmann, R. Hartmann, G. Hauser, H. Hirsemann, P. Holl, S. Kassemeyer, N. Kimmel, M. Kiskinova, M. Liang, N. T. D. Loh, L. Lomb, F. R. N. C. Maia, A. V. Martin, K. Nass, E. Pedersoli, C. Reich, D. Rolles, B. Rudek, A. Rudenko, I. Schlichting, J. Schulz, M. Seibert, V. Seltzer, R. L. Shoeman, R. G. Sierra, H. Soltau, D. Starodub, J. Steinbrener, G. Stier, L. Strüder, M. Svenda, J. Ullrich, G. Weidenspointner, T. A. White, C. Wunderer, A. Ourmazd, “Unsupervised classification of single-particle X-ray diffraction snapshots by spectral clustering,” Opt. Express 19(17), 16542–16549 (2011).
[CrossRef] [PubMed]

P. A. Penczek, M. Kimmel, C. M. T. Spahn, “Identifying conformational states of macromolecules by eigen-analysis of resampled cryo-EM images,” Structure 19(11), 1582–1590 (2011).
[CrossRef] [PubMed]

2010 (3)

P. Schwander, R. Fung, G. N. Phillips, A. Ourmazd, “Mapping the conformations of biological assemblies,” New J. Phys. 12(3), 035007 (2010).
[CrossRef]

M. J. Bogan, D. Starodub, C. Y. Hampton, R. G. Sierra, “Single-particle coherent diffractive imaging with a soft x-ray free electron laser: towards soot aerosol morphology,” J. Phys. At. Mol. Opt. Phys. 43(19), 194013 (2010).
[CrossRef]

A. P. Mancuso, T. Gorniak, F. Staier, O. M. Yefanov, R. Barth, C. Christophis, B. Reime, J. Gulden, A. Singer, M. E. Pettit, T. Nisius, T. Wilhein, C. Gutt, G. Grübel, N. Guerassimova, R. Treusch, J. Feldhaus, S. Eisebitt, E. Weckert, M. Grunze, A. Rosenhahn, I. A. Vartanyants, “Coherent imaging of biological samples with femtosecond pulses at the free-electron laser FLASH,” New J. Phys. 12(3), 035003 (2010).
[CrossRef]

2009 (1)

H. N. Chapman, “X-ray imaging beyond the limits,” Nat. Mater. 8(4), 299–301 (2009).
[CrossRef] [PubMed]

2007 (1)

S. H. W. Scheres, H. Gao, M. Valle, G. T. Herman, P. P. B. Eggermont, J. Frank, J. M. Carazo, “Disentangling conformational states of macromolecules in 3D-EM through likelihood optimization,” Nat. Methods 4(1), 27–29 (2007).
[CrossRef] [PubMed]

2006 (2)

H. N. Chapman, A. Barty, M. J. Bogan, S. Boutet, M. Frank, S. P. Hau-Riege, S. Marchesini, B. W. Woods, S. Bajt, W. H. Benner, R. A. London, E. Plönjes, M. Kuhlmann, R. Treusch, S. Düsterer, T. Tschentscher, J. R. Schneider, E. Spiller, T. Möller, C. Bostedt, M. Hoener, D. A. Shapiro, K. O. Hodgson, D. van der Spoel, F. Burmeister, M. Bergh, C. Caleman, G. Huldt, M. M. Seibert, F. R. N. C. Maia, R. W. Lee, A. Szöke, N. Timneanu, J. Hajdu, “Femtosecond diffractive imaging with a soft-X-ray free-electron laser,” Nat. Phys. 2(12), 839–843 (2006).
[CrossRef]

H. N. Chapman, A. Barty, S. Marchesini, A. Noy, S. P. Hau-Riege, C. Cui, M. R. Howells, R. Rosen, H. He, J. C. H. Spence, U. Weierstall, T. Beetz, C. Jacobsen, D. Shapiro, “High-resolution ab initio three-dimensional x-ray diffraction microscopy,” J. Opt. Soc. Am. A 23(5), 1179 (2006).
[CrossRef]

2003 (1)

S. Marchesini, H. He, H. N. Chapman, S. P. Hau-Riege, A. Noy, M. R. Howells, U. Weierstall, J. C. H. Spence, “X-ray image reconstruction from a diffraction pattern alone,” Phys. Rev. B 68(14), 140101 (2003).
[CrossRef]

2000 (2)

R. Neutze, R. Wouts, D. van der Spoel, E. Weckert, J. Hajdu, “Potential for biomolecular imaging with femtosecond X-ray pulses,” Nature 406(6797), 752–757 (2000).
[CrossRef] [PubMed]

J. B. Tenenbaum, V. de Silva, J. C. Langford, “A global geometric framework for nonlinear dimensionality reduction,” Science 290(5500), 2319–2323 (2000).
[CrossRef] [PubMed]

1992 (1)

I. McNulty, J. Kirz, C. Jacobsen, E. H. Anderson, M. R. Howells, D. P. Kern, “High-resolution imaging by Fourier transform X-ray holography,” Science 256(5059), 1009–1012 (1992).
[CrossRef] [PubMed]

1982 (1)

Abergel, C.

M. M. Seibert, T. Ekeberg, F. R. N. C. Maia, M. Svenda, J. Andreasson, O. Jönsson, D. Odić, B. Iwan, A. Rocker, D. Westphal, M. Hantke, D. P. DePonte, A. Barty, J. Schulz, L. Gumprecht, N. Coppola, A. Aquila, M. Liang, T. A. White, A. Martin, C. Caleman, S. Stern, C. Abergel, V. Seltzer, J. M. Claverie, C. Bostedt, J. D. Bozek, S. Boutet, A. A. Miahnahri, M. Messerschmidt, J. Krzywinski, G. Williams, K. O. Hodgson, M. J. Bogan, C. Y. Hampton, R. G. Sierra, D. Starodub, I. Andersson, S. Bajt, M. Barthelmess, J. C. H. Spence, P. Fromme, U. Weierstall, R. Kirian, M. Hunter, R. B. Doak, S. Marchesini, S. P. Hau-Riege, M. Frank, R. L. Shoeman, L. Lomb, S. W. Epp, R. Hartmann, D. Rolles, A. Rudenko, C. Schmidt, L. Foucar, N. Kimmel, P. Holl, B. Rudek, B. Erk, A. Hömke, C. Reich, D. Pietschner, G. Weidenspointner, L. Strüder, G. Hauser, H. Gorke, J. Ullrich, I. Schlichting, S. Herrmann, G. Schaller, F. Schopper, H. Soltau, K. U. Kühnel, R. Andritschke, C. D. Schröter, F. Krasniqi, M. Bott, S. Schorb, D. Rupp, M. Adolph, T. Gorkhover, H. Hirsemann, G. Potdevin, H. Graafsma, B. Nilsson, H. N. Chapman, J. Hajdu, “Single mimivirus particles intercepted and imaged with an X-ray laser,” Nature 470(7332), 78–81 (2011).
[CrossRef] [PubMed]

C. H. Yoon, P. Schwander, C. Abergel, I. Andersson, J. Andreasson, A. Aquila, S. Bajt, M. Barthelmess, A. Barty, M. J. Bogan, C. Bostedt, J. Bozek, H. N. Chapman, J. M. Claverie, N. Coppola, D. P. DePonte, T. Ekeberg, S. W. Epp, B. Erk, H. Fleckenstein, L. Foucar, H. Graafsma, L. Gumprecht, J. Hajdu, C. Y. Hampton, A. Hartmann, E. Hartmann, R. Hartmann, G. Hauser, H. Hirsemann, P. Holl, S. Kassemeyer, N. Kimmel, M. Kiskinova, M. Liang, N. T. D. Loh, L. Lomb, F. R. N. C. Maia, A. V. Martin, K. Nass, E. Pedersoli, C. Reich, D. Rolles, B. Rudek, A. Rudenko, I. Schlichting, J. Schulz, M. Seibert, V. Seltzer, R. L. Shoeman, R. G. Sierra, H. Soltau, D. Starodub, J. Steinbrener, G. Stier, L. Strüder, M. Svenda, J. Ullrich, G. Weidenspointner, T. A. White, C. Wunderer, A. Ourmazd, “Unsupervised classification of single-particle X-ray diffraction snapshots by spectral clustering,” Opt. Express 19(17), 16542–16549 (2011).
[CrossRef] [PubMed]

Adams, P. D.

J. Kern, R. Alonso-Mori, R. Tran, J. Hattne, R. J. Gildea, N. Echols, C. Glöckner, J. Hellmich, H. Laksmono, R. G. Sierra, B. Lassalle-Kaiser, S. Koroidov, A. Lampe, G. Han, S. Gul, D. Difiore, D. Milathianaki, A. R. Fry, A. Miahnahri, D. W. Schafer, M. Messerschmidt, M. M. Seibert, J. E. Koglin, D. Sokaras, T. C. Weng, J. Sellberg, M. J. Latimer, R. W. Grosse-Kunstleve, P. H. Zwart, W. E. White, P. Glatzel, P. D. Adams, M. J. Bogan, G. J. Williams, S. Boutet, J. Messinger, A. Zouni, N. K. Sauter, V. K. Yachandra, U. Bergmann, J. Yano, “Simultaneous femtosecond X-ray spectroscopy and diffraction of photosystem II at room temperature,” Science 340(6131), 491–495 (2013).
[CrossRef] [PubMed]

Adolph, M.

M. M. Seibert, T. Ekeberg, F. R. N. C. Maia, M. Svenda, J. Andreasson, O. Jönsson, D. Odić, B. Iwan, A. Rocker, D. Westphal, M. Hantke, D. P. DePonte, A. Barty, J. Schulz, L. Gumprecht, N. Coppola, A. Aquila, M. Liang, T. A. White, A. Martin, C. Caleman, S. Stern, C. Abergel, V. Seltzer, J. M. Claverie, C. Bostedt, J. D. Bozek, S. Boutet, A. A. Miahnahri, M. Messerschmidt, J. Krzywinski, G. Williams, K. O. Hodgson, M. J. Bogan, C. Y. Hampton, R. G. Sierra, D. Starodub, I. Andersson, S. Bajt, M. Barthelmess, J. C. H. Spence, P. Fromme, U. Weierstall, R. Kirian, M. Hunter, R. B. Doak, S. Marchesini, S. P. Hau-Riege, M. Frank, R. L. Shoeman, L. Lomb, S. W. Epp, R. Hartmann, D. Rolles, A. Rudenko, C. Schmidt, L. Foucar, N. Kimmel, P. Holl, B. Rudek, B. Erk, A. Hömke, C. Reich, D. Pietschner, G. Weidenspointner, L. Strüder, G. Hauser, H. Gorke, J. Ullrich, I. Schlichting, S. Herrmann, G. Schaller, F. Schopper, H. Soltau, K. U. Kühnel, R. Andritschke, C. D. Schröter, F. Krasniqi, M. Bott, S. Schorb, D. Rupp, M. Adolph, T. Gorkhover, H. Hirsemann, G. Potdevin, H. Graafsma, B. Nilsson, H. N. Chapman, J. Hajdu, “Single mimivirus particles intercepted and imaged with an X-ray laser,” Nature 470(7332), 78–81 (2011).
[CrossRef] [PubMed]

Allaria, E.

E. Allaria, R. Appio, L. Badano, W. A. Barletta, S. Bassanese, S. G. Biedron, A. Borga, E. Busetto, D. Castronovo, P. Cinquegrana, S. Cleva, D. Cocco, M. Cornacchia, P. Craievich, I. Cudin, G. D’Auria, M. Dal Forno, M. B. Danailov, R. De Monte, G. De Ninno, P. Delgiusto, A. Demidovich, S. Di Mitri, B. Diviacco, A. Fabris, R. Fabris, W. Fawley, M. Ferianis, E. Ferrari, S. Ferry, L. Froehlich, P. Furlan, G. Gaio, F. Gelmetti, L. Giannessi, M. Giannini, R. Gobessi, R. Ivanov, E. Karantzoulis, M. Lonza, A. Lutman, B. Mahieu, M. Milloch, S. V. Milton, M. Musardo, I. Nikolov, S. Noe, F. Parmigiani, G. Penco, M. Petronio, L. Pivetta, M. Predonzani, F. Rossi, L. Rumiz, A. Salom, C. Scafuri, C. Serpico, P. Sigalotti, S. Spampinati, C. Spezzani, M. Svandrlik, C. Svetina, S. Tazzari, M. Trovo, R. Umer, A. Vascotto, M. Veronese, R. Visintini, M. Zaccaria, D. Zangrando, M. Zangrando, “Highly coherent and stable pulses from the FERMI seeded free-electron laser in the extreme ultraviolet,” Nat. Photonics 6(10), 699–704 (2012).
[CrossRef]

Alonso-Mori, R.

J. Kern, R. Alonso-Mori, R. Tran, J. Hattne, R. J. Gildea, N. Echols, C. Glöckner, J. Hellmich, H. Laksmono, R. G. Sierra, B. Lassalle-Kaiser, S. Koroidov, A. Lampe, G. Han, S. Gul, D. Difiore, D. Milathianaki, A. R. Fry, A. Miahnahri, D. W. Schafer, M. Messerschmidt, M. M. Seibert, J. E. Koglin, D. Sokaras, T. C. Weng, J. Sellberg, M. J. Latimer, R. W. Grosse-Kunstleve, P. H. Zwart, W. E. White, P. Glatzel, P. D. Adams, M. J. Bogan, G. J. Williams, S. Boutet, J. Messinger, A. Zouni, N. K. Sauter, V. K. Yachandra, U. Bergmann, J. Yano, “Simultaneous femtosecond X-ray spectroscopy and diffraction of photosystem II at room temperature,” Science 340(6131), 491–495 (2013).
[CrossRef] [PubMed]

Anderson, E. H.

I. McNulty, J. Kirz, C. Jacobsen, E. H. Anderson, M. R. Howells, D. P. Kern, “High-resolution imaging by Fourier transform X-ray holography,” Science 256(5059), 1009–1012 (1992).
[CrossRef] [PubMed]

Andersson, I.

M. M. Seibert, T. Ekeberg, F. R. N. C. Maia, M. Svenda, J. Andreasson, O. Jönsson, D. Odić, B. Iwan, A. Rocker, D. Westphal, M. Hantke, D. P. DePonte, A. Barty, J. Schulz, L. Gumprecht, N. Coppola, A. Aquila, M. Liang, T. A. White, A. Martin, C. Caleman, S. Stern, C. Abergel, V. Seltzer, J. M. Claverie, C. Bostedt, J. D. Bozek, S. Boutet, A. A. Miahnahri, M. Messerschmidt, J. Krzywinski, G. Williams, K. O. Hodgson, M. J. Bogan, C. Y. Hampton, R. G. Sierra, D. Starodub, I. Andersson, S. Bajt, M. Barthelmess, J. C. H. Spence, P. Fromme, U. Weierstall, R. Kirian, M. Hunter, R. B. Doak, S. Marchesini, S. P. Hau-Riege, M. Frank, R. L. Shoeman, L. Lomb, S. W. Epp, R. Hartmann, D. Rolles, A. Rudenko, C. Schmidt, L. Foucar, N. Kimmel, P. Holl, B. Rudek, B. Erk, A. Hömke, C. Reich, D. Pietschner, G. Weidenspointner, L. Strüder, G. Hauser, H. Gorke, J. Ullrich, I. Schlichting, S. Herrmann, G. Schaller, F. Schopper, H. Soltau, K. U. Kühnel, R. Andritschke, C. D. Schröter, F. Krasniqi, M. Bott, S. Schorb, D. Rupp, M. Adolph, T. Gorkhover, H. Hirsemann, G. Potdevin, H. Graafsma, B. Nilsson, H. N. Chapman, J. Hajdu, “Single mimivirus particles intercepted and imaged with an X-ray laser,” Nature 470(7332), 78–81 (2011).
[CrossRef] [PubMed]

C. H. Yoon, P. Schwander, C. Abergel, I. Andersson, J. Andreasson, A. Aquila, S. Bajt, M. Barthelmess, A. Barty, M. J. Bogan, C. Bostedt, J. Bozek, H. N. Chapman, J. M. Claverie, N. Coppola, D. P. DePonte, T. Ekeberg, S. W. Epp, B. Erk, H. Fleckenstein, L. Foucar, H. Graafsma, L. Gumprecht, J. Hajdu, C. Y. Hampton, A. Hartmann, E. Hartmann, R. Hartmann, G. Hauser, H. Hirsemann, P. Holl, S. Kassemeyer, N. Kimmel, M. Kiskinova, M. Liang, N. T. D. Loh, L. Lomb, F. R. N. C. Maia, A. V. Martin, K. Nass, E. Pedersoli, C. Reich, D. Rolles, B. Rudek, A. Rudenko, I. Schlichting, J. Schulz, M. Seibert, V. Seltzer, R. L. Shoeman, R. G. Sierra, H. Soltau, D. Starodub, J. Steinbrener, G. Stier, L. Strüder, M. Svenda, J. Ullrich, G. Weidenspointner, T. A. White, C. Wunderer, A. Ourmazd, “Unsupervised classification of single-particle X-ray diffraction snapshots by spectral clustering,” Opt. Express 19(17), 16542–16549 (2011).
[CrossRef] [PubMed]

Andreasson, J.

C. H. Yoon, P. Schwander, C. Abergel, I. Andersson, J. Andreasson, A. Aquila, S. Bajt, M. Barthelmess, A. Barty, M. J. Bogan, C. Bostedt, J. Bozek, H. N. Chapman, J. M. Claverie, N. Coppola, D. P. DePonte, T. Ekeberg, S. W. Epp, B. Erk, H. Fleckenstein, L. Foucar, H. Graafsma, L. Gumprecht, J. Hajdu, C. Y. Hampton, A. Hartmann, E. Hartmann, R. Hartmann, G. Hauser, H. Hirsemann, P. Holl, S. Kassemeyer, N. Kimmel, M. Kiskinova, M. Liang, N. T. D. Loh, L. Lomb, F. R. N. C. Maia, A. V. Martin, K. Nass, E. Pedersoli, C. Reich, D. Rolles, B. Rudek, A. Rudenko, I. Schlichting, J. Schulz, M. Seibert, V. Seltzer, R. L. Shoeman, R. G. Sierra, H. Soltau, D. Starodub, J. Steinbrener, G. Stier, L. Strüder, M. Svenda, J. Ullrich, G. Weidenspointner, T. A. White, C. Wunderer, A. Ourmazd, “Unsupervised classification of single-particle X-ray diffraction snapshots by spectral clustering,” Opt. Express 19(17), 16542–16549 (2011).
[CrossRef] [PubMed]

M. M. Seibert, T. Ekeberg, F. R. N. C. Maia, M. Svenda, J. Andreasson, O. Jönsson, D. Odić, B. Iwan, A. Rocker, D. Westphal, M. Hantke, D. P. DePonte, A. Barty, J. Schulz, L. Gumprecht, N. Coppola, A. Aquila, M. Liang, T. A. White, A. Martin, C. Caleman, S. Stern, C. Abergel, V. Seltzer, J. M. Claverie, C. Bostedt, J. D. Bozek, S. Boutet, A. A. Miahnahri, M. Messerschmidt, J. Krzywinski, G. Williams, K. O. Hodgson, M. J. Bogan, C. Y. Hampton, R. G. Sierra, D. Starodub, I. Andersson, S. Bajt, M. Barthelmess, J. C. H. Spence, P. Fromme, U. Weierstall, R. Kirian, M. Hunter, R. B. Doak, S. Marchesini, S. P. Hau-Riege, M. Frank, R. L. Shoeman, L. Lomb, S. W. Epp, R. Hartmann, D. Rolles, A. Rudenko, C. Schmidt, L. Foucar, N. Kimmel, P. Holl, B. Rudek, B. Erk, A. Hömke, C. Reich, D. Pietschner, G. Weidenspointner, L. Strüder, G. Hauser, H. Gorke, J. Ullrich, I. Schlichting, S. Herrmann, G. Schaller, F. Schopper, H. Soltau, K. U. Kühnel, R. Andritschke, C. D. Schröter, F. Krasniqi, M. Bott, S. Schorb, D. Rupp, M. Adolph, T. Gorkhover, H. Hirsemann, G. Potdevin, H. Graafsma, B. Nilsson, H. N. Chapman, J. Hajdu, “Single mimivirus particles intercepted and imaged with an X-ray laser,” Nature 470(7332), 78–81 (2011).
[CrossRef] [PubMed]

Andritschke, R.

M. M. Seibert, T. Ekeberg, F. R. N. C. Maia, M. Svenda, J. Andreasson, O. Jönsson, D. Odić, B. Iwan, A. Rocker, D. Westphal, M. Hantke, D. P. DePonte, A. Barty, J. Schulz, L. Gumprecht, N. Coppola, A. Aquila, M. Liang, T. A. White, A. Martin, C. Caleman, S. Stern, C. Abergel, V. Seltzer, J. M. Claverie, C. Bostedt, J. D. Bozek, S. Boutet, A. A. Miahnahri, M. Messerschmidt, J. Krzywinski, G. Williams, K. O. Hodgson, M. J. Bogan, C. Y. Hampton, R. G. Sierra, D. Starodub, I. Andersson, S. Bajt, M. Barthelmess, J. C. H. Spence, P. Fromme, U. Weierstall, R. Kirian, M. Hunter, R. B. Doak, S. Marchesini, S. P. Hau-Riege, M. Frank, R. L. Shoeman, L. Lomb, S. W. Epp, R. Hartmann, D. Rolles, A. Rudenko, C. Schmidt, L. Foucar, N. Kimmel, P. Holl, B. Rudek, B. Erk, A. Hömke, C. Reich, D. Pietschner, G. Weidenspointner, L. Strüder, G. Hauser, H. Gorke, J. Ullrich, I. Schlichting, S. Herrmann, G. Schaller, F. Schopper, H. Soltau, K. U. Kühnel, R. Andritschke, C. D. Schröter, F. Krasniqi, M. Bott, S. Schorb, D. Rupp, M. Adolph, T. Gorkhover, H. Hirsemann, G. Potdevin, H. Graafsma, B. Nilsson, H. N. Chapman, J. Hajdu, “Single mimivirus particles intercepted and imaged with an X-ray laser,” Nature 470(7332), 78–81 (2011).
[CrossRef] [PubMed]

Appio, R.

E. Allaria, R. Appio, L. Badano, W. A. Barletta, S. Bassanese, S. G. Biedron, A. Borga, E. Busetto, D. Castronovo, P. Cinquegrana, S. Cleva, D. Cocco, M. Cornacchia, P. Craievich, I. Cudin, G. D’Auria, M. Dal Forno, M. B. Danailov, R. De Monte, G. De Ninno, P. Delgiusto, A. Demidovich, S. Di Mitri, B. Diviacco, A. Fabris, R. Fabris, W. Fawley, M. Ferianis, E. Ferrari, S. Ferry, L. Froehlich, P. Furlan, G. Gaio, F. Gelmetti, L. Giannessi, M. Giannini, R. Gobessi, R. Ivanov, E. Karantzoulis, M. Lonza, A. Lutman, B. Mahieu, M. Milloch, S. V. Milton, M. Musardo, I. Nikolov, S. Noe, F. Parmigiani, G. Penco, M. Petronio, L. Pivetta, M. Predonzani, F. Rossi, L. Rumiz, A. Salom, C. Scafuri, C. Serpico, P. Sigalotti, S. Spampinati, C. Spezzani, M. Svandrlik, C. Svetina, S. Tazzari, M. Trovo, R. Umer, A. Vascotto, M. Veronese, R. Visintini, M. Zaccaria, D. Zangrando, M. Zangrando, “Highly coherent and stable pulses from the FERMI seeded free-electron laser in the extreme ultraviolet,” Nat. Photonics 6(10), 699–704 (2012).
[CrossRef]

Aquila, A.

L. Redecke, K. Nass, D. P. DePonte, T. A. White, D. Rehders, A. Barty, F. Stellato, M. Liang, T. R. M. Barends, S. Boutet, G. J. Williams, M. Messerschmidt, M. M. Seibert, A. Aquila, D. Arnlund, S. Bajt, T. Barth, M. J. Bogan, C. Caleman, T. C. Chao, R. B. Doak, H. Fleckenstein, M. Frank, R. Fromme, L. Galli, I. Grotjohann, M. S. Hunter, L. C. Johansson, S. Kassemeyer, G. Katona, R. A. Kirian, R. Koopmann, C. Kupitz, L. Lomb, A. V. Martin, S. Mogk, R. Neutze, R. L. Shoeman, J. Steinbrener, N. Timneanu, D. Wang, U. Weierstall, N. A. Zatsepin, J. C. H. Spence, P. Fromme, I. Schlichting, M. Duszenko, C. Betzel, H. N. Chapman, “Natively inhibited Trypanosoma brucei Cathepsin B structure determined by using an X-ray laser,” Science 339(6116), 227–230 (2013).
[CrossRef] [PubMed]

S. Boutet, L. Lomb, G. J. Williams, T. R. M. Barends, A. Aquila, R. B. Doak, U. Weierstall, D. P. DePonte, J. Steinbrener, R. L. Shoeman, M. Messerschmidt, A. Barty, T. A. White, S. Kassemeyer, R. A. Kirian, M. M. Seibert, P. A. Montanez, C. Kenney, R. Herbst, P. Hart, J. Pines, G. Haller, S. M. Gruner, H. T. Philipp, M. W. Tate, M. Hromalik, L. J. Koerner, N. van Bakel, J. Morse, W. Ghonsalves, D. Arnlund, M. J. Bogan, C. Caleman, R. Fromme, C. Y. Hampton, M. S. Hunter, L. C. Johansson, G. Katona, C. Kupitz, M. Liang, A. V. Martin, K. Nass, L. Redecke, F. Stellato, N. Timneanu, D. Wang, N. A. Zatsepin, D. Schafer, J. Defever, R. Neutze, P. Fromme, J. C. H. Spence, H. N. Chapman, I. Schlichting, “High-resolution protein structure determination by serial femtosecond crystallography,” Science 337(6092), 362–364 (2012).
[CrossRef] [PubMed]

M. M. Seibert, T. Ekeberg, F. R. N. C. Maia, M. Svenda, J. Andreasson, O. Jönsson, D. Odić, B. Iwan, A. Rocker, D. Westphal, M. Hantke, D. P. DePonte, A. Barty, J. Schulz, L. Gumprecht, N. Coppola, A. Aquila, M. Liang, T. A. White, A. Martin, C. Caleman, S. Stern, C. Abergel, V. Seltzer, J. M. Claverie, C. Bostedt, J. D. Bozek, S. Boutet, A. A. Miahnahri, M. Messerschmidt, J. Krzywinski, G. Williams, K. O. Hodgson, M. J. Bogan, C. Y. Hampton, R. G. Sierra, D. Starodub, I. Andersson, S. Bajt, M. Barthelmess, J. C. H. Spence, P. Fromme, U. Weierstall, R. Kirian, M. Hunter, R. B. Doak, S. Marchesini, S. P. Hau-Riege, M. Frank, R. L. Shoeman, L. Lomb, S. W. Epp, R. Hartmann, D. Rolles, A. Rudenko, C. Schmidt, L. Foucar, N. Kimmel, P. Holl, B. Rudek, B. Erk, A. Hömke, C. Reich, D. Pietschner, G. Weidenspointner, L. Strüder, G. Hauser, H. Gorke, J. Ullrich, I. Schlichting, S. Herrmann, G. Schaller, F. Schopper, H. Soltau, K. U. Kühnel, R. Andritschke, C. D. Schröter, F. Krasniqi, M. Bott, S. Schorb, D. Rupp, M. Adolph, T. Gorkhover, H. Hirsemann, G. Potdevin, H. Graafsma, B. Nilsson, H. N. Chapman, J. Hajdu, “Single mimivirus particles intercepted and imaged with an X-ray laser,” Nature 470(7332), 78–81 (2011).
[CrossRef] [PubMed]

C. H. Yoon, P. Schwander, C. Abergel, I. Andersson, J. Andreasson, A. Aquila, S. Bajt, M. Barthelmess, A. Barty, M. J. Bogan, C. Bostedt, J. Bozek, H. N. Chapman, J. M. Claverie, N. Coppola, D. P. DePonte, T. Ekeberg, S. W. Epp, B. Erk, H. Fleckenstein, L. Foucar, H. Graafsma, L. Gumprecht, J. Hajdu, C. Y. Hampton, A. Hartmann, E. Hartmann, R. Hartmann, G. Hauser, H. Hirsemann, P. Holl, S. Kassemeyer, N. Kimmel, M. Kiskinova, M. Liang, N. T. D. Loh, L. Lomb, F. R. N. C. Maia, A. V. Martin, K. Nass, E. Pedersoli, C. Reich, D. Rolles, B. Rudek, A. Rudenko, I. Schlichting, J. Schulz, M. Seibert, V. Seltzer, R. L. Shoeman, R. G. Sierra, H. Soltau, D. Starodub, J. Steinbrener, G. Stier, L. Strüder, M. Svenda, J. Ullrich, G. Weidenspointner, T. A. White, C. Wunderer, A. Ourmazd, “Unsupervised classification of single-particle X-ray diffraction snapshots by spectral clustering,” Opt. Express 19(17), 16542–16549 (2011).
[CrossRef] [PubMed]

Arnlund, D.

L. Redecke, K. Nass, D. P. DePonte, T. A. White, D. Rehders, A. Barty, F. Stellato, M. Liang, T. R. M. Barends, S. Boutet, G. J. Williams, M. Messerschmidt, M. M. Seibert, A. Aquila, D. Arnlund, S. Bajt, T. Barth, M. J. Bogan, C. Caleman, T. C. Chao, R. B. Doak, H. Fleckenstein, M. Frank, R. Fromme, L. Galli, I. Grotjohann, M. S. Hunter, L. C. Johansson, S. Kassemeyer, G. Katona, R. A. Kirian, R. Koopmann, C. Kupitz, L. Lomb, A. V. Martin, S. Mogk, R. Neutze, R. L. Shoeman, J. Steinbrener, N. Timneanu, D. Wang, U. Weierstall, N. A. Zatsepin, J. C. H. Spence, P. Fromme, I. Schlichting, M. Duszenko, C. Betzel, H. N. Chapman, “Natively inhibited Trypanosoma brucei Cathepsin B structure determined by using an X-ray laser,” Science 339(6116), 227–230 (2013).
[CrossRef] [PubMed]

S. Boutet, L. Lomb, G. J. Williams, T. R. M. Barends, A. Aquila, R. B. Doak, U. Weierstall, D. P. DePonte, J. Steinbrener, R. L. Shoeman, M. Messerschmidt, A. Barty, T. A. White, S. Kassemeyer, R. A. Kirian, M. M. Seibert, P. A. Montanez, C. Kenney, R. Herbst, P. Hart, J. Pines, G. Haller, S. M. Gruner, H. T. Philipp, M. W. Tate, M. Hromalik, L. J. Koerner, N. van Bakel, J. Morse, W. Ghonsalves, D. Arnlund, M. J. Bogan, C. Caleman, R. Fromme, C. Y. Hampton, M. S. Hunter, L. C. Johansson, G. Katona, C. Kupitz, M. Liang, A. V. Martin, K. Nass, L. Redecke, F. Stellato, N. Timneanu, D. Wang, N. A. Zatsepin, D. Schafer, J. Defever, R. Neutze, P. Fromme, J. C. H. Spence, H. N. Chapman, I. Schlichting, “High-resolution protein structure determination by serial femtosecond crystallography,” Science 337(6092), 362–364 (2012).
[CrossRef] [PubMed]

Bach, J.

F. Capotondi, E. Pedersoli, N. Mahne, R. H. Menk, G. Passos, L. Raimondi, C. Svetina, G. Sandrin, M. Zangrando, M. Kiskinova, S. Bajt, M. Barthelmess, H. Fleckenstein, H. N. Chapman, J. Schulz, J. Bach, R. Frömter, S. Schleitzer, L. Müller, C. Gutt, G. Grübel, “Invited article: Coherent imaging using seeded free-electron laser pulses with variable polarization: First results and research opportunities,” Rev. Sci. Instrum. 84(5), 051301 (2013).
[CrossRef] [PubMed]

Badano, L.

E. Allaria, R. Appio, L. Badano, W. A. Barletta, S. Bassanese, S. G. Biedron, A. Borga, E. Busetto, D. Castronovo, P. Cinquegrana, S. Cleva, D. Cocco, M. Cornacchia, P. Craievich, I. Cudin, G. D’Auria, M. Dal Forno, M. B. Danailov, R. De Monte, G. De Ninno, P. Delgiusto, A. Demidovich, S. Di Mitri, B. Diviacco, A. Fabris, R. Fabris, W. Fawley, M. Ferianis, E. Ferrari, S. Ferry, L. Froehlich, P. Furlan, G. Gaio, F. Gelmetti, L. Giannessi, M. Giannini, R. Gobessi, R. Ivanov, E. Karantzoulis, M. Lonza, A. Lutman, B. Mahieu, M. Milloch, S. V. Milton, M. Musardo, I. Nikolov, S. Noe, F. Parmigiani, G. Penco, M. Petronio, L. Pivetta, M. Predonzani, F. Rossi, L. Rumiz, A. Salom, C. Scafuri, C. Serpico, P. Sigalotti, S. Spampinati, C. Spezzani, M. Svandrlik, C. Svetina, S. Tazzari, M. Trovo, R. Umer, A. Vascotto, M. Veronese, R. Visintini, M. Zaccaria, D. Zangrando, M. Zangrando, “Highly coherent and stable pulses from the FERMI seeded free-electron laser in the extreme ultraviolet,” Nat. Photonics 6(10), 699–704 (2012).
[CrossRef]

Bajt, S.

L. Redecke, K. Nass, D. P. DePonte, T. A. White, D. Rehders, A. Barty, F. Stellato, M. Liang, T. R. M. Barends, S. Boutet, G. J. Williams, M. Messerschmidt, M. M. Seibert, A. Aquila, D. Arnlund, S. Bajt, T. Barth, M. J. Bogan, C. Caleman, T. C. Chao, R. B. Doak, H. Fleckenstein, M. Frank, R. Fromme, L. Galli, I. Grotjohann, M. S. Hunter, L. C. Johansson, S. Kassemeyer, G. Katona, R. A. Kirian, R. Koopmann, C. Kupitz, L. Lomb, A. V. Martin, S. Mogk, R. Neutze, R. L. Shoeman, J. Steinbrener, N. Timneanu, D. Wang, U. Weierstall, N. A. Zatsepin, J. C. H. Spence, P. Fromme, I. Schlichting, M. Duszenko, C. Betzel, H. N. Chapman, “Natively inhibited Trypanosoma brucei Cathepsin B structure determined by using an X-ray laser,” Science 339(6116), 227–230 (2013).
[CrossRef] [PubMed]

F. Capotondi, E. Pedersoli, N. Mahne, R. H. Menk, G. Passos, L. Raimondi, C. Svetina, G. Sandrin, M. Zangrando, M. Kiskinova, S. Bajt, M. Barthelmess, H. Fleckenstein, H. N. Chapman, J. Schulz, J. Bach, R. Frömter, S. Schleitzer, L. Müller, C. Gutt, G. Grübel, “Invited article: Coherent imaging using seeded free-electron laser pulses with variable polarization: First results and research opportunities,” Rev. Sci. Instrum. 84(5), 051301 (2013).
[CrossRef] [PubMed]

M. M. Seibert, T. Ekeberg, F. R. N. C. Maia, M. Svenda, J. Andreasson, O. Jönsson, D. Odić, B. Iwan, A. Rocker, D. Westphal, M. Hantke, D. P. DePonte, A. Barty, J. Schulz, L. Gumprecht, N. Coppola, A. Aquila, M. Liang, T. A. White, A. Martin, C. Caleman, S. Stern, C. Abergel, V. Seltzer, J. M. Claverie, C. Bostedt, J. D. Bozek, S. Boutet, A. A. Miahnahri, M. Messerschmidt, J. Krzywinski, G. Williams, K. O. Hodgson, M. J. Bogan, C. Y. Hampton, R. G. Sierra, D. Starodub, I. Andersson, S. Bajt, M. Barthelmess, J. C. H. Spence, P. Fromme, U. Weierstall, R. Kirian, M. Hunter, R. B. Doak, S. Marchesini, S. P. Hau-Riege, M. Frank, R. L. Shoeman, L. Lomb, S. W. Epp, R. Hartmann, D. Rolles, A. Rudenko, C. Schmidt, L. Foucar, N. Kimmel, P. Holl, B. Rudek, B. Erk, A. Hömke, C. Reich, D. Pietschner, G. Weidenspointner, L. Strüder, G. Hauser, H. Gorke, J. Ullrich, I. Schlichting, S. Herrmann, G. Schaller, F. Schopper, H. Soltau, K. U. Kühnel, R. Andritschke, C. D. Schröter, F. Krasniqi, M. Bott, S. Schorb, D. Rupp, M. Adolph, T. Gorkhover, H. Hirsemann, G. Potdevin, H. Graafsma, B. Nilsson, H. N. Chapman, J. Hajdu, “Single mimivirus particles intercepted and imaged with an X-ray laser,” Nature 470(7332), 78–81 (2011).
[CrossRef] [PubMed]

C. H. Yoon, P. Schwander, C. Abergel, I. Andersson, J. Andreasson, A. Aquila, S. Bajt, M. Barthelmess, A. Barty, M. J. Bogan, C. Bostedt, J. Bozek, H. N. Chapman, J. M. Claverie, N. Coppola, D. P. DePonte, T. Ekeberg, S. W. Epp, B. Erk, H. Fleckenstein, L. Foucar, H. Graafsma, L. Gumprecht, J. Hajdu, C. Y. Hampton, A. Hartmann, E. Hartmann, R. Hartmann, G. Hauser, H. Hirsemann, P. Holl, S. Kassemeyer, N. Kimmel, M. Kiskinova, M. Liang, N. T. D. Loh, L. Lomb, F. R. N. C. Maia, A. V. Martin, K. Nass, E. Pedersoli, C. Reich, D. Rolles, B. Rudek, A. Rudenko, I. Schlichting, J. Schulz, M. Seibert, V. Seltzer, R. L. Shoeman, R. G. Sierra, H. Soltau, D. Starodub, J. Steinbrener, G. Stier, L. Strüder, M. Svenda, J. Ullrich, G. Weidenspointner, T. A. White, C. Wunderer, A. Ourmazd, “Unsupervised classification of single-particle X-ray diffraction snapshots by spectral clustering,” Opt. Express 19(17), 16542–16549 (2011).
[CrossRef] [PubMed]

H. N. Chapman, A. Barty, M. J. Bogan, S. Boutet, M. Frank, S. P. Hau-Riege, S. Marchesini, B. W. Woods, S. Bajt, W. H. Benner, R. A. London, E. Plönjes, M. Kuhlmann, R. Treusch, S. Düsterer, T. Tschentscher, J. R. Schneider, E. Spiller, T. Möller, C. Bostedt, M. Hoener, D. A. Shapiro, K. O. Hodgson, D. van der Spoel, F. Burmeister, M. Bergh, C. Caleman, G. Huldt, M. M. Seibert, F. R. N. C. Maia, R. W. Lee, A. Szöke, N. Timneanu, J. Hajdu, “Femtosecond diffractive imaging with a soft-X-ray free-electron laser,” Nat. Phys. 2(12), 839–843 (2006).
[CrossRef]

Barends, T. R. M.

L. Redecke, K. Nass, D. P. DePonte, T. A. White, D. Rehders, A. Barty, F. Stellato, M. Liang, T. R. M. Barends, S. Boutet, G. J. Williams, M. Messerschmidt, M. M. Seibert, A. Aquila, D. Arnlund, S. Bajt, T. Barth, M. J. Bogan, C. Caleman, T. C. Chao, R. B. Doak, H. Fleckenstein, M. Frank, R. Fromme, L. Galli, I. Grotjohann, M. S. Hunter, L. C. Johansson, S. Kassemeyer, G. Katona, R. A. Kirian, R. Koopmann, C. Kupitz, L. Lomb, A. V. Martin, S. Mogk, R. Neutze, R. L. Shoeman, J. Steinbrener, N. Timneanu, D. Wang, U. Weierstall, N. A. Zatsepin, J. C. H. Spence, P. Fromme, I. Schlichting, M. Duszenko, C. Betzel, H. N. Chapman, “Natively inhibited Trypanosoma brucei Cathepsin B structure determined by using an X-ray laser,” Science 339(6116), 227–230 (2013).
[CrossRef] [PubMed]

S. Boutet, L. Lomb, G. J. Williams, T. R. M. Barends, A. Aquila, R. B. Doak, U. Weierstall, D. P. DePonte, J. Steinbrener, R. L. Shoeman, M. Messerschmidt, A. Barty, T. A. White, S. Kassemeyer, R. A. Kirian, M. M. Seibert, P. A. Montanez, C. Kenney, R. Herbst, P. Hart, J. Pines, G. Haller, S. M. Gruner, H. T. Philipp, M. W. Tate, M. Hromalik, L. J. Koerner, N. van Bakel, J. Morse, W. Ghonsalves, D. Arnlund, M. J. Bogan, C. Caleman, R. Fromme, C. Y. Hampton, M. S. Hunter, L. C. Johansson, G. Katona, C. Kupitz, M. Liang, A. V. Martin, K. Nass, L. Redecke, F. Stellato, N. Timneanu, D. Wang, N. A. Zatsepin, D. Schafer, J. Defever, R. Neutze, P. Fromme, J. C. H. Spence, H. N. Chapman, I. Schlichting, “High-resolution protein structure determination by serial femtosecond crystallography,” Science 337(6092), 362–364 (2012).
[CrossRef] [PubMed]

Barletta, W. A.

E. Allaria, R. Appio, L. Badano, W. A. Barletta, S. Bassanese, S. G. Biedron, A. Borga, E. Busetto, D. Castronovo, P. Cinquegrana, S. Cleva, D. Cocco, M. Cornacchia, P. Craievich, I. Cudin, G. D’Auria, M. Dal Forno, M. B. Danailov, R. De Monte, G. De Ninno, P. Delgiusto, A. Demidovich, S. Di Mitri, B. Diviacco, A. Fabris, R. Fabris, W. Fawley, M. Ferianis, E. Ferrari, S. Ferry, L. Froehlich, P. Furlan, G. Gaio, F. Gelmetti, L. Giannessi, M. Giannini, R. Gobessi, R. Ivanov, E. Karantzoulis, M. Lonza, A. Lutman, B. Mahieu, M. Milloch, S. V. Milton, M. Musardo, I. Nikolov, S. Noe, F. Parmigiani, G. Penco, M. Petronio, L. Pivetta, M. Predonzani, F. Rossi, L. Rumiz, A. Salom, C. Scafuri, C. Serpico, P. Sigalotti, S. Spampinati, C. Spezzani, M. Svandrlik, C. Svetina, S. Tazzari, M. Trovo, R. Umer, A. Vascotto, M. Veronese, R. Visintini, M. Zaccaria, D. Zangrando, M. Zangrando, “Highly coherent and stable pulses from the FERMI seeded free-electron laser in the extreme ultraviolet,” Nat. Photonics 6(10), 699–704 (2012).
[CrossRef]

Barth, R.

A. P. Mancuso, T. Gorniak, F. Staier, O. M. Yefanov, R. Barth, C. Christophis, B. Reime, J. Gulden, A. Singer, M. E. Pettit, T. Nisius, T. Wilhein, C. Gutt, G. Grübel, N. Guerassimova, R. Treusch, J. Feldhaus, S. Eisebitt, E. Weckert, M. Grunze, A. Rosenhahn, I. A. Vartanyants, “Coherent imaging of biological samples with femtosecond pulses at the free-electron laser FLASH,” New J. Phys. 12(3), 035003 (2010).
[CrossRef]

Barth, T.

L. Redecke, K. Nass, D. P. DePonte, T. A. White, D. Rehders, A. Barty, F. Stellato, M. Liang, T. R. M. Barends, S. Boutet, G. J. Williams, M. Messerschmidt, M. M. Seibert, A. Aquila, D. Arnlund, S. Bajt, T. Barth, M. J. Bogan, C. Caleman, T. C. Chao, R. B. Doak, H. Fleckenstein, M. Frank, R. Fromme, L. Galli, I. Grotjohann, M. S. Hunter, L. C. Johansson, S. Kassemeyer, G. Katona, R. A. Kirian, R. Koopmann, C. Kupitz, L. Lomb, A. V. Martin, S. Mogk, R. Neutze, R. L. Shoeman, J. Steinbrener, N. Timneanu, D. Wang, U. Weierstall, N. A. Zatsepin, J. C. H. Spence, P. Fromme, I. Schlichting, M. Duszenko, C. Betzel, H. N. Chapman, “Natively inhibited Trypanosoma brucei Cathepsin B structure determined by using an X-ray laser,” Science 339(6116), 227–230 (2013).
[CrossRef] [PubMed]

Barthelmess, M.

F. Capotondi, E. Pedersoli, N. Mahne, R. H. Menk, G. Passos, L. Raimondi, C. Svetina, G. Sandrin, M. Zangrando, M. Kiskinova, S. Bajt, M. Barthelmess, H. Fleckenstein, H. N. Chapman, J. Schulz, J. Bach, R. Frömter, S. Schleitzer, L. Müller, C. Gutt, G. Grübel, “Invited article: Coherent imaging using seeded free-electron laser pulses with variable polarization: First results and research opportunities,” Rev. Sci. Instrum. 84(5), 051301 (2013).
[CrossRef] [PubMed]

M. M. Seibert, T. Ekeberg, F. R. N. C. Maia, M. Svenda, J. Andreasson, O. Jönsson, D. Odić, B. Iwan, A. Rocker, D. Westphal, M. Hantke, D. P. DePonte, A. Barty, J. Schulz, L. Gumprecht, N. Coppola, A. Aquila, M. Liang, T. A. White, A. Martin, C. Caleman, S. Stern, C. Abergel, V. Seltzer, J. M. Claverie, C. Bostedt, J. D. Bozek, S. Boutet, A. A. Miahnahri, M. Messerschmidt, J. Krzywinski, G. Williams, K. O. Hodgson, M. J. Bogan, C. Y. Hampton, R. G. Sierra, D. Starodub, I. Andersson, S. Bajt, M. Barthelmess, J. C. H. Spence, P. Fromme, U. Weierstall, R. Kirian, M. Hunter, R. B. Doak, S. Marchesini, S. P. Hau-Riege, M. Frank, R. L. Shoeman, L. Lomb, S. W. Epp, R. Hartmann, D. Rolles, A. Rudenko, C. Schmidt, L. Foucar, N. Kimmel, P. Holl, B. Rudek, B. Erk, A. Hömke, C. Reich, D. Pietschner, G. Weidenspointner, L. Strüder, G. Hauser, H. Gorke, J. Ullrich, I. Schlichting, S. Herrmann, G. Schaller, F. Schopper, H. Soltau, K. U. Kühnel, R. Andritschke, C. D. Schröter, F. Krasniqi, M. Bott, S. Schorb, D. Rupp, M. Adolph, T. Gorkhover, H. Hirsemann, G. Potdevin, H. Graafsma, B. Nilsson, H. N. Chapman, J. Hajdu, “Single mimivirus particles intercepted and imaged with an X-ray laser,” Nature 470(7332), 78–81 (2011).
[CrossRef] [PubMed]

C. H. Yoon, P. Schwander, C. Abergel, I. Andersson, J. Andreasson, A. Aquila, S. Bajt, M. Barthelmess, A. Barty, M. J. Bogan, C. Bostedt, J. Bozek, H. N. Chapman, J. M. Claverie, N. Coppola, D. P. DePonte, T. Ekeberg, S. W. Epp, B. Erk, H. Fleckenstein, L. Foucar, H. Graafsma, L. Gumprecht, J. Hajdu, C. Y. Hampton, A. Hartmann, E. Hartmann, R. Hartmann, G. Hauser, H. Hirsemann, P. Holl, S. Kassemeyer, N. Kimmel, M. Kiskinova, M. Liang, N. T. D. Loh, L. Lomb, F. R. N. C. Maia, A. V. Martin, K. Nass, E. Pedersoli, C. Reich, D. Rolles, B. Rudek, A. Rudenko, I. Schlichting, J. Schulz, M. Seibert, V. Seltzer, R. L. Shoeman, R. G. Sierra, H. Soltau, D. Starodub, J. Steinbrener, G. Stier, L. Strüder, M. Svenda, J. Ullrich, G. Weidenspointner, T. A. White, C. Wunderer, A. Ourmazd, “Unsupervised classification of single-particle X-ray diffraction snapshots by spectral clustering,” Opt. Express 19(17), 16542–16549 (2011).
[CrossRef] [PubMed]

Barty, A.

L. Redecke, K. Nass, D. P. DePonte, T. A. White, D. Rehders, A. Barty, F. Stellato, M. Liang, T. R. M. Barends, S. Boutet, G. J. Williams, M. Messerschmidt, M. M. Seibert, A. Aquila, D. Arnlund, S. Bajt, T. Barth, M. J. Bogan, C. Caleman, T. C. Chao, R. B. Doak, H. Fleckenstein, M. Frank, R. Fromme, L. Galli, I. Grotjohann, M. S. Hunter, L. C. Johansson, S. Kassemeyer, G. Katona, R. A. Kirian, R. Koopmann, C. Kupitz, L. Lomb, A. V. Martin, S. Mogk, R. Neutze, R. L. Shoeman, J. Steinbrener, N. Timneanu, D. Wang, U. Weierstall, N. A. Zatsepin, J. C. H. Spence, P. Fromme, I. Schlichting, M. Duszenko, C. Betzel, H. N. Chapman, “Natively inhibited Trypanosoma brucei Cathepsin B structure determined by using an X-ray laser,” Science 339(6116), 227–230 (2013).
[CrossRef] [PubMed]

S. Boutet, L. Lomb, G. J. Williams, T. R. M. Barends, A. Aquila, R. B. Doak, U. Weierstall, D. P. DePonte, J. Steinbrener, R. L. Shoeman, M. Messerschmidt, A. Barty, T. A. White, S. Kassemeyer, R. A. Kirian, M. M. Seibert, P. A. Montanez, C. Kenney, R. Herbst, P. Hart, J. Pines, G. Haller, S. M. Gruner, H. T. Philipp, M. W. Tate, M. Hromalik, L. J. Koerner, N. van Bakel, J. Morse, W. Ghonsalves, D. Arnlund, M. J. Bogan, C. Caleman, R. Fromme, C. Y. Hampton, M. S. Hunter, L. C. Johansson, G. Katona, C. Kupitz, M. Liang, A. V. Martin, K. Nass, L. Redecke, F. Stellato, N. Timneanu, D. Wang, N. A. Zatsepin, D. Schafer, J. Defever, R. Neutze, P. Fromme, J. C. H. Spence, H. N. Chapman, I. Schlichting, “High-resolution protein structure determination by serial femtosecond crystallography,” Science 337(6092), 362–364 (2012).
[CrossRef] [PubMed]

M. M. Seibert, T. Ekeberg, F. R. N. C. Maia, M. Svenda, J. Andreasson, O. Jönsson, D. Odić, B. Iwan, A. Rocker, D. Westphal, M. Hantke, D. P. DePonte, A. Barty, J. Schulz, L. Gumprecht, N. Coppola, A. Aquila, M. Liang, T. A. White, A. Martin, C. Caleman, S. Stern, C. Abergel, V. Seltzer, J. M. Claverie, C. Bostedt, J. D. Bozek, S. Boutet, A. A. Miahnahri, M. Messerschmidt, J. Krzywinski, G. Williams, K. O. Hodgson, M. J. Bogan, C. Y. Hampton, R. G. Sierra, D. Starodub, I. Andersson, S. Bajt, M. Barthelmess, J. C. H. Spence, P. Fromme, U. Weierstall, R. Kirian, M. Hunter, R. B. Doak, S. Marchesini, S. P. Hau-Riege, M. Frank, R. L. Shoeman, L. Lomb, S. W. Epp, R. Hartmann, D. Rolles, A. Rudenko, C. Schmidt, L. Foucar, N. Kimmel, P. Holl, B. Rudek, B. Erk, A. Hömke, C. Reich, D. Pietschner, G. Weidenspointner, L. Strüder, G. Hauser, H. Gorke, J. Ullrich, I. Schlichting, S. Herrmann, G. Schaller, F. Schopper, H. Soltau, K. U. Kühnel, R. Andritschke, C. D. Schröter, F. Krasniqi, M. Bott, S. Schorb, D. Rupp, M. Adolph, T. Gorkhover, H. Hirsemann, G. Potdevin, H. Graafsma, B. Nilsson, H. N. Chapman, J. Hajdu, “Single mimivirus particles intercepted and imaged with an X-ray laser,” Nature 470(7332), 78–81 (2011).
[CrossRef] [PubMed]

C. H. Yoon, P. Schwander, C. Abergel, I. Andersson, J. Andreasson, A. Aquila, S. Bajt, M. Barthelmess, A. Barty, M. J. Bogan, C. Bostedt, J. Bozek, H. N. Chapman, J. M. Claverie, N. Coppola, D. P. DePonte, T. Ekeberg, S. W. Epp, B. Erk, H. Fleckenstein, L. Foucar, H. Graafsma, L. Gumprecht, J. Hajdu, C. Y. Hampton, A. Hartmann, E. Hartmann, R. Hartmann, G. Hauser, H. Hirsemann, P. Holl, S. Kassemeyer, N. Kimmel, M. Kiskinova, M. Liang, N. T. D. Loh, L. Lomb, F. R. N. C. Maia, A. V. Martin, K. Nass, E. Pedersoli, C. Reich, D. Rolles, B. Rudek, A. Rudenko, I. Schlichting, J. Schulz, M. Seibert, V. Seltzer, R. L. Shoeman, R. G. Sierra, H. Soltau, D. Starodub, J. Steinbrener, G. Stier, L. Strüder, M. Svenda, J. Ullrich, G. Weidenspointner, T. A. White, C. Wunderer, A. Ourmazd, “Unsupervised classification of single-particle X-ray diffraction snapshots by spectral clustering,” Opt. Express 19(17), 16542–16549 (2011).
[CrossRef] [PubMed]

H. N. Chapman, A. Barty, M. J. Bogan, S. Boutet, M. Frank, S. P. Hau-Riege, S. Marchesini, B. W. Woods, S. Bajt, W. H. Benner, R. A. London, E. Plönjes, M. Kuhlmann, R. Treusch, S. Düsterer, T. Tschentscher, J. R. Schneider, E. Spiller, T. Möller, C. Bostedt, M. Hoener, D. A. Shapiro, K. O. Hodgson, D. van der Spoel, F. Burmeister, M. Bergh, C. Caleman, G. Huldt, M. M. Seibert, F. R. N. C. Maia, R. W. Lee, A. Szöke, N. Timneanu, J. Hajdu, “Femtosecond diffractive imaging with a soft-X-ray free-electron laser,” Nat. Phys. 2(12), 839–843 (2006).
[CrossRef]

H. N. Chapman, A. Barty, S. Marchesini, A. Noy, S. P. Hau-Riege, C. Cui, M. R. Howells, R. Rosen, H. He, J. C. H. Spence, U. Weierstall, T. Beetz, C. Jacobsen, D. Shapiro, “High-resolution ab initio three-dimensional x-ray diffraction microscopy,” J. Opt. Soc. Am. A 23(5), 1179 (2006).
[CrossRef]

Bassanese, S.

E. Allaria, R. Appio, L. Badano, W. A. Barletta, S. Bassanese, S. G. Biedron, A. Borga, E. Busetto, D. Castronovo, P. Cinquegrana, S. Cleva, D. Cocco, M. Cornacchia, P. Craievich, I. Cudin, G. D’Auria, M. Dal Forno, M. B. Danailov, R. De Monte, G. De Ninno, P. Delgiusto, A. Demidovich, S. Di Mitri, B. Diviacco, A. Fabris, R. Fabris, W. Fawley, M. Ferianis, E. Ferrari, S. Ferry, L. Froehlich, P. Furlan, G. Gaio, F. Gelmetti, L. Giannessi, M. Giannini, R. Gobessi, R. Ivanov, E. Karantzoulis, M. Lonza, A. Lutman, B. Mahieu, M. Milloch, S. V. Milton, M. Musardo, I. Nikolov, S. Noe, F. Parmigiani, G. Penco, M. Petronio, L. Pivetta, M. Predonzani, F. Rossi, L. Rumiz, A. Salom, C. Scafuri, C. Serpico, P. Sigalotti, S. Spampinati, C. Spezzani, M. Svandrlik, C. Svetina, S. Tazzari, M. Trovo, R. Umer, A. Vascotto, M. Veronese, R. Visintini, M. Zaccaria, D. Zangrando, M. Zangrando, “Highly coherent and stable pulses from the FERMI seeded free-electron laser in the extreme ultraviolet,” Nat. Photonics 6(10), 699–704 (2012).
[CrossRef]

Beetz, T.

Benner, W. H.

H. N. Chapman, A. Barty, M. J. Bogan, S. Boutet, M. Frank, S. P. Hau-Riege, S. Marchesini, B. W. Woods, S. Bajt, W. H. Benner, R. A. London, E. Plönjes, M. Kuhlmann, R. Treusch, S. Düsterer, T. Tschentscher, J. R. Schneider, E. Spiller, T. Möller, C. Bostedt, M. Hoener, D. A. Shapiro, K. O. Hodgson, D. van der Spoel, F. Burmeister, M. Bergh, C. Caleman, G. Huldt, M. M. Seibert, F. R. N. C. Maia, R. W. Lee, A. Szöke, N. Timneanu, J. Hajdu, “Femtosecond diffractive imaging with a soft-X-ray free-electron laser,” Nat. Phys. 2(12), 839–843 (2006).
[CrossRef]

Bergh, M.

H. N. Chapman, A. Barty, M. J. Bogan, S. Boutet, M. Frank, S. P. Hau-Riege, S. Marchesini, B. W. Woods, S. Bajt, W. H. Benner, R. A. London, E. Plönjes, M. Kuhlmann, R. Treusch, S. Düsterer, T. Tschentscher, J. R. Schneider, E. Spiller, T. Möller, C. Bostedt, M. Hoener, D. A. Shapiro, K. O. Hodgson, D. van der Spoel, F. Burmeister, M. Bergh, C. Caleman, G. Huldt, M. M. Seibert, F. R. N. C. Maia, R. W. Lee, A. Szöke, N. Timneanu, J. Hajdu, “Femtosecond diffractive imaging with a soft-X-ray free-electron laser,” Nat. Phys. 2(12), 839–843 (2006).
[CrossRef]

Bergmann, U.

J. Kern, R. Alonso-Mori, R. Tran, J. Hattne, R. J. Gildea, N. Echols, C. Glöckner, J. Hellmich, H. Laksmono, R. G. Sierra, B. Lassalle-Kaiser, S. Koroidov, A. Lampe, G. Han, S. Gul, D. Difiore, D. Milathianaki, A. R. Fry, A. Miahnahri, D. W. Schafer, M. Messerschmidt, M. M. Seibert, J. E. Koglin, D. Sokaras, T. C. Weng, J. Sellberg, M. J. Latimer, R. W. Grosse-Kunstleve, P. H. Zwart, W. E. White, P. Glatzel, P. D. Adams, M. J. Bogan, G. J. Williams, S. Boutet, J. Messinger, A. Zouni, N. K. Sauter, V. K. Yachandra, U. Bergmann, J. Yano, “Simultaneous femtosecond X-ray spectroscopy and diffraction of photosystem II at room temperature,” Science 340(6131), 491–495 (2013).
[CrossRef] [PubMed]

Betzel, C.

L. Redecke, K. Nass, D. P. DePonte, T. A. White, D. Rehders, A. Barty, F. Stellato, M. Liang, T. R. M. Barends, S. Boutet, G. J. Williams, M. Messerschmidt, M. M. Seibert, A. Aquila, D. Arnlund, S. Bajt, T. Barth, M. J. Bogan, C. Caleman, T. C. Chao, R. B. Doak, H. Fleckenstein, M. Frank, R. Fromme, L. Galli, I. Grotjohann, M. S. Hunter, L. C. Johansson, S. Kassemeyer, G. Katona, R. A. Kirian, R. Koopmann, C. Kupitz, L. Lomb, A. V. Martin, S. Mogk, R. Neutze, R. L. Shoeman, J. Steinbrener, N. Timneanu, D. Wang, U. Weierstall, N. A. Zatsepin, J. C. H. Spence, P. Fromme, I. Schlichting, M. Duszenko, C. Betzel, H. N. Chapman, “Natively inhibited Trypanosoma brucei Cathepsin B structure determined by using an X-ray laser,” Science 339(6116), 227–230 (2013).
[CrossRef] [PubMed]

Biedron, S. G.

E. Allaria, R. Appio, L. Badano, W. A. Barletta, S. Bassanese, S. G. Biedron, A. Borga, E. Busetto, D. Castronovo, P. Cinquegrana, S. Cleva, D. Cocco, M. Cornacchia, P. Craievich, I. Cudin, G. D’Auria, M. Dal Forno, M. B. Danailov, R. De Monte, G. De Ninno, P. Delgiusto, A. Demidovich, S. Di Mitri, B. Diviacco, A. Fabris, R. Fabris, W. Fawley, M. Ferianis, E. Ferrari, S. Ferry, L. Froehlich, P. Furlan, G. Gaio, F. Gelmetti, L. Giannessi, M. Giannini, R. Gobessi, R. Ivanov, E. Karantzoulis, M. Lonza, A. Lutman, B. Mahieu, M. Milloch, S. V. Milton, M. Musardo, I. Nikolov, S. Noe, F. Parmigiani, G. Penco, M. Petronio, L. Pivetta, M. Predonzani, F. Rossi, L. Rumiz, A. Salom, C. Scafuri, C. Serpico, P. Sigalotti, S. Spampinati, C. Spezzani, M. Svandrlik, C. Svetina, S. Tazzari, M. Trovo, R. Umer, A. Vascotto, M. Veronese, R. Visintini, M. Zaccaria, D. Zangrando, M. Zangrando, “Highly coherent and stable pulses from the FERMI seeded free-electron laser in the extreme ultraviolet,” Nat. Photonics 6(10), 699–704 (2012).
[CrossRef]

Bogan, M. J.

L. Redecke, K. Nass, D. P. DePonte, T. A. White, D. Rehders, A. Barty, F. Stellato, M. Liang, T. R. M. Barends, S. Boutet, G. J. Williams, M. Messerschmidt, M. M. Seibert, A. Aquila, D. Arnlund, S. Bajt, T. Barth, M. J. Bogan, C. Caleman, T. C. Chao, R. B. Doak, H. Fleckenstein, M. Frank, R. Fromme, L. Galli, I. Grotjohann, M. S. Hunter, L. C. Johansson, S. Kassemeyer, G. Katona, R. A. Kirian, R. Koopmann, C. Kupitz, L. Lomb, A. V. Martin, S. Mogk, R. Neutze, R. L. Shoeman, J. Steinbrener, N. Timneanu, D. Wang, U. Weierstall, N. A. Zatsepin, J. C. H. Spence, P. Fromme, I. Schlichting, M. Duszenko, C. Betzel, H. N. Chapman, “Natively inhibited Trypanosoma brucei Cathepsin B structure determined by using an X-ray laser,” Science 339(6116), 227–230 (2013).
[CrossRef] [PubMed]

J. Kern, R. Alonso-Mori, R. Tran, J. Hattne, R. J. Gildea, N. Echols, C. Glöckner, J. Hellmich, H. Laksmono, R. G. Sierra, B. Lassalle-Kaiser, S. Koroidov, A. Lampe, G. Han, S. Gul, D. Difiore, D. Milathianaki, A. R. Fry, A. Miahnahri, D. W. Schafer, M. Messerschmidt, M. M. Seibert, J. E. Koglin, D. Sokaras, T. C. Weng, J. Sellberg, M. J. Latimer, R. W. Grosse-Kunstleve, P. H. Zwart, W. E. White, P. Glatzel, P. D. Adams, M. J. Bogan, G. J. Williams, S. Boutet, J. Messinger, A. Zouni, N. K. Sauter, V. K. Yachandra, U. Bergmann, J. Yano, “Simultaneous femtosecond X-ray spectroscopy and diffraction of photosystem II at room temperature,” Science 340(6131), 491–495 (2013).
[CrossRef] [PubMed]

S. Boutet, L. Lomb, G. J. Williams, T. R. M. Barends, A. Aquila, R. B. Doak, U. Weierstall, D. P. DePonte, J. Steinbrener, R. L. Shoeman, M. Messerschmidt, A. Barty, T. A. White, S. Kassemeyer, R. A. Kirian, M. M. Seibert, P. A. Montanez, C. Kenney, R. Herbst, P. Hart, J. Pines, G. Haller, S. M. Gruner, H. T. Philipp, M. W. Tate, M. Hromalik, L. J. Koerner, N. van Bakel, J. Morse, W. Ghonsalves, D. Arnlund, M. J. Bogan, C. Caleman, R. Fromme, C. Y. Hampton, M. S. Hunter, L. C. Johansson, G. Katona, C. Kupitz, M. Liang, A. V. Martin, K. Nass, L. Redecke, F. Stellato, N. Timneanu, D. Wang, N. A. Zatsepin, D. Schafer, J. Defever, R. Neutze, P. Fromme, J. C. H. Spence, H. N. Chapman, I. Schlichting, “High-resolution protein structure determination by serial femtosecond crystallography,” Science 337(6092), 362–364 (2012).
[CrossRef] [PubMed]

M. M. Seibert, T. Ekeberg, F. R. N. C. Maia, M. Svenda, J. Andreasson, O. Jönsson, D. Odić, B. Iwan, A. Rocker, D. Westphal, M. Hantke, D. P. DePonte, A. Barty, J. Schulz, L. Gumprecht, N. Coppola, A. Aquila, M. Liang, T. A. White, A. Martin, C. Caleman, S. Stern, C. Abergel, V. Seltzer, J. M. Claverie, C. Bostedt, J. D. Bozek, S. Boutet, A. A. Miahnahri, M. Messerschmidt, J. Krzywinski, G. Williams, K. O. Hodgson, M. J. Bogan, C. Y. Hampton, R. G. Sierra, D. Starodub, I. Andersson, S. Bajt, M. Barthelmess, J. C. H. Spence, P. Fromme, U. Weierstall, R. Kirian, M. Hunter, R. B. Doak, S. Marchesini, S. P. Hau-Riege, M. Frank, R. L. Shoeman, L. Lomb, S. W. Epp, R. Hartmann, D. Rolles, A. Rudenko, C. Schmidt, L. Foucar, N. Kimmel, P. Holl, B. Rudek, B. Erk, A. Hömke, C. Reich, D. Pietschner, G. Weidenspointner, L. Strüder, G. Hauser, H. Gorke, J. Ullrich, I. Schlichting, S. Herrmann, G. Schaller, F. Schopper, H. Soltau, K. U. Kühnel, R. Andritschke, C. D. Schröter, F. Krasniqi, M. Bott, S. Schorb, D. Rupp, M. Adolph, T. Gorkhover, H. Hirsemann, G. Potdevin, H. Graafsma, B. Nilsson, H. N. Chapman, J. Hajdu, “Single mimivirus particles intercepted and imaged with an X-ray laser,” Nature 470(7332), 78–81 (2011).
[CrossRef] [PubMed]

C. H. Yoon, P. Schwander, C. Abergel, I. Andersson, J. Andreasson, A. Aquila, S. Bajt, M. Barthelmess, A. Barty, M. J. Bogan, C. Bostedt, J. Bozek, H. N. Chapman, J. M. Claverie, N. Coppola, D. P. DePonte, T. Ekeberg, S. W. Epp, B. Erk, H. Fleckenstein, L. Foucar, H. Graafsma, L. Gumprecht, J. Hajdu, C. Y. Hampton, A. Hartmann, E. Hartmann, R. Hartmann, G. Hauser, H. Hirsemann, P. Holl, S. Kassemeyer, N. Kimmel, M. Kiskinova, M. Liang, N. T. D. Loh, L. Lomb, F. R. N. C. Maia, A. V. Martin, K. Nass, E. Pedersoli, C. Reich, D. Rolles, B. Rudek, A. Rudenko, I. Schlichting, J. Schulz, M. Seibert, V. Seltzer, R. L. Shoeman, R. G. Sierra, H. Soltau, D. Starodub, J. Steinbrener, G. Stier, L. Strüder, M. Svenda, J. Ullrich, G. Weidenspointner, T. A. White, C. Wunderer, A. Ourmazd, “Unsupervised classification of single-particle X-ray diffraction snapshots by spectral clustering,” Opt. Express 19(17), 16542–16549 (2011).
[CrossRef] [PubMed]

M. J. Bogan, D. Starodub, C. Y. Hampton, R. G. Sierra, “Single-particle coherent diffractive imaging with a soft x-ray free electron laser: towards soot aerosol morphology,” J. Phys. At. Mol. Opt. Phys. 43(19), 194013 (2010).
[CrossRef]

H. N. Chapman, A. Barty, M. J. Bogan, S. Boutet, M. Frank, S. P. Hau-Riege, S. Marchesini, B. W. Woods, S. Bajt, W. H. Benner, R. A. London, E. Plönjes, M. Kuhlmann, R. Treusch, S. Düsterer, T. Tschentscher, J. R. Schneider, E. Spiller, T. Möller, C. Bostedt, M. Hoener, D. A. Shapiro, K. O. Hodgson, D. van der Spoel, F. Burmeister, M. Bergh, C. Caleman, G. Huldt, M. M. Seibert, F. R. N. C. Maia, R. W. Lee, A. Szöke, N. Timneanu, J. Hajdu, “Femtosecond diffractive imaging with a soft-X-ray free-electron laser,” Nat. Phys. 2(12), 839–843 (2006).
[CrossRef]

Borga, A.

E. Allaria, R. Appio, L. Badano, W. A. Barletta, S. Bassanese, S. G. Biedron, A. Borga, E. Busetto, D. Castronovo, P. Cinquegrana, S. Cleva, D. Cocco, M. Cornacchia, P. Craievich, I. Cudin, G. D’Auria, M. Dal Forno, M. B. Danailov, R. De Monte, G. De Ninno, P. Delgiusto, A. Demidovich, S. Di Mitri, B. Diviacco, A. Fabris, R. Fabris, W. Fawley, M. Ferianis, E. Ferrari, S. Ferry, L. Froehlich, P. Furlan, G. Gaio, F. Gelmetti, L. Giannessi, M. Giannini, R. Gobessi, R. Ivanov, E. Karantzoulis, M. Lonza, A. Lutman, B. Mahieu, M. Milloch, S. V. Milton, M. Musardo, I. Nikolov, S. Noe, F. Parmigiani, G. Penco, M. Petronio, L. Pivetta, M. Predonzani, F. Rossi, L. Rumiz, A. Salom, C. Scafuri, C. Serpico, P. Sigalotti, S. Spampinati, C. Spezzani, M. Svandrlik, C. Svetina, S. Tazzari, M. Trovo, R. Umer, A. Vascotto, M. Veronese, R. Visintini, M. Zaccaria, D. Zangrando, M. Zangrando, “Highly coherent and stable pulses from the FERMI seeded free-electron laser in the extreme ultraviolet,” Nat. Photonics 6(10), 699–704 (2012).
[CrossRef]

Bostedt, C.

M. M. Seibert, T. Ekeberg, F. R. N. C. Maia, M. Svenda, J. Andreasson, O. Jönsson, D. Odić, B. Iwan, A. Rocker, D. Westphal, M. Hantke, D. P. DePonte, A. Barty, J. Schulz, L. Gumprecht, N. Coppola, A. Aquila, M. Liang, T. A. White, A. Martin, C. Caleman, S. Stern, C. Abergel, V. Seltzer, J. M. Claverie, C. Bostedt, J. D. Bozek, S. Boutet, A. A. Miahnahri, M. Messerschmidt, J. Krzywinski, G. Williams, K. O. Hodgson, M. J. Bogan, C. Y. Hampton, R. G. Sierra, D. Starodub, I. Andersson, S. Bajt, M. Barthelmess, J. C. H. Spence, P. Fromme, U. Weierstall, R. Kirian, M. Hunter, R. B. Doak, S. Marchesini, S. P. Hau-Riege, M. Frank, R. L. Shoeman, L. Lomb, S. W. Epp, R. Hartmann, D. Rolles, A. Rudenko, C. Schmidt, L. Foucar, N. Kimmel, P. Holl, B. Rudek, B. Erk, A. Hömke, C. Reich, D. Pietschner, G. Weidenspointner, L. Strüder, G. Hauser, H. Gorke, J. Ullrich, I. Schlichting, S. Herrmann, G. Schaller, F. Schopper, H. Soltau, K. U. Kühnel, R. Andritschke, C. D. Schröter, F. Krasniqi, M. Bott, S. Schorb, D. Rupp, M. Adolph, T. Gorkhover, H. Hirsemann, G. Potdevin, H. Graafsma, B. Nilsson, H. N. Chapman, J. Hajdu, “Single mimivirus particles intercepted and imaged with an X-ray laser,” Nature 470(7332), 78–81 (2011).
[CrossRef] [PubMed]

C. H. Yoon, P. Schwander, C. Abergel, I. Andersson, J. Andreasson, A. Aquila, S. Bajt, M. Barthelmess, A. Barty, M. J. Bogan, C. Bostedt, J. Bozek, H. N. Chapman, J. M. Claverie, N. Coppola, D. P. DePonte, T. Ekeberg, S. W. Epp, B. Erk, H. Fleckenstein, L. Foucar, H. Graafsma, L. Gumprecht, J. Hajdu, C. Y. Hampton, A. Hartmann, E. Hartmann, R. Hartmann, G. Hauser, H. Hirsemann, P. Holl, S. Kassemeyer, N. Kimmel, M. Kiskinova, M. Liang, N. T. D. Loh, L. Lomb, F. R. N. C. Maia, A. V. Martin, K. Nass, E. Pedersoli, C. Reich, D. Rolles, B. Rudek, A. Rudenko, I. Schlichting, J. Schulz, M. Seibert, V. Seltzer, R. L. Shoeman, R. G. Sierra, H. Soltau, D. Starodub, J. Steinbrener, G. Stier, L. Strüder, M. Svenda, J. Ullrich, G. Weidenspointner, T. A. White, C. Wunderer, A. Ourmazd, “Unsupervised classification of single-particle X-ray diffraction snapshots by spectral clustering,” Opt. Express 19(17), 16542–16549 (2011).
[CrossRef] [PubMed]

H. N. Chapman, A. Barty, M. J. Bogan, S. Boutet, M. Frank, S. P. Hau-Riege, S. Marchesini, B. W. Woods, S. Bajt, W. H. Benner, R. A. London, E. Plönjes, M. Kuhlmann, R. Treusch, S. Düsterer, T. Tschentscher, J. R. Schneider, E. Spiller, T. Möller, C. Bostedt, M. Hoener, D. A. Shapiro, K. O. Hodgson, D. van der Spoel, F. Burmeister, M. Bergh, C. Caleman, G. Huldt, M. M. Seibert, F. R. N. C. Maia, R. W. Lee, A. Szöke, N. Timneanu, J. Hajdu, “Femtosecond diffractive imaging with a soft-X-ray free-electron laser,” Nat. Phys. 2(12), 839–843 (2006).
[CrossRef]

Bott, M.

