Abstract

We present an imaging system that collects hyperspectral images of cells travelling through a microfluidic channel. Using a single monochrome camera and a linear variable bandpass filter (LVF), the system captures a bright field image and a set of hyperspectral fluorescence images for each cell. While the bandwidth of the LVF is 20 nm, we have demonstrated that we can determine the peak wavelength of a fluorescent object’s emission spectrum with an accuracy of below 3 nm. In addition, we have used this system to capture fluorescence spectra of individual spatially resolved cellular organelles and to spectrally resolve multiple fluorophores in individual cells.

© 2013 OSA

Full Article  |  PDF Article

References

  • View by:
  • |
  • |
  • |

  1. D. J. Stephens and V. J. Allan, “Light microscopy techniques for live cell imaging,” Science300(5616), 82–86 (2003).
    [CrossRef] [PubMed]
  2. V. G. Cheung, N. Nowak, W. Jang, I. R. Kirsch, S. Zhao, X.-N. Chen, T. S. Furey, U.-J. Kim, W.-L. Kuo, M. Olivier, J. Conroy, A. Kasprzyk, H. Massa, R. Yonescu, S. Sait, C. Thoreen, A. Snijders, E. Lemyre, J. A. Bailey, A. Bruzel, W. D. Burrill, S. M. Clegg, S. Collins, P. Dhami, C. Friedman, C. S. Han, S. Herrick, J. Lee, A. H. Ligon, S. Lowry, M. Morley, S. Narasimhan, K. Osoegawa, Z. Peng, I. Plajzer-Frick, B. J. Quade, D. Scott, K. Sirotkin, A. A. Thorpe, J. W. Gray, J. Hudson, D. Pinkel, T. Ried, L. Rowen, G. L. Shen-Ong, R. L. Strausberg, E. Birney, D. F. Callen, J. F. Cheng, D. R. Cox, N. A. Doggett, N. P. Carter, E. E. Eichler, D. Haussler, J. R. Korenberg, C. C. Morton, D. Albertson, G. Schuler, P. J. de Jong, B. J. Trask, and BAC Resource Consortium, “Integration of cytogenetic landmarks into the draft sequence of the human genome,” Nature409(6822), 953–958 (2001).
    [CrossRef] [PubMed]
  3. J. Lippincott-Schwartz and G. H. Patterson, “Development and use of fluorescent protein markers in living cells,” Science300(5616), 87–91 (2003).
    [CrossRef] [PubMed]
  4. M. Kneen, J. Farinas, Y. Li, and A. S. Verkman, “Green fluorescent protein as a noninvasive intracellular pH indicator,” Biophys. J.74(3), 1591–1599 (1998).
    [CrossRef] [PubMed]
  5. A. Minta, J. P. Kao, and R. Y. Tsien, “Fluorescent indicators for cytosolic calcium based on rhodamine and fluorescein chromophores,” J. Biol. Chem.264(14), 8171–8178 (1989).
    [PubMed]
  6. D. M. Owen, D. J. Williamson, A. Magenau, and K. Gaus, “Sub-resolution lipid domains exist in the plasma membrane and regulate protein diffusion and distribution,” Nat Commun3, 1256 (2012).
    [CrossRef] [PubMed]
  7. S. P. Perfetto, P. K. Chattopadhyay, and M. Roederer, “Seventeen-colour flow cytometry: unravelling the immune system,” Nat. Rev. Immunol.4(8), 648–655 (2004).
    [CrossRef] [PubMed]
  8. G. Grégori, V. Patsekin, B. Rajwa, J. Jones, K. Ragheb, C. Holdman, and J. P. Robinson, “Hyperspectral cytometry at the single-cell level using a 32-channel photodetector,” Cytometry A81(1), 35–44 (2012).
    [CrossRef] [PubMed]
  9. D. A. Basiji, W. E. Ortyn, L. Liang, V. Venkatachalam, and P. Morrissey, “Cellular image analysis and imaging by flow cytometry,” Clin. Lab. Med.27(3), 653–670, viii (2007).
    [CrossRef] [PubMed]
  10. Item LVF-HL, Ocean Optics, Catalogue of Products.
  11. T. Haraguchi, D. Q. Ding, A. Yamamoto, T. Kaneda, T. Koujin, and Y. Hiraoka, “Multiple-color fluorescence imaging of chromosomes and microtubules in living cells,” Cell Struct. Funct.24(5), 291–298 (1999).
    [CrossRef] [PubMed]
  12. S. J. Woltman, G. D. Jay, and G. P. Crawford, “Liquid-crystal materials find a new order in biomedical applications,” Nat. Mater.6(12), 929–938 (2007).
    [CrossRef] [PubMed]
  13. R. M. Levenson, “Spectral imaging perspective on cytomics,” Cytometry A69(7), 592–600 (2006).
    [CrossRef] [PubMed]
  14. M. B. Sinclair, D. M. Haaland, J. A. Timlin, and H. D. Jones, “Hyperspectral confocal fluorescence imaging: exploring alternative multivariate curve resolution approaches,” Appl. Opt.45, 6283–6291 (2006).
    [CrossRef] [PubMed]
  15. H. Matsuoka, Y. Kosai, M. Saito, N. Takeyama, and H. Suto, “Single-cell viability assessment with a novel spectro-imaging system,” J. Biotechnol.94(3), 299–308 (2002).
    [CrossRef] [PubMed]
  16. L. Gao, R. T. Kester, N. Hagen, and T. S. Tkaczyk, “Snapshot image mapping spectrometer (IMS) with high sampling density for hyperspectral microscopy,” Opt. Express18(14), 14330–14344 (2010).
    [CrossRef] [PubMed]
  17. O. Schmidt, M. Bassler, P. Kiesel, C. Knollenberg, and N. Johnson, “Fluorescence spectrometer-on-a-fluidic-chip,” Lab Chip7(5), 626–629 (2007).
    [CrossRef] [PubMed]
  18. S. S. Gorthi and E. Schonbrun, “Phase imaging flow cytometry using a focus-stack collecting microscope,” Opt. Lett.37(4), 707–709 (2012).
    [CrossRef] [PubMed]
  19. E. Schonbrun, S. S. Gorthi, and D. Schaak, “Microfabricated multiple field of view imaging flow cytometry,” Lab Chip12(2), 268–273 (2011).
    [CrossRef] [PubMed]
  20. FluoroSpheres, Carboxylate-modified microsphere, Invitrogen.
  21. Sigma Aldrich, Catalogue of Products.
  22. Nucleic Acid Cell Stains, Invitrogen.
  23. T. Zimmermann, “Spectral imaging and linear unmixing in light microscopy,” Adv. Biochem. Eng. Biotechnol.95, 245–265 (2005).
    [CrossRef] [PubMed]

