Abstract

Dependence of surface-enhanced Raman scattering (SERS) from Calf thymus DNA on anions is investigated. With the silver colloid, the bands at 732, 960 and 1333 cm-1 for adenine (A), 1466 cm-1 for deoxyribose, and 1652 cm-1 for the C=O group of thymine (T) are observably enhanced. With the presence of the Cl- or SO^(2-)_(4) anions, the bands at 732 and 1326/1329 cm-1 for the symmetric stretching and skeletal vibrational modes of adenine (A) are dramatically enhanced, and the enhancement effect with the SO^(2-)_(4) ion is more than that with the Cl_ ion. The experimental results show that the DNA molecule can be adsorbed on the silver colloid particles through the C6N and N7 of adenine (A), the C=O of thymine (T) and deoxyribose. Moreover, the formed hydrogen bonding of the Cl_ or SO^(2-)_(4) ions to the C6NH2 group of adenine (A) can induce larger C6N electronegativity, which is favor for the C6N/N7 cooperative adsorption on the (Ag)^(+)_(n) colloid particles.

© 2008 Chinese Optics Letters

PDF Article

References

  • View by:
  • |
  • |
  • |

  1. D. Pappas, B. W. Smith, and J. D. Winefordner, Talanta 51, 131 (2000).
  2. K. Nithipatikom, M. J. McCoy, S. R. Hawi, K. Nakamoto, F. Adar, and W. B. Campbell, Anal. Biochem. 322, 198 (2003).
  3. J. Yang, J. Guo, L. Wu, Z. Sun, W. Cai, and Z. Wang, Chin. Opt. Lett. 3, 705 (2005).
  4. J. M. Benevides, S. A. Overman, and G. J. Thomas, Jr., J. Raman Spectrosc. 36, 279 (2005).
  5. W. Ke, D. Zhou, and J. Wu, J. Raman Spectrosc. 36, 39 (2005).
  6. A. J. Ruiz-Chica, M. A. Medina, and F. Sanchez-Jimenez, J. Raman Spectrosc. 35, 93 (2004).
  7. L. Tang, Z. Sun, J. Guo, and Z. Wang, Chin. Opt. Lett. 4, 101 (2006).
  8. K. Kneipp, H. Kneipp, V. B. Kartha, R. Manoharan, G. Deinum, and I. Itzkan, Phys. Rev. E 57, R6281 (1998).
  9. L. Dong, J. Zhou, L. Wu, P. Dong, and Z. Lin, Chem. J. Chin. Univ. (in Chinese) 23, 2303 (2002).
  10. A. Rasumussen and V. Deckert, J. Raman Spectrosc. 37, 311 (2006).
  11. H. Kneipp and K. Kneipp, J. Raman Spectrosc. 33, 551 (2005).
  12. M. Sackmann and A. Materny, J. Raman Spectrosc. 37, 305 (2006).
  13. S. Sánchez-Cortés and J. V. García-Ramos, Surface Science 473, 133 (2001).
  14. B. Giese and D. McNaughton, J. Phys. Chem. B 106, 1461 (2002).
  15. L. Grajcar, V. Huteau, T. Huynh-Dinh, and M.-H. Baron, J. Raman Spectrosc. 32, 1037 (2001).
  16. P. C. Lee and D. Meisel, J. Phys. Chem. 86, 3391 (1982).
  17. A. Zheng, D. Wang, Y. Xu, Y. Zhao, J. Wu, and D. Xu, Spectros. Spec. Anal. (in Chinese) 23, 1132 (2003).
  18. L. A. Gearheart, H. J. Ploehn, and C. J. Murphy, J. Phys. Chem. B 105, 12609 (2001).
  19. R. Y. Zhang, D. W. Pang, Z. L. Zhang, J. W. Yan, J. L. Yao, Z. Q. Tian, B. W. Mao, and S. G. Sun, J. Phys. Chem. B 106, 11233 (2002).
  20. L. Grajcar and M. H. Baron, J. Raman Spectrosc. 32, 912 (2001).
  21. H. Shen, J. Xia, F. Zhang, H. Yang, and Z. Zhang, Spectros. Spec. Anal. (in Chinese) 21, 798 (2001).
  22. C. Otto, T. J. J. van den Tweel, and F. F. M. de Mul, J. Raman Spectrosc. 17, 289 (1986).