M. M. Seibert, T. Ekeberg, F. R. N. C. Maia, M. Svenda, J. Andreasson, O. Jönsson, D. Odić, B. Iwan, A. Rocker, D. Westphal, M. Hantke, D. P. DePonte, A. Barty, J. Schulz, L. Gumprecht, N. Coppola, A. Aquila, M. Liang, T. A. White, A. Martin, C. Caleman, S. Stern, C. Abergel, V. Seltzer, J. M. Claverie, C. Bostedt, J. D. Bozek, S. Boutet, A. A. Miahnahri, M. Messerschmidt, J. Krzywinski, G. Williams, K. O. Hodgson, M. J. Bogan, C. Y. Hampton, R. G. Sierra, D. Starodub, I. Andersson, S. Bajt, M. Barthelmess, J. C. H. Spence, P. Fromme, U. Weierstall, R. Kirian, M. Hunter, R. B. Doak, S. Marchesini, S. P. Hau-Riege, M. Frank, R. L. Shoeman, L. Lomb, S. W. Epp, R. Hartmann, D. Rolles, A. Rudenko, C. Schmidt, L. Foucar, N. Kimmel, P. Holl, B. Rudek, B. Erk, A. Hömke, C. Reich, D. Pietschner, G. Weidenspointner, L. Strüder, G. Hauser, H. Gorke, J. Ullrich, I. Schlichting, S. Herrmann, G. Schaller, F. Schopper, H. Soltau, K. U. Kühnel, R. Andritschke, C. D. Schröter, F. Krasniqi, M. Bott, S. Schorb, D. Rupp, M. Adolph, T. Gorkhover, H. Hirsemann, G. Potdevin, H. Graafsma, B. Nilsson, H. N. Chapman, J. Hajdu, “Single mimivirus particles intercepted and imaged with an X-ray laser,” Nature 470(7332), 78–81 (2011).
[CrossRef] [PubMed]

Boutet, S.

J. Kern, R. Alonso-Mori, R. Tran, J. Hattne, R. J. Gildea, N. Echols, C. Glöckner, J. Hellmich, H. Laksmono, R. G. Sierra, B. Lassalle-Kaiser, S. Koroidov, A. Lampe, G. Han, S. Gul, D. Difiore, D. Milathianaki, A. R. Fry, A. Miahnahri, D. W. Schafer, M. Messerschmidt, M. M. Seibert, J. E. Koglin, D. Sokaras, T. C. Weng, J. Sellberg, M. J. Latimer, R. W. Grosse-Kunstleve, P. H. Zwart, W. E. White, P. Glatzel, P. D. Adams, M. J. Bogan, G. J. Williams, S. Boutet, J. Messinger, A. Zouni, N. K. Sauter, V. K. Yachandra, U. Bergmann, J. Yano, “Simultaneous femtosecond X-ray spectroscopy and diffraction of photosystem II at room temperature,” Science 340(6131), 491–495 (2013).
[CrossRef] [PubMed]

L. Redecke, K. Nass, D. P. DePonte, T. A. White, D. Rehders, A. Barty, F. Stellato, M. Liang, T. R. M. Barends, S. Boutet, G. J. Williams, M. Messerschmidt, M. M. Seibert, A. Aquila, D. Arnlund, S. Bajt, T. Barth, M. J. Bogan, C. Caleman, T. C. Chao, R. B. Doak, H. Fleckenstein, M. Frank, R. Fromme, L. Galli, I. Grotjohann, M. S. Hunter, L. C. Johansson, S. Kassemeyer, G. Katona, R. A. Kirian, R. Koopmann, C. Kupitz, L. Lomb, A. V. Martin, S. Mogk, R. Neutze, R. L. Shoeman, J. Steinbrener, N. Timneanu, D. Wang, U. Weierstall, N. A. Zatsepin, J. C. H. Spence, P. Fromme, I. Schlichting, M. Duszenko, C. Betzel, H. N. Chapman, “Natively inhibited Trypanosoma brucei Cathepsin B structure determined by using an X-ray laser,” Science 339(6116), 227–230 (2013).
[CrossRef] [PubMed]

S. Boutet, L. Lomb, G. J. Williams, T. R. M. Barends, A. Aquila, R. B. Doak, U. Weierstall, D. P. DePonte, J. Steinbrener, R. L. Shoeman, M. Messerschmidt, A. Barty, T. A. White, S. Kassemeyer, R. A. Kirian, M. M. Seibert, P. A. Montanez, C. Kenney, R. Herbst, P. Hart, J. Pines, G. Haller, S. M. Gruner, H. T. Philipp, M. W. Tate, M. Hromalik, L. J. Koerner, N. van Bakel, J. Morse, W. Ghonsalves, D. Arnlund, M. J. Bogan, C. Caleman, R. Fromme, C. Y. Hampton, M. S. Hunter, L. C. Johansson, G. Katona, C. Kupitz, M. Liang, A. V. Martin, K. Nass, L. Redecke, F. Stellato, N. Timneanu, D. Wang, N. A. Zatsepin, D. Schafer, J. Defever, R. Neutze, P. Fromme, J. C. H. Spence, H. N. Chapman, I. Schlichting, “High-resolution protein structure determination by serial femtosecond crystallography,” Science 337(6092), 362–364 (2012).
[CrossRef] [PubMed]

M. M. Seibert, T. Ekeberg, F. R. N. C. Maia, M. Svenda, J. Andreasson, O. Jönsson, D. Odić, B. Iwan, A. Rocker, D. Westphal, M. Hantke, D. P. DePonte, A. Barty, J. Schulz, L. Gumprecht, N. Coppola, A. Aquila, M. Liang, T. A. White, A. Martin, C. Caleman, S. Stern, C. Abergel, V. Seltzer, J. M. Claverie, C. Bostedt, J. D. Bozek, S. Boutet, A. A. Miahnahri, M. Messerschmidt, J. Krzywinski, G. Williams, K. O. Hodgson, M. J. Bogan, C. Y. Hampton, R. G. Sierra, D. Starodub, I. Andersson, S. Bajt, M. Barthelmess, J. C. H. Spence, P. Fromme, U. Weierstall, R. Kirian, M. Hunter, R. B. Doak, S. Marchesini, S. P. Hau-Riege, M. Frank, R. L. Shoeman, L. Lomb, S. W. Epp, R. Hartmann, D. Rolles, A. Rudenko, C. Schmidt, L. Foucar, N. Kimmel, P. Holl, B. Rudek, B. Erk, A. Hömke, C. Reich, D. Pietschner, G. Weidenspointner, L. Strüder, G. Hauser, H. Gorke, J. Ullrich, I. Schlichting, S. Herrmann, G. Schaller, F. Schopper, H. Soltau, K. U. Kühnel, R. Andritschke, C. D. Schröter, F. Krasniqi, M. Bott, S. Schorb, D. Rupp, M. Adolph, T. Gorkhover, H. Hirsemann, G. Potdevin, H. Graafsma, B. Nilsson, H. N. Chapman, J. Hajdu, “Single mimivirus particles intercepted and imaged with an X-ray laser,” Nature 470(7332), 78–81 (2011).
[CrossRef] [PubMed]

H. N. Chapman, A. Barty, M. J. Bogan, S. Boutet, M. Frank, S. P. Hau-Riege, S. Marchesini, B. W. Woods, S. Bajt, W. H. Benner, R. A. London, E. Plönjes, M. Kuhlmann, R. Treusch, S. Düsterer, T. Tschentscher, J. R. Schneider, E. Spiller, T. Möller, C. Bostedt, M. Hoener, D. A. Shapiro, K. O. Hodgson, D. van der Spoel, F. Burmeister, M. Bergh, C. Caleman, G. Huldt, M. M. Seibert, F. R. N. C. Maia, R. W. Lee, A. Szöke, N. Timneanu, J. Hajdu, “Femtosecond diffractive imaging with a soft-X-ray free-electron laser,” Nat. Phys. 2(12), 839–843 (2006).
[CrossRef]

Bozek, J.

Bozek, J. D.

M. M. Seibert, T. Ekeberg, F. R. N. C. Maia, M. Svenda, J. Andreasson, O. Jönsson, D. Odić, B. Iwan, A. Rocker, D. Westphal, M. Hantke, D. P. DePonte, A. Barty, J. Schulz, L. Gumprecht, N. Coppola, A. Aquila, M. Liang, T. A. White, A. Martin, C. Caleman, S. Stern, C. Abergel, V. Seltzer, J. M. Claverie, C. Bostedt, J. D. Bozek, S. Boutet, A. A. Miahnahri, M. Messerschmidt, J. Krzywinski, G. Williams, K. O. Hodgson, M. J. Bogan, C. Y. Hampton, R. G. Sierra, D. Starodub, I. Andersson, S. Bajt, M. Barthelmess, J. C. H. Spence, P. Fromme, U. Weierstall, R. Kirian, M. Hunter, R. B. Doak, S. Marchesini, S. P. Hau-Riege, M. Frank, R. L. Shoeman, L. Lomb, S. W. Epp, R. Hartmann, D. Rolles, A. Rudenko, C. Schmidt, L. Foucar, N. Kimmel, P. Holl, B. Rudek, B. Erk, A. Hömke, C. Reich, D. Pietschner, G. Weidenspointner, L. Strüder, G. Hauser, H. Gorke, J. Ullrich, I. Schlichting, S. Herrmann, G. Schaller, F. Schopper, H. Soltau, K. U. Kühnel, R. Andritschke, C. D. Schröter, F. Krasniqi, M. Bott, S. Schorb, D. Rupp, M. Adolph, T. Gorkhover, H. Hirsemann, G. Potdevin, H. Graafsma, B. Nilsson, H. N. Chapman, J. Hajdu, “Single mimivirus particles intercepted and imaged with an X-ray laser,” Nature 470(7332), 78–81 (2011).
[CrossRef] [PubMed]

Burmeister, F.

H. N. Chapman, A. Barty, M. J. Bogan, S. Boutet, M. Frank, S. P. Hau-Riege, S. Marchesini, B. W. Woods, S. Bajt, W. H. Benner, R. A. London, E. Plönjes, M. Kuhlmann, R. Treusch, S. Düsterer, T. Tschentscher, J. R. Schneider, E. Spiller, T. Möller, C. Bostedt, M. Hoener, D. A. Shapiro, K. O. Hodgson, D. van der Spoel, F. Burmeister, M. Bergh, C. Caleman, G. Huldt, M. M. Seibert, F. R. N. C. Maia, R. W. Lee, A. Szöke, N. Timneanu, J. Hajdu, “Femtosecond diffractive imaging with a soft-X-ray free-electron laser,” Nat. Phys. 2(12), 839–843 (2006).
[CrossRef]

Busetto, E.

E. Allaria, R. Appio, L. Badano, W. A. Barletta, S. Bassanese, S. G. Biedron, A. Borga, E. Busetto, D. Castronovo, P. Cinquegrana, S. Cleva, D. Cocco, M. Cornacchia, P. Craievich, I. Cudin, G. D’Auria, M. Dal Forno, M. B. Danailov, R. De Monte, G. De Ninno, P. Delgiusto, A. Demidovich, S. Di Mitri, B. Diviacco, A. Fabris, R. Fabris, W. Fawley, M. Ferianis, E. Ferrari, S. Ferry, L. Froehlich, P. Furlan, G. Gaio, F. Gelmetti, L. Giannessi, M. Giannini, R. Gobessi, R. Ivanov, E. Karantzoulis, M. Lonza, A. Lutman, B. Mahieu, M. Milloch, S. V. Milton, M. Musardo, I. Nikolov, S. Noe, F. Parmigiani, G. Penco, M. Petronio, L. Pivetta, M. Predonzani, F. Rossi, L. Rumiz, A. Salom, C. Scafuri, C. Serpico, P. Sigalotti, S. Spampinati, C. Spezzani, M. Svandrlik, C. Svetina, S. Tazzari, M. Trovo, R. Umer, A. Vascotto, M. Veronese, R. Visintini, M. Zaccaria, D. Zangrando, M. Zangrando, “Highly coherent and stable pulses from the FERMI seeded free-electron laser in the extreme ultraviolet,” Nat. Photonics 6(10), 699–704 (2012).
[CrossRef]

Caleman, C.

L. Redecke, K. Nass, D. P. DePonte, T. A. White, D. Rehders, A. Barty, F. Stellato, M. Liang, T. R. M. Barends, S. Boutet, G. J. Williams, M. Messerschmidt, M. M. Seibert, A. Aquila, D. Arnlund, S. Bajt, T. Barth, M. J. Bogan, C. Caleman, T. C. Chao, R. B. Doak, H. Fleckenstein, M. Frank, R. Fromme, L. Galli, I. Grotjohann, M. S. Hunter, L. C. Johansson, S. Kassemeyer, G. Katona, R. A. Kirian, R. Koopmann, C. Kupitz, L. Lomb, A. V. Martin, S. Mogk, R. Neutze, R. L. Shoeman, J. Steinbrener, N. Timneanu, D. Wang, U. Weierstall, N. A. Zatsepin, J. C. H. Spence, P. Fromme, I. Schlichting, M. Duszenko, C. Betzel, H. N. Chapman, “Natively inhibited Trypanosoma brucei Cathepsin B structure determined by using an X-ray laser,” Science 339(6116), 227–230 (2013).
[CrossRef] [PubMed]

S. Boutet, L. Lomb, G. J. Williams, T. R. M. Barends, A. Aquila, R. B. Doak, U. Weierstall, D. P. DePonte, J. Steinbrener, R. L. Shoeman, M. Messerschmidt, A. Barty, T. A. White, S. Kassemeyer, R. A. Kirian, M. M. Seibert, P. A. Montanez, C. Kenney, R. Herbst, P. Hart, J. Pines, G. Haller, S. M. Gruner, H. T. Philipp, M. W. Tate, M. Hromalik, L. J. Koerner, N. van Bakel, J. Morse, W. Ghonsalves, D. Arnlund, M. J. Bogan, C. Caleman, R. Fromme, C. Y. Hampton, M. S. Hunter, L. C. Johansson, G. Katona, C. Kupitz, M. Liang, A. V. Martin, K. Nass, L. Redecke, F. Stellato, N. Timneanu, D. Wang, N. A. Zatsepin, D. Schafer, J. Defever, R. Neutze, P. Fromme, J. C. H. Spence, H. N. Chapman, I. Schlichting, “High-resolution protein structure determination by serial femtosecond crystallography,” Science 337(6092), 362–364 (2012).
[CrossRef] [PubMed]

M. M. Seibert, T. Ekeberg, F. R. N. C. Maia, M. Svenda, J. Andreasson, O. Jönsson, D. Odić, B. Iwan, A. Rocker, D. Westphal, M. Hantke, D. P. DePonte, A. Barty, J. Schulz, L. Gumprecht, N. Coppola, A. Aquila, M. Liang, T. A. White, A. Martin, C. Caleman, S. Stern, C. Abergel, V. Seltzer, J. M. Claverie, C. Bostedt, J. D. Bozek, S. Boutet, A. A. Miahnahri, M. Messerschmidt, J. Krzywinski, G. Williams, K. O. Hodgson, M. J. Bogan, C. Y. Hampton, R. G. Sierra, D. Starodub, I. Andersson, S. Bajt, M. Barthelmess, J. C. H. Spence, P. Fromme, U. Weierstall, R. Kirian, M. Hunter, R. B. Doak, S. Marchesini, S. P. Hau-Riege, M. Frank, R. L. Shoeman, L. Lomb, S. W. Epp, R. Hartmann, D. Rolles, A. Rudenko, C. Schmidt, L. Foucar, N. Kimmel, P. Holl, B. Rudek, B. Erk, A. Hömke, C. Reich, D. Pietschner, G. Weidenspointner, L. Strüder, G. Hauser, H. Gorke, J. Ullrich, I. Schlichting, S. Herrmann, G. Schaller, F. Schopper, H. Soltau, K. U. Kühnel, R. Andritschke, C. D. Schröter, F. Krasniqi, M. Bott, S. Schorb, D. Rupp, M. Adolph, T. Gorkhover, H. Hirsemann, G. Potdevin, H. Graafsma, B. Nilsson, H. N. Chapman, J. Hajdu, “Single mimivirus particles intercepted and imaged with an X-ray laser,” Nature 470(7332), 78–81 (2011).
[CrossRef] [PubMed]

H. N. Chapman, A. Barty, M. J. Bogan, S. Boutet, M. Frank, S. P. Hau-Riege, S. Marchesini, B. W. Woods, S. Bajt, W. H. Benner, R. A. London, E. Plönjes, M. Kuhlmann, R. Treusch, S. Düsterer, T. Tschentscher, J. R. Schneider, E. Spiller, T. Möller, C. Bostedt, M. Hoener, D. A. Shapiro, K. O. Hodgson, D. van der Spoel, F. Burmeister, M. Bergh, C. Caleman, G. Huldt, M. M. Seibert, F. R. N. C. Maia, R. W. Lee, A. Szöke, N. Timneanu, J. Hajdu, “Femtosecond diffractive imaging with a soft-X-ray free-electron laser,” Nat. Phys. 2(12), 839–843 (2006).
[CrossRef]

Capotondi, F.

F. Capotondi, E. Pedersoli, N. Mahne, R. H. Menk, G. Passos, L. Raimondi, C. Svetina, G. Sandrin, M. Zangrando, M. Kiskinova, S. Bajt, M. Barthelmess, H. Fleckenstein, H. N. Chapman, J. Schulz, J. Bach, R. Frömter, S. Schleitzer, L. Müller, C. Gutt, G. Grübel, “Invited article: Coherent imaging using seeded free-electron laser pulses with variable polarization: First results and research opportunities,” Rev. Sci. Instrum. 84(5), 051301 (2013).
[CrossRef] [PubMed]

Carazo, J. M.

S. H. W. Scheres, H. Gao, M. Valle, G. T. Herman, P. P. B. Eggermont, J. Frank, J. M. Carazo, “Disentangling conformational states of macromolecules in 3D-EM through likelihood optimization,” Nat. Methods 4(1), 27–29 (2007).
[CrossRef] [PubMed]

Castronovo, D.

E. Allaria, R. Appio, L. Badano, W. A. Barletta, S. Bassanese, S. G. Biedron, A. Borga, E. Busetto, D. Castronovo, P. Cinquegrana, S. Cleva, D. Cocco, M. Cornacchia, P. Craievich, I. Cudin, G. D’Auria, M. Dal Forno, M. B. Danailov, R. De Monte, G. De Ninno, P. Delgiusto, A. Demidovich, S. Di Mitri, B. Diviacco, A. Fabris, R. Fabris, W. Fawley, M. Ferianis, E. Ferrari, S. Ferry, L. Froehlich, P. Furlan, G. Gaio, F. Gelmetti, L. Giannessi, M. Giannini, R. Gobessi, R. Ivanov, E. Karantzoulis, M. Lonza, A. Lutman, B. Mahieu, M. Milloch, S. V. Milton, M. Musardo, I. Nikolov, S. Noe, F. Parmigiani, G. Penco, M. Petronio, L. Pivetta, M. Predonzani, F. Rossi, L. Rumiz, A. Salom, C. Scafuri, C. Serpico, P. Sigalotti, S. Spampinati, C. Spezzani, M. Svandrlik, C. Svetina, S. Tazzari, M. Trovo, R. Umer, A. Vascotto, M. Veronese, R. Visintini, M. Zaccaria, D. Zangrando, M. Zangrando, “Highly coherent and stable pulses from the FERMI seeded free-electron laser in the extreme ultraviolet,” Nat. Photonics 6(10), 699–704 (2012).
[CrossRef]

Chao, T. C.

L. Redecke, K. Nass, D. P. DePonte, T. A. White, D. Rehders, A. Barty, F. Stellato, M. Liang, T. R. M. Barends, S. Boutet, G. J. Williams, M. Messerschmidt, M. M. Seibert, A. Aquila, D. Arnlund, S. Bajt, T. Barth, M. J. Bogan, C. Caleman, T. C. Chao, R. B. Doak, H. Fleckenstein, M. Frank, R. Fromme, L. Galli, I. Grotjohann, M. S. Hunter, L. C. Johansson, S. Kassemeyer, G. Katona, R. A. Kirian, R. Koopmann, C. Kupitz, L. Lomb, A. V. Martin, S. Mogk, R. Neutze, R. L. Shoeman, J. Steinbrener, N. Timneanu, D. Wang, U. Weierstall, N. A. Zatsepin, J. C. H. Spence, P. Fromme, I. Schlichting, M. Duszenko, C. Betzel, H. N. Chapman, “Natively inhibited Trypanosoma brucei Cathepsin B structure determined by using an X-ray laser,” Science 339(6116), 227–230 (2013).
[CrossRef] [PubMed]

Chapman, H. N.

L. Redecke, K. Nass, D. P. DePonte, T. A. White, D. Rehders, A. Barty, F. Stellato, M. Liang, T. R. M. Barends, S. Boutet, G. J. Williams, M. Messerschmidt, M. M. Seibert, A. Aquila, D. Arnlund, S. Bajt, T. Barth, M. J. Bogan, C. Caleman, T. C. Chao, R. B. Doak, H. Fleckenstein, M. Frank, R. Fromme, L. Galli, I. Grotjohann, M. S. Hunter, L. C. Johansson, S. Kassemeyer, G. Katona, R. A. Kirian, R. Koopmann, C. Kupitz, L. Lomb, A. V. Martin, S. Mogk, R. Neutze, R. L. Shoeman, J. Steinbrener, N. Timneanu, D. Wang, U. Weierstall, N. A. Zatsepin, J. C. H. Spence, P. Fromme, I. Schlichting, M. Duszenko, C. Betzel, H. N. Chapman, “Natively inhibited Trypanosoma brucei Cathepsin B structure determined by using an X-ray laser,” Science 339(6116), 227–230 (2013).
[CrossRef] [PubMed]

F. Capotondi, E. Pedersoli, N. Mahne, R. H. Menk, G. Passos, L. Raimondi, C. Svetina, G. Sandrin, M. Zangrando, M. Kiskinova, S. Bajt, M. Barthelmess, H. Fleckenstein, H. N. Chapman, J. Schulz, J. Bach, R. Frömter, S. Schleitzer, L. Müller, C. Gutt, G. Grübel, “Invited article: Coherent imaging using seeded free-electron laser pulses with variable polarization: First results and research opportunities,” Rev. Sci. Instrum. 84(5), 051301 (2013).
[CrossRef] [PubMed]

S. Boutet, L. Lomb, G. J. Williams, T. R. M. Barends, A. Aquila, R. B. Doak, U. Weierstall, D. P. DePonte, J. Steinbrener, R. L. Shoeman, M. Messerschmidt, A. Barty, T. A. White, S. Kassemeyer, R. A. Kirian, M. M. Seibert, P. A. Montanez, C. Kenney, R. Herbst, P. Hart, J. Pines, G. Haller, S. M. Gruner, H. T. Philipp, M. W. Tate, M. Hromalik, L. J. Koerner, N. van Bakel, J. Morse, W. Ghonsalves, D. Arnlund, M. J. Bogan, C. Caleman, R. Fromme, C. Y. Hampton, M. S. Hunter, L. C. Johansson, G. Katona, C. Kupitz, M. Liang, A. V. Martin, K. Nass, L. Redecke, F. Stellato, N. Timneanu, D. Wang, N. A. Zatsepin, D. Schafer, J. Defever, R. Neutze, P. Fromme, J. C. H. Spence, H. N. Chapman, I. Schlichting, “High-resolution protein structure determination by serial femtosecond crystallography,” Science 337(6092), 362–364 (2012).
[CrossRef] [PubMed]

M. M. Seibert, T. Ekeberg, F. R. N. C. Maia, M. Svenda, J. Andreasson, O. Jönsson, D. Odić, B. Iwan, A. Rocker, D. Westphal, M. Hantke, D. P. DePonte, A. Barty, J. Schulz, L. Gumprecht, N. Coppola, A. Aquila, M. Liang, T. A. White, A. Martin, C. Caleman, S. Stern, C. Abergel, V. Seltzer, J. M. Claverie, C. Bostedt, J. D. Bozek, S. Boutet, A. A. Miahnahri, M. Messerschmidt, J. Krzywinski, G. Williams, K. O. Hodgson, M. J. Bogan, C. Y. Hampton, R. G. Sierra, D. Starodub, I. Andersson, S. Bajt, M. Barthelmess, J. C. H. Spence, P. Fromme, U. Weierstall, R. Kirian, M. Hunter, R. B. Doak, S. Marchesini, S. P. Hau-Riege, M. Frank, R. L. Shoeman, L. Lomb, S. W. Epp, R. Hartmann, D. Rolles, A. Rudenko, C. Schmidt, L. Foucar, N. Kimmel, P. Holl, B. Rudek, B. Erk, A. Hömke, C. Reich, D. Pietschner, G. Weidenspointner, L. Strüder, G. Hauser, H. Gorke, J. Ullrich, I. Schlichting, S. Herrmann, G. Schaller, F. Schopper, H. Soltau, K. U. Kühnel, R. Andritschke, C. D. Schröter, F. Krasniqi, M. Bott, S. Schorb, D. Rupp, M. Adolph, T. Gorkhover, H. Hirsemann, G. Potdevin, H. Graafsma, B. Nilsson, H. N. Chapman, J. Hajdu, “Single mimivirus particles intercepted and imaged with an X-ray laser,” Nature 470(7332), 78–81 (2011).
[CrossRef] [PubMed]

C. H. Yoon, P. Schwander, C. Abergel, I. Andersson, J. Andreasson, A. Aquila, S. Bajt, M. Barthelmess, A. Barty, M. J. Bogan, C. Bostedt, J. Bozek, H. N. Chapman, J. M. Claverie, N. Coppola, D. P. DePonte, T. Ekeberg, S. W. Epp, B. Erk, H. Fleckenstein, L. Foucar, H. Graafsma, L. Gumprecht, J. Hajdu, C. Y. Hampton, A. Hartmann, E. Hartmann, R. Hartmann, G. Hauser, H. Hirsemann, P. Holl, S. Kassemeyer, N. Kimmel, M. Kiskinova, M. Liang, N. T. D. Loh, L. Lomb, F. R. N. C. Maia, A. V. Martin, K. Nass, E. Pedersoli, C. Reich, D. Rolles, B. Rudek, A. Rudenko, I. Schlichting, J. Schulz, M. Seibert, V. Seltzer, R. L. Shoeman, R. G. Sierra, H. Soltau, D. Starodub, J. Steinbrener, G. Stier, L. Strüder, M. Svenda, J. Ullrich, G. Weidenspointner, T. A. White, C. Wunderer, A. Ourmazd, “Unsupervised classification of single-particle X-ray diffraction snapshots by spectral clustering,” Opt. Express 19(17), 16542–16549 (2011).
[CrossRef] [PubMed]

H. N. Chapman, “X-ray imaging beyond the limits,” Nat. Mater. 8(4), 299–301 (2009).
[CrossRef] [PubMed]

H. N. Chapman, A. Barty, M. J. Bogan, S. Boutet, M. Frank, S. P. Hau-Riege, S. Marchesini, B. W. Woods, S. Bajt, W. H. Benner, R. A. London, E. Plönjes, M. Kuhlmann, R. Treusch, S. Düsterer, T. Tschentscher, J. R. Schneider, E. Spiller, T. Möller, C. Bostedt, M. Hoener, D. A. Shapiro, K. O. Hodgson, D. van der Spoel, F. Burmeister, M. Bergh, C. Caleman, G. Huldt, M. M. Seibert, F. R. N. C. Maia, R. W. Lee, A. Szöke, N. Timneanu, J. Hajdu, “Femtosecond diffractive imaging with a soft-X-ray free-electron laser,” Nat. Phys. 2(12), 839–843 (2006).
[CrossRef]

H. N. Chapman, A. Barty, S. Marchesini, A. Noy, S. P. Hau-Riege, C. Cui, M. R. Howells, R. Rosen, H. He, J. C. H. Spence, U. Weierstall, T. Beetz, C. Jacobsen, D. Shapiro, “High-resolution ab initio three-dimensional x-ray diffraction microscopy,” J. Opt. Soc. Am. A 23(5), 1179 (2006).
[CrossRef]

S. Marchesini, H. He, H. N. Chapman, S. P. Hau-Riege, A. Noy, M. R. Howells, U. Weierstall, J. C. H. Spence, “X-ray image reconstruction from a diffraction pattern alone,” Phys. Rev. B 68(14), 140101 (2003).
[CrossRef]

Christophis, C.

A. P. Mancuso, T. Gorniak, F. Staier, O. M. Yefanov, R. Barth, C. Christophis, B. Reime, J. Gulden, A. Singer, M. E. Pettit, T. Nisius, T. Wilhein, C. Gutt, G. Grübel, N. Guerassimova, R. Treusch, J. Feldhaus, S. Eisebitt, E. Weckert, M. Grunze, A. Rosenhahn, I. A. Vartanyants, “Coherent imaging of biological samples with femtosecond pulses at the free-electron laser FLASH,” New J. Phys. 12(3), 035003 (2010).
[CrossRef]

Cinquegrana, P.

E. Allaria, R. Appio, L. Badano, W. A. Barletta, S. Bassanese, S. G. Biedron, A. Borga, E. Busetto, D. Castronovo, P. Cinquegrana, S. Cleva, D. Cocco, M. Cornacchia, P. Craievich, I. Cudin, G. D’Auria, M. Dal Forno, M. B. Danailov, R. De Monte, G. De Ninno, P. Delgiusto, A. Demidovich, S. Di Mitri, B. Diviacco, A. Fabris, R. Fabris, W. Fawley, M. Ferianis, E. Ferrari, S. Ferry, L. Froehlich, P. Furlan, G. Gaio, F. Gelmetti, L. Giannessi, M. Giannini, R. Gobessi, R. Ivanov, E. Karantzoulis, M. Lonza, A. Lutman, B. Mahieu, M. Milloch, S. V. Milton, M. Musardo, I. Nikolov, S. Noe, F. Parmigiani, G. Penco, M. Petronio, L. Pivetta, M. Predonzani, F. Rossi, L. Rumiz, A. Salom, C. Scafuri, C. Serpico, P. Sigalotti, S. Spampinati, C. Spezzani, M. Svandrlik, C. Svetina, S. Tazzari, M. Trovo, R. Umer, A. Vascotto, M. Veronese, R. Visintini, M. Zaccaria, D. Zangrando, M. Zangrando, “Highly coherent and stable pulses from the FERMI seeded free-electron laser in the extreme ultraviolet,” Nat. Photonics 6(10), 699–704 (2012).
[CrossRef]

Claverie, J. M.

M. M. Seibert, T. Ekeberg, F. R. N. C. Maia, M. Svenda, J. Andreasson, O. Jönsson, D. Odić, B. Iwan, A. Rocker, D. Westphal, M. Hantke, D. P. DePonte, A. Barty, J. Schulz, L. Gumprecht, N. Coppola, A. Aquila, M. Liang, T. A. White, A. Martin, C. Caleman, S. Stern, C. Abergel, V. Seltzer, J. M. Claverie, C. Bostedt, J. D. Bozek, S. Boutet, A. A. Miahnahri, M. Messerschmidt, J. Krzywinski, G. Williams, K. O. Hodgson, M. J. Bogan, C. Y. Hampton, R. G. Sierra, D. Starodub, I. Andersson, S. Bajt, M. Barthelmess, J. C. H. Spence, P. Fromme, U. Weierstall, R. Kirian, M. Hunter, R. B. Doak, S. Marchesini, S. P. Hau-Riege, M. Frank, R. L. Shoeman, L. Lomb, S. W. Epp, R. Hartmann, D. Rolles, A. Rudenko, C. Schmidt, L. Foucar, N. Kimmel, P. Holl, B. Rudek, B. Erk, A. Hömke, C. Reich, D. Pietschner, G. Weidenspointner, L. Strüder, G. Hauser, H. Gorke, J. Ullrich, I. Schlichting, S. Herrmann, G. Schaller, F. Schopper, H. Soltau, K. U. Kühnel, R. Andritschke, C. D. Schröter, F. Krasniqi, M. Bott, S. Schorb, D. Rupp, M. Adolph, T. Gorkhover, H. Hirsemann, G. Potdevin, H. Graafsma, B. Nilsson, H. N. Chapman, J. Hajdu, “Single mimivirus particles intercepted and imaged with an X-ray laser,” Nature 470(7332), 78–81 (2011).
[CrossRef] [PubMed]

C. H. Yoon, P. Schwander, C. Abergel, I. Andersson, J. Andreasson, A. Aquila, S. Bajt, M. Barthelmess, A. Barty, M. J. Bogan, C. Bostedt, J. Bozek, H. N. Chapman, J. M. Claverie, N. Coppola, D. P. DePonte, T. Ekeberg, S. W. Epp, B. Erk, H. Fleckenstein, L. Foucar, H. Graafsma, L. Gumprecht, J. Hajdu, C. Y. Hampton, A. Hartmann, E. Hartmann, R. Hartmann, G. Hauser, H. Hirsemann, P. Holl, S. Kassemeyer, N. Kimmel, M. Kiskinova, M. Liang, N. T. D. Loh, L. Lomb, F. R. N. C. Maia, A. V. Martin, K. Nass, E. Pedersoli, C. Reich, D. Rolles, B. Rudek, A. Rudenko, I. Schlichting, J. Schulz, M. Seibert, V. Seltzer, R. L. Shoeman, R. G. Sierra, H. Soltau, D. Starodub, J. Steinbrener, G. Stier, L. Strüder, M. Svenda, J. Ullrich, G. Weidenspointner, T. A. White, C. Wunderer, A. Ourmazd, “Unsupervised classification of single-particle X-ray diffraction snapshots by spectral clustering,” Opt. Express 19(17), 16542–16549 (2011).
[CrossRef] [PubMed]

Cleva, S.

E. Allaria, R. Appio, L. Badano, W. A. Barletta, S. Bassanese, S. G. Biedron, A. Borga, E. Busetto, D. Castronovo, P. Cinquegrana, S. Cleva, D. Cocco, M. Cornacchia, P. Craievich, I. Cudin, G. D’Auria, M. Dal Forno, M. B. Danailov, R. De Monte, G. De Ninno, P. Delgiusto, A. Demidovich, S. Di Mitri, B. Diviacco, A. Fabris, R. Fabris, W. Fawley, M. Ferianis, E. Ferrari, S. Ferry, L. Froehlich, P. Furlan, G. Gaio, F. Gelmetti, L. Giannessi, M. Giannini, R. Gobessi, R. Ivanov, E. Karantzoulis, M. Lonza, A. Lutman, B. Mahieu, M. Milloch, S. V. Milton, M. Musardo, I. Nikolov, S. Noe, F. Parmigiani, G. Penco, M. Petronio, L. Pivetta, M. Predonzani, F. Rossi, L. Rumiz, A. Salom, C. Scafuri, C. Serpico, P. Sigalotti, S. Spampinati, C. Spezzani, M. Svandrlik, C. Svetina, S. Tazzari, M. Trovo, R. Umer, A. Vascotto, M. Veronese, R. Visintini, M. Zaccaria, D. Zangrando, M. Zangrando, “Highly coherent and stable pulses from the FERMI seeded free-electron laser in the extreme ultraviolet,” Nat. Photonics 6(10), 699–704 (2012).
[CrossRef]

Cocco, D.

E. Allaria, R. Appio, L. Badano, W. A. Barletta, S. Bassanese, S. G. Biedron, A. Borga, E. Busetto, D. Castronovo, P. Cinquegrana, S. Cleva, D. Cocco, M. Cornacchia, P. Craievich, I. Cudin, G. D’Auria, M. Dal Forno, M. B. Danailov, R. De Monte, G. De Ninno, P. Delgiusto, A. Demidovich, S. Di Mitri, B. Diviacco, A. Fabris, R. Fabris, W. Fawley, M. Ferianis, E. Ferrari, S. Ferry, L. Froehlich, P. Furlan, G. Gaio, F. Gelmetti, L. Giannessi, M. Giannini, R. Gobessi, R. Ivanov, E. Karantzoulis, M. Lonza, A. Lutman, B. Mahieu, M. Milloch, S. V. Milton, M. Musardo, I. Nikolov, S. Noe, F. Parmigiani, G. Penco, M. Petronio, L. Pivetta, M. Predonzani, F. Rossi, L. Rumiz, A. Salom, C. Scafuri, C. Serpico, P. Sigalotti, S. Spampinati, C. Spezzani, M. Svandrlik, C. Svetina, S. Tazzari, M. Trovo, R. Umer, A. Vascotto, M. Veronese, R. Visintini, M. Zaccaria, D. Zangrando, M. Zangrando, “Highly coherent and stable pulses from the FERMI seeded free-electron laser in the extreme ultraviolet,” Nat. Photonics 6(10), 699–704 (2012).
[CrossRef]

Coppola, N.

C. H. Yoon, P. Schwander, C. Abergel, I. Andersson, J. Andreasson, A. Aquila, S. Bajt, M. Barthelmess, A. Barty, M. J. Bogan, C. Bostedt, J. Bozek, H. N. Chapman, J. M. Claverie, N. Coppola, D. P. DePonte, T. Ekeberg, S. W. Epp, B. Erk, H. Fleckenstein, L. Foucar, H. Graafsma, L. Gumprecht, J. Hajdu, C. Y. Hampton, A. Hartmann, E. Hartmann, R. Hartmann, G. Hauser, H. Hirsemann, P. Holl, S. Kassemeyer, N. Kimmel, M. Kiskinova, M. Liang, N. T. D. Loh, L. Lomb, F. R. N. C. Maia, A. V. Martin, K. Nass, E. Pedersoli, C. Reich, D. Rolles, B. Rudek, A. Rudenko, I. Schlichting, J. Schulz, M. Seibert, V. Seltzer, R. L. Shoeman, R. G. Sierra, H. Soltau, D. Starodub, J. Steinbrener, G. Stier, L. Strüder, M. Svenda, J. Ullrich, G. Weidenspointner, T. A. White, C. Wunderer, A. Ourmazd, “Unsupervised classification of single-particle X-ray diffraction snapshots by spectral clustering,” Opt. Express 19(17), 16542–16549 (2011).
[CrossRef] [PubMed]

M. M. Seibert, T. Ekeberg, F. R. N. C. Maia, M. Svenda, J. Andreasson, O. Jönsson, D. Odić, B. Iwan, A. Rocker, D. Westphal, M. Hantke, D. P. DePonte, A. Barty, J. Schulz, L. Gumprecht, N. Coppola, A. Aquila, M. Liang, T. A. White, A. Martin, C. Caleman, S. Stern, C. Abergel, V. Seltzer, J. M. Claverie, C. Bostedt, J. D. Bozek, S. Boutet, A. A. Miahnahri, M. Messerschmidt, J. Krzywinski, G. Williams, K. O. Hodgson, M. J. Bogan, C. Y. Hampton, R. G. Sierra, D. Starodub, I. Andersson, S. Bajt, M. Barthelmess, J. C. H. Spence, P. Fromme, U. Weierstall, R. Kirian, M. Hunter, R. B. Doak, S. Marchesini, S. P. Hau-Riege, M. Frank, R. L. Shoeman, L. Lomb, S. W. Epp, R. Hartmann, D. Rolles, A. Rudenko, C. Schmidt, L. Foucar, N. Kimmel, P. Holl, B. Rudek, B. Erk, A. Hömke, C. Reich, D. Pietschner, G. Weidenspointner, L. Strüder, G. Hauser, H. Gorke, J. Ullrich, I. Schlichting, S. Herrmann, G. Schaller, F. Schopper, H. Soltau, K. U. Kühnel, R. Andritschke, C. D. Schröter, F. Krasniqi, M. Bott, S. Schorb, D. Rupp, M. Adolph, T. Gorkhover, H. Hirsemann, G. Potdevin, H. Graafsma, B. Nilsson, H. N. Chapman, J. Hajdu, “Single mimivirus particles intercepted and imaged with an X-ray laser,” Nature 470(7332), 78–81 (2011).
[CrossRef] [PubMed]

Cornacchia, M.

E. Allaria, R. Appio, L. Badano, W. A. Barletta, S. Bassanese, S. G. Biedron, A. Borga, E. Busetto, D. Castronovo, P. Cinquegrana, S. Cleva, D. Cocco, M. Cornacchia, P. Craievich, I. Cudin, G. D’Auria, M. Dal Forno, M. B. Danailov, R. De Monte, G. De Ninno, P. Delgiusto, A. Demidovich, S. Di Mitri, B. Diviacco, A. Fabris, R. Fabris, W. Fawley, M. Ferianis, E. Ferrari, S. Ferry, L. Froehlich, P. Furlan, G. Gaio, F. Gelmetti, L. Giannessi, M. Giannini, R. Gobessi, R. Ivanov, E. Karantzoulis, M. Lonza, A. Lutman, B. Mahieu, M. Milloch, S. V. Milton, M. Musardo, I. Nikolov, S. Noe, F. Parmigiani, G. Penco, M. Petronio, L. Pivetta, M. Predonzani, F. Rossi, L. Rumiz, A. Salom, C. Scafuri, C. Serpico, P. Sigalotti, S. Spampinati, C. Spezzani, M. Svandrlik, C. Svetina, S. Tazzari, M. Trovo, R. Umer, A. Vascotto, M. Veronese, R. Visintini, M. Zaccaria, D. Zangrando, M. Zangrando, “Highly coherent and stable pulses from the FERMI seeded free-electron laser in the extreme ultraviolet,” Nat. Photonics 6(10), 699–704 (2012).
[CrossRef]

Craievich, P.

E. Allaria, R. Appio, L. Badano, W. A. Barletta, S. Bassanese, S. G. Biedron, A. Borga, E. Busetto, D. Castronovo, P. Cinquegrana, S. Cleva, D. Cocco, M. Cornacchia, P. Craievich, I. Cudin, G. D’Auria, M. Dal Forno, M. B. Danailov, R. De Monte, G. De Ninno, P. Delgiusto, A. Demidovich, S. Di Mitri, B. Diviacco, A. Fabris, R. Fabris, W. Fawley, M. Ferianis, E. Ferrari, S. Ferry, L. Froehlich, P. Furlan, G. Gaio, F. Gelmetti, L. Giannessi, M. Giannini, R. Gobessi, R. Ivanov, E. Karantzoulis, M. Lonza, A. Lutman, B. Mahieu, M. Milloch, S. V. Milton, M. Musardo, I. Nikolov, S. Noe, F. Parmigiani, G. Penco, M. Petronio, L. Pivetta, M. Predonzani, F. Rossi, L. Rumiz, A. Salom, C. Scafuri, C. Serpico, P. Sigalotti, S. Spampinati, C. Spezzani, M. Svandrlik, C. Svetina, S. Tazzari, M. Trovo, R. Umer, A. Vascotto, M. Veronese, R. Visintini, M. Zaccaria, D. Zangrando, M. Zangrando, “Highly coherent and stable pulses from the FERMI seeded free-electron laser in the extreme ultraviolet,” Nat. Photonics 6(10), 699–704 (2012).
[CrossRef]

Cudin, I.

E. Allaria, R. Appio, L. Badano, W. A. Barletta, S. Bassanese, S. G. Biedron, A. Borga, E. Busetto, D. Castronovo, P. Cinquegrana, S. Cleva, D. Cocco, M. Cornacchia, P. Craievich, I. Cudin, G. D’Auria, M. Dal Forno, M. B. Danailov, R. De Monte, G. De Ninno, P. Delgiusto, A. Demidovich, S. Di Mitri, B. Diviacco, A. Fabris, R. Fabris, W. Fawley, M. Ferianis, E. Ferrari, S. Ferry, L. Froehlich, P. Furlan, G. Gaio, F. Gelmetti, L. Giannessi, M. Giannini, R. Gobessi, R. Ivanov, E. Karantzoulis, M. Lonza, A. Lutman, B. Mahieu, M. Milloch, S. V. Milton, M. Musardo, I. Nikolov, S. Noe, F. Parmigiani, G. Penco, M. Petronio, L. Pivetta, M. Predonzani, F. Rossi, L. Rumiz, A. Salom, C. Scafuri, C. Serpico, P. Sigalotti, S. Spampinati, C. Spezzani, M. Svandrlik, C. Svetina, S. Tazzari, M. Trovo, R. Umer, A. Vascotto, M. Veronese, R. Visintini, M. Zaccaria, D. Zangrando, M. Zangrando, “Highly coherent and stable pulses from the FERMI seeded free-electron laser in the extreme ultraviolet,” Nat. Photonics 6(10), 699–704 (2012).
[CrossRef]

Cui, C.

D’Auria, G.

E. Allaria, R. Appio, L. Badano, W. A. Barletta, S. Bassanese, S. G. Biedron, A. Borga, E. Busetto, D. Castronovo, P. Cinquegrana, S. Cleva, D. Cocco, M. Cornacchia, P. Craievich, I. Cudin, G. D’Auria, M. Dal Forno, M. B. Danailov, R. De Monte, G. De Ninno, P. Delgiusto, A. Demidovich, S. Di Mitri, B. Diviacco, A. Fabris, R. Fabris, W. Fawley, M. Ferianis, E. Ferrari, S. Ferry, L. Froehlich, P. Furlan, G. Gaio, F. Gelmetti, L. Giannessi, M. Giannini, R. Gobessi, R. Ivanov, E. Karantzoulis, M. Lonza, A. Lutman, B. Mahieu, M. Milloch, S. V. Milton, M. Musardo, I. Nikolov, S. Noe, F. Parmigiani, G. Penco, M. Petronio, L. Pivetta, M. Predonzani, F. Rossi, L. Rumiz, A. Salom, C. Scafuri, C. Serpico, P. Sigalotti, S. Spampinati, C. Spezzani, M. Svandrlik, C. Svetina, S. Tazzari, M. Trovo, R. Umer, A. Vascotto, M. Veronese, R. Visintini, M. Zaccaria, D. Zangrando, M. Zangrando, “Highly coherent and stable pulses from the FERMI seeded free-electron laser in the extreme ultraviolet,” Nat. Photonics 6(10), 699–704 (2012).
[CrossRef]

Dal Forno, M.

E. Allaria, R. Appio, L. Badano, W. A. Barletta, S. Bassanese, S. G. Biedron, A. Borga, E. Busetto, D. Castronovo, P. Cinquegrana, S. Cleva, D. Cocco, M. Cornacchia, P. Craievich, I. Cudin, G. D’Auria, M. Dal Forno, M. B. Danailov, R. De Monte, G. De Ninno, P. Delgiusto, A. Demidovich, S. Di Mitri, B. Diviacco, A. Fabris, R. Fabris, W. Fawley, M. Ferianis, E. Ferrari, S. Ferry, L. Froehlich, P. Furlan, G. Gaio, F. Gelmetti, L. Giannessi, M. Giannini, R. Gobessi, R. Ivanov, E. Karantzoulis, M. Lonza, A. Lutman, B. Mahieu, M. Milloch, S. V. Milton, M. Musardo, I. Nikolov, S. Noe, F. Parmigiani, G. Penco, M. Petronio, L. Pivetta, M. Predonzani, F. Rossi, L. Rumiz, A. Salom, C. Scafuri, C. Serpico, P. Sigalotti, S. Spampinati, C. Spezzani, M. Svandrlik, C. Svetina, S. Tazzari, M. Trovo, R. Umer, A. Vascotto, M. Veronese, R. Visintini, M. Zaccaria, D. Zangrando, M. Zangrando, “Highly coherent and stable pulses from the FERMI seeded free-electron laser in the extreme ultraviolet,” Nat. Photonics 6(10), 699–704 (2012).
[CrossRef]

Danailov, M. B.

E. Allaria, R. Appio, L. Badano, W. A. Barletta, S. Bassanese, S. G. Biedron, A. Borga, E. Busetto, D. Castronovo, P. Cinquegrana, S. Cleva, D. Cocco, M. Cornacchia, P. Craievich, I. Cudin, G. D’Auria, M. Dal Forno, M. B. Danailov, R. De Monte, G. De Ninno, P. Delgiusto, A. Demidovich, S. Di Mitri, B. Diviacco, A. Fabris, R. Fabris, W. Fawley, M. Ferianis, E. Ferrari, S. Ferry, L. Froehlich, P. Furlan, G. Gaio, F. Gelmetti, L. Giannessi, M. Giannini, R. Gobessi, R. Ivanov, E. Karantzoulis, M. Lonza, A. Lutman, B. Mahieu, M. Milloch, S. V. Milton, M. Musardo, I. Nikolov, S. Noe, F. Parmigiani, G. Penco, M. Petronio, L. Pivetta, M. Predonzani, F. Rossi, L. Rumiz, A. Salom, C. Scafuri, C. Serpico, P. Sigalotti, S. Spampinati, C. Spezzani, M. Svandrlik, C. Svetina, S. Tazzari, M. Trovo, R. Umer, A. Vascotto, M. Veronese, R. Visintini, M. Zaccaria, D. Zangrando, M. Zangrando, “Highly coherent and stable pulses from the FERMI seeded free-electron laser in the extreme ultraviolet,” Nat. Photonics 6(10), 699–704 (2012).
[CrossRef]

De Monte, R.

E. Allaria, R. Appio, L. Badano, W. A. Barletta, S. Bassanese, S. G. Biedron, A. Borga, E. Busetto, D. Castronovo, P. Cinquegrana, S. Cleva, D. Cocco, M. Cornacchia, P. Craievich, I. Cudin, G. D’Auria, M. Dal Forno, M. B. Danailov, R. De Monte, G. De Ninno, P. Delgiusto, A. Demidovich, S. Di Mitri, B. Diviacco, A. Fabris, R. Fabris, W. Fawley, M. Ferianis, E. Ferrari, S. Ferry, L. Froehlich, P. Furlan, G. Gaio, F. Gelmetti, L. Giannessi, M. Giannini, R. Gobessi, R. Ivanov, E. Karantzoulis, M. Lonza, A. Lutman, B. Mahieu, M. Milloch, S. V. Milton, M. Musardo, I. Nikolov, S. Noe, F. Parmigiani, G. Penco, M. Petronio, L. Pivetta, M. Predonzani, F. Rossi, L. Rumiz, A. Salom, C. Scafuri, C. Serpico, P. Sigalotti, S. Spampinati, C. Spezzani, M. Svandrlik, C. Svetina, S. Tazzari, M. Trovo, R. Umer, A. Vascotto, M. Veronese, R. Visintini, M. Zaccaria, D. Zangrando, M. Zangrando, “Highly coherent and stable pulses from the FERMI seeded free-electron laser in the extreme ultraviolet,” Nat. Photonics 6(10), 699–704 (2012).
[CrossRef]

De Ninno, G.

E. Allaria, R. Appio, L. Badano, W. A. Barletta, S. Bassanese, S. G. Biedron, A. Borga, E. Busetto, D. Castronovo, P. Cinquegrana, S. Cleva, D. Cocco, M. Cornacchia, P. Craievich, I. Cudin, G. D’Auria, M. Dal Forno, M. B. Danailov, R. De Monte, G. De Ninno, P. Delgiusto, A. Demidovich, S. Di Mitri, B. Diviacco, A. Fabris, R. Fabris, W. Fawley, M. Ferianis, E. Ferrari, S. Ferry, L. Froehlich, P. Furlan, G. Gaio, F. Gelmetti, L. Giannessi, M. Giannini, R. Gobessi, R. Ivanov, E. Karantzoulis, M. Lonza, A. Lutman, B. Mahieu, M. Milloch, S. V. Milton, M. Musardo, I. Nikolov, S. Noe, F. Parmigiani, G. Penco, M. Petronio, L. Pivetta, M. Predonzani, F. Rossi, L. Rumiz, A. Salom, C. Scafuri, C. Serpico, P. Sigalotti, S. Spampinati, C. Spezzani, M. Svandrlik, C. Svetina, S. Tazzari, M. Trovo, R. Umer, A. Vascotto, M. Veronese, R. Visintini, M. Zaccaria, D. Zangrando, M. Zangrando, “Highly coherent and stable pulses from the FERMI seeded free-electron laser in the extreme ultraviolet,” Nat. Photonics 6(10), 699–704 (2012).
[CrossRef]

de Silva, V.

J. B. Tenenbaum, V. de Silva, J. C. Langford, “A global geometric framework for nonlinear dimensionality reduction,” Science 290(5500), 2319–2323 (2000).
[CrossRef] [PubMed]

Defever, J.

S. Boutet, L. Lomb, G. J. Williams, T. R. M. Barends, A. Aquila, R. B. Doak, U. Weierstall, D. P. DePonte, J. Steinbrener, R. L. Shoeman, M. Messerschmidt, A. Barty, T. A. White, S. Kassemeyer, R. A. Kirian, M. M. Seibert, P. A. Montanez, C. Kenney, R. Herbst, P. Hart, J. Pines, G. Haller, S. M. Gruner, H. T. Philipp, M. W. Tate, M. Hromalik, L. J. Koerner, N. van Bakel, J. Morse, W. Ghonsalves, D. Arnlund, M. J. Bogan, C. Caleman, R. Fromme, C. Y. Hampton, M. S. Hunter, L. C. Johansson, G. Katona, C. Kupitz, M. Liang, A. V. Martin, K. Nass, L. Redecke, F. Stellato, N. Timneanu, D. Wang, N. A. Zatsepin, D. Schafer, J. Defever, R. Neutze, P. Fromme, J. C. H. Spence, H. N. Chapman, I. Schlichting, “High-resolution protein structure determination by serial femtosecond crystallography,” Science 337(6092), 362–364 (2012).
[CrossRef] [PubMed]

Delgiusto, P.

E. Allaria, R. Appio, L. Badano, W. A. Barletta, S. Bassanese, S. G. Biedron, A. Borga, E. Busetto, D. Castronovo, P. Cinquegrana, S. Cleva, D. Cocco, M. Cornacchia, P. Craievich, I. Cudin, G. D’Auria, M. Dal Forno, M. B. Danailov, R. De Monte, G. De Ninno, P. Delgiusto, A. Demidovich, S. Di Mitri, B. Diviacco, A. Fabris, R. Fabris, W. Fawley, M. Ferianis, E. Ferrari, S. Ferry, L. Froehlich, P. Furlan, G. Gaio, F. Gelmetti, L. Giannessi, M. Giannini, R. Gobessi, R. Ivanov, E. Karantzoulis, M. Lonza, A. Lutman, B. Mahieu, M. Milloch, S. V. Milton, M. Musardo, I. Nikolov, S. Noe, F. Parmigiani, G. Penco, M. Petronio, L. Pivetta, M. Predonzani, F. Rossi, L. Rumiz, A. Salom, C. Scafuri, C. Serpico, P. Sigalotti, S. Spampinati, C. Spezzani, M. Svandrlik, C. Svetina, S. Tazzari, M. Trovo, R. Umer, A. Vascotto, M. Veronese, R. Visintini, M. Zaccaria, D. Zangrando, M. Zangrando, “Highly coherent and stable pulses from the FERMI seeded free-electron laser in the extreme ultraviolet,” Nat. Photonics 6(10), 699–704 (2012).
[CrossRef]

Demidovich, A.

E. Allaria, R. Appio, L. Badano, W. A. Barletta, S. Bassanese, S. G. Biedron, A. Borga, E. Busetto, D. Castronovo, P. Cinquegrana, S. Cleva, D. Cocco, M. Cornacchia, P. Craievich, I. Cudin, G. D’Auria, M. Dal Forno, M. B. Danailov, R. De Monte, G. De Ninno, P. Delgiusto, A. Demidovich, S. Di Mitri, B. Diviacco, A. Fabris, R. Fabris, W. Fawley, M. Ferianis, E. Ferrari, S. Ferry, L. Froehlich, P. Furlan, G. Gaio, F. Gelmetti, L. Giannessi, M. Giannini, R. Gobessi, R. Ivanov, E. Karantzoulis, M. Lonza, A. Lutman, B. Mahieu, M. Milloch, S. V. Milton, M. Musardo, I. Nikolov, S. Noe, F. Parmigiani, G. Penco, M. Petronio, L. Pivetta, M. Predonzani, F. Rossi, L. Rumiz, A. Salom, C. Scafuri, C. Serpico, P. Sigalotti, S. Spampinati, C. Spezzani, M. Svandrlik, C. Svetina, S. Tazzari, M. Trovo, R. Umer, A. Vascotto, M. Veronese, R. Visintini, M. Zaccaria, D. Zangrando, M. Zangrando, “Highly coherent and stable pulses from the FERMI seeded free-electron laser in the extreme ultraviolet,” Nat. Photonics 6(10), 699–704 (2012).
[CrossRef]

DePonte, D. P.

L. Redecke, K. Nass, D. P. DePonte, T. A. White, D. Rehders, A. Barty, F. Stellato, M. Liang, T. R. M. Barends, S. Boutet, G. J. Williams, M. Messerschmidt, M. M. Seibert, A. Aquila, D. Arnlund, S. Bajt, T. Barth, M. J. Bogan, C. Caleman, T. C. Chao, R. B. Doak, H. Fleckenstein, M. Frank, R. Fromme, L. Galli, I. Grotjohann, M. S. Hunter, L. C. Johansson, S. Kassemeyer, G. Katona, R. A. Kirian, R. Koopmann, C. Kupitz, L. Lomb, A. V. Martin, S. Mogk, R. Neutze, R. L. Shoeman, J. Steinbrener, N. Timneanu, D. Wang, U. Weierstall, N. A. Zatsepin, J. C. H. Spence, P. Fromme, I. Schlichting, M. Duszenko, C. Betzel, H. N. Chapman, “Natively inhibited Trypanosoma brucei Cathepsin B structure determined by using an X-ray laser,” Science 339(6116), 227–230 (2013).
[CrossRef] [PubMed]

S. Boutet, L. Lomb, G. J. Williams, T. R. M. Barends, A. Aquila, R. B. Doak, U. Weierstall, D. P. DePonte, J. Steinbrener, R. L. Shoeman, M. Messerschmidt, A. Barty, T. A. White, S. Kassemeyer, R. A. Kirian, M. M. Seibert, P. A. Montanez, C. Kenney, R. Herbst, P. Hart, J. Pines, G. Haller, S. M. Gruner, H. T. Philipp, M. W. Tate, M. Hromalik, L. J. Koerner, N. van Bakel, J. Morse, W. Ghonsalves, D. Arnlund, M. J. Bogan, C. Caleman, R. Fromme, C. Y. Hampton, M. S. Hunter, L. C. Johansson, G. Katona, C. Kupitz, M. Liang, A. V. Martin, K. Nass, L. Redecke, F. Stellato, N. Timneanu, D. Wang, N. A. Zatsepin, D. Schafer, J. Defever, R. Neutze, P. Fromme, J. C. H. Spence, H. N. Chapman, I. Schlichting, “High-resolution protein structure determination by serial femtosecond crystallography,” Science 337(6092), 362–364 (2012).
[CrossRef] [PubMed]

M. M. Seibert, T. Ekeberg, F. R. N. C. Maia, M. Svenda, J. Andreasson, O. Jönsson, D. Odić, B. Iwan, A. Rocker, D. Westphal, M. Hantke, D. P. DePonte, A. Barty, J. Schulz, L. Gumprecht, N. Coppola, A. Aquila, M. Liang, T. A. White, A. Martin, C. Caleman, S. Stern, C. Abergel, V. Seltzer, J. M. Claverie, C. Bostedt, J. D. Bozek, S. Boutet, A. A. Miahnahri, M. Messerschmidt, J. Krzywinski, G. Williams, K. O. Hodgson, M. J. Bogan, C. Y. Hampton, R. G. Sierra, D. Starodub, I. Andersson, S. Bajt, M. Barthelmess, J. C. H. Spence, P. Fromme, U. Weierstall, R. Kirian, M. Hunter, R. B. Doak, S. Marchesini, S. P. Hau-Riege, M. Frank, R. L. Shoeman, L. Lomb, S. W. Epp, R. Hartmann, D. Rolles, A. Rudenko, C. Schmidt, L. Foucar, N. Kimmel, P. Holl, B. Rudek, B. Erk, A. Hömke, C. Reich, D. Pietschner, G. Weidenspointner, L. Strüder, G. Hauser, H. Gorke, J. Ullrich, I. Schlichting, S. Herrmann, G. Schaller, F. Schopper, H. Soltau, K. U. Kühnel, R. Andritschke, C. D. Schröter, F. Krasniqi, M. Bott, S. Schorb, D. Rupp, M. Adolph, T. Gorkhover, H. Hirsemann, G. Potdevin, H. Graafsma, B. Nilsson, H. N. Chapman, J. Hajdu, “Single mimivirus particles intercepted and imaged with an X-ray laser,” Nature 470(7332), 78–81 (2011).
[CrossRef] [PubMed]

C. H. Yoon, P. Schwander, C. Abergel, I. Andersson, J. Andreasson, A. Aquila, S. Bajt, M. Barthelmess, A. Barty, M. J. Bogan, C. Bostedt, J. Bozek, H. N. Chapman, J. M. Claverie, N. Coppola, D. P. DePonte, T. Ekeberg, S. W. Epp, B. Erk, H. Fleckenstein, L. Foucar, H. Graafsma, L. Gumprecht, J. Hajdu, C. Y. Hampton, A. Hartmann, E. Hartmann, R. Hartmann, G. Hauser, H. Hirsemann, P. Holl, S. Kassemeyer, N. Kimmel, M. Kiskinova, M. Liang, N. T. D. Loh, L. Lomb, F. R. N. C. Maia, A. V. Martin, K. Nass, E. Pedersoli, C. Reich, D. Rolles, B. Rudek, A. Rudenko, I. Schlichting, J. Schulz, M. Seibert, V. Seltzer, R. L. Shoeman, R. G. Sierra, H. Soltau, D. Starodub, J. Steinbrener, G. Stier, L. Strüder, M. Svenda, J. Ullrich, G. Weidenspointner, T. A. White, C. Wunderer, A. Ourmazd, “Unsupervised classification of single-particle X-ray diffraction snapshots by spectral clustering,” Opt. Express 19(17), 16542–16549 (2011).
[CrossRef] [PubMed]

Di Mitri, S.

E. Allaria, R. Appio, L. Badano, W. A. Barletta, S. Bassanese, S. G. Biedron, A. Borga, E. Busetto, D. Castronovo, P. Cinquegrana, S. Cleva, D. Cocco, M. Cornacchia, P. Craievich, I. Cudin, G. D’Auria, M. Dal Forno, M. B. Danailov, R. De Monte, G. De Ninno, P. Delgiusto, A. Demidovich, S. Di Mitri, B. Diviacco, A. Fabris, R. Fabris, W. Fawley, M. Ferianis, E. Ferrari, S. Ferry, L. Froehlich, P. Furlan, G. Gaio, F. Gelmetti, L. Giannessi, M. Giannini, R. Gobessi, R. Ivanov, E. Karantzoulis, M. Lonza, A. Lutman, B. Mahieu, M. Milloch, S. V. Milton, M. Musardo, I. Nikolov, S. Noe, F. Parmigiani, G. Penco, M. Petronio, L. Pivetta, M. Predonzani, F. Rossi, L. Rumiz, A. Salom, C. Scafuri, C. Serpico, P. Sigalotti, S. Spampinati, C. Spezzani, M. Svandrlik, C. Svetina, S. Tazzari, M. Trovo, R. Umer, A. Vascotto, M. Veronese, R. Visintini, M. Zaccaria, D. Zangrando, M. Zangrando, “Highly coherent and stable pulses from the FERMI seeded free-electron laser in the extreme ultraviolet,” Nat. Photonics 6(10), 699–704 (2012).
[CrossRef]

Difiore, D.

J. Kern, R. Alonso-Mori, R. Tran, J. Hattne, R. J. Gildea, N. Echols, C. Glöckner, J. Hellmich, H. Laksmono, R. G. Sierra, B. Lassalle-Kaiser, S. Koroidov, A. Lampe, G. Han, S. Gul, D. Difiore, D. Milathianaki, A. R. Fry, A. Miahnahri, D. W. Schafer, M. Messerschmidt, M. M. Seibert, J. E. Koglin, D. Sokaras, T. C. Weng, J. Sellberg, M. J. Latimer, R. W. Grosse-Kunstleve, P. H. Zwart, W. E. White, P. Glatzel, P. D. Adams, M. J. Bogan, G. J. Williams, S. Boutet, J. Messinger, A. Zouni, N. K. Sauter, V. K. Yachandra, U. Bergmann, J. Yano, “Simultaneous femtosecond X-ray spectroscopy and diffraction of photosystem II at room temperature,” Science 340(6131), 491–495 (2013).
[CrossRef] [PubMed]

Diviacco, B.

E. Allaria, R. Appio, L. Badano, W. A. Barletta, S. Bassanese, S. G. Biedron, A. Borga, E. Busetto, D. Castronovo, P. Cinquegrana, S. Cleva, D. Cocco, M. Cornacchia, P. Craievich, I. Cudin, G. D’Auria, M. Dal Forno, M. B. Danailov, R. De Monte, G. De Ninno, P. Delgiusto, A. Demidovich, S. Di Mitri, B. Diviacco, A. Fabris, R. Fabris, W. Fawley, M. Ferianis, E. Ferrari, S. Ferry, L. Froehlich, P. Furlan, G. Gaio, F. Gelmetti, L. Giannessi, M. Giannini, R. Gobessi, R. Ivanov, E. Karantzoulis, M. Lonza, A. Lutman, B. Mahieu, M. Milloch, S. V. Milton, M. Musardo, I. Nikolov, S. Noe, F. Parmigiani, G. Penco, M. Petronio, L. Pivetta, M. Predonzani, F. Rossi, L. Rumiz, A. Salom, C. Scafuri, C. Serpico, P. Sigalotti, S. Spampinati, C. Spezzani, M. Svandrlik, C. Svetina, S. Tazzari, M. Trovo, R. Umer, A. Vascotto, M. Veronese, R. Visintini, M. Zaccaria, D. Zangrando, M. Zangrando, “Highly coherent and stable pulses from the FERMI seeded free-electron laser in the extreme ultraviolet,” Nat. Photonics 6(10), 699–704 (2012).
[CrossRef]

Doak, R. B.

L. Redecke, K. Nass, D. P. DePonte, T. A. White, D. Rehders, A. Barty, F. Stellato, M. Liang, T. R. M. Barends, S. Boutet, G. J. Williams, M. Messerschmidt, M. M. Seibert, A. Aquila, D. Arnlund, S. Bajt, T. Barth, M. J. Bogan, C. Caleman, T. C. Chao, R. B. Doak, H. Fleckenstein, M. Frank, R. Fromme, L. Galli, I. Grotjohann, M. S. Hunter, L. C. Johansson, S. Kassemeyer, G. Katona, R. A. Kirian, R. Koopmann, C. Kupitz, L. Lomb, A. V. Martin, S. Mogk, R. Neutze, R. L. Shoeman, J. Steinbrener, N. Timneanu, D. Wang, U. Weierstall, N. A. Zatsepin, J. C. H. Spence, P. Fromme, I. Schlichting, M. Duszenko, C. Betzel, H. N. Chapman, “Natively inhibited Trypanosoma brucei Cathepsin B structure determined by using an X-ray laser,” Science 339(6116), 227–230 (2013).
[CrossRef] [PubMed]

S. Boutet, L. Lomb, G. J. Williams, T. R. M. Barends, A. Aquila, R. B. Doak, U. Weierstall, D. P. DePonte, J. Steinbrener, R. L. Shoeman, M. Messerschmidt, A. Barty, T. A. White, S. Kassemeyer, R. A. Kirian, M. M. Seibert, P. A. Montanez, C. Kenney, R. Herbst, P. Hart, J. Pines, G. Haller, S. M. Gruner, H. T. Philipp, M. W. Tate, M. Hromalik, L. J. Koerner, N. van Bakel, J. Morse, W. Ghonsalves, D. Arnlund, M. J. Bogan, C. Caleman, R. Fromme, C. Y. Hampton, M. S. Hunter, L. C. Johansson, G. Katona, C. Kupitz, M. Liang, A. V. Martin, K. Nass, L. Redecke, F. Stellato, N. Timneanu, D. Wang, N. A. Zatsepin, D. Schafer, J. Defever, R. Neutze, P. Fromme, J. C. H. Spence, H. N. Chapman, I. Schlichting, “High-resolution protein structure determination by serial femtosecond crystallography,” Science 337(6092), 362–364 (2012).
[CrossRef] [PubMed]

M. M. Seibert, T. Ekeberg, F. R. N. C. Maia, M. Svenda, J. Andreasson, O. Jönsson, D. Odić, B. Iwan, A. Rocker, D. Westphal, M. Hantke, D. P. DePonte, A. Barty, J. Schulz, L. Gumprecht, N. Coppola, A. Aquila, M. Liang, T. A. White, A. Martin, C. Caleman, S. Stern, C. Abergel, V. Seltzer, J. M. Claverie, C. Bostedt, J. D. Bozek, S. Boutet, A. A. Miahnahri, M. Messerschmidt, J. Krzywinski, G. Williams, K. O. Hodgson, M. J. Bogan, C. Y. Hampton, R. G. Sierra, D. Starodub, I. Andersson, S. Bajt, M. Barthelmess, J. C. H. Spence, P. Fromme, U. Weierstall, R. Kirian, M. Hunter, R. B. Doak, S. Marchesini, S. P. Hau-Riege, M. Frank, R. L. Shoeman, L. Lomb, S. W. Epp, R. Hartmann, D. Rolles, A. Rudenko, C. Schmidt, L. Foucar, N. Kimmel, P. Holl, B. Rudek, B. Erk, A. Hömke, C. Reich, D. Pietschner, G. Weidenspointner, L. Strüder, G. Hauser, H. Gorke, J. Ullrich, I. Schlichting, S. Herrmann, G. Schaller, F. Schopper, H. Soltau, K. U. Kühnel, R. Andritschke, C. D. Schröter, F. Krasniqi, M. Bott, S. Schorb, D. Rupp, M. Adolph, T. Gorkhover, H. Hirsemann, G. Potdevin, H. Graafsma, B. Nilsson, H. N. Chapman, J. Hajdu, “Single mimivirus particles intercepted and imaged with an X-ray laser,” Nature 470(7332), 78–81 (2011).
[CrossRef] [PubMed]

Düsterer, S.

H. N. Chapman, A. Barty, M. J. Bogan, S. Boutet, M. Frank, S. P. Hau-Riege, S. Marchesini, B. W. Woods, S. Bajt, W. H. Benner, R. A. London, E. Plönjes, M. Kuhlmann, R. Treusch, S. Düsterer, T. Tschentscher, J. R. Schneider, E. Spiller, T. Möller, C. Bostedt, M. Hoener, D. A. Shapiro, K. O. Hodgson, D. van der Spoel, F. Burmeister, M. Bergh, C. Caleman, G. Huldt, M. M. Seibert, F. R. N. C. Maia, R. W. Lee, A. Szöke, N. Timneanu, J. Hajdu, “Femtosecond diffractive imaging with a soft-X-ray free-electron laser,” Nat. Phys. 2(12), 839–843 (2006).
[CrossRef]

Duszenko, M.