2012

D. M. Owen, D. J. Williamson, A. Magenau, and K. Gaus, “Sub-resolution lipid domains exist in the plasma membrane and regulate protein diffusion and distribution,” Nat Commun3, 1256 (2012).
[CrossRef] [PubMed]

G. Grégori, V. Patsekin, B. Rajwa, J. Jones, K. Ragheb, C. Holdman, and J. P. Robinson, “Hyperspectral cytometry at the single-cell level using a 32-channel photodetector,” Cytometry A81(1), 35–44 (2012).
[CrossRef] [PubMed]

S. S. Gorthi and E. Schonbrun, “Phase imaging flow cytometry using a focus-stack collecting microscope,” Opt. Lett.37(4), 707–709 (2012).
[CrossRef] [PubMed]

2011

E. Schonbrun, S. S. Gorthi, and D. Schaak, “Microfabricated multiple field of view imaging flow cytometry,” Lab Chip12(2), 268–273 (2011).
[CrossRef] [PubMed]

2010

2007

O. Schmidt, M. Bassler, P. Kiesel, C. Knollenberg, and N. Johnson, “Fluorescence spectrometer-on-a-fluidic-chip,” Lab Chip7(5), 626–629 (2007).
[CrossRef] [PubMed]

S. J. Woltman, G. D. Jay, and G. P. Crawford, “Liquid-crystal materials find a new order in biomedical applications,” Nat. Mater.6(12), 929–938 (2007).
[CrossRef] [PubMed]