2006

A. Rasumussen and V. Deckert, J. Raman Spectrosc. 37, 311 (2006).

M. Sackmann and A. Materny, J. Raman Spectrosc. 37, 305 (2006).

L. Tang, Z. Sun, J. Guo, and Z. Wang, Chin. Opt. Lett. 4, 101 (2006).

2005

J. Yang, J. Guo, L. Wu, Z. Sun, W. Cai, and Z. Wang, Chin. Opt. Lett. 3, 705 (2005).

H. Kneipp and K. Kneipp, J. Raman Spectrosc. 33, 551 (2005).

J. M. Benevides, S. A. Overman, and G. J. Thomas, Jr., J. Raman Spectrosc. 36, 279 (2005).

W. Ke, D. Zhou, and J. Wu, J. Raman Spectrosc. 36, 39 (2005).

2004

A. J. Ruiz-Chica, M. A. Medina, and F. Sanchez-Jimenez, J. Raman Spectrosc. 35, 93 (2004).

2003

K. Nithipatikom, M. J. McCoy, S. R. Hawi, K. Nakamoto, F. Adar, and W. B. Campbell, Anal. Biochem. 322, 198 (2003).

A. Zheng, D. Wang, Y. Xu, Y. Zhao, J. Wu, and D. Xu, Spectros. Spec. Anal. (in Chinese) 23, 1132 (2003).

2002

R. Y. Zhang, D. W. Pang, Z. L. Zhang, J. W. Yan, J. L. Yao, Z. Q. Tian, B. W. Mao, and S. G. Sun, J. Phys. Chem. B 106, 11233 (2002).

L. Dong, J. Zhou, L. Wu, P. Dong, and Z. Lin, Chem. J. Chin. Univ. (in Chinese) 23, 2303 (2002).

B. Giese and D. McNaughton, J. Phys. Chem. B 106, 1461 (2002).

2001

L. Grajcar, V. Huteau, T. Huynh-Dinh, and M.-H. Baron, J. Raman Spectrosc. 32, 1037 (2001).

S. Sánchez-Cortés and J. V. García-Ramos, Surface Science 473, 133 (2001).

L. Grajcar and M. H. Baron, J. Raman Spectrosc. 32, 912 (2001).

H. Shen, J. Xia, F. Zhang, H. Yang, and Z. Zhang, Spectros. Spec. Anal. (in Chinese) 21, 798 (2001).

L. A. Gearheart, H. J. Ploehn, and C. J. Murphy, J. Phys. Chem. B 105, 12609 (2001).

2000

D. Pappas, B. W. Smith, and J. D. Winefordner, Talanta 51, 131 (2000).

1998

K. Kneipp, H. Kneipp, V. B. Kartha, R. Manoharan, G. Deinum, and I. Itzkan, Phys. Rev. E 57, R6281 (1998).

1986

C. Otto, T. J. J. van den Tweel, and F. F. M. de Mul, J. Raman Spectrosc. 17, 289 (1986).

1982

P. C. Lee and D. Meisel, J. Phys. Chem. 86, 3391 (1982).

Adar, F.

K. Nithipatikom, M. J. McCoy, S. R. Hawi, K. Nakamoto, F. Adar, and W. B. Campbell, Anal. Biochem. 322, 198 (2003).

Baron, M. H.

L. Grajcar and M. H. Baron, J. Raman Spectrosc. 32, 912 (2001).

Baron, M.-H.

L. Grajcar, V. Huteau, T. Huynh-Dinh, and M.-H. Baron, J. Raman Spectrosc. 32, 1037 (2001).

Benevides, J. M.