L. Redecke, K. Nass, D. P. DePonte, T. A. White, D. Rehders, A. Barty, F. Stellato, M. Liang, T. R. M. Barends, S. Boutet, G. J. Williams, M. Messerschmidt, M. M. Seibert, A. Aquila, D. Arnlund, S. Bajt, T. Barth, M. J. Bogan, C. Caleman, T. C. Chao, R. B. Doak, H. Fleckenstein, M. Frank, R. Fromme, L. Galli, I. Grotjohann, M. S. Hunter, L. C. Johansson, S. Kassemeyer, G. Katona, R. A. Kirian, R. Koopmann, C. Kupitz, L. Lomb, A. V. Martin, S. Mogk, R. Neutze, R. L. Shoeman, J. Steinbrener, N. Timneanu, D. Wang, U. Weierstall, N. A. Zatsepin, J. C. H. Spence, P. Fromme, I. Schlichting, M. Duszenko, C. Betzel, H. N. Chapman, “Natively inhibited Trypanosoma brucei Cathepsin B structure determined by using an X-ray laser,” Science 339(6116), 227–230 (2013).
[CrossRef] [PubMed]

Echols, N.

J. Kern, R. Alonso-Mori, R. Tran, J. Hattne, R. J. Gildea, N. Echols, C. Glöckner, J. Hellmich, H. Laksmono, R. G. Sierra, B. Lassalle-Kaiser, S. Koroidov, A. Lampe, G. Han, S. Gul, D. Difiore, D. Milathianaki, A. R. Fry, A. Miahnahri, D. W. Schafer, M. Messerschmidt, M. M. Seibert, J. E. Koglin, D. Sokaras, T. C. Weng, J. Sellberg, M. J. Latimer, R. W. Grosse-Kunstleve, P. H. Zwart, W. E. White, P. Glatzel, P. D. Adams, M. J. Bogan, G. J. Williams, S. Boutet, J. Messinger, A. Zouni, N. K. Sauter, V. K. Yachandra, U. Bergmann, J. Yano, “Simultaneous femtosecond X-ray spectroscopy and diffraction of photosystem II at room temperature,” Science 340(6131), 491–495 (2013).
[CrossRef] [PubMed]

Eggermont, P. P. B.

S. H. W. Scheres, H. Gao, M. Valle, G. T. Herman, P. P. B. Eggermont, J. Frank, J. M. Carazo, “Disentangling conformational states of macromolecules in 3D-EM through likelihood optimization,” Nat. Methods 4(1), 27–29 (2007).
[CrossRef] [PubMed]

Eisebitt, S.

A. P. Mancuso, T. Gorniak, F. Staier, O. M. Yefanov, R. Barth, C. Christophis, B. Reime, J. Gulden, A. Singer, M. E. Pettit, T. Nisius, T. Wilhein, C. Gutt, G. Grübel, N. Guerassimova, R. Treusch, J. Feldhaus, S. Eisebitt, E. Weckert, M. Grunze, A. Rosenhahn, I. A. Vartanyants, “Coherent imaging of biological samples with femtosecond pulses at the free-electron laser FLASH,” New J. Phys. 12(3), 035003 (2010).
[CrossRef]

Ekeberg, T.

M. M. Seibert, T. Ekeberg, F. R. N. C. Maia, M. Svenda, J. Andreasson, O. Jönsson, D. Odić, B. Iwan, A. Rocker, D. Westphal, M. Hantke, D. P. DePonte, A. Barty, J. Schulz, L. Gumprecht, N. Coppola, A. Aquila, M. Liang, T. A. White, A. Martin, C. Caleman, S. Stern, C. Abergel, V. Seltzer, J. M. Claverie, C. Bostedt, J. D. Bozek, S. Boutet, A. A. Miahnahri, M. Messerschmidt, J. Krzywinski, G. Williams, K. O. Hodgson, M. J. Bogan, C. Y. Hampton, R. G. Sierra, D. Starodub, I. Andersson, S. Bajt, M. Barthelmess, J. C. H. Spence, P. Fromme, U. Weierstall, R. Kirian, M. Hunter, R. B. Doak, S. Marchesini, S. P. Hau-Riege, M. Frank, R. L. Shoeman, L. Lomb, S. W. Epp, R. Hartmann, D. Rolles, A. Rudenko, C. Schmidt, L. Foucar, N. Kimmel, P. Holl, B. Rudek, B. Erk, A. Hömke, C. Reich, D. Pietschner, G. Weidenspointner, L. Strüder, G. Hauser, H. Gorke, J. Ullrich, I. Schlichting, S. Herrmann, G. Schaller, F. Schopper, H. Soltau, K. U. Kühnel, R. Andritschke, C. D. Schröter, F. Krasniqi, M. Bott, S. Schorb, D. Rupp, M. Adolph, T. Gorkhover, H. Hirsemann, G. Potdevin, H. Graafsma, B. Nilsson, H. N. Chapman, J. Hajdu, “Single mimivirus particles intercepted and imaged with an X-ray laser,” Nature 470(7332), 78–81 (2011).
[CrossRef] [PubMed]

C. H. Yoon, P. Schwander, C. Abergel, I. Andersson, J. Andreasson, A. Aquila, S. Bajt, M. Barthelmess, A. Barty, M. J. Bogan, C. Bostedt, J. Bozek, H. N. Chapman, J. M. Claverie, N. Coppola, D. P. DePonte, T. Ekeberg, S. W. Epp, B. Erk, H. Fleckenstein, L. Foucar, H. Graafsma, L. Gumprecht, J. Hajdu, C. Y. Hampton, A. Hartmann, E. Hartmann, R. Hartmann, G. Hauser, H. Hirsemann, P. Holl, S. Kassemeyer, N. Kimmel, M. Kiskinova, M. Liang, N. T. D. Loh, L. Lomb, F. R. N. C. Maia, A. V. Martin, K. Nass, E. Pedersoli, C. Reich, D. Rolles, B. Rudek, A. Rudenko, I. Schlichting, J. Schulz, M. Seibert, V. Seltzer, R. L. Shoeman, R. G. Sierra, H. Soltau, D. Starodub, J. Steinbrener, G. Stier, L. Strüder, M. Svenda, J. Ullrich, G. Weidenspointner, T. A. White, C. Wunderer, A. Ourmazd, “Unsupervised classification of single-particle X-ray diffraction snapshots by spectral clustering,” Opt. Express 19(17), 16542–16549 (2011).
[CrossRef] [PubMed]

Epp, S. W.

C. H. Yoon, P. Schwander, C. Abergel, I. Andersson, J. Andreasson, A. Aquila, S. Bajt, M. Barthelmess, A. Barty, M. J. Bogan, C. Bostedt, J. Bozek, H. N. Chapman, J. M. Claverie, N. Coppola, D. P. DePonte, T. Ekeberg, S. W. Epp, B. Erk, H. Fleckenstein, L. Foucar, H. Graafsma, L. Gumprecht, J. Hajdu, C. Y. Hampton, A. Hartmann, E. Hartmann, R. Hartmann, G. Hauser, H. Hirsemann, P. Holl, S. Kassemeyer, N. Kimmel, M. Kiskinova, M. Liang, N. T. D. Loh, L. Lomb, F. R. N. C. Maia, A. V. Martin, K. Nass, E. Pedersoli, C. Reich, D. Rolles, B. Rudek, A. Rudenko, I. Schlichting, J. Schulz, M. Seibert, V. Seltzer, R. L. Shoeman, R. G. Sierra, H. Soltau, D. Starodub, J. Steinbrener, G. Stier, L. Strüder, M. Svenda, J. Ullrich, G. Weidenspointner, T. A. White, C. Wunderer, A. Ourmazd, “Unsupervised classification of single-particle X-ray diffraction snapshots by spectral clustering,” Opt. Express 19(17), 16542–16549 (2011).
[CrossRef] [PubMed]

M. M. Seibert, T. Ekeberg, F. R. N. C. Maia, M. Svenda, J. Andreasson, O. Jönsson, D. Odić, B. Iwan, A. Rocker, D. Westphal, M. Hantke, D. P. DePonte, A. Barty, J. Schulz, L. Gumprecht, N. Coppola, A. Aquila, M. Liang, T. A. White, A. Martin, C. Caleman, S. Stern, C. Abergel, V. Seltzer, J. M. Claverie, C. Bostedt, J. D. Bozek, S. Boutet, A. A. Miahnahri, M. Messerschmidt, J. Krzywinski, G. Williams, K. O. Hodgson, M. J. Bogan, C. Y. Hampton, R. G. Sierra, D. Starodub, I. Andersson, S. Bajt, M. Barthelmess, J. C. H. Spence, P. Fromme, U. Weierstall, R. Kirian, M. Hunter, R. B. Doak, S. Marchesini, S. P. Hau-Riege, M. Frank, R. L. Shoeman, L. Lomb, S. W. Epp, R. Hartmann, D. Rolles, A. Rudenko, C. Schmidt, L. Foucar, N. Kimmel, P. Holl, B. Rudek, B. Erk, A. Hömke, C. Reich, D. Pietschner, G. Weidenspointner, L. Strüder, G. Hauser, H. Gorke, J. Ullrich, I. Schlichting, S. Herrmann, G. Schaller, F. Schopper, H. Soltau, K. U. Kühnel, R. Andritschke, C. D. Schröter, F. Krasniqi, M. Bott, S. Schorb, D. Rupp, M. Adolph, T. Gorkhover, H. Hirsemann, G. Potdevin, H. Graafsma, B. Nilsson, H. N. Chapman, J. Hajdu, “Single mimivirus particles intercepted and imaged with an X-ray laser,” Nature 470(7332), 78–81 (2011).
[CrossRef] [PubMed]

Erk, B.

M. M. Seibert, T. Ekeberg, F. R. N. C. Maia, M. Svenda, J. Andreasson, O. Jönsson, D. Odić, B. Iwan, A. Rocker, D. Westphal, M. Hantke, D. P. DePonte, A. Barty, J. Schulz, L. Gumprecht, N. Coppola, A. Aquila, M. Liang, T. A. White, A. Martin, C. Caleman, S. Stern, C. Abergel, V. Seltzer, J. M. Claverie, C. Bostedt, J. D. Bozek, S. Boutet, A. A. Miahnahri, M. Messerschmidt, J. Krzywinski, G. Williams, K. O. Hodgson, M. J. Bogan, C. Y. Hampton, R. G. Sierra, D. Starodub, I. Andersson, S. Bajt, M. Barthelmess, J. C. H. Spence, P. Fromme, U. Weierstall, R. Kirian, M. Hunter, R. B. Doak, S. Marchesini, S. P. Hau-Riege, M. Frank, R. L. Shoeman, L. Lomb, S. W. Epp, R. Hartmann, D. Rolles, A. Rudenko, C. Schmidt, L. Foucar, N. Kimmel, P. Holl, B. Rudek, B. Erk, A. Hömke, C. Reich, D. Pietschner, G. Weidenspointner, L. Strüder, G. Hauser, H. Gorke, J. Ullrich, I. Schlichting, S. Herrmann, G. Schaller, F. Schopper, H. Soltau, K. U. Kühnel, R. Andritschke, C. D. Schröter, F. Krasniqi, M. Bott, S. Schorb, D. Rupp, M. Adolph, T. Gorkhover, H. Hirsemann, G. Potdevin, H. Graafsma, B. Nilsson, H. N. Chapman, J. Hajdu, “Single mimivirus particles intercepted and imaged with an X-ray laser,” Nature 470(7332), 78–81 (2011).
[CrossRef] [PubMed]

C. H. Yoon, P. Schwander, C. Abergel, I. Andersson, J. Andreasson, A. Aquila, S. Bajt, M. Barthelmess, A. Barty, M. J. Bogan, C. Bostedt, J. Bozek, H. N. Chapman, J. M. Claverie, N. Coppola, D. P. DePonte, T. Ekeberg, S. W. Epp, B. Erk, H. Fleckenstein, L. Foucar, H. Graafsma, L. Gumprecht, J. Hajdu, C. Y. Hampton, A. Hartmann, E. Hartmann, R. Hartmann, G. Hauser, H. Hirsemann, P. Holl, S. Kassemeyer, N. Kimmel, M. Kiskinova, M. Liang, N. T. D. Loh, L. Lomb, F. R. N. C. Maia, A. V. Martin, K. Nass, E. Pedersoli, C. Reich, D. Rolles, B. Rudek, A. Rudenko, I. Schlichting, J. Schulz, M. Seibert, V. Seltzer, R. L. Shoeman, R. G. Sierra, H. Soltau, D. Starodub, J. Steinbrener, G. Stier, L. Strüder, M. Svenda, J. Ullrich, G. Weidenspointner, T. A. White, C. Wunderer, A. Ourmazd, “Unsupervised classification of single-particle X-ray diffraction snapshots by spectral clustering,” Opt. Express 19(17), 16542–16549 (2011).
[CrossRef] [PubMed]

Fabris, A.

E. Allaria, R. Appio, L. Badano, W. A. Barletta, S. Bassanese, S. G. Biedron, A. Borga, E. Busetto, D. Castronovo, P. Cinquegrana, S. Cleva, D. Cocco, M. Cornacchia, P. Craievich, I. Cudin, G. D’Auria, M. Dal Forno, M. B. Danailov, R. De Monte, G. De Ninno, P. Delgiusto, A. Demidovich, S. Di Mitri, B. Diviacco, A. Fabris, R. Fabris, W. Fawley, M. Ferianis, E. Ferrari, S. Ferry, L. Froehlich, P. Furlan, G. Gaio, F. Gelmetti, L. Giannessi, M. Giannini, R. Gobessi, R. Ivanov, E. Karantzoulis, M. Lonza, A. Lutman, B. Mahieu, M. Milloch, S. V. Milton, M. Musardo, I. Nikolov, S. Noe, F. Parmigiani, G. Penco, M. Petronio, L. Pivetta, M. Predonzani, F. Rossi, L. Rumiz, A. Salom, C. Scafuri, C. Serpico, P. Sigalotti, S. Spampinati, C. Spezzani, M. Svandrlik, C. Svetina, S. Tazzari, M. Trovo, R. Umer, A. Vascotto, M. Veronese, R. Visintini, M. Zaccaria, D. Zangrando, M. Zangrando, “Highly coherent and stable pulses from the FERMI seeded free-electron laser in the extreme ultraviolet,” Nat. Photonics 6(10), 699–704 (2012).
[CrossRef]

Fabris, R.

E. Allaria, R. Appio, L. Badano, W. A. Barletta, S. Bassanese, S. G. Biedron, A. Borga, E. Busetto, D. Castronovo, P. Cinquegrana, S. Cleva, D. Cocco, M. Cornacchia, P. Craievich, I. Cudin, G. D’Auria, M. Dal Forno, M. B. Danailov, R. De Monte, G. De Ninno, P. Delgiusto, A. Demidovich, S. Di Mitri, B. Diviacco, A. Fabris, R. Fabris, W. Fawley, M. Ferianis, E. Ferrari, S. Ferry, L. Froehlich, P. Furlan, G. Gaio, F. Gelmetti, L. Giannessi, M. Giannini, R. Gobessi, R. Ivanov, E. Karantzoulis, M. Lonza, A. Lutman, B. Mahieu, M. Milloch, S. V. Milton, M. Musardo, I. Nikolov, S. Noe, F. Parmigiani, G. Penco, M. Petronio, L. Pivetta, M. Predonzani, F. Rossi, L. Rumiz, A. Salom, C. Scafuri, C. Serpico, P. Sigalotti, S. Spampinati, C. Spezzani, M. Svandrlik, C. Svetina, S. Tazzari, M. Trovo, R. Umer, A. Vascotto, M. Veronese, R. Visintini, M. Zaccaria, D. Zangrando, M. Zangrando, “Highly coherent and stable pulses from the FERMI seeded free-electron laser in the extreme ultraviolet,” Nat. Photonics 6(10), 699–704 (2012).
[CrossRef]

Fawley, W.

E. Allaria, R. Appio, L. Badano, W. A. Barletta, S. Bassanese, S. G. Biedron, A. Borga, E. Busetto, D. Castronovo, P. Cinquegrana, S. Cleva, D. Cocco, M. Cornacchia, P. Craievich, I. Cudin, G. D’Auria, M. Dal Forno, M. B. Danailov, R. De Monte, G. De Ninno, P. Delgiusto, A. Demidovich, S. Di Mitri, B. Diviacco, A. Fabris, R. Fabris, W. Fawley, M. Ferianis, E. Ferrari, S. Ferry, L. Froehlich, P. Furlan, G. Gaio, F. Gelmetti, L. Giannessi, M. Giannini, R. Gobessi, R. Ivanov, E. Karantzoulis, M. Lonza, A. Lutman, B. Mahieu, M. Milloch, S. V. Milton, M. Musardo, I. Nikolov, S. Noe, F. Parmigiani, G. Penco, M. Petronio, L. Pivetta, M. Predonzani, F. Rossi, L. Rumiz, A. Salom, C. Scafuri, C. Serpico, P. Sigalotti, S. Spampinati, C. Spezzani, M. Svandrlik, C. Svetina, S. Tazzari, M. Trovo, R. Umer, A. Vascotto, M. Veronese, R. Visintini, M. Zaccaria, D. Zangrando, M. Zangrando, “Highly coherent and stable pulses from the FERMI seeded free-electron laser in the extreme ultraviolet,” Nat. Photonics 6(10), 699–704 (2012).
[CrossRef]

Feldhaus, J.

A. P. Mancuso, T. Gorniak, F. Staier, O. M. Yefanov, R. Barth, C. Christophis, B. Reime, J. Gulden, A. Singer, M. E. Pettit, T. Nisius, T. Wilhein, C. Gutt, G. Grübel, N. Guerassimova, R. Treusch, J. Feldhaus, S. Eisebitt, E. Weckert, M. Grunze, A. Rosenhahn, I. A. Vartanyants, “Coherent imaging of biological samples with femtosecond pulses at the free-electron laser FLASH,” New J. Phys. 12(3), 035003 (2010).
[CrossRef]

Ferianis, M.

E. Allaria, R. Appio, L. Badano, W. A. Barletta, S. Bassanese, S. G. Biedron, A. Borga, E. Busetto, D. Castronovo, P. Cinquegrana, S. Cleva, D. Cocco, M. Cornacchia, P. Craievich, I. Cudin, G. D’Auria, M. Dal Forno, M. B. Danailov, R. De Monte, G. De Ninno, P. Delgiusto, A. Demidovich, S. Di Mitri, B. Diviacco, A. Fabris, R. Fabris, W. Fawley, M. Ferianis, E. Ferrari, S. Ferry, L. Froehlich, P. Furlan, G. Gaio, F. Gelmetti, L. Giannessi, M. Giannini, R. Gobessi, R. Ivanov, E. Karantzoulis, M. Lonza, A. Lutman, B. Mahieu, M. Milloch, S. V. Milton, M. Musardo, I. Nikolov, S. Noe, F. Parmigiani, G. Penco, M. Petronio, L. Pivetta, M. Predonzani, F. Rossi, L. Rumiz, A. Salom, C. Scafuri, C. Serpico, P. Sigalotti, S. Spampinati, C. Spezzani, M. Svandrlik, C. Svetina, S. Tazzari, M. Trovo, R. Umer, A. Vascotto, M. Veronese, R. Visintini, M. Zaccaria, D. Zangrando, M. Zangrando, “Highly coherent and stable pulses from the FERMI seeded free-electron laser in the extreme ultraviolet,” Nat. Photonics 6(10), 699–704 (2012).
[CrossRef]

Ferrari, E.

E. Allaria, R. Appio, L. Badano, W. A. Barletta, S. Bassanese, S. G. Biedron, A. Borga, E. Busetto, D. Castronovo, P. Cinquegrana, S. Cleva, D. Cocco, M. Cornacchia, P. Craievich, I. Cudin, G. D’Auria, M. Dal Forno, M. B. Danailov, R. De Monte, G. De Ninno, P. Delgiusto, A. Demidovich, S. Di Mitri, B. Diviacco, A. Fabris, R. Fabris, W. Fawley, M. Ferianis, E. Ferrari, S. Ferry, L. Froehlich, P. Furlan, G. Gaio, F. Gelmetti, L. Giannessi, M. Giannini, R. Gobessi, R. Ivanov, E. Karantzoulis, M. Lonza, A. Lutman, B. Mahieu, M. Milloch, S. V. Milton, M. Musardo, I. Nikolov, S. Noe, F. Parmigiani, G. Penco, M. Petronio, L. Pivetta, M. Predonzani, F. Rossi, L. Rumiz, A. Salom, C. Scafuri, C. Serpico, P. Sigalotti, S. Spampinati, C. Spezzani, M. Svandrlik, C. Svetina, S. Tazzari, M. Trovo, R. Umer, A. Vascotto, M. Veronese, R. Visintini, M. Zaccaria, D. Zangrando, M. Zangrando, “Highly coherent and stable pulses from the FERMI seeded free-electron laser in the extreme ultraviolet,” Nat. Photonics 6(10), 699–704 (2012).
[CrossRef]

Ferry, S.

E. Allaria, R. Appio, L. Badano, W. A. Barletta, S. Bassanese, S. G. Biedron, A. Borga, E. Busetto, D. Castronovo, P. Cinquegrana, S. Cleva, D. Cocco, M. Cornacchia, P. Craievich, I. Cudin, G. D’Auria, M. Dal Forno, M. B. Danailov, R. De Monte, G. De Ninno, P. Delgiusto, A. Demidovich, S. Di Mitri, B. Diviacco, A. Fabris, R. Fabris, W. Fawley, M. Ferianis, E. Ferrari, S. Ferry, L. Froehlich, P. Furlan, G. Gaio, F. Gelmetti, L. Giannessi, M. Giannini, R. Gobessi, R. Ivanov, E. Karantzoulis, M. Lonza, A. Lutman, B. Mahieu, M. Milloch, S. V. Milton, M. Musardo, I. Nikolov, S. Noe, F. Parmigiani, G. Penco, M. Petronio, L. Pivetta, M. Predonzani, F. Rossi, L. Rumiz, A. Salom, C. Scafuri, C. Serpico, P. Sigalotti, S. Spampinati, C. Spezzani, M. Svandrlik, C. Svetina, S. Tazzari, M. Trovo, R. Umer, A. Vascotto, M. Veronese, R. Visintini, M. Zaccaria, D. Zangrando, M. Zangrando, “Highly coherent and stable pulses from the FERMI seeded free-electron laser in the extreme ultraviolet,” Nat. Photonics 6(10), 699–704 (2012).
[CrossRef]

Fienup, J. R.

Fleckenstein, H.

L. Redecke, K. Nass, D. P. DePonte, T. A. White, D. Rehders, A. Barty, F. Stellato, M. Liang, T. R. M. Barends, S. Boutet, G. J. Williams, M. Messerschmidt, M. M. Seibert, A. Aquila, D. Arnlund, S. Bajt, T. Barth, M. J. Bogan, C. Caleman, T. C. Chao, R. B. Doak, H. Fleckenstein, M. Frank, R. Fromme, L. Galli, I. Grotjohann, M. S. Hunter, L. C. Johansson, S. Kassemeyer, G. Katona, R. A. Kirian, R. Koopmann, C. Kupitz, L. Lomb, A. V. Martin, S. Mogk, R. Neutze, R. L. Shoeman, J. Steinbrener, N. Timneanu, D. Wang, U. Weierstall, N. A. Zatsepin, J. C. H. Spence, P. Fromme, I. Schlichting, M. Duszenko, C. Betzel, H. N. Chapman, “Natively inhibited Trypanosoma brucei Cathepsin B structure determined by using an X-ray laser,” Science 339(6116), 227–230 (2013).
[CrossRef] [PubMed]

F. Capotondi, E. Pedersoli, N. Mahne, R. H. Menk, G. Passos, L. Raimondi, C. Svetina, G. Sandrin, M. Zangrando, M. Kiskinova, S. Bajt, M. Barthelmess, H. Fleckenstein, H. N. Chapman, J. Schulz, J. Bach, R. Frömter, S. Schleitzer, L. Müller, C. Gutt, G. Grübel, “Invited article: Coherent imaging using seeded free-electron laser pulses with variable polarization: First results and research opportunities,” Rev. Sci. Instrum. 84(5), 051301 (2013).
[CrossRef] [PubMed]

C. H. Yoon, P. Schwander, C. Abergel, I. Andersson, J. Andreasson, A. Aquila, S. Bajt, M. Barthelmess, A. Barty, M. J. Bogan, C. Bostedt, J. Bozek, H. N. Chapman, J. M. Claverie, N. Coppola, D. P. DePonte, T. Ekeberg, S. W. Epp, B. Erk, H. Fleckenstein, L. Foucar, H. Graafsma, L. Gumprecht, J. Hajdu, C. Y. Hampton, A. Hartmann, E. Hartmann, R. Hartmann, G. Hauser, H. Hirsemann, P. Holl, S. Kassemeyer, N. Kimmel, M. Kiskinova, M. Liang, N. T. D. Loh, L. Lomb, F. R. N. C. Maia, A. V. Martin, K. Nass, E. Pedersoli, C. Reich, D. Rolles, B. Rudek, A. Rudenko, I. Schlichting, J. Schulz, M. Seibert, V. Seltzer, R. L. Shoeman, R. G. Sierra, H. Soltau, D. Starodub, J. Steinbrener, G. Stier, L. Strüder, M. Svenda, J. Ullrich, G. Weidenspointner, T. A. White, C. Wunderer, A. Ourmazd, “Unsupervised classification of single-particle X-ray diffraction snapshots by spectral clustering,” Opt. Express 19(17), 16542–16549 (2011).
[CrossRef] [PubMed]

Foucar, L.

C. H. Yoon, P. Schwander, C. Abergel, I. Andersson, J. Andreasson, A. Aquila, S. Bajt, M. Barthelmess, A. Barty, M. J. Bogan, C. Bostedt, J. Bozek, H. N. Chapman, J. M. Claverie, N. Coppola, D. P. DePonte, T. Ekeberg, S. W. Epp, B. Erk, H. Fleckenstein, L. Foucar, H. Graafsma, L. Gumprecht, J. Hajdu, C. Y. Hampton, A. Hartmann, E. Hartmann, R. Hartmann, G. Hauser, H. Hirsemann, P. Holl, S. Kassemeyer, N. Kimmel, M. Kiskinova, M. Liang, N. T. D. Loh, L. Lomb, F. R. N. C. Maia, A. V. Martin, K. Nass, E. Pedersoli, C. Reich, D. Rolles, B. Rudek, A. Rudenko, I. Schlichting, J. Schulz, M. Seibert, V. Seltzer, R. L. Shoeman, R. G. Sierra, H. Soltau, D. Starodub, J. Steinbrener, G. Stier, L. Strüder, M. Svenda, J. Ullrich, G. Weidenspointner, T. A. White, C. Wunderer, A. Ourmazd, “Unsupervised classification of single-particle X-ray diffraction snapshots by spectral clustering,” Opt. Express 19(17), 16542–16549 (2011).
[CrossRef] [PubMed]

M. M. Seibert, T. Ekeberg, F. R. N. C. Maia, M. Svenda, J. Andreasson, O. Jönsson, D. Odić, B. Iwan, A. Rocker, D. Westphal, M. Hantke, D. P. DePonte, A. Barty, J. Schulz, L. Gumprecht, N. Coppola, A. Aquila, M. Liang, T. A. White, A. Martin, C. Caleman, S. Stern, C. Abergel, V. Seltzer, J. M. Claverie, C. Bostedt, J. D. Bozek, S. Boutet, A. A. Miahnahri, M. Messerschmidt, J. Krzywinski, G. Williams, K. O. Hodgson, M. J. Bogan, C. Y. Hampton, R. G. Sierra, D. Starodub, I. Andersson, S. Bajt, M. Barthelmess, J. C. H. Spence, P. Fromme, U. Weierstall, R. Kirian, M. Hunter, R. B. Doak, S. Marchesini, S. P. Hau-Riege, M. Frank, R. L. Shoeman, L. Lomb, S. W. Epp, R. Hartmann, D. Rolles, A. Rudenko, C. Schmidt, L. Foucar, N. Kimmel, P. Holl, B. Rudek, B. Erk, A. Hömke, C. Reich, D. Pietschner, G. Weidenspointner, L. Strüder, G. Hauser, H. Gorke, J. Ullrich, I. Schlichting, S. Herrmann, G. Schaller, F. Schopper, H. Soltau, K. U. Kühnel, R. Andritschke, C. D. Schröter, F. Krasniqi, M. Bott, S. Schorb, D. Rupp, M. Adolph, T. Gorkhover, H. Hirsemann, G. Potdevin, H. Graafsma, B. Nilsson, H. N. Chapman, J. Hajdu, “Single mimivirus particles intercepted and imaged with an X-ray laser,” Nature 470(7332), 78–81 (2011).
[CrossRef] [PubMed]

Frank, J.

S. H. W. Scheres, H. Gao, M. Valle, G. T. Herman, P. P. B. Eggermont, J. Frank, J. M. Carazo, “Disentangling conformational states of macromolecules in 3D-EM through likelihood optimization,” Nat. Methods 4(1), 27–29 (2007).
[CrossRef] [PubMed]

Frank, M.

L. Redecke, K. Nass, D. P. DePonte, T. A. White, D. Rehders, A. Barty, F. Stellato, M. Liang, T. R. M. Barends, S. Boutet, G. J. Williams, M. Messerschmidt, M. M. Seibert, A. Aquila, D. Arnlund, S. Bajt, T. Barth, M. J. Bogan, C. Caleman, T. C. Chao, R. B. Doak, H. Fleckenstein, M. Frank, R. Fromme, L. Galli, I. Grotjohann, M. S. Hunter, L. C. Johansson, S. Kassemeyer, G. Katona, R. A. Kirian, R. Koopmann, C. Kupitz, L. Lomb, A. V. Martin, S. Mogk, R. Neutze, R. L. Shoeman, J. Steinbrener, N. Timneanu, D. Wang, U. Weierstall, N. A. Zatsepin, J. C. H. Spence, P. Fromme, I. Schlichting, M. Duszenko, C. Betzel, H. N. Chapman, “Natively inhibited Trypanosoma brucei Cathepsin B structure determined by using an X-ray laser,” Science 339(6116), 227–230 (2013).
[CrossRef] [PubMed]

M. M. Seibert, T. Ekeberg, F. R. N. C. Maia, M. Svenda, J. Andreasson, O. Jönsson, D. Odić, B. Iwan, A. Rocker, D. Westphal, M. Hantke, D. P. DePonte, A. Barty, J. Schulz, L. Gumprecht, N. Coppola, A. Aquila, M. Liang, T. A. White, A. Martin, C. Caleman, S. Stern, C. Abergel, V. Seltzer, J. M. Claverie, C. Bostedt, J. D. Bozek, S. Boutet, A. A. Miahnahri, M. Messerschmidt, J. Krzywinski, G. Williams, K. O. Hodgson, M. J. Bogan, C. Y. Hampton, R. G. Sierra, D. Starodub, I. Andersson, S. Bajt, M. Barthelmess, J. C. H. Spence, P. Fromme, U. Weierstall, R. Kirian, M. Hunter, R. B. Doak, S. Marchesini, S. P. Hau-Riege, M. Frank, R. L. Shoeman, L. Lomb, S. W. Epp, R. Hartmann, D. Rolles, A. Rudenko, C. Schmidt, L. Foucar, N. Kimmel, P. Holl, B. Rudek, B. Erk, A. Hömke, C. Reich, D. Pietschner, G. Weidenspointner, L. Strüder, G. Hauser, H. Gorke, J. Ullrich, I. Schlichting, S. Herrmann, G. Schaller, F. Schopper, H. Soltau, K. U. Kühnel, R. Andritschke, C. D. Schröter, F. Krasniqi, M. Bott, S. Schorb, D. Rupp, M. Adolph, T. Gorkhover, H. Hirsemann, G. Potdevin, H. Graafsma, B. Nilsson, H. N. Chapman, J. Hajdu, “Single mimivirus particles intercepted and imaged with an X-ray laser,” Nature 470(7332), 78–81 (2011).
[CrossRef] [PubMed]

H. N. Chapman, A. Barty, M. J. Bogan, S. Boutet, M. Frank, S. P. Hau-Riege, S. Marchesini, B. W. Woods, S. Bajt, W. H. Benner, R. A. London, E. Plönjes, M. Kuhlmann, R. Treusch, S. Düsterer, T. Tschentscher, J. R. Schneider, E. Spiller, T. Möller, C. Bostedt, M. Hoener, D. A. Shapiro, K. O. Hodgson, D. van der Spoel, F. Burmeister, M. Bergh, C. Caleman, G. Huldt, M. M. Seibert, F. R. N. C. Maia, R. W. Lee, A. Szöke, N. Timneanu, J. Hajdu, “Femtosecond diffractive imaging with a soft-X-ray free-electron laser,” Nat. Phys. 2(12), 839–843 (2006).
[CrossRef]

Froehlich, L.

E. Allaria, R. Appio, L. Badano, W. A. Barletta, S. Bassanese, S. G. Biedron, A. Borga, E. Busetto, D. Castronovo, P. Cinquegrana, S. Cleva, D. Cocco, M. Cornacchia, P. Craievich, I. Cudin, G. D’Auria, M. Dal Forno, M. B. Danailov, R. De Monte, G. De Ninno, P. Delgiusto, A. Demidovich, S. Di Mitri, B. Diviacco, A. Fabris, R. Fabris, W. Fawley, M. Ferianis, E. Ferrari, S. Ferry, L. Froehlich, P. Furlan, G. Gaio, F. Gelmetti, L. Giannessi, M. Giannini, R. Gobessi, R. Ivanov, E. Karantzoulis, M. Lonza, A. Lutman, B. Mahieu, M. Milloch, S. V. Milton, M. Musardo, I. Nikolov, S. Noe, F. Parmigiani, G. Penco, M. Petronio, L. Pivetta, M. Predonzani, F. Rossi, L. Rumiz, A. Salom, C. Scafuri, C. Serpico, P. Sigalotti, S. Spampinati, C. Spezzani, M. Svandrlik, C. Svetina, S. Tazzari, M. Trovo, R. Umer, A. Vascotto, M. Veronese, R. Visintini, M. Zaccaria, D. Zangrando, M. Zangrando, “Highly coherent and stable pulses from the FERMI seeded free-electron laser in the extreme ultraviolet,” Nat. Photonics 6(10), 699–704 (2012).
[CrossRef]

Fromme, P.

L. Redecke, K. Nass, D. P. DePonte, T. A. White, D. Rehders, A. Barty, F. Stellato, M. Liang, T. R. M. Barends, S. Boutet, G. J. Williams, M. Messerschmidt, M. M. Seibert, A. Aquila, D. Arnlund, S. Bajt, T. Barth, M. J. Bogan, C. Caleman, T. C. Chao, R. B. Doak, H. Fleckenstein, M. Frank, R. Fromme, L. Galli, I. Grotjohann, M. S. Hunter, L. C. Johansson, S. Kassemeyer, G. Katona, R. A. Kirian, R. Koopmann, C. Kupitz, L. Lomb, A. V. Martin, S. Mogk, R. Neutze, R. L. Shoeman, J. Steinbrener, N. Timneanu, D. Wang, U. Weierstall, N. A. Zatsepin, J. C. H. Spence, P. Fromme, I. Schlichting, M. Duszenko, C. Betzel, H. N. Chapman, “Natively inhibited Trypanosoma brucei Cathepsin B structure determined by using an X-ray laser,” Science 339(6116), 227–230 (2013).
[CrossRef] [PubMed]

S. Boutet, L. Lomb, G. J. Williams, T. R. M. Barends, A. Aquila, R. B. Doak, U. Weierstall, D. P. DePonte, J. Steinbrener, R. L. Shoeman, M. Messerschmidt, A. Barty, T. A. White, S. Kassemeyer, R. A. Kirian, M. M. Seibert, P. A. Montanez, C. Kenney, R. Herbst, P. Hart, J. Pines, G. Haller, S. M. Gruner, H. T. Philipp, M. W. Tate, M. Hromalik, L. J. Koerner, N. van Bakel, J. Morse, W. Ghonsalves, D. Arnlund, M. J. Bogan, C. Caleman, R. Fromme, C. Y. Hampton, M. S. Hunter, L. C. Johansson, G. Katona, C. Kupitz, M. Liang, A. V. Martin, K. Nass, L. Redecke, F. Stellato, N. Timneanu, D. Wang, N. A. Zatsepin, D. Schafer, J. Defever, R. Neutze, P. Fromme, J. C. H. Spence, H. N. Chapman, I. Schlichting, “High-resolution protein structure determination by serial femtosecond crystallography,” Science 337(6092), 362–364 (2012).
[CrossRef] [PubMed]

M. M. Seibert, T. Ekeberg, F. R. N. C. Maia, M. Svenda, J. Andreasson, O. Jönsson, D. Odić, B. Iwan, A. Rocker, D. Westphal, M. Hantke, D. P. DePonte, A. Barty, J. Schulz, L. Gumprecht, N. Coppola, A. Aquila, M. Liang, T. A. White, A. Martin, C. Caleman, S. Stern, C. Abergel, V. Seltzer, J. M. Claverie, C. Bostedt, J. D. Bozek, S. Boutet, A. A. Miahnahri, M. Messerschmidt, J. Krzywinski, G. Williams, K. O. Hodgson, M. J. Bogan, C. Y. Hampton, R. G. Sierra, D. Starodub, I. Andersson, S. Bajt, M. Barthelmess, J. C. H. Spence, P. Fromme, U. Weierstall, R. Kirian, M. Hunter, R. B. Doak, S. Marchesini, S. P. Hau-Riege, M. Frank, R. L. Shoeman, L. Lomb, S. W. Epp, R. Hartmann, D. Rolles, A. Rudenko, C. Schmidt, L. Foucar, N. Kimmel, P. Holl, B. Rudek, B. Erk, A. Hömke, C. Reich, D. Pietschner, G. Weidenspointner, L. Strüder, G. Hauser, H. Gorke, J. Ullrich, I. Schlichting, S. Herrmann, G. Schaller, F. Schopper, H. Soltau, K. U. Kühnel, R. Andritschke, C. D. Schröter, F. Krasniqi, M. Bott, S. Schorb, D. Rupp, M. Adolph, T. Gorkhover, H. Hirsemann, G. Potdevin, H. Graafsma, B. Nilsson, H. N. Chapman, J. Hajdu, “Single mimivirus particles intercepted and imaged with an X-ray laser,” Nature 470(7332), 78–81 (2011).
[CrossRef] [PubMed]

Fromme, R.

L. Redecke, K. Nass, D. P. DePonte, T. A. White, D. Rehders, A. Barty, F. Stellato, M. Liang, T. R. M. Barends, S. Boutet, G. J. Williams, M. Messerschmidt, M. M. Seibert, A. Aquila, D. Arnlund, S. Bajt, T. Barth, M. J. Bogan, C. Caleman, T. C. Chao, R. B. Doak, H. Fleckenstein, M. Frank, R. Fromme, L. Galli, I. Grotjohann, M. S. Hunter, L. C. Johansson, S. Kassemeyer, G. Katona, R. A. Kirian, R. Koopmann, C. Kupitz, L. Lomb, A. V. Martin, S. Mogk, R. Neutze, R. L. Shoeman, J. Steinbrener, N. Timneanu, D. Wang, U. Weierstall, N. A. Zatsepin, J. C. H. Spence, P. Fromme, I. Schlichting, M. Duszenko, C. Betzel, H. N. Chapman, “Natively inhibited Trypanosoma brucei Cathepsin B structure determined by using an X-ray laser,” Science 339(6116), 227–230 (2013).
[CrossRef] [PubMed]

S. Boutet, L. Lomb, G. J. Williams, T. R. M. Barends, A. Aquila, R. B. Doak, U. Weierstall, D. P. DePonte, J. Steinbrener, R. L. Shoeman, M. Messerschmidt, A. Barty, T. A. White, S. Kassemeyer, R. A. Kirian, M. M. Seibert, P. A. Montanez, C. Kenney, R. Herbst, P. Hart, J. Pines, G. Haller, S. M. Gruner, H. T. Philipp, M. W. Tate, M. Hromalik, L. J. Koerner, N. van Bakel, J. Morse, W. Ghonsalves, D. Arnlund, M. J. Bogan, C. Caleman, R. Fromme, C. Y. Hampton, M. S. Hunter, L. C. Johansson, G. Katona, C. Kupitz, M. Liang, A. V. Martin, K. Nass, L. Redecke, F. Stellato, N. Timneanu, D. Wang, N. A. Zatsepin, D. Schafer, J. Defever, R. Neutze, P. Fromme, J. C. H. Spence, H. N. Chapman, I. Schlichting, “High-resolution protein structure determination by serial femtosecond crystallography,” Science 337(6092), 362–364 (2012).
[CrossRef] [PubMed]

Frömter, R.

F. Capotondi, E. Pedersoli, N. Mahne, R. H. Menk, G. Passos, L. Raimondi, C. Svetina, G. Sandrin, M. Zangrando, M. Kiskinova, S. Bajt, M. Barthelmess, H. Fleckenstein, H. N. Chapman, J. Schulz, J. Bach, R. Frömter, S. Schleitzer, L. Müller, C. Gutt, G. Grübel, “Invited article: Coherent imaging using seeded free-electron laser pulses with variable polarization: First results and research opportunities,” Rev. Sci. Instrum. 84(5), 051301 (2013).
[CrossRef] [PubMed]

Fry, A. R.

J. Kern, R. Alonso-Mori, R. Tran, J. Hattne, R. J. Gildea, N. Echols, C. Glöckner, J. Hellmich, H. Laksmono, R. G. Sierra, B. Lassalle-Kaiser, S. Koroidov, A. Lampe, G. Han, S. Gul, D. Difiore, D. Milathianaki, A. R. Fry, A. Miahnahri, D. W. Schafer, M. Messerschmidt, M. M. Seibert, J. E. Koglin, D. Sokaras, T. C. Weng, J. Sellberg, M. J. Latimer, R. W. Grosse-Kunstleve, P. H. Zwart, W. E. White, P. Glatzel, P. D. Adams, M. J. Bogan, G. J. Williams, S. Boutet, J. Messinger, A. Zouni, N. K. Sauter, V. K. Yachandra, U. Bergmann, J. Yano, “Simultaneous femtosecond X-ray spectroscopy and diffraction of photosystem II at room temperature,” Science 340(6131), 491–495 (2013).
[CrossRef] [PubMed]

Fung, R.

P. Schwander, R. Fung, G. N. Phillips, A. Ourmazd, “Mapping the conformations of biological assemblies,” New J. Phys. 12(3), 035007 (2010).
[CrossRef]

Furlan, P.

E. Allaria, R. Appio, L. Badano, W. A. Barletta, S. Bassanese, S. G. Biedron, A. Borga, E. Busetto, D. Castronovo, P. Cinquegrana, S. Cleva, D. Cocco, M. Cornacchia, P. Craievich, I. Cudin, G. D’Auria, M. Dal Forno, M. B. Danailov, R. De Monte, G. De Ninno, P. Delgiusto, A. Demidovich, S. Di Mitri, B. Diviacco, A. Fabris, R. Fabris, W. Fawley, M. Ferianis, E. Ferrari, S. Ferry, L. Froehlich, P. Furlan, G. Gaio, F. Gelmetti, L. Giannessi, M. Giannini, R. Gobessi, R. Ivanov, E. Karantzoulis, M. Lonza, A. Lutman, B. Mahieu, M. Milloch, S. V. Milton, M. Musardo, I. Nikolov, S. Noe, F. Parmigiani, G. Penco, M. Petronio, L. Pivetta, M. Predonzani, F. Rossi, L. Rumiz, A. Salom, C. Scafuri, C. Serpico, P. Sigalotti, S. Spampinati, C. Spezzani, M. Svandrlik, C. Svetina, S. Tazzari, M. Trovo, R. Umer, A. Vascotto, M. Veronese, R. Visintini, M. Zaccaria, D. Zangrando, M. Zangrando, “Highly coherent and stable pulses from the FERMI seeded free-electron laser in the extreme ultraviolet,” Nat. Photonics 6(10), 699–704 (2012).
[CrossRef]

Gaio, G.

E. Allaria, R. Appio, L. Badano, W. A. Barletta, S. Bassanese, S. G. Biedron, A. Borga, E. Busetto, D. Castronovo, P. Cinquegrana, S. Cleva, D. Cocco, M. Cornacchia, P. Craievich, I. Cudin, G. D’Auria, M. Dal Forno, M. B. Danailov, R. De Monte, G. De Ninno, P. Delgiusto, A. Demidovich, S. Di Mitri, B. Diviacco, A. Fabris, R. Fabris, W. Fawley, M. Ferianis, E. Ferrari, S. Ferry, L. Froehlich, P. Furlan, G. Gaio, F. Gelmetti, L. Giannessi, M. Giannini, R. Gobessi, R. Ivanov, E. Karantzoulis, M. Lonza, A. Lutman, B. Mahieu, M. Milloch, S. V. Milton, M. Musardo, I. Nikolov, S. Noe, F. Parmigiani, G. Penco, M. Petronio, L. Pivetta, M. Predonzani, F. Rossi, L. Rumiz, A. Salom, C. Scafuri, C. Serpico, P. Sigalotti, S. Spampinati, C. Spezzani, M. Svandrlik, C. Svetina, S. Tazzari, M. Trovo, R. Umer, A. Vascotto, M. Veronese, R. Visintini, M. Zaccaria, D. Zangrando, M. Zangrando, “Highly coherent and stable pulses from the FERMI seeded free-electron laser in the extreme ultraviolet,” Nat. Photonics 6(10), 699–704 (2012).
[CrossRef]

Galli, L.

L. Redecke, K. Nass, D. P. DePonte, T. A. White, D. Rehders, A. Barty, F. Stellato, M. Liang, T. R. M. Barends, S. Boutet, G. J. Williams, M. Messerschmidt, M. M. Seibert, A. Aquila, D. Arnlund, S. Bajt, T. Barth, M. J. Bogan, C. Caleman, T. C. Chao, R. B. Doak, H. Fleckenstein, M. Frank, R. Fromme, L. Galli, I. Grotjohann, M. S. Hunter, L. C. Johansson, S. Kassemeyer, G. Katona, R. A. Kirian, R. Koopmann, C. Kupitz, L. Lomb, A. V. Martin, S. Mogk, R. Neutze, R. L. Shoeman, J. Steinbrener, N. Timneanu, D. Wang, U. Weierstall, N. A. Zatsepin, J. C. H. Spence, P. Fromme, I. Schlichting, M. Duszenko, C. Betzel, H. N. Chapman, “Natively inhibited Trypanosoma brucei Cathepsin B structure determined by using an X-ray laser,” Science 339(6116), 227–230 (2013).
[CrossRef] [PubMed]

Gao, H.

S. H. W. Scheres, H. Gao, M. Valle, G. T. Herman, P. P. B. Eggermont, J. Frank, J. M. Carazo, “Disentangling conformational states of macromolecules in 3D-EM through likelihood optimization,” Nat. Methods 4(1), 27–29 (2007).
[CrossRef] [PubMed]

Gelmetti, F.

E. Allaria, R. Appio, L. Badano, W. A. Barletta, S. Bassanese, S. G. Biedron, A. Borga, E. Busetto, D. Castronovo, P. Cinquegrana, S. Cleva, D. Cocco, M. Cornacchia, P. Craievich, I. Cudin, G. D’Auria, M. Dal Forno, M. B. Danailov, R. De Monte, G. De Ninno, P. Delgiusto, A. Demidovich, S. Di Mitri, B. Diviacco, A. Fabris, R. Fabris, W. Fawley, M. Ferianis, E. Ferrari, S. Ferry, L. Froehlich, P. Furlan, G. Gaio, F. Gelmetti, L. Giannessi, M. Giannini, R. Gobessi, R. Ivanov, E. Karantzoulis, M. Lonza, A. Lutman, B. Mahieu, M. Milloch, S. V. Milton, M. Musardo, I. Nikolov, S. Noe, F. Parmigiani, G. Penco, M. Petronio, L. Pivetta, M. Predonzani, F. Rossi, L. Rumiz, A. Salom, C. Scafuri, C. Serpico, P. Sigalotti, S. Spampinati, C. Spezzani, M. Svandrlik, C. Svetina, S. Tazzari, M. Trovo, R. Umer, A. Vascotto, M. Veronese, R. Visintini, M. Zaccaria, D. Zangrando, M. Zangrando, “Highly coherent and stable pulses from the FERMI seeded free-electron laser in the extreme ultraviolet,” Nat. Photonics 6(10), 699–704 (2012).
[CrossRef]

Ghonsalves, W.

S. Boutet, L. Lomb, G. J. Williams, T. R. M. Barends, A. Aquila, R. B. Doak, U. Weierstall, D. P. DePonte, J. Steinbrener, R. L. Shoeman, M. Messerschmidt, A. Barty, T. A. White, S. Kassemeyer, R. A. Kirian, M. M. Seibert, P. A. Montanez, C. Kenney, R. Herbst, P. Hart, J. Pines, G. Haller, S. M. Gruner, H. T. Philipp, M. W. Tate, M. Hromalik, L. J. Koerner, N. van Bakel, J. Morse, W. Ghonsalves, D. Arnlund, M. J. Bogan, C. Caleman, R. Fromme, C. Y. Hampton, M. S. Hunter, L. C. Johansson, G. Katona, C. Kupitz, M. Liang, A. V. Martin, K. Nass, L. Redecke, F. Stellato, N. Timneanu, D. Wang, N. A. Zatsepin, D. Schafer, J. Defever, R. Neutze, P. Fromme, J. C. H. Spence, H. N. Chapman, I. Schlichting, “High-resolution protein structure determination by serial femtosecond crystallography,” Science 337(6092), 362–364 (2012).
[CrossRef] [PubMed]

Giannakis, D.

Giannessi, L.

E. Allaria, R. Appio, L. Badano, W. A. Barletta, S. Bassanese, S. G. Biedron, A. Borga, E. Busetto, D. Castronovo, P. Cinquegrana, S. Cleva, D. Cocco, M. Cornacchia, P. Craievich, I. Cudin, G. D’Auria, M. Dal Forno, M. B. Danailov, R. De Monte, G. De Ninno, P. Delgiusto, A. Demidovich, S. Di Mitri, B. Diviacco, A. Fabris, R. Fabris, W. Fawley, M. Ferianis, E. Ferrari, S. Ferry, L. Froehlich, P. Furlan, G. Gaio, F. Gelmetti, L. Giannessi, M. Giannini, R. Gobessi, R. Ivanov, E. Karantzoulis, M. Lonza, A. Lutman, B. Mahieu, M. Milloch, S. V. Milton, M. Musardo, I. Nikolov, S. Noe, F. Parmigiani, G. Penco, M. Petronio, L. Pivetta, M. Predonzani, F. Rossi, L. Rumiz, A. Salom, C. Scafuri, C. Serpico, P. Sigalotti, S. Spampinati, C. Spezzani, M. Svandrlik, C. Svetina, S. Tazzari, M. Trovo, R. Umer, A. Vascotto, M. Veronese, R. Visintini, M. Zaccaria, D. Zangrando, M. Zangrando, “Highly coherent and stable pulses from the FERMI seeded free-electron laser in the extreme ultraviolet,” Nat. Photonics 6(10), 699–704 (2012).
[CrossRef]

Giannini, M.

E. Allaria, R. Appio, L. Badano, W. A. Barletta, S. Bassanese, S. G. Biedron, A. Borga, E. Busetto, D. Castronovo, P. Cinquegrana, S. Cleva, D. Cocco, M. Cornacchia, P. Craievich, I. Cudin, G. D’Auria, M. Dal Forno, M. B. Danailov, R. De Monte, G. De Ninno, P. Delgiusto, A. Demidovich, S. Di Mitri, B. Diviacco, A. Fabris, R. Fabris, W. Fawley, M. Ferianis, E. Ferrari, S. Ferry, L. Froehlich, P. Furlan, G. Gaio, F. Gelmetti, L. Giannessi, M. Giannini, R. Gobessi, R. Ivanov, E. Karantzoulis, M. Lonza, A. Lutman, B. Mahieu, M. Milloch, S. V. Milton, M. Musardo, I. Nikolov, S. Noe, F. Parmigiani, G. Penco, M. Petronio, L. Pivetta, M. Predonzani, F. Rossi, L. Rumiz, A. Salom, C. Scafuri, C. Serpico, P. Sigalotti, S. Spampinati, C. Spezzani, M. Svandrlik, C. Svetina, S. Tazzari, M. Trovo, R. Umer, A. Vascotto, M. Veronese, R. Visintini, M. Zaccaria, D. Zangrando, M. Zangrando, “Highly coherent and stable pulses from the FERMI seeded free-electron laser in the extreme ultraviolet,” Nat. Photonics 6(10), 699–704 (2012).
[CrossRef]

Gildea, R. J.

J. Kern, R. Alonso-Mori, R. Tran, J. Hattne, R. J. Gildea, N. Echols, C. Glöckner, J. Hellmich, H. Laksmono, R. G. Sierra, B. Lassalle-Kaiser, S. Koroidov, A. Lampe, G. Han, S. Gul, D. Difiore, D. Milathianaki, A. R. Fry, A. Miahnahri, D. W. Schafer, M. Messerschmidt, M. M. Seibert, J. E. Koglin, D. Sokaras, T. C. Weng, J. Sellberg, M. J. Latimer, R. W. Grosse-Kunstleve, P. H. Zwart, W. E. White, P. Glatzel, P. D. Adams, M. J. Bogan, G. J. Williams, S. Boutet, J. Messinger, A. Zouni, N. K. Sauter, V. K. Yachandra, U. Bergmann, J. Yano, “Simultaneous femtosecond X-ray spectroscopy and diffraction of photosystem II at room temperature,” Science 340(6131), 491–495 (2013).
[CrossRef] [PubMed]

Glatzel, P.

J. Kern, R. Alonso-Mori, R. Tran, J. Hattne, R. J. Gildea, N. Echols, C. Glöckner, J. Hellmich, H. Laksmono, R. G. Sierra, B. Lassalle-Kaiser, S. Koroidov, A. Lampe, G. Han, S. Gul, D. Difiore, D. Milathianaki, A. R. Fry, A. Miahnahri, D. W. Schafer, M. Messerschmidt, M. M. Seibert, J. E. Koglin, D. Sokaras, T. C. Weng, J. Sellberg, M. J. Latimer, R. W. Grosse-Kunstleve, P. H. Zwart, W. E. White, P. Glatzel, P. D. Adams, M. J. Bogan, G. J. Williams, S. Boutet, J. Messinger, A. Zouni, N. K. Sauter, V. K. Yachandra, U. Bergmann, J. Yano, “Simultaneous femtosecond X-ray spectroscopy and diffraction of photosystem II at room temperature,” Science 340(6131), 491–495 (2013).
[CrossRef] [PubMed]

Glöckner, C.

J. Kern, R. Alonso-Mori, R. Tran, J. Hattne, R. J. Gildea, N. Echols, C. Glöckner, J. Hellmich, H. Laksmono, R. G. Sierra, B. Lassalle-Kaiser, S. Koroidov, A. Lampe, G. Han, S. Gul, D. Difiore, D. Milathianaki, A. R. Fry, A. Miahnahri, D. W. Schafer, M. Messerschmidt, M. M. Seibert, J. E. Koglin, D. Sokaras, T. C. Weng, J. Sellberg, M. J. Latimer, R. W. Grosse-Kunstleve, P. H. Zwart, W. E. White, P. Glatzel, P. D. Adams, M. J. Bogan, G. J. Williams, S. Boutet, J. Messinger, A. Zouni, N. K. Sauter, V. K. Yachandra, U. Bergmann, J. Yano, “Simultaneous femtosecond X-ray spectroscopy and diffraction of photosystem II at room temperature,” Science 340(6131), 491–495 (2013).
[CrossRef] [PubMed]

Gobessi, R.

E. Allaria, R. Appio, L. Badano, W. A. Barletta, S. Bassanese, S. G. Biedron, A. Borga, E. Busetto, D. Castronovo, P. Cinquegrana, S. Cleva, D. Cocco, M. Cornacchia, P. Craievich, I. Cudin, G. D’Auria, M. Dal Forno, M. B. Danailov, R. De Monte, G. De Ninno, P. Delgiusto, A. Demidovich, S. Di Mitri, B. Diviacco, A. Fabris, R. Fabris, W. Fawley, M. Ferianis, E. Ferrari, S. Ferry, L. Froehlich, P. Furlan, G. Gaio, F. Gelmetti, L. Giannessi, M. Giannini, R. Gobessi, R. Ivanov, E. Karantzoulis, M. Lonza, A. Lutman, B. Mahieu, M. Milloch, S. V. Milton, M. Musardo, I. Nikolov, S. Noe, F. Parmigiani, G. Penco, M. Petronio, L. Pivetta, M. Predonzani, F. Rossi, L. Rumiz, A. Salom, C. Scafuri, C. Serpico, P. Sigalotti, S. Spampinati, C. Spezzani, M. Svandrlik, C. Svetina, S. Tazzari, M. Trovo, R. Umer, A. Vascotto, M. Veronese, R. Visintini, M. Zaccaria, D. Zangrando, M. Zangrando, “Highly coherent and stable pulses from the FERMI seeded free-electron laser in the extreme ultraviolet,” Nat. Photonics 6(10), 699–704 (2012).
[CrossRef]

Gorke, H.

M. M. Seibert, T. Ekeberg, F. R. N. C. Maia, M. Svenda, J. Andreasson, O. Jönsson, D. Odić, B. Iwan, A. Rocker, D. Westphal, M. Hantke, D. P. DePonte, A. Barty, J. Schulz, L. Gumprecht, N. Coppola, A. Aquila, M. Liang, T. A. White, A. Martin, C. Caleman, S. Stern, C. Abergel, V. Seltzer, J. M. Claverie, C. Bostedt, J. D. Bozek, S. Boutet, A. A. Miahnahri, M. Messerschmidt, J. Krzywinski, G. Williams, K. O. Hodgson, M. J. Bogan, C. Y. Hampton, R. G. Sierra, D. Starodub, I. Andersson, S. Bajt, M. Barthelmess, J. C. H. Spence, P. Fromme, U. Weierstall, R. Kirian, M. Hunter, R. B. Doak, S. Marchesini, S. P. Hau-Riege, M. Frank, R. L. Shoeman, L. Lomb, S. W. Epp, R. Hartmann, D. Rolles, A. Rudenko, C. Schmidt, L. Foucar, N. Kimmel, P. Holl, B. Rudek, B. Erk, A. Hömke, C. Reich, D. Pietschner, G. Weidenspointner, L. Strüder, G. Hauser, H. Gorke, J. Ullrich, I. Schlichting, S. Herrmann, G. Schaller, F. Schopper, H. Soltau, K. U. Kühnel, R. Andritschke, C. D. Schröter, F. Krasniqi, M. Bott, S. Schorb, D. Rupp, M. Adolph, T. Gorkhover, H. Hirsemann, G. Potdevin, H. Graafsma, B. Nilsson, H. N. Chapman, J. Hajdu, “Single mimivirus particles intercepted and imaged with an X-ray laser,” Nature 470(7332), 78–81 (2011).
[CrossRef] [PubMed]

Gorkhover, T.

M. M. Seibert, T. Ekeberg, F. R. N. C. Maia, M. Svenda, J. Andreasson, O. Jönsson, D. Odić, B. Iwan, A. Rocker, D. Westphal, M. Hantke, D. P. DePonte, A. Barty, J. Schulz, L. Gumprecht, N. Coppola, A. Aquila, M. Liang, T. A. White, A. Martin, C. Caleman, S. Stern, C. Abergel, V. Seltzer, J. M. Claverie, C. Bostedt, J. D. Bozek, S. Boutet, A. A. Miahnahri, M. Messerschmidt, J. Krzywinski, G. Williams, K. O. Hodgson, M. J. Bogan, C. Y. Hampton, R. G. Sierra, D. Starodub, I. Andersson, S. Bajt, M. Barthelmess, J. C. H. Spence, P. Fromme, U. Weierstall, R. Kirian, M. Hunter, R. B. Doak, S. Marchesini, S. P. Hau-Riege, M. Frank, R. L. Shoeman, L. Lomb, S. W. Epp, R. Hartmann, D. Rolles, A. Rudenko, C. Schmidt, L. Foucar, N. Kimmel, P. Holl, B. Rudek, B. Erk, A. Hömke, C. Reich, D. Pietschner, G. Weidenspointner, L. Strüder, G. Hauser, H. Gorke, J. Ullrich, I. Schlichting, S. Herrmann, G. Schaller, F. Schopper, H. Soltau, K. U. Kühnel, R. Andritschke, C. D. Schröter, F. Krasniqi, M. Bott, S. Schorb, D. Rupp, M. Adolph, T. Gorkhover, H. Hirsemann, G. Potdevin, H. Graafsma, B. Nilsson, H. N. Chapman, J. Hajdu, “Single mimivirus particles intercepted and imaged with an X-ray laser,” Nature 470(7332), 78–81 (2011).
[CrossRef] [PubMed]

Gorniak, T.

A. P. Mancuso, T. Gorniak, F. Staier, O. M. Yefanov, R. Barth, C. Christophis, B. Reime, J. Gulden, A. Singer, M. E. Pettit, T. Nisius, T. Wilhein, C. Gutt, G. Grübel, N. Guerassimova, R. Treusch, J. Feldhaus, S. Eisebitt, E. Weckert, M. Grunze, A. Rosenhahn, I. A. Vartanyants, “Coherent imaging of biological samples with femtosecond pulses at the free-electron laser FLASH,” New J. Phys. 12(3), 035003 (2010).
[CrossRef]

Graafsma, H.

M. M. Seibert, T. Ekeberg, F. R. N. C. Maia, M. Svenda, J. Andreasson, O. Jönsson, D. Odić, B. Iwan, A. Rocker, D. Westphal, M. Hantke, D. P. DePonte, A. Barty, J. Schulz, L. Gumprecht, N. Coppola, A. Aquila, M. Liang, T. A. White, A. Martin, C. Caleman, S. Stern, C. Abergel, V. Seltzer, J. M. Claverie, C. Bostedt, J. D. Bozek, S. Boutet, A. A. Miahnahri, M. Messerschmidt, J. Krzywinski, G. Williams, K. O. Hodgson, M. J. Bogan, C. Y. Hampton, R. G. Sierra, D. Starodub, I. Andersson, S. Bajt, M. Barthelmess, J. C. H. Spence, P. Fromme, U. Weierstall, R. Kirian, M. Hunter, R. B. Doak, S. Marchesini, S. P. Hau-Riege, M. Frank, R. L. Shoeman, L. Lomb, S. W. Epp, R. Hartmann, D. Rolles, A. Rudenko, C. Schmidt, L. Foucar, N. Kimmel, P. Holl, B. Rudek, B. Erk, A. Hömke, C. Reich, D. Pietschner, G. Weidenspointner, L. Strüder, G. Hauser, H. Gorke, J. Ullrich, I. Schlichting, S. Herrmann, G. Schaller, F. Schopper, H. Soltau, K. U. Kühnel, R. Andritschke, C. D. Schröter, F. Krasniqi, M. Bott, S. Schorb, D. Rupp, M. Adolph, T. Gorkhover, H. Hirsemann, G. Potdevin, H. Graafsma, B. Nilsson, H. N. Chapman, J. Hajdu, “Single mimivirus particles intercepted and imaged with an X-ray laser,” Nature 470(7332), 78–81 (2011).
[CrossRef] [PubMed]

C. H. Yoon, P. Schwander, C. Abergel, I. Andersson, J. Andreasson, A. Aquila, S. Bajt, M. Barthelmess, A. Barty, M. J. Bogan, C. Bostedt, J. Bozek, H. N. Chapman, J. M. Claverie, N. Coppola, D. P. DePonte, T. Ekeberg, S. W. Epp, B. Erk, H. Fleckenstein, L. Foucar, H. Graafsma, L. Gumprecht, J. Hajdu, C. Y. Hampton, A. Hartmann, E. Hartmann, R. Hartmann, G. Hauser, H. Hirsemann, P. Holl, S. Kassemeyer, N. Kimmel, M. Kiskinova, M. Liang, N. T. D. Loh, L. Lomb, F. R. N. C. Maia, A. V. Martin, K. Nass, E. Pedersoli, C. Reich, D. Rolles, B. Rudek, A. Rudenko, I. Schlichting, J. Schulz, M. Seibert, V. Seltzer, R. L. Shoeman, R. G. Sierra, H. Soltau, D. Starodub, J. Steinbrener, G. Stier, L. Strüder, M. Svenda, J. Ullrich, G. Weidenspointner, T. A. White, C. Wunderer, A. Ourmazd, “Unsupervised classification of single-particle X-ray diffraction snapshots by spectral clustering,” Opt. Express 19(17), 16542–16549 (2011).
[CrossRef] [PubMed]

Grosse-Kunstleve, R. W.

J. Kern, R. Alonso-Mori, R. Tran, J. Hattne, R. J. Gildea, N. Echols, C. Glöckner, J. Hellmich, H. Laksmono, R. G. Sierra, B. Lassalle-Kaiser, S. Koroidov, A. Lampe, G. Han, S. Gul, D. Difiore, D. Milathianaki, A. R. Fry, A. Miahnahri, D. W. Schafer, M. Messerschmidt, M. M. Seibert, J. E. Koglin, D. Sokaras, T. C. Weng, J. Sellberg, M. J. Latimer, R. W. Grosse-Kunstleve, P. H. Zwart, W. E. White, P. Glatzel, P. D. Adams, M. J. Bogan, G. J. Williams, S. Boutet, J. Messinger, A. Zouni, N. K. Sauter, V. K. Yachandra, U. Bergmann, J. Yano, “Simultaneous femtosecond X-ray spectroscopy and diffraction of photosystem II at room temperature,” Science 340(6131), 491–495 (2013).
[CrossRef] [PubMed]

Grotjohann, I.

L. Redecke, K. Nass, D. P. DePonte, T. A. White, D. Rehders, A. Barty, F. Stellato, M. Liang, T. R. M. Barends, S. Boutet, G. J. Williams, M. Messerschmidt, M. M. Seibert, A. Aquila, D. Arnlund, S. Bajt, T. Barth, M. J. Bogan, C. Caleman, T. C. Chao, R. B. Doak, H. Fleckenstein, M. Frank, R. Fromme, L. Galli, I. Grotjohann, M. S. Hunter, L. C. Johansson, S. Kassemeyer, G. Katona, R. A. Kirian, R. Koopmann, C. Kupitz, L. Lomb, A. V. Martin, S. Mogk, R. Neutze, R. L. Shoeman, J. Steinbrener, N. Timneanu, D. Wang, U. Weierstall, N. A. Zatsepin, J. C. H. Spence, P. Fromme, I. Schlichting, M. Duszenko, C. Betzel, H. N. Chapman, “Natively inhibited Trypanosoma brucei Cathepsin B structure determined by using an X-ray laser,” Science 339(6116), 227–230 (2013).
[CrossRef] [PubMed]

Grübel, G.

F. Capotondi, E. Pedersoli, N. Mahne, R. H. Menk, G. Passos, L. Raimondi, C. Svetina, G. Sandrin, M. Zangrando, M. Kiskinova, S. Bajt, M. Barthelmess, H. Fleckenstein, H. N. Chapman, J. Schulz, J. Bach, R. Frömter, S. Schleitzer, L. Müller, C. Gutt, G. Grübel, “Invited article: Coherent imaging using seeded free-electron laser pulses with variable polarization: First results and research opportunities,” Rev. Sci. Instrum. 84(5), 051301 (2013).
[CrossRef] [PubMed]

A. P. Mancuso, T. Gorniak, F. Staier, O. M. Yefanov, R. Barth, C. Christophis, B. Reime, J. Gulden, A. Singer, M. E. Pettit, T. Nisius, T. Wilhein, C. Gutt, G. Grübel, N. Guerassimova, R. Treusch, J. Feldhaus, S. Eisebitt, E. Weckert, M. Grunze, A. Rosenhahn, I. A. Vartanyants, “Coherent imaging of biological samples with femtosecond pulses at the free-electron laser FLASH,” New J. Phys. 12(3), 035003 (2010).
[CrossRef]

Gruner, S. M.

S. Boutet, L. Lomb, G. J. Williams, T. R. M. Barends, A. Aquila, R. B. Doak, U. Weierstall, D. P. DePonte, J. Steinbrener, R. L. Shoeman, M. Messerschmidt, A. Barty, T. A. White, S. Kassemeyer, R. A. Kirian, M. M. Seibert, P. A. Montanez, C. Kenney, R. Herbst, P. Hart, J. Pines, G. Haller, S. M. Gruner, H. T. Philipp, M. W. Tate, M. Hromalik, L. J. Koerner, N. van Bakel, J. Morse, W. Ghonsalves, D. Arnlund, M. J. Bogan, C. Caleman, R. Fromme, C. Y. Hampton, M. S. Hunter, L. C. Johansson, G. Katona, C. Kupitz, M. Liang, A. V. Martin, K. Nass, L. Redecke, F. Stellato, N. Timneanu, D. Wang, N. A. Zatsepin, D. Schafer, J. Defever, R. Neutze, P. Fromme, J. C. H. Spence, H. N. Chapman, I. Schlichting, “High-resolution protein structure determination by serial femtosecond crystallography,” Science 337(6092), 362–364 (2012).
[CrossRef] [PubMed]

Grunze, M.

A. P. Mancuso, T. Gorniak, F. Staier, O. M. Yefanov, R. Barth, C. Christophis, B. Reime, J. Gulden, A. Singer, M. E. Pettit, T. Nisius, T. Wilhein, C. Gutt, G. Grübel, N. Guerassimova, R. Treusch, J. Feldhaus, S. Eisebitt, E. Weckert, M. Grunze, A. Rosenhahn, I. A. Vartanyants, “Coherent imaging of biological samples with femtosecond pulses at the free-electron laser FLASH,” New J. Phys. 12(3), 035003 (2010).
[CrossRef]

Guerassimova, N.

A. P. Mancuso, T. Gorniak, F. Staier, O. M. Yefanov, R. Barth, C. Christophis, B. Reime, J. Gulden, A. Singer, M. E. Pettit, T. Nisius, T. Wilhein, C. Gutt, G. Grübel, N. Guerassimova, R. Treusch, J. Feldhaus, S. Eisebitt, E. Weckert, M. Grunze, A. Rosenhahn, I. A. Vartanyants, “Coherent imaging of biological samples with femtosecond pulses at the free-electron laser FLASH,” New J. Phys. 12(3), 035003 (2010).
[CrossRef]

Gul, S.

J. Kern, R. Alonso-Mori, R. Tran, J. Hattne, R. J. Gildea, N. Echols, C. Glöckner, J. Hellmich, H. Laksmono, R. G. Sierra, B. Lassalle-Kaiser, S. Koroidov, A. Lampe, G. Han, S. Gul, D. Difiore, D. Milathianaki, A. R. Fry, A. Miahnahri, D. W. Schafer, M. Messerschmidt, M. M. Seibert, J. E. Koglin, D. Sokaras, T. C. Weng, J. Sellberg, M. J. Latimer, R. W. Grosse-Kunstleve, P. H. Zwart, W. E. White, P. Glatzel, P. D. Adams, M. J. Bogan, G. J. Williams, S. Boutet, J. Messinger, A. Zouni, N. K. Sauter, V. K. Yachandra, U. Bergmann, J. Yano, “Simultaneous femtosecond X-ray spectroscopy and diffraction of photosystem II at room temperature,” Science 340(6131), 491–495 (2013).
[CrossRef] [PubMed]

Gulden, J.

A. P. Mancuso, T. Gorniak, F. Staier, O. M. Yefanov, R. Barth, C. Christophis, B. Reime, J. Gulden, A. Singer, M. E. Pettit, T. Nisius, T. Wilhein, C. Gutt, G. Grübel, N. Guerassimova, R. Treusch, J. Feldhaus, S. Eisebitt, E. Weckert, M. Grunze, A. Rosenhahn, I. A. Vartanyants, “Coherent imaging of biological samples with femtosecond pulses at the free-electron laser FLASH,” New J. Phys. 12(3), 035003 (2010).
[CrossRef]

Gumprecht, L.

M. M. Seibert, T. Ekeberg, F. R. N. C. Maia, M. Svenda, J. Andreasson, O. Jönsson, D. Odić, B. Iwan, A. Rocker, D. Westphal, M. Hantke, D. P. DePonte, A. Barty, J. Schulz, L. Gumprecht, N. Coppola, A. Aquila, M. Liang, T. A. White, A. Martin, C. Caleman, S. Stern, C. Abergel, V. Seltzer, J. M. Claverie, C. Bostedt, J. D. Bozek, S. Boutet, A. A. Miahnahri, M. Messerschmidt, J. Krzywinski, G. Williams, K. O. Hodgson, M. J. Bogan, C. Y. Hampton, R. G. Sierra, D. Starodub, I. Andersson, S. Bajt, M. Barthelmess, J. C. H. Spence, P. Fromme, U. Weierstall, R. Kirian, M. Hunter, R. B. Doak, S. Marchesini, S. P. Hau-Riege, M. Frank, R. L. Shoeman, L. Lomb, S. W. Epp, R. Hartmann, D. Rolles, A. Rudenko, C. Schmidt, L. Foucar, N. Kimmel, P. Holl, B. Rudek, B. Erk, A. Hömke, C. Reich, D. Pietschner, G. Weidenspointner, L. Strüder, G. Hauser, H. Gorke, J. Ullrich, I. Schlichting, S. Herrmann, G. Schaller, F. Schopper, H. Soltau, K. U. Kühnel, R. Andritschke, C. D. Schröter, F. Krasniqi, M. Bott, S. Schorb, D. Rupp, M. Adolph, T. Gorkhover, H. Hirsemann, G. Potdevin, H. Graafsma, B. Nilsson, H. N. Chapman, J. Hajdu, “Single mimivirus particles intercepted and imaged with an X-ray laser,” Nature 470(7332), 78–81 (2011).
[CrossRef] [PubMed]

C. H. Yoon, P. Schwander, C. Abergel, I. Andersson, J. Andreasson, A. Aquila, S. Bajt, M. Barthelmess, A. Barty, M. J. Bogan, C. Bostedt, J. Bozek, H. N. Chapman, J. M. Claverie, N. Coppola, D. P. DePonte, T. Ekeberg, S. W. Epp, B. Erk, H. Fleckenstein, L. Foucar, H. Graafsma, L. Gumprecht, J. Hajdu, C. Y. Hampton, A. Hartmann, E. Hartmann, R. Hartmann, G. Hauser, H. Hirsemann, P. Holl, S. Kassemeyer, N. Kimmel, M. Kiskinova, M. Liang, N. T. D. Loh, L. Lomb, F. R. N. C. Maia, A. V. Martin, K. Nass, E. Pedersoli, C. Reich, D. Rolles, B. Rudek, A. Rudenko, I. Schlichting, J. Schulz, M. Seibert, V. Seltzer, R. L. Shoeman, R. G. Sierra, H. Soltau, D. Starodub, J. Steinbrener, G. Stier, L. Strüder, M. Svenda, J. Ullrich, G. Weidenspointner, T. A. White, C. Wunderer, A. Ourmazd, “Unsupervised classification of single-particle X-ray diffraction snapshots by spectral clustering,” Opt. Express 19(17), 16542–16549 (2011).
[CrossRef] [PubMed]

Gutt, C.