D. A. Basiji, W. E. Ortyn, L. Liang, V. Venkatachalam, and P. Morrissey, “Cellular image analysis and imaging by flow cytometry,” Clin. Lab. Med.27(3), 653–670, viii (2007).
[CrossRef] [PubMed]

2006

2005

T. Zimmermann, “Spectral imaging and linear unmixing in light microscopy,” Adv. Biochem. Eng. Biotechnol.95, 245–265 (2005).
[CrossRef] [PubMed]

2004

S. P. Perfetto, P. K. Chattopadhyay, and M. Roederer, “Seventeen-colour flow cytometry: unravelling the immune system,” Nat. Rev. Immunol.4(8), 648–655 (2004).
[CrossRef] [PubMed]

2003

D. J. Stephens and V. J. Allan, “Light microscopy techniques for live cell imaging,” Science300(5616), 82–86 (2003).
[CrossRef] [PubMed]

J. Lippincott-Schwartz and G. H. Patterson, “Development and use of fluorescent protein markers in living cells,” Science300(5616), 87–91 (2003).
[CrossRef] [PubMed]

2002

H. Matsuoka, Y. Kosai, M. Saito, N. Takeyama, and H. Suto, “Single-cell viability assessment with a novel spectro-imaging system,” J. Biotechnol.94(3), 299–308 (2002).
[CrossRef] [PubMed]

2001

V. G. Cheung, N. Nowak, W. Jang, I. R. Kirsch, S. Zhao, X.-N. Chen, T. S. Furey, U.-J. Kim, W.-L. Kuo, M. Olivier, J. Conroy, A. Kasprzyk, H. Massa, R. Yonescu, S. Sait, C. Thoreen, A. Snijders, E. Lemyre, J. A. Bailey, A. Bruzel, W. D. Burrill, S. M. Clegg, S. Collins, P. Dhami, C. Friedman, C. S. Han, S. Herrick, J. Lee, A. H. Ligon, S. Lowry, M. Morley, S. Narasimhan, K. Osoegawa, Z. Peng, I. Plajzer-Frick, B. J. Quade, D. Scott, K. Sirotkin, A. A. Thorpe, J. W. Gray, J. Hudson, D. Pinkel, T. Ried, L. Rowen, G. L. Shen-Ong, R. L. Strausberg, E. Birney, D. F. Callen, J. F. Cheng, D. R. Cox, N. A. Doggett, N. P. Carter, E. E. Eichler, D. Haussler, J. R. Korenberg, C. C. Morton, D. Albertson, G. Schuler, P. J. de Jong, B. J. Trask, and BAC Resource Consortium, “Integration of cytogenetic landmarks into the draft sequence of the human genome,” Nature409(6822), 953–958 (2001).
[CrossRef] [PubMed]

1999

T. Haraguchi, D. Q. Ding, A. Yamamoto, T. Kaneda, T. Koujin, and Y. Hiraoka, “Multiple-color fluorescence imaging of chromosomes and microtubules in living cells,” Cell Struct. Funct.24(5), 291–298 (1999).
[CrossRef] [PubMed]

1998

M. Kneen, J. Farinas, Y. Li, and A. S. Verkman, “Green fluorescent protein as a noninvasive intracellular pH indicator,” Biophys. J.74(3), 1591–1599 (1998).
[CrossRef] [PubMed]

1989

A. Minta, J. P. Kao, and R. Y. Tsien, “Fluorescent indicators for cytosolic calcium based on rhodamine and fluorescein chromophores,” J. Biol. Chem.264(14), 8171–8178 (1989).
[PubMed]

Albertson, D.