J. M. Benevides, S. A. Overman, and G. J. Thomas, Jr., J. Raman Spectrosc. 36, 279 (2005).

Cai, W.

Campbell, W. B.

K. Nithipatikom, M. J. McCoy, S. R. Hawi, K. Nakamoto, F. Adar, and W. B. Campbell, Anal. Biochem. 322, 198 (2003).

Deckert, V.

A. Rasumussen and V. Deckert, J. Raman Spectrosc. 37, 311 (2006).

Deinum, G.

K. Kneipp, H. Kneipp, V. B. Kartha, R. Manoharan, G. Deinum, and I. Itzkan, Phys. Rev. E 57, R6281 (1998).

Dong, L.

L. Dong, J. Zhou, L. Wu, P. Dong, and Z. Lin, Chem. J. Chin. Univ. (in Chinese) 23, 2303 (2002).

Dong, P.

L. Dong, J. Zhou, L. Wu, P. Dong, and Z. Lin, Chem. J. Chin. Univ. (in Chinese) 23, 2303 (2002).

García-Ramos, J. V.

S. Sánchez-Cortés and J. V. García-Ramos, Surface Science 473, 133 (2001).

Gearheart, L. A.

L. A. Gearheart, H. J. Ploehn, and C. J. Murphy, J. Phys. Chem. B 105, 12609 (2001).

Giese, B.

B. Giese and D. McNaughton, J. Phys. Chem. B 106, 1461 (2002).

Grajcar, L.

L. Grajcar and M. H. Baron, J. Raman Spectrosc. 32, 912 (2001).

L. Grajcar, V. Huteau, T. Huynh-Dinh, and M.-H. Baron, J. Raman Spectrosc. 32, 1037 (2001).

Guo, J.

Hawi, S. R.

K. Nithipatikom, M. J. McCoy, S. R. Hawi, K. Nakamoto, F. Adar, and W. B. Campbell, Anal. Biochem. 322, 198 (2003).

Huteau, V.

L. Grajcar, V. Huteau, T. Huynh-Dinh, and M.-H. Baron, J. Raman Spectrosc. 32, 1037 (2001).

Huynh-Dinh, T.

L. Grajcar, V. Huteau, T. Huynh-Dinh, and M.-H. Baron, J. Raman Spectrosc. 32, 1037 (2001).

Itzkan, I.

K. Kneipp, H. Kneipp, V. B. Kartha, R. Manoharan, G. Deinum, and I. Itzkan, Phys. Rev. E 57, R6281 (1998).

Kartha, V. B.

K. Kneipp, H. Kneipp, V. B. Kartha, R. Manoharan, G. Deinum, and I. Itzkan, Phys. Rev. E 57, R6281 (1998).

Ke, W.

W. Ke, D. Zhou, and J. Wu, J. Raman Spectrosc. 36, 39 (2005).

Kneipp, H.

H. Kneipp and K. Kneipp, J. Raman Spectrosc. 33, 551 (2005).

K. Kneipp, H. Kneipp, V. B. Kartha, R. Manoharan, G. Deinum, and I. Itzkan, Phys. Rev. E 57, R6281 (1998).

Kneipp, K.

H. Kneipp and K. Kneipp, J. Raman Spectrosc. 33, 551 (2005).

K. Kneipp, H. Kneipp, V. B. Kartha, R. Manoharan, G. Deinum, and I. Itzkan, Phys. Rev. E 57, R6281 (1998).

Lee, P. C.

P. C. Lee and D. Meisel, J. Phys. Chem. 86, 3391 (1982).

Lin, Z.

L. Dong, J. Zhou, L. Wu, P. Dong, and Z. Lin, Chem. J. Chin. Univ. (in Chinese) 23, 2303 (2002).

Manoharan, R.