F. Capotondi, E. Pedersoli, N. Mahne, R. H. Menk, G. Passos, L. Raimondi, C. Svetina, G. Sandrin, M. Zangrando, M. Kiskinova, S. Bajt, M. Barthelmess, H. Fleckenstein, H. N. Chapman, J. Schulz, J. Bach, R. Frömter, S. Schleitzer, L. Müller, C. Gutt, G. Grübel, “Invited article: Coherent imaging using seeded free-electron laser pulses with variable polarization: First results and research opportunities,” Rev. Sci. Instrum. 84(5), 051301 (2013).
[CrossRef] [PubMed]

A. P. Mancuso, T. Gorniak, F. Staier, O. M. Yefanov, R. Barth, C. Christophis, B. Reime, J. Gulden, A. Singer, M. E. Pettit, T. Nisius, T. Wilhein, C. Gutt, G. Grübel, N. Guerassimova, R. Treusch, J. Feldhaus, S. Eisebitt, E. Weckert, M. Grunze, A. Rosenhahn, I. A. Vartanyants, “Coherent imaging of biological samples with femtosecond pulses at the free-electron laser FLASH,” New J. Phys. 12(3), 035003 (2010).
[CrossRef]

Hajdu, J.

M. M. Seibert, T. Ekeberg, F. R. N. C. Maia, M. Svenda, J. Andreasson, O. Jönsson, D. Odić, B. Iwan, A. Rocker, D. Westphal, M. Hantke, D. P. DePonte, A. Barty, J. Schulz, L. Gumprecht, N. Coppola, A. Aquila, M. Liang, T. A. White, A. Martin, C. Caleman, S. Stern, C. Abergel, V. Seltzer, J. M. Claverie, C. Bostedt, J. D. Bozek, S. Boutet, A. A. Miahnahri, M. Messerschmidt, J. Krzywinski, G. Williams, K. O. Hodgson, M. J. Bogan, C. Y. Hampton, R. G. Sierra, D. Starodub, I. Andersson, S. Bajt, M. Barthelmess, J. C. H. Spence, P. Fromme, U. Weierstall, R. Kirian, M. Hunter, R. B. Doak, S. Marchesini, S. P. Hau-Riege, M. Frank, R. L. Shoeman, L. Lomb, S. W. Epp, R. Hartmann, D. Rolles, A. Rudenko, C. Schmidt, L. Foucar, N. Kimmel, P. Holl, B. Rudek, B. Erk, A. Hömke, C. Reich, D. Pietschner, G. Weidenspointner, L. Strüder, G. Hauser, H. Gorke, J. Ullrich, I. Schlichting, S. Herrmann, G. Schaller, F. Schopper, H. Soltau, K. U. Kühnel, R. Andritschke, C. D. Schröter, F. Krasniqi, M. Bott, S. Schorb, D. Rupp, M. Adolph, T. Gorkhover, H. Hirsemann, G. Potdevin, H. Graafsma, B. Nilsson, H. N. Chapman, J. Hajdu, “Single mimivirus particles intercepted and imaged with an X-ray laser,” Nature 470(7332), 78–81 (2011).
[CrossRef] [PubMed]

C. H. Yoon, P. Schwander, C. Abergel, I. Andersson, J. Andreasson, A. Aquila, S. Bajt, M. Barthelmess, A. Barty, M. J. Bogan, C. Bostedt, J. Bozek, H. N. Chapman, J. M. Claverie, N. Coppola, D. P. DePonte, T. Ekeberg, S. W. Epp, B. Erk, H. Fleckenstein, L. Foucar, H. Graafsma, L. Gumprecht, J. Hajdu, C. Y. Hampton, A. Hartmann, E. Hartmann, R. Hartmann, G. Hauser, H. Hirsemann, P. Holl, S. Kassemeyer, N. Kimmel, M. Kiskinova, M. Liang, N. T. D. Loh, L. Lomb, F. R. N. C. Maia, A. V. Martin, K. Nass, E. Pedersoli, C. Reich, D. Rolles, B. Rudek, A. Rudenko, I. Schlichting, J. Schulz, M. Seibert, V. Seltzer, R. L. Shoeman, R. G. Sierra, H. Soltau, D. Starodub, J. Steinbrener, G. Stier, L. Strüder, M. Svenda, J. Ullrich, G. Weidenspointner, T. A. White, C. Wunderer, A. Ourmazd, “Unsupervised classification of single-particle X-ray diffraction snapshots by spectral clustering,” Opt. Express 19(17), 16542–16549 (2011).
[CrossRef] [PubMed]

H. N. Chapman, A. Barty, M. J. Bogan, S. Boutet, M. Frank, S. P. Hau-Riege, S. Marchesini, B. W. Woods, S. Bajt, W. H. Benner, R. A. London, E. Plönjes, M. Kuhlmann, R. Treusch, S. Düsterer, T. Tschentscher, J. R. Schneider, E. Spiller, T. Möller, C. Bostedt, M. Hoener, D. A. Shapiro, K. O. Hodgson, D. van der Spoel, F. Burmeister, M. Bergh, C. Caleman, G. Huldt, M. M. Seibert, F. R. N. C. Maia, R. W. Lee, A. Szöke, N. Timneanu, J. Hajdu, “Femtosecond diffractive imaging with a soft-X-ray free-electron laser,” Nat. Phys. 2(12), 839–843 (2006).
[CrossRef]

R. Neutze, R. Wouts, D. van der Spoel, E. Weckert, J. Hajdu, “Potential for biomolecular imaging with femtosecond X-ray pulses,” Nature 406(6797), 752–757 (2000).
[CrossRef] [PubMed]

Haller, G.

S. Boutet, L. Lomb, G. J. Williams, T. R. M. Barends, A. Aquila, R. B. Doak, U. Weierstall, D. P. DePonte, J. Steinbrener, R. L. Shoeman, M. Messerschmidt, A. Barty, T. A. White, S. Kassemeyer, R. A. Kirian, M. M. Seibert, P. A. Montanez, C. Kenney, R. Herbst, P. Hart, J. Pines, G. Haller, S. M. Gruner, H. T. Philipp, M. W. Tate, M. Hromalik, L. J. Koerner, N. van Bakel, J. Morse, W. Ghonsalves, D. Arnlund, M. J. Bogan, C. Caleman, R. Fromme, C. Y. Hampton, M. S. Hunter, L. C. Johansson, G. Katona, C. Kupitz, M. Liang, A. V. Martin, K. Nass, L. Redecke, F. Stellato, N. Timneanu, D. Wang, N. A. Zatsepin, D. Schafer, J. Defever, R. Neutze, P. Fromme, J. C. H. Spence, H. N. Chapman, I. Schlichting, “High-resolution protein structure determination by serial femtosecond crystallography,” Science 337(6092), 362–364 (2012).
[CrossRef] [PubMed]

Hampton, C. Y.

S. Boutet, L. Lomb, G. J. Williams, T. R. M. Barends, A. Aquila, R. B. Doak, U. Weierstall, D. P. DePonte, J. Steinbrener, R. L. Shoeman, M. Messerschmidt, A. Barty, T. A. White, S. Kassemeyer, R. A. Kirian, M. M. Seibert, P. A. Montanez, C. Kenney, R. Herbst, P. Hart, J. Pines, G. Haller, S. M. Gruner, H. T. Philipp, M. W. Tate, M. Hromalik, L. J. Koerner, N. van Bakel, J. Morse, W. Ghonsalves, D. Arnlund, M. J. Bogan, C. Caleman, R. Fromme, C. Y. Hampton, M. S. Hunter, L. C. Johansson, G. Katona, C. Kupitz, M. Liang, A. V. Martin, K. Nass, L. Redecke, F. Stellato, N. Timneanu, D. Wang, N. A. Zatsepin, D. Schafer, J. Defever, R. Neutze, P. Fromme, J. C. H. Spence, H. N. Chapman, I. Schlichting, “High-resolution protein structure determination by serial femtosecond crystallography,” Science 337(6092), 362–364 (2012).
[CrossRef] [PubMed]

M. M. Seibert, T. Ekeberg, F. R. N. C. Maia, M. Svenda, J. Andreasson, O. Jönsson, D. Odić, B. Iwan, A. Rocker, D. Westphal, M. Hantke, D. P. DePonte, A. Barty, J. Schulz, L. Gumprecht, N. Coppola, A. Aquila, M. Liang, T. A. White, A. Martin, C. Caleman, S. Stern, C. Abergel, V. Seltzer, J. M. Claverie, C. Bostedt, J. D. Bozek, S. Boutet, A. A. Miahnahri, M. Messerschmidt, J. Krzywinski, G. Williams, K. O. Hodgson, M. J. Bogan, C. Y. Hampton, R. G. Sierra, D. Starodub, I. Andersson, S. Bajt, M. Barthelmess, J. C. H. Spence, P. Fromme, U. Weierstall, R. Kirian, M. Hunter, R. B. Doak, S. Marchesini, S. P. Hau-Riege, M. Frank, R. L. Shoeman, L. Lomb, S. W. Epp, R. Hartmann, D. Rolles, A. Rudenko, C. Schmidt, L. Foucar, N. Kimmel, P. Holl, B. Rudek, B. Erk, A. Hömke, C. Reich, D. Pietschner, G. Weidenspointner, L. Strüder, G. Hauser, H. Gorke, J. Ullrich, I. Schlichting, S. Herrmann, G. Schaller, F. Schopper, H. Soltau, K. U. Kühnel, R. Andritschke, C. D. Schröter, F. Krasniqi, M. Bott, S. Schorb, D. Rupp, M. Adolph, T. Gorkhover, H. Hirsemann, G. Potdevin, H. Graafsma, B. Nilsson, H. N. Chapman, J. Hajdu, “Single mimivirus particles intercepted and imaged with an X-ray laser,” Nature 470(7332), 78–81 (2011).
[CrossRef] [PubMed]

C. H. Yoon, P. Schwander, C. Abergel, I. Andersson, J. Andreasson, A. Aquila, S. Bajt, M. Barthelmess, A. Barty, M. J. Bogan, C. Bostedt, J. Bozek, H. N. Chapman, J. M. Claverie, N. Coppola, D. P. DePonte, T. Ekeberg, S. W. Epp, B. Erk, H. Fleckenstein, L. Foucar, H. Graafsma, L. Gumprecht, J. Hajdu, C. Y. Hampton, A. Hartmann, E. Hartmann, R. Hartmann, G. Hauser, H. Hirsemann, P. Holl, S. Kassemeyer, N. Kimmel, M. Kiskinova, M. Liang, N. T. D. Loh, L. Lomb, F. R. N. C. Maia, A. V. Martin, K. Nass, E. Pedersoli, C. Reich, D. Rolles, B. Rudek, A. Rudenko, I. Schlichting, J. Schulz, M. Seibert, V. Seltzer, R. L. Shoeman, R. G. Sierra, H. Soltau, D. Starodub, J. Steinbrener, G. Stier, L. Strüder, M. Svenda, J. Ullrich, G. Weidenspointner, T. A. White, C. Wunderer, A. Ourmazd, “Unsupervised classification of single-particle X-ray diffraction snapshots by spectral clustering,” Opt. Express 19(17), 16542–16549 (2011).
[CrossRef] [PubMed]

M. J. Bogan, D. Starodub, C. Y. Hampton, R. G. Sierra, “Single-particle coherent diffractive imaging with a soft x-ray free electron laser: towards soot aerosol morphology,” J. Phys. At. Mol. Opt. Phys. 43(19), 194013 (2010).
[CrossRef]

Han, G.

J. Kern, R. Alonso-Mori, R. Tran, J. Hattne, R. J. Gildea, N. Echols, C. Glöckner, J. Hellmich, H. Laksmono, R. G. Sierra, B. Lassalle-Kaiser, S. Koroidov, A. Lampe, G. Han, S. Gul, D. Difiore, D. Milathianaki, A. R. Fry, A. Miahnahri, D. W. Schafer, M. Messerschmidt, M. M. Seibert, J. E. Koglin, D. Sokaras, T. C. Weng, J. Sellberg, M. J. Latimer, R. W. Grosse-Kunstleve, P. H. Zwart, W. E. White, P. Glatzel, P. D. Adams, M. J. Bogan, G. J. Williams, S. Boutet, J. Messinger, A. Zouni, N. K. Sauter, V. K. Yachandra, U. Bergmann, J. Yano, “Simultaneous femtosecond X-ray spectroscopy and diffraction of photosystem II at room temperature,” Science 340(6131), 491–495 (2013).
[CrossRef] [PubMed]

Hantke, M.

M. M. Seibert, T. Ekeberg, F. R. N. C. Maia, M. Svenda, J. Andreasson, O. Jönsson, D. Odić, B. Iwan, A. Rocker, D. Westphal, M. Hantke, D. P. DePonte, A. Barty, J. Schulz, L. Gumprecht, N. Coppola, A. Aquila, M. Liang, T. A. White, A. Martin, C. Caleman, S. Stern, C. Abergel, V. Seltzer, J. M. Claverie, C. Bostedt, J. D. Bozek, S. Boutet, A. A. Miahnahri, M. Messerschmidt, J. Krzywinski, G. Williams, K. O. Hodgson, M. J. Bogan, C. Y. Hampton, R. G. Sierra, D. Starodub, I. Andersson, S. Bajt, M. Barthelmess, J. C. H. Spence, P. Fromme, U. Weierstall, R. Kirian, M. Hunter, R. B. Doak, S. Marchesini, S. P. Hau-Riege, M. Frank, R. L. Shoeman, L. Lomb, S. W. Epp, R. Hartmann, D. Rolles, A. Rudenko, C. Schmidt, L. Foucar, N. Kimmel, P. Holl, B. Rudek, B. Erk, A. Hömke, C. Reich, D. Pietschner, G. Weidenspointner, L. Strüder, G. Hauser, H. Gorke, J. Ullrich, I. Schlichting, S. Herrmann, G. Schaller, F. Schopper, H. Soltau, K. U. Kühnel, R. Andritschke, C. D. Schröter, F. Krasniqi, M. Bott, S. Schorb, D. Rupp, M. Adolph, T. Gorkhover, H. Hirsemann, G. Potdevin, H. Graafsma, B. Nilsson, H. N. Chapman, J. Hajdu, “Single mimivirus particles intercepted and imaged with an X-ray laser,” Nature 470(7332), 78–81 (2011).
[CrossRef] [PubMed]

Hart, P.

S. Boutet, L. Lomb, G. J. Williams, T. R. M. Barends, A. Aquila, R. B. Doak, U. Weierstall, D. P. DePonte, J. Steinbrener, R. L. Shoeman, M. Messerschmidt, A. Barty, T. A. White, S. Kassemeyer, R. A. Kirian, M. M. Seibert, P. A. Montanez, C. Kenney, R. Herbst, P. Hart, J. Pines, G. Haller, S. M. Gruner, H. T. Philipp, M. W. Tate, M. Hromalik, L. J. Koerner, N. van Bakel, J. Morse, W. Ghonsalves, D. Arnlund, M. J. Bogan, C. Caleman, R. Fromme, C. Y. Hampton, M. S. Hunter, L. C. Johansson, G. Katona, C. Kupitz, M. Liang, A. V. Martin, K. Nass, L. Redecke, F. Stellato, N. Timneanu, D. Wang, N. A. Zatsepin, D. Schafer, J. Defever, R. Neutze, P. Fromme, J. C. H. Spence, H. N. Chapman, I. Schlichting, “High-resolution protein structure determination by serial femtosecond crystallography,” Science 337(6092), 362–364 (2012).
[CrossRef] [PubMed]

Hartmann, A.

Hartmann, E.

Hartmann, R.

C. H. Yoon, P. Schwander, C. Abergel, I. Andersson, J. Andreasson, A. Aquila, S. Bajt, M. Barthelmess, A. Barty, M. J. Bogan, C. Bostedt, J. Bozek, H. N. Chapman, J. M. Claverie, N. Coppola, D. P. DePonte, T. Ekeberg, S. W. Epp, B. Erk, H. Fleckenstein, L. Foucar, H. Graafsma, L. Gumprecht, J. Hajdu, C. Y. Hampton, A. Hartmann, E. Hartmann, R. Hartmann, G. Hauser, H. Hirsemann, P. Holl, S. Kassemeyer, N. Kimmel, M. Kiskinova, M. Liang, N. T. D. Loh, L. Lomb, F. R. N. C. Maia, A. V. Martin, K. Nass, E. Pedersoli, C. Reich, D. Rolles, B. Rudek, A. Rudenko, I. Schlichting, J. Schulz, M. Seibert, V. Seltzer, R. L. Shoeman, R. G. Sierra, H. Soltau, D. Starodub, J. Steinbrener, G. Stier, L. Strüder, M. Svenda, J. Ullrich, G. Weidenspointner, T. A. White, C. Wunderer, A. Ourmazd, “Unsupervised classification of single-particle X-ray diffraction snapshots by spectral clustering,” Opt. Express 19(17), 16542–16549 (2011).
[CrossRef] [PubMed]

M. M. Seibert, T. Ekeberg, F. R. N. C. Maia, M. Svenda, J. Andreasson, O. Jönsson, D. Odić, B. Iwan, A. Rocker, D. Westphal, M. Hantke, D. P. DePonte, A. Barty, J. Schulz, L. Gumprecht, N. Coppola, A. Aquila, M. Liang, T. A. White, A. Martin, C. Caleman, S. Stern, C. Abergel, V. Seltzer, J. M. Claverie, C. Bostedt, J. D. Bozek, S. Boutet, A. A. Miahnahri, M. Messerschmidt, J. Krzywinski, G. Williams, K. O. Hodgson, M. J. Bogan, C. Y. Hampton, R. G. Sierra, D. Starodub, I. Andersson, S. Bajt, M. Barthelmess, J. C. H. Spence, P. Fromme, U. Weierstall, R. Kirian, M. Hunter, R. B. Doak, S. Marchesini, S. P. Hau-Riege, M. Frank, R. L. Shoeman, L. Lomb, S. W. Epp, R. Hartmann, D. Rolles, A. Rudenko, C. Schmidt, L. Foucar, N. Kimmel, P. Holl, B. Rudek, B. Erk, A. Hömke, C. Reich, D. Pietschner, G. Weidenspointner, L. Strüder, G. Hauser, H. Gorke, J. Ullrich, I. Schlichting, S. Herrmann, G. Schaller, F. Schopper, H. Soltau, K. U. Kühnel, R. Andritschke, C. D. Schröter, F. Krasniqi, M. Bott, S. Schorb, D. Rupp, M. Adolph, T. Gorkhover, H. Hirsemann, G. Potdevin, H. Graafsma, B. Nilsson, H. N. Chapman, J. Hajdu, “Single mimivirus particles intercepted and imaged with an X-ray laser,” Nature 470(7332), 78–81 (2011).
[CrossRef] [PubMed]

Hattne, J.

J. Kern, R. Alonso-Mori, R. Tran, J. Hattne, R. J. Gildea, N. Echols, C. Glöckner, J. Hellmich, H. Laksmono, R. G. Sierra, B. Lassalle-Kaiser, S. Koroidov, A. Lampe, G. Han, S. Gul, D. Difiore, D. Milathianaki, A. R. Fry, A. Miahnahri, D. W. Schafer, M. Messerschmidt, M. M. Seibert, J. E. Koglin, D. Sokaras, T. C. Weng, J. Sellberg, M. J. Latimer, R. W. Grosse-Kunstleve, P. H. Zwart, W. E. White, P. Glatzel, P. D. Adams, M. J. Bogan, G. J. Williams, S. Boutet, J. Messinger, A. Zouni, N. K. Sauter, V. K. Yachandra, U. Bergmann, J. Yano, “Simultaneous femtosecond X-ray spectroscopy and diffraction of photosystem II at room temperature,” Science 340(6131), 491–495 (2013).
[CrossRef] [PubMed]

Hau-Riege, S. P.

M. M. Seibert, T. Ekeberg, F. R. N. C. Maia, M. Svenda, J. Andreasson, O. Jönsson, D. Odić, B. Iwan, A. Rocker, D. Westphal, M. Hantke, D. P. DePonte, A. Barty, J. Schulz, L. Gumprecht, N. Coppola, A. Aquila, M. Liang, T. A. White, A. Martin, C. Caleman, S. Stern, C. Abergel, V. Seltzer, J. M. Claverie, C. Bostedt, J. D. Bozek, S. Boutet, A. A. Miahnahri, M. Messerschmidt, J. Krzywinski, G. Williams, K. O. Hodgson, M. J. Bogan, C. Y. Hampton, R. G. Sierra, D. Starodub, I. Andersson, S. Bajt, M. Barthelmess, J. C. H. Spence, P. Fromme, U. Weierstall, R. Kirian, M. Hunter, R. B. Doak, S. Marchesini, S. P. Hau-Riege, M. Frank, R. L. Shoeman, L. Lomb, S. W. Epp, R. Hartmann, D. Rolles, A. Rudenko, C. Schmidt, L. Foucar, N. Kimmel, P. Holl, B. Rudek, B. Erk, A. Hömke, C. Reich, D. Pietschner, G. Weidenspointner, L. Strüder, G. Hauser, H. Gorke, J. Ullrich, I. Schlichting, S. Herrmann, G. Schaller, F. Schopper, H. Soltau, K. U. Kühnel, R. Andritschke, C. D. Schröter, F. Krasniqi, M. Bott, S. Schorb, D. Rupp, M. Adolph, T. Gorkhover, H. Hirsemann, G. Potdevin, H. Graafsma, B. Nilsson, H. N. Chapman, J. Hajdu, “Single mimivirus particles intercepted and imaged with an X-ray laser,” Nature 470(7332), 78–81 (2011).
[CrossRef] [PubMed]

H. N. Chapman, A. Barty, M. J. Bogan, S. Boutet, M. Frank, S. P. Hau-Riege, S. Marchesini, B. W. Woods, S. Bajt, W. H. Benner, R. A. London, E. Plönjes, M. Kuhlmann, R. Treusch, S. Düsterer, T. Tschentscher, J. R. Schneider, E. Spiller, T. Möller, C. Bostedt, M. Hoener, D. A. Shapiro, K. O. Hodgson, D. van der Spoel, F. Burmeister, M. Bergh, C. Caleman, G. Huldt, M. M. Seibert, F. R. N. C. Maia, R. W. Lee, A. Szöke, N. Timneanu, J. Hajdu, “Femtosecond diffractive imaging with a soft-X-ray free-electron laser,” Nat. Phys. 2(12), 839–843 (2006).
[CrossRef]

H. N. Chapman, A. Barty, S. Marchesini, A. Noy, S. P. Hau-Riege, C. Cui, M. R. Howells, R. Rosen, H. He, J. C. H. Spence, U. Weierstall, T. Beetz, C. Jacobsen, D. Shapiro, “High-resolution ab initio three-dimensional x-ray diffraction microscopy,” J. Opt. Soc. Am. A 23(5), 1179 (2006).
[CrossRef]

S. Marchesini, H. He, H. N. Chapman, S. P. Hau-Riege, A. Noy, M. R. Howells, U. Weierstall, J. C. H. Spence, “X-ray image reconstruction from a diffraction pattern alone,” Phys. Rev. B 68(14), 140101 (2003).
[CrossRef]

Hauser, G.

M. M. Seibert, T. Ekeberg, F. R. N. C. Maia, M. Svenda, J. Andreasson, O. Jönsson, D. Odić, B. Iwan, A. Rocker, D. Westphal, M. Hantke, D. P. DePonte, A. Barty, J. Schulz, L. Gumprecht, N. Coppola, A. Aquila, M. Liang, T. A. White, A. Martin, C. Caleman, S. Stern, C. Abergel, V. Seltzer, J. M. Claverie, C. Bostedt, J. D. Bozek, S. Boutet, A. A. Miahnahri, M. Messerschmidt, J. Krzywinski, G. Williams, K. O. Hodgson, M. J. Bogan, C. Y. Hampton, R. G. Sierra, D. Starodub, I. Andersson, S. Bajt, M. Barthelmess, J. C. H. Spence, P. Fromme, U. Weierstall, R. Kirian, M. Hunter, R. B. Doak, S. Marchesini, S. P. Hau-Riege, M. Frank, R. L. Shoeman, L. Lomb, S. W. Epp, R. Hartmann, D. Rolles, A. Rudenko, C. Schmidt, L. Foucar, N. Kimmel, P. Holl, B. Rudek, B. Erk, A. Hömke, C. Reich, D. Pietschner, G. Weidenspointner, L. Strüder, G. Hauser, H. Gorke, J. Ullrich, I. Schlichting, S. Herrmann, G. Schaller, F. Schopper, H. Soltau, K. U. Kühnel, R. Andritschke, C. D. Schröter, F. Krasniqi, M. Bott, S. Schorb, D. Rupp, M. Adolph, T. Gorkhover, H. Hirsemann, G. Potdevin, H. Graafsma, B. Nilsson, H. N. Chapman, J. Hajdu, “Single mimivirus particles intercepted and imaged with an X-ray laser,” Nature 470(7332), 78–81 (2011).
[CrossRef] [PubMed]

C. H. Yoon, P. Schwander, C. Abergel, I. Andersson, J. Andreasson, A. Aquila, S. Bajt, M. Barthelmess, A. Barty, M. J. Bogan, C. Bostedt, J. Bozek, H. N. Chapman, J. M. Claverie, N. Coppola, D. P. DePonte, T. Ekeberg, S. W. Epp, B. Erk, H. Fleckenstein, L. Foucar, H. Graafsma, L. Gumprecht, J. Hajdu, C. Y. Hampton, A. Hartmann, E. Hartmann, R. Hartmann, G. Hauser, H. Hirsemann, P. Holl, S. Kassemeyer, N. Kimmel, M. Kiskinova, M. Liang, N. T. D. Loh, L. Lomb, F. R. N. C. Maia, A. V. Martin, K. Nass, E. Pedersoli, C. Reich, D. Rolles, B. Rudek, A. Rudenko, I. Schlichting, J. Schulz, M. Seibert, V. Seltzer, R. L. Shoeman, R. G. Sierra, H. Soltau, D. Starodub, J. Steinbrener, G. Stier, L. Strüder, M. Svenda, J. Ullrich, G. Weidenspointner, T. A. White, C. Wunderer, A. Ourmazd, “Unsupervised classification of single-particle X-ray diffraction snapshots by spectral clustering,” Opt. Express 19(17), 16542–16549 (2011).
[CrossRef] [PubMed]

He, H.

H. N. Chapman, A. Barty, S. Marchesini, A. Noy, S. P. Hau-Riege, C. Cui, M. R. Howells, R. Rosen, H. He, J. C. H. Spence, U. Weierstall, T. Beetz, C. Jacobsen, D. Shapiro, “High-resolution ab initio three-dimensional x-ray diffraction microscopy,” J. Opt. Soc. Am. A 23(5), 1179 (2006).
[CrossRef]

S. Marchesini, H. He, H. N. Chapman, S. P. Hau-Riege, A. Noy, M. R. Howells, U. Weierstall, J. C. H. Spence, “X-ray image reconstruction from a diffraction pattern alone,” Phys. Rev. B 68(14), 140101 (2003).
[CrossRef]

Hellmich, J.

J. Kern, R. Alonso-Mori, R. Tran, J. Hattne, R. J. Gildea, N. Echols, C. Glöckner, J. Hellmich, H. Laksmono, R. G. Sierra, B. Lassalle-Kaiser, S. Koroidov, A. Lampe, G. Han, S. Gul, D. Difiore, D. Milathianaki, A. R. Fry, A. Miahnahri, D. W. Schafer, M. Messerschmidt, M. M. Seibert, J. E. Koglin, D. Sokaras, T. C. Weng, J. Sellberg, M. J. Latimer, R. W. Grosse-Kunstleve, P. H. Zwart, W. E. White, P. Glatzel, P. D. Adams, M. J. Bogan, G. J. Williams, S. Boutet, J. Messinger, A. Zouni, N. K. Sauter, V. K. Yachandra, U. Bergmann, J. Yano, “Simultaneous femtosecond X-ray spectroscopy and diffraction of photosystem II at room temperature,” Science 340(6131), 491–495 (2013).
[CrossRef] [PubMed]

Herbst, R.

S. Boutet, L. Lomb, G. J. Williams, T. R. M. Barends, A. Aquila, R. B. Doak, U. Weierstall, D. P. DePonte, J. Steinbrener, R. L. Shoeman, M. Messerschmidt, A. Barty, T. A. White, S. Kassemeyer, R. A. Kirian, M. M. Seibert, P. A. Montanez, C. Kenney, R. Herbst, P. Hart, J. Pines, G. Haller, S. M. Gruner, H. T. Philipp, M. W. Tate, M. Hromalik, L. J. Koerner, N. van Bakel, J. Morse, W. Ghonsalves, D. Arnlund, M. J. Bogan, C. Caleman, R. Fromme, C. Y. Hampton, M. S. Hunter, L. C. Johansson, G. Katona, C. Kupitz, M. Liang, A. V. Martin, K. Nass, L. Redecke, F. Stellato, N. Timneanu, D. Wang, N. A. Zatsepin, D. Schafer, J. Defever, R. Neutze, P. Fromme, J. C. H. Spence, H. N. Chapman, I. Schlichting, “High-resolution protein structure determination by serial femtosecond crystallography,” Science 337(6092), 362–364 (2012).
[CrossRef] [PubMed]

Herman, G. T.

S. H. W. Scheres, H. Gao, M. Valle, G. T. Herman, P. P. B. Eggermont, J. Frank, J. M. Carazo, “Disentangling conformational states of macromolecules in 3D-EM through likelihood optimization,” Nat. Methods 4(1), 27–29 (2007).
[CrossRef] [PubMed]

Herrmann, S.

M. M. Seibert, T. Ekeberg, F. R. N. C. Maia, M. Svenda, J. Andreasson, O. Jönsson, D. Odić, B. Iwan, A. Rocker, D. Westphal, M. Hantke, D. P. DePonte, A. Barty, J. Schulz, L. Gumprecht, N. Coppola, A. Aquila, M. Liang, T. A. White, A. Martin, C. Caleman, S. Stern, C. Abergel, V. Seltzer, J. M. Claverie, C. Bostedt, J. D. Bozek, S. Boutet, A. A. Miahnahri, M. Messerschmidt, J. Krzywinski, G. Williams, K. O. Hodgson, M. J. Bogan, C. Y. Hampton, R. G. Sierra, D. Starodub, I. Andersson, S. Bajt, M. Barthelmess, J. C. H. Spence, P. Fromme, U. Weierstall, R. Kirian, M. Hunter, R. B. Doak, S. Marchesini, S. P. Hau-Riege, M. Frank, R. L. Shoeman, L. Lomb, S. W. Epp, R. Hartmann, D. Rolles, A. Rudenko, C. Schmidt, L. Foucar, N. Kimmel, P. Holl, B. Rudek, B. Erk, A. Hömke, C. Reich, D. Pietschner, G. Weidenspointner, L. Strüder, G. Hauser, H. Gorke, J. Ullrich, I. Schlichting, S. Herrmann, G. Schaller, F. Schopper, H. Soltau, K. U. Kühnel, R. Andritschke, C. D. Schröter, F. Krasniqi, M. Bott, S. Schorb, D. Rupp, M. Adolph, T. Gorkhover, H. Hirsemann, G. Potdevin, H. Graafsma, B. Nilsson, H. N. Chapman, J. Hajdu, “Single mimivirus particles intercepted and imaged with an X-ray laser,” Nature 470(7332), 78–81 (2011).
[CrossRef] [PubMed]

Hirsemann, H.

M. M. Seibert, T. Ekeberg, F. R. N. C. Maia, M. Svenda, J. Andreasson, O. Jönsson, D. Odić, B. Iwan, A. Rocker, D. Westphal, M. Hantke, D. P. DePonte, A. Barty, J. Schulz, L. Gumprecht, N. Coppola, A. Aquila, M. Liang, T. A. White, A. Martin, C. Caleman, S. Stern, C. Abergel, V. Seltzer, J. M. Claverie, C. Bostedt, J. D. Bozek, S. Boutet, A. A. Miahnahri, M. Messerschmidt, J. Krzywinski, G. Williams, K. O. Hodgson, M. J. Bogan, C. Y. Hampton, R. G. Sierra, D. Starodub, I. Andersson, S. Bajt, M. Barthelmess, J. C. H. Spence, P. Fromme, U. Weierstall, R. Kirian, M. Hunter, R. B. Doak, S. Marchesini, S. P. Hau-Riege, M. Frank, R. L. Shoeman, L. Lomb, S. W. Epp, R. Hartmann, D. Rolles, A. Rudenko, C. Schmidt, L. Foucar, N. Kimmel, P. Holl, B. Rudek, B. Erk, A. Hömke, C. Reich, D. Pietschner, G. Weidenspointner, L. Strüder, G. Hauser, H. Gorke, J. Ullrich, I. Schlichting, S. Herrmann, G. Schaller, F. Schopper, H. Soltau, K. U. Kühnel, R. Andritschke, C. D. Schröter, F. Krasniqi, M. Bott, S. Schorb, D. Rupp, M. Adolph, T. Gorkhover, H. Hirsemann, G. Potdevin, H. Graafsma, B. Nilsson, H. N. Chapman, J. Hajdu, “Single mimivirus particles intercepted and imaged with an X-ray laser,” Nature 470(7332), 78–81 (2011).
[CrossRef] [PubMed]

C. H. Yoon, P. Schwander, C. Abergel, I. Andersson, J. Andreasson, A. Aquila, S. Bajt, M. Barthelmess, A. Barty, M. J. Bogan, C. Bostedt, J. Bozek, H. N. Chapman, J. M. Claverie, N. Coppola, D. P. DePonte, T. Ekeberg, S. W. Epp, B. Erk, H. Fleckenstein, L. Foucar, H. Graafsma, L. Gumprecht, J. Hajdu, C. Y. Hampton, A. Hartmann, E. Hartmann, R. Hartmann, G. Hauser, H. Hirsemann, P. Holl, S. Kassemeyer, N. Kimmel, M. Kiskinova, M. Liang, N. T. D. Loh, L. Lomb, F. R. N. C. Maia, A. V. Martin, K. Nass, E. Pedersoli, C. Reich, D. Rolles, B. Rudek, A. Rudenko, I. Schlichting, J. Schulz, M. Seibert, V. Seltzer, R. L. Shoeman, R. G. Sierra, H. Soltau, D. Starodub, J. Steinbrener, G. Stier, L. Strüder, M. Svenda, J. Ullrich, G. Weidenspointner, T. A. White, C. Wunderer, A. Ourmazd, “Unsupervised classification of single-particle X-ray diffraction snapshots by spectral clustering,” Opt. Express 19(17), 16542–16549 (2011).
[CrossRef] [PubMed]

Hodgson, K. O.

M. M. Seibert, T. Ekeberg, F. R. N. C. Maia, M. Svenda, J. Andreasson, O. Jönsson, D. Odić, B. Iwan, A. Rocker, D. Westphal, M. Hantke, D. P. DePonte, A. Barty, J. Schulz, L. Gumprecht, N. Coppola, A. Aquila, M. Liang, T. A. White, A. Martin, C. Caleman, S. Stern, C. Abergel, V. Seltzer, J. M. Claverie, C. Bostedt, J. D. Bozek, S. Boutet, A. A. Miahnahri, M. Messerschmidt, J. Krzywinski, G. Williams, K. O. Hodgson, M. J. Bogan, C. Y. Hampton, R. G. Sierra, D. Starodub, I. Andersson, S. Bajt, M. Barthelmess, J. C. H. Spence, P. Fromme, U. Weierstall, R. Kirian, M. Hunter, R. B. Doak, S. Marchesini, S. P. Hau-Riege, M. Frank, R. L. Shoeman, L. Lomb, S. W. Epp, R. Hartmann, D. Rolles, A. Rudenko, C. Schmidt, L. Foucar, N. Kimmel, P. Holl, B. Rudek, B. Erk, A. Hömke, C. Reich, D. Pietschner, G. Weidenspointner, L. Strüder, G. Hauser, H. Gorke, J. Ullrich, I. Schlichting, S. Herrmann, G. Schaller, F. Schopper, H. Soltau, K. U. Kühnel, R. Andritschke, C. D. Schröter, F. Krasniqi, M. Bott, S. Schorb, D. Rupp, M. Adolph, T. Gorkhover, H. Hirsemann, G. Potdevin, H. Graafsma, B. Nilsson, H. N. Chapman, J. Hajdu, “Single mimivirus particles intercepted and imaged with an X-ray laser,” Nature 470(7332), 78–81 (2011).
[CrossRef] [PubMed]

H. N. Chapman, A. Barty, M. J. Bogan, S. Boutet, M. Frank, S. P. Hau-Riege, S. Marchesini, B. W. Woods, S. Bajt, W. H. Benner, R. A. London, E. Plönjes, M. Kuhlmann, R. Treusch, S. Düsterer, T. Tschentscher, J. R. Schneider, E. Spiller, T. Möller, C. Bostedt, M. Hoener, D. A. Shapiro, K. O. Hodgson, D. van der Spoel, F. Burmeister, M. Bergh, C. Caleman, G. Huldt, M. M. Seibert, F. R. N. C. Maia, R. W. Lee, A. Szöke, N. Timneanu, J. Hajdu, “Femtosecond diffractive imaging with a soft-X-ray free-electron laser,” Nat. Phys. 2(12), 839–843 (2006).
[CrossRef]

Hoener, M.

H. N. Chapman, A. Barty, M. J. Bogan, S. Boutet, M. Frank, S. P. Hau-Riege, S. Marchesini, B. W. Woods, S. Bajt, W. H. Benner, R. A. London, E. Plönjes, M. Kuhlmann, R. Treusch, S. Düsterer, T. Tschentscher, J. R. Schneider, E. Spiller, T. Möller, C. Bostedt, M. Hoener, D. A. Shapiro, K. O. Hodgson, D. van der Spoel, F. Burmeister, M. Bergh, C. Caleman, G. Huldt, M. M. Seibert, F. R. N. C. Maia, R. W. Lee, A. Szöke, N. Timneanu, J. Hajdu, “Femtosecond diffractive imaging with a soft-X-ray free-electron laser,” Nat. Phys. 2(12), 839–843 (2006).
[CrossRef]

Holl, P.

M. M. Seibert, T. Ekeberg, F. R. N. C. Maia, M. Svenda, J. Andreasson, O. Jönsson, D. Odić, B. Iwan, A. Rocker, D. Westphal, M. Hantke, D. P. DePonte, A. Barty, J. Schulz, L. Gumprecht, N. Coppola, A. Aquila, M. Liang, T. A. White, A. Martin, C. Caleman, S. Stern, C. Abergel, V. Seltzer, J. M. Claverie, C. Bostedt, J. D. Bozek, S. Boutet, A. A. Miahnahri, M. Messerschmidt, J. Krzywinski, G. Williams, K. O. Hodgson, M. J. Bogan, C. Y. Hampton, R. G. Sierra, D. Starodub, I. Andersson, S. Bajt, M. Barthelmess, J. C. H. Spence, P. Fromme, U. Weierstall, R. Kirian, M. Hunter, R. B. Doak, S. Marchesini, S. P. Hau-Riege, M. Frank, R. L. Shoeman, L. Lomb, S. W. Epp, R. Hartmann, D. Rolles, A. Rudenko, C. Schmidt, L. Foucar, N. Kimmel, P. Holl, B. Rudek, B. Erk, A. Hömke, C. Reich, D. Pietschner, G. Weidenspointner, L. Strüder, G. Hauser, H. Gorke, J. Ullrich, I. Schlichting, S. Herrmann, G. Schaller, F. Schopper, H. Soltau, K. U. Kühnel, R. Andritschke, C. D. Schröter, F. Krasniqi, M. Bott, S. Schorb, D. Rupp, M. Adolph, T. Gorkhover, H. Hirsemann, G. Potdevin, H. Graafsma, B. Nilsson, H. N. Chapman, J. Hajdu, “Single mimivirus particles intercepted and imaged with an X-ray laser,” Nature 470(7332), 78–81 (2011).
[CrossRef] [PubMed]

C. H. Yoon, P. Schwander, C. Abergel, I. Andersson, J. Andreasson, A. Aquila, S. Bajt, M. Barthelmess, A. Barty, M. J. Bogan, C. Bostedt, J. Bozek, H. N. Chapman, J. M. Claverie, N. Coppola, D. P. DePonte, T. Ekeberg, S. W. Epp, B. Erk, H. Fleckenstein, L. Foucar, H. Graafsma, L. Gumprecht, J. Hajdu, C. Y. Hampton, A. Hartmann, E. Hartmann, R. Hartmann, G. Hauser, H. Hirsemann, P. Holl, S. Kassemeyer, N. Kimmel, M. Kiskinova, M. Liang, N. T. D. Loh, L. Lomb, F. R. N. C. Maia, A. V. Martin, K. Nass, E. Pedersoli, C. Reich, D. Rolles, B. Rudek, A. Rudenko, I. Schlichting, J. Schulz, M. Seibert, V. Seltzer, R. L. Shoeman, R. G. Sierra, H. Soltau, D. Starodub, J. Steinbrener, G. Stier, L. Strüder, M. Svenda, J. Ullrich, G. Weidenspointner, T. A. White, C. Wunderer, A. Ourmazd, “Unsupervised classification of single-particle X-ray diffraction snapshots by spectral clustering,” Opt. Express 19(17), 16542–16549 (2011).
[CrossRef] [PubMed]

Hömke, A.

M. M. Seibert, T. Ekeberg, F. R. N. C. Maia, M. Svenda, J. Andreasson, O. Jönsson, D. Odić, B. Iwan, A. Rocker, D. Westphal, M. Hantke, D. P. DePonte, A. Barty, J. Schulz, L. Gumprecht, N. Coppola, A. Aquila, M. Liang, T. A. White, A. Martin, C. Caleman, S. Stern, C. Abergel, V. Seltzer, J. M. Claverie, C. Bostedt, J. D. Bozek, S. Boutet, A. A. Miahnahri, M. Messerschmidt, J. Krzywinski, G. Williams, K. O. Hodgson, M. J. Bogan, C. Y. Hampton, R. G. Sierra, D. Starodub, I. Andersson, S. Bajt, M. Barthelmess, J. C. H. Spence, P. Fromme, U. Weierstall, R. Kirian, M. Hunter, R. B. Doak, S. Marchesini, S. P. Hau-Riege, M. Frank, R. L. Shoeman, L. Lomb, S. W. Epp, R. Hartmann, D. Rolles, A. Rudenko, C. Schmidt, L. Foucar, N. Kimmel, P. Holl, B. Rudek, B. Erk, A. Hömke, C. Reich, D. Pietschner, G. Weidenspointner, L. Strüder, G. Hauser, H. Gorke, J. Ullrich, I. Schlichting, S. Herrmann, G. Schaller, F. Schopper, H. Soltau, K. U. Kühnel, R. Andritschke, C. D. Schröter, F. Krasniqi, M. Bott, S. Schorb, D. Rupp, M. Adolph, T. Gorkhover, H. Hirsemann, G. Potdevin, H. Graafsma, B. Nilsson, H. N. Chapman, J. Hajdu, “Single mimivirus particles intercepted and imaged with an X-ray laser,” Nature 470(7332), 78–81 (2011).
[CrossRef] [PubMed]

Howells, M. R.

H. N. Chapman, A. Barty, S. Marchesini, A. Noy, S. P. Hau-Riege, C. Cui, M. R. Howells, R. Rosen, H. He, J. C. H. Spence, U. Weierstall, T. Beetz, C. Jacobsen, D. Shapiro, “High-resolution ab initio three-dimensional x-ray diffraction microscopy,” J. Opt. Soc. Am. A 23(5), 1179 (2006).
[CrossRef]

S. Marchesini, H. He, H. N. Chapman, S. P. Hau-Riege, A. Noy, M. R. Howells, U. Weierstall, J. C. H. Spence, “X-ray image reconstruction from a diffraction pattern alone,” Phys. Rev. B 68(14), 140101 (2003).
[CrossRef]

I. McNulty, J. Kirz, C. Jacobsen, E. H. Anderson, M. R. Howells, D. P. Kern, “High-resolution imaging by Fourier transform X-ray holography,” Science 256(5059), 1009–1012 (1992).
[CrossRef] [PubMed]

Hromalik, M.

S. Boutet, L. Lomb, G. J. Williams, T. R. M. Barends, A. Aquila, R. B. Doak, U. Weierstall, D. P. DePonte, J. Steinbrener, R. L. Shoeman, M. Messerschmidt, A. Barty, T. A. White, S. Kassemeyer, R. A. Kirian, M. M. Seibert, P. A. Montanez, C. Kenney, R. Herbst, P. Hart, J. Pines, G. Haller, S. M. Gruner, H. T. Philipp, M. W. Tate, M. Hromalik, L. J. Koerner, N. van Bakel, J. Morse, W. Ghonsalves, D. Arnlund, M. J. Bogan, C. Caleman, R. Fromme, C. Y. Hampton, M. S. Hunter, L. C. Johansson, G. Katona, C. Kupitz, M. Liang, A. V. Martin, K. Nass, L. Redecke, F. Stellato, N. Timneanu, D. Wang, N. A. Zatsepin, D. Schafer, J. Defever, R. Neutze, P. Fromme, J. C. H. Spence, H. N. Chapman, I. Schlichting, “High-resolution protein structure determination by serial femtosecond crystallography,” Science 337(6092), 362–364 (2012).
[CrossRef] [PubMed]

Huldt, G.

H. N. Chapman, A. Barty, M. J. Bogan, S. Boutet, M. Frank, S. P. Hau-Riege, S. Marchesini, B. W. Woods, S. Bajt, W. H. Benner, R. A. London, E. Plönjes, M. Kuhlmann, R. Treusch, S. Düsterer, T. Tschentscher, J. R. Schneider, E. Spiller, T. Möller, C. Bostedt, M. Hoener, D. A. Shapiro, K. O. Hodgson, D. van der Spoel, F. Burmeister, M. Bergh, C. Caleman, G. Huldt, M. M. Seibert, F. R. N. C. Maia, R. W. Lee, A. Szöke, N. Timneanu, J. Hajdu, “Femtosecond diffractive imaging with a soft-X-ray free-electron laser,” Nat. Phys. 2(12), 839–843 (2006).
[CrossRef]

Hunter, M.

M. M. Seibert, T. Ekeberg, F. R. N. C. Maia, M. Svenda, J. Andreasson, O. Jönsson, D. Odić, B. Iwan, A. Rocker, D. Westphal, M. Hantke, D. P. DePonte, A. Barty, J. Schulz, L. Gumprecht, N. Coppola, A. Aquila, M. Liang, T. A. White, A. Martin, C. Caleman, S. Stern, C. Abergel, V. Seltzer, J. M. Claverie, C. Bostedt, J. D. Bozek, S. Boutet, A. A. Miahnahri, M. Messerschmidt, J. Krzywinski, G. Williams, K. O. Hodgson, M. J. Bogan, C. Y. Hampton, R. G. Sierra, D. Starodub, I. Andersson, S. Bajt, M. Barthelmess, J. C. H. Spence, P. Fromme, U. Weierstall, R. Kirian, M. Hunter, R. B. Doak, S. Marchesini, S. P. Hau-Riege, M. Frank, R. L. Shoeman, L. Lomb, S. W. Epp, R. Hartmann, D. Rolles, A. Rudenko, C. Schmidt, L. Foucar, N. Kimmel, P. Holl, B. Rudek, B. Erk, A. Hömke, C. Reich, D. Pietschner, G. Weidenspointner, L. Strüder, G. Hauser, H. Gorke, J. Ullrich, I. Schlichting, S. Herrmann, G. Schaller, F. Schopper, H. Soltau, K. U. Kühnel, R. Andritschke, C. D. Schröter, F. Krasniqi, M. Bott, S. Schorb, D. Rupp, M. Adolph, T. Gorkhover, H. Hirsemann, G. Potdevin, H. Graafsma, B. Nilsson, H. N. Chapman, J. Hajdu, “Single mimivirus particles intercepted and imaged with an X-ray laser,” Nature 470(7332), 78–81 (2011).
[CrossRef] [PubMed]

Hunter, M. S.

L. Redecke, K. Nass, D. P. DePonte, T. A. White, D. Rehders, A. Barty, F. Stellato, M. Liang, T. R. M. Barends, S. Boutet, G. J. Williams, M. Messerschmidt, M. M. Seibert, A. Aquila, D. Arnlund, S. Bajt, T. Barth, M. J. Bogan, C. Caleman, T. C. Chao, R. B. Doak, H. Fleckenstein, M. Frank, R. Fromme, L. Galli, I. Grotjohann, M. S. Hunter, L. C. Johansson, S. Kassemeyer, G. Katona, R. A. Kirian, R. Koopmann, C. Kupitz, L. Lomb, A. V. Martin, S. Mogk, R. Neutze, R. L. Shoeman, J. Steinbrener, N. Timneanu, D. Wang, U. Weierstall, N. A. Zatsepin, J. C. H. Spence, P. Fromme, I. Schlichting, M. Duszenko, C. Betzel, H. N. Chapman, “Natively inhibited Trypanosoma brucei Cathepsin B structure determined by using an X-ray laser,” Science 339(6116), 227–230 (2013).
[CrossRef] [PubMed]

S. Boutet, L. Lomb, G. J. Williams, T. R. M. Barends, A. Aquila, R. B. Doak, U. Weierstall, D. P. DePonte, J. Steinbrener, R. L. Shoeman, M. Messerschmidt, A. Barty, T. A. White, S. Kassemeyer, R. A. Kirian, M. M. Seibert, P. A. Montanez, C. Kenney, R. Herbst, P. Hart, J. Pines, G. Haller, S. M. Gruner, H. T. Philipp, M. W. Tate, M. Hromalik, L. J. Koerner, N. van Bakel, J. Morse, W. Ghonsalves, D. Arnlund, M. J. Bogan, C. Caleman, R. Fromme, C. Y. Hampton, M. S. Hunter, L. C. Johansson, G. Katona, C. Kupitz, M. Liang, A. V. Martin, K. Nass, L. Redecke, F. Stellato, N. Timneanu, D. Wang, N. A. Zatsepin, D. Schafer, J. Defever, R. Neutze, P. Fromme, J. C. H. Spence, H. N. Chapman, I. Schlichting, “High-resolution protein structure determination by serial femtosecond crystallography,” Science 337(6092), 362–364 (2012).
[CrossRef] [PubMed]

Ivanov, R.

E. Allaria, R. Appio, L. Badano, W. A. Barletta, S. Bassanese, S. G. Biedron, A. Borga, E. Busetto, D. Castronovo, P. Cinquegrana, S. Cleva, D. Cocco, M. Cornacchia, P. Craievich, I. Cudin, G. D’Auria, M. Dal Forno, M. B. Danailov, R. De Monte, G. De Ninno, P. Delgiusto, A. Demidovich, S. Di Mitri, B. Diviacco, A. Fabris, R. Fabris, W. Fawley, M. Ferianis, E. Ferrari, S. Ferry, L. Froehlich, P. Furlan, G. Gaio, F. Gelmetti, L. Giannessi, M. Giannini, R. Gobessi, R. Ivanov, E. Karantzoulis, M. Lonza, A. Lutman, B. Mahieu, M. Milloch, S. V. Milton, M. Musardo, I. Nikolov, S. Noe, F. Parmigiani, G. Penco, M. Petronio, L. Pivetta, M. Predonzani, F. Rossi, L. Rumiz, A. Salom, C. Scafuri, C. Serpico, P. Sigalotti, S. Spampinati, C. Spezzani, M. Svandrlik, C. Svetina, S. Tazzari, M. Trovo, R. Umer, A. Vascotto, M. Veronese, R. Visintini, M. Zaccaria, D. Zangrando, M. Zangrando, “Highly coherent and stable pulses from the FERMI seeded free-electron laser in the extreme ultraviolet,” Nat. Photonics 6(10), 699–704 (2012).
[CrossRef]

Iwan, B.

M. M. Seibert, T. Ekeberg, F. R. N. C. Maia, M. Svenda, J. Andreasson, O. Jönsson, D. Odić, B. Iwan, A. Rocker, D. Westphal, M. Hantke, D. P. DePonte, A. Barty, J. Schulz, L. Gumprecht, N. Coppola, A. Aquila, M. Liang, T. A. White, A. Martin, C. Caleman, S. Stern, C. Abergel, V. Seltzer, J. M. Claverie, C. Bostedt, J. D. Bozek, S. Boutet, A. A. Miahnahri, M. Messerschmidt, J. Krzywinski, G. Williams, K. O. Hodgson, M. J. Bogan, C. Y. Hampton, R. G. Sierra, D. Starodub, I. Andersson, S. Bajt, M. Barthelmess, J. C. H. Spence, P. Fromme, U. Weierstall, R. Kirian, M. Hunter, R. B. Doak, S. Marchesini, S. P. Hau-Riege, M. Frank, R. L. Shoeman, L. Lomb, S. W. Epp, R. Hartmann, D. Rolles, A. Rudenko, C. Schmidt, L. Foucar, N. Kimmel, P. Holl, B. Rudek, B. Erk, A. Hömke, C. Reich, D. Pietschner, G. Weidenspointner, L. Strüder, G. Hauser, H. Gorke, J. Ullrich, I. Schlichting, S. Herrmann, G. Schaller, F. Schopper, H. Soltau, K. U. Kühnel, R. Andritschke, C. D. Schröter, F. Krasniqi, M. Bott, S. Schorb, D. Rupp, M. Adolph, T. Gorkhover, H. Hirsemann, G. Potdevin, H. Graafsma, B. Nilsson, H. N. Chapman, J. Hajdu, “Single mimivirus particles intercepted and imaged with an X-ray laser,” Nature 470(7332), 78–81 (2011).
[CrossRef] [PubMed]

Jacobsen, C.

Johansson, L. C.

L. Redecke, K. Nass, D. P. DePonte, T. A. White, D. Rehders, A. Barty, F. Stellato, M. Liang, T. R. M. Barends, S. Boutet, G. J. Williams, M. Messerschmidt, M. M. Seibert, A. Aquila, D. Arnlund, S. Bajt, T. Barth, M. J. Bogan, C. Caleman, T. C. Chao, R. B. Doak, H. Fleckenstein, M. Frank, R. Fromme, L. Galli, I. Grotjohann, M. S. Hunter, L. C. Johansson, S. Kassemeyer, G. Katona, R. A. Kirian, R. Koopmann, C. Kupitz, L. Lomb, A. V. Martin, S. Mogk, R. Neutze, R. L. Shoeman, J. Steinbrener, N. Timneanu, D. Wang, U. Weierstall, N. A. Zatsepin, J. C. H. Spence, P. Fromme, I. Schlichting, M. Duszenko, C. Betzel, H. N. Chapman, “Natively inhibited Trypanosoma brucei Cathepsin B structure determined by using an X-ray laser,” Science 339(6116), 227–230 (2013).
[CrossRef] [PubMed]

S. Boutet, L. Lomb, G. J. Williams, T. R. M. Barends, A. Aquila, R. B. Doak, U. Weierstall, D. P. DePonte, J. Steinbrener, R. L. Shoeman, M. Messerschmidt, A. Barty, T. A. White, S. Kassemeyer, R. A. Kirian, M. M. Seibert, P. A. Montanez, C. Kenney, R. Herbst, P. Hart, J. Pines, G. Haller, S. M. Gruner, H. T. Philipp, M. W. Tate, M. Hromalik, L. J. Koerner, N. van Bakel, J. Morse, W. Ghonsalves, D. Arnlund, M. J. Bogan, C. Caleman, R. Fromme, C. Y. Hampton, M. S. Hunter, L. C. Johansson, G. Katona, C. Kupitz, M. Liang, A. V. Martin, K. Nass, L. Redecke, F. Stellato, N. Timneanu, D. Wang, N. A. Zatsepin, D. Schafer, J. Defever, R. Neutze, P. Fromme, J. C. H. Spence, H. N. Chapman, I. Schlichting, “High-resolution protein structure determination by serial femtosecond crystallography,” Science 337(6092), 362–364 (2012).
[CrossRef] [PubMed]

Jönsson, O.

M. M. Seibert, T. Ekeberg, F. R. N. C. Maia, M. Svenda, J. Andreasson, O. Jönsson, D. Odić, B. Iwan, A. Rocker, D. Westphal, M. Hantke, D. P. DePonte, A. Barty, J. Schulz, L. Gumprecht, N. Coppola, A. Aquila, M. Liang, T. A. White, A. Martin, C. Caleman, S. Stern, C. Abergel, V. Seltzer, J. M. Claverie, C. Bostedt, J. D. Bozek, S. Boutet, A. A. Miahnahri, M. Messerschmidt, J. Krzywinski, G. Williams, K. O. Hodgson, M. J. Bogan, C. Y. Hampton, R. G. Sierra, D. Starodub, I. Andersson, S. Bajt, M. Barthelmess, J. C. H. Spence, P. Fromme, U. Weierstall, R. Kirian, M. Hunter, R. B. Doak, S. Marchesini, S. P. Hau-Riege, M. Frank, R. L. Shoeman, L. Lomb, S. W. Epp, R. Hartmann, D. Rolles, A. Rudenko, C. Schmidt, L. Foucar, N. Kimmel, P. Holl, B. Rudek, B. Erk, A. Hömke, C. Reich, D. Pietschner, G. Weidenspointner, L. Strüder, G. Hauser, H. Gorke, J. Ullrich, I. Schlichting, S. Herrmann, G. Schaller, F. Schopper, H. Soltau, K. U. Kühnel, R. Andritschke, C. D. Schröter, F. Krasniqi, M. Bott, S. Schorb, D. Rupp, M. Adolph, T. Gorkhover, H. Hirsemann, G. Potdevin, H. Graafsma, B. Nilsson, H. N. Chapman, J. Hajdu, “Single mimivirus particles intercepted and imaged with an X-ray laser,” Nature 470(7332), 78–81 (2011).
[CrossRef] [PubMed]

Karantzoulis, E.

E. Allaria, R. Appio, L. Badano, W. A. Barletta, S. Bassanese, S. G. Biedron, A. Borga, E. Busetto, D. Castronovo, P. Cinquegrana, S. Cleva, D. Cocco, M. Cornacchia, P. Craievich, I. Cudin, G. D’Auria, M. Dal Forno, M. B. Danailov, R. De Monte, G. De Ninno, P. Delgiusto, A. Demidovich, S. Di Mitri, B. Diviacco, A. Fabris, R. Fabris, W. Fawley, M. Ferianis, E. Ferrari, S. Ferry, L. Froehlich, P. Furlan, G. Gaio, F. Gelmetti, L. Giannessi, M. Giannini, R. Gobessi, R. Ivanov, E. Karantzoulis, M. Lonza, A. Lutman, B. Mahieu, M. Milloch, S. V. Milton, M. Musardo, I. Nikolov, S. Noe, F. Parmigiani, G. Penco, M. Petronio, L. Pivetta, M. Predonzani, F. Rossi, L. Rumiz, A. Salom, C. Scafuri, C. Serpico, P. Sigalotti, S. Spampinati, C. Spezzani, M. Svandrlik, C. Svetina, S. Tazzari, M. Trovo, R. Umer, A. Vascotto, M. Veronese, R. Visintini, M. Zaccaria, D. Zangrando, M. Zangrando, “Highly coherent and stable pulses from the FERMI seeded free-electron laser in the extreme ultraviolet,” Nat. Photonics 6(10), 699–704 (2012).
[CrossRef]

Kassemeyer, S.

L. Redecke, K. Nass, D. P. DePonte, T. A. White, D. Rehders, A. Barty, F. Stellato, M. Liang, T. R. M. Barends, S. Boutet, G. J. Williams, M. Messerschmidt, M. M. Seibert, A. Aquila, D. Arnlund, S. Bajt, T. Barth, M. J. Bogan, C. Caleman, T. C. Chao, R. B. Doak, H. Fleckenstein, M. Frank, R. Fromme, L. Galli, I. Grotjohann, M. S. Hunter, L. C. Johansson, S. Kassemeyer, G. Katona, R. A. Kirian, R. Koopmann, C. Kupitz, L. Lomb, A. V. Martin, S. Mogk, R. Neutze, R. L. Shoeman, J. Steinbrener, N. Timneanu, D. Wang, U. Weierstall, N. A. Zatsepin, J. C. H. Spence, P. Fromme, I. Schlichting, M. Duszenko, C. Betzel, H. N. Chapman, “Natively inhibited Trypanosoma brucei Cathepsin B structure determined by using an X-ray laser,” Science 339(6116), 227–230 (2013).
[CrossRef] [PubMed]

S. Boutet, L. Lomb, G. J. Williams, T. R. M. Barends, A. Aquila, R. B. Doak, U. Weierstall, D. P. DePonte, J. Steinbrener, R. L. Shoeman, M. Messerschmidt, A. Barty, T. A. White, S. Kassemeyer, R. A. Kirian, M. M. Seibert, P. A. Montanez, C. Kenney, R. Herbst, P. Hart, J. Pines, G. Haller, S. M. Gruner, H. T. Philipp, M. W. Tate, M. Hromalik, L. J. Koerner, N. van Bakel, J. Morse, W. Ghonsalves, D. Arnlund, M. J. Bogan, C. Caleman, R. Fromme, C. Y. Hampton, M. S. Hunter, L. C. Johansson, G. Katona, C. Kupitz, M. Liang, A. V. Martin, K. Nass, L. Redecke, F. Stellato, N. Timneanu, D. Wang, N. A. Zatsepin, D. Schafer, J. Defever, R. Neutze, P. Fromme, J. C. H. Spence, H. N. Chapman, I. Schlichting, “High-resolution protein structure determination by serial femtosecond crystallography,” Science 337(6092), 362–364 (2012).
[CrossRef] [PubMed]

C. H. Yoon, P. Schwander, C. Abergel, I. Andersson, J. Andreasson, A. Aquila, S. Bajt, M. Barthelmess, A. Barty, M. J. Bogan, C. Bostedt, J. Bozek, H. N. Chapman, J. M. Claverie, N. Coppola, D. P. DePonte, T. Ekeberg, S. W. Epp, B. Erk, H. Fleckenstein, L. Foucar, H. Graafsma, L. Gumprecht, J. Hajdu, C. Y. Hampton, A. Hartmann, E. Hartmann, R. Hartmann, G. Hauser, H. Hirsemann, P. Holl, S. Kassemeyer, N. Kimmel, M. Kiskinova, M. Liang, N. T. D. Loh, L. Lomb, F. R. N. C. Maia, A. V. Martin, K. Nass, E. Pedersoli, C. Reich, D. Rolles, B. Rudek, A. Rudenko, I. Schlichting, J. Schulz, M. Seibert, V. Seltzer, R. L. Shoeman, R. G. Sierra, H. Soltau, D. Starodub, J. Steinbrener, G. Stier, L. Strüder, M. Svenda, J. Ullrich, G. Weidenspointner, T. A. White, C. Wunderer, A. Ourmazd, “Unsupervised classification of single-particle X-ray diffraction snapshots by spectral clustering,” Opt. Express 19(17), 16542–16549 (2011).
[CrossRef] [PubMed]

Katona, G.

L. Redecke, K. Nass, D. P. DePonte, T. A. White, D. Rehders, A. Barty, F. Stellato, M. Liang, T. R. M. Barends, S. Boutet, G. J. Williams, M. Messerschmidt, M. M. Seibert, A. Aquila, D. Arnlund, S. Bajt, T. Barth, M. J. Bogan, C. Caleman, T. C. Chao, R. B. Doak, H. Fleckenstein, M. Frank, R. Fromme, L. Galli, I. Grotjohann, M. S. Hunter, L. C. Johansson, S. Kassemeyer, G. Katona, R. A. Kirian, R. Koopmann, C. Kupitz, L. Lomb, A. V. Martin, S. Mogk, R. Neutze, R. L. Shoeman, J. Steinbrener, N. Timneanu, D. Wang, U. Weierstall, N. A. Zatsepin, J. C. H. Spence, P. Fromme, I. Schlichting, M. Duszenko, C. Betzel, H. N. Chapman, “Natively inhibited Trypanosoma brucei Cathepsin B structure determined by using an X-ray laser,” Science 339(6116), 227–230 (2013).
[CrossRef] [PubMed]

S. Boutet, L. Lomb, G. J. Williams, T. R. M. Barends, A. Aquila, R. B. Doak, U. Weierstall, D. P. DePonte, J. Steinbrener, R. L. Shoeman, M. Messerschmidt, A. Barty, T. A. White, S. Kassemeyer, R. A. Kirian, M. M. Seibert, P. A. Montanez, C. Kenney, R. Herbst, P. Hart, J. Pines, G. Haller, S. M. Gruner, H. T. Philipp, M. W. Tate, M. Hromalik, L. J. Koerner, N. van Bakel, J. Morse, W. Ghonsalves, D. Arnlund, M. J. Bogan, C. Caleman, R. Fromme, C. Y. Hampton, M. S. Hunter, L. C. Johansson, G. Katona, C. Kupitz, M. Liang, A. V. Martin, K. Nass, L. Redecke, F. Stellato, N. Timneanu, D. Wang, N. A. Zatsepin, D. Schafer, J. Defever, R. Neutze, P. Fromme, J. C. H. Spence, H. N. Chapman, I. Schlichting, “High-resolution protein structure determination by serial femtosecond crystallography,” Science 337(6092), 362–364 (2012).
[CrossRef] [PubMed]

Kenney, C.

S. Boutet, L. Lomb, G. J. Williams, T. R. M. Barends, A. Aquila, R. B. Doak, U. Weierstall, D. P. DePonte, J. Steinbrener, R. L. Shoeman, M. Messerschmidt, A. Barty, T. A. White, S. Kassemeyer, R. A. Kirian, M. M. Seibert, P. A. Montanez, C. Kenney, R. Herbst, P. Hart, J. Pines, G. Haller, S. M. Gruner, H. T. Philipp, M. W. Tate, M. Hromalik, L. J. Koerner, N. van Bakel, J. Morse, W. Ghonsalves, D. Arnlund, M. J. Bogan, C. Caleman, R. Fromme, C. Y. Hampton, M. S. Hunter, L. C. Johansson, G. Katona, C. Kupitz, M. Liang, A. V. Martin, K. Nass, L. Redecke, F. Stellato, N. Timneanu, D. Wang, N. A. Zatsepin, D. Schafer, J. Defever, R. Neutze, P. Fromme, J. C. H. Spence, H. N. Chapman, I. Schlichting, “High-resolution protein structure determination by serial femtosecond crystallography,” Science 337(6092), 362–364 (2012).
[CrossRef] [PubMed]

Kern, D. P.

I. McNulty, J. Kirz, C. Jacobsen, E. H. Anderson, M. R. Howells, D. P. Kern, “High-resolution imaging by Fourier transform X-ray holography,” Science 256(5059), 1009–1012 (1992).
[CrossRef] [PubMed]

Kern, J.

J. Kern, R. Alonso-Mori, R. Tran, J. Hattne, R. J. Gildea, N. Echols, C. Glöckner, J. Hellmich, H. Laksmono, R. G. Sierra, B. Lassalle-Kaiser, S. Koroidov, A. Lampe, G. Han, S. Gul, D. Difiore, D. Milathianaki, A. R. Fry, A. Miahnahri, D. W. Schafer, M. Messerschmidt, M. M. Seibert, J. E. Koglin, D. Sokaras, T. C. Weng, J. Sellberg, M. J. Latimer, R. W. Grosse-Kunstleve, P. H. Zwart, W. E. White, P. Glatzel, P. D. Adams, M. J. Bogan, G. J. Williams, S. Boutet, J. Messinger, A. Zouni, N. K. Sauter, V. K. Yachandra, U. Bergmann, J. Yano, “Simultaneous femtosecond X-ray spectroscopy and diffraction of photosystem II at room temperature,” Science 340(6131), 491–495 (2013).
[CrossRef] [PubMed]

Kimmel, M.

P. A. Penczek, M. Kimmel, C. M. T. Spahn, “Identifying conformational states of macromolecules by eigen-analysis of resampled cryo-EM images,” Structure 19(11), 1582–1590 (2011).
[CrossRef] [PubMed]

Kimmel, N.

M. M. Seibert, T. Ekeberg, F. R. N. C. Maia, M. Svenda, J. Andreasson, O. Jönsson, D. Odić, B. Iwan, A. Rocker, D. Westphal, M. Hantke, D. P. DePonte, A. Barty, J. Schulz, L. Gumprecht, N. Coppola, A. Aquila, M. Liang, T. A. White, A. Martin, C. Caleman, S. Stern, C. Abergel, V. Seltzer, J. M. Claverie, C. Bostedt, J. D. Bozek, S. Boutet, A. A. Miahnahri, M. Messerschmidt, J. Krzywinski, G. Williams, K. O. Hodgson, M. J. Bogan, C. Y. Hampton, R. G. Sierra, D. Starodub, I. Andersson, S. Bajt, M. Barthelmess, J. C. H. Spence, P. Fromme, U. Weierstall, R. Kirian, M. Hunter, R. B. Doak, S. Marchesini, S. P. Hau-Riege, M. Frank, R. L. Shoeman, L. Lomb, S. W. Epp, R. Hartmann, D. Rolles, A. Rudenko, C. Schmidt, L. Foucar, N. Kimmel, P. Holl, B. Rudek, B. Erk, A. Hömke, C. Reich, D. Pietschner, G. Weidenspointner, L. Strüder, G. Hauser, H. Gorke, J. Ullrich, I. Schlichting, S. Herrmann, G. Schaller, F. Schopper, H. Soltau, K. U. Kühnel, R. Andritschke, C. D. Schröter, F. Krasniqi, M. Bott, S. Schorb, D. Rupp, M. Adolph, T. Gorkhover, H. Hirsemann, G. Potdevin, H. Graafsma, B. Nilsson, H. N. Chapman, J. Hajdu, “Single mimivirus particles intercepted and imaged with an X-ray laser,” Nature 470(7332), 78–81 (2011).
[CrossRef] [PubMed]

C. H. Yoon, P. Schwander, C. Abergel, I. Andersson, J. Andreasson, A. Aquila, S. Bajt, M. Barthelmess, A. Barty, M. J. Bogan, C. Bostedt, J. Bozek, H. N. Chapman, J. M. Claverie, N. Coppola, D. P. DePonte, T. Ekeberg, S. W. Epp, B. Erk, H. Fleckenstein, L. Foucar, H. Graafsma, L. Gumprecht, J. Hajdu, C. Y. Hampton, A. Hartmann, E. Hartmann, R. Hartmann, G. Hauser, H. Hirsemann, P. Holl, S. Kassemeyer, N. Kimmel, M. Kiskinova, M. Liang, N. T. D. Loh, L. Lomb, F. R. N. C. Maia, A. V. Martin, K. Nass, E. Pedersoli, C. Reich, D. Rolles, B. Rudek, A. Rudenko, I. Schlichting, J. Schulz, M. Seibert, V. Seltzer, R. L. Shoeman, R. G. Sierra, H. Soltau, D. Starodub, J. Steinbrener, G. Stier, L. Strüder, M. Svenda, J. Ullrich, G. Weidenspointner, T. A. White, C. Wunderer, A. Ourmazd, “Unsupervised classification of single-particle X-ray diffraction snapshots by spectral clustering,” Opt. Express 19(17), 16542–16549 (2011).
[CrossRef] [PubMed]

Kirian, R.