V. G. Cheung, N. Nowak, W. Jang, I. R. Kirsch, S. Zhao, X.-N. Chen, T. S. Furey, U.-J. Kim, W.-L. Kuo, M. Olivier, J. Conroy, A. Kasprzyk, H. Massa, R. Yonescu, S. Sait, C. Thoreen, A. Snijders, E. Lemyre, J. A. Bailey, A. Bruzel, W. D. Burrill, S. M. Clegg, S. Collins, P. Dhami, C. Friedman, C. S. Han, S. Herrick, J. Lee, A. H. Ligon, S. Lowry, M. Morley, S. Narasimhan, K. Osoegawa, Z. Peng, I. Plajzer-Frick, B. J. Quade, D. Scott, K. Sirotkin, A. A. Thorpe, J. W. Gray, J. Hudson, D. Pinkel, T. Ried, L. Rowen, G. L. Shen-Ong, R. L. Strausberg, E. Birney, D. F. Callen, J. F. Cheng, D. R. Cox, N. A. Doggett, N. P. Carter, E. E. Eichler, D. Haussler, J. R. Korenberg, C. C. Morton, D. Albertson, G. Schuler, P. J. de Jong, B. J. Trask, and BAC Resource Consortium, “Integration of cytogenetic landmarks into the draft sequence of the human genome,” Nature409(6822), 953–958 (2001).
[CrossRef] [PubMed]

Allan, V. J.

D. J. Stephens and V. J. Allan, “Light microscopy techniques for live cell imaging,” Science300(5616), 82–86 (2003).
[CrossRef] [PubMed]

Bailey, J. A.

V. G. Cheung, N. Nowak, W. Jang, I. R. Kirsch, S. Zhao, X.-N. Chen, T. S. Furey, U.-J. Kim, W.-L. Kuo, M. Olivier, J. Conroy, A. Kasprzyk, H. Massa, R. Yonescu, S. Sait, C. Thoreen, A. Snijders, E. Lemyre, J. A. Bailey, A. Bruzel, W. D. Burrill, S. M. Clegg, S. Collins, P. Dhami, C. Friedman, C. S. Han, S. Herrick, J. Lee, A. H. Ligon, S. Lowry, M. Morley, S. Narasimhan, K. Osoegawa, Z. Peng, I. Plajzer-Frick, B. J. Quade, D. Scott, K. Sirotkin, A. A. Thorpe, J. W. Gray, J. Hudson, D. Pinkel, T. Ried, L. Rowen, G. L. Shen-Ong, R. L. Strausberg, E. Birney, D. F. Callen, J. F. Cheng, D. R. Cox, N. A. Doggett, N. P. Carter, E. E. Eichler, D. Haussler, J. R. Korenberg, C. C. Morton, D. Albertson, G. Schuler, P. J. de Jong, B. J. Trask, and BAC Resource Consortium, “Integration of cytogenetic landmarks into the draft sequence of the human genome,” Nature409(6822), 953–958 (2001).
[CrossRef] [PubMed]

Basiji, D. A.

D. A. Basiji, W. E. Ortyn, L. Liang, V. Venkatachalam, and P. Morrissey, “Cellular image analysis and imaging by flow cytometry,” Clin. Lab. Med.27(3), 653–670, viii (2007).
[CrossRef] [PubMed]

Bassler, M.

O. Schmidt, M. Bassler, P. Kiesel, C. Knollenberg, and N. Johnson, “Fluorescence spectrometer-on-a-fluidic-chip,” Lab Chip7(5), 626–629 (2007).
[CrossRef] [PubMed]

Birney, E.

V. G. Cheung, N. Nowak, W. Jang, I. R. Kirsch, S. Zhao, X.-N. Chen, T. S. Furey, U.-J. Kim, W.-L. Kuo, M. Olivier, J. Conroy, A. Kasprzyk, H. Massa, R. Yonescu, S. Sait, C. Thoreen, A. Snijders, E. Lemyre, J. A. Bailey, A. Bruzel, W. D. Burrill, S. M. Clegg, S. Collins, P. Dhami, C. Friedman, C. S. Han, S. Herrick, J. Lee, A. H. Ligon, S. Lowry, M. Morley, S. Narasimhan, K. Osoegawa, Z. Peng, I. Plajzer-Frick, B. J. Quade, D. Scott, K. Sirotkin, A. A. Thorpe, J. W. Gray, J. Hudson, D. Pinkel, T. Ried, L. Rowen, G. L. Shen-Ong, R. L. Strausberg, E. Birney, D. F. Callen, J. F. Cheng, D. R. Cox, N. A. Doggett, N. P. Carter, E. E. Eichler, D. Haussler, J. R. Korenberg, C. C. Morton, D. Albertson, G. Schuler, P. J. de Jong, B. J. Trask, and BAC Resource Consortium, “Integration of cytogenetic landmarks into the draft sequence of the human genome,” Nature409(6822), 953–958 (2001).
[CrossRef] [PubMed]

Bruzel, A.