K. Kneipp, H. Kneipp, V. B. Kartha, R. Manoharan, G. Deinum, and I. Itzkan, Phys. Rev. E 57, R6281 (1998).

Mao, B. W.

R. Y. Zhang, D. W. Pang, Z. L. Zhang, J. W. Yan, J. L. Yao, Z. Q. Tian, B. W. Mao, and S. G. Sun, J. Phys. Chem. B 106, 11233 (2002).

Materny, A.

M. Sackmann and A. Materny, J. Raman Spectrosc. 37, 305 (2006).

McCoy, M. J.

K. Nithipatikom, M. J. McCoy, S. R. Hawi, K. Nakamoto, F. Adar, and W. B. Campbell, Anal. Biochem. 322, 198 (2003).

McNaughton, D.

B. Giese and D. McNaughton, J. Phys. Chem. B 106, 1461 (2002).

Medina, M. A.

A. J. Ruiz-Chica, M. A. Medina, and F. Sanchez-Jimenez, J. Raman Spectrosc. 35, 93 (2004).

Meisel, D.

P. C. Lee and D. Meisel, J. Phys. Chem. 86, 3391 (1982).

Mul, F. F. M. de

C. Otto, T. J. J. van den Tweel, and F. F. M. de Mul, J. Raman Spectrosc. 17, 289 (1986).

Murphy, C. J.

L. A. Gearheart, H. J. Ploehn, and C. J. Murphy, J. Phys. Chem. B 105, 12609 (2001).

Nakamoto, K.

K. Nithipatikom, M. J. McCoy, S. R. Hawi, K. Nakamoto, F. Adar, and W. B. Campbell, Anal. Biochem. 322, 198 (2003).

Nithipatikom, K.

K. Nithipatikom, M. J. McCoy, S. R. Hawi, K. Nakamoto, F. Adar, and W. B. Campbell, Anal. Biochem. 322, 198 (2003).

Otto, C.

C. Otto, T. J. J. van den Tweel, and F. F. M. de Mul, J. Raman Spectrosc. 17, 289 (1986).

Overman, S. A.

J. M. Benevides, S. A. Overman, and G. J. Thomas, Jr., J. Raman Spectrosc. 36, 279 (2005).

Pang, D. W.

R. Y. Zhang, D. W. Pang, Z. L. Zhang, J. W. Yan, J. L. Yao, Z. Q. Tian, B. W. Mao, and S. G. Sun, J. Phys. Chem. B 106, 11233 (2002).

Pappas, D.

D. Pappas, B. W. Smith, and J. D. Winefordner, Talanta 51, 131 (2000).

Ploehn, H. J.

L. A. Gearheart, H. J. Ploehn, and C. J. Murphy, J. Phys. Chem. B 105, 12609 (2001).

Rasumussen, A.

A. Rasumussen and V. Deckert, J. Raman Spectrosc. 37, 311 (2006).

Ruiz-Chica, A. J.

A. J. Ruiz-Chica, M. A. Medina, and F. Sanchez-Jimenez, J. Raman Spectrosc. 35, 93 (2004).

Sackmann, M.

M. Sackmann and A. Materny, J. Raman Spectrosc. 37, 305 (2006).

Sánchez-Cortés, S.

S. Sánchez-Cortés and J. V. García-Ramos, Surface Science 473, 133 (2001).

Sanchez-Jimenez, F.

A. J. Ruiz-Chica, M. A. Medina, and F. Sanchez-Jimenez, J. Raman Spectrosc. 35, 93 (2004).

Shen, H.

H. Shen, J. Xia, F. Zhang, H. Yang, and Z. Zhang, Spectros. Spec. Anal. (in Chinese) 21, 798 (2001).

Smith, B. W.

D. Pappas, B. W. Smith, and J. D. Winefordner, Talanta 51, 131 (2000).

Sun, S. G.

R. Y. Zhang, D. W. Pang, Z. L. Zhang, J. W. Yan, J. L. Yao, Z. Q. Tian, B. W. Mao, and S. G. Sun, J. Phys. Chem. B 106, 11233 (2002).