M. M. Seibert, T. Ekeberg, F. R. N. C. Maia, M. Svenda, J. Andreasson, O. Jönsson, D. Odić, B. Iwan, A. Rocker, D. Westphal, M. Hantke, D. P. DePonte, A. Barty, J. Schulz, L. Gumprecht, N. Coppola, A. Aquila, M. Liang, T. A. White, A. Martin, C. Caleman, S. Stern, C. Abergel, V. Seltzer, J. M. Claverie, C. Bostedt, J. D. Bozek, S. Boutet, A. A. Miahnahri, M. Messerschmidt, J. Krzywinski, G. Williams, K. O. Hodgson, M. J. Bogan, C. Y. Hampton, R. G. Sierra, D. Starodub, I. Andersson, S. Bajt, M. Barthelmess, J. C. H. Spence, P. Fromme, U. Weierstall, R. Kirian, M. Hunter, R. B. Doak, S. Marchesini, S. P. Hau-Riege, M. Frank, R. L. Shoeman, L. Lomb, S. W. Epp, R. Hartmann, D. Rolles, A. Rudenko, C. Schmidt, L. Foucar, N. Kimmel, P. Holl, B. Rudek, B. Erk, A. Hömke, C. Reich, D. Pietschner, G. Weidenspointner, L. Strüder, G. Hauser, H. Gorke, J. Ullrich, I. Schlichting, S. Herrmann, G. Schaller, F. Schopper, H. Soltau, K. U. Kühnel, R. Andritschke, C. D. Schröter, F. Krasniqi, M. Bott, S. Schorb, D. Rupp, M. Adolph, T. Gorkhover, H. Hirsemann, G. Potdevin, H. Graafsma, B. Nilsson, H. N. Chapman, J. Hajdu, “Single mimivirus particles intercepted and imaged with an X-ray laser,” Nature 470(7332), 78–81 (2011).
[CrossRef] [PubMed]

Kirian, R. A.

L. Redecke, K. Nass, D. P. DePonte, T. A. White, D. Rehders, A. Barty, F. Stellato, M. Liang, T. R. M. Barends, S. Boutet, G. J. Williams, M. Messerschmidt, M. M. Seibert, A. Aquila, D. Arnlund, S. Bajt, T. Barth, M. J. Bogan, C. Caleman, T. C. Chao, R. B. Doak, H. Fleckenstein, M. Frank, R. Fromme, L. Galli, I. Grotjohann, M. S. Hunter, L. C. Johansson, S. Kassemeyer, G. Katona, R. A. Kirian, R. Koopmann, C. Kupitz, L. Lomb, A. V. Martin, S. Mogk, R. Neutze, R. L. Shoeman, J. Steinbrener, N. Timneanu, D. Wang, U. Weierstall, N. A. Zatsepin, J. C. H. Spence, P. Fromme, I. Schlichting, M. Duszenko, C. Betzel, H. N. Chapman, “Natively inhibited Trypanosoma brucei Cathepsin B structure determined by using an X-ray laser,” Science 339(6116), 227–230 (2013).
[CrossRef] [PubMed]

S. Boutet, L. Lomb, G. J. Williams, T. R. M. Barends, A. Aquila, R. B. Doak, U. Weierstall, D. P. DePonte, J. Steinbrener, R. L. Shoeman, M. Messerschmidt, A. Barty, T. A. White, S. Kassemeyer, R. A. Kirian, M. M. Seibert, P. A. Montanez, C. Kenney, R. Herbst, P. Hart, J. Pines, G. Haller, S. M. Gruner, H. T. Philipp, M. W. Tate, M. Hromalik, L. J. Koerner, N. van Bakel, J. Morse, W. Ghonsalves, D. Arnlund, M. J. Bogan, C. Caleman, R. Fromme, C. Y. Hampton, M. S. Hunter, L. C. Johansson, G. Katona, C. Kupitz, M. Liang, A. V. Martin, K. Nass, L. Redecke, F. Stellato, N. Timneanu, D. Wang, N. A. Zatsepin, D. Schafer, J. Defever, R. Neutze, P. Fromme, J. C. H. Spence, H. N. Chapman, I. Schlichting, “High-resolution protein structure determination by serial femtosecond crystallography,” Science 337(6092), 362–364 (2012).
[CrossRef] [PubMed]

Kirz, J.

I. McNulty, J. Kirz, C. Jacobsen, E. H. Anderson, M. R. Howells, D. P. Kern, “High-resolution imaging by Fourier transform X-ray holography,” Science 256(5059), 1009–1012 (1992).
[CrossRef] [PubMed]

Kiskinova, M.

Koerner, L. J.

S. Boutet, L. Lomb, G. J. Williams, T. R. M. Barends, A. Aquila, R. B. Doak, U. Weierstall, D. P. DePonte, J. Steinbrener, R. L. Shoeman, M. Messerschmidt, A. Barty, T. A. White, S. Kassemeyer, R. A. Kirian, M. M. Seibert, P. A. Montanez, C. Kenney, R. Herbst, P. Hart, J. Pines, G. Haller, S. M. Gruner, H. T. Philipp, M. W. Tate, M. Hromalik, L. J. Koerner, N. van Bakel, J. Morse, W. Ghonsalves, D. Arnlund, M. J. Bogan, C. Caleman, R. Fromme, C. Y. Hampton, M. S. Hunter, L. C. Johansson, G. Katona, C. Kupitz, M. Liang, A. V. Martin, K. Nass, L. Redecke, F. Stellato, N. Timneanu, D. Wang, N. A. Zatsepin, D. Schafer, J. Defever, R. Neutze, P. Fromme, J. C. H. Spence, H. N. Chapman, I. Schlichting, “High-resolution protein structure determination by serial femtosecond crystallography,” Science 337(6092), 362–364 (2012).
[CrossRef] [PubMed]

Koglin, J. E.

J. Kern, R. Alonso-Mori, R. Tran, J. Hattne, R. J. Gildea, N. Echols, C. Glöckner, J. Hellmich, H. Laksmono, R. G. Sierra, B. Lassalle-Kaiser, S. Koroidov, A. Lampe, G. Han, S. Gul, D. Difiore, D. Milathianaki, A. R. Fry, A. Miahnahri, D. W. Schafer, M. Messerschmidt, M. M. Seibert, J. E. Koglin, D. Sokaras, T. C. Weng, J. Sellberg, M. J. Latimer, R. W. Grosse-Kunstleve, P. H. Zwart, W. E. White, P. Glatzel, P. D. Adams, M. J. Bogan, G. J. Williams, S. Boutet, J. Messinger, A. Zouni, N. K. Sauter, V. K. Yachandra, U. Bergmann, J. Yano, “Simultaneous femtosecond X-ray spectroscopy and diffraction of photosystem II at room temperature,” Science 340(6131), 491–495 (2013).
[CrossRef] [PubMed]

Koopmann, R.

L. Redecke, K. Nass, D. P. DePonte, T. A. White, D. Rehders, A. Barty, F. Stellato, M. Liang, T. R. M. Barends, S. Boutet, G. J. Williams, M. Messerschmidt, M. M. Seibert, A. Aquila, D. Arnlund, S. Bajt, T. Barth, M. J. Bogan, C. Caleman, T. C. Chao, R. B. Doak, H. Fleckenstein, M. Frank, R. Fromme, L. Galli, I. Grotjohann, M. S. Hunter, L. C. Johansson, S. Kassemeyer, G. Katona, R. A. Kirian, R. Koopmann, C. Kupitz, L. Lomb, A. V. Martin, S. Mogk, R. Neutze, R. L. Shoeman, J. Steinbrener, N. Timneanu, D. Wang, U. Weierstall, N. A. Zatsepin, J. C. H. Spence, P. Fromme, I. Schlichting, M. Duszenko, C. Betzel, H. N. Chapman, “Natively inhibited Trypanosoma brucei Cathepsin B structure determined by using an X-ray laser,” Science 339(6116), 227–230 (2013).
[CrossRef] [PubMed]

Koroidov, S.

J. Kern, R. Alonso-Mori, R. Tran, J. Hattne, R. J. Gildea, N. Echols, C. Glöckner, J. Hellmich, H. Laksmono, R. G. Sierra, B. Lassalle-Kaiser, S. Koroidov, A. Lampe, G. Han, S. Gul, D. Difiore, D. Milathianaki, A. R. Fry, A. Miahnahri, D. W. Schafer, M. Messerschmidt, M. M. Seibert, J. E. Koglin, D. Sokaras, T. C. Weng, J. Sellberg, M. J. Latimer, R. W. Grosse-Kunstleve, P. H. Zwart, W. E. White, P. Glatzel, P. D. Adams, M. J. Bogan, G. J. Williams, S. Boutet, J. Messinger, A. Zouni, N. K. Sauter, V. K. Yachandra, U. Bergmann, J. Yano, “Simultaneous femtosecond X-ray spectroscopy and diffraction of photosystem II at room temperature,” Science 340(6131), 491–495 (2013).
[CrossRef] [PubMed]

Krasniqi, F.

M. M. Seibert, T. Ekeberg, F. R. N. C. Maia, M. Svenda, J. Andreasson, O. Jönsson, D. Odić, B. Iwan, A. Rocker, D. Westphal, M. Hantke, D. P. DePonte, A. Barty, J. Schulz, L. Gumprecht, N. Coppola, A. Aquila, M. Liang, T. A. White, A. Martin, C. Caleman, S. Stern, C. Abergel, V. Seltzer, J. M. Claverie, C. Bostedt, J. D. Bozek, S. Boutet, A. A. Miahnahri, M. Messerschmidt, J. Krzywinski, G. Williams, K. O. Hodgson, M. J. Bogan, C. Y. Hampton, R. G. Sierra, D. Starodub, I. Andersson, S. Bajt, M. Barthelmess, J. C. H. Spence, P. Fromme, U. Weierstall, R. Kirian, M. Hunter, R. B. Doak, S. Marchesini, S. P. Hau-Riege, M. Frank, R. L. Shoeman, L. Lomb, S. W. Epp, R. Hartmann, D. Rolles, A. Rudenko, C. Schmidt, L. Foucar, N. Kimmel, P. Holl, B. Rudek, B. Erk, A. Hömke, C. Reich, D. Pietschner, G. Weidenspointner, L. Strüder, G. Hauser, H. Gorke, J. Ullrich, I. Schlichting, S. Herrmann, G. Schaller, F. Schopper, H. Soltau, K. U. Kühnel, R. Andritschke, C. D. Schröter, F. Krasniqi, M. Bott, S. Schorb, D. Rupp, M. Adolph, T. Gorkhover, H. Hirsemann, G. Potdevin, H. Graafsma, B. Nilsson, H. N. Chapman, J. Hajdu, “Single mimivirus particles intercepted and imaged with an X-ray laser,” Nature 470(7332), 78–81 (2011).
[CrossRef] [PubMed]

Krzywinski, J.

M. M. Seibert, T. Ekeberg, F. R. N. C. Maia, M. Svenda, J. Andreasson, O. Jönsson, D. Odić, B. Iwan, A. Rocker, D. Westphal, M. Hantke, D. P. DePonte, A. Barty, J. Schulz, L. Gumprecht, N. Coppola, A. Aquila, M. Liang, T. A. White, A. Martin, C. Caleman, S. Stern, C. Abergel, V. Seltzer, J. M. Claverie, C. Bostedt, J. D. Bozek, S. Boutet, A. A. Miahnahri, M. Messerschmidt, J. Krzywinski, G. Williams, K. O. Hodgson, M. J. Bogan, C. Y. Hampton, R. G. Sierra, D. Starodub, I. Andersson, S. Bajt, M. Barthelmess, J. C. H. Spence, P. Fromme, U. Weierstall, R. Kirian, M. Hunter, R. B. Doak, S. Marchesini, S. P. Hau-Riege, M. Frank, R. L. Shoeman, L. Lomb, S. W. Epp, R. Hartmann, D. Rolles, A. Rudenko, C. Schmidt, L. Foucar, N. Kimmel, P. Holl, B. Rudek, B. Erk, A. Hömke, C. Reich, D. Pietschner, G. Weidenspointner, L. Strüder, G. Hauser, H. Gorke, J. Ullrich, I. Schlichting, S. Herrmann, G. Schaller, F. Schopper, H. Soltau, K. U. Kühnel, R. Andritschke, C. D. Schröter, F. Krasniqi, M. Bott, S. Schorb, D. Rupp, M. Adolph, T. Gorkhover, H. Hirsemann, G. Potdevin, H. Graafsma, B. Nilsson, H. N. Chapman, J. Hajdu, “Single mimivirus particles intercepted and imaged with an X-ray laser,” Nature 470(7332), 78–81 (2011).
[CrossRef] [PubMed]

Kuhlmann, M.

H. N. Chapman, A. Barty, M. J. Bogan, S. Boutet, M. Frank, S. P. Hau-Riege, S. Marchesini, B. W. Woods, S. Bajt, W. H. Benner, R. A. London, E. Plönjes, M. Kuhlmann, R. Treusch, S. Düsterer, T. Tschentscher, J. R. Schneider, E. Spiller, T. Möller, C. Bostedt, M. Hoener, D. A. Shapiro, K. O. Hodgson, D. van der Spoel, F. Burmeister, M. Bergh, C. Caleman, G. Huldt, M. M. Seibert, F. R. N. C. Maia, R. W. Lee, A. Szöke, N. Timneanu, J. Hajdu, “Femtosecond diffractive imaging with a soft-X-ray free-electron laser,” Nat. Phys. 2(12), 839–843 (2006).
[CrossRef]

Kühnel, K. U.

M. M. Seibert, T. Ekeberg, F. R. N. C. Maia, M. Svenda, J. Andreasson, O. Jönsson, D. Odić, B. Iwan, A. Rocker, D. Westphal, M. Hantke, D. P. DePonte, A. Barty, J. Schulz, L. Gumprecht, N. Coppola, A. Aquila, M. Liang, T. A. White, A. Martin, C. Caleman, S. Stern, C. Abergel, V. Seltzer, J. M. Claverie, C. Bostedt, J. D. Bozek, S. Boutet, A. A. Miahnahri, M. Messerschmidt, J. Krzywinski, G. Williams, K. O. Hodgson, M. J. Bogan, C. Y. Hampton, R. G. Sierra, D. Starodub, I. Andersson, S. Bajt, M. Barthelmess, J. C. H. Spence, P. Fromme, U. Weierstall, R. Kirian, M. Hunter, R. B. Doak, S. Marchesini, S. P. Hau-Riege, M. Frank, R. L. Shoeman, L. Lomb, S. W. Epp, R. Hartmann, D. Rolles, A. Rudenko, C. Schmidt, L. Foucar, N. Kimmel, P. Holl, B. Rudek, B. Erk, A. Hömke, C. Reich, D. Pietschner, G. Weidenspointner, L. Strüder, G. Hauser, H. Gorke, J. Ullrich, I. Schlichting, S. Herrmann, G. Schaller, F. Schopper, H. Soltau, K. U. Kühnel, R. Andritschke, C. D. Schröter, F. Krasniqi, M. Bott, S. Schorb, D. Rupp, M. Adolph, T. Gorkhover, H. Hirsemann, G. Potdevin, H. Graafsma, B. Nilsson, H. N. Chapman, J. Hajdu, “Single mimivirus particles intercepted and imaged with an X-ray laser,” Nature 470(7332), 78–81 (2011).
[CrossRef] [PubMed]

Kupitz, C.

L. Redecke, K. Nass, D. P. DePonte, T. A. White, D. Rehders, A. Barty, F. Stellato, M. Liang, T. R. M. Barends, S. Boutet, G. J. Williams, M. Messerschmidt, M. M. Seibert, A. Aquila, D. Arnlund, S. Bajt, T. Barth, M. J. Bogan, C. Caleman, T. C. Chao, R. B. Doak, H. Fleckenstein, M. Frank, R. Fromme, L. Galli, I. Grotjohann, M. S. Hunter, L. C. Johansson, S. Kassemeyer, G. Katona, R. A. Kirian, R. Koopmann, C. Kupitz, L. Lomb, A. V. Martin, S. Mogk, R. Neutze, R. L. Shoeman, J. Steinbrener, N. Timneanu, D. Wang, U. Weierstall, N. A. Zatsepin, J. C. H. Spence, P. Fromme, I. Schlichting, M. Duszenko, C. Betzel, H. N. Chapman, “Natively inhibited Trypanosoma brucei Cathepsin B structure determined by using an X-ray laser,” Science 339(6116), 227–230 (2013).
[CrossRef] [PubMed]

S. Boutet, L. Lomb, G. J. Williams, T. R. M. Barends, A. Aquila, R. B. Doak, U. Weierstall, D. P. DePonte, J. Steinbrener, R. L. Shoeman, M. Messerschmidt, A. Barty, T. A. White, S. Kassemeyer, R. A. Kirian, M. M. Seibert, P. A. Montanez, C. Kenney, R. Herbst, P. Hart, J. Pines, G. Haller, S. M. Gruner, H. T. Philipp, M. W. Tate, M. Hromalik, L. J. Koerner, N. van Bakel, J. Morse, W. Ghonsalves, D. Arnlund, M. J. Bogan, C. Caleman, R. Fromme, C. Y. Hampton, M. S. Hunter, L. C. Johansson, G. Katona, C. Kupitz, M. Liang, A. V. Martin, K. Nass, L. Redecke, F. Stellato, N. Timneanu, D. Wang, N. A. Zatsepin, D. Schafer, J. Defever, R. Neutze, P. Fromme, J. C. H. Spence, H. N. Chapman, I. Schlichting, “High-resolution protein structure determination by serial femtosecond crystallography,” Science 337(6092), 362–364 (2012).
[CrossRef] [PubMed]

Laksmono, H.

J. Kern, R. Alonso-Mori, R. Tran, J. Hattne, R. J. Gildea, N. Echols, C. Glöckner, J. Hellmich, H. Laksmono, R. G. Sierra, B. Lassalle-Kaiser, S. Koroidov, A. Lampe, G. Han, S. Gul, D. Difiore, D. Milathianaki, A. R. Fry, A. Miahnahri, D. W. Schafer, M. Messerschmidt, M. M. Seibert, J. E. Koglin, D. Sokaras, T. C. Weng, J. Sellberg, M. J. Latimer, R. W. Grosse-Kunstleve, P. H. Zwart, W. E. White, P. Glatzel, P. D. Adams, M. J. Bogan, G. J. Williams, S. Boutet, J. Messinger, A. Zouni, N. K. Sauter, V. K. Yachandra, U. Bergmann, J. Yano, “Simultaneous femtosecond X-ray spectroscopy and diffraction of photosystem II at room temperature,” Science 340(6131), 491–495 (2013).
[CrossRef] [PubMed]

Lampe, A.

J. Kern, R. Alonso-Mori, R. Tran, J. Hattne, R. J. Gildea, N. Echols, C. Glöckner, J. Hellmich, H. Laksmono, R. G. Sierra, B. Lassalle-Kaiser, S. Koroidov, A. Lampe, G. Han, S. Gul, D. Difiore, D. Milathianaki, A. R. Fry, A. Miahnahri, D. W. Schafer, M. Messerschmidt, M. M. Seibert, J. E. Koglin, D. Sokaras, T. C. Weng, J. Sellberg, M. J. Latimer, R. W. Grosse-Kunstleve, P. H. Zwart, W. E. White, P. Glatzel, P. D. Adams, M. J. Bogan, G. J. Williams, S. Boutet, J. Messinger, A. Zouni, N. K. Sauter, V. K. Yachandra, U. Bergmann, J. Yano, “Simultaneous femtosecond X-ray spectroscopy and diffraction of photosystem II at room temperature,” Science 340(6131), 491–495 (2013).
[CrossRef] [PubMed]

Langford, J. C.

J. B. Tenenbaum, V. de Silva, J. C. Langford, “A global geometric framework for nonlinear dimensionality reduction,” Science 290(5500), 2319–2323 (2000).
[CrossRef] [PubMed]

Lassalle-Kaiser, B.

J. Kern, R. Alonso-Mori, R. Tran, J. Hattne, R. J. Gildea, N. Echols, C. Glöckner, J. Hellmich, H. Laksmono, R. G. Sierra, B. Lassalle-Kaiser, S. Koroidov, A. Lampe, G. Han, S. Gul, D. Difiore, D. Milathianaki, A. R. Fry, A. Miahnahri, D. W. Schafer, M. Messerschmidt, M. M. Seibert, J. E. Koglin, D. Sokaras, T. C. Weng, J. Sellberg, M. J. Latimer, R. W. Grosse-Kunstleve, P. H. Zwart, W. E. White, P. Glatzel, P. D. Adams, M. J. Bogan, G. J. Williams, S. Boutet, J. Messinger, A. Zouni, N. K. Sauter, V. K. Yachandra, U. Bergmann, J. Yano, “Simultaneous femtosecond X-ray spectroscopy and diffraction of photosystem II at room temperature,” Science 340(6131), 491–495 (2013).
[CrossRef] [PubMed]

Latimer, M. J.

J. Kern, R. Alonso-Mori, R. Tran, J. Hattne, R. J. Gildea, N. Echols, C. Glöckner, J. Hellmich, H. Laksmono, R. G. Sierra, B. Lassalle-Kaiser, S. Koroidov, A. Lampe, G. Han, S. Gul, D. Difiore, D. Milathianaki, A. R. Fry, A. Miahnahri, D. W. Schafer, M. Messerschmidt, M. M. Seibert, J. E. Koglin, D. Sokaras, T. C. Weng, J. Sellberg, M. J. Latimer, R. W. Grosse-Kunstleve, P. H. Zwart, W. E. White, P. Glatzel, P. D. Adams, M. J. Bogan, G. J. Williams, S. Boutet, J. Messinger, A. Zouni, N. K. Sauter, V. K. Yachandra, U. Bergmann, J. Yano, “Simultaneous femtosecond X-ray spectroscopy and diffraction of photosystem II at room temperature,” Science 340(6131), 491–495 (2013).
[CrossRef] [PubMed]

Lee, R. W.

H. N. Chapman, A. Barty, M. J. Bogan, S. Boutet, M. Frank, S. P. Hau-Riege, S. Marchesini, B. W. Woods, S. Bajt, W. H. Benner, R. A. London, E. Plönjes, M. Kuhlmann, R. Treusch, S. Düsterer, T. Tschentscher, J. R. Schneider, E. Spiller, T. Möller, C. Bostedt, M. Hoener, D. A. Shapiro, K. O. Hodgson, D. van der Spoel, F. Burmeister, M. Bergh, C. Caleman, G. Huldt, M. M. Seibert, F. R. N. C. Maia, R. W. Lee, A. Szöke, N. Timneanu, J. Hajdu, “Femtosecond diffractive imaging with a soft-X-ray free-electron laser,” Nat. Phys. 2(12), 839–843 (2006).
[CrossRef]

Liang, M.

L. Redecke, K. Nass, D. P. DePonte, T. A. White, D. Rehders, A. Barty, F. Stellato, M. Liang, T. R. M. Barends, S. Boutet, G. J. Williams, M. Messerschmidt, M. M. Seibert, A. Aquila, D. Arnlund, S. Bajt, T. Barth, M. J. Bogan, C. Caleman, T. C. Chao, R. B. Doak, H. Fleckenstein, M. Frank, R. Fromme, L. Galli, I. Grotjohann, M. S. Hunter, L. C. Johansson, S. Kassemeyer, G. Katona, R. A. Kirian, R. Koopmann, C. Kupitz, L. Lomb, A. V. Martin, S. Mogk, R. Neutze, R. L. Shoeman, J. Steinbrener, N. Timneanu, D. Wang, U. Weierstall, N. A. Zatsepin, J. C. H. Spence, P. Fromme, I. Schlichting, M. Duszenko, C. Betzel, H. N. Chapman, “Natively inhibited Trypanosoma brucei Cathepsin B structure determined by using an X-ray laser,” Science 339(6116), 227–230 (2013).
[CrossRef] [PubMed]

S. Boutet, L. Lomb, G. J. Williams, T. R. M. Barends, A. Aquila, R. B. Doak, U. Weierstall, D. P. DePonte, J. Steinbrener, R. L. Shoeman, M. Messerschmidt, A. Barty, T. A. White, S. Kassemeyer, R. A. Kirian, M. M. Seibert, P. A. Montanez, C. Kenney, R. Herbst, P. Hart, J. Pines, G. Haller, S. M. Gruner, H. T. Philipp, M. W. Tate, M. Hromalik, L. J. Koerner, N. van Bakel, J. Morse, W. Ghonsalves, D. Arnlund, M. J. Bogan, C. Caleman, R. Fromme, C. Y. Hampton, M. S. Hunter, L. C. Johansson, G. Katona, C. Kupitz, M. Liang, A. V. Martin, K. Nass, L. Redecke, F. Stellato, N. Timneanu, D. Wang, N. A. Zatsepin, D. Schafer, J. Defever, R. Neutze, P. Fromme, J. C. H. Spence, H. N. Chapman, I. Schlichting, “High-resolution protein structure determination by serial femtosecond crystallography,” Science 337(6092), 362–364 (2012).
[CrossRef] [PubMed]

M. M. Seibert, T. Ekeberg, F. R. N. C. Maia, M. Svenda, J. Andreasson, O. Jönsson, D. Odić, B. Iwan, A. Rocker, D. Westphal, M. Hantke, D. P. DePonte, A. Barty, J. Schulz, L. Gumprecht, N. Coppola, A. Aquila, M. Liang, T. A. White, A. Martin, C. Caleman, S. Stern, C. Abergel, V. Seltzer, J. M. Claverie, C. Bostedt, J. D. Bozek, S. Boutet, A. A. Miahnahri, M. Messerschmidt, J. Krzywinski, G. Williams, K. O. Hodgson, M. J. Bogan, C. Y. Hampton, R. G. Sierra, D. Starodub, I. Andersson, S. Bajt, M. Barthelmess, J. C. H. Spence, P. Fromme, U. Weierstall, R. Kirian, M. Hunter, R. B. Doak, S. Marchesini, S. P. Hau-Riege, M. Frank, R. L. Shoeman, L. Lomb, S. W. Epp, R. Hartmann, D. Rolles, A. Rudenko, C. Schmidt, L. Foucar, N. Kimmel, P. Holl, B. Rudek, B. Erk, A. Hömke, C. Reich, D. Pietschner, G. Weidenspointner, L. Strüder, G. Hauser, H. Gorke, J. Ullrich, I. Schlichting, S. Herrmann, G. Schaller, F. Schopper, H. Soltau, K. U. Kühnel, R. Andritschke, C. D. Schröter, F. Krasniqi, M. Bott, S. Schorb, D. Rupp, M. Adolph, T. Gorkhover, H. Hirsemann, G. Potdevin, H. Graafsma, B. Nilsson, H. N. Chapman, J. Hajdu, “Single mimivirus particles intercepted and imaged with an X-ray laser,” Nature 470(7332), 78–81 (2011).
[CrossRef] [PubMed]

C. H. Yoon, P. Schwander, C. Abergel, I. Andersson, J. Andreasson, A. Aquila, S. Bajt, M. Barthelmess, A. Barty, M. J. Bogan, C. Bostedt, J. Bozek, H. N. Chapman, J. M. Claverie, N. Coppola, D. P. DePonte, T. Ekeberg, S. W. Epp, B. Erk, H. Fleckenstein, L. Foucar, H. Graafsma, L. Gumprecht, J. Hajdu, C. Y. Hampton, A. Hartmann, E. Hartmann, R. Hartmann, G. Hauser, H. Hirsemann, P. Holl, S. Kassemeyer, N. Kimmel, M. Kiskinova, M. Liang, N. T. D. Loh, L. Lomb, F. R. N. C. Maia, A. V. Martin, K. Nass, E. Pedersoli, C. Reich, D. Rolles, B. Rudek, A. Rudenko, I. Schlichting, J. Schulz, M. Seibert, V. Seltzer, R. L. Shoeman, R. G. Sierra, H. Soltau, D. Starodub, J. Steinbrener, G. Stier, L. Strüder, M. Svenda, J. Ullrich, G. Weidenspointner, T. A. White, C. Wunderer, A. Ourmazd, “Unsupervised classification of single-particle X-ray diffraction snapshots by spectral clustering,” Opt. Express 19(17), 16542–16549 (2011).
[CrossRef] [PubMed]

Loh, N. T. D.

Lomb, L.

L. Redecke, K. Nass, D. P. DePonte, T. A. White, D. Rehders, A. Barty, F. Stellato, M. Liang, T. R. M. Barends, S. Boutet, G. J. Williams, M. Messerschmidt, M. M. Seibert, A. Aquila, D. Arnlund, S. Bajt, T. Barth, M. J. Bogan, C. Caleman, T. C. Chao, R. B. Doak, H. Fleckenstein, M. Frank, R. Fromme, L. Galli, I. Grotjohann, M. S. Hunter, L. C. Johansson, S. Kassemeyer, G. Katona, R. A. Kirian, R. Koopmann, C. Kupitz, L. Lomb, A. V. Martin, S. Mogk, R. Neutze, R. L. Shoeman, J. Steinbrener, N. Timneanu, D. Wang, U. Weierstall, N. A. Zatsepin, J. C. H. Spence, P. Fromme, I. Schlichting, M. Duszenko, C. Betzel, H. N. Chapman, “Natively inhibited Trypanosoma brucei Cathepsin B structure determined by using an X-ray laser,” Science 339(6116), 227–230 (2013).
[CrossRef] [PubMed]

S. Boutet, L. Lomb, G. J. Williams, T. R. M. Barends, A. Aquila, R. B. Doak, U. Weierstall, D. P. DePonte, J. Steinbrener, R. L. Shoeman, M. Messerschmidt, A. Barty, T. A. White, S. Kassemeyer, R. A. Kirian, M. M. Seibert, P. A. Montanez, C. Kenney, R. Herbst, P. Hart, J. Pines, G. Haller, S. M. Gruner, H. T. Philipp, M. W. Tate, M. Hromalik, L. J. Koerner, N. van Bakel, J. Morse, W. Ghonsalves, D. Arnlund, M. J. Bogan, C. Caleman, R. Fromme, C. Y. Hampton, M. S. Hunter, L. C. Johansson, G. Katona, C. Kupitz, M. Liang, A. V. Martin, K. Nass, L. Redecke, F. Stellato, N. Timneanu, D. Wang, N. A. Zatsepin, D. Schafer, J. Defever, R. Neutze, P. Fromme, J. C. H. Spence, H. N. Chapman, I. Schlichting, “High-resolution protein structure determination by serial femtosecond crystallography,” Science 337(6092), 362–364 (2012).
[CrossRef] [PubMed]

M. M. Seibert, T. Ekeberg, F. R. N. C. Maia, M. Svenda, J. Andreasson, O. Jönsson, D. Odić, B. Iwan, A. Rocker, D. Westphal, M. Hantke, D. P. DePonte, A. Barty, J. Schulz, L. Gumprecht, N. Coppola, A. Aquila, M. Liang, T. A. White, A. Martin, C. Caleman, S. Stern, C. Abergel, V. Seltzer, J. M. Claverie, C. Bostedt, J. D. Bozek, S. Boutet, A. A. Miahnahri, M. Messerschmidt, J. Krzywinski, G. Williams, K. O. Hodgson, M. J. Bogan, C. Y. Hampton, R. G. Sierra, D. Starodub, I. Andersson, S. Bajt, M. Barthelmess, J. C. H. Spence, P. Fromme, U. Weierstall, R. Kirian, M. Hunter, R. B. Doak, S. Marchesini, S. P. Hau-Riege, M. Frank, R. L. Shoeman, L. Lomb, S. W. Epp, R. Hartmann, D. Rolles, A. Rudenko, C. Schmidt, L. Foucar, N. Kimmel, P. Holl, B. Rudek, B. Erk, A. Hömke, C. Reich, D. Pietschner, G. Weidenspointner, L. Strüder, G. Hauser, H. Gorke, J. Ullrich, I. Schlichting, S. Herrmann, G. Schaller, F. Schopper, H. Soltau, K. U. Kühnel, R. Andritschke, C. D. Schröter, F. Krasniqi, M. Bott, S. Schorb, D. Rupp, M. Adolph, T. Gorkhover, H. Hirsemann, G. Potdevin, H. Graafsma, B. Nilsson, H. N. Chapman, J. Hajdu, “Single mimivirus particles intercepted and imaged with an X-ray laser,” Nature 470(7332), 78–81 (2011).
[CrossRef] [PubMed]

C. H. Yoon, P. Schwander, C. Abergel, I. Andersson, J. Andreasson, A. Aquila, S. Bajt, M. Barthelmess, A. Barty, M. J. Bogan, C. Bostedt, J. Bozek, H. N. Chapman, J. M. Claverie, N. Coppola, D. P. DePonte, T. Ekeberg, S. W. Epp, B. Erk, H. Fleckenstein, L. Foucar, H. Graafsma, L. Gumprecht, J. Hajdu, C. Y. Hampton, A. Hartmann, E. Hartmann, R. Hartmann, G. Hauser, H. Hirsemann, P. Holl, S. Kassemeyer, N. Kimmel, M. Kiskinova, M. Liang, N. T. D. Loh, L. Lomb, F. R. N. C. Maia, A. V. Martin, K. Nass, E. Pedersoli, C. Reich, D. Rolles, B. Rudek, A. Rudenko, I. Schlichting, J. Schulz, M. Seibert, V. Seltzer, R. L. Shoeman, R. G. Sierra, H. Soltau, D. Starodub, J. Steinbrener, G. Stier, L. Strüder, M. Svenda, J. Ullrich, G. Weidenspointner, T. A. White, C. Wunderer, A. Ourmazd, “Unsupervised classification of single-particle X-ray diffraction snapshots by spectral clustering,” Opt. Express 19(17), 16542–16549 (2011).
[CrossRef] [PubMed]

London, R. A.

H. N. Chapman, A. Barty, M. J. Bogan, S. Boutet, M. Frank, S. P. Hau-Riege, S. Marchesini, B. W. Woods, S. Bajt, W. H. Benner, R. A. London, E. Plönjes, M. Kuhlmann, R. Treusch, S. Düsterer, T. Tschentscher, J. R. Schneider, E. Spiller, T. Möller, C. Bostedt, M. Hoener, D. A. Shapiro, K. O. Hodgson, D. van der Spoel, F. Burmeister, M. Bergh, C. Caleman, G. Huldt, M. M. Seibert, F. R. N. C. Maia, R. W. Lee, A. Szöke, N. Timneanu, J. Hajdu, “Femtosecond diffractive imaging with a soft-X-ray free-electron laser,” Nat. Phys. 2(12), 839–843 (2006).
[CrossRef]

Lonza, M.

E. Allaria, R. Appio, L. Badano, W. A. Barletta, S. Bassanese, S. G. Biedron, A. Borga, E. Busetto, D. Castronovo, P. Cinquegrana, S. Cleva, D. Cocco, M. Cornacchia, P. Craievich, I. Cudin, G. D’Auria, M. Dal Forno, M. B. Danailov, R. De Monte, G. De Ninno, P. Delgiusto, A. Demidovich, S. Di Mitri, B. Diviacco, A. Fabris, R. Fabris, W. Fawley, M. Ferianis, E. Ferrari, S. Ferry, L. Froehlich, P. Furlan, G. Gaio, F. Gelmetti, L. Giannessi, M. Giannini, R. Gobessi, R. Ivanov, E. Karantzoulis, M. Lonza, A. Lutman, B. Mahieu, M. Milloch, S. V. Milton, M. Musardo, I. Nikolov, S. Noe, F. Parmigiani, G. Penco, M. Petronio, L. Pivetta, M. Predonzani, F. Rossi, L. Rumiz, A. Salom, C. Scafuri, C. Serpico, P. Sigalotti, S. Spampinati, C. Spezzani, M. Svandrlik, C. Svetina, S. Tazzari, M. Trovo, R. Umer, A. Vascotto, M. Veronese, R. Visintini, M. Zaccaria, D. Zangrando, M. Zangrando, “Highly coherent and stable pulses from the FERMI seeded free-electron laser in the extreme ultraviolet,” Nat. Photonics 6(10), 699–704 (2012).
[CrossRef]

Lutman, A.

E. Allaria, R. Appio, L. Badano, W. A. Barletta, S. Bassanese, S. G. Biedron, A. Borga, E. Busetto, D. Castronovo, P. Cinquegrana, S. Cleva, D. Cocco, M. Cornacchia, P. Craievich, I. Cudin, G. D’Auria, M. Dal Forno, M. B. Danailov, R. De Monte, G. De Ninno, P. Delgiusto, A. Demidovich, S. Di Mitri, B. Diviacco, A. Fabris, R. Fabris, W. Fawley, M. Ferianis, E. Ferrari, S. Ferry, L. Froehlich, P. Furlan, G. Gaio, F. Gelmetti, L. Giannessi, M. Giannini, R. Gobessi, R. Ivanov, E. Karantzoulis, M. Lonza, A. Lutman, B. Mahieu, M. Milloch, S. V. Milton, M. Musardo, I. Nikolov, S. Noe, F. Parmigiani, G. Penco, M. Petronio, L. Pivetta, M. Predonzani, F. Rossi, L. Rumiz, A. Salom, C. Scafuri, C. Serpico, P. Sigalotti, S. Spampinati, C. Spezzani, M. Svandrlik, C. Svetina, S. Tazzari, M. Trovo, R. Umer, A. Vascotto, M. Veronese, R. Visintini, M. Zaccaria, D. Zangrando, M. Zangrando, “Highly coherent and stable pulses from the FERMI seeded free-electron laser in the extreme ultraviolet,” Nat. Photonics 6(10), 699–704 (2012).
[CrossRef]

Mahieu, B.

E. Allaria, R. Appio, L. Badano, W. A. Barletta, S. Bassanese, S. G. Biedron, A. Borga, E. Busetto, D. Castronovo, P. Cinquegrana, S. Cleva, D. Cocco, M. Cornacchia, P. Craievich, I. Cudin, G. D’Auria, M. Dal Forno, M. B. Danailov, R. De Monte, G. De Ninno, P. Delgiusto, A. Demidovich, S. Di Mitri, B. Diviacco, A. Fabris, R. Fabris, W. Fawley, M. Ferianis, E. Ferrari, S. Ferry, L. Froehlich, P. Furlan, G. Gaio, F. Gelmetti, L. Giannessi, M. Giannini, R. Gobessi, R. Ivanov, E. Karantzoulis, M. Lonza, A. Lutman, B. Mahieu, M. Milloch, S. V. Milton, M. Musardo, I. Nikolov, S. Noe, F. Parmigiani, G. Penco, M. Petronio, L. Pivetta, M. Predonzani, F. Rossi, L. Rumiz, A. Salom, C. Scafuri, C. Serpico, P. Sigalotti, S. Spampinati, C. Spezzani, M. Svandrlik, C. Svetina, S. Tazzari, M. Trovo, R. Umer, A. Vascotto, M. Veronese, R. Visintini, M. Zaccaria, D. Zangrando, M. Zangrando, “Highly coherent and stable pulses from the FERMI seeded free-electron laser in the extreme ultraviolet,” Nat. Photonics 6(10), 699–704 (2012).
[CrossRef]

Mahne, N.

F. Capotondi, E. Pedersoli, N. Mahne, R. H. Menk, G. Passos, L. Raimondi, C. Svetina, G. Sandrin, M. Zangrando, M. Kiskinova, S. Bajt, M. Barthelmess, H. Fleckenstein, H. N. Chapman, J. Schulz, J. Bach, R. Frömter, S. Schleitzer, L. Müller, C. Gutt, G. Grübel, “Invited article: Coherent imaging using seeded free-electron laser pulses with variable polarization: First results and research opportunities,” Rev. Sci. Instrum. 84(5), 051301 (2013).
[CrossRef] [PubMed]

Maia, F. R. N. C.

M. M. Seibert, T. Ekeberg, F. R. N. C. Maia, M. Svenda, J. Andreasson, O. Jönsson, D. Odić, B. Iwan, A. Rocker, D. Westphal, M. Hantke, D. P. DePonte, A. Barty, J. Schulz, L. Gumprecht, N. Coppola, A. Aquila, M. Liang, T. A. White, A. Martin, C. Caleman, S. Stern, C. Abergel, V. Seltzer, J. M. Claverie, C. Bostedt, J. D. Bozek, S. Boutet, A. A. Miahnahri, M. Messerschmidt, J. Krzywinski, G. Williams, K. O. Hodgson, M. J. Bogan, C. Y. Hampton, R. G. Sierra, D. Starodub, I. Andersson, S. Bajt, M. Barthelmess, J. C. H. Spence, P. Fromme, U. Weierstall, R. Kirian, M. Hunter, R. B. Doak, S. Marchesini, S. P. Hau-Riege, M. Frank, R. L. Shoeman, L. Lomb, S. W. Epp, R. Hartmann, D. Rolles, A. Rudenko, C. Schmidt, L. Foucar, N. Kimmel, P. Holl, B. Rudek, B. Erk, A. Hömke, C. Reich, D. Pietschner, G. Weidenspointner, L. Strüder, G. Hauser, H. Gorke, J. Ullrich, I. Schlichting, S. Herrmann, G. Schaller, F. Schopper, H. Soltau, K. U. Kühnel, R. Andritschke, C. D. Schröter, F. Krasniqi, M. Bott, S. Schorb, D. Rupp, M. Adolph, T. Gorkhover, H. Hirsemann, G. Potdevin, H. Graafsma, B. Nilsson, H. N. Chapman, J. Hajdu, “Single mimivirus particles intercepted and imaged with an X-ray laser,” Nature 470(7332), 78–81 (2011).
[CrossRef] [PubMed]

C. H. Yoon, P. Schwander, C. Abergel, I. Andersson, J. Andreasson, A. Aquila, S. Bajt, M. Barthelmess, A. Barty, M. J. Bogan, C. Bostedt, J. Bozek, H. N. Chapman, J. M. Claverie, N. Coppola, D. P. DePonte, T. Ekeberg, S. W. Epp, B. Erk, H. Fleckenstein, L. Foucar, H. Graafsma, L. Gumprecht, J. Hajdu, C. Y. Hampton, A. Hartmann, E. Hartmann, R. Hartmann, G. Hauser, H. Hirsemann, P. Holl, S. Kassemeyer, N. Kimmel, M. Kiskinova, M. Liang, N. T. D. Loh, L. Lomb, F. R. N. C. Maia, A. V. Martin, K. Nass, E. Pedersoli, C. Reich, D. Rolles, B. Rudek, A. Rudenko, I. Schlichting, J. Schulz, M. Seibert, V. Seltzer, R. L. Shoeman, R. G. Sierra, H. Soltau, D. Starodub, J. Steinbrener, G. Stier, L. Strüder, M. Svenda, J. Ullrich, G. Weidenspointner, T. A. White, C. Wunderer, A. Ourmazd, “Unsupervised classification of single-particle X-ray diffraction snapshots by spectral clustering,” Opt. Express 19(17), 16542–16549 (2011).
[CrossRef] [PubMed]

H. N. Chapman, A. Barty, M. J. Bogan, S. Boutet, M. Frank, S. P. Hau-Riege, S. Marchesini, B. W. Woods, S. Bajt, W. H. Benner, R. A. London, E. Plönjes, M. Kuhlmann, R. Treusch, S. Düsterer, T. Tschentscher, J. R. Schneider, E. Spiller, T. Möller, C. Bostedt, M. Hoener, D. A. Shapiro, K. O. Hodgson, D. van der Spoel, F. Burmeister, M. Bergh, C. Caleman, G. Huldt, M. M. Seibert, F. R. N. C. Maia, R. W. Lee, A. Szöke, N. Timneanu, J. Hajdu, “Femtosecond diffractive imaging with a soft-X-ray free-electron laser,” Nat. Phys. 2(12), 839–843 (2006).
[CrossRef]

Mancuso, A. P.

A. P. Mancuso, T. Gorniak, F. Staier, O. M. Yefanov, R. Barth, C. Christophis, B. Reime, J. Gulden, A. Singer, M. E. Pettit, T. Nisius, T. Wilhein, C. Gutt, G. Grübel, N. Guerassimova, R. Treusch, J. Feldhaus, S. Eisebitt, E. Weckert, M. Grunze, A. Rosenhahn, I. A. Vartanyants, “Coherent imaging of biological samples with femtosecond pulses at the free-electron laser FLASH,” New J. Phys. 12(3), 035003 (2010).
[CrossRef]

Marchesini, S.

M. M. Seibert, T. Ekeberg, F. R. N. C. Maia, M. Svenda, J. Andreasson, O. Jönsson, D. Odić, B. Iwan, A. Rocker, D. Westphal, M. Hantke, D. P. DePonte, A. Barty, J. Schulz, L. Gumprecht, N. Coppola, A. Aquila, M. Liang, T. A. White, A. Martin, C. Caleman, S. Stern, C. Abergel, V. Seltzer, J. M. Claverie, C. Bostedt, J. D. Bozek, S. Boutet, A. A. Miahnahri, M. Messerschmidt, J. Krzywinski, G. Williams, K. O. Hodgson, M. J. Bogan, C. Y. Hampton, R. G. Sierra, D. Starodub, I. Andersson, S. Bajt, M. Barthelmess, J. C. H. Spence, P. Fromme, U. Weierstall, R. Kirian, M. Hunter, R. B. Doak, S. Marchesini, S. P. Hau-Riege, M. Frank, R. L. Shoeman, L. Lomb, S. W. Epp, R. Hartmann, D. Rolles, A. Rudenko, C. Schmidt, L. Foucar, N. Kimmel, P. Holl, B. Rudek, B. Erk, A. Hömke, C. Reich, D. Pietschner, G. Weidenspointner, L. Strüder, G. Hauser, H. Gorke, J. Ullrich, I. Schlichting, S. Herrmann, G. Schaller, F. Schopper, H. Soltau, K. U. Kühnel, R. Andritschke, C. D. Schröter, F. Krasniqi, M. Bott, S. Schorb, D. Rupp, M. Adolph, T. Gorkhover, H. Hirsemann, G. Potdevin, H. Graafsma, B. Nilsson, H. N. Chapman, J. Hajdu, “Single mimivirus particles intercepted and imaged with an X-ray laser,” Nature 470(7332), 78–81 (2011).
[CrossRef] [PubMed]

H. N. Chapman, A. Barty, M. J. Bogan, S. Boutet, M. Frank, S. P. Hau-Riege, S. Marchesini, B. W. Woods, S. Bajt, W. H. Benner, R. A. London, E. Plönjes, M. Kuhlmann, R. Treusch, S. Düsterer, T. Tschentscher, J. R. Schneider, E. Spiller, T. Möller, C. Bostedt, M. Hoener, D. A. Shapiro, K. O. Hodgson, D. van der Spoel, F. Burmeister, M. Bergh, C. Caleman, G. Huldt, M. M. Seibert, F. R. N. C. Maia, R. W. Lee, A. Szöke, N. Timneanu, J. Hajdu, “Femtosecond diffractive imaging with a soft-X-ray free-electron laser,” Nat. Phys. 2(12), 839–843 (2006).
[CrossRef]

H. N. Chapman, A. Barty, S. Marchesini, A. Noy, S. P. Hau-Riege, C. Cui, M. R. Howells, R. Rosen, H. He, J. C. H. Spence, U. Weierstall, T. Beetz, C. Jacobsen, D. Shapiro, “High-resolution ab initio three-dimensional x-ray diffraction microscopy,” J. Opt. Soc. Am. A 23(5), 1179 (2006).
[CrossRef]

S. Marchesini, H. He, H. N. Chapman, S. P. Hau-Riege, A. Noy, M. R. Howells, U. Weierstall, J. C. H. Spence, “X-ray image reconstruction from a diffraction pattern alone,” Phys. Rev. B 68(14), 140101 (2003).
[CrossRef]

Martin, A.

M. M. Seibert, T. Ekeberg, F. R. N. C. Maia, M. Svenda, J. Andreasson, O. Jönsson, D. Odić, B. Iwan, A. Rocker, D. Westphal, M. Hantke, D. P. DePonte, A. Barty, J. Schulz, L. Gumprecht, N. Coppola, A. Aquila, M. Liang, T. A. White, A. Martin, C. Caleman, S. Stern, C. Abergel, V. Seltzer, J. M. Claverie, C. Bostedt, J. D. Bozek, S. Boutet, A. A. Miahnahri, M. Messerschmidt, J. Krzywinski, G. Williams, K. O. Hodgson, M. J. Bogan, C. Y. Hampton, R. G. Sierra, D. Starodub, I. Andersson, S. Bajt, M. Barthelmess, J. C. H. Spence, P. Fromme, U. Weierstall, R. Kirian, M. Hunter, R. B. Doak, S. Marchesini, S. P. Hau-Riege, M. Frank, R. L. Shoeman, L. Lomb, S. W. Epp, R. Hartmann, D. Rolles, A. Rudenko, C. Schmidt, L. Foucar, N. Kimmel, P. Holl, B. Rudek, B. Erk, A. Hömke, C. Reich, D. Pietschner, G. Weidenspointner, L. Strüder, G. Hauser, H. Gorke, J. Ullrich, I. Schlichting, S. Herrmann, G. Schaller, F. Schopper, H. Soltau, K. U. Kühnel, R. Andritschke, C. D. Schröter, F. Krasniqi, M. Bott, S. Schorb, D. Rupp, M. Adolph, T. Gorkhover, H. Hirsemann, G. Potdevin, H. Graafsma, B. Nilsson, H. N. Chapman, J. Hajdu, “Single mimivirus particles intercepted and imaged with an X-ray laser,” Nature 470(7332), 78–81 (2011).
[CrossRef] [PubMed]

Martin, A. V.

L. Redecke, K. Nass, D. P. DePonte, T. A. White, D. Rehders, A. Barty, F. Stellato, M. Liang, T. R. M. Barends, S. Boutet, G. J. Williams, M. Messerschmidt, M. M. Seibert, A. Aquila, D. Arnlund, S. Bajt, T. Barth, M. J. Bogan, C. Caleman, T. C. Chao, R. B. Doak, H. Fleckenstein, M. Frank, R. Fromme, L. Galli, I. Grotjohann, M. S. Hunter, L. C. Johansson, S. Kassemeyer, G. Katona, R. A. Kirian, R. Koopmann, C. Kupitz, L. Lomb, A. V. Martin, S. Mogk, R. Neutze, R. L. Shoeman, J. Steinbrener, N. Timneanu, D. Wang, U. Weierstall, N. A. Zatsepin, J. C. H. Spence, P. Fromme, I. Schlichting, M. Duszenko, C. Betzel, H. N. Chapman, “Natively inhibited Trypanosoma brucei Cathepsin B structure determined by using an X-ray laser,” Science 339(6116), 227–230 (2013).
[CrossRef] [PubMed]

S. Boutet, L. Lomb, G. J. Williams, T. R. M. Barends, A. Aquila, R. B. Doak, U. Weierstall, D. P. DePonte, J. Steinbrener, R. L. Shoeman, M. Messerschmidt, A. Barty, T. A. White, S. Kassemeyer, R. A. Kirian, M. M. Seibert, P. A. Montanez, C. Kenney, R. Herbst, P. Hart, J. Pines, G. Haller, S. M. Gruner, H. T. Philipp, M. W. Tate, M. Hromalik, L. J. Koerner, N. van Bakel, J. Morse, W. Ghonsalves, D. Arnlund, M. J. Bogan, C. Caleman, R. Fromme, C. Y. Hampton, M. S. Hunter, L. C. Johansson, G. Katona, C. Kupitz, M. Liang, A. V. Martin, K. Nass, L. Redecke, F. Stellato, N. Timneanu, D. Wang, N. A. Zatsepin, D. Schafer, J. Defever, R. Neutze, P. Fromme, J. C. H. Spence, H. N. Chapman, I. Schlichting, “High-resolution protein structure determination by serial femtosecond crystallography,” Science 337(6092), 362–364 (2012).
[CrossRef] [PubMed]

C. H. Yoon, P. Schwander, C. Abergel, I. Andersson, J. Andreasson, A. Aquila, S. Bajt, M. Barthelmess, A. Barty, M. J. Bogan, C. Bostedt, J. Bozek, H. N. Chapman, J. M. Claverie, N. Coppola, D. P. DePonte, T. Ekeberg, S. W. Epp, B. Erk, H. Fleckenstein, L. Foucar, H. Graafsma, L. Gumprecht, J. Hajdu, C. Y. Hampton, A. Hartmann, E. Hartmann, R. Hartmann, G. Hauser, H. Hirsemann, P. Holl, S. Kassemeyer, N. Kimmel, M. Kiskinova, M. Liang, N. T. D. Loh, L. Lomb, F. R. N. C. Maia, A. V. Martin, K. Nass, E. Pedersoli, C. Reich, D. Rolles, B. Rudek, A. Rudenko, I. Schlichting, J. Schulz, M. Seibert, V. Seltzer, R. L. Shoeman, R. G. Sierra, H. Soltau, D. Starodub, J. Steinbrener, G. Stier, L. Strüder, M. Svenda, J. Ullrich, G. Weidenspointner, T. A. White, C. Wunderer, A. Ourmazd, “Unsupervised classification of single-particle X-ray diffraction snapshots by spectral clustering,” Opt. Express 19(17), 16542–16549 (2011).
[CrossRef] [PubMed]

McNulty, I.

I. McNulty, J. Kirz, C. Jacobsen, E. H. Anderson, M. R. Howells, D. P. Kern, “High-resolution imaging by Fourier transform X-ray holography,” Science 256(5059), 1009–1012 (1992).
[CrossRef] [PubMed]

Medvedev, N.

B. Ziaja, N. Medvedev, “Modelling ultrafast transitions within laser-irradiated solids,” High Energy Density Phys. 8(1), 18–29 (2012).
[CrossRef]

Menk, R. H.

F. Capotondi, E. Pedersoli, N. Mahne, R. H. Menk, G. Passos, L. Raimondi, C. Svetina, G. Sandrin, M. Zangrando, M. Kiskinova, S. Bajt, M. Barthelmess, H. Fleckenstein, H. N. Chapman, J. Schulz, J. Bach, R. Frömter, S. Schleitzer, L. Müller, C. Gutt, G. Grübel, “Invited article: Coherent imaging using seeded free-electron laser pulses with variable polarization: First results and research opportunities,” Rev. Sci. Instrum. 84(5), 051301 (2013).
[CrossRef] [PubMed]

Messerschmidt, M.

J. Kern, R. Alonso-Mori, R. Tran, J. Hattne, R. J. Gildea, N. Echols, C. Glöckner, J. Hellmich, H. Laksmono, R. G. Sierra, B. Lassalle-Kaiser, S. Koroidov, A. Lampe, G. Han, S. Gul, D. Difiore, D. Milathianaki, A. R. Fry, A. Miahnahri, D. W. Schafer, M. Messerschmidt, M. M. Seibert, J. E. Koglin, D. Sokaras, T. C. Weng, J. Sellberg, M. J. Latimer, R. W. Grosse-Kunstleve, P. H. Zwart, W. E. White, P. Glatzel, P. D. Adams, M. J. Bogan, G. J. Williams, S. Boutet, J. Messinger, A. Zouni, N. K. Sauter, V. K. Yachandra, U. Bergmann, J. Yano, “Simultaneous femtosecond X-ray spectroscopy and diffraction of photosystem II at room temperature,” Science 340(6131), 491–495 (2013).
[CrossRef] [PubMed]

L. Redecke, K. Nass, D. P. DePonte, T. A. White, D. Rehders, A. Barty, F. Stellato, M. Liang, T. R. M. Barends, S. Boutet, G. J. Williams, M. Messerschmidt, M. M. Seibert, A. Aquila, D. Arnlund, S. Bajt, T. Barth, M. J. Bogan, C. Caleman, T. C. Chao, R. B. Doak, H. Fleckenstein, M. Frank, R. Fromme, L. Galli, I. Grotjohann, M. S. Hunter, L. C. Johansson, S. Kassemeyer, G. Katona, R. A. Kirian, R. Koopmann, C. Kupitz, L. Lomb, A. V. Martin, S. Mogk, R. Neutze, R. L. Shoeman, J. Steinbrener, N. Timneanu, D. Wang, U. Weierstall, N. A. Zatsepin, J. C. H. Spence, P. Fromme, I. Schlichting, M. Duszenko, C. Betzel, H. N. Chapman, “Natively inhibited Trypanosoma brucei Cathepsin B structure determined by using an X-ray laser,” Science 339(6116), 227–230 (2013).
[CrossRef] [PubMed]

S. Boutet, L. Lomb, G. J. Williams, T. R. M. Barends, A. Aquila, R. B. Doak, U. Weierstall, D. P. DePonte, J. Steinbrener, R. L. Shoeman, M. Messerschmidt, A. Barty, T. A. White, S. Kassemeyer, R. A. Kirian, M. M. Seibert, P. A. Montanez, C. Kenney, R. Herbst, P. Hart, J. Pines, G. Haller, S. M. Gruner, H. T. Philipp, M. W. Tate, M. Hromalik, L. J. Koerner, N. van Bakel, J. Morse, W. Ghonsalves, D. Arnlund, M. J. Bogan, C. Caleman, R. Fromme, C. Y. Hampton, M. S. Hunter, L. C. Johansson, G. Katona, C. Kupitz, M. Liang, A. V. Martin, K. Nass, L. Redecke, F. Stellato, N. Timneanu, D. Wang, N. A. Zatsepin, D. Schafer, J. Defever, R. Neutze, P. Fromme, J. C. H. Spence, H. N. Chapman, I. Schlichting, “High-resolution protein structure determination by serial femtosecond crystallography,” Science 337(6092), 362–364 (2012).
[CrossRef] [PubMed]

M. M. Seibert, T. Ekeberg, F. R. N. C. Maia, M. Svenda, J. Andreasson, O. Jönsson, D. Odić, B. Iwan, A. Rocker, D. Westphal, M. Hantke, D. P. DePonte, A. Barty, J. Schulz, L. Gumprecht, N. Coppola, A. Aquila, M. Liang, T. A. White, A. Martin, C. Caleman, S. Stern, C. Abergel, V. Seltzer, J. M. Claverie, C. Bostedt, J. D. Bozek, S. Boutet, A. A. Miahnahri, M. Messerschmidt, J. Krzywinski, G. Williams, K. O. Hodgson, M. J. Bogan, C. Y. Hampton, R. G. Sierra, D. Starodub, I. Andersson, S. Bajt, M. Barthelmess, J. C. H. Spence, P. Fromme, U. Weierstall, R. Kirian, M. Hunter, R. B. Doak, S. Marchesini, S. P. Hau-Riege, M. Frank, R. L. Shoeman, L. Lomb, S. W. Epp, R. Hartmann, D. Rolles, A. Rudenko, C. Schmidt, L. Foucar, N. Kimmel, P. Holl, B. Rudek, B. Erk, A. Hömke, C. Reich, D. Pietschner, G. Weidenspointner, L. Strüder, G. Hauser, H. Gorke, J. Ullrich, I. Schlichting, S. Herrmann, G. Schaller, F. Schopper, H. Soltau, K. U. Kühnel, R. Andritschke, C. D. Schröter, F. Krasniqi, M. Bott, S. Schorb, D. Rupp, M. Adolph, T. Gorkhover, H. Hirsemann, G. Potdevin, H. Graafsma, B. Nilsson, H. N. Chapman, J. Hajdu, “Single mimivirus particles intercepted and imaged with an X-ray laser,” Nature 470(7332), 78–81 (2011).
[CrossRef] [PubMed]

Messinger, J.

J. Kern, R. Alonso-Mori, R. Tran, J. Hattne, R. J. Gildea, N. Echols, C. Glöckner, J. Hellmich, H. Laksmono, R. G. Sierra, B. Lassalle-Kaiser, S. Koroidov, A. Lampe, G. Han, S. Gul, D. Difiore, D. Milathianaki, A. R. Fry, A. Miahnahri, D. W. Schafer, M. Messerschmidt, M. M. Seibert, J. E. Koglin, D. Sokaras, T. C. Weng, J. Sellberg, M. J. Latimer, R. W. Grosse-Kunstleve, P. H. Zwart, W. E. White, P. Glatzel, P. D. Adams, M. J. Bogan, G. J. Williams, S. Boutet, J. Messinger, A. Zouni, N. K. Sauter, V. K. Yachandra, U. Bergmann, J. Yano, “Simultaneous femtosecond X-ray spectroscopy and diffraction of photosystem II at room temperature,” Science 340(6131), 491–495 (2013).
[CrossRef] [PubMed]

Miahnahri, A.

J. Kern, R. Alonso-Mori, R. Tran, J. Hattne, R. J. Gildea, N. Echols, C. Glöckner, J. Hellmich, H. Laksmono, R. G. Sierra, B. Lassalle-Kaiser, S. Koroidov, A. Lampe, G. Han, S. Gul, D. Difiore, D. Milathianaki, A. R. Fry, A. Miahnahri, D. W. Schafer, M. Messerschmidt, M. M. Seibert, J. E. Koglin, D. Sokaras, T. C. Weng, J. Sellberg, M. J. Latimer, R. W. Grosse-Kunstleve, P. H. Zwart, W. E. White, P. Glatzel, P. D. Adams, M. J. Bogan, G. J. Williams, S. Boutet, J. Messinger, A. Zouni, N. K. Sauter, V. K. Yachandra, U. Bergmann, J. Yano, “Simultaneous femtosecond X-ray spectroscopy and diffraction of photosystem II at room temperature,” Science 340(6131), 491–495 (2013).
[CrossRef] [PubMed]

Miahnahri, A. A.

M. M. Seibert, T. Ekeberg, F. R. N. C. Maia, M. Svenda, J. Andreasson, O. Jönsson, D. Odić, B. Iwan, A. Rocker, D. Westphal, M. Hantke, D. P. DePonte, A. Barty, J. Schulz, L. Gumprecht, N. Coppola, A. Aquila, M. Liang, T. A. White, A. Martin, C. Caleman, S. Stern, C. Abergel, V. Seltzer, J. M. Claverie, C. Bostedt, J. D. Bozek, S. Boutet, A. A. Miahnahri, M. Messerschmidt, J. Krzywinski, G. Williams, K. O. Hodgson, M. J. Bogan, C. Y. Hampton, R. G. Sierra, D. Starodub, I. Andersson, S. Bajt, M. Barthelmess, J. C. H. Spence, P. Fromme, U. Weierstall, R. Kirian, M. Hunter, R. B. Doak, S. Marchesini, S. P. Hau-Riege, M. Frank, R. L. Shoeman, L. Lomb, S. W. Epp, R. Hartmann, D. Rolles, A. Rudenko, C. Schmidt, L. Foucar, N. Kimmel, P. Holl, B. Rudek, B. Erk, A. Hömke, C. Reich, D. Pietschner, G. Weidenspointner, L. Strüder, G. Hauser, H. Gorke, J. Ullrich, I. Schlichting, S. Herrmann, G. Schaller, F. Schopper, H. Soltau, K. U. Kühnel, R. Andritschke, C. D. Schröter, F. Krasniqi, M. Bott, S. Schorb, D. Rupp, M. Adolph, T. Gorkhover, H. Hirsemann, G. Potdevin, H. Graafsma, B. Nilsson, H. N. Chapman, J. Hajdu, “Single mimivirus particles intercepted and imaged with an X-ray laser,” Nature 470(7332), 78–81 (2011).
[CrossRef] [PubMed]

Milathianaki, D.

J. Kern, R. Alonso-Mori, R. Tran, J. Hattne, R. J. Gildea, N. Echols, C. Glöckner, J. Hellmich, H. Laksmono, R. G. Sierra, B. Lassalle-Kaiser, S. Koroidov, A. Lampe, G. Han, S. Gul, D. Difiore, D. Milathianaki, A. R. Fry, A. Miahnahri, D. W. Schafer, M. Messerschmidt, M. M. Seibert, J. E. Koglin, D. Sokaras, T. C. Weng, J. Sellberg, M. J. Latimer, R. W. Grosse-Kunstleve, P. H. Zwart, W. E. White, P. Glatzel, P. D. Adams, M. J. Bogan, G. J. Williams, S. Boutet, J. Messinger, A. Zouni, N. K. Sauter, V. K. Yachandra, U. Bergmann, J. Yano, “Simultaneous femtosecond X-ray spectroscopy and diffraction of photosystem II at room temperature,” Science 340(6131), 491–495 (2013).
[CrossRef] [PubMed]

Milloch, M.

E. Allaria, R. Appio, L. Badano, W. A. Barletta, S. Bassanese, S. G. Biedron, A. Borga, E. Busetto, D. Castronovo, P. Cinquegrana, S. Cleva, D. Cocco, M. Cornacchia, P. Craievich, I. Cudin, G. D’Auria, M. Dal Forno, M. B. Danailov, R. De Monte, G. De Ninno, P. Delgiusto, A. Demidovich, S. Di Mitri, B. Diviacco, A. Fabris, R. Fabris, W. Fawley, M. Ferianis, E. Ferrari, S. Ferry, L. Froehlich, P. Furlan, G. Gaio, F. Gelmetti, L. Giannessi, M. Giannini, R. Gobessi, R. Ivanov, E. Karantzoulis, M. Lonza, A. Lutman, B. Mahieu, M. Milloch, S. V. Milton, M. Musardo, I. Nikolov, S. Noe, F. Parmigiani, G. Penco, M. Petronio, L. Pivetta, M. Predonzani, F. Rossi, L. Rumiz, A. Salom, C. Scafuri, C. Serpico, P. Sigalotti, S. Spampinati, C. Spezzani, M. Svandrlik, C. Svetina, S. Tazzari, M. Trovo, R. Umer, A. Vascotto, M. Veronese, R. Visintini, M. Zaccaria, D. Zangrando, M. Zangrando, “Highly coherent and stable pulses from the FERMI seeded free-electron laser in the extreme ultraviolet,” Nat. Photonics 6(10), 699–704 (2012).
[CrossRef]

Milton, S. V.

E. Allaria, R. Appio, L. Badano, W. A. Barletta, S. Bassanese, S. G. Biedron, A. Borga, E. Busetto, D. Castronovo, P. Cinquegrana, S. Cleva, D. Cocco, M. Cornacchia, P. Craievich, I. Cudin, G. D’Auria, M. Dal Forno, M. B. Danailov, R. De Monte, G. De Ninno, P. Delgiusto, A. Demidovich, S. Di Mitri, B. Diviacco, A. Fabris, R. Fabris, W. Fawley, M. Ferianis, E. Ferrari, S. Ferry, L. Froehlich, P. Furlan, G. Gaio, F. Gelmetti, L. Giannessi, M. Giannini, R. Gobessi, R. Ivanov, E. Karantzoulis, M. Lonza, A. Lutman, B. Mahieu, M. Milloch, S. V. Milton, M. Musardo, I. Nikolov, S. Noe, F. Parmigiani, G. Penco, M. Petronio, L. Pivetta, M. Predonzani, F. Rossi, L. Rumiz, A. Salom, C. Scafuri, C. Serpico, P. Sigalotti, S. Spampinati, C. Spezzani, M. Svandrlik, C. Svetina, S. Tazzari, M. Trovo, R. Umer, A. Vascotto, M. Veronese, R. Visintini, M. Zaccaria, D. Zangrando, M. Zangrando, “Highly coherent and stable pulses from the FERMI seeded free-electron laser in the extreme ultraviolet,” Nat. Photonics 6(10), 699–704 (2012).
[CrossRef]

Mogk, S.

L. Redecke, K. Nass, D. P. DePonte, T. A. White, D. Rehders, A. Barty, F. Stellato, M. Liang, T. R. M. Barends, S. Boutet, G. J. Williams, M. Messerschmidt, M. M. Seibert, A. Aquila, D. Arnlund, S. Bajt, T. Barth, M. J. Bogan, C. Caleman, T. C. Chao, R. B. Doak, H. Fleckenstein, M. Frank, R. Fromme, L. Galli, I. Grotjohann, M. S. Hunter, L. C. Johansson, S. Kassemeyer, G. Katona, R. A. Kirian, R. Koopmann, C. Kupitz, L. Lomb, A. V. Martin, S. Mogk, R. Neutze, R. L. Shoeman, J. Steinbrener, N. Timneanu, D. Wang, U. Weierstall, N. A. Zatsepin, J. C. H. Spence, P. Fromme, I. Schlichting, M. Duszenko, C. Betzel, H. N. Chapman, “Natively inhibited Trypanosoma brucei Cathepsin B structure determined by using an X-ray laser,” Science 339(6116), 227–230 (2013).
[CrossRef] [PubMed]

Möller, T.

H. N. Chapman, A. Barty, M. J. Bogan, S. Boutet, M. Frank, S. P. Hau-Riege, S. Marchesini, B. W. Woods, S. Bajt, W. H. Benner, R. A. London, E. Plönjes, M. Kuhlmann, R. Treusch, S. Düsterer, T. Tschentscher, J. R. Schneider, E. Spiller, T. Möller, C. Bostedt, M. Hoener, D. A. Shapiro, K. O. Hodgson, D. van der Spoel, F. Burmeister, M. Bergh, C. Caleman, G. Huldt, M. M. Seibert, F. R. N. C. Maia, R. W. Lee, A. Szöke, N. Timneanu, J. Hajdu, “Femtosecond diffractive imaging with a soft-X-ray free-electron laser,” Nat. Phys. 2(12), 839–843 (2006).
[CrossRef]

Montanez, P. A.

S. Boutet, L. Lomb, G. J. Williams, T. R. M. Barends, A. Aquila, R. B. Doak, U. Weierstall, D. P. DePonte, J. Steinbrener, R. L. Shoeman, M. Messerschmidt, A. Barty, T. A. White, S. Kassemeyer, R. A. Kirian, M. M. Seibert, P. A. Montanez, C. Kenney, R. Herbst, P. Hart, J. Pines, G. Haller, S. M. Gruner, H. T. Philipp, M. W. Tate, M. Hromalik, L. J. Koerner, N. van Bakel, J. Morse, W. Ghonsalves, D. Arnlund, M. J. Bogan, C. Caleman, R. Fromme, C. Y. Hampton, M. S. Hunter, L. C. Johansson, G. Katona, C. Kupitz, M. Liang, A. V. Martin, K. Nass, L. Redecke, F. Stellato, N. Timneanu, D. Wang, N. A. Zatsepin, D. Schafer, J. Defever, R. Neutze, P. Fromme, J. C. H. Spence, H. N. Chapman, I. Schlichting, “High-resolution protein structure determination by serial femtosecond crystallography,” Science 337(6092), 362–364 (2012).
[CrossRef] [PubMed]

Morse, J.

S. Boutet, L. Lomb, G. J. Williams, T. R. M. Barends, A. Aquila, R. B. Doak, U. Weierstall, D. P. DePonte, J. Steinbrener, R. L. Shoeman, M. Messerschmidt, A. Barty, T. A. White, S. Kassemeyer, R. A. Kirian, M. M. Seibert, P. A. Montanez, C. Kenney, R. Herbst, P. Hart, J. Pines, G. Haller, S. M. Gruner, H. T. Philipp, M. W. Tate, M. Hromalik, L. J. Koerner, N. van Bakel, J. Morse, W. Ghonsalves, D. Arnlund, M. J. Bogan, C. Caleman, R. Fromme, C. Y. Hampton, M. S. Hunter, L. C. Johansson, G. Katona, C. Kupitz, M. Liang, A. V. Martin, K. Nass, L. Redecke, F. Stellato, N. Timneanu, D. Wang, N. A. Zatsepin, D. Schafer, J. Defever, R. Neutze, P. Fromme, J. C. H. Spence, H. N. Chapman, I. Schlichting, “High-resolution protein structure determination by serial femtosecond crystallography,” Science 337(6092), 362–364 (2012).
[CrossRef] [PubMed]

Müller, L.

F. Capotondi, E. Pedersoli, N. Mahne, R. H. Menk, G. Passos, L. Raimondi, C. Svetina, G. Sandrin, M. Zangrando, M. Kiskinova, S. Bajt, M. Barthelmess, H. Fleckenstein, H. N. Chapman, J. Schulz, J. Bach, R. Frömter, S. Schleitzer, L. Müller, C. Gutt, G. Grübel, “Invited article: Coherent imaging using seeded free-electron laser pulses with variable polarization: First results and research opportunities,” Rev. Sci. Instrum. 84(5), 051301 (2013).
[CrossRef] [PubMed]

Musardo, M.

E. Allaria, R. Appio, L. Badano, W. A. Barletta, S. Bassanese, S. G. Biedron, A. Borga, E. Busetto, D. Castronovo, P. Cinquegrana, S. Cleva, D. Cocco, M. Cornacchia, P. Craievich, I. Cudin, G. D’Auria, M. Dal Forno, M. B. Danailov, R. De Monte, G. De Ninno, P. Delgiusto, A. Demidovich, S. Di Mitri, B. Diviacco, A. Fabris, R. Fabris, W. Fawley, M. Ferianis, E. Ferrari, S. Ferry, L. Froehlich, P. Furlan, G. Gaio, F. Gelmetti, L. Giannessi, M. Giannini, R. Gobessi, R. Ivanov, E. Karantzoulis, M. Lonza, A. Lutman, B. Mahieu, M. Milloch, S. V. Milton, M. Musardo, I. Nikolov, S. Noe, F. Parmigiani, G. Penco, M. Petronio, L. Pivetta, M. Predonzani, F. Rossi, L. Rumiz, A. Salom, C. Scafuri, C. Serpico, P. Sigalotti, S. Spampinati, C. Spezzani, M. Svandrlik, C. Svetina, S. Tazzari, M. Trovo, R. Umer, A. Vascotto, M. Veronese, R. Visintini, M. Zaccaria, D. Zangrando, M. Zangrando, “Highly coherent and stable pulses from the FERMI seeded free-electron laser in the extreme ultraviolet,” Nat. Photonics 6(10), 699–704 (2012).
[CrossRef]

Nass, K.