V. G. Cheung, N. Nowak, W. Jang, I. R. Kirsch, S. Zhao, X.-N. Chen, T. S. Furey, U.-J. Kim, W.-L. Kuo, M. Olivier, J. Conroy, A. Kasprzyk, H. Massa, R. Yonescu, S. Sait, C. Thoreen, A. Snijders, E. Lemyre, J. A. Bailey, A. Bruzel, W. D. Burrill, S. M. Clegg, S. Collins, P. Dhami, C. Friedman, C. S. Han, S. Herrick, J. Lee, A. H. Ligon, S. Lowry, M. Morley, S. Narasimhan, K. Osoegawa, Z. Peng, I. Plajzer-Frick, B. J. Quade, D. Scott, K. Sirotkin, A. A. Thorpe, J. W. Gray, J. Hudson, D. Pinkel, T. Ried, L. Rowen, G. L. Shen-Ong, R. L. Strausberg, E. Birney, D. F. Callen, J. F. Cheng, D. R. Cox, N. A. Doggett, N. P. Carter, E. E. Eichler, D. Haussler, J. R. Korenberg, C. C. Morton, D. Albertson, G. Schuler, P. J. de Jong, B. J. Trask, and BAC Resource Consortium, “Integration of cytogenetic landmarks into the draft sequence of the human genome,” Nature409(6822), 953–958 (2001).
[CrossRef] [PubMed]

Burrill, W. D.

V. G. Cheung, N. Nowak, W. Jang, I. R. Kirsch, S. Zhao, X.-N. Chen, T. S. Furey, U.-J. Kim, W.-L. Kuo, M. Olivier, J. Conroy, A. Kasprzyk, H. Massa, R. Yonescu, S. Sait, C. Thoreen, A. Snijders, E. Lemyre, J. A. Bailey, A. Bruzel, W. D. Burrill, S. M. Clegg, S. Collins, P. Dhami, C. Friedman, C. S. Han, S. Herrick, J. Lee, A. H. Ligon, S. Lowry, M. Morley, S. Narasimhan, K. Osoegawa, Z. Peng, I. Plajzer-Frick, B. J. Quade, D. Scott, K. Sirotkin, A. A. Thorpe, J. W. Gray, J. Hudson, D. Pinkel, T. Ried, L. Rowen, G. L. Shen-Ong, R. L. Strausberg, E. Birney, D. F. Callen, J. F. Cheng, D. R. Cox, N. A. Doggett, N. P. Carter, E. E. Eichler, D. Haussler, J. R. Korenberg, C. C. Morton, D. Albertson, G. Schuler, P. J. de Jong, B. J. Trask, and BAC Resource Consortium, “Integration of cytogenetic landmarks into the draft sequence of the human genome,” Nature409(6822), 953–958 (2001).
[CrossRef] [PubMed]

Callen, D. F.

V. G. Cheung, N. Nowak, W. Jang, I. R. Kirsch, S. Zhao, X.-N. Chen, T. S. Furey, U.-J. Kim, W.-L. Kuo, M. Olivier, J. Conroy, A. Kasprzyk, H. Massa, R. Yonescu, S. Sait, C. Thoreen, A. Snijders, E. Lemyre, J. A. Bailey, A. Bruzel, W. D. Burrill, S. M. Clegg, S. Collins, P. Dhami, C. Friedman, C. S. Han, S. Herrick, J. Lee, A. H. Ligon, S. Lowry, M. Morley, S. Narasimhan, K. Osoegawa, Z. Peng, I. Plajzer-Frick, B. J. Quade, D. Scott, K. Sirotkin, A. A. Thorpe, J. W. Gray, J. Hudson, D. Pinkel, T. Ried, L. Rowen, G. L. Shen-Ong, R. L. Strausberg, E. Birney, D. F. Callen, J. F. Cheng, D. R. Cox, N. A. Doggett, N. P. Carter, E. E. Eichler, D. Haussler, J. R. Korenberg, C. C. Morton, D. Albertson, G. Schuler, P. J. de Jong, B. J. Trask, and BAC Resource Consortium, “Integration of cytogenetic landmarks into the draft sequence of the human genome,” Nature409(6822), 953–958 (2001).
[CrossRef] [PubMed]

Carter, N. P.