Sun, Z.

Tang, L.

Thomas, G. J.

J. M. Benevides, S. A. Overman, and G. J. Thomas, Jr., J. Raman Spectrosc. 36, 279 (2005).

Tian, Z. Q.

R. Y. Zhang, D. W. Pang, Z. L. Zhang, J. W. Yan, J. L. Yao, Z. Q. Tian, B. W. Mao, and S. G. Sun, J. Phys. Chem. B 106, 11233 (2002).

Tweel, T. J. J. van den

C. Otto, T. J. J. van den Tweel, and F. F. M. de Mul, J. Raman Spectrosc. 17, 289 (1986).

Wang, D.

A. Zheng, D. Wang, Y. Xu, Y. Zhao, J. Wu, and D. Xu, Spectros. Spec. Anal. (in Chinese) 23, 1132 (2003).

Wang, Z.

Winefordner, J. D.

D. Pappas, B. W. Smith, and J. D. Winefordner, Talanta 51, 131 (2000).

Wu, J.

W. Ke, D. Zhou, and J. Wu, J. Raman Spectrosc. 36, 39 (2005).

A. Zheng, D. Wang, Y. Xu, Y. Zhao, J. Wu, and D. Xu, Spectros. Spec. Anal. (in Chinese) 23, 1132 (2003).

Wu, L.

J. Yang, J. Guo, L. Wu, Z. Sun, W. Cai, and Z. Wang, Chin. Opt. Lett. 3, 705 (2005).

L. Dong, J. Zhou, L. Wu, P. Dong, and Z. Lin, Chem. J. Chin. Univ. (in Chinese) 23, 2303 (2002).

Xia, J.

H. Shen, J. Xia, F. Zhang, H. Yang, and Z. Zhang, Spectros. Spec. Anal. (in Chinese) 21, 798 (2001).

Xu, D.

A. Zheng, D. Wang, Y. Xu, Y. Zhao, J. Wu, and D. Xu, Spectros. Spec. Anal. (in Chinese) 23, 1132 (2003).

Xu, Y.

A. Zheng, D. Wang, Y. Xu, Y. Zhao, J. Wu, and D. Xu, Spectros. Spec. Anal. (in Chinese) 23, 1132 (2003).

Yan, J. W.

R. Y. Zhang, D. W. Pang, Z. L. Zhang, J. W. Yan, J. L. Yao, Z. Q. Tian, B. W. Mao, and S. G. Sun, J. Phys. Chem. B 106, 11233 (2002).

Yang, H.

H. Shen, J. Xia, F. Zhang, H. Yang, and Z. Zhang, Spectros. Spec. Anal. (in Chinese) 21, 798 (2001).

Yang, J.

Yao, J. L.

R. Y. Zhang, D. W. Pang, Z. L. Zhang, J. W. Yan, J. L. Yao, Z. Q. Tian, B. W. Mao, and S. G. Sun, J. Phys. Chem. B 106, 11233 (2002).

Zhang, F.

H. Shen, J. Xia, F. Zhang, H. Yang, and Z. Zhang, Spectros. Spec. Anal. (in Chinese) 21, 798 (2001).

Zhang, R. Y.

R. Y. Zhang, D. W. Pang, Z. L. Zhang, J. W. Yan, J. L. Yao, Z. Q. Tian, B. W. Mao, and S. G. Sun, J. Phys. Chem. B 106, 11233 (2002).

Zhang, Z.

H. Shen, J. Xia, F. Zhang, H. Yang, and Z. Zhang, Spectros. Spec. Anal. (in Chinese) 21, 798 (2001).

Zhang, Z. L.

R. Y. Zhang, D. W. Pang, Z. L. Zhang, J. W. Yan, J. L. Yao, Z. Q. Tian, B. W. Mao, and S. G. Sun, J. Phys. Chem. B 106, 11233 (2002).