L. Redecke, K. Nass, D. P. DePonte, T. A. White, D. Rehders, A. Barty, F. Stellato, M. Liang, T. R. M. Barends, S. Boutet, G. J. Williams, M. Messerschmidt, M. M. Seibert, A. Aquila, D. Arnlund, S. Bajt, T. Barth, M. J. Bogan, C. Caleman, T. C. Chao, R. B. Doak, H. Fleckenstein, M. Frank, R. Fromme, L. Galli, I. Grotjohann, M. S. Hunter, L. C. Johansson, S. Kassemeyer, G. Katona, R. A. Kirian, R. Koopmann, C. Kupitz, L. Lomb, A. V. Martin, S. Mogk, R. Neutze, R. L. Shoeman, J. Steinbrener, N. Timneanu, D. Wang, U. Weierstall, N. A. Zatsepin, J. C. H. Spence, P. Fromme, I. Schlichting, M. Duszenko, C. Betzel, H. N. Chapman, “Natively inhibited Trypanosoma brucei Cathepsin B structure determined by using an X-ray laser,” Science 339(6116), 227–230 (2013).
[CrossRef] [PubMed]

S. Boutet, L. Lomb, G. J. Williams, T. R. M. Barends, A. Aquila, R. B. Doak, U. Weierstall, D. P. DePonte, J. Steinbrener, R. L. Shoeman, M. Messerschmidt, A. Barty, T. A. White, S. Kassemeyer, R. A. Kirian, M. M. Seibert, P. A. Montanez, C. Kenney, R. Herbst, P. Hart, J. Pines, G. Haller, S. M. Gruner, H. T. Philipp, M. W. Tate, M. Hromalik, L. J. Koerner, N. van Bakel, J. Morse, W. Ghonsalves, D. Arnlund, M. J. Bogan, C. Caleman, R. Fromme, C. Y. Hampton, M. S. Hunter, L. C. Johansson, G. Katona, C. Kupitz, M. Liang, A. V. Martin, K. Nass, L. Redecke, F. Stellato, N. Timneanu, D. Wang, N. A. Zatsepin, D. Schafer, J. Defever, R. Neutze, P. Fromme, J. C. H. Spence, H. N. Chapman, I. Schlichting, “High-resolution protein structure determination by serial femtosecond crystallography,” Science 337(6092), 362–364 (2012).
[CrossRef] [PubMed]

C. H. Yoon, P. Schwander, C. Abergel, I. Andersson, J. Andreasson, A. Aquila, S. Bajt, M. Barthelmess, A. Barty, M. J. Bogan, C. Bostedt, J. Bozek, H. N. Chapman, J. M. Claverie, N. Coppola, D. P. DePonte, T. Ekeberg, S. W. Epp, B. Erk, H. Fleckenstein, L. Foucar, H. Graafsma, L. Gumprecht, J. Hajdu, C. Y. Hampton, A. Hartmann, E. Hartmann, R. Hartmann, G. Hauser, H. Hirsemann, P. Holl, S. Kassemeyer, N. Kimmel, M. Kiskinova, M. Liang, N. T. D. Loh, L. Lomb, F. R. N. C. Maia, A. V. Martin, K. Nass, E. Pedersoli, C. Reich, D. Rolles, B. Rudek, A. Rudenko, I. Schlichting, J. Schulz, M. Seibert, V. Seltzer, R. L. Shoeman, R. G. Sierra, H. Soltau, D. Starodub, J. Steinbrener, G. Stier, L. Strüder, M. Svenda, J. Ullrich, G. Weidenspointner, T. A. White, C. Wunderer, A. Ourmazd, “Unsupervised classification of single-particle X-ray diffraction snapshots by spectral clustering,” Opt. Express 19(17), 16542–16549 (2011).
[CrossRef] [PubMed]

Neutze, R.

L. Redecke, K. Nass, D. P. DePonte, T. A. White, D. Rehders, A. Barty, F. Stellato, M. Liang, T. R. M. Barends, S. Boutet, G. J. Williams, M. Messerschmidt, M. M. Seibert, A. Aquila, D. Arnlund, S. Bajt, T. Barth, M. J. Bogan, C. Caleman, T. C. Chao, R. B. Doak, H. Fleckenstein, M. Frank, R. Fromme, L. Galli, I. Grotjohann, M. S. Hunter, L. C. Johansson, S. Kassemeyer, G. Katona, R. A. Kirian, R. Koopmann, C. Kupitz, L. Lomb, A. V. Martin, S. Mogk, R. Neutze, R. L. Shoeman, J. Steinbrener, N. Timneanu, D. Wang, U. Weierstall, N. A. Zatsepin, J. C. H. Spence, P. Fromme, I. Schlichting, M. Duszenko, C. Betzel, H. N. Chapman, “Natively inhibited Trypanosoma brucei Cathepsin B structure determined by using an X-ray laser,” Science 339(6116), 227–230 (2013).
[CrossRef] [PubMed]

S. Boutet, L. Lomb, G. J. Williams, T. R. M. Barends, A. Aquila, R. B. Doak, U. Weierstall, D. P. DePonte, J. Steinbrener, R. L. Shoeman, M. Messerschmidt, A. Barty, T. A. White, S. Kassemeyer, R. A. Kirian, M. M. Seibert, P. A. Montanez, C. Kenney, R. Herbst, P. Hart, J. Pines, G. Haller, S. M. Gruner, H. T. Philipp, M. W. Tate, M. Hromalik, L. J. Koerner, N. van Bakel, J. Morse, W. Ghonsalves, D. Arnlund, M. J. Bogan, C. Caleman, R. Fromme, C. Y. Hampton, M. S. Hunter, L. C. Johansson, G. Katona, C. Kupitz, M. Liang, A. V. Martin, K. Nass, L. Redecke, F. Stellato, N. Timneanu, D. Wang, N. A. Zatsepin, D. Schafer, J. Defever, R. Neutze, P. Fromme, J. C. H. Spence, H. N. Chapman, I. Schlichting, “High-resolution protein structure determination by serial femtosecond crystallography,” Science 337(6092), 362–364 (2012).
[CrossRef] [PubMed]

R. Neutze, R. Wouts, D. van der Spoel, E. Weckert, J. Hajdu, “Potential for biomolecular imaging with femtosecond X-ray pulses,” Nature 406(6797), 752–757 (2000).
[CrossRef] [PubMed]

Nikolov, I.

E. Allaria, R. Appio, L. Badano, W. A. Barletta, S. Bassanese, S. G. Biedron, A. Borga, E. Busetto, D. Castronovo, P. Cinquegrana, S. Cleva, D. Cocco, M. Cornacchia, P. Craievich, I. Cudin, G. D’Auria, M. Dal Forno, M. B. Danailov, R. De Monte, G. De Ninno, P. Delgiusto, A. Demidovich, S. Di Mitri, B. Diviacco, A. Fabris, R. Fabris, W. Fawley, M. Ferianis, E. Ferrari, S. Ferry, L. Froehlich, P. Furlan, G. Gaio, F. Gelmetti, L. Giannessi, M. Giannini, R. Gobessi, R. Ivanov, E. Karantzoulis, M. Lonza, A. Lutman, B. Mahieu, M. Milloch, S. V. Milton, M. Musardo, I. Nikolov, S. Noe, F. Parmigiani, G. Penco, M. Petronio, L. Pivetta, M. Predonzani, F. Rossi, L. Rumiz, A. Salom, C. Scafuri, C. Serpico, P. Sigalotti, S. Spampinati, C. Spezzani, M. Svandrlik, C. Svetina, S. Tazzari, M. Trovo, R. Umer, A. Vascotto, M. Veronese, R. Visintini, M. Zaccaria, D. Zangrando, M. Zangrando, “Highly coherent and stable pulses from the FERMI seeded free-electron laser in the extreme ultraviolet,” Nat. Photonics 6(10), 699–704 (2012).
[CrossRef]

Nilsson, B.

M. M. Seibert, T. Ekeberg, F. R. N. C. Maia, M. Svenda, J. Andreasson, O. Jönsson, D. Odić, B. Iwan, A. Rocker, D. Westphal, M. Hantke, D. P. DePonte, A. Barty, J. Schulz, L. Gumprecht, N. Coppola, A. Aquila, M. Liang, T. A. White, A. Martin, C. Caleman, S. Stern, C. Abergel, V. Seltzer, J. M. Claverie, C. Bostedt, J. D. Bozek, S. Boutet, A. A. Miahnahri, M. Messerschmidt, J. Krzywinski, G. Williams, K. O. Hodgson, M. J. Bogan, C. Y. Hampton, R. G. Sierra, D. Starodub, I. Andersson, S. Bajt, M. Barthelmess, J. C. H. Spence, P. Fromme, U. Weierstall, R. Kirian, M. Hunter, R. B. Doak, S. Marchesini, S. P. Hau-Riege, M. Frank, R. L. Shoeman, L. Lomb, S. W. Epp, R. Hartmann, D. Rolles, A. Rudenko, C. Schmidt, L. Foucar, N. Kimmel, P. Holl, B. Rudek, B. Erk, A. Hömke, C. Reich, D. Pietschner, G. Weidenspointner, L. Strüder, G. Hauser, H. Gorke, J. Ullrich, I. Schlichting, S. Herrmann, G. Schaller, F. Schopper, H. Soltau, K. U. Kühnel, R. Andritschke, C. D. Schröter, F. Krasniqi, M. Bott, S. Schorb, D. Rupp, M. Adolph, T. Gorkhover, H. Hirsemann, G. Potdevin, H. Graafsma, B. Nilsson, H. N. Chapman, J. Hajdu, “Single mimivirus particles intercepted and imaged with an X-ray laser,” Nature 470(7332), 78–81 (2011).
[CrossRef] [PubMed]

Nisius, T.

A. P. Mancuso, T. Gorniak, F. Staier, O. M. Yefanov, R. Barth, C. Christophis, B. Reime, J. Gulden, A. Singer, M. E. Pettit, T. Nisius, T. Wilhein, C. Gutt, G. Grübel, N. Guerassimova, R. Treusch, J. Feldhaus, S. Eisebitt, E. Weckert, M. Grunze, A. Rosenhahn, I. A. Vartanyants, “Coherent imaging of biological samples with femtosecond pulses at the free-electron laser FLASH,” New J. Phys. 12(3), 035003 (2010).
[CrossRef]

Noe, S.

E. Allaria, R. Appio, L. Badano, W. A. Barletta, S. Bassanese, S. G. Biedron, A. Borga, E. Busetto, D. Castronovo, P. Cinquegrana, S. Cleva, D. Cocco, M. Cornacchia, P. Craievich, I. Cudin, G. D’Auria, M. Dal Forno, M. B. Danailov, R. De Monte, G. De Ninno, P. Delgiusto, A. Demidovich, S. Di Mitri, B. Diviacco, A. Fabris, R. Fabris, W. Fawley, M. Ferianis, E. Ferrari, S. Ferry, L. Froehlich, P. Furlan, G. Gaio, F. Gelmetti, L. Giannessi, M. Giannini, R. Gobessi, R. Ivanov, E. Karantzoulis, M. Lonza, A. Lutman, B. Mahieu, M. Milloch, S. V. Milton, M. Musardo, I. Nikolov, S. Noe, F. Parmigiani, G. Penco, M. Petronio, L. Pivetta, M. Predonzani, F. Rossi, L. Rumiz, A. Salom, C. Scafuri, C. Serpico, P. Sigalotti, S. Spampinati, C. Spezzani, M. Svandrlik, C. Svetina, S. Tazzari, M. Trovo, R. Umer, A. Vascotto, M. Veronese, R. Visintini, M. Zaccaria, D. Zangrando, M. Zangrando, “Highly coherent and stable pulses from the FERMI seeded free-electron laser in the extreme ultraviolet,” Nat. Photonics 6(10), 699–704 (2012).
[CrossRef]

Noy, A.

H. N. Chapman, A. Barty, S. Marchesini, A. Noy, S. P. Hau-Riege, C. Cui, M. R. Howells, R. Rosen, H. He, J. C. H. Spence, U. Weierstall, T. Beetz, C. Jacobsen, D. Shapiro, “High-resolution ab initio three-dimensional x-ray diffraction microscopy,” J. Opt. Soc. Am. A 23(5), 1179 (2006).
[CrossRef]

S. Marchesini, H. He, H. N. Chapman, S. P. Hau-Riege, A. Noy, M. R. Howells, U. Weierstall, J. C. H. Spence, “X-ray image reconstruction from a diffraction pattern alone,” Phys. Rev. B 68(14), 140101 (2003).
[CrossRef]

Odic, D.

M. M. Seibert, T. Ekeberg, F. R. N. C. Maia, M. Svenda, J. Andreasson, O. Jönsson, D. Odić, B. Iwan, A. Rocker, D. Westphal, M. Hantke, D. P. DePonte, A. Barty, J. Schulz, L. Gumprecht, N. Coppola, A. Aquila, M. Liang, T. A. White, A. Martin, C. Caleman, S. Stern, C. Abergel, V. Seltzer, J. M. Claverie, C. Bostedt, J. D. Bozek, S. Boutet, A. A. Miahnahri, M. Messerschmidt, J. Krzywinski, G. Williams, K. O. Hodgson, M. J. Bogan, C. Y. Hampton, R. G. Sierra, D. Starodub, I. Andersson, S. Bajt, M. Barthelmess, J. C. H. Spence, P. Fromme, U. Weierstall, R. Kirian, M. Hunter, R. B. Doak, S. Marchesini, S. P. Hau-Riege, M. Frank, R. L. Shoeman, L. Lomb, S. W. Epp, R. Hartmann, D. Rolles, A. Rudenko, C. Schmidt, L. Foucar, N. Kimmel, P. Holl, B. Rudek, B. Erk, A. Hömke, C. Reich, D. Pietschner, G. Weidenspointner, L. Strüder, G. Hauser, H. Gorke, J. Ullrich, I. Schlichting, S. Herrmann, G. Schaller, F. Schopper, H. Soltau, K. U. Kühnel, R. Andritschke, C. D. Schröter, F. Krasniqi, M. Bott, S. Schorb, D. Rupp, M. Adolph, T. Gorkhover, H. Hirsemann, G. Potdevin, H. Graafsma, B. Nilsson, H. N. Chapman, J. Hajdu, “Single mimivirus particles intercepted and imaged with an X-ray laser,” Nature 470(7332), 78–81 (2011).
[CrossRef] [PubMed]

Ourmazd, A.

Parmigiani, F.

E. Allaria, R. Appio, L. Badano, W. A. Barletta, S. Bassanese, S. G. Biedron, A. Borga, E. Busetto, D. Castronovo, P. Cinquegrana, S. Cleva, D. Cocco, M. Cornacchia, P. Craievich, I. Cudin, G. D’Auria, M. Dal Forno, M. B. Danailov, R. De Monte, G. De Ninno, P. Delgiusto, A. Demidovich, S. Di Mitri, B. Diviacco, A. Fabris, R. Fabris, W. Fawley, M. Ferianis, E. Ferrari, S. Ferry, L. Froehlich, P. Furlan, G. Gaio, F. Gelmetti, L. Giannessi, M. Giannini, R. Gobessi, R. Ivanov, E. Karantzoulis, M. Lonza, A. Lutman, B. Mahieu, M. Milloch, S. V. Milton, M. Musardo, I. Nikolov, S. Noe, F. Parmigiani, G. Penco, M. Petronio, L. Pivetta, M. Predonzani, F. Rossi, L. Rumiz, A. Salom, C. Scafuri, C. Serpico, P. Sigalotti, S. Spampinati, C. Spezzani, M. Svandrlik, C. Svetina, S. Tazzari, M. Trovo, R. Umer, A. Vascotto, M. Veronese, R. Visintini, M. Zaccaria, D. Zangrando, M. Zangrando, “Highly coherent and stable pulses from the FERMI seeded free-electron laser in the extreme ultraviolet,” Nat. Photonics 6(10), 699–704 (2012).
[CrossRef]

Passos, G.

F. Capotondi, E. Pedersoli, N. Mahne, R. H. Menk, G. Passos, L. Raimondi, C. Svetina, G. Sandrin, M. Zangrando, M. Kiskinova, S. Bajt, M. Barthelmess, H. Fleckenstein, H. N. Chapman, J. Schulz, J. Bach, R. Frömter, S. Schleitzer, L. Müller, C. Gutt, G. Grübel, “Invited article: Coherent imaging using seeded free-electron laser pulses with variable polarization: First results and research opportunities,” Rev. Sci. Instrum. 84(5), 051301 (2013).
[CrossRef] [PubMed]

Pedersoli, E.

Penco, G.

E. Allaria, R. Appio, L. Badano, W. A. Barletta, S. Bassanese, S. G. Biedron, A. Borga, E. Busetto, D. Castronovo, P. Cinquegrana, S. Cleva, D. Cocco, M. Cornacchia, P. Craievich, I. Cudin, G. D’Auria, M. Dal Forno, M. B. Danailov, R. De Monte, G. De Ninno, P. Delgiusto, A. Demidovich, S. Di Mitri, B. Diviacco, A. Fabris, R. Fabris, W. Fawley, M. Ferianis, E. Ferrari, S. Ferry, L. Froehlich, P. Furlan, G. Gaio, F. Gelmetti, L. Giannessi, M. Giannini, R. Gobessi, R. Ivanov, E. Karantzoulis, M. Lonza, A. Lutman, B. Mahieu, M. Milloch, S. V. Milton, M. Musardo, I. Nikolov, S. Noe, F. Parmigiani, G. Penco, M. Petronio, L. Pivetta, M. Predonzani, F. Rossi, L. Rumiz, A. Salom, C. Scafuri, C. Serpico, P. Sigalotti, S. Spampinati, C. Spezzani, M. Svandrlik, C. Svetina, S. Tazzari, M. Trovo, R. Umer, A. Vascotto, M. Veronese, R. Visintini, M. Zaccaria, D. Zangrando, M. Zangrando, “Highly coherent and stable pulses from the FERMI seeded free-electron laser in the extreme ultraviolet,” Nat. Photonics 6(10), 699–704 (2012).
[CrossRef]

Penczek, P. A.

P. A. Penczek, M. Kimmel, C. M. T. Spahn, “Identifying conformational states of macromolecules by eigen-analysis of resampled cryo-EM images,” Structure 19(11), 1582–1590 (2011).
[CrossRef] [PubMed]

Petronio, M.

E. Allaria, R. Appio, L. Badano, W. A. Barletta, S. Bassanese, S. G. Biedron, A. Borga, E. Busetto, D. Castronovo, P. Cinquegrana, S. Cleva, D. Cocco, M. Cornacchia, P. Craievich, I. Cudin, G. D’Auria, M. Dal Forno, M. B. Danailov, R. De Monte, G. De Ninno, P. Delgiusto, A. Demidovich, S. Di Mitri, B. Diviacco, A. Fabris, R. Fabris, W. Fawley, M. Ferianis, E. Ferrari, S. Ferry, L. Froehlich, P. Furlan, G. Gaio, F. Gelmetti, L. Giannessi, M. Giannini, R. Gobessi, R. Ivanov, E. Karantzoulis, M. Lonza, A. Lutman, B. Mahieu, M. Milloch, S. V. Milton, M. Musardo, I. Nikolov, S. Noe, F. Parmigiani, G. Penco, M. Petronio, L. Pivetta, M. Predonzani, F. Rossi, L. Rumiz, A. Salom, C. Scafuri, C. Serpico, P. Sigalotti, S. Spampinati, C. Spezzani, M. Svandrlik, C. Svetina, S. Tazzari, M. Trovo, R. Umer, A. Vascotto, M. Veronese, R. Visintini, M. Zaccaria, D. Zangrando, M. Zangrando, “Highly coherent and stable pulses from the FERMI seeded free-electron laser in the extreme ultraviolet,” Nat. Photonics 6(10), 699–704 (2012).
[CrossRef]

Pettit, M. E.

A. P. Mancuso, T. Gorniak, F. Staier, O. M. Yefanov, R. Barth, C. Christophis, B. Reime, J. Gulden, A. Singer, M. E. Pettit, T. Nisius, T. Wilhein, C. Gutt, G. Grübel, N. Guerassimova, R. Treusch, J. Feldhaus, S. Eisebitt, E. Weckert, M. Grunze, A. Rosenhahn, I. A. Vartanyants, “Coherent imaging of biological samples with femtosecond pulses at the free-electron laser FLASH,” New J. Phys. 12(3), 035003 (2010).
[CrossRef]

Philipp, H. T.

S. Boutet, L. Lomb, G. J. Williams, T. R. M. Barends, A. Aquila, R. B. Doak, U. Weierstall, D. P. DePonte, J. Steinbrener, R. L. Shoeman, M. Messerschmidt, A. Barty, T. A. White, S. Kassemeyer, R. A. Kirian, M. M. Seibert, P. A. Montanez, C. Kenney, R. Herbst, P. Hart, J. Pines, G. Haller, S. M. Gruner, H. T. Philipp, M. W. Tate, M. Hromalik, L. J. Koerner, N. van Bakel, J. Morse, W. Ghonsalves, D. Arnlund, M. J. Bogan, C. Caleman, R. Fromme, C. Y. Hampton, M. S. Hunter, L. C. Johansson, G. Katona, C. Kupitz, M. Liang, A. V. Martin, K. Nass, L. Redecke, F. Stellato, N. Timneanu, D. Wang, N. A. Zatsepin, D. Schafer, J. Defever, R. Neutze, P. Fromme, J. C. H. Spence, H. N. Chapman, I. Schlichting, “High-resolution protein structure determination by serial femtosecond crystallography,” Science 337(6092), 362–364 (2012).
[CrossRef] [PubMed]

Phillips, G. N.

P. Schwander, R. Fung, G. N. Phillips, A. Ourmazd, “Mapping the conformations of biological assemblies,” New J. Phys. 12(3), 035007 (2010).
[CrossRef]

Pietschner, D.

M. M. Seibert, T. Ekeberg, F. R. N. C. Maia, M. Svenda, J. Andreasson, O. Jönsson, D. Odić, B. Iwan, A. Rocker, D. Westphal, M. Hantke, D. P. DePonte, A. Barty, J. Schulz, L. Gumprecht, N. Coppola, A. Aquila, M. Liang, T. A. White, A. Martin, C. Caleman, S. Stern, C. Abergel, V. Seltzer, J. M. Claverie, C. Bostedt, J. D. Bozek, S. Boutet, A. A. Miahnahri, M. Messerschmidt, J. Krzywinski, G. Williams, K. O. Hodgson, M. J. Bogan, C. Y. Hampton, R. G. Sierra, D. Starodub, I. Andersson, S. Bajt, M. Barthelmess, J. C. H. Spence, P. Fromme, U. Weierstall, R. Kirian, M. Hunter, R. B. Doak, S. Marchesini, S. P. Hau-Riege, M. Frank, R. L. Shoeman, L. Lomb, S. W. Epp, R. Hartmann, D. Rolles, A. Rudenko, C. Schmidt, L. Foucar, N. Kimmel, P. Holl, B. Rudek, B. Erk, A. Hömke, C. Reich, D. Pietschner, G. Weidenspointner, L. Strüder, G. Hauser, H. Gorke, J. Ullrich, I. Schlichting, S. Herrmann, G. Schaller, F. Schopper, H. Soltau, K. U. Kühnel, R. Andritschke, C. D. Schröter, F. Krasniqi, M. Bott, S. Schorb, D. Rupp, M. Adolph, T. Gorkhover, H. Hirsemann, G. Potdevin, H. Graafsma, B. Nilsson, H. N. Chapman, J. Hajdu, “Single mimivirus particles intercepted and imaged with an X-ray laser,” Nature 470(7332), 78–81 (2011).
[CrossRef] [PubMed]

Pines, J.

S. Boutet, L. Lomb, G. J. Williams, T. R. M. Barends, A. Aquila, R. B. Doak, U. Weierstall, D. P. DePonte, J. Steinbrener, R. L. Shoeman, M. Messerschmidt, A. Barty, T. A. White, S. Kassemeyer, R. A. Kirian, M. M. Seibert, P. A. Montanez, C. Kenney, R. Herbst, P. Hart, J. Pines, G. Haller, S. M. Gruner, H. T. Philipp, M. W. Tate, M. Hromalik, L. J. Koerner, N. van Bakel, J. Morse, W. Ghonsalves, D. Arnlund, M. J. Bogan, C. Caleman, R. Fromme, C. Y. Hampton, M. S. Hunter, L. C. Johansson, G. Katona, C. Kupitz, M. Liang, A. V. Martin, K. Nass, L. Redecke, F. Stellato, N. Timneanu, D. Wang, N. A. Zatsepin, D. Schafer, J. Defever, R. Neutze, P. Fromme, J. C. H. Spence, H. N. Chapman, I. Schlichting, “High-resolution protein structure determination by serial femtosecond crystallography,” Science 337(6092), 362–364 (2012).
[CrossRef] [PubMed]

Pivetta, L.

E. Allaria, R. Appio, L. Badano, W. A. Barletta, S. Bassanese, S. G. Biedron, A. Borga, E. Busetto, D. Castronovo, P. Cinquegrana, S. Cleva, D. Cocco, M. Cornacchia, P. Craievich, I. Cudin, G. D’Auria, M. Dal Forno, M. B. Danailov, R. De Monte, G. De Ninno, P. Delgiusto, A. Demidovich, S. Di Mitri, B. Diviacco, A. Fabris, R. Fabris, W. Fawley, M. Ferianis, E. Ferrari, S. Ferry, L. Froehlich, P. Furlan, G. Gaio, F. Gelmetti, L. Giannessi, M. Giannini, R. Gobessi, R. Ivanov, E. Karantzoulis, M. Lonza, A. Lutman, B. Mahieu, M. Milloch, S. V. Milton, M. Musardo, I. Nikolov, S. Noe, F. Parmigiani, G. Penco, M. Petronio, L. Pivetta, M. Predonzani, F. Rossi, L. Rumiz, A. Salom, C. Scafuri, C. Serpico, P. Sigalotti, S. Spampinati, C. Spezzani, M. Svandrlik, C. Svetina, S. Tazzari, M. Trovo, R. Umer, A. Vascotto, M. Veronese, R. Visintini, M. Zaccaria, D. Zangrando, M. Zangrando, “Highly coherent and stable pulses from the FERMI seeded free-electron laser in the extreme ultraviolet,” Nat. Photonics 6(10), 699–704 (2012).
[CrossRef]

Plönjes, E.

H. N. Chapman, A. Barty, M. J. Bogan, S. Boutet, M. Frank, S. P. Hau-Riege, S. Marchesini, B. W. Woods, S. Bajt, W. H. Benner, R. A. London, E. Plönjes, M. Kuhlmann, R. Treusch, S. Düsterer, T. Tschentscher, J. R. Schneider, E. Spiller, T. Möller, C. Bostedt, M. Hoener, D. A. Shapiro, K. O. Hodgson, D. van der Spoel, F. Burmeister, M. Bergh, C. Caleman, G. Huldt, M. M. Seibert, F. R. N. C. Maia, R. W. Lee, A. Szöke, N. Timneanu, J. Hajdu, “Femtosecond diffractive imaging with a soft-X-ray free-electron laser,” Nat. Phys. 2(12), 839–843 (2006).
[CrossRef]

Potdevin, G.

M. M. Seibert, T. Ekeberg, F. R. N. C. Maia, M. Svenda, J. Andreasson, O. Jönsson, D. Odić, B. Iwan, A. Rocker, D. Westphal, M. Hantke, D. P. DePonte, A. Barty, J. Schulz, L. Gumprecht, N. Coppola, A. Aquila, M. Liang, T. A. White, A. Martin, C. Caleman, S. Stern, C. Abergel, V. Seltzer, J. M. Claverie, C. Bostedt, J. D. Bozek, S. Boutet, A. A. Miahnahri, M. Messerschmidt, J. Krzywinski, G. Williams, K. O. Hodgson, M. J. Bogan, C. Y. Hampton, R. G. Sierra, D. Starodub, I. Andersson, S. Bajt, M. Barthelmess, J. C. H. Spence, P. Fromme, U. Weierstall, R. Kirian, M. Hunter, R. B. Doak, S. Marchesini, S. P. Hau-Riege, M. Frank, R. L. Shoeman, L. Lomb, S. W. Epp, R. Hartmann, D. Rolles, A. Rudenko, C. Schmidt, L. Foucar, N. Kimmel, P. Holl, B. Rudek, B. Erk, A. Hömke, C. Reich, D. Pietschner, G. Weidenspointner, L. Strüder, G. Hauser, H. Gorke, J. Ullrich, I. Schlichting, S. Herrmann, G. Schaller, F. Schopper, H. Soltau, K. U. Kühnel, R. Andritschke, C. D. Schröter, F. Krasniqi, M. Bott, S. Schorb, D. Rupp, M. Adolph, T. Gorkhover, H. Hirsemann, G. Potdevin, H. Graafsma, B. Nilsson, H. N. Chapman, J. Hajdu, “Single mimivirus particles intercepted and imaged with an X-ray laser,” Nature 470(7332), 78–81 (2011).
[CrossRef] [PubMed]

Predonzani, M.

E. Allaria, R. Appio, L. Badano, W. A. Barletta, S. Bassanese, S. G. Biedron, A. Borga, E. Busetto, D. Castronovo, P. Cinquegrana, S. Cleva, D. Cocco, M. Cornacchia, P. Craievich, I. Cudin, G. D’Auria, M. Dal Forno, M. B. Danailov, R. De Monte, G. De Ninno, P. Delgiusto, A. Demidovich, S. Di Mitri, B. Diviacco, A. Fabris, R. Fabris, W. Fawley, M. Ferianis, E. Ferrari, S. Ferry, L. Froehlich, P. Furlan, G. Gaio, F. Gelmetti, L. Giannessi, M. Giannini, R. Gobessi, R. Ivanov, E. Karantzoulis, M. Lonza, A. Lutman, B. Mahieu, M. Milloch, S. V. Milton, M. Musardo, I. Nikolov, S. Noe, F. Parmigiani, G. Penco, M. Petronio, L. Pivetta, M. Predonzani, F. Rossi, L. Rumiz, A. Salom, C. Scafuri, C. Serpico, P. Sigalotti, S. Spampinati, C. Spezzani, M. Svandrlik, C. Svetina, S. Tazzari, M. Trovo, R. Umer, A. Vascotto, M. Veronese, R. Visintini, M. Zaccaria, D. Zangrando, M. Zangrando, “Highly coherent and stable pulses from the FERMI seeded free-electron laser in the extreme ultraviolet,” Nat. Photonics 6(10), 699–704 (2012).
[CrossRef]

Raimondi, L.

F. Capotondi, E. Pedersoli, N. Mahne, R. H. Menk, G. Passos, L. Raimondi, C. Svetina, G. Sandrin, M. Zangrando, M. Kiskinova, S. Bajt, M. Barthelmess, H. Fleckenstein, H. N. Chapman, J. Schulz, J. Bach, R. Frömter, S. Schleitzer, L. Müller, C. Gutt, G. Grübel, “Invited article: Coherent imaging using seeded free-electron laser pulses with variable polarization: First results and research opportunities,” Rev. Sci. Instrum. 84(5), 051301 (2013).
[CrossRef] [PubMed]

Redecke, L.

L. Redecke, K. Nass, D. P. DePonte, T. A. White, D. Rehders, A. Barty, F. Stellato, M. Liang, T. R. M. Barends, S. Boutet, G. J. Williams, M. Messerschmidt, M. M. Seibert, A. Aquila, D. Arnlund, S. Bajt, T. Barth, M. J. Bogan, C. Caleman, T. C. Chao, R. B. Doak, H. Fleckenstein, M. Frank, R. Fromme, L. Galli, I. Grotjohann, M. S. Hunter, L. C. Johansson, S. Kassemeyer, G. Katona, R. A. Kirian, R. Koopmann, C. Kupitz, L. Lomb, A. V. Martin, S. Mogk, R. Neutze, R. L. Shoeman, J. Steinbrener, N. Timneanu, D. Wang, U. Weierstall, N. A. Zatsepin, J. C. H. Spence, P. Fromme, I. Schlichting, M. Duszenko, C. Betzel, H. N. Chapman, “Natively inhibited Trypanosoma brucei Cathepsin B structure determined by using an X-ray laser,” Science 339(6116), 227–230 (2013).
[CrossRef] [PubMed]

S. Boutet, L. Lomb, G. J. Williams, T. R. M. Barends, A. Aquila, R. B. Doak, U. Weierstall, D. P. DePonte, J. Steinbrener, R. L. Shoeman, M. Messerschmidt, A. Barty, T. A. White, S. Kassemeyer, R. A. Kirian, M. M. Seibert, P. A. Montanez, C. Kenney, R. Herbst, P. Hart, J. Pines, G. Haller, S. M. Gruner, H. T. Philipp, M. W. Tate, M. Hromalik, L. J. Koerner, N. van Bakel, J. Morse, W. Ghonsalves, D. Arnlund, M. J. Bogan, C. Caleman, R. Fromme, C. Y. Hampton, M. S. Hunter, L. C. Johansson, G. Katona, C. Kupitz, M. Liang, A. V. Martin, K. Nass, L. Redecke, F. Stellato, N. Timneanu, D. Wang, N. A. Zatsepin, D. Schafer, J. Defever, R. Neutze, P. Fromme, J. C. H. Spence, H. N. Chapman, I. Schlichting, “High-resolution protein structure determination by serial femtosecond crystallography,” Science 337(6092), 362–364 (2012).
[CrossRef] [PubMed]

Rehders, D.

L. Redecke, K. Nass, D. P. DePonte, T. A. White, D. Rehders, A. Barty, F. Stellato, M. Liang, T. R. M. Barends, S. Boutet, G. J. Williams, M. Messerschmidt, M. M. Seibert, A. Aquila, D. Arnlund, S. Bajt, T. Barth, M. J. Bogan, C. Caleman, T. C. Chao, R. B. Doak, H. Fleckenstein, M. Frank, R. Fromme, L. Galli, I. Grotjohann, M. S. Hunter, L. C. Johansson, S. Kassemeyer, G. Katona, R. A. Kirian, R. Koopmann, C. Kupitz, L. Lomb, A. V. Martin, S. Mogk, R. Neutze, R. L. Shoeman, J. Steinbrener, N. Timneanu, D. Wang, U. Weierstall, N. A. Zatsepin, J. C. H. Spence, P. Fromme, I. Schlichting, M. Duszenko, C. Betzel, H. N. Chapman, “Natively inhibited Trypanosoma brucei Cathepsin B structure determined by using an X-ray laser,” Science 339(6116), 227–230 (2013).
[CrossRef] [PubMed]

Reich, C.

M. M. Seibert, T. Ekeberg, F. R. N. C. Maia, M. Svenda, J. Andreasson, O. Jönsson, D. Odić, B. Iwan, A. Rocker, D. Westphal, M. Hantke, D. P. DePonte, A. Barty, J. Schulz, L. Gumprecht, N. Coppola, A. Aquila, M. Liang, T. A. White, A. Martin, C. Caleman, S. Stern, C. Abergel, V. Seltzer, J. M. Claverie, C. Bostedt, J. D. Bozek, S. Boutet, A. A. Miahnahri, M. Messerschmidt, J. Krzywinski, G. Williams, K. O. Hodgson, M. J. Bogan, C. Y. Hampton, R. G. Sierra, D. Starodub, I. Andersson, S. Bajt, M. Barthelmess, J. C. H. Spence, P. Fromme, U. Weierstall, R. Kirian, M. Hunter, R. B. Doak, S. Marchesini, S. P. Hau-Riege, M. Frank, R. L. Shoeman, L. Lomb, S. W. Epp, R. Hartmann, D. Rolles, A. Rudenko, C. Schmidt, L. Foucar, N. Kimmel, P. Holl, B. Rudek, B. Erk, A. Hömke, C. Reich, D. Pietschner, G. Weidenspointner, L. Strüder, G. Hauser, H. Gorke, J. Ullrich, I. Schlichting, S. Herrmann, G. Schaller, F. Schopper, H. Soltau, K. U. Kühnel, R. Andritschke, C. D. Schröter, F. Krasniqi, M. Bott, S. Schorb, D. Rupp, M. Adolph, T. Gorkhover, H. Hirsemann, G. Potdevin, H. Graafsma, B. Nilsson, H. N. Chapman, J. Hajdu, “Single mimivirus particles intercepted and imaged with an X-ray laser,” Nature 470(7332), 78–81 (2011).
[CrossRef] [PubMed]

C. H. Yoon, P. Schwander, C. Abergel, I. Andersson, J. Andreasson, A. Aquila, S. Bajt, M. Barthelmess, A. Barty, M. J. Bogan, C. Bostedt, J. Bozek, H. N. Chapman, J. M. Claverie, N. Coppola, D. P. DePonte, T. Ekeberg, S. W. Epp, B. Erk, H. Fleckenstein, L. Foucar, H. Graafsma, L. Gumprecht, J. Hajdu, C. Y. Hampton, A. Hartmann, E. Hartmann, R. Hartmann, G. Hauser, H. Hirsemann, P. Holl, S. Kassemeyer, N. Kimmel, M. Kiskinova, M. Liang, N. T. D. Loh, L. Lomb, F. R. N. C. Maia, A. V. Martin, K. Nass, E. Pedersoli, C. Reich, D. Rolles, B. Rudek, A. Rudenko, I. Schlichting, J. Schulz, M. Seibert, V. Seltzer, R. L. Shoeman, R. G. Sierra, H. Soltau, D. Starodub, J. Steinbrener, G. Stier, L. Strüder, M. Svenda, J. Ullrich, G. Weidenspointner, T. A. White, C. Wunderer, A. Ourmazd, “Unsupervised classification of single-particle X-ray diffraction snapshots by spectral clustering,” Opt. Express 19(17), 16542–16549 (2011).
[CrossRef] [PubMed]

Reime, B.

A. P. Mancuso, T. Gorniak, F. Staier, O. M. Yefanov, R. Barth, C. Christophis, B. Reime, J. Gulden, A. Singer, M. E. Pettit, T. Nisius, T. Wilhein, C. Gutt, G. Grübel, N. Guerassimova, R. Treusch, J. Feldhaus, S. Eisebitt, E. Weckert, M. Grunze, A. Rosenhahn, I. A. Vartanyants, “Coherent imaging of biological samples with femtosecond pulses at the free-electron laser FLASH,” New J. Phys. 12(3), 035003 (2010).
[CrossRef]

Rocker, A.

M. M. Seibert, T. Ekeberg, F. R. N. C. Maia, M. Svenda, J. Andreasson, O. Jönsson, D. Odić, B. Iwan, A. Rocker, D. Westphal, M. Hantke, D. P. DePonte, A. Barty, J. Schulz, L. Gumprecht, N. Coppola, A. Aquila, M. Liang, T. A. White, A. Martin, C. Caleman, S. Stern, C. Abergel, V. Seltzer, J. M. Claverie, C. Bostedt, J. D. Bozek, S. Boutet, A. A. Miahnahri, M. Messerschmidt, J. Krzywinski, G. Williams, K. O. Hodgson, M. J. Bogan, C. Y. Hampton, R. G. Sierra, D. Starodub, I. Andersson, S. Bajt, M. Barthelmess, J. C. H. Spence, P. Fromme, U. Weierstall, R. Kirian, M. Hunter, R. B. Doak, S. Marchesini, S. P. Hau-Riege, M. Frank, R. L. Shoeman, L. Lomb, S. W. Epp, R. Hartmann, D. Rolles, A. Rudenko, C. Schmidt, L. Foucar, N. Kimmel, P. Holl, B. Rudek, B. Erk, A. Hömke, C. Reich, D. Pietschner, G. Weidenspointner, L. Strüder, G. Hauser, H. Gorke, J. Ullrich, I. Schlichting, S. Herrmann, G. Schaller, F. Schopper, H. Soltau, K. U. Kühnel, R. Andritschke, C. D. Schröter, F. Krasniqi, M. Bott, S. Schorb, D. Rupp, M. Adolph, T. Gorkhover, H. Hirsemann, G. Potdevin, H. Graafsma, B. Nilsson, H. N. Chapman, J. Hajdu, “Single mimivirus particles intercepted and imaged with an X-ray laser,” Nature 470(7332), 78–81 (2011).
[CrossRef] [PubMed]

Rolles, D.

M. M. Seibert, T. Ekeberg, F. R. N. C. Maia, M. Svenda, J. Andreasson, O. Jönsson, D. Odić, B. Iwan, A. Rocker, D. Westphal, M. Hantke, D. P. DePonte, A. Barty, J. Schulz, L. Gumprecht, N. Coppola, A. Aquila, M. Liang, T. A. White, A. Martin, C. Caleman, S. Stern, C. Abergel, V. Seltzer, J. M. Claverie, C. Bostedt, J. D. Bozek, S. Boutet, A. A. Miahnahri, M. Messerschmidt, J. Krzywinski, G. Williams, K. O. Hodgson, M. J. Bogan, C. Y. Hampton, R. G. Sierra, D. Starodub, I. Andersson, S. Bajt, M. Barthelmess, J. C. H. Spence, P. Fromme, U. Weierstall, R. Kirian, M. Hunter, R. B. Doak, S. Marchesini, S. P. Hau-Riege, M. Frank, R. L. Shoeman, L. Lomb, S. W. Epp, R. Hartmann, D. Rolles, A. Rudenko, C. Schmidt, L. Foucar, N. Kimmel, P. Holl, B. Rudek, B. Erk, A. Hömke, C. Reich, D. Pietschner, G. Weidenspointner, L. Strüder, G. Hauser, H. Gorke, J. Ullrich, I. Schlichting, S. Herrmann, G. Schaller, F. Schopper, H. Soltau, K. U. Kühnel, R. Andritschke, C. D. Schröter, F. Krasniqi, M. Bott, S. Schorb, D. Rupp, M. Adolph, T. Gorkhover, H. Hirsemann, G. Potdevin, H. Graafsma, B. Nilsson, H. N. Chapman, J. Hajdu, “Single mimivirus particles intercepted and imaged with an X-ray laser,” Nature 470(7332), 78–81 (2011).
[CrossRef] [PubMed]

C. H. Yoon, P. Schwander, C. Abergel, I. Andersson, J. Andreasson, A. Aquila, S. Bajt, M. Barthelmess, A. Barty, M. J. Bogan, C. Bostedt, J. Bozek, H. N. Chapman, J. M. Claverie, N. Coppola, D. P. DePonte, T. Ekeberg, S. W. Epp, B. Erk, H. Fleckenstein, L. Foucar, H. Graafsma, L. Gumprecht, J. Hajdu, C. Y. Hampton, A. Hartmann, E. Hartmann, R. Hartmann, G. Hauser, H. Hirsemann, P. Holl, S. Kassemeyer, N. Kimmel, M. Kiskinova, M. Liang, N. T. D. Loh, L. Lomb, F. R. N. C. Maia, A. V. Martin, K. Nass, E. Pedersoli, C. Reich, D. Rolles, B. Rudek, A. Rudenko, I. Schlichting, J. Schulz, M. Seibert, V. Seltzer, R. L. Shoeman, R. G. Sierra, H. Soltau, D. Starodub, J. Steinbrener, G. Stier, L. Strüder, M. Svenda, J. Ullrich, G. Weidenspointner, T. A. White, C. Wunderer, A. Ourmazd, “Unsupervised classification of single-particle X-ray diffraction snapshots by spectral clustering,” Opt. Express 19(17), 16542–16549 (2011).
[CrossRef] [PubMed]

Rosen, R.

Rosenhahn, A.

A. P. Mancuso, T. Gorniak, F. Staier, O. M. Yefanov, R. Barth, C. Christophis, B. Reime, J. Gulden, A. Singer, M. E. Pettit, T. Nisius, T. Wilhein, C. Gutt, G. Grübel, N. Guerassimova, R. Treusch, J. Feldhaus, S. Eisebitt, E. Weckert, M. Grunze, A. Rosenhahn, I. A. Vartanyants, “Coherent imaging of biological samples with femtosecond pulses at the free-electron laser FLASH,” New J. Phys. 12(3), 035003 (2010).
[CrossRef]

Rossi, F.

E. Allaria, R. Appio, L. Badano, W. A. Barletta, S. Bassanese, S. G. Biedron, A. Borga, E. Busetto, D. Castronovo, P. Cinquegrana, S. Cleva, D. Cocco, M. Cornacchia, P. Craievich, I. Cudin, G. D’Auria, M. Dal Forno, M. B. Danailov, R. De Monte, G. De Ninno, P. Delgiusto, A. Demidovich, S. Di Mitri, B. Diviacco, A. Fabris, R. Fabris, W. Fawley, M. Ferianis, E. Ferrari, S. Ferry, L. Froehlich, P. Furlan, G. Gaio, F. Gelmetti, L. Giannessi, M. Giannini, R. Gobessi, R. Ivanov, E. Karantzoulis, M. Lonza, A. Lutman, B. Mahieu, M. Milloch, S. V. Milton, M. Musardo, I. Nikolov, S. Noe, F. Parmigiani, G. Penco, M. Petronio, L. Pivetta, M. Predonzani, F. Rossi, L. Rumiz, A. Salom, C. Scafuri, C. Serpico, P. Sigalotti, S. Spampinati, C. Spezzani, M. Svandrlik, C. Svetina, S. Tazzari, M. Trovo, R. Umer, A. Vascotto, M. Veronese, R. Visintini, M. Zaccaria, D. Zangrando, M. Zangrando, “Highly coherent and stable pulses from the FERMI seeded free-electron laser in the extreme ultraviolet,” Nat. Photonics 6(10), 699–704 (2012).
[CrossRef]

Rudek, B.

M. M. Seibert, T. Ekeberg, F. R. N. C. Maia, M. Svenda, J. Andreasson, O. Jönsson, D. Odić, B. Iwan, A. Rocker, D. Westphal, M. Hantke, D. P. DePonte, A. Barty, J. Schulz, L. Gumprecht, N. Coppola, A. Aquila, M. Liang, T. A. White, A. Martin, C. Caleman, S. Stern, C. Abergel, V. Seltzer, J. M. Claverie, C. Bostedt, J. D. Bozek, S. Boutet, A. A. Miahnahri, M. Messerschmidt, J. Krzywinski, G. Williams, K. O. Hodgson, M. J. Bogan, C. Y. Hampton, R. G. Sierra, D. Starodub, I. Andersson, S. Bajt, M. Barthelmess, J. C. H. Spence, P. Fromme, U. Weierstall, R. Kirian, M. Hunter, R. B. Doak, S. Marchesini, S. P. Hau-Riege, M. Frank, R. L. Shoeman, L. Lomb, S. W. Epp, R. Hartmann, D. Rolles, A. Rudenko, C. Schmidt, L. Foucar, N. Kimmel, P. Holl, B. Rudek, B. Erk, A. Hömke, C. Reich, D. Pietschner, G. Weidenspointner, L. Strüder, G. Hauser, H. Gorke, J. Ullrich, I. Schlichting, S. Herrmann, G. Schaller, F. Schopper, H. Soltau, K. U. Kühnel, R. Andritschke, C. D. Schröter, F. Krasniqi, M. Bott, S. Schorb, D. Rupp, M. Adolph, T. Gorkhover, H. Hirsemann, G. Potdevin, H. Graafsma, B. Nilsson, H. N. Chapman, J. Hajdu, “Single mimivirus particles intercepted and imaged with an X-ray laser,” Nature 470(7332), 78–81 (2011).
[CrossRef] [PubMed]

C. H. Yoon, P. Schwander, C. Abergel, I. Andersson, J. Andreasson, A. Aquila, S. Bajt, M. Barthelmess, A. Barty, M. J. Bogan, C. Bostedt, J. Bozek, H. N. Chapman, J. M. Claverie, N. Coppola, D. P. DePonte, T. Ekeberg, S. W. Epp, B. Erk, H. Fleckenstein, L. Foucar, H. Graafsma, L. Gumprecht, J. Hajdu, C. Y. Hampton, A. Hartmann, E. Hartmann, R. Hartmann, G. Hauser, H. Hirsemann, P. Holl, S. Kassemeyer, N. Kimmel, M. Kiskinova, M. Liang, N. T. D. Loh, L. Lomb, F. R. N. C. Maia, A. V. Martin, K. Nass, E. Pedersoli, C. Reich, D. Rolles, B. Rudek, A. Rudenko, I. Schlichting, J. Schulz, M. Seibert, V. Seltzer, R. L. Shoeman, R. G. Sierra, H. Soltau, D. Starodub, J. Steinbrener, G. Stier, L. Strüder, M. Svenda, J. Ullrich, G. Weidenspointner, T. A. White, C. Wunderer, A. Ourmazd, “Unsupervised classification of single-particle X-ray diffraction snapshots by spectral clustering,” Opt. Express 19(17), 16542–16549 (2011).
[CrossRef] [PubMed]

Rudenko, A.

M. M. Seibert, T. Ekeberg, F. R. N. C. Maia, M. Svenda, J. Andreasson, O. Jönsson, D. Odić, B. Iwan, A. Rocker, D. Westphal, M. Hantke, D. P. DePonte, A. Barty, J. Schulz, L. Gumprecht, N. Coppola, A. Aquila, M. Liang, T. A. White, A. Martin, C. Caleman, S. Stern, C. Abergel, V. Seltzer, J. M. Claverie, C. Bostedt, J. D. Bozek, S. Boutet, A. A. Miahnahri, M. Messerschmidt, J. Krzywinski, G. Williams, K. O. Hodgson, M. J. Bogan, C. Y. Hampton, R. G. Sierra, D. Starodub, I. Andersson, S. Bajt, M. Barthelmess, J. C. H. Spence, P. Fromme, U. Weierstall, R. Kirian, M. Hunter, R. B. Doak, S. Marchesini, S. P. Hau-Riege, M. Frank, R. L. Shoeman, L. Lomb, S. W. Epp, R. Hartmann, D. Rolles, A. Rudenko, C. Schmidt, L. Foucar, N. Kimmel, P. Holl, B. Rudek, B. Erk, A. Hömke, C. Reich, D. Pietschner, G. Weidenspointner, L. Strüder, G. Hauser, H. Gorke, J. Ullrich, I. Schlichting, S. Herrmann, G. Schaller, F. Schopper, H. Soltau, K. U. Kühnel, R. Andritschke, C. D. Schröter, F. Krasniqi, M. Bott, S. Schorb, D. Rupp, M. Adolph, T. Gorkhover, H. Hirsemann, G. Potdevin, H. Graafsma, B. Nilsson, H. N. Chapman, J. Hajdu, “Single mimivirus particles intercepted and imaged with an X-ray laser,” Nature 470(7332), 78–81 (2011).
[CrossRef] [PubMed]

C. H. Yoon, P. Schwander, C. Abergel, I. Andersson, J. Andreasson, A. Aquila, S. Bajt, M. Barthelmess, A. Barty, M. J. Bogan, C. Bostedt, J. Bozek, H. N. Chapman, J. M. Claverie, N. Coppola, D. P. DePonte, T. Ekeberg, S. W. Epp, B. Erk, H. Fleckenstein, L. Foucar, H. Graafsma, L. Gumprecht, J. Hajdu, C. Y. Hampton, A. Hartmann, E. Hartmann, R. Hartmann, G. Hauser, H. Hirsemann, P. Holl, S. Kassemeyer, N. Kimmel, M. Kiskinova, M. Liang, N. T. D. Loh, L. Lomb, F. R. N. C. Maia, A. V. Martin, K. Nass, E. Pedersoli, C. Reich, D. Rolles, B. Rudek, A. Rudenko, I. Schlichting, J. Schulz, M. Seibert, V. Seltzer, R. L. Shoeman, R. G. Sierra, H. Soltau, D. Starodub, J. Steinbrener, G. Stier, L. Strüder, M. Svenda, J. Ullrich, G. Weidenspointner, T. A. White, C. Wunderer, A. Ourmazd, “Unsupervised classification of single-particle X-ray diffraction snapshots by spectral clustering,” Opt. Express 19(17), 16542–16549 (2011).
[CrossRef] [PubMed]

Rumiz, L.

E. Allaria, R. Appio, L. Badano, W. A. Barletta, S. Bassanese, S. G. Biedron, A. Borga, E. Busetto, D. Castronovo, P. Cinquegrana, S. Cleva, D. Cocco, M. Cornacchia, P. Craievich, I. Cudin, G. D’Auria, M. Dal Forno, M. B. Danailov, R. De Monte, G. De Ninno, P. Delgiusto, A. Demidovich, S. Di Mitri, B. Diviacco, A. Fabris, R. Fabris, W. Fawley, M. Ferianis, E. Ferrari, S. Ferry, L. Froehlich, P. Furlan, G. Gaio, F. Gelmetti, L. Giannessi, M. Giannini, R. Gobessi, R. Ivanov, E. Karantzoulis, M. Lonza, A. Lutman, B. Mahieu, M. Milloch, S. V. Milton, M. Musardo, I. Nikolov, S. Noe, F. Parmigiani, G. Penco, M. Petronio, L. Pivetta, M. Predonzani, F. Rossi, L. Rumiz, A. Salom, C. Scafuri, C. Serpico, P. Sigalotti, S. Spampinati, C. Spezzani, M. Svandrlik, C. Svetina, S. Tazzari, M. Trovo, R. Umer, A. Vascotto, M. Veronese, R. Visintini, M. Zaccaria, D. Zangrando, M. Zangrando, “Highly coherent and stable pulses from the FERMI seeded free-electron laser in the extreme ultraviolet,” Nat. Photonics 6(10), 699–704 (2012).
[CrossRef]

Rupp, D.

M. M. Seibert, T. Ekeberg, F. R. N. C. Maia, M. Svenda, J. Andreasson, O. Jönsson, D. Odić, B. Iwan, A. Rocker, D. Westphal, M. Hantke, D. P. DePonte, A. Barty, J. Schulz, L. Gumprecht, N. Coppola, A. Aquila, M. Liang, T. A. White, A. Martin, C. Caleman, S. Stern, C. Abergel, V. Seltzer, J. M. Claverie, C. Bostedt, J. D. Bozek, S. Boutet, A. A. Miahnahri, M. Messerschmidt, J. Krzywinski, G. Williams, K. O. Hodgson, M. J. Bogan, C. Y. Hampton, R. G. Sierra, D. Starodub, I. Andersson, S. Bajt, M. Barthelmess, J. C. H. Spence, P. Fromme, U. Weierstall, R. Kirian, M. Hunter, R. B. Doak, S. Marchesini, S. P. Hau-Riege, M. Frank, R. L. Shoeman, L. Lomb, S. W. Epp, R. Hartmann, D. Rolles, A. Rudenko, C. Schmidt, L. Foucar, N. Kimmel, P. Holl, B. Rudek, B. Erk, A. Hömke, C. Reich, D. Pietschner, G. Weidenspointner, L. Strüder, G. Hauser, H. Gorke, J. Ullrich, I. Schlichting, S. Herrmann, G. Schaller, F. Schopper, H. Soltau, K. U. Kühnel, R. Andritschke, C. D. Schröter, F. Krasniqi, M. Bott, S. Schorb, D. Rupp, M. Adolph, T. Gorkhover, H. Hirsemann, G. Potdevin, H. Graafsma, B. Nilsson, H. N. Chapman, J. Hajdu, “Single mimivirus particles intercepted and imaged with an X-ray laser,” Nature 470(7332), 78–81 (2011).
[CrossRef] [PubMed]

Salom, A.

E. Allaria, R. Appio, L. Badano, W. A. Barletta, S. Bassanese, S. G. Biedron, A. Borga, E. Busetto, D. Castronovo, P. Cinquegrana, S. Cleva, D. Cocco, M. Cornacchia, P. Craievich, I. Cudin, G. D’Auria, M. Dal Forno, M. B. Danailov, R. De Monte, G. De Ninno, P. Delgiusto, A. Demidovich, S. Di Mitri, B. Diviacco, A. Fabris, R. Fabris, W. Fawley, M. Ferianis, E. Ferrari, S. Ferry, L. Froehlich, P. Furlan, G. Gaio, F. Gelmetti, L. Giannessi, M. Giannini, R. Gobessi, R. Ivanov, E. Karantzoulis, M. Lonza, A. Lutman, B. Mahieu, M. Milloch, S. V. Milton, M. Musardo, I. Nikolov, S. Noe, F. Parmigiani, G. Penco, M. Petronio, L. Pivetta, M. Predonzani, F. Rossi, L. Rumiz, A. Salom, C. Scafuri, C. Serpico, P. Sigalotti, S. Spampinati, C. Spezzani, M. Svandrlik, C. Svetina, S. Tazzari, M. Trovo, R. Umer, A. Vascotto, M. Veronese, R. Visintini, M. Zaccaria, D. Zangrando, M. Zangrando, “Highly coherent and stable pulses from the FERMI seeded free-electron laser in the extreme ultraviolet,” Nat. Photonics 6(10), 699–704 (2012).
[CrossRef]

Sandrin, G.

F. Capotondi, E. Pedersoli, N. Mahne, R. H. Menk, G. Passos, L. Raimondi, C. Svetina, G. Sandrin, M. Zangrando, M. Kiskinova, S. Bajt, M. Barthelmess, H. Fleckenstein, H. N. Chapman, J. Schulz, J. Bach, R. Frömter, S. Schleitzer, L. Müller, C. Gutt, G. Grübel, “Invited article: Coherent imaging using seeded free-electron laser pulses with variable polarization: First results and research opportunities,” Rev. Sci. Instrum. 84(5), 051301 (2013).
[CrossRef] [PubMed]

Sauter, N. K.

J. Kern, R. Alonso-Mori, R. Tran, J. Hattne, R. J. Gildea, N. Echols, C. Glöckner, J. Hellmich, H. Laksmono, R. G. Sierra, B. Lassalle-Kaiser, S. Koroidov, A. Lampe, G. Han, S. Gul, D. Difiore, D. Milathianaki, A. R. Fry, A. Miahnahri, D. W. Schafer, M. Messerschmidt, M. M. Seibert, J. E. Koglin, D. Sokaras, T. C. Weng, J. Sellberg, M. J. Latimer, R. W. Grosse-Kunstleve, P. H. Zwart, W. E. White, P. Glatzel, P. D. Adams, M. J. Bogan, G. J. Williams, S. Boutet, J. Messinger, A. Zouni, N. K. Sauter, V. K. Yachandra, U. Bergmann, J. Yano, “Simultaneous femtosecond X-ray spectroscopy and diffraction of photosystem II at room temperature,” Science 340(6131), 491–495 (2013).
[CrossRef] [PubMed]

Scafuri, C.

E. Allaria, R. Appio, L. Badano, W. A. Barletta, S. Bassanese, S. G. Biedron, A. Borga, E. Busetto, D. Castronovo, P. Cinquegrana, S. Cleva, D. Cocco, M. Cornacchia, P. Craievich, I. Cudin, G. D’Auria, M. Dal Forno, M. B. Danailov, R. De Monte, G. De Ninno, P. Delgiusto, A. Demidovich, S. Di Mitri, B. Diviacco, A. Fabris, R. Fabris, W. Fawley, M. Ferianis, E. Ferrari, S. Ferry, L. Froehlich, P. Furlan, G. Gaio, F. Gelmetti, L. Giannessi, M. Giannini, R. Gobessi, R. Ivanov, E. Karantzoulis, M. Lonza, A. Lutman, B. Mahieu, M. Milloch, S. V. Milton, M. Musardo, I. Nikolov, S. Noe, F. Parmigiani, G. Penco, M. Petronio, L. Pivetta, M. Predonzani, F. Rossi, L. Rumiz, A. Salom, C. Scafuri, C. Serpico, P. Sigalotti, S. Spampinati, C. Spezzani, M. Svandrlik, C. Svetina, S. Tazzari, M. Trovo, R. Umer, A. Vascotto, M. Veronese, R. Visintini, M. Zaccaria, D. Zangrando, M. Zangrando, “Highly coherent and stable pulses from the FERMI seeded free-electron laser in the extreme ultraviolet,” Nat. Photonics 6(10), 699–704 (2012).
[CrossRef]

Schafer, D.

S. Boutet, L. Lomb, G. J. Williams, T. R. M. Barends, A. Aquila, R. B. Doak, U. Weierstall, D. P. DePonte, J. Steinbrener, R. L. Shoeman, M. Messerschmidt, A. Barty, T. A. White, S. Kassemeyer, R. A. Kirian, M. M. Seibert, P. A. Montanez, C. Kenney, R. Herbst, P. Hart, J. Pines, G. Haller, S. M. Gruner, H. T. Philipp, M. W. Tate, M. Hromalik, L. J. Koerner, N. van Bakel, J. Morse, W. Ghonsalves, D. Arnlund, M. J. Bogan, C. Caleman, R. Fromme, C. Y. Hampton, M. S. Hunter, L. C. Johansson, G. Katona, C. Kupitz, M. Liang, A. V. Martin, K. Nass, L. Redecke, F. Stellato, N. Timneanu, D. Wang, N. A. Zatsepin, D. Schafer, J. Defever, R. Neutze, P. Fromme, J. C. H. Spence, H. N. Chapman, I. Schlichting, “High-resolution protein structure determination by serial femtosecond crystallography,” Science 337(6092), 362–364 (2012).
[CrossRef] [PubMed]

Schafer, D. W.

J. Kern, R. Alonso-Mori, R. Tran, J. Hattne, R. J. Gildea, N. Echols, C. Glöckner, J. Hellmich, H. Laksmono, R. G. Sierra, B. Lassalle-Kaiser, S. Koroidov, A. Lampe, G. Han, S. Gul, D. Difiore, D. Milathianaki, A. R. Fry, A. Miahnahri, D. W. Schafer, M. Messerschmidt, M. M. Seibert, J. E. Koglin, D. Sokaras, T. C. Weng, J. Sellberg, M. J. Latimer, R. W. Grosse-Kunstleve, P. H. Zwart, W. E. White, P. Glatzel, P. D. Adams, M. J. Bogan, G. J. Williams, S. Boutet, J. Messinger, A. Zouni, N. K. Sauter, V. K. Yachandra, U. Bergmann, J. Yano, “Simultaneous femtosecond X-ray spectroscopy and diffraction of photosystem II at room temperature,” Science 340(6131), 491–495 (2013).
[CrossRef] [PubMed]

Schaller, G.

M. M. Seibert, T. Ekeberg, F. R. N. C. Maia, M. Svenda, J. Andreasson, O. Jönsson, D. Odić, B. Iwan, A. Rocker, D. Westphal, M. Hantke, D. P. DePonte, A. Barty, J. Schulz, L. Gumprecht, N. Coppola, A. Aquila, M. Liang, T. A. White, A. Martin, C. Caleman, S. Stern, C. Abergel, V. Seltzer, J. M. Claverie, C. Bostedt, J. D. Bozek, S. Boutet, A. A. Miahnahri, M. Messerschmidt, J. Krzywinski, G. Williams, K. O. Hodgson, M. J. Bogan, C. Y. Hampton, R. G. Sierra, D. Starodub, I. Andersson, S. Bajt, M. Barthelmess, J. C. H. Spence, P. Fromme, U. Weierstall, R. Kirian, M. Hunter, R. B. Doak, S. Marchesini, S. P. Hau-Riege, M. Frank, R. L. Shoeman, L. Lomb, S. W. Epp, R. Hartmann, D. Rolles, A. Rudenko, C. Schmidt, L. Foucar, N. Kimmel, P. Holl, B. Rudek, B. Erk, A. Hömke, C. Reich, D. Pietschner, G. Weidenspointner, L. Strüder, G. Hauser, H. Gorke, J. Ullrich, I. Schlichting, S. Herrmann, G. Schaller, F. Schopper, H. Soltau, K. U. Kühnel, R. Andritschke, C. D. Schröter, F. Krasniqi, M. Bott, S. Schorb, D. Rupp, M. Adolph, T. Gorkhover, H. Hirsemann, G. Potdevin, H. Graafsma, B. Nilsson, H. N. Chapman, J. Hajdu, “Single mimivirus particles intercepted and imaged with an X-ray laser,” Nature 470(7332), 78–81 (2011).
[CrossRef] [PubMed]

Scheres, S. H. W.

S. H. W. Scheres, H. Gao, M. Valle, G. T. Herman, P. P. B. Eggermont, J. Frank, J. M. Carazo, “Disentangling conformational states of macromolecules in 3D-EM through likelihood optimization,” Nat. Methods 4(1), 27–29 (2007).
[CrossRef] [PubMed]

Schleitzer, S.

F. Capotondi, E. Pedersoli, N. Mahne, R. H. Menk, G. Passos, L. Raimondi, C. Svetina, G. Sandrin, M. Zangrando, M. Kiskinova, S. Bajt, M. Barthelmess, H. Fleckenstein, H. N. Chapman, J. Schulz, J. Bach, R. Frömter, S. Schleitzer, L. Müller, C. Gutt, G. Grübel, “Invited article: Coherent imaging using seeded free-electron laser pulses with variable polarization: First results and research opportunities,” Rev. Sci. Instrum. 84(5), 051301 (2013).
[CrossRef] [PubMed]

Schlichting, I.

L. Redecke, K. Nass, D. P. DePonte, T. A. White, D. Rehders, A. Barty, F. Stellato, M. Liang, T. R. M. Barends, S. Boutet, G. J. Williams, M. Messerschmidt, M. M. Seibert, A. Aquila, D. Arnlund, S. Bajt, T. Barth, M. J. Bogan, C. Caleman, T. C. Chao, R. B. Doak, H. Fleckenstein, M. Frank, R. Fromme, L. Galli, I. Grotjohann, M. S. Hunter, L. C. Johansson, S. Kassemeyer, G. Katona, R. A. Kirian, R. Koopmann, C. Kupitz, L. Lomb, A. V. Martin, S. Mogk, R. Neutze, R. L. Shoeman, J. Steinbrener, N. Timneanu, D. Wang, U. Weierstall, N. A. Zatsepin, J. C. H. Spence, P. Fromme, I. Schlichting, M. Duszenko, C. Betzel, H. N. Chapman, “Natively inhibited Trypanosoma brucei Cathepsin B structure determined by using an X-ray laser,” Science 339(6116), 227–230 (2013).
[CrossRef] [PubMed]

S. Boutet, L. Lomb, G. J. Williams, T. R. M. Barends, A. Aquila, R. B. Doak, U. Weierstall, D. P. DePonte, J. Steinbrener, R. L. Shoeman, M. Messerschmidt, A. Barty, T. A. White, S. Kassemeyer, R. A. Kirian, M. M. Seibert, P. A. Montanez, C. Kenney, R. Herbst, P. Hart, J. Pines, G. Haller, S. M. Gruner, H. T. Philipp, M. W. Tate, M. Hromalik, L. J. Koerner, N. van Bakel, J. Morse, W. Ghonsalves, D. Arnlund, M. J. Bogan, C. Caleman, R. Fromme, C. Y. Hampton, M. S. Hunter, L. C. Johansson, G. Katona, C. Kupitz, M. Liang, A. V. Martin, K. Nass, L. Redecke, F. Stellato, N. Timneanu, D. Wang, N. A. Zatsepin, D. Schafer, J. Defever, R. Neutze, P. Fromme, J. C. H. Spence, H. N. Chapman, I. Schlichting, “High-resolution protein structure determination by serial femtosecond crystallography,” Science 337(6092), 362–364 (2012).
[CrossRef] [PubMed]

M. M. Seibert, T. Ekeberg, F. R. N. C. Maia, M. Svenda, J. Andreasson, O. Jönsson, D. Odić, B. Iwan, A. Rocker, D. Westphal, M. Hantke, D. P. DePonte, A. Barty, J. Schulz, L. Gumprecht, N. Coppola, A. Aquila, M. Liang, T. A. White, A. Martin, C. Caleman, S. Stern, C. Abergel, V. Seltzer, J. M. Claverie, C. Bostedt, J. D. Bozek, S. Boutet, A. A. Miahnahri, M. Messerschmidt, J. Krzywinski, G. Williams, K. O. Hodgson, M. J. Bogan, C. Y. Hampton, R. G. Sierra, D. Starodub, I. Andersson, S. Bajt, M. Barthelmess, J. C. H. Spence, P. Fromme, U. Weierstall, R. Kirian, M. Hunter, R. B. Doak, S. Marchesini, S. P. Hau-Riege, M. Frank, R. L. Shoeman, L. Lomb, S. W. Epp, R. Hartmann, D. Rolles, A. Rudenko, C. Schmidt, L. Foucar, N. Kimmel, P. Holl, B. Rudek, B. Erk, A. Hömke, C. Reich, D. Pietschner, G. Weidenspointner, L. Strüder, G. Hauser, H. Gorke, J. Ullrich, I. Schlichting, S. Herrmann, G. Schaller, F. Schopper, H. Soltau, K. U. Kühnel, R. Andritschke, C. D. Schröter, F. Krasniqi, M. Bott, S. Schorb, D. Rupp, M. Adolph, T. Gorkhover, H. Hirsemann, G. Potdevin, H. Graafsma, B. Nilsson, H. N. Chapman, J. Hajdu, “Single mimivirus particles intercepted and imaged with an X-ray laser,” Nature 470(7332), 78–81 (2011).
[CrossRef] [PubMed]

C. H. Yoon, P. Schwander, C. Abergel, I. Andersson, J. Andreasson, A. Aquila, S. Bajt, M. Barthelmess, A. Barty, M. J. Bogan, C. Bostedt, J. Bozek, H. N. Chapman, J. M. Claverie, N. Coppola, D. P. DePonte, T. Ekeberg, S. W. Epp, B. Erk, H. Fleckenstein, L. Foucar, H. Graafsma, L. Gumprecht, J. Hajdu, C. Y. Hampton, A. Hartmann, E. Hartmann, R. Hartmann, G. Hauser, H. Hirsemann, P. Holl, S. Kassemeyer, N. Kimmel, M. Kiskinova, M. Liang, N. T. D. Loh, L. Lomb, F. R. N. C. Maia, A. V. Martin, K. Nass, E. Pedersoli, C. Reich, D. Rolles, B. Rudek, A. Rudenko, I. Schlichting, J. Schulz, M. Seibert, V. Seltzer, R. L. Shoeman, R. G. Sierra, H. Soltau, D. Starodub, J. Steinbrener, G. Stier, L. Strüder, M. Svenda, J. Ullrich, G. Weidenspointner, T. A. White, C. Wunderer, A. Ourmazd, “Unsupervised classification of single-particle X-ray diffraction snapshots by spectral clustering,” Opt. Express 19(17), 16542–16549 (2011).
[CrossRef] [PubMed]

Schmidt, C.

M. M. Seibert, T. Ekeberg, F. R. N. C. Maia, M. Svenda, J. Andreasson, O. Jönsson, D. Odić, B. Iwan, A. Rocker, D. Westphal, M. Hantke, D. P. DePonte, A. Barty, J. Schulz, L. Gumprecht, N. Coppola, A. Aquila, M. Liang, T. A. White, A. Martin, C. Caleman, S. Stern, C. Abergel, V. Seltzer, J. M. Claverie, C. Bostedt, J. D. Bozek, S. Boutet, A. A. Miahnahri, M. Messerschmidt, J. Krzywinski, G. Williams, K. O. Hodgson, M. J. Bogan, C. Y. Hampton, R. G. Sierra, D. Starodub, I. Andersson, S. Bajt, M. Barthelmess, J. C. H. Spence, P. Fromme, U. Weierstall, R. Kirian, M. Hunter, R. B. Doak, S. Marchesini, S. P. Hau-Riege, M. Frank, R. L. Shoeman, L. Lomb, S. W. Epp, R. Hartmann, D. Rolles, A. Rudenko, C. Schmidt, L. Foucar, N. Kimmel, P. Holl, B. Rudek, B. Erk, A. Hömke, C. Reich, D. Pietschner, G. Weidenspointner, L. Strüder, G. Hauser, H. Gorke, J. Ullrich, I. Schlichting, S. Herrmann, G. Schaller, F. Schopper, H. Soltau, K. U. Kühnel, R. Andritschke, C. D. Schröter, F. Krasniqi, M. Bott, S. Schorb, D. Rupp, M. Adolph, T. Gorkhover, H. Hirsemann, G. Potdevin, H. Graafsma, B. Nilsson, H. N. Chapman, J. Hajdu, “Single mimivirus particles intercepted and imaged with an X-ray laser,” Nature 470(7332), 78–81 (2011).
[CrossRef] [PubMed]

Schneider, J. R.

H. N. Chapman, A. Barty, M. J. Bogan, S. Boutet, M. Frank, S. P. Hau-Riege, S. Marchesini, B. W. Woods, S. Bajt, W. H. Benner, R. A. London, E. Plönjes, M. Kuhlmann, R. Treusch, S. Düsterer, T. Tschentscher, J. R. Schneider, E. Spiller, T. Möller, C. Bostedt, M. Hoener, D. A. Shapiro, K. O. Hodgson, D. van der Spoel, F. Burmeister, M. Bergh, C. Caleman, G. Huldt, M. M. Seibert, F. R. N. C. Maia, R. W. Lee, A. Szöke, N. Timneanu, J. Hajdu, “Femtosecond diffractive imaging with a soft-X-ray free-electron laser,” Nat. Phys. 2(12), 839–843 (2006).
[CrossRef]

Schopper, F.

M. M. Seibert, T. Ekeberg, F. R. N. C. Maia, M. Svenda, J. Andreasson, O. Jönsson, D. Odić, B. Iwan, A. Rocker, D. Westphal, M. Hantke, D. P. DePonte, A. Barty, J. Schulz, L. Gumprecht, N. Coppola, A. Aquila, M. Liang, T. A. White, A. Martin, C. Caleman, S. Stern, C. Abergel, V. Seltzer, J. M. Claverie, C. Bostedt, J. D. Bozek, S. Boutet, A. A. Miahnahri, M. Messerschmidt, J. Krzywinski, G. Williams, K. O. Hodgson, M. J. Bogan, C. Y. Hampton, R. G. Sierra, D. Starodub, I. Andersson, S. Bajt, M. Barthelmess, J. C. H. Spence, P. Fromme, U. Weierstall, R. Kirian, M. Hunter, R. B. Doak, S. Marchesini, S. P. Hau-Riege, M. Frank, R. L. Shoeman, L. Lomb, S. W. Epp, R. Hartmann, D. Rolles, A. Rudenko, C. Schmidt, L. Foucar, N. Kimmel, P. Holl, B. Rudek, B. Erk, A. Hömke, C. Reich, D. Pietschner, G. Weidenspointner, L. Strüder, G. Hauser, H. Gorke, J. Ullrich, I. Schlichting, S. Herrmann, G. Schaller, F. Schopper, H. Soltau, K. U. Kühnel, R. Andritschke, C. D. Schröter, F. Krasniqi, M. Bott, S. Schorb, D. Rupp, M. Adolph, T. Gorkhover, H. Hirsemann, G. Potdevin, H. Graafsma, B. Nilsson, H. N. Chapman, J. Hajdu, “Single mimivirus particles intercepted and imaged with an X-ray laser,” Nature 470(7332), 78–81 (2011).
[CrossRef] [PubMed]

Schorb, S.

M. M. Seibert, T. Ekeberg, F. R. N. C. Maia, M. Svenda, J. Andreasson, O. Jönsson, D. Odić, B. Iwan, A. Rocker, D. Westphal, M. Hantke, D. P. DePonte, A. Barty, J. Schulz, L. Gumprecht, N. Coppola, A. Aquila, M. Liang, T. A. White, A. Martin, C. Caleman, S. Stern, C. Abergel, V. Seltzer, J. M. Claverie, C. Bostedt, J. D. Bozek, S. Boutet, A. A. Miahnahri, M. Messerschmidt, J. Krzywinski, G. Williams, K. O. Hodgson, M. J. Bogan, C. Y. Hampton, R. G. Sierra, D. Starodub, I. Andersson, S. Bajt, M. Barthelmess, J. C. H. Spence, P. Fromme, U. Weierstall, R. Kirian, M. Hunter, R. B. Doak, S. Marchesini, S. P. Hau-Riege, M. Frank, R. L. Shoeman, L. Lomb, S. W. Epp, R. Hartmann, D. Rolles, A. Rudenko, C. Schmidt, L. Foucar, N. Kimmel, P. Holl, B. Rudek, B. Erk, A. Hömke, C. Reich, D. Pietschner, G. Weidenspointner, L. Strüder, G. Hauser, H. Gorke, J. Ullrich, I. Schlichting, S. Herrmann, G. Schaller, F. Schopper, H. Soltau, K. U. Kühnel, R. Andritschke, C. D. Schröter, F. Krasniqi, M. Bott, S. Schorb, D. Rupp, M. Adolph, T. Gorkhover, H. Hirsemann, G. Potdevin, H. Graafsma, B. Nilsson, H. N. Chapman, J. Hajdu, “Single mimivirus particles intercepted and imaged with an X-ray laser,” Nature 470(7332), 78–81 (2011).
[CrossRef] [PubMed]

Schröter, C. D.

M. M. Seibert, T. Ekeberg, F. R. N. C. Maia, M. Svenda, J. Andreasson, O. Jönsson, D. Odić, B. Iwan, A. Rocker, D. Westphal, M. Hantke, D. P. DePonte, A. Barty, J. Schulz, L. Gumprecht, N. Coppola, A. Aquila, M. Liang, T. A. White, A. Martin, C. Caleman, S. Stern, C. Abergel, V. Seltzer, J. M. Claverie, C. Bostedt, J. D. Bozek, S. Boutet, A. A. Miahnahri, M. Messerschmidt, J. Krzywinski, G. Williams, K. O. Hodgson, M. J. Bogan, C. Y. Hampton, R. G. Sierra, D. Starodub, I. Andersson, S. Bajt, M. Barthelmess, J. C. H. Spence, P. Fromme, U. Weierstall, R. Kirian, M. Hunter, R. B. Doak, S. Marchesini, S. P. Hau-Riege, M. Frank, R. L. Shoeman, L. Lomb, S. W. Epp, R. Hartmann, D. Rolles, A. Rudenko, C. Schmidt, L. Foucar, N. Kimmel, P. Holl, B. Rudek, B. Erk, A. Hömke, C. Reich, D. Pietschner, G. Weidenspointner, L. Strüder, G. Hauser, H. Gorke, J. Ullrich, I. Schlichting, S. Herrmann, G. Schaller, F. Schopper, H. Soltau, K. U. Kühnel, R. Andritschke, C. D. Schröter, F. Krasniqi, M. Bott, S. Schorb, D. Rupp, M. Adolph, T. Gorkhover, H. Hirsemann, G. Potdevin, H. Graafsma, B. Nilsson, H. N. Chapman, J. Hajdu, “Single mimivirus particles intercepted and imaged with an X-ray laser,” Nature 470(7332), 78–81 (2011).
[CrossRef] [PubMed]

Schulz, J.

F. Capotondi, E. Pedersoli, N. Mahne, R. H. Menk, G. Passos, L. Raimondi, C. Svetina, G. Sandrin, M. Zangrando, M. Kiskinova, S. Bajt, M. Barthelmess, H. Fleckenstein, H. N. Chapman, J. Schulz, J. Bach, R. Frömter, S. Schleitzer, L. Müller, C. Gutt, G. Grübel, “Invited article: Coherent imaging using seeded free-electron laser pulses with variable polarization: First results and research opportunities,” Rev. Sci. Instrum. 84(5), 051301 (2013).
[CrossRef] [PubMed]

M. M. Seibert, T. Ekeberg, F. R. N. C. Maia, M. Svenda, J. Andreasson, O. Jönsson, D. Odić, B. Iwan, A. Rocker, D. Westphal, M. Hantke, D. P. DePonte, A. Barty, J. Schulz, L. Gumprecht, N. Coppola, A. Aquila, M. Liang, T. A. White, A. Martin, C. Caleman, S. Stern, C. Abergel, V. Seltzer, J. M. Claverie, C. Bostedt, J. D. Bozek, S. Boutet, A. A. Miahnahri, M. Messerschmidt, J. Krzywinski, G. Williams, K. O. Hodgson, M. J. Bogan, C. Y. Hampton, R. G. Sierra, D. Starodub, I. Andersson, S. Bajt, M. Barthelmess, J. C. H. Spence, P. Fromme, U. Weierstall, R. Kirian, M. Hunter, R. B. Doak, S. Marchesini, S. P. Hau-Riege, M. Frank, R. L. Shoeman, L. Lomb, S. W. Epp, R. Hartmann, D. Rolles, A. Rudenko, C. Schmidt, L. Foucar, N. Kimmel, P. Holl, B. Rudek, B. Erk, A. Hömke, C. Reich, D. Pietschner, G. Weidenspointner, L. Strüder, G. Hauser, H. Gorke, J. Ullrich, I. Schlichting, S. Herrmann, G. Schaller, F. Schopper, H. Soltau, K. U. Kühnel, R. Andritschke, C. D. Schröter, F. Krasniqi, M. Bott, S. Schorb, D. Rupp, M. Adolph, T. Gorkhover, H. Hirsemann, G. Potdevin, H. Graafsma, B. Nilsson, H. N. Chapman, J. Hajdu, “Single mimivirus particles intercepted and imaged with an X-ray laser,” Nature 470(7332), 78–81 (2011).
[CrossRef] [PubMed]

C. H. Yoon, P. Schwander, C. Abergel, I. Andersson, J. Andreasson, A. Aquila, S. Bajt, M. Barthelmess, A. Barty, M. J. Bogan, C. Bostedt, J. Bozek, H. N. Chapman, J. M. Claverie, N. Coppola, D. P. DePonte, T. Ekeberg, S. W. Epp, B. Erk, H. Fleckenstein, L. Foucar, H. Graafsma, L. Gumprecht, J. Hajdu, C. Y. Hampton, A. Hartmann, E. Hartmann, R. Hartmann, G. Hauser, H. Hirsemann, P. Holl, S. Kassemeyer, N. Kimmel, M. Kiskinova, M. Liang, N. T. D. Loh, L. Lomb, F. R. N. C. Maia, A. V. Martin, K. Nass, E. Pedersoli, C. Reich, D. Rolles, B. Rudek, A. Rudenko, I. Schlichting, J. Schulz, M. Seibert, V. Seltzer, R. L. Shoeman, R. G. Sierra, H. Soltau, D. Starodub, J. Steinbrener, G. Stier, L. Strüder, M. Svenda, J. Ullrich, G. Weidenspointner, T. A. White, C. Wunderer, A. Ourmazd, “Unsupervised classification of single-particle X-ray diffraction snapshots by spectral clustering,” Opt. Express 19(17), 16542–16549 (2011).
[CrossRef] [PubMed]

Schwander, P.

Seibert, M.

Seibert, M. M.

J. Kern, R. Alonso-Mori, R. Tran, J. Hattne, R. J. Gildea, N. Echols, C. Glöckner, J. Hellmich, H. Laksmono, R. G. Sierra, B. Lassalle-Kaiser, S. Koroidov, A. Lampe, G. Han, S. Gul, D. Difiore, D. Milathianaki, A. R. Fry, A. Miahnahri, D. W. Schafer, M. Messerschmidt, M. M. Seibert, J. E. Koglin, D. Sokaras, T. C. Weng, J. Sellberg, M. J. Latimer, R. W. Grosse-Kunstleve, P. H. Zwart, W. E. White, P. Glatzel, P. D. Adams, M. J. Bogan, G. J. Williams, S. Boutet, J. Messinger, A. Zouni, N. K. Sauter, V. K. Yachandra, U. Bergmann, J. Yano, “Simultaneous femtosecond X-ray spectroscopy and diffraction of photosystem II at room temperature,” Science 340(6131), 491–495 (2013).
[CrossRef] [PubMed]

L. Redecke, K. Nass, D. P. DePonte, T. A. White, D. Rehders, A. Barty, F. Stellato, M. Liang, T. R. M. Barends, S. Boutet, G. J. Williams, M. Messerschmidt, M. M. Seibert, A. Aquila, D. Arnlund, S. Bajt, T. Barth, M. J. Bogan, C. Caleman, T. C. Chao, R. B. Doak, H. Fleckenstein, M. Frank, R. Fromme, L. Galli, I. Grotjohann, M. S. Hunter, L. C. Johansson, S. Kassemeyer, G. Katona, R. A. Kirian, R. Koopmann, C. Kupitz, L. Lomb, A. V. Martin, S. Mogk, R. Neutze, R. L. Shoeman, J. Steinbrener, N. Timneanu, D. Wang, U. Weierstall, N. A. Zatsepin, J. C. H. Spence, P. Fromme, I. Schlichting, M. Duszenko, C. Betzel, H. N. Chapman, “Natively inhibited Trypanosoma brucei Cathepsin B structure determined by using an X-ray laser,” Science 339(6116), 227–230 (2013).
[CrossRef] [PubMed]

S. Boutet, L. Lomb, G. J. Williams, T. R. M. Barends, A. Aquila, R. B. Doak, U. Weierstall, D. P. DePonte, J. Steinbrener, R. L. Shoeman, M. Messerschmidt, A. Barty, T. A. White, S. Kassemeyer, R. A. Kirian, M. M. Seibert, P. A. Montanez, C. Kenney, R. Herbst, P. Hart, J. Pines, G. Haller, S. M. Gruner, H. T. Philipp, M. W. Tate, M. Hromalik, L. J. Koerner, N. van Bakel, J. Morse, W. Ghonsalves, D. Arnlund, M. J. Bogan, C. Caleman, R. Fromme, C. Y. Hampton, M. S. Hunter, L. C. Johansson, G. Katona, C. Kupitz, M. Liang, A. V. Martin, K. Nass, L. Redecke, F. Stellato, N. Timneanu, D. Wang, N. A. Zatsepin, D. Schafer, J. Defever, R. Neutze, P. Fromme, J. C. H. Spence, H. N. Chapman, I. Schlichting, “High-resolution protein structure determination by serial femtosecond crystallography,” Science 337(6092), 362–364 (2012).
[CrossRef] [PubMed]

M. M. Seibert, T. Ekeberg, F. R. N. C. Maia, M. Svenda, J. Andreasson, O. Jönsson, D. Odić, B. Iwan, A. Rocker, D. Westphal, M. Hantke, D. P. DePonte, A. Barty, J. Schulz, L. Gumprecht, N. Coppola, A. Aquila, M. Liang, T. A. White, A. Martin, C. Caleman, S. Stern, C. Abergel, V. Seltzer, J. M. Claverie, C. Bostedt, J. D. Bozek, S. Boutet, A. A. Miahnahri, M. Messerschmidt, J. Krzywinski, G. Williams, K. O. Hodgson, M. J. Bogan, C. Y. Hampton, R. G. Sierra, D. Starodub, I. Andersson, S. Bajt, M. Barthelmess, J. C. H. Spence, P. Fromme, U. Weierstall, R. Kirian, M. Hunter, R. B. Doak, S. Marchesini, S. P. Hau-Riege, M. Frank, R. L. Shoeman, L. Lomb, S. W. Epp, R. Hartmann, D. Rolles, A. Rudenko, C. Schmidt, L. Foucar, N. Kimmel, P. Holl, B. Rudek, B. Erk, A. Hömke, C. Reich, D. Pietschner, G. Weidenspointner, L. Strüder, G. Hauser, H. Gorke, J. Ullrich, I. Schlichting, S. Herrmann, G. Schaller, F. Schopper, H. Soltau, K. U. Kühnel, R. Andritschke, C. D. Schröter, F. Krasniqi, M. Bott, S. Schorb, D. Rupp, M. Adolph, T. Gorkhover, H. Hirsemann, G. Potdevin, H. Graafsma, B. Nilsson, H. N. Chapman, J. Hajdu, “Single mimivirus particles intercepted and imaged with an X-ray laser,” Nature 470(7332), 78–81 (2011).
[CrossRef] [PubMed]

H. N. Chapman, A. Barty, M. J. Bogan, S. Boutet, M. Frank, S. P. Hau-Riege, S. Marchesini, B. W. Woods, S. Bajt, W. H. Benner, R. A. London, E. Plönjes, M. Kuhlmann, R. Treusch, S. Düsterer, T. Tschentscher, J. R. Schneider, E. Spiller, T. Möller, C. Bostedt, M. Hoener, D. A. Shapiro, K. O. Hodgson, D. van der Spoel, F. Burmeister, M. Bergh, C. Caleman, G. Huldt, M. M. Seibert, F. R. N. C. Maia, R. W. Lee, A. Szöke, N. Timneanu, J. Hajdu, “Femtosecond diffractive imaging with a soft-X-ray free-electron laser,” Nat. Phys. 2(12), 839–843 (2006).
[CrossRef]

Sellberg, J.

J. Kern, R. Alonso-Mori, R. Tran, J. Hattne, R. J. Gildea, N. Echols, C. Glöckner, J. Hellmich, H. Laksmono, R. G. Sierra, B. Lassalle-Kaiser, S. Koroidov, A. Lampe, G. Han, S. Gul, D. Difiore, D. Milathianaki, A. R. Fry, A. Miahnahri, D. W. Schafer, M. Messerschmidt, M. M. Seibert, J. E. Koglin, D. Sokaras, T. C. Weng, J. Sellberg, M. J. Latimer, R. W. Grosse-Kunstleve, P. H. Zwart, W. E. White, P. Glatzel, P. D. Adams, M. J. Bogan, G. J. Williams, S. Boutet, J. Messinger, A. Zouni, N. K. Sauter, V. K. Yachandra, U. Bergmann, J. Yano, “Simultaneous femtosecond X-ray spectroscopy and diffraction of photosystem II at room temperature,” Science 340(6131), 491–495 (2013).
[CrossRef] [PubMed]

Seltzer, V.

M. M. Seibert, T. Ekeberg, F. R. N. C. Maia, M. Svenda, J. Andreasson, O. Jönsson, D. Odić, B. Iwan, A. Rocker, D. Westphal, M. Hantke, D. P. DePonte, A. Barty, J. Schulz, L. Gumprecht, N. Coppola, A. Aquila, M. Liang, T. A. White, A. Martin, C. Caleman, S. Stern, C. Abergel, V. Seltzer, J. M. Claverie, C. Bostedt, J. D. Bozek, S. Boutet, A. A. Miahnahri, M. Messerschmidt, J. Krzywinski, G. Williams, K. O. Hodgson, M. J. Bogan, C. Y. Hampton, R. G. Sierra, D. Starodub, I. Andersson, S. Bajt, M. Barthelmess, J. C. H. Spence, P. Fromme, U. Weierstall, R. Kirian, M. Hunter, R. B. Doak, S. Marchesini, S. P. Hau-Riege, M. Frank, R. L. Shoeman, L. Lomb, S. W. Epp, R. Hartmann, D. Rolles, A. Rudenko, C. Schmidt, L. Foucar, N. Kimmel, P. Holl, B. Rudek, B. Erk, A. Hömke, C. Reich, D. Pietschner, G. Weidenspointner, L. Strüder, G. Hauser, H. Gorke, J. Ullrich, I. Schlichting, S. Herrmann, G. Schaller, F. Schopper, H. Soltau, K. U. Kühnel, R. Andritschke, C. D. Schröter, F. Krasniqi, M. Bott, S. Schorb, D. Rupp, M. Adolph, T. Gorkhover, H. Hirsemann, G. Potdevin, H. Graafsma, B. Nilsson, H. N. Chapman, J. Hajdu, “Single mimivirus particles intercepted and imaged with an X-ray laser,” Nature 470(7332), 78–81 (2011).
[CrossRef] [PubMed]

C. H. Yoon, P. Schwander, C. Abergel, I. Andersson, J. Andreasson, A. Aquila, S. Bajt, M. Barthelmess, A. Barty, M. J. Bogan, C. Bostedt, J. Bozek, H. N. Chapman, J. M. Claverie, N. Coppola, D. P. DePonte, T. Ekeberg, S. W. Epp, B. Erk, H. Fleckenstein, L. Foucar, H. Graafsma, L. Gumprecht, J. Hajdu, C. Y. Hampton, A. Hartmann, E. Hartmann, R. Hartmann, G. Hauser, H. Hirsemann, P. Holl, S. Kassemeyer, N. Kimmel, M. Kiskinova, M. Liang, N. T. D. Loh, L. Lomb, F. R. N. C. Maia, A. V. Martin, K. Nass, E. Pedersoli, C. Reich, D. Rolles, B. Rudek, A. Rudenko, I. Schlichting, J. Schulz, M. Seibert, V. Seltzer, R. L. Shoeman, R. G. Sierra, H. Soltau, D. Starodub, J. Steinbrener, G. Stier, L. Strüder, M. Svenda, J. Ullrich, G. Weidenspointner, T. A. White, C. Wunderer, A. Ourmazd, “Unsupervised classification of single-particle X-ray diffraction snapshots by spectral clustering,” Opt. Express 19(17), 16542–16549 (2011).
[CrossRef] [PubMed]

Serpico, C.

E. Allaria, R. Appio, L. Badano, W. A. Barletta, S. Bassanese, S. G. Biedron, A. Borga, E. Busetto, D. Castronovo, P. Cinquegrana, S. Cleva, D. Cocco, M. Cornacchia, P. Craievich, I. Cudin, G. D’Auria, M. Dal Forno, M. B. Danailov, R. De Monte, G. De Ninno, P. Delgiusto, A. Demidovich, S. Di Mitri, B. Diviacco, A. Fabris, R. Fabris, W. Fawley, M. Ferianis, E. Ferrari, S. Ferry, L. Froehlich, P. Furlan, G. Gaio, F. Gelmetti, L. Giannessi, M. Giannini, R. Gobessi, R. Ivanov, E. Karantzoulis, M. Lonza, A. Lutman, B. Mahieu, M. Milloch, S. V. Milton, M. Musardo, I. Nikolov, S. Noe, F. Parmigiani, G. Penco, M. Petronio, L. Pivetta, M. Predonzani, F. Rossi, L. Rumiz, A. Salom, C. Scafuri, C. Serpico, P. Sigalotti, S. Spampinati, C. Spezzani, M. Svandrlik, C. Svetina, S. Tazzari, M. Trovo, R. Umer, A. Vascotto, M. Veronese, R. Visintini, M. Zaccaria, D. Zangrando, M. Zangrando, “Highly coherent and stable pulses from the FERMI seeded free-electron laser in the extreme ultraviolet,” Nat. Photonics 6(10), 699–704 (2012).
[CrossRef]

Shapiro, D.

Shapiro, D. A.

H. N. Chapman, A. Barty, M. J. Bogan, S. Boutet, M. Frank, S. P. Hau-Riege, S. Marchesini, B. W. Woods, S. Bajt, W. H. Benner, R. A. London, E. Plönjes, M. Kuhlmann, R. Treusch, S. Düsterer, T. Tschentscher, J. R. Schneider, E. Spiller, T. Möller, C. Bostedt, M. Hoener, D. A. Shapiro, K. O. Hodgson, D. van der Spoel, F. Burmeister, M. Bergh, C. Caleman, G. Huldt, M. M. Seibert, F. R. N. C. Maia, R. W. Lee, A. Szöke, N. Timneanu, J. Hajdu, “Femtosecond diffractive imaging with a soft-X-ray free-electron laser,” Nat. Phys. 2(12), 839–843 (2006).
[CrossRef]

Shoeman, R. L.

L. Redecke, K. Nass, D. P. DePonte, T. A. White, D. Rehders, A. Barty, F. Stellato, M. Liang, T. R. M. Barends, S. Boutet, G. J. Williams, M. Messerschmidt, M. M. Seibert, A. Aquila, D. Arnlund, S. Bajt, T. Barth, M. J. Bogan, C. Caleman, T. C. Chao, R. B. Doak, H. Fleckenstein, M. Frank, R. Fromme, L. Galli, I. Grotjohann, M. S. Hunter, L. C. Johansson, S. Kassemeyer, G. Katona, R. A. Kirian, R. Koopmann, C. Kupitz, L. Lomb, A. V. Martin, S. Mogk, R. Neutze, R. L. Shoeman, J. Steinbrener, N. Timneanu, D. Wang, U. Weierstall, N. A. Zatsepin, J. C. H. Spence, P. Fromme, I. Schlichting, M. Duszenko, C. Betzel, H. N. Chapman, “Natively inhibited Trypanosoma brucei Cathepsin B structure determined by using an X-ray laser,” Science 339(6116), 227–230 (2013).
[CrossRef] [PubMed]

S. Boutet, L. Lomb, G. J. Williams, T. R. M. Barends, A. Aquila, R. B. Doak, U. Weierstall, D. P. DePonte, J. Steinbrener, R. L. Shoeman, M. Messerschmidt, A. Barty, T. A. White, S. Kassemeyer, R. A. Kirian, M. M. Seibert, P. A. Montanez, C. Kenney, R. Herbst, P. Hart, J. Pines, G. Haller, S. M. Gruner, H. T. Philipp, M. W. Tate, M. Hromalik, L. J. Koerner, N. van Bakel, J. Morse, W. Ghonsalves, D. Arnlund, M. J. Bogan, C. Caleman, R. Fromme, C. Y. Hampton, M. S. Hunter, L. C. Johansson, G. Katona, C. Kupitz, M. Liang, A. V. Martin, K. Nass, L. Redecke, F. Stellato, N. Timneanu, D. Wang, N. A. Zatsepin, D. Schafer, J. Defever, R. Neutze, P. Fromme, J. C. H. Spence, H. N. Chapman, I. Schlichting, “High-resolution protein structure determination by serial femtosecond crystallography,” Science 337(6092), 362–364 (2012).
[CrossRef] [PubMed]

M. M. Seibert, T. Ekeberg, F. R. N. C. Maia, M. Svenda, J. Andreasson, O. Jönsson, D. Odić, B. Iwan, A. Rocker, D. Westphal, M. Hantke, D. P. DePonte, A. Barty, J. Schulz, L. Gumprecht, N. Coppola, A. Aquila, M. Liang, T. A. White, A. Martin, C. Caleman, S. Stern, C. Abergel, V. Seltzer, J. M. Claverie, C. Bostedt, J. D. Bozek, S. Boutet, A. A. Miahnahri, M. Messerschmidt, J. Krzywinski, G. Williams, K. O. Hodgson, M. J. Bogan, C. Y. Hampton, R. G. Sierra, D. Starodub, I. Andersson, S. Bajt, M. Barthelmess, J. C. H. Spence, P. Fromme, U. Weierstall, R. Kirian, M. Hunter, R. B. Doak, S. Marchesini, S. P. Hau-Riege, M. Frank, R. L. Shoeman, L. Lomb, S. W. Epp, R. Hartmann, D. Rolles, A. Rudenko, C. Schmidt, L. Foucar, N. Kimmel, P. Holl, B. Rudek, B. Erk, A. Hömke, C. Reich, D. Pietschner, G. Weidenspointner, L. Strüder, G. Hauser, H. Gorke, J. Ullrich, I. Schlichting, S. Herrmann, G. Schaller, F. Schopper, H. Soltau, K. U. Kühnel, R. Andritschke, C. D. Schröter, F. Krasniqi, M. Bott, S. Schorb, D. Rupp, M. Adolph, T. Gorkhover, H. Hirsemann, G. Potdevin, H. Graafsma, B. Nilsson, H. N. Chapman, J. Hajdu, “Single mimivirus particles intercepted and imaged with an X-ray laser,” Nature 470(7332), 78–81 (2011).
[CrossRef] [PubMed]

C. H. Yoon, P. Schwander, C. Abergel, I. Andersson, J. Andreasson, A. Aquila, S. Bajt, M. Barthelmess, A. Barty, M. J. Bogan, C. Bostedt, J. Bozek, H. N. Chapman, J. M. Claverie, N. Coppola, D. P. DePonte, T. Ekeberg, S. W. Epp, B. Erk, H. Fleckenstein, L. Foucar, H. Graafsma, L. Gumprecht, J. Hajdu, C. Y. Hampton, A. Hartmann, E. Hartmann, R. Hartmann, G. Hauser, H. Hirsemann, P. Holl, S. Kassemeyer, N. Kimmel, M. Kiskinova, M. Liang, N. T. D. Loh, L. Lomb, F. R. N. C. Maia, A. V. Martin, K. Nass, E. Pedersoli, C. Reich, D. Rolles, B. Rudek, A. Rudenko, I. Schlichting, J. Schulz, M. Seibert, V. Seltzer, R. L. Shoeman, R. G. Sierra, H. Soltau, D. Starodub, J. Steinbrener, G. Stier, L. Strüder, M. Svenda, J. Ullrich, G. Weidenspointner, T. A. White, C. Wunderer, A. Ourmazd, “Unsupervised classification of single-particle X-ray diffraction snapshots by spectral clustering,” Opt. Express 19(17), 16542–16549 (2011).
[CrossRef] [PubMed]

Sierra, R. G.

J. Kern, R. Alonso-Mori, R. Tran, J. Hattne, R. J. Gildea, N. Echols, C. Glöckner, J. Hellmich, H. Laksmono, R. G. Sierra, B. Lassalle-Kaiser, S. Koroidov, A. Lampe, G. Han, S. Gul, D. Difiore, D. Milathianaki, A. R. Fry, A. Miahnahri, D. W. Schafer, M. Messerschmidt, M. M. Seibert, J. E. Koglin, D. Sokaras, T. C. Weng, J. Sellberg, M. J. Latimer, R. W. Grosse-Kunstleve, P. H. Zwart, W. E. White, P. Glatzel, P. D. Adams, M. J. Bogan, G. J. Williams, S. Boutet, J. Messinger, A. Zouni, N. K. Sauter, V. K. Yachandra, U. Bergmann, J. Yano, “Simultaneous femtosecond X-ray spectroscopy and diffraction of photosystem II at room temperature,” Science 340(6131), 491–495 (2013).
[CrossRef] [PubMed]

M. M. Seibert, T. Ekeberg, F. R. N. C. Maia, M. Svenda, J. Andreasson, O. Jönsson, D. Odić, B. Iwan, A. Rocker, D. Westphal, M. Hantke, D. P. DePonte, A. Barty, J. Schulz, L. Gumprecht, N. Coppola, A. Aquila, M. Liang, T. A. White, A. Martin, C. Caleman, S. Stern, C. Abergel, V. Seltzer, J. M. Claverie, C. Bostedt, J. D. Bozek, S. Boutet, A. A. Miahnahri, M. Messerschmidt, J. Krzywinski, G. Williams, K. O. Hodgson, M. J. Bogan, C. Y. Hampton, R. G. Sierra, D. Starodub, I. Andersson, S. Bajt, M. Barthelmess, J. C. H. Spence, P. Fromme, U. Weierstall, R. Kirian, M. Hunter, R. B. Doak, S. Marchesini, S. P. Hau-Riege, M. Frank, R. L. Shoeman, L. Lomb, S. W. Epp, R. Hartmann, D. Rolles, A. Rudenko, C. Schmidt, L. Foucar, N. Kimmel, P. Holl, B. Rudek, B. Erk, A. Hömke, C. Reich, D. Pietschner, G. Weidenspointner, L. Strüder, G. Hauser, H. Gorke, J. Ullrich, I. Schlichting, S. Herrmann, G. Schaller, F. Schopper, H. Soltau, K. U. Kühnel, R. Andritschke, C. D. Schröter, F. Krasniqi, M. Bott, S. Schorb, D. Rupp, M. Adolph, T. Gorkhover, H. Hirsemann, G. Potdevin, H. Graafsma, B. Nilsson, H. N. Chapman, J. Hajdu, “Single mimivirus particles intercepted and imaged with an X-ray laser,” Nature 470(7332), 78–81 (2011).
[CrossRef] [PubMed]

C. H. Yoon, P. Schwander, C. Abergel, I. Andersson, J. Andreasson, A. Aquila, S. Bajt, M. Barthelmess, A. Barty, M. J. Bogan, C. Bostedt, J. Bozek, H. N. Chapman, J. M. Claverie, N. Coppola, D. P. DePonte, T. Ekeberg, S. W. Epp, B. Erk, H. Fleckenstein, L. Foucar, H. Graafsma, L. Gumprecht, J. Hajdu, C. Y. Hampton, A. Hartmann, E. Hartmann, R. Hartmann, G. Hauser, H. Hirsemann, P. Holl, S. Kassemeyer, N. Kimmel, M. Kiskinova, M. Liang, N. T. D. Loh, L. Lomb, F. R. N. C. Maia, A. V. Martin, K. Nass, E. Pedersoli, C. Reich, D. Rolles, B. Rudek, A. Rudenko, I. Schlichting, J. Schulz, M. Seibert, V. Seltzer, R. L. Shoeman, R. G. Sierra, H. Soltau, D. Starodub, J. Steinbrener, G. Stier, L. Strüder, M. Svenda, J. Ullrich, G. Weidenspointner, T. A. White, C. Wunderer, A. Ourmazd, “Unsupervised classification of single-particle X-ray diffraction snapshots by spectral clustering,” Opt. Express 19(17), 16542–16549 (2011).
[CrossRef] [PubMed]

M. J. Bogan, D. Starodub, C. Y. Hampton, R. G. Sierra, “Single-particle coherent diffractive imaging with a soft x-ray free electron laser: towards soot aerosol morphology,” J. Phys. At. Mol. Opt. Phys. 43(19), 194013 (2010).
[CrossRef]

Sigalotti, P.

E. Allaria, R. Appio, L. Badano, W. A. Barletta, S. Bassanese, S. G. Biedron, A. Borga, E. Busetto, D. Castronovo, P. Cinquegrana, S. Cleva, D. Cocco, M. Cornacchia, P. Craievich, I. Cudin, G. D’Auria, M. Dal Forno, M. B. Danailov, R. De Monte, G. De Ninno, P. Delgiusto, A. Demidovich, S. Di Mitri, B. Diviacco, A. Fabris, R. Fabris, W. Fawley, M. Ferianis, E. Ferrari, S. Ferry, L. Froehlich, P. Furlan, G. Gaio, F. Gelmetti, L. Giannessi, M. Giannini, R. Gobessi, R. Ivanov, E. Karantzoulis, M. Lonza, A. Lutman, B. Mahieu, M. Milloch, S. V. Milton, M. Musardo, I. Nikolov, S. Noe, F. Parmigiani, G. Penco, M. Petronio, L. Pivetta, M. Predonzani, F. Rossi, L. Rumiz, A. Salom, C. Scafuri, C. Serpico, P. Sigalotti, S. Spampinati, C. Spezzani, M. Svandrlik, C. Svetina, S. Tazzari, M. Trovo, R. Umer, A. Vascotto, M. Veronese, R. Visintini, M. Zaccaria, D. Zangrando, M. Zangrando, “Highly coherent and stable pulses from the FERMI seeded free-electron laser in the extreme ultraviolet,” Nat. Photonics 6(10), 699–704 (2012).
[CrossRef]

Singer, A.

A. P. Mancuso, T. Gorniak, F. Staier, O. M. Yefanov, R. Barth, C. Christophis, B. Reime, J. Gulden, A. Singer, M. E. Pettit, T. Nisius, T. Wilhein, C. Gutt, G. Grübel, N. Guerassimova, R. Treusch, J. Feldhaus, S. Eisebitt, E. Weckert, M. Grunze, A. Rosenhahn, I. A. Vartanyants, “Coherent imaging of biological samples with femtosecond pulses at the free-electron laser FLASH,” New J. Phys. 12(3), 035003 (2010).
[CrossRef]

Sokaras, D.

J. Kern, R. Alonso-Mori, R. Tran, J. Hattne, R. J. Gildea, N. Echols, C. Glöckner, J. Hellmich, H. Laksmono, R. G. Sierra, B. Lassalle-Kaiser, S. Koroidov, A. Lampe, G. Han, S. Gul, D. Difiore, D. Milathianaki, A. R. Fry, A. Miahnahri, D. W. Schafer, M. Messerschmidt, M. M. Seibert, J. E. Koglin, D. Sokaras, T. C. Weng, J. Sellberg, M. J. Latimer, R. W. Grosse-Kunstleve, P. H. Zwart, W. E. White, P. Glatzel, P. D. Adams, M. J. Bogan, G. J. Williams, S. Boutet, J. Messinger, A. Zouni, N. K. Sauter, V. K. Yachandra, U. Bergmann, J. Yano, “Simultaneous femtosecond X-ray spectroscopy and diffraction of photosystem II at room temperature,” Science 340(6131), 491–495 (2013).
[CrossRef] [PubMed]

Soltau, H.

M. M. Seibert, T. Ekeberg, F. R. N. C. Maia, M. Svenda, J. Andreasson, O. Jönsson, D. Odić, B. Iwan, A. Rocker, D. Westphal, M. Hantke, D. P. DePonte, A. Barty, J. Schulz, L. Gumprecht, N. Coppola, A. Aquila, M. Liang, T. A. White, A. Martin, C. Caleman, S. Stern, C. Abergel, V. Seltzer, J. M. Claverie, C. Bostedt, J. D. Bozek, S. Boutet, A. A. Miahnahri, M. Messerschmidt, J. Krzywinski, G. Williams, K. O. Hodgson, M. J. Bogan, C. Y. Hampton, R. G. Sierra, D. Starodub, I. Andersson, S. Bajt, M. Barthelmess, J. C. H. Spence, P. Fromme, U. Weierstall, R. Kirian, M. Hunter, R. B. Doak, S. Marchesini, S. P. Hau-Riege, M. Frank, R. L. Shoeman, L. Lomb, S. W. Epp, R. Hartmann, D. Rolles, A. Rudenko, C. Schmidt, L. Foucar, N. Kimmel, P. Holl, B. Rudek, B. Erk, A. Hömke, C. Reich, D. Pietschner, G. Weidenspointner, L. Strüder, G. Hauser, H. Gorke, J. Ullrich, I. Schlichting, S. Herrmann, G. Schaller, F. Schopper, H. Soltau, K. U. Kühnel, R. Andritschke, C. D. Schröter, F. Krasniqi, M. Bott, S. Schorb, D. Rupp, M. Adolph, T. Gorkhover, H. Hirsemann, G. Potdevin, H. Graafsma, B. Nilsson, H. N. Chapman, J. Hajdu, “Single mimivirus particles intercepted and imaged with an X-ray laser,” Nature 470(7332), 78–81 (2011).
[CrossRef] [PubMed]

C. H. Yoon, P. Schwander, C. Abergel, I. Andersson, J. Andreasson, A. Aquila, S. Bajt, M. Barthelmess, A. Barty, M. J. Bogan, C. Bostedt, J. Bozek, H. N. Chapman, J. M. Claverie, N. Coppola, D. P. DePonte, T. Ekeberg, S. W. Epp, B. Erk, H. Fleckenstein, L. Foucar, H. Graafsma, L. Gumprecht, J. Hajdu, C. Y. Hampton, A. Hartmann, E. Hartmann, R. Hartmann, G. Hauser, H. Hirsemann, P. Holl, S. Kassemeyer, N. Kimmel, M. Kiskinova, M. Liang, N. T. D. Loh, L. Lomb, F. R. N. C. Maia, A. V. Martin, K. Nass, E. Pedersoli, C. Reich, D. Rolles, B. Rudek, A. Rudenko, I. Schlichting, J. Schulz, M. Seibert, V. Seltzer, R. L. Shoeman, R. G. Sierra, H. Soltau, D. Starodub, J. Steinbrener, G. Stier, L. Strüder, M. Svenda, J. Ullrich, G. Weidenspointner, T. A. White, C. Wunderer, A. Ourmazd, “Unsupervised classification of single-particle X-ray diffraction snapshots by spectral clustering,” Opt. Express 19(17), 16542–16549 (2011).
[CrossRef] [PubMed]

Spahn, C. M. T.

P. A. Penczek, M. Kimmel, C. M. T. Spahn, “Identifying conformational states of macromolecules by eigen-analysis of resampled cryo-EM images,” Structure 19(11), 1582–1590 (2011).
[CrossRef] [PubMed]

Spampinati, S.

E. Allaria, R. Appio, L. Badano, W. A. Barletta, S. Bassanese, S. G. Biedron, A. Borga, E. Busetto, D. Castronovo, P. Cinquegrana, S. Cleva, D. Cocco, M. Cornacchia, P. Craievich, I. Cudin, G. D’Auria, M. Dal Forno, M. B. Danailov, R. De Monte, G. De Ninno, P. Delgiusto, A. Demidovich, S. Di Mitri, B. Diviacco, A. Fabris, R. Fabris, W. Fawley, M. Ferianis, E. Ferrari, S. Ferry, L. Froehlich, P. Furlan, G. Gaio, F. Gelmetti, L. Giannessi, M. Giannini, R. Gobessi, R. Ivanov, E. Karantzoulis, M. Lonza, A. Lutman, B. Mahieu, M. Milloch, S. V. Milton, M. Musardo, I. Nikolov, S. Noe, F. Parmigiani, G. Penco, M. Petronio, L. Pivetta, M. Predonzani, F. Rossi, L. Rumiz, A. Salom, C. Scafuri, C. Serpico, P. Sigalotti, S. Spampinati, C. Spezzani, M. Svandrlik, C. Svetina, S. Tazzari, M. Trovo, R. Umer, A. Vascotto, M. Veronese, R. Visintini, M. Zaccaria, D. Zangrando, M. Zangrando, “Highly coherent and stable pulses from the FERMI seeded free-electron laser in the extreme ultraviolet,” Nat. Photonics 6(10), 699–704 (2012).
[CrossRef]

Spence, J. C. H.

L. Redecke, K. Nass, D. P. DePonte, T. A. White, D. Rehders, A. Barty, F. Stellato, M. Liang, T. R. M. Barends, S. Boutet, G. J. Williams, M. Messerschmidt, M. M. Seibert, A. Aquila, D. Arnlund, S. Bajt, T. Barth, M. J. Bogan, C. Caleman, T. C. Chao, R. B. Doak, H. Fleckenstein, M. Frank, R. Fromme, L. Galli, I. Grotjohann, M. S. Hunter, L. C. Johansson, S. Kassemeyer, G. Katona, R. A. Kirian, R. Koopmann, C. Kupitz, L. Lomb, A. V. Martin, S. Mogk, R. Neutze, R. L. Shoeman, J. Steinbrener, N. Timneanu, D. Wang, U. Weierstall, N. A. Zatsepin, J. C. H. Spence, P. Fromme, I. Schlichting, M. Duszenko, C. Betzel, H. N. Chapman, “Natively inhibited Trypanosoma brucei Cathepsin B structure determined by using an X-ray laser,” Science 339(6116), 227–230 (2013).
[CrossRef] [PubMed]

S. Boutet, L. Lomb, G. J. Williams, T. R. M. Barends, A. Aquila, R. B. Doak, U. Weierstall, D. P. DePonte, J. Steinbrener, R. L. Shoeman, M. Messerschmidt, A. Barty, T. A. White, S. Kassemeyer, R. A. Kirian, M. M. Seibert, P. A. Montanez, C. Kenney, R. Herbst, P. Hart, J. Pines, G. Haller, S. M. Gruner, H. T. Philipp, M. W. Tate, M. Hromalik, L. J. Koerner, N. van Bakel, J. Morse, W. Ghonsalves, D. Arnlund, M. J. Bogan, C. Caleman, R. Fromme, C. Y. Hampton, M. S. Hunter, L. C. Johansson, G. Katona, C. Kupitz, M. Liang, A. V. Martin, K. Nass, L. Redecke, F. Stellato, N. Timneanu, D. Wang, N. A. Zatsepin, D. Schafer, J. Defever, R. Neutze, P. Fromme, J. C. H. Spence, H. N. Chapman, I. Schlichting, “High-resolution protein structure determination by serial femtosecond crystallography,” Science 337(6092), 362–364 (2012).
[CrossRef] [PubMed]

M. M. Seibert, T. Ekeberg, F. R. N. C. Maia, M. Svenda, J. Andreasson, O. Jönsson, D. Odić, B. Iwan, A. Rocker, D. Westphal, M. Hantke, D. P. DePonte, A. Barty, J. Schulz, L. Gumprecht, N. Coppola, A. Aquila, M. Liang, T. A. White, A. Martin, C. Caleman, S. Stern, C. Abergel, V. Seltzer, J. M. Claverie, C. Bostedt, J. D. Bozek, S. Boutet, A. A. Miahnahri, M. Messerschmidt, J. Krzywinski, G. Williams, K. O. Hodgson, M. J. Bogan, C. Y. Hampton, R. G. Sierra, D. Starodub, I. Andersson, S. Bajt, M. Barthelmess, J. C. H. Spence, P. Fromme, U. Weierstall, R. Kirian, M. Hunter, R. B. Doak, S. Marchesini, S. P. Hau-Riege, M. Frank, R. L. Shoeman, L. Lomb, S. W. Epp, R. Hartmann, D. Rolles, A. Rudenko, C. Schmidt, L. Foucar, N. Kimmel, P. Holl, B. Rudek, B. Erk, A. Hömke, C. Reich, D. Pietschner, G. Weidenspointner, L. Strüder, G. Hauser, H. Gorke, J. Ullrich, I. Schlichting, S. Herrmann, G. Schaller, F. Schopper, H. Soltau, K. U. Kühnel, R. Andritschke, C. D. Schröter, F. Krasniqi, M. Bott, S. Schorb, D. Rupp, M. Adolph, T. Gorkhover, H. Hirsemann, G. Potdevin, H. Graafsma, B. Nilsson, H. N. Chapman, J. Hajdu, “Single mimivirus particles intercepted and imaged with an X-ray laser,” Nature 470(7332), 78–81 (2011).
[CrossRef] [PubMed]

H. N. Chapman, A. Barty, S. Marchesini, A. Noy, S. P. Hau-Riege, C. Cui, M. R. Howells, R. Rosen, H. He, J. C. H. Spence, U. Weierstall, T. Beetz, C. Jacobsen, D. Shapiro, “High-resolution ab initio three-dimensional x-ray diffraction microscopy,” J. Opt. Soc. Am. A 23(5), 1179 (2006).
[CrossRef]

S. Marchesini, H. He, H. N. Chapman, S. P. Hau-Riege, A. Noy, M. R. Howells, U. Weierstall, J. C. H. Spence, “X-ray image reconstruction from a diffraction pattern alone,” Phys. Rev. B 68(14), 140101 (2003).
[CrossRef]

Spezzani, C.

E. Allaria, R. Appio, L. Badano, W. A. Barletta, S. Bassanese, S. G. Biedron, A. Borga, E. Busetto, D. Castronovo, P. Cinquegrana, S. Cleva, D. Cocco, M. Cornacchia, P. Craievich, I. Cudin, G. D’Auria, M. Dal Forno, M. B. Danailov, R. De Monte, G. De Ninno, P. Delgiusto, A. Demidovich, S. Di Mitri, B. Diviacco, A. Fabris, R. Fabris, W. Fawley, M. Ferianis, E. Ferrari, S. Ferry, L. Froehlich, P. Furlan, G. Gaio, F. Gelmetti, L. Giannessi, M. Giannini, R. Gobessi, R. Ivanov, E. Karantzoulis, M. Lonza, A. Lutman, B. Mahieu, M. Milloch, S. V. Milton, M. Musardo, I. Nikolov, S. Noe, F. Parmigiani, G. Penco, M. Petronio, L. Pivetta, M. Predonzani, F. Rossi, L. Rumiz, A. Salom, C. Scafuri, C. Serpico, P. Sigalotti, S. Spampinati, C. Spezzani, M. Svandrlik, C. Svetina, S. Tazzari, M. Trovo, R. Umer, A. Vascotto, M. Veronese, R. Visintini, M. Zaccaria, D. Zangrando, M. Zangrando, “Highly coherent and stable pulses from the FERMI seeded free-electron laser in the extreme ultraviolet,” Nat. Photonics 6(10), 699–704 (2012).
[CrossRef]

Spiller, E.

H. N. Chapman, A. Barty, M. J. Bogan, S. Boutet, M. Frank, S. P. Hau-Riege, S. Marchesini, B. W. Woods, S. Bajt, W. H. Benner, R. A. London, E. Plönjes, M. Kuhlmann, R. Treusch, S. Düsterer, T. Tschentscher, J. R. Schneider, E. Spiller, T. Möller, C. Bostedt, M. Hoener, D. A. Shapiro, K. O. Hodgson, D. van der Spoel, F. Burmeister, M. Bergh, C. Caleman, G. Huldt, M. M. Seibert, F. R. N. C. Maia, R. W. Lee, A. Szöke, N. Timneanu, J. Hajdu, “Femtosecond diffractive imaging with a soft-X-ray free-electron laser,” Nat. Phys. 2(12), 839–843 (2006).
[CrossRef]

Staier, F.

A. P. Mancuso, T. Gorniak, F. Staier, O. M. Yefanov, R. Barth, C. Christophis, B. Reime, J. Gulden, A. Singer, M. E. Pettit, T. Nisius, T. Wilhein, C. Gutt, G. Grübel, N. Guerassimova, R. Treusch, J. Feldhaus, S. Eisebitt, E. Weckert, M. Grunze, A. Rosenhahn, I. A. Vartanyants, “Coherent imaging of biological samples with femtosecond pulses at the free-electron laser FLASH,” New J. Phys. 12(3), 035003 (2010).
[CrossRef]

Starodub, D.

M. M. Seibert, T. Ekeberg, F. R. N. C. Maia, M. Svenda, J. Andreasson, O. Jönsson, D. Odić, B. Iwan, A. Rocker, D. Westphal, M. Hantke, D. P. DePonte, A. Barty, J. Schulz, L. Gumprecht, N. Coppola, A. Aquila, M. Liang, T. A. White, A. Martin, C. Caleman, S. Stern, C. Abergel, V. Seltzer, J. M. Claverie, C. Bostedt, J. D. Bozek, S. Boutet, A. A. Miahnahri, M. Messerschmidt, J. Krzywinski, G. Williams, K. O. Hodgson, M. J. Bogan, C. Y. Hampton, R. G. Sierra, D. Starodub, I. Andersson, S. Bajt, M. Barthelmess, J. C. H. Spence, P. Fromme, U. Weierstall, R. Kirian, M. Hunter, R. B. Doak, S. Marchesini, S. P. Hau-Riege, M. Frank, R. L. Shoeman, L. Lomb, S. W. Epp, R. Hartmann, D. Rolles, A. Rudenko, C. Schmidt, L. Foucar, N. Kimmel, P. Holl, B. Rudek, B. Erk, A. Hömke, C. Reich, D. Pietschner, G. Weidenspointner, L. Strüder, G. Hauser, H. Gorke, J. Ullrich, I. Schlichting, S. Herrmann, G. Schaller, F. Schopper, H. Soltau, K. U. Kühnel, R. Andritschke, C. D. Schröter, F. Krasniqi, M. Bott, S. Schorb, D. Rupp, M. Adolph, T. Gorkhover, H. Hirsemann, G. Potdevin, H. Graafsma, B. Nilsson, H. N. Chapman, J. Hajdu, “Single mimivirus particles intercepted and imaged with an X-ray laser,” Nature 470(7332), 78–81 (2011).
[CrossRef] [PubMed]

C. H. Yoon, P. Schwander, C. Abergel, I. Andersson, J. Andreasson, A. Aquila, S. Bajt, M. Barthelmess, A. Barty, M. J. Bogan, C. Bostedt, J. Bozek, H. N. Chapman, J. M. Claverie, N. Coppola, D. P. DePonte, T. Ekeberg, S. W. Epp, B. Erk, H. Fleckenstein, L. Foucar, H. Graafsma, L. Gumprecht, J. Hajdu, C. Y. Hampton, A. Hartmann, E. Hartmann, R. Hartmann, G. Hauser, H. Hirsemann, P. Holl, S. Kassemeyer, N. Kimmel, M. Kiskinova, M. Liang, N. T. D. Loh, L. Lomb, F. R. N. C. Maia, A. V. Martin, K. Nass, E. Pedersoli, C. Reich, D. Rolles, B. Rudek, A. Rudenko, I. Schlichting, J. Schulz, M. Seibert, V. Seltzer, R. L. Shoeman, R. G. Sierra, H. Soltau, D. Starodub, J. Steinbrener, G. Stier, L. Strüder, M. Svenda, J. Ullrich, G. Weidenspointner, T. A. White, C. Wunderer, A. Ourmazd, “Unsupervised classification of single-particle X-ray diffraction snapshots by spectral clustering,” Opt. Express 19(17), 16542–16549 (2011).
[CrossRef] [PubMed]

M. J. Bogan, D. Starodub, C. Y. Hampton, R. G. Sierra, “Single-particle coherent diffractive imaging with a soft x-ray free electron laser: towards soot aerosol morphology,” J. Phys. At. Mol. Opt. Phys. 43(19), 194013 (2010).
[CrossRef]

Steinbrener, J.

L. Redecke, K. Nass, D. P. DePonte, T. A. White, D. Rehders, A. Barty, F. Stellato, M. Liang, T. R. M. Barends, S. Boutet, G. J. Williams, M. Messerschmidt, M. M. Seibert, A. Aquila, D. Arnlund, S. Bajt, T. Barth, M. J. Bogan, C. Caleman, T. C. Chao, R. B. Doak, H. Fleckenstein, M. Frank, R. Fromme, L. Galli, I. Grotjohann, M. S. Hunter, L. C. Johansson, S. Kassemeyer, G. Katona, R. A. Kirian, R. Koopmann, C. Kupitz, L. Lomb, A. V. Martin, S. Mogk, R. Neutze, R. L. Shoeman, J. Steinbrener, N. Timneanu, D. Wang, U. Weierstall, N. A. Zatsepin, J. C. H. Spence, P. Fromme, I. Schlichting, M. Duszenko, C. Betzel, H. N. Chapman, “Natively inhibited Trypanosoma brucei Cathepsin B structure determined by using an X-ray laser,” Science 339(6116), 227–230 (2013).
[CrossRef] [PubMed]

S. Boutet, L. Lomb, G. J. Williams, T. R. M. Barends, A. Aquila, R. B. Doak, U. Weierstall, D. P. DePonte, J. Steinbrener, R. L. Shoeman, M. Messerschmidt, A. Barty, T. A. White, S. Kassemeyer, R. A. Kirian, M. M. Seibert, P. A. Montanez, C. Kenney, R. Herbst, P. Hart, J. Pines, G. Haller, S. M. Gruner, H. T. Philipp, M. W. Tate, M. Hromalik, L. J. Koerner, N. van Bakel, J. Morse, W. Ghonsalves, D. Arnlund, M. J. Bogan, C. Caleman, R. Fromme, C. Y. Hampton, M. S. Hunter, L. C. Johansson, G. Katona, C. Kupitz, M. Liang, A. V. Martin, K. Nass, L. Redecke, F. Stellato, N. Timneanu, D. Wang, N. A. Zatsepin, D. Schafer, J. Defever, R. Neutze, P. Fromme, J. C. H. Spence, H. N. Chapman, I. Schlichting, “High-resolution protein structure determination by serial femtosecond crystallography,” Science 337(6092), 362–364 (2012).
[CrossRef] [PubMed]

C. H. Yoon, P. Schwander, C. Abergel, I. Andersson, J. Andreasson, A. Aquila, S. Bajt, M. Barthelmess, A. Barty, M. J. Bogan, C. Bostedt, J. Bozek, H. N. Chapman, J. M. Claverie, N. Coppola, D. P. DePonte, T. Ekeberg, S. W. Epp, B. Erk, H. Fleckenstein, L. Foucar, H. Graafsma, L. Gumprecht, J. Hajdu, C. Y. Hampton, A. Hartmann, E. Hartmann, R. Hartmann, G. Hauser, H. Hirsemann, P. Holl, S. Kassemeyer, N. Kimmel, M. Kiskinova, M. Liang, N. T. D. Loh, L. Lomb, F. R. N. C. Maia, A. V. Martin, K. Nass, E. Pedersoli, C. Reich, D. Rolles, B. Rudek, A. Rudenko, I. Schlichting, J. Schulz, M. Seibert, V. Seltzer, R. L. Shoeman, R. G. Sierra, H. Soltau, D. Starodub, J. Steinbrener, G. Stier, L. Strüder, M. Svenda, J. Ullrich, G. Weidenspointner, T. A. White, C. Wunderer, A. Ourmazd, “Unsupervised classification of single-particle X-ray diffraction snapshots by spectral clustering,” Opt. Express 19(17), 16542–16549 (2011).
[CrossRef] [PubMed]

Stellato, F.

L. Redecke, K. Nass, D. P. DePonte, T. A. White, D. Rehders, A. Barty, F. Stellato, M. Liang, T. R. M. Barends, S. Boutet, G. J. Williams, M. Messerschmidt, M. M. Seibert, A. Aquila, D. Arnlund, S. Bajt, T. Barth, M. J. Bogan, C. Caleman, T. C. Chao, R. B. Doak, H. Fleckenstein, M. Frank, R. Fromme, L. Galli, I. Grotjohann, M. S. Hunter, L. C. Johansson, S. Kassemeyer, G. Katona, R. A. Kirian, R. Koopmann, C. Kupitz, L. Lomb, A. V. Martin, S. Mogk, R. Neutze, R. L. Shoeman, J. Steinbrener, N. Timneanu, D. Wang, U. Weierstall, N. A. Zatsepin, J. C. H. Spence, P. Fromme, I. Schlichting, M. Duszenko, C. Betzel, H. N. Chapman, “Natively inhibited Trypanosoma brucei Cathepsin B structure determined by using an X-ray laser,” Science 339(6116), 227–230 (2013).
[CrossRef] [PubMed]

S. Boutet, L. Lomb, G. J. Williams, T. R. M. Barends, A. Aquila, R. B. Doak, U. Weierstall, D. P. DePonte, J. Steinbrener, R. L. Shoeman, M. Messerschmidt, A. Barty, T. A. White, S. Kassemeyer, R. A. Kirian, M. M. Seibert, P. A. Montanez, C. Kenney, R. Herbst, P. Hart, J. Pines, G. Haller, S. M. Gruner, H. T. Philipp, M. W. Tate, M. Hromalik, L. J. Koerner, N. van Bakel, J. Morse, W. Ghonsalves, D. Arnlund, M. J. Bogan, C. Caleman, R. Fromme, C. Y. Hampton, M. S. Hunter, L. C. Johansson, G. Katona, C. Kupitz, M. Liang, A. V. Martin, K. Nass, L. Redecke, F. Stellato, N. Timneanu, D. Wang, N. A. Zatsepin, D. Schafer, J. Defever, R. Neutze, P. Fromme, J. C. H. Spence, H. N. Chapman, I. Schlichting, “High-resolution protein structure determination by serial femtosecond crystallography,” Science 337(6092), 362–364 (2012).
[CrossRef] [PubMed]

Stern, S.

M. M. Seibert, T. Ekeberg, F. R. N. C. Maia, M. Svenda, J. Andreasson, O. Jönsson, D. Odić, B. Iwan, A. Rocker, D. Westphal, M. Hantke, D. P. DePonte, A. Barty, J. Schulz, L. Gumprecht, N. Coppola, A. Aquila, M. Liang, T. A. White, A. Martin, C. Caleman, S. Stern, C. Abergel, V. Seltzer, J. M. Claverie, C. Bostedt, J. D. Bozek, S. Boutet, A. A. Miahnahri, M. Messerschmidt, J. Krzywinski, G. Williams, K. O. Hodgson, M. J. Bogan, C. Y. Hampton, R. G. Sierra, D. Starodub, I. Andersson, S. Bajt, M. Barthelmess, J. C. H. Spence, P. Fromme, U. Weierstall, R. Kirian, M. Hunter, R. B. Doak, S. Marchesini, S. P. Hau-Riege, M. Frank, R. L. Shoeman, L. Lomb, S. W. Epp, R. Hartmann, D. Rolles, A. Rudenko, C. Schmidt, L. Foucar, N. Kimmel, P. Holl, B. Rudek, B. Erk, A. Hömke, C. Reich, D. Pietschner, G. Weidenspointner, L. Strüder, G. Hauser, H. Gorke, J. Ullrich, I. Schlichting, S. Herrmann, G. Schaller, F. Schopper, H. Soltau, K. U. Kühnel, R. Andritschke, C. D. Schröter, F. Krasniqi, M. Bott, S. Schorb, D. Rupp, M. Adolph, T. Gorkhover, H. Hirsemann, G. Potdevin, H. Graafsma, B. Nilsson, H. N. Chapman, J. Hajdu, “Single mimivirus particles intercepted and imaged with an X-ray laser,” Nature 470(7332), 78–81 (2011).
[CrossRef] [PubMed]

Stier, G.

Strüder, L.

M. M. Seibert, T. Ekeberg, F. R. N. C. Maia, M. Svenda, J. Andreasson, O. Jönsson, D. Odić, B. Iwan, A. Rocker, D. Westphal, M. Hantke, D. P. DePonte, A. Barty, J. Schulz, L. Gumprecht, N. Coppola, A. Aquila, M. Liang, T. A. White, A. Martin, C. Caleman, S. Stern, C. Abergel, V. Seltzer, J. M. Claverie, C. Bostedt, J. D. Bozek, S. Boutet, A. A. Miahnahri, M. Messerschmidt, J. Krzywinski, G. Williams, K. O. Hodgson, M. J. Bogan, C. Y. Hampton, R. G. Sierra, D. Starodub, I. Andersson, S. Bajt, M. Barthelmess, J. C. H. Spence, P. Fromme, U. Weierstall, R. Kirian, M. Hunter, R. B. Doak, S. Marchesini, S. P. Hau-Riege, M. Frank, R. L. Shoeman, L. Lomb, S. W. Epp, R. Hartmann, D. Rolles, A. Rudenko, C. Schmidt, L. Foucar, N. Kimmel, P. Holl, B. Rudek, B. Erk, A. Hömke, C. Reich, D. Pietschner, G. Weidenspointner, L. Strüder, G. Hauser, H. Gorke, J. Ullrich, I. Schlichting, S. Herrmann, G. Schaller, F. Schopper, H. Soltau, K. U. Kühnel, R. Andritschke, C. D. Schröter, F. Krasniqi, M. Bott, S. Schorb, D. Rupp, M. Adolph, T. Gorkhover, H. Hirsemann, G. Potdevin, H. Graafsma, B. Nilsson, H. N. Chapman, J. Hajdu, “Single mimivirus particles intercepted and imaged with an X-ray laser,” Nature 470(7332), 78–81 (2011).
[CrossRef] [PubMed]

C. H. Yoon, P. Schwander, C. Abergel, I. Andersson, J. Andreasson, A. Aquila, S. Bajt, M. Barthelmess, A. Barty, M. J. Bogan, C. Bostedt, J. Bozek, H. N. Chapman, J. M. Claverie, N. Coppola, D. P. DePonte, T. Ekeberg, S. W. Epp, B. Erk, H. Fleckenstein, L. Foucar, H. Graafsma, L. Gumprecht, J. Hajdu, C. Y. Hampton, A. Hartmann, E. Hartmann, R. Hartmann, G. Hauser, H. Hirsemann, P. Holl, S. Kassemeyer, N. Kimmel, M. Kiskinova, M. Liang, N. T. D. Loh, L. Lomb, F. R. N. C. Maia, A. V. Martin, K. Nass, E. Pedersoli, C. Reich, D. Rolles, B. Rudek, A. Rudenko, I. Schlichting, J. Schulz, M. Seibert, V. Seltzer, R. L. Shoeman, R. G. Sierra, H. Soltau, D. Starodub, J. Steinbrener, G. Stier, L. Strüder, M. Svenda, J. Ullrich, G. Weidenspointner, T. A. White, C. Wunderer, A. Ourmazd, “Unsupervised classification of single-particle X-ray diffraction snapshots by spectral clustering,” Opt. Express 19(17), 16542–16549 (2011).
[CrossRef] [PubMed]

Svandrlik, M.

E. Allaria, R. Appio, L. Badano, W. A. Barletta, S. Bassanese, S. G. Biedron, A. Borga, E. Busetto, D. Castronovo, P. Cinquegrana, S. Cleva, D. Cocco, M. Cornacchia, P. Craievich, I. Cudin, G. D’Auria, M. Dal Forno, M. B. Danailov, R. De Monte, G. De Ninno, P. Delgiusto, A. Demidovich, S. Di Mitri, B. Diviacco, A. Fabris, R. Fabris, W. Fawley, M. Ferianis, E. Ferrari, S. Ferry, L. Froehlich, P. Furlan, G. Gaio, F. Gelmetti, L. Giannessi, M. Giannini, R. Gobessi, R. Ivanov, E. Karantzoulis, M. Lonza, A. Lutman, B. Mahieu, M. Milloch, S. V. Milton, M. Musardo, I. Nikolov, S. Noe, F. Parmigiani, G. Penco, M. Petronio, L. Pivetta, M. Predonzani, F. Rossi, L. Rumiz, A. Salom, C. Scafuri, C. Serpico, P. Sigalotti, S. Spampinati, C. Spezzani, M. Svandrlik, C. Svetina, S. Tazzari, M. Trovo, R. Umer, A. Vascotto, M. Veronese, R. Visintini, M. Zaccaria, D. Zangrando, M. Zangrando, “Highly coherent and stable pulses from the FERMI seeded free-electron laser in the extreme ultraviolet,” Nat. Photonics 6(10), 699–704 (2012).
[CrossRef]

Svenda, M.

M. M. Seibert, T. Ekeberg, F. R. N. C. Maia, M. Svenda, J. Andreasson, O. Jönsson, D. Odić, B. Iwan, A. Rocker, D. Westphal, M. Hantke, D. P. DePonte, A. Barty, J. Schulz, L. Gumprecht, N. Coppola, A. Aquila, M. Liang, T. A. White, A. Martin, C. Caleman, S. Stern, C. Abergel, V. Seltzer, J. M. Claverie, C. Bostedt, J. D. Bozek, S. Boutet, A. A. Miahnahri, M. Messerschmidt, J. Krzywinski, G. Williams, K. O. Hodgson, M. J. Bogan, C. Y. Hampton, R. G. Sierra, D. Starodub, I. Andersson, S. Bajt, M. Barthelmess, J. C. H. Spence, P. Fromme, U. Weierstall, R. Kirian, M. Hunter, R. B. Doak, S. Marchesini, S. P. Hau-Riege, M. Frank, R. L. Shoeman, L. Lomb, S. W. Epp, R. Hartmann, D. Rolles, A. Rudenko, C. Schmidt, L. Foucar, N. Kimmel, P. Holl, B. Rudek, B. Erk, A. Hömke, C. Reich, D. Pietschner, G. Weidenspointner, L. Strüder, G. Hauser, H. Gorke, J. Ullrich, I. Schlichting, S. Herrmann, G. Schaller, F. Schopper, H. Soltau, K. U. Kühnel, R. Andritschke, C. D. Schröter, F. Krasniqi, M. Bott, S. Schorb, D. Rupp, M. Adolph, T. Gorkhover, H. Hirsemann, G. Potdevin, H. Graafsma, B. Nilsson, H. N. Chapman, J. Hajdu, “Single mimivirus particles intercepted and imaged with an X-ray laser,” Nature 470(7332), 78–81 (2011).
[CrossRef] [PubMed]

C. H. Yoon, P. Schwander, C. Abergel, I. Andersson, J. Andreasson, A. Aquila, S. Bajt, M. Barthelmess, A. Barty, M. J. Bogan, C. Bostedt, J. Bozek, H. N. Chapman, J. M. Claverie, N. Coppola, D. P. DePonte, T. Ekeberg, S. W. Epp, B. Erk, H. Fleckenstein, L. Foucar, H. Graafsma, L. Gumprecht, J. Hajdu, C. Y. Hampton, A. Hartmann, E. Hartmann, R. Hartmann, G. Hauser, H. Hirsemann, P. Holl, S. Kassemeyer, N. Kimmel, M. Kiskinova, M. Liang, N. T. D. Loh, L. Lomb, F. R. N. C. Maia, A. V. Martin, K. Nass, E. Pedersoli, C. Reich, D. Rolles, B. Rudek, A. Rudenko, I. Schlichting, J. Schulz, M. Seibert, V. Seltzer, R. L. Shoeman, R. G. Sierra, H. Soltau, D. Starodub, J. Steinbrener, G. Stier, L. Strüder, M. Svenda, J. Ullrich, G. Weidenspointner, T. A. White, C. Wunderer, A. Ourmazd, “Unsupervised classification of single-particle X-ray diffraction snapshots by spectral clustering,” Opt. Express 19(17), 16542–16549 (2011).
[CrossRef] [PubMed]

Svetina, C.

F. Capotondi, E. Pedersoli, N. Mahne, R. H. Menk, G. Passos, L. Raimondi, C. Svetina, G. Sandrin, M. Zangrando, M. Kiskinova, S. Bajt, M. Barthelmess, H. Fleckenstein, H. N. Chapman, J. Schulz, J. Bach, R. Frömter, S. Schleitzer, L. Müller, C. Gutt, G. Grübel, “Invited article: Coherent imaging using seeded free-electron laser pulses with variable polarization: First results and research opportunities,” Rev. Sci. Instrum. 84(5), 051301 (2013).
[CrossRef] [PubMed]

E. Allaria, R. Appio, L. Badano, W. A. Barletta, S. Bassanese, S. G. Biedron, A. Borga, E. Busetto, D. Castronovo, P. Cinquegrana, S. Cleva, D. Cocco, M. Cornacchia, P. Craievich, I. Cudin, G. D’Auria, M. Dal Forno, M. B. Danailov, R. De Monte, G. De Ninno, P. Delgiusto, A. Demidovich, S. Di Mitri, B. Diviacco, A. Fabris, R. Fabris, W. Fawley, M. Ferianis, E. Ferrari, S. Ferry, L. Froehlich, P. Furlan, G. Gaio, F. Gelmetti, L. Giannessi, M. Giannini, R. Gobessi, R. Ivanov, E. Karantzoulis, M. Lonza, A. Lutman, B. Mahieu, M. Milloch, S. V. Milton, M. Musardo, I. Nikolov, S. Noe, F. Parmigiani, G. Penco, M. Petronio, L. Pivetta, M. Predonzani, F. Rossi, L. Rumiz, A. Salom, C. Scafuri, C. Serpico, P. Sigalotti, S. Spampinati, C. Spezzani, M. Svandrlik, C. Svetina, S. Tazzari, M. Trovo, R. Umer, A. Vascotto, M. Veronese, R. Visintini, M. Zaccaria, D. Zangrando, M. Zangrando, “Highly coherent and stable pulses from the FERMI seeded free-electron laser in the extreme ultraviolet,” Nat. Photonics 6(10), 699–704 (2012).
[CrossRef]

Szöke, A.

H. N. Chapman, A. Barty, M. J. Bogan, S. Boutet, M. Frank, S. P. Hau-Riege, S. Marchesini, B. W. Woods, S. Bajt, W. H. Benner, R. A. London, E. Plönjes, M. Kuhlmann, R. Treusch, S. Düsterer, T. Tschentscher, J. R. Schneider, E. Spiller, T. Möller, C. Bostedt, M. Hoener, D. A. Shapiro, K. O. Hodgson, D. van der Spoel, F. Burmeister, M. Bergh, C. Caleman, G. Huldt, M. M. Seibert, F. R. N. C. Maia, R. W. Lee, A. Szöke, N. Timneanu, J. Hajdu, “Femtosecond diffractive imaging with a soft-X-ray free-electron laser,” Nat. Phys. 2(12), 839–843 (2006).
[CrossRef]

Tate, M. W.

S. Boutet, L. Lomb, G. J. Williams, T. R. M. Barends, A. Aquila, R. B. Doak, U. Weierstall, D. P. DePonte, J. Steinbrener, R. L. Shoeman, M. Messerschmidt, A. Barty, T. A. White, S. Kassemeyer, R. A. Kirian, M. M. Seibert, P. A. Montanez, C. Kenney, R. Herbst, P. Hart, J. Pines, G. Haller, S. M. Gruner, H. T. Philipp, M. W. Tate, M. Hromalik, L. J. Koerner, N. van Bakel, J. Morse, W. Ghonsalves, D. Arnlund, M. J. Bogan, C. Caleman, R. Fromme, C. Y. Hampton, M. S. Hunter, L. C. Johansson, G. Katona, C. Kupitz, M. Liang, A. V. Martin, K. Nass, L. Redecke, F. Stellato, N. Timneanu, D. Wang, N. A. Zatsepin, D. Schafer, J. Defever, R. Neutze, P. Fromme, J. C. H. Spence, H. N. Chapman, I. Schlichting, “High-resolution protein structure determination by serial femtosecond crystallography,” Science 337(6092), 362–364 (2012).
[CrossRef] [PubMed]

Tazzari, S.

E. Allaria, R. Appio, L. Badano, W. A. Barletta, S. Bassanese, S. G. Biedron, A. Borga, E. Busetto, D. Castronovo, P. Cinquegrana, S. Cleva, D. Cocco, M. Cornacchia, P. Craievich, I. Cudin, G. D’Auria, M. Dal Forno, M. B. Danailov, R. De Monte, G. De Ninno, P. Delgiusto, A. Demidovich, S. Di Mitri, B. Diviacco, A. Fabris, R. Fabris, W. Fawley, M. Ferianis, E. Ferrari, S. Ferry, L. Froehlich, P. Furlan, G. Gaio, F. Gelmetti, L. Giannessi, M. Giannini, R. Gobessi, R. Ivanov, E. Karantzoulis, M. Lonza, A. Lutman, B. Mahieu, M. Milloch, S. V. Milton, M. Musardo, I. Nikolov, S. Noe, F. Parmigiani, G. Penco, M. Petronio, L. Pivetta, M. Predonzani, F. Rossi, L. Rumiz, A. Salom, C. Scafuri, C. Serpico, P. Sigalotti, S. Spampinati, C. Spezzani, M. Svandrlik, C. Svetina, S. Tazzari, M. Trovo, R. Umer, A. Vascotto, M. Veronese, R. Visintini, M. Zaccaria, D. Zangrando, M. Zangrando, “Highly coherent and stable pulses from the FERMI seeded free-electron laser in the extreme ultraviolet,” Nat. Photonics 6(10), 699–704 (2012).
[CrossRef]

Tenenbaum, J. B.

J. B. Tenenbaum, V. de Silva, J. C. Langford, “A global geometric framework for nonlinear dimensionality reduction,” Science 290(5500), 2319–2323 (2000).
[CrossRef] [PubMed]

Timneanu, N.