Zhao, Y.

A. Zheng, D. Wang, Y. Xu, Y. Zhao, J. Wu, and D. Xu, Spectros. Spec. Anal. (in Chinese) 23, 1132 (2003).

Zheng, A.

A. Zheng, D. Wang, Y. Xu, Y. Zhao, J. Wu, and D. Xu, Spectros. Spec. Anal. (in Chinese) 23, 1132 (2003).

Zhou, D.

W. Ke, D. Zhou, and J. Wu, J. Raman Spectrosc. 36, 39 (2005).

Zhou, J.

L. Dong, J. Zhou, L. Wu, P. Dong, and Z. Lin, Chem. J. Chin. Univ. (in Chinese) 23, 2303 (2002).

Anal. Biochem.

K. Nithipatikom, M. J. McCoy, S. R. Hawi, K. Nakamoto, F. Adar, and W. B. Campbell, Anal. Biochem. 322, 198 (2003).

Chem. J. Chin. Univ. (in Chinese)

L. Dong, J. Zhou, L. Wu, P. Dong, and Z. Lin, Chem. J. Chin. Univ. (in Chinese) 23, 2303 (2002).

Chin. Opt. Lett.

J. Phys. Chem.

P. C. Lee and D. Meisel, J. Phys. Chem. 86, 3391 (1982).

J. Phys. Chem. B

B. Giese and D. McNaughton, J. Phys. Chem. B 106, 1461 (2002).

L. A. Gearheart, H. J. Ploehn, and C. J. Murphy, J. Phys. Chem. B 105, 12609 (2001).

R. Y. Zhang, D. W. Pang, Z. L. Zhang, J. W. Yan, J. L. Yao, Z. Q. Tian, B. W. Mao, and S. G. Sun, J. Phys. Chem. B 106, 11233 (2002).

J. Raman Spectrosc.

L. Grajcar and M. H. Baron, J. Raman Spectrosc. 32, 912 (2001).

C. Otto, T. J. J. van den Tweel, and F. F. M. de Mul, J. Raman Spectrosc. 17, 289 (1986).

J. M. Benevides, S. A. Overman, and G. J. Thomas, Jr., J. Raman Spectrosc. 36, 279 (2005).

W. Ke, D. Zhou, and J. Wu, J. Raman Spectrosc. 36, 39 (2005).

A. J. Ruiz-Chica, M. A. Medina, and F. Sanchez-Jimenez, J. Raman Spectrosc. 35, 93 (2004).

L. Grajcar, V. Huteau, T. Huynh-Dinh, and M.-H. Baron, J. Raman Spectrosc. 32, 1037 (2001).

A. Rasumussen and V. Deckert, J. Raman Spectrosc. 37, 311 (2006).

H. Kneipp and K. Kneipp, J. Raman Spectrosc. 33, 551 (2005).

M. Sackmann and A. Materny, J. Raman Spectrosc. 37, 305 (2006).

Phys. Rev. E

K. Kneipp, H. Kneipp, V. B. Kartha, R. Manoharan, G. Deinum, and I. Itzkan, Phys. Rev. E 57, R6281 (1998).

Spectros. Spec. Anal. (in Chinese)

A. Zheng, D. Wang, Y. Xu, Y. Zhao, J. Wu, and D. Xu, Spectros. Spec. Anal. (in Chinese) 23, 1132 (2003).

H. Shen, J. Xia, F. Zhang, H. Yang, and Z. Zhang, Spectros. Spec. Anal. (in Chinese) 21, 798 (2001).

Surface Science

S. Sánchez-Cortés and J. V. García-Ramos, Surface Science 473, 133 (2001).

Talanta

D. Pappas, B. W. Smith, and J. D. Winefordner, Talanta 51, 131 (2000).

Cited By

OSA participates in CrossRef's Cited-By Linking service. Citing articles from OSA journals and other participating publishers are listed here.

Alert me when this article is cited.