L. Redecke, K. Nass, D. P. DePonte, T. A. White, D. Rehders, A. Barty, F. Stellato, M. Liang, T. R. M. Barends, S. Boutet, G. J. Williams, M. Messerschmidt, M. M. Seibert, A. Aquila, D. Arnlund, S. Bajt, T. Barth, M. J. Bogan, C. Caleman, T. C. Chao, R. B. Doak, H. Fleckenstein, M. Frank, R. Fromme, L. Galli, I. Grotjohann, M. S. Hunter, L. C. Johansson, S. Kassemeyer, G. Katona, R. A. Kirian, R. Koopmann, C. Kupitz, L. Lomb, A. V. Martin, S. Mogk, R. Neutze, R. L. Shoeman, J. Steinbrener, N. Timneanu, D. Wang, U. Weierstall, N. A. Zatsepin, J. C. H. Spence, P. Fromme, I. Schlichting, M. Duszenko, C. Betzel, H. N. Chapman, “Natively inhibited Trypanosoma brucei Cathepsin B structure determined by using an X-ray laser,” Science 339(6116), 227–230 (2013).
[CrossRef] [PubMed]

S. Boutet, L. Lomb, G. J. Williams, T. R. M. Barends, A. Aquila, R. B. Doak, U. Weierstall, D. P. DePonte, J. Steinbrener, R. L. Shoeman, M. Messerschmidt, A. Barty, T. A. White, S. Kassemeyer, R. A. Kirian, M. M. Seibert, P. A. Montanez, C. Kenney, R. Herbst, P. Hart, J. Pines, G. Haller, S. M. Gruner, H. T. Philipp, M. W. Tate, M. Hromalik, L. J. Koerner, N. van Bakel, J. Morse, W. Ghonsalves, D. Arnlund, M. J. Bogan, C. Caleman, R. Fromme, C. Y. Hampton, M. S. Hunter, L. C. Johansson, G. Katona, C. Kupitz, M. Liang, A. V. Martin, K. Nass, L. Redecke, F. Stellato, N. Timneanu, D. Wang, N. A. Zatsepin, D. Schafer, J. Defever, R. Neutze, P. Fromme, J. C. H. Spence, H. N. Chapman, I. Schlichting, “High-resolution protein structure determination by serial femtosecond crystallography,” Science 337(6092), 362–364 (2012).
[CrossRef] [PubMed]

H. N. Chapman, A. Barty, M. J. Bogan, S. Boutet, M. Frank, S. P. Hau-Riege, S. Marchesini, B. W. Woods, S. Bajt, W. H. Benner, R. A. London, E. Plönjes, M. Kuhlmann, R. Treusch, S. Düsterer, T. Tschentscher, J. R. Schneider, E. Spiller, T. Möller, C. Bostedt, M. Hoener, D. A. Shapiro, K. O. Hodgson, D. van der Spoel, F. Burmeister, M. Bergh, C. Caleman, G. Huldt, M. M. Seibert, F. R. N. C. Maia, R. W. Lee, A. Szöke, N. Timneanu, J. Hajdu, “Femtosecond diffractive imaging with a soft-X-ray free-electron laser,” Nat. Phys. 2(12), 839–843 (2006).
[CrossRef]

Tran, R.

J. Kern, R. Alonso-Mori, R. Tran, J. Hattne, R. J. Gildea, N. Echols, C. Glöckner, J. Hellmich, H. Laksmono, R. G. Sierra, B. Lassalle-Kaiser, S. Koroidov, A. Lampe, G. Han, S. Gul, D. Difiore, D. Milathianaki, A. R. Fry, A. Miahnahri, D. W. Schafer, M. Messerschmidt, M. M. Seibert, J. E. Koglin, D. Sokaras, T. C. Weng, J. Sellberg, M. J. Latimer, R. W. Grosse-Kunstleve, P. H. Zwart, W. E. White, P. Glatzel, P. D. Adams, M. J. Bogan, G. J. Williams, S. Boutet, J. Messinger, A. Zouni, N. K. Sauter, V. K. Yachandra, U. Bergmann, J. Yano, “Simultaneous femtosecond X-ray spectroscopy and diffraction of photosystem II at room temperature,” Science 340(6131), 491–495 (2013).
[CrossRef] [PubMed]

Treusch, R.

A. P. Mancuso, T. Gorniak, F. Staier, O. M. Yefanov, R. Barth, C. Christophis, B. Reime, J. Gulden, A. Singer, M. E. Pettit, T. Nisius, T. Wilhein, C. Gutt, G. Grübel, N. Guerassimova, R. Treusch, J. Feldhaus, S. Eisebitt, E. Weckert, M. Grunze, A. Rosenhahn, I. A. Vartanyants, “Coherent imaging of biological samples with femtosecond pulses at the free-electron laser FLASH,” New J. Phys. 12(3), 035003 (2010).
[CrossRef]

H. N. Chapman, A. Barty, M. J. Bogan, S. Boutet, M. Frank, S. P. Hau-Riege, S. Marchesini, B. W. Woods, S. Bajt, W. H. Benner, R. A. London, E. Plönjes, M. Kuhlmann, R. Treusch, S. Düsterer, T. Tschentscher, J. R. Schneider, E. Spiller, T. Möller, C. Bostedt, M. Hoener, D. A. Shapiro, K. O. Hodgson, D. van der Spoel, F. Burmeister, M. Bergh, C. Caleman, G. Huldt, M. M. Seibert, F. R. N. C. Maia, R. W. Lee, A. Szöke, N. Timneanu, J. Hajdu, “Femtosecond diffractive imaging with a soft-X-ray free-electron laser,” Nat. Phys. 2(12), 839–843 (2006).
[CrossRef]

Trovo, M.

E. Allaria, R. Appio, L. Badano, W. A. Barletta, S. Bassanese, S. G. Biedron, A. Borga, E. Busetto, D. Castronovo, P. Cinquegrana, S. Cleva, D. Cocco, M. Cornacchia, P. Craievich, I. Cudin, G. D’Auria, M. Dal Forno, M. B. Danailov, R. De Monte, G. De Ninno, P. Delgiusto, A. Demidovich, S. Di Mitri, B. Diviacco, A. Fabris, R. Fabris, W. Fawley, M. Ferianis, E. Ferrari, S. Ferry, L. Froehlich, P. Furlan, G. Gaio, F. Gelmetti, L. Giannessi, M. Giannini, R. Gobessi, R. Ivanov, E. Karantzoulis, M. Lonza, A. Lutman, B. Mahieu, M. Milloch, S. V. Milton, M. Musardo, I. Nikolov, S. Noe, F. Parmigiani, G. Penco, M. Petronio, L. Pivetta, M. Predonzani, F. Rossi, L. Rumiz, A. Salom, C. Scafuri, C. Serpico, P. Sigalotti, S. Spampinati, C. Spezzani, M. Svandrlik, C. Svetina, S. Tazzari, M. Trovo, R. Umer, A. Vascotto, M. Veronese, R. Visintini, M. Zaccaria, D. Zangrando, M. Zangrando, “Highly coherent and stable pulses from the FERMI seeded free-electron laser in the extreme ultraviolet,” Nat. Photonics 6(10), 699–704 (2012).
[CrossRef]

Tschentscher, T.

H. N. Chapman, A. Barty, M. J. Bogan, S. Boutet, M. Frank, S. P. Hau-Riege, S. Marchesini, B. W. Woods, S. Bajt, W. H. Benner, R. A. London, E. Plönjes, M. Kuhlmann, R. Treusch, S. Düsterer, T. Tschentscher, J. R. Schneider, E. Spiller, T. Möller, C. Bostedt, M. Hoener, D. A. Shapiro, K. O. Hodgson, D. van der Spoel, F. Burmeister, M. Bergh, C. Caleman, G. Huldt, M. M. Seibert, F. R. N. C. Maia, R. W. Lee, A. Szöke, N. Timneanu, J. Hajdu, “Femtosecond diffractive imaging with a soft-X-ray free-electron laser,” Nat. Phys. 2(12), 839–843 (2006).
[CrossRef]

Ullrich, J.

M. M. Seibert, T. Ekeberg, F. R. N. C. Maia, M. Svenda, J. Andreasson, O. Jönsson, D. Odić, B. Iwan, A. Rocker, D. Westphal, M. Hantke, D. P. DePonte, A. Barty, J. Schulz, L. Gumprecht, N. Coppola, A. Aquila, M. Liang, T. A. White, A. Martin, C. Caleman, S. Stern, C. Abergel, V. Seltzer, J. M. Claverie, C. Bostedt, J. D. Bozek, S. Boutet, A. A. Miahnahri, M. Messerschmidt, J. Krzywinski, G. Williams, K. O. Hodgson, M. J. Bogan, C. Y. Hampton, R. G. Sierra, D. Starodub, I. Andersson, S. Bajt, M. Barthelmess, J. C. H. Spence, P. Fromme, U. Weierstall, R. Kirian, M. Hunter, R. B. Doak, S. Marchesini, S. P. Hau-Riege, M. Frank, R. L. Shoeman, L. Lomb, S. W. Epp, R. Hartmann, D. Rolles, A. Rudenko, C. Schmidt, L. Foucar, N. Kimmel, P. Holl, B. Rudek, B. Erk, A. Hömke, C. Reich, D. Pietschner, G. Weidenspointner, L. Strüder, G. Hauser, H. Gorke, J. Ullrich, I. Schlichting, S. Herrmann, G. Schaller, F. Schopper, H. Soltau, K. U. Kühnel, R. Andritschke, C. D. Schröter, F. Krasniqi, M. Bott, S. Schorb, D. Rupp, M. Adolph, T. Gorkhover, H. Hirsemann, G. Potdevin, H. Graafsma, B. Nilsson, H. N. Chapman, J. Hajdu, “Single mimivirus particles intercepted and imaged with an X-ray laser,” Nature 470(7332), 78–81 (2011).
[CrossRef] [PubMed]

C. H. Yoon, P. Schwander, C. Abergel, I. Andersson, J. Andreasson, A. Aquila, S. Bajt, M. Barthelmess, A. Barty, M. J. Bogan, C. Bostedt, J. Bozek, H. N. Chapman, J. M. Claverie, N. Coppola, D. P. DePonte, T. Ekeberg, S. W. Epp, B. Erk, H. Fleckenstein, L. Foucar, H. Graafsma, L. Gumprecht, J. Hajdu, C. Y. Hampton, A. Hartmann, E. Hartmann, R. Hartmann, G. Hauser, H. Hirsemann, P. Holl, S. Kassemeyer, N. Kimmel, M. Kiskinova, M. Liang, N. T. D. Loh, L. Lomb, F. R. N. C. Maia, A. V. Martin, K. Nass, E. Pedersoli, C. Reich, D. Rolles, B. Rudek, A. Rudenko, I. Schlichting, J. Schulz, M. Seibert, V. Seltzer, R. L. Shoeman, R. G. Sierra, H. Soltau, D. Starodub, J. Steinbrener, G. Stier, L. Strüder, M. Svenda, J. Ullrich, G. Weidenspointner, T. A. White, C. Wunderer, A. Ourmazd, “Unsupervised classification of single-particle X-ray diffraction snapshots by spectral clustering,” Opt. Express 19(17), 16542–16549 (2011).
[CrossRef] [PubMed]

Umer, R.

E. Allaria, R. Appio, L. Badano, W. A. Barletta, S. Bassanese, S. G. Biedron, A. Borga, E. Busetto, D. Castronovo, P. Cinquegrana, S. Cleva, D. Cocco, M. Cornacchia, P. Craievich, I. Cudin, G. D’Auria, M. Dal Forno, M. B. Danailov, R. De Monte, G. De Ninno, P. Delgiusto, A. Demidovich, S. Di Mitri, B. Diviacco, A. Fabris, R. Fabris, W. Fawley, M. Ferianis, E. Ferrari, S. Ferry, L. Froehlich, P. Furlan, G. Gaio, F. Gelmetti, L. Giannessi, M. Giannini, R. Gobessi, R. Ivanov, E. Karantzoulis, M. Lonza, A. Lutman, B. Mahieu, M. Milloch, S. V. Milton, M. Musardo, I. Nikolov, S. Noe, F. Parmigiani, G. Penco, M. Petronio, L. Pivetta, M. Predonzani, F. Rossi, L. Rumiz, A. Salom, C. Scafuri, C. Serpico, P. Sigalotti, S. Spampinati, C. Spezzani, M. Svandrlik, C. Svetina, S. Tazzari, M. Trovo, R. Umer, A. Vascotto, M. Veronese, R. Visintini, M. Zaccaria, D. Zangrando, M. Zangrando, “Highly coherent and stable pulses from the FERMI seeded free-electron laser in the extreme ultraviolet,” Nat. Photonics 6(10), 699–704 (2012).
[CrossRef]

Valle, M.

S. H. W. Scheres, H. Gao, M. Valle, G. T. Herman, P. P. B. Eggermont, J. Frank, J. M. Carazo, “Disentangling conformational states of macromolecules in 3D-EM through likelihood optimization,” Nat. Methods 4(1), 27–29 (2007).
[CrossRef] [PubMed]

van Bakel, N.

S. Boutet, L. Lomb, G. J. Williams, T. R. M. Barends, A. Aquila, R. B. Doak, U. Weierstall, D. P. DePonte, J. Steinbrener, R. L. Shoeman, M. Messerschmidt, A. Barty, T. A. White, S. Kassemeyer, R. A. Kirian, M. M. Seibert, P. A. Montanez, C. Kenney, R. Herbst, P. Hart, J. Pines, G. Haller, S. M. Gruner, H. T. Philipp, M. W. Tate, M. Hromalik, L. J. Koerner, N. van Bakel, J. Morse, W. Ghonsalves, D. Arnlund, M. J. Bogan, C. Caleman, R. Fromme, C. Y. Hampton, M. S. Hunter, L. C. Johansson, G. Katona, C. Kupitz, M. Liang, A. V. Martin, K. Nass, L. Redecke, F. Stellato, N. Timneanu, D. Wang, N. A. Zatsepin, D. Schafer, J. Defever, R. Neutze, P. Fromme, J. C. H. Spence, H. N. Chapman, I. Schlichting, “High-resolution protein structure determination by serial femtosecond crystallography,” Science 337(6092), 362–364 (2012).
[CrossRef] [PubMed]

van der Spoel, D.

H. N. Chapman, A. Barty, M. J. Bogan, S. Boutet, M. Frank, S. P. Hau-Riege, S. Marchesini, B. W. Woods, S. Bajt, W. H. Benner, R. A. London, E. Plönjes, M. Kuhlmann, R. Treusch, S. Düsterer, T. Tschentscher, J. R. Schneider, E. Spiller, T. Möller, C. Bostedt, M. Hoener, D. A. Shapiro, K. O. Hodgson, D. van der Spoel, F. Burmeister, M. Bergh, C. Caleman, G. Huldt, M. M. Seibert, F. R. N. C. Maia, R. W. Lee, A. Szöke, N. Timneanu, J. Hajdu, “Femtosecond diffractive imaging with a soft-X-ray free-electron laser,” Nat. Phys. 2(12), 839–843 (2006).
[CrossRef]

R. Neutze, R. Wouts, D. van der Spoel, E. Weckert, J. Hajdu, “Potential for biomolecular imaging with femtosecond X-ray pulses,” Nature 406(6797), 752–757 (2000).
[CrossRef] [PubMed]

Vartanyants, I. A.

A. P. Mancuso, T. Gorniak, F. Staier, O. M. Yefanov, R. Barth, C. Christophis, B. Reime, J. Gulden, A. Singer, M. E. Pettit, T. Nisius, T. Wilhein, C. Gutt, G. Grübel, N. Guerassimova, R. Treusch, J. Feldhaus, S. Eisebitt, E. Weckert, M. Grunze, A. Rosenhahn, I. A. Vartanyants, “Coherent imaging of biological samples with femtosecond pulses at the free-electron laser FLASH,” New J. Phys. 12(3), 035003 (2010).
[CrossRef]

Vascotto, A.

E. Allaria, R. Appio, L. Badano, W. A. Barletta, S. Bassanese, S. G. Biedron, A. Borga, E. Busetto, D. Castronovo, P. Cinquegrana, S. Cleva, D. Cocco, M. Cornacchia, P. Craievich, I. Cudin, G. D’Auria, M. Dal Forno, M. B. Danailov, R. De Monte, G. De Ninno, P. Delgiusto, A. Demidovich, S. Di Mitri, B. Diviacco, A. Fabris, R. Fabris, W. Fawley, M. Ferianis, E. Ferrari, S. Ferry, L. Froehlich, P. Furlan, G. Gaio, F. Gelmetti, L. Giannessi, M. Giannini, R. Gobessi, R. Ivanov, E. Karantzoulis, M. Lonza, A. Lutman, B. Mahieu, M. Milloch, S. V. Milton, M. Musardo, I. Nikolov, S. Noe, F. Parmigiani, G. Penco, M. Petronio, L. Pivetta, M. Predonzani, F. Rossi, L. Rumiz, A. Salom, C. Scafuri, C. Serpico, P. Sigalotti, S. Spampinati, C. Spezzani, M. Svandrlik, C. Svetina, S. Tazzari, M. Trovo, R. Umer, A. Vascotto, M. Veronese, R. Visintini, M. Zaccaria, D. Zangrando, M. Zangrando, “Highly coherent and stable pulses from the FERMI seeded free-electron laser in the extreme ultraviolet,” Nat. Photonics 6(10), 699–704 (2012).
[CrossRef]

Veronese, M.

E. Allaria, R. Appio, L. Badano, W. A. Barletta, S. Bassanese, S. G. Biedron, A. Borga, E. Busetto, D. Castronovo, P. Cinquegrana, S. Cleva, D. Cocco, M. Cornacchia, P. Craievich, I. Cudin, G. D’Auria, M. Dal Forno, M. B. Danailov, R. De Monte, G. De Ninno, P. Delgiusto, A. Demidovich, S. Di Mitri, B. Diviacco, A. Fabris, R. Fabris, W. Fawley, M. Ferianis, E. Ferrari, S. Ferry, L. Froehlich, P. Furlan, G. Gaio, F. Gelmetti, L. Giannessi, M. Giannini, R. Gobessi, R. Ivanov, E. Karantzoulis, M. Lonza, A. Lutman, B. Mahieu, M. Milloch, S. V. Milton, M. Musardo, I. Nikolov, S. Noe, F. Parmigiani, G. Penco, M. Petronio, L. Pivetta, M. Predonzani, F. Rossi, L. Rumiz, A. Salom, C. Scafuri, C. Serpico, P. Sigalotti, S. Spampinati, C. Spezzani, M. Svandrlik, C. Svetina, S. Tazzari, M. Trovo, R. Umer, A. Vascotto, M. Veronese, R. Visintini, M. Zaccaria, D. Zangrando, M. Zangrando, “Highly coherent and stable pulses from the FERMI seeded free-electron laser in the extreme ultraviolet,” Nat. Photonics 6(10), 699–704 (2012).
[CrossRef]

Visintini, R.

E. Allaria, R. Appio, L. Badano, W. A. Barletta, S. Bassanese, S. G. Biedron, A. Borga, E. Busetto, D. Castronovo, P. Cinquegrana, S. Cleva, D. Cocco, M. Cornacchia, P. Craievich, I. Cudin, G. D’Auria, M. Dal Forno, M. B. Danailov, R. De Monte, G. De Ninno, P. Delgiusto, A. Demidovich, S. Di Mitri, B. Diviacco, A. Fabris, R. Fabris, W. Fawley, M. Ferianis, E. Ferrari, S. Ferry, L. Froehlich, P. Furlan, G. Gaio, F. Gelmetti, L. Giannessi, M. Giannini, R. Gobessi, R. Ivanov, E. Karantzoulis, M. Lonza, A. Lutman, B. Mahieu, M. Milloch, S. V. Milton, M. Musardo, I. Nikolov, S. Noe, F. Parmigiani, G. Penco, M. Petronio, L. Pivetta, M. Predonzani, F. Rossi, L. Rumiz, A. Salom, C. Scafuri, C. Serpico, P. Sigalotti, S. Spampinati, C. Spezzani, M. Svandrlik, C. Svetina, S. Tazzari, M. Trovo, R. Umer, A. Vascotto, M. Veronese, R. Visintini, M. Zaccaria, D. Zangrando, M. Zangrando, “Highly coherent and stable pulses from the FERMI seeded free-electron laser in the extreme ultraviolet,” Nat. Photonics 6(10), 699–704 (2012).
[CrossRef]

Wang, D.

L. Redecke, K. Nass, D. P. DePonte, T. A. White, D. Rehders, A. Barty, F. Stellato, M. Liang, T. R. M. Barends, S. Boutet, G. J. Williams, M. Messerschmidt, M. M. Seibert, A. Aquila, D. Arnlund, S. Bajt, T. Barth, M. J. Bogan, C. Caleman, T. C. Chao, R. B. Doak, H. Fleckenstein, M. Frank, R. Fromme, L. Galli, I. Grotjohann, M. S. Hunter, L. C. Johansson, S. Kassemeyer, G. Katona, R. A. Kirian, R. Koopmann, C. Kupitz, L. Lomb, A. V. Martin, S. Mogk, R. Neutze, R. L. Shoeman, J. Steinbrener, N. Timneanu, D. Wang, U. Weierstall, N. A. Zatsepin, J. C. H. Spence, P. Fromme, I. Schlichting, M. Duszenko, C. Betzel, H. N. Chapman, “Natively inhibited Trypanosoma brucei Cathepsin B structure determined by using an X-ray laser,” Science 339(6116), 227–230 (2013).
[CrossRef] [PubMed]

S. Boutet, L. Lomb, G. J. Williams, T. R. M. Barends, A. Aquila, R. B. Doak, U. Weierstall, D. P. DePonte, J. Steinbrener, R. L. Shoeman, M. Messerschmidt, A. Barty, T. A. White, S. Kassemeyer, R. A. Kirian, M. M. Seibert, P. A. Montanez, C. Kenney, R. Herbst, P. Hart, J. Pines, G. Haller, S. M. Gruner, H. T. Philipp, M. W. Tate, M. Hromalik, L. J. Koerner, N. van Bakel, J. Morse, W. Ghonsalves, D. Arnlund, M. J. Bogan, C. Caleman, R. Fromme, C. Y. Hampton, M. S. Hunter, L. C. Johansson, G. Katona, C. Kupitz, M. Liang, A. V. Martin, K. Nass, L. Redecke, F. Stellato, N. Timneanu, D. Wang, N. A. Zatsepin, D. Schafer, J. Defever, R. Neutze, P. Fromme, J. C. H. Spence, H. N. Chapman, I. Schlichting, “High-resolution protein structure determination by serial femtosecond crystallography,” Science 337(6092), 362–364 (2012).
[CrossRef] [PubMed]

Weckert, E.

A. P. Mancuso, T. Gorniak, F. Staier, O. M. Yefanov, R. Barth, C. Christophis, B. Reime, J. Gulden, A. Singer, M. E. Pettit, T. Nisius, T. Wilhein, C. Gutt, G. Grübel, N. Guerassimova, R. Treusch, J. Feldhaus, S. Eisebitt, E. Weckert, M. Grunze, A. Rosenhahn, I. A. Vartanyants, “Coherent imaging of biological samples with femtosecond pulses at the free-electron laser FLASH,” New J. Phys. 12(3), 035003 (2010).
[CrossRef]

R. Neutze, R. Wouts, D. van der Spoel, E. Weckert, J. Hajdu, “Potential for biomolecular imaging with femtosecond X-ray pulses,” Nature 406(6797), 752–757 (2000).
[CrossRef] [PubMed]

Weidenspointner, G.

M. M. Seibert, T. Ekeberg, F. R. N. C. Maia, M. Svenda, J. Andreasson, O. Jönsson, D. Odić, B. Iwan, A. Rocker, D. Westphal, M. Hantke, D. P. DePonte, A. Barty, J. Schulz, L. Gumprecht, N. Coppola, A. Aquila, M. Liang, T. A. White, A. Martin, C. Caleman, S. Stern, C. Abergel, V. Seltzer, J. M. Claverie, C. Bostedt, J. D. Bozek, S. Boutet, A. A. Miahnahri, M. Messerschmidt, J. Krzywinski, G. Williams, K. O. Hodgson, M. J. Bogan, C. Y. Hampton, R. G. Sierra, D. Starodub, I. Andersson, S. Bajt, M. Barthelmess, J. C. H. Spence, P. Fromme, U. Weierstall, R. Kirian, M. Hunter, R. B. Doak, S. Marchesini, S. P. Hau-Riege, M. Frank, R. L. Shoeman, L. Lomb, S. W. Epp, R. Hartmann, D. Rolles, A. Rudenko, C. Schmidt, L. Foucar, N. Kimmel, P. Holl, B. Rudek, B. Erk, A. Hömke, C. Reich, D. Pietschner, G. Weidenspointner, L. Strüder, G. Hauser, H. Gorke, J. Ullrich, I. Schlichting, S. Herrmann, G. Schaller, F. Schopper, H. Soltau, K. U. Kühnel, R. Andritschke, C. D. Schröter, F. Krasniqi, M. Bott, S. Schorb, D. Rupp, M. Adolph, T. Gorkhover, H. Hirsemann, G. Potdevin, H. Graafsma, B. Nilsson, H. N. Chapman, J. Hajdu, “Single mimivirus particles intercepted and imaged with an X-ray laser,” Nature 470(7332), 78–81 (2011).
[CrossRef] [PubMed]

C. H. Yoon, P. Schwander, C. Abergel, I. Andersson, J. Andreasson, A. Aquila, S. Bajt, M. Barthelmess, A. Barty, M. J. Bogan, C. Bostedt, J. Bozek, H. N. Chapman, J. M. Claverie, N. Coppola, D. P. DePonte, T. Ekeberg, S. W. Epp, B. Erk, H. Fleckenstein, L. Foucar, H. Graafsma, L. Gumprecht, J. Hajdu, C. Y. Hampton, A. Hartmann, E. Hartmann, R. Hartmann, G. Hauser, H. Hirsemann, P. Holl, S. Kassemeyer, N. Kimmel, M. Kiskinova, M. Liang, N. T. D. Loh, L. Lomb, F. R. N. C. Maia, A. V. Martin, K. Nass, E. Pedersoli, C. Reich, D. Rolles, B. Rudek, A. Rudenko, I. Schlichting, J. Schulz, M. Seibert, V. Seltzer, R. L. Shoeman, R. G. Sierra, H. Soltau, D. Starodub, J. Steinbrener, G. Stier, L. Strüder, M. Svenda, J. Ullrich, G. Weidenspointner, T. A. White, C. Wunderer, A. Ourmazd, “Unsupervised classification of single-particle X-ray diffraction snapshots by spectral clustering,” Opt. Express 19(17), 16542–16549 (2011).
[CrossRef] [PubMed]

Weierstall, U.

L. Redecke, K. Nass, D. P. DePonte, T. A. White, D. Rehders, A. Barty, F. Stellato, M. Liang, T. R. M. Barends, S. Boutet, G. J. Williams, M. Messerschmidt, M. M. Seibert, A. Aquila, D. Arnlund, S. Bajt, T. Barth, M. J. Bogan, C. Caleman, T. C. Chao, R. B. Doak, H. Fleckenstein, M. Frank, R. Fromme, L. Galli, I. Grotjohann, M. S. Hunter, L. C. Johansson, S. Kassemeyer, G. Katona, R. A. Kirian, R. Koopmann, C. Kupitz, L. Lomb, A. V. Martin, S. Mogk, R. Neutze, R. L. Shoeman, J. Steinbrener, N. Timneanu, D. Wang, U. Weierstall, N. A. Zatsepin, J. C. H. Spence, P. Fromme, I. Schlichting, M. Duszenko, C. Betzel, H. N. Chapman, “Natively inhibited Trypanosoma brucei Cathepsin B structure determined by using an X-ray laser,” Science 339(6116), 227–230 (2013).
[CrossRef] [PubMed]

S. Boutet, L. Lomb, G. J. Williams, T. R. M. Barends, A. Aquila, R. B. Doak, U. Weierstall, D. P. DePonte, J. Steinbrener, R. L. Shoeman, M. Messerschmidt, A. Barty, T. A. White, S. Kassemeyer, R. A. Kirian, M. M. Seibert, P. A. Montanez, C. Kenney, R. Herbst, P. Hart, J. Pines, G. Haller, S. M. Gruner, H. T. Philipp, M. W. Tate, M. Hromalik, L. J. Koerner, N. van Bakel, J. Morse, W. Ghonsalves, D. Arnlund, M. J. Bogan, C. Caleman, R. Fromme, C. Y. Hampton, M. S. Hunter, L. C. Johansson, G. Katona, C. Kupitz, M. Liang, A. V. Martin, K. Nass, L. Redecke, F. Stellato, N. Timneanu, D. Wang, N. A. Zatsepin, D. Schafer, J. Defever, R. Neutze, P. Fromme, J. C. H. Spence, H. N. Chapman, I. Schlichting, “High-resolution protein structure determination by serial femtosecond crystallography,” Science 337(6092), 362–364 (2012).
[CrossRef] [PubMed]

M. M. Seibert, T. Ekeberg, F. R. N. C. Maia, M. Svenda, J. Andreasson, O. Jönsson, D. Odić, B. Iwan, A. Rocker, D. Westphal, M. Hantke, D. P. DePonte, A. Barty, J. Schulz, L. Gumprecht, N. Coppola, A. Aquila, M. Liang, T. A. White, A. Martin, C. Caleman, S. Stern, C. Abergel, V. Seltzer, J. M. Claverie, C. Bostedt, J. D. Bozek, S. Boutet, A. A. Miahnahri, M. Messerschmidt, J. Krzywinski, G. Williams, K. O. Hodgson, M. J. Bogan, C. Y. Hampton, R. G. Sierra, D. Starodub, I. Andersson, S. Bajt, M. Barthelmess, J. C. H. Spence, P. Fromme, U. Weierstall, R. Kirian, M. Hunter, R. B. Doak, S. Marchesini, S. P. Hau-Riege, M. Frank, R. L. Shoeman, L. Lomb, S. W. Epp, R. Hartmann, D. Rolles, A. Rudenko, C. Schmidt, L. Foucar, N. Kimmel, P. Holl, B. Rudek, B. Erk, A. Hömke, C. Reich, D. Pietschner, G. Weidenspointner, L. Strüder, G. Hauser, H. Gorke, J. Ullrich, I. Schlichting, S. Herrmann, G. Schaller, F. Schopper, H. Soltau, K. U. Kühnel, R. Andritschke, C. D. Schröter, F. Krasniqi, M. Bott, S. Schorb, D. Rupp, M. Adolph, T. Gorkhover, H. Hirsemann, G. Potdevin, H. Graafsma, B. Nilsson, H. N. Chapman, J. Hajdu, “Single mimivirus particles intercepted and imaged with an X-ray laser,” Nature 470(7332), 78–81 (2011).
[CrossRef] [PubMed]

H. N. Chapman, A. Barty, S. Marchesini, A. Noy, S. P. Hau-Riege, C. Cui, M. R. Howells, R. Rosen, H. He, J. C. H. Spence, U. Weierstall, T. Beetz, C. Jacobsen, D. Shapiro, “High-resolution ab initio three-dimensional x-ray diffraction microscopy,” J. Opt. Soc. Am. A 23(5), 1179 (2006).
[CrossRef]

S. Marchesini, H. He, H. N. Chapman, S. P. Hau-Riege, A. Noy, M. R. Howells, U. Weierstall, J. C. H. Spence, “X-ray image reconstruction from a diffraction pattern alone,” Phys. Rev. B 68(14), 140101 (2003).
[CrossRef]

Weng, T. C.

J. Kern, R. Alonso-Mori, R. Tran, J. Hattne, R. J. Gildea, N. Echols, C. Glöckner, J. Hellmich, H. Laksmono, R. G. Sierra, B. Lassalle-Kaiser, S. Koroidov, A. Lampe, G. Han, S. Gul, D. Difiore, D. Milathianaki, A. R. Fry, A. Miahnahri, D. W. Schafer, M. Messerschmidt, M. M. Seibert, J. E. Koglin, D. Sokaras, T. C. Weng, J. Sellberg, M. J. Latimer, R. W. Grosse-Kunstleve, P. H. Zwart, W. E. White, P. Glatzel, P. D. Adams, M. J. Bogan, G. J. Williams, S. Boutet, J. Messinger, A. Zouni, N. K. Sauter, V. K. Yachandra, U. Bergmann, J. Yano, “Simultaneous femtosecond X-ray spectroscopy and diffraction of photosystem II at room temperature,” Science 340(6131), 491–495 (2013).
[CrossRef] [PubMed]

Westphal, D.

M. M. Seibert, T. Ekeberg, F. R. N. C. Maia, M. Svenda, J. Andreasson, O. Jönsson, D. Odić, B. Iwan, A. Rocker, D. Westphal, M. Hantke, D. P. DePonte, A. Barty, J. Schulz, L. Gumprecht, N. Coppola, A. Aquila, M. Liang, T. A. White, A. Martin, C. Caleman, S. Stern, C. Abergel, V. Seltzer, J. M. Claverie, C. Bostedt, J. D. Bozek, S. Boutet, A. A. Miahnahri, M. Messerschmidt, J. Krzywinski, G. Williams, K. O. Hodgson, M. J. Bogan, C. Y. Hampton, R. G. Sierra, D. Starodub, I. Andersson, S. Bajt, M. Barthelmess, J. C. H. Spence, P. Fromme, U. Weierstall, R. Kirian, M. Hunter, R. B. Doak, S. Marchesini, S. P. Hau-Riege, M. Frank, R. L. Shoeman, L. Lomb, S. W. Epp, R. Hartmann, D. Rolles, A. Rudenko, C. Schmidt, L. Foucar, N. Kimmel, P. Holl, B. Rudek, B. Erk, A. Hömke, C. Reich, D. Pietschner, G. Weidenspointner, L. Strüder, G. Hauser, H. Gorke, J. Ullrich, I. Schlichting, S. Herrmann, G. Schaller, F. Schopper, H. Soltau, K. U. Kühnel, R. Andritschke, C. D. Schröter, F. Krasniqi, M. Bott, S. Schorb, D. Rupp, M. Adolph, T. Gorkhover, H. Hirsemann, G. Potdevin, H. Graafsma, B. Nilsson, H. N. Chapman, J. Hajdu, “Single mimivirus particles intercepted and imaged with an X-ray laser,” Nature 470(7332), 78–81 (2011).
[CrossRef] [PubMed]

White, T. A.

L. Redecke, K. Nass, D. P. DePonte, T. A. White, D. Rehders, A. Barty, F. Stellato, M. Liang, T. R. M. Barends, S. Boutet, G. J. Williams, M. Messerschmidt, M. M. Seibert, A. Aquila, D. Arnlund, S. Bajt, T. Barth, M. J. Bogan, C. Caleman, T. C. Chao, R. B. Doak, H. Fleckenstein, M. Frank, R. Fromme, L. Galli, I. Grotjohann, M. S. Hunter, L. C. Johansson, S. Kassemeyer, G. Katona, R. A. Kirian, R. Koopmann, C. Kupitz, L. Lomb, A. V. Martin, S. Mogk, R. Neutze, R. L. Shoeman, J. Steinbrener, N. Timneanu, D. Wang, U. Weierstall, N. A. Zatsepin, J. C. H. Spence, P. Fromme, I. Schlichting, M. Duszenko, C. Betzel, H. N. Chapman, “Natively inhibited Trypanosoma brucei Cathepsin B structure determined by using an X-ray laser,” Science 339(6116), 227–230 (2013).
[CrossRef] [PubMed]

S. Boutet, L. Lomb, G. J. Williams, T. R. M. Barends, A. Aquila, R. B. Doak, U. Weierstall, D. P. DePonte, J. Steinbrener, R. L. Shoeman, M. Messerschmidt, A. Barty, T. A. White, S. Kassemeyer, R. A. Kirian, M. M. Seibert, P. A. Montanez, C. Kenney, R. Herbst, P. Hart, J. Pines, G. Haller, S. M. Gruner, H. T. Philipp, M. W. Tate, M. Hromalik, L. J. Koerner, N. van Bakel, J. Morse, W. Ghonsalves, D. Arnlund, M. J. Bogan, C. Caleman, R. Fromme, C. Y. Hampton, M. S. Hunter, L. C. Johansson, G. Katona, C. Kupitz, M. Liang, A. V. Martin, K. Nass, L. Redecke, F. Stellato, N. Timneanu, D. Wang, N. A. Zatsepin, D. Schafer, J. Defever, R. Neutze, P. Fromme, J. C. H. Spence, H. N. Chapman, I. Schlichting, “High-resolution protein structure determination by serial femtosecond crystallography,” Science 337(6092), 362–364 (2012).
[CrossRef] [PubMed]

M. M. Seibert, T. Ekeberg, F. R. N. C. Maia, M. Svenda, J. Andreasson, O. Jönsson, D. Odić, B. Iwan, A. Rocker, D. Westphal, M. Hantke, D. P. DePonte, A. Barty, J. Schulz, L. Gumprecht, N. Coppola, A. Aquila, M. Liang, T. A. White, A. Martin, C. Caleman, S. Stern, C. Abergel, V. Seltzer, J. M. Claverie, C. Bostedt, J. D. Bozek, S. Boutet, A. A. Miahnahri, M. Messerschmidt, J. Krzywinski, G. Williams, K. O. Hodgson, M. J. Bogan, C. Y. Hampton, R. G. Sierra, D. Starodub, I. Andersson, S. Bajt, M. Barthelmess, J. C. H. Spence, P. Fromme, U. Weierstall, R. Kirian, M. Hunter, R. B. Doak, S. Marchesini, S. P. Hau-Riege, M. Frank, R. L. Shoeman, L. Lomb, S. W. Epp, R. Hartmann, D. Rolles, A. Rudenko, C. Schmidt, L. Foucar, N. Kimmel, P. Holl, B. Rudek, B. Erk, A. Hömke, C. Reich, D. Pietschner, G. Weidenspointner, L. Strüder, G. Hauser, H. Gorke, J. Ullrich, I. Schlichting, S. Herrmann, G. Schaller, F. Schopper, H. Soltau, K. U. Kühnel, R. Andritschke, C. D. Schröter, F. Krasniqi, M. Bott, S. Schorb, D. Rupp, M. Adolph, T. Gorkhover, H. Hirsemann, G. Potdevin, H. Graafsma, B. Nilsson, H. N. Chapman, J. Hajdu, “Single mimivirus particles intercepted and imaged with an X-ray laser,” Nature 470(7332), 78–81 (2011).
[CrossRef] [PubMed]

C. H. Yoon, P. Schwander, C. Abergel, I. Andersson, J. Andreasson, A. Aquila, S. Bajt, M. Barthelmess, A. Barty, M. J. Bogan, C. Bostedt, J. Bozek, H. N. Chapman, J. M. Claverie, N. Coppola, D. P. DePonte, T. Ekeberg, S. W. Epp, B. Erk, H. Fleckenstein, L. Foucar, H. Graafsma, L. Gumprecht, J. Hajdu, C. Y. Hampton, A. Hartmann, E. Hartmann, R. Hartmann, G. Hauser, H. Hirsemann, P. Holl, S. Kassemeyer, N. Kimmel, M. Kiskinova, M. Liang, N. T. D. Loh, L. Lomb, F. R. N. C. Maia, A. V. Martin, K. Nass, E. Pedersoli, C. Reich, D. Rolles, B. Rudek, A. Rudenko, I. Schlichting, J. Schulz, M. Seibert, V. Seltzer, R. L. Shoeman, R. G. Sierra, H. Soltau, D. Starodub, J. Steinbrener, G. Stier, L. Strüder, M. Svenda, J. Ullrich, G. Weidenspointner, T. A. White, C. Wunderer, A. Ourmazd, “Unsupervised classification of single-particle X-ray diffraction snapshots by spectral clustering,” Opt. Express 19(17), 16542–16549 (2011).
[CrossRef] [PubMed]

White, W. E.

J. Kern, R. Alonso-Mori, R. Tran, J. Hattne, R. J. Gildea, N. Echols, C. Glöckner, J. Hellmich, H. Laksmono, R. G. Sierra, B. Lassalle-Kaiser, S. Koroidov, A. Lampe, G. Han, S. Gul, D. Difiore, D. Milathianaki, A. R. Fry, A. Miahnahri, D. W. Schafer, M. Messerschmidt, M. M. Seibert, J. E. Koglin, D. Sokaras, T. C. Weng, J. Sellberg, M. J. Latimer, R. W. Grosse-Kunstleve, P. H. Zwart, W. E. White, P. Glatzel, P. D. Adams, M. J. Bogan, G. J. Williams, S. Boutet, J. Messinger, A. Zouni, N. K. Sauter, V. K. Yachandra, U. Bergmann, J. Yano, “Simultaneous femtosecond X-ray spectroscopy and diffraction of photosystem II at room temperature,” Science 340(6131), 491–495 (2013).
[CrossRef] [PubMed]

Wilhein, T.

A. P. Mancuso, T. Gorniak, F. Staier, O. M. Yefanov, R. Barth, C. Christophis, B. Reime, J. Gulden, A. Singer, M. E. Pettit, T. Nisius, T. Wilhein, C. Gutt, G. Grübel, N. Guerassimova, R. Treusch, J. Feldhaus, S. Eisebitt, E. Weckert, M. Grunze, A. Rosenhahn, I. A. Vartanyants, “Coherent imaging of biological samples with femtosecond pulses at the free-electron laser FLASH,” New J. Phys. 12(3), 035003 (2010).
[CrossRef]

Williams, G.

M. M. Seibert, T. Ekeberg, F. R. N. C. Maia, M. Svenda, J. Andreasson, O. Jönsson, D. Odić, B. Iwan, A. Rocker, D. Westphal, M. Hantke, D. P. DePonte, A. Barty, J. Schulz, L. Gumprecht, N. Coppola, A. Aquila, M. Liang, T. A. White, A. Martin, C. Caleman, S. Stern, C. Abergel, V. Seltzer, J. M. Claverie, C. Bostedt, J. D. Bozek, S. Boutet, A. A. Miahnahri, M. Messerschmidt, J. Krzywinski, G. Williams, K. O. Hodgson, M. J. Bogan, C. Y. Hampton, R. G. Sierra, D. Starodub, I. Andersson, S. Bajt, M. Barthelmess, J. C. H. Spence, P. Fromme, U. Weierstall, R. Kirian, M. Hunter, R. B. Doak, S. Marchesini, S. P. Hau-Riege, M. Frank, R. L. Shoeman, L. Lomb, S. W. Epp, R. Hartmann, D. Rolles, A. Rudenko, C. Schmidt, L. Foucar, N. Kimmel, P. Holl, B. Rudek, B. Erk, A. Hömke, C. Reich, D. Pietschner, G. Weidenspointner, L. Strüder, G. Hauser, H. Gorke, J. Ullrich, I. Schlichting, S. Herrmann, G. Schaller, F. Schopper, H. Soltau, K. U. Kühnel, R. Andritschke, C. D. Schröter, F. Krasniqi, M. Bott, S. Schorb, D. Rupp, M. Adolph, T. Gorkhover, H. Hirsemann, G. Potdevin, H. Graafsma, B. Nilsson, H. N. Chapman, J. Hajdu, “Single mimivirus particles intercepted and imaged with an X-ray laser,” Nature 470(7332), 78–81 (2011).
[CrossRef] [PubMed]

Williams, G. J.

L. Redecke, K. Nass, D. P. DePonte, T. A. White, D. Rehders, A. Barty, F. Stellato, M. Liang, T. R. M. Barends, S. Boutet, G. J. Williams, M. Messerschmidt, M. M. Seibert, A. Aquila, D. Arnlund, S. Bajt, T. Barth, M. J. Bogan, C. Caleman, T. C. Chao, R. B. Doak, H. Fleckenstein, M. Frank, R. Fromme, L. Galli, I. Grotjohann, M. S. Hunter, L. C. Johansson, S. Kassemeyer, G. Katona, R. A. Kirian, R. Koopmann, C. Kupitz, L. Lomb, A. V. Martin, S. Mogk, R. Neutze, R. L. Shoeman, J. Steinbrener, N. Timneanu, D. Wang, U. Weierstall, N. A. Zatsepin, J. C. H. Spence, P. Fromme, I. Schlichting, M. Duszenko, C. Betzel, H. N. Chapman, “Natively inhibited Trypanosoma brucei Cathepsin B structure determined by using an X-ray laser,” Science 339(6116), 227–230 (2013).
[CrossRef] [PubMed]

J. Kern, R. Alonso-Mori, R. Tran, J. Hattne, R. J. Gildea, N. Echols, C. Glöckner, J. Hellmich, H. Laksmono, R. G. Sierra, B. Lassalle-Kaiser, S. Koroidov, A. Lampe, G. Han, S. Gul, D. Difiore, D. Milathianaki, A. R. Fry, A. Miahnahri, D. W. Schafer, M. Messerschmidt, M. M. Seibert, J. E. Koglin, D. Sokaras, T. C. Weng, J. Sellberg, M. J. Latimer, R. W. Grosse-Kunstleve, P. H. Zwart, W. E. White, P. Glatzel, P. D. Adams, M. J. Bogan, G. J. Williams, S. Boutet, J. Messinger, A. Zouni, N. K. Sauter, V. K. Yachandra, U. Bergmann, J. Yano, “Simultaneous femtosecond X-ray spectroscopy and diffraction of photosystem II at room temperature,” Science 340(6131), 491–495 (2013).
[CrossRef] [PubMed]

S. Boutet, L. Lomb, G. J. Williams, T. R. M. Barends, A. Aquila, R. B. Doak, U. Weierstall, D. P. DePonte, J. Steinbrener, R. L. Shoeman, M. Messerschmidt, A. Barty, T. A. White, S. Kassemeyer, R. A. Kirian, M. M. Seibert, P. A. Montanez, C. Kenney, R. Herbst, P. Hart, J. Pines, G. Haller, S. M. Gruner, H. T. Philipp, M. W. Tate, M. Hromalik, L. J. Koerner, N. van Bakel, J. Morse, W. Ghonsalves, D. Arnlund, M. J. Bogan, C. Caleman, R. Fromme, C. Y. Hampton, M. S. Hunter, L. C. Johansson, G. Katona, C. Kupitz, M. Liang, A. V. Martin, K. Nass, L. Redecke, F. Stellato, N. Timneanu, D. Wang, N. A. Zatsepin, D. Schafer, J. Defever, R. Neutze, P. Fromme, J. C. H. Spence, H. N. Chapman, I. Schlichting, “High-resolution protein structure determination by serial femtosecond crystallography,” Science 337(6092), 362–364 (2012).
[CrossRef] [PubMed]

Woods, B. W.

H. N. Chapman, A. Barty, M. J. Bogan, S. Boutet, M. Frank, S. P. Hau-Riege, S. Marchesini, B. W. Woods, S. Bajt, W. H. Benner, R. A. London, E. Plönjes, M. Kuhlmann, R. Treusch, S. Düsterer, T. Tschentscher, J. R. Schneider, E. Spiller, T. Möller, C. Bostedt, M. Hoener, D. A. Shapiro, K. O. Hodgson, D. van der Spoel, F. Burmeister, M. Bergh, C. Caleman, G. Huldt, M. M. Seibert, F. R. N. C. Maia, R. W. Lee, A. Szöke, N. Timneanu, J. Hajdu, “Femtosecond diffractive imaging with a soft-X-ray free-electron laser,” Nat. Phys. 2(12), 839–843 (2006).
[CrossRef]

Wouts, R.

R. Neutze, R. Wouts, D. van der Spoel, E. Weckert, J. Hajdu, “Potential for biomolecular imaging with femtosecond X-ray pulses,” Nature 406(6797), 752–757 (2000).
[CrossRef] [PubMed]

Wunderer, C.

Yachandra, V. K.

J. Kern, R. Alonso-Mori, R. Tran, J. Hattne, R. J. Gildea, N. Echols, C. Glöckner, J. Hellmich, H. Laksmono, R. G. Sierra, B. Lassalle-Kaiser, S. Koroidov, A. Lampe, G. Han, S. Gul, D. Difiore, D. Milathianaki, A. R. Fry, A. Miahnahri, D. W. Schafer, M. Messerschmidt, M. M. Seibert, J. E. Koglin, D. Sokaras, T. C. Weng, J. Sellberg, M. J. Latimer, R. W. Grosse-Kunstleve, P. H. Zwart, W. E. White, P. Glatzel, P. D. Adams, M. J. Bogan, G. J. Williams, S. Boutet, J. Messinger, A. Zouni, N. K. Sauter, V. K. Yachandra, U. Bergmann, J. Yano, “Simultaneous femtosecond X-ray spectroscopy and diffraction of photosystem II at room temperature,” Science 340(6131), 491–495 (2013).
[CrossRef] [PubMed]

Yano, J.

J. Kern, R. Alonso-Mori, R. Tran, J. Hattne, R. J. Gildea, N. Echols, C. Glöckner, J. Hellmich, H. Laksmono, R. G. Sierra, B. Lassalle-Kaiser, S. Koroidov, A. Lampe, G. Han, S. Gul, D. Difiore, D. Milathianaki, A. R. Fry, A. Miahnahri, D. W. Schafer, M. Messerschmidt, M. M. Seibert, J. E. Koglin, D. Sokaras, T. C. Weng, J. Sellberg, M. J. Latimer, R. W. Grosse-Kunstleve, P. H. Zwart, W. E. White, P. Glatzel, P. D. Adams, M. J. Bogan, G. J. Williams, S. Boutet, J. Messinger, A. Zouni, N. K. Sauter, V. K. Yachandra, U. Bergmann, J. Yano, “Simultaneous femtosecond X-ray spectroscopy and diffraction of photosystem II at room temperature,” Science 340(6131), 491–495 (2013).
[CrossRef] [PubMed]

Yefanov, O. M.

A. P. Mancuso, T. Gorniak, F. Staier, O. M. Yefanov, R. Barth, C. Christophis, B. Reime, J. Gulden, A. Singer, M. E. Pettit, T. Nisius, T. Wilhein, C. Gutt, G. Grübel, N. Guerassimova, R. Treusch, J. Feldhaus, S. Eisebitt, E. Weckert, M. Grunze, A. Rosenhahn, I. A. Vartanyants, “Coherent imaging of biological samples with femtosecond pulses at the free-electron laser FLASH,” New J. Phys. 12(3), 035003 (2010).
[CrossRef]

Yoon, C. H.

Zaccaria, M.

E. Allaria, R. Appio, L. Badano, W. A. Barletta, S. Bassanese, S. G. Biedron, A. Borga, E. Busetto, D. Castronovo, P. Cinquegrana, S. Cleva, D. Cocco, M. Cornacchia, P. Craievich, I. Cudin, G. D’Auria, M. Dal Forno, M. B. Danailov, R. De Monte, G. De Ninno, P. Delgiusto, A. Demidovich, S. Di Mitri, B. Diviacco, A. Fabris, R. Fabris, W. Fawley, M. Ferianis, E. Ferrari, S. Ferry, L. Froehlich, P. Furlan, G. Gaio, F. Gelmetti, L. Giannessi, M. Giannini, R. Gobessi, R. Ivanov, E. Karantzoulis, M. Lonza, A. Lutman, B. Mahieu, M. Milloch, S. V. Milton, M. Musardo, I. Nikolov, S. Noe, F. Parmigiani, G. Penco, M. Petronio, L. Pivetta, M. Predonzani, F. Rossi, L. Rumiz, A. Salom, C. Scafuri, C. Serpico, P. Sigalotti, S. Spampinati, C. Spezzani, M. Svandrlik, C. Svetina, S. Tazzari, M. Trovo, R. Umer, A. Vascotto, M. Veronese, R. Visintini, M. Zaccaria, D. Zangrando, M. Zangrando, “Highly coherent and stable pulses from the FERMI seeded free-electron laser in the extreme ultraviolet,” Nat. Photonics 6(10), 699–704 (2012).
[CrossRef]

Zangrando, D.

E. Allaria, R. Appio, L. Badano, W. A. Barletta, S. Bassanese, S. G. Biedron, A. Borga, E. Busetto, D. Castronovo, P. Cinquegrana, S. Cleva, D. Cocco, M. Cornacchia, P. Craievich, I. Cudin, G. D’Auria, M. Dal Forno, M. B. Danailov, R. De Monte, G. De Ninno, P. Delgiusto, A. Demidovich, S. Di Mitri, B. Diviacco, A. Fabris, R. Fabris, W. Fawley, M. Ferianis, E. Ferrari, S. Ferry, L. Froehlich, P. Furlan, G. Gaio, F. Gelmetti, L. Giannessi, M. Giannini, R. Gobessi, R. Ivanov, E. Karantzoulis, M. Lonza, A. Lutman, B. Mahieu, M. Milloch, S. V. Milton, M. Musardo, I. Nikolov, S. Noe, F. Parmigiani, G. Penco, M. Petronio, L. Pivetta, M. Predonzani, F. Rossi, L. Rumiz, A. Salom, C. Scafuri, C. Serpico, P. Sigalotti, S. Spampinati, C. Spezzani, M. Svandrlik, C. Svetina, S. Tazzari, M. Trovo, R. Umer, A. Vascotto, M. Veronese, R. Visintini, M. Zaccaria, D. Zangrando, M. Zangrando, “Highly coherent and stable pulses from the FERMI seeded free-electron laser in the extreme ultraviolet,” Nat. Photonics 6(10), 699–704 (2012).
[CrossRef]

Zangrando, M.

F. Capotondi, E. Pedersoli, N. Mahne, R. H. Menk, G. Passos, L. Raimondi, C. Svetina, G. Sandrin, M. Zangrando, M. Kiskinova, S. Bajt, M. Barthelmess, H. Fleckenstein, H. N. Chapman, J. Schulz, J. Bach, R. Frömter, S. Schleitzer, L. Müller, C. Gutt, G. Grübel, “Invited article: Coherent imaging using seeded free-electron laser pulses with variable polarization: First results and research opportunities,” Rev. Sci. Instrum. 84(5), 051301 (2013).
[CrossRef] [PubMed]

E. Allaria, R. Appio, L. Badano, W. A. Barletta, S. Bassanese, S. G. Biedron, A. Borga, E. Busetto, D. Castronovo, P. Cinquegrana, S. Cleva, D. Cocco, M. Cornacchia, P. Craievich, I. Cudin, G. D’Auria, M. Dal Forno, M. B. Danailov, R. De Monte, G. De Ninno, P. Delgiusto, A. Demidovich, S. Di Mitri, B. Diviacco, A. Fabris, R. Fabris, W. Fawley, M. Ferianis, E. Ferrari, S. Ferry, L. Froehlich, P. Furlan, G. Gaio, F. Gelmetti, L. Giannessi, M. Giannini, R. Gobessi, R. Ivanov, E. Karantzoulis, M. Lonza, A. Lutman, B. Mahieu, M. Milloch, S. V. Milton, M. Musardo, I. Nikolov, S. Noe, F. Parmigiani, G. Penco, M. Petronio, L. Pivetta, M. Predonzani, F. Rossi, L. Rumiz, A. Salom, C. Scafuri, C. Serpico, P. Sigalotti, S. Spampinati, C. Spezzani, M. Svandrlik, C. Svetina, S. Tazzari, M. Trovo, R. Umer, A. Vascotto, M. Veronese, R. Visintini, M. Zaccaria, D. Zangrando, M. Zangrando, “Highly coherent and stable pulses from the FERMI seeded free-electron laser in the extreme ultraviolet,” Nat. Photonics 6(10), 699–704 (2012).
[CrossRef]

Zatsepin, N. A.

L. Redecke, K. Nass, D. P. DePonte, T. A. White, D. Rehders, A. Barty, F. Stellato, M. Liang, T. R. M. Barends, S. Boutet, G. J. Williams, M. Messerschmidt, M. M. Seibert, A. Aquila, D. Arnlund, S. Bajt, T. Barth, M. J. Bogan, C. Caleman, T. C. Chao, R. B. Doak, H. Fleckenstein, M. Frank, R. Fromme, L. Galli, I. Grotjohann, M. S. Hunter, L. C. Johansson, S. Kassemeyer, G. Katona, R. A. Kirian, R. Koopmann, C. Kupitz, L. Lomb, A. V. Martin, S. Mogk, R. Neutze, R. L. Shoeman, J. Steinbrener, N. Timneanu, D. Wang, U. Weierstall, N. A. Zatsepin, J. C. H. Spence, P. Fromme, I. Schlichting, M. Duszenko, C. Betzel, H. N. Chapman, “Natively inhibited Trypanosoma brucei Cathepsin B structure determined by using an X-ray laser,” Science 339(6116), 227–230 (2013).
[CrossRef] [PubMed]

S. Boutet, L. Lomb, G. J. Williams, T. R. M. Barends, A. Aquila, R. B. Doak, U. Weierstall, D. P. DePonte, J. Steinbrener, R. L. Shoeman, M. Messerschmidt, A. Barty, T. A. White, S. Kassemeyer, R. A. Kirian, M. M. Seibert, P. A. Montanez, C. Kenney, R. Herbst, P. Hart, J. Pines, G. Haller, S. M. Gruner, H. T. Philipp, M. W. Tate, M. Hromalik, L. J. Koerner, N. van Bakel, J. Morse, W. Ghonsalves, D. Arnlund, M. J. Bogan, C. Caleman, R. Fromme, C. Y. Hampton, M. S. Hunter, L. C. Johansson, G. Katona, C. Kupitz, M. Liang, A. V. Martin, K. Nass, L. Redecke, F. Stellato, N. Timneanu, D. Wang, N. A. Zatsepin, D. Schafer, J. Defever, R. Neutze, P. Fromme, J. C. H. Spence, H. N. Chapman, I. Schlichting, “High-resolution protein structure determination by serial femtosecond crystallography,” Science 337(6092), 362–364 (2012).
[CrossRef] [PubMed]

Ziaja, B.

B. Ziaja, N. Medvedev, “Modelling ultrafast transitions within laser-irradiated solids,” High Energy Density Phys. 8(1), 18–29 (2012).
[CrossRef]

Zouni, A.

J. Kern, R. Alonso-Mori, R. Tran, J. Hattne, R. J. Gildea, N. Echols, C. Glöckner, J. Hellmich, H. Laksmono, R. G. Sierra, B. Lassalle-Kaiser, S. Koroidov, A. Lampe, G. Han, S. Gul, D. Difiore, D. Milathianaki, A. R. Fry, A. Miahnahri, D. W. Schafer, M. Messerschmidt, M. M. Seibert, J. E. Koglin, D. Sokaras, T. C. Weng, J. Sellberg, M. J. Latimer, R. W. Grosse-Kunstleve, P. H. Zwart, W. E. White, P. Glatzel, P. D. Adams, M. J. Bogan, G. J. Williams, S. Boutet, J. Messinger, A. Zouni, N. K. Sauter, V. K. Yachandra, U. Bergmann, J. Yano, “Simultaneous femtosecond X-ray spectroscopy and diffraction of photosystem II at room temperature,” Science 340(6131), 491–495 (2013).
[CrossRef] [PubMed]

Zwart, P. H.

J. Kern, R. Alonso-Mori, R. Tran, J. Hattne, R. J. Gildea, N. Echols, C. Glöckner, J. Hellmich, H. Laksmono, R. G. Sierra, B. Lassalle-Kaiser, S. Koroidov, A. Lampe, G. Han, S. Gul, D. Difiore, D. Milathianaki, A. R. Fry, A. Miahnahri, D. W. Schafer, M. Messerschmidt, M. M. Seibert, J. E. Koglin, D. Sokaras, T. C. Weng, J. Sellberg, M. J. Latimer, R. W. Grosse-Kunstleve, P. H. Zwart, W. E. White, P. Glatzel, P. D. Adams, M. J. Bogan, G. J. Williams, S. Boutet, J. Messinger, A. Zouni, N. K. Sauter, V. K. Yachandra, U. Bergmann, J. Yano, “Simultaneous femtosecond X-ray spectroscopy and diffraction of photosystem II at room temperature,” Science 340(6131), 491–495 (2013).
[CrossRef] [PubMed]

Appl. Opt. (1)

High Energy Density Phys. (1)

B. Ziaja, N. Medvedev, “Modelling ultrafast transitions within laser-irradiated solids,” High Energy Density Phys. 8(1), 18–29 (2012).
[CrossRef]

J. Opt. Soc. Am. A (1)

J. Phys. At. Mol. Opt. Phys. (1)

M. J. Bogan, D. Starodub, C. Y. Hampton, R. G. Sierra, “Single-particle coherent diffractive imaging with a soft x-ray free electron laser: towards soot aerosol morphology,” J. Phys. At. Mol. Opt. Phys. 43(19), 194013 (2010).
[CrossRef]

Nat. Mater. (1)

H. N. Chapman, “X-ray imaging beyond the limits,” Nat. Mater. 8(4), 299–301 (2009).
[CrossRef] [PubMed]

Nat. Methods (1)

S. H. W. Scheres, H. Gao, M. Valle, G. T. Herman, P. P. B. Eggermont, J. Frank, J. M. Carazo, “Disentangling conformational states of macromolecules in 3D-EM through likelihood optimization,” Nat. Methods 4(1), 27–29 (2007).
[CrossRef] [PubMed]

Nat. Photonics (1)

E. Allaria, R. Appio, L. Badano, W. A. Barletta, S. Bassanese, S. G. Biedron, A. Borga, E. Busetto, D. Castronovo, P. Cinquegrana, S. Cleva, D. Cocco, M. Cornacchia, P. Craievich, I. Cudin, G. D’Auria, M. Dal Forno, M. B. Danailov, R. De Monte, G. De Ninno, P. Delgiusto, A. Demidovich, S. Di Mitri, B. Diviacco, A. Fabris, R. Fabris, W. Fawley, M. Ferianis, E. Ferrari, S. Ferry, L. Froehlich, P. Furlan, G. Gaio, F. Gelmetti, L. Giannessi, M. Giannini, R. Gobessi, R. Ivanov, E. Karantzoulis, M. Lonza, A. Lutman, B. Mahieu, M. Milloch, S. V. Milton, M. Musardo, I. Nikolov, S. Noe, F. Parmigiani, G. Penco, M. Petronio, L. Pivetta, M. Predonzani, F. Rossi, L. Rumiz, A. Salom, C. Scafuri, C. Serpico, P. Sigalotti, S. Spampinati, C. Spezzani, M. Svandrlik, C. Svetina, S. Tazzari, M. Trovo, R. Umer, A. Vascotto, M. Veronese, R. Visintini, M. Zaccaria, D. Zangrando, M. Zangrando, “Highly coherent and stable pulses from the FERMI seeded free-electron laser in the extreme ultraviolet,” Nat. Photonics 6(10), 699–704 (2012).
[CrossRef]

Nat. Phys. (1)

H. N. Chapman, A. Barty, M. J. Bogan, S. Boutet, M. Frank, S. P. Hau-Riege, S. Marchesini, B. W. Woods, S. Bajt, W. H. Benner, R. A. London, E. Plönjes, M. Kuhlmann, R. Treusch, S. Düsterer, T. Tschentscher, J. R. Schneider, E. Spiller, T. Möller, C. Bostedt, M. Hoener, D. A. Shapiro, K. O. Hodgson, D. van der Spoel, F. Burmeister, M. Bergh, C. Caleman, G. Huldt, M. M. Seibert, F. R. N. C. Maia, R. W. Lee, A. Szöke, N. Timneanu, J. Hajdu, “Femtosecond diffractive imaging with a soft-X-ray free-electron laser,” Nat. Phys. 2(12), 839–843 (2006).
[CrossRef]

Nature (2)

R. Neutze, R. Wouts, D. van der Spoel, E. Weckert, J. Hajdu, “Potential for biomolecular imaging with femtosecond X-ray pulses,” Nature 406(6797), 752–757 (2000).
[CrossRef] [PubMed]

M. M. Seibert, T. Ekeberg, F. R. N. C. Maia, M. Svenda, J. Andreasson, O. Jönsson, D. Odić, B. Iwan, A. Rocker, D. Westphal, M. Hantke, D. P. DePonte, A. Barty, J. Schulz, L. Gumprecht, N. Coppola, A. Aquila, M. Liang, T. A. White, A. Martin, C. Caleman, S. Stern, C. Abergel, V. Seltzer, J. M. Claverie, C. Bostedt, J. D. Bozek, S. Boutet, A. A. Miahnahri, M. Messerschmidt, J. Krzywinski, G. Williams, K. O. Hodgson, M. J. Bogan, C. Y. Hampton, R. G. Sierra, D. Starodub, I. Andersson, S. Bajt, M. Barthelmess, J. C. H. Spence, P. Fromme, U. Weierstall, R. Kirian, M. Hunter, R. B. Doak, S. Marchesini, S. P. Hau-Riege, M. Frank, R. L. Shoeman, L. Lomb, S. W. Epp, R. Hartmann, D. Rolles, A. Rudenko, C. Schmidt, L. Foucar, N. Kimmel, P. Holl, B. Rudek, B. Erk, A. Hömke, C. Reich, D. Pietschner, G. Weidenspointner, L. Strüder, G. Hauser, H. Gorke, J. Ullrich, I. Schlichting, S. Herrmann, G. Schaller, F. Schopper, H. Soltau, K. U. Kühnel, R. Andritschke, C. D. Schröter, F. Krasniqi, M. Bott, S. Schorb, D. Rupp, M. Adolph, T. Gorkhover, H. Hirsemann, G. Potdevin, H. Graafsma, B. Nilsson, H. N. Chapman, J. Hajdu, “Single mimivirus particles intercepted and imaged with an X-ray laser,” Nature 470(7332), 78–81 (2011).
[CrossRef] [PubMed]

New J. Phys. (2)

A. P. Mancuso, T. Gorniak, F. Staier, O. M. Yefanov, R. Barth, C. Christophis, B. Reime, J. Gulden, A. Singer, M. E. Pettit, T. Nisius, T. Wilhein, C. Gutt, G. Grübel, N. Guerassimova, R. Treusch, J. Feldhaus, S. Eisebitt, E. Weckert, M. Grunze, A. Rosenhahn, I. A. Vartanyants, “Coherent imaging of biological samples with femtosecond pulses at the free-electron laser FLASH,” New J. Phys. 12(3), 035003 (2010).
[CrossRef]

P. Schwander, R. Fung, G. N. Phillips, A. Ourmazd, “Mapping the conformations of biological assemblies,” New J. Phys. 12(3), 035007 (2010).
[CrossRef]

Opt. Express (2)

Phys. Rev. B (1)

S. Marchesini, H. He, H. N. Chapman, S. P. Hau-Riege, A. Noy, M. R. Howells, U. Weierstall, J. C. H. Spence, “X-ray image reconstruction from a diffraction pattern alone,” Phys. Rev. B 68(14), 140101 (2003).
[CrossRef]

Rev. Sci. Instrum. (1)

F. Capotondi, E. Pedersoli, N. Mahne, R. H. Menk, G. Passos, L. Raimondi, C. Svetina, G. Sandrin, M. Zangrando, M. Kiskinova, S. Bajt, M. Barthelmess, H. Fleckenstein, H. N. Chapman, J. Schulz, J. Bach, R. Frömter, S. Schleitzer, L. Müller, C. Gutt, G. Grübel, “Invited article: Coherent imaging using seeded free-electron laser pulses with variable polarization: First results and research opportunities,” Rev. Sci. Instrum. 84(5), 051301 (2013).
[CrossRef] [PubMed]

Science (5)

I. McNulty, J. Kirz, C. Jacobsen, E. H. Anderson, M. R. Howells, D. P. Kern, “High-resolution imaging by Fourier transform X-ray holography,” Science 256(5059), 1009–1012 (1992).
[CrossRef] [PubMed]

J. B. Tenenbaum, V. de Silva, J. C. Langford, “A global geometric framework for nonlinear dimensionality reduction,” Science 290(5500), 2319–2323 (2000).
[CrossRef] [PubMed]

L. Redecke, K. Nass, D. P. DePonte, T. A. White, D. Rehders, A. Barty, F. Stellato, M. Liang, T. R. M. Barends, S. Boutet, G. J. Williams, M. Messerschmidt, M. M. Seibert, A. Aquila, D. Arnlund, S. Bajt, T. Barth, M. J. Bogan, C. Caleman, T. C. Chao, R. B. Doak, H. Fleckenstein, M. Frank, R. Fromme, L. Galli, I. Grotjohann, M. S. Hunter, L. C. Johansson, S. Kassemeyer, G. Katona, R. A. Kirian, R. Koopmann, C. Kupitz, L. Lomb, A. V. Martin, S. Mogk, R. Neutze, R. L. Shoeman, J. Steinbrener, N. Timneanu, D. Wang, U. Weierstall, N. A. Zatsepin, J. C. H. Spence, P. Fromme, I. Schlichting, M. Duszenko, C. Betzel, H. N. Chapman, “Natively inhibited Trypanosoma brucei Cathepsin B structure determined by using an X-ray laser,” Science 339(6116), 227–230 (2013).
[CrossRef] [PubMed]

S. Boutet, L. Lomb, G. J. Williams, T. R. M. Barends, A. Aquila, R. B. Doak, U. Weierstall, D. P. DePonte, J. Steinbrener, R. L. Shoeman, M. Messerschmidt, A. Barty, T. A. White, S. Kassemeyer, R. A. Kirian, M. M. Seibert, P. A. Montanez, C. Kenney, R. Herbst, P. Hart, J. Pines, G. Haller, S. M. Gruner, H. T. Philipp, M. W. Tate, M. Hromalik, L. J. Koerner, N. van Bakel, J. Morse, W. Ghonsalves, D. Arnlund, M. J. Bogan, C. Caleman, R. Fromme, C. Y. Hampton, M. S. Hunter, L. C. Johansson, G. Katona, C. Kupitz, M. Liang, A. V. Martin, K. Nass, L. Redecke, F. Stellato, N. Timneanu, D. Wang, N. A. Zatsepin, D. Schafer, J. Defever, R. Neutze, P. Fromme, J. C. H. Spence, H. N. Chapman, I. Schlichting, “High-resolution protein structure determination by serial femtosecond crystallography,” Science 337(6092), 362–364 (2012).
[CrossRef] [PubMed]

J. Kern, R. Alonso-Mori, R. Tran, J. Hattne, R. J. Gildea, N. Echols, C. Glöckner, J. Hellmich, H. Laksmono, R. G. Sierra, B. Lassalle-Kaiser, S. Koroidov, A. Lampe, G. Han, S. Gul, D. Difiore, D. Milathianaki, A. R. Fry, A. Miahnahri, D. W. Schafer, M. Messerschmidt, M. M. Seibert, J. E. Koglin, D. Sokaras, T. C. Weng, J. Sellberg, M. J. Latimer, R. W. Grosse-Kunstleve, P. H. Zwart, W. E. White, P. Glatzel, P. D. Adams, M. J. Bogan, G. J. Williams, S. Boutet, J. Messinger, A. Zouni, N. K. Sauter, V. K. Yachandra, U. Bergmann, J. Yano, “Simultaneous femtosecond X-ray spectroscopy and diffraction of photosystem II at room temperature,” Science 340(6131), 491–495 (2013).
[CrossRef] [PubMed]

Structure (1)

P. A. Penczek, M. Kimmel, C. M. T. Spahn, “Identifying conformational states of macromolecules by eigen-analysis of resampled cryo-EM images,” Structure 19(11), 1582–1590 (2011).
[CrossRef] [PubMed]

Other (3)

N. Davidson, “NADIA Software Project Page,” http://cxscode.ph.unimelb.edu.au/ .

en.wikipedia.org/wiki/File:Muybridge_race_horse_animated.gif .

K. V. Mardia, J. T. Kent, and J. M. Bibby, Multivariate Analysis (Academic, 1979).

Supplementary Material (1)

» Media 1: AVI (267 KB)     

Cited By

OSA participates in CrossRef's Cited-By Linking service. Citing articles from OSA journals and other participating publishers are listed here.

Alert me when this article is cited.


Figures (6)

Fig. 1
Fig. 1

Images of a galloping horse in random order. Thirty frames sample the full period of motion.

Fig. 2
Fig. 2

Sample fabrication using a focused ion beam. a) Electron micrograph of a Pt deposited horse on a silicon nitride membrane (100 μm × 100 μm). A magnified view of the horse is shown in the inset. Some membranes were contaminated by an unknown substance (as can be seen here on the lower right corner of the membrane) which also diffracted. (b) Holographic images of the horse (dashed lines) can sometimes be seen from the Patterson function (direct Fourier transform) of the diffracted intensities.

Fig. 3
Fig. 3

(a)-(c) Diffraction patterns collected at FERMI. Frames 1, 23 and 26 are shown in log scale (left to right). The scale bar represents the exchanged momentum of 2 μm-1. Central orthogonal streaks are caused by beam interaction with the square Si window frame. Incoming wavelength spectrum centred around 32.5 nm is also shown below each diffraction pattern in linear scale (arbitrary units). A wide range of shot-to-shot pulse intensities can be seen.

Fig. 4
Fig. 4

Demonstration of diffraction-before-destruction: (a) Diffraction pattern from frame 26 in log scale. The scale bar represents the exchanged momentum of 2 μm-1. (c) Phase retrieval transfer function estimates the half period resolution to be 0.15 μm. (d) Diffraction signal collected after the initial X-ray pulse confirms that the sample is destroyed.

Fig. 5
Fig. 5

Simulated recovery of horse in motion using dimensionality reduction with neighbourhood graph. The input consists of 30 diffraction patterns in 202,500 vector space (450 × 450 pixels) of the horse in motion. The first two eigenvectors capture the periodic nature of the motion. The correct frame sequence is shown in colour from red to blue. The connecting lines represent the nearest neighbours. Horse frames are shown next to their corresponding data points.

Fig. 6
Fig. 6

Recovery of horse in motion using dimensionality reduction with neighbourhood graph. The input consists of 30 diffraction patterns in 202,500 vector space (450 × 450 pixels) of the horse in motion. The first two eigenvectors capture the periodic nature of the motion. The correct frame sequence is shown in colour from red to blue. The connecting lines represent the nearest neighbours. Reconstructions are shown next to their corresponding data points (Media 1).

Equations (1)

Equations on this page are rendered with MathJax. Learn more.

P R T F ( u ) = | Γ ( u ) exp ( i Φ 0 ) | I ( u ) ,

Metrics