V. G. Cheung, N. Nowak, W. Jang, I. R. Kirsch, S. Zhao, X.-N. Chen, T. S. Furey, U.-J. Kim, W.-L. Kuo, M. Olivier, J. Conroy, A. Kasprzyk, H. Massa, R. Yonescu, S. Sait, C. Thoreen, A. Snijders, E. Lemyre, J. A. Bailey, A. Bruzel, W. D. Burrill, S. M. Clegg, S. Collins, P. Dhami, C. Friedman, C. S. Han, S. Herrick, J. Lee, A. H. Ligon, S. Lowry, M. Morley, S. Narasimhan, K. Osoegawa, Z. Peng, I. Plajzer-Frick, B. J. Quade, D. Scott, K. Sirotkin, A. A. Thorpe, J. W. Gray, J. Hudson, D. Pinkel, T. Ried, L. Rowen, G. L. Shen-Ong, R. L. Strausberg, E. Birney, D. F. Callen, J. F. Cheng, D. R. Cox, N. A. Doggett, N. P. Carter, E. E. Eichler, D. Haussler, J. R. Korenberg, C. C. Morton, D. Albertson, G. Schuler, P. J. de Jong, B. J. Trask, and BAC Resource Consortium, “Integration of cytogenetic landmarks into the draft sequence of the human genome,” Nature409(6822), 953–958 (2001).
[CrossRef] [PubMed]

Chattopadhyay, P. K.

S. P. Perfetto, P. K. Chattopadhyay, and M. Roederer, “Seventeen-colour flow cytometry: unravelling the immune system,” Nat. Rev. Immunol.4(8), 648–655 (2004).
[CrossRef] [PubMed]

Chen, X.-N.

V. G. Cheung, N. Nowak, W. Jang, I. R. Kirsch, S. Zhao, X.-N. Chen, T. S. Furey, U.-J. Kim, W.-L. Kuo, M. Olivier, J. Conroy, A. Kasprzyk, H. Massa, R. Yonescu, S. Sait, C. Thoreen, A. Snijders, E. Lemyre, J. A. Bailey, A. Bruzel, W. D. Burrill, S. M. Clegg, S. Collins, P. Dhami, C. Friedman, C. S. Han, S. Herrick, J. Lee, A. H. Ligon, S. Lowry, M. Morley, S. Narasimhan, K. Osoegawa, Z. Peng, I. Plajzer-Frick, B. J. Quade, D. Scott, K. Sirotkin, A. A. Thorpe, J. W. Gray, J. Hudson, D. Pinkel, T. Ried, L. Rowen, G. L. Shen-Ong, R. L. Strausberg, E. Birney, D. F. Callen, J. F. Cheng, D. R. Cox, N. A. Doggett, N. P. Carter, E. E. Eichler, D. Haussler, J. R. Korenberg, C. C. Morton, D. Albertson, G. Schuler, P. J. de Jong, B. J. Trask, and BAC Resource Consortium, “Integration of cytogenetic landmarks into the draft sequence of the human genome,” Nature409(6822), 953–958 (2001).
[CrossRef] [PubMed]

Cheng, J. F.

V. G. Cheung, N. Nowak, W. Jang, I. R. Kirsch, S. Zhao, X.-N. Chen, T. S. Furey, U.-J. Kim, W.-L. Kuo, M. Olivier, J. Conroy, A. Kasprzyk, H. Massa, R. Yonescu, S. Sait, C. Thoreen, A. Snijders, E. Lemyre, J. A. Bailey, A. Bruzel, W. D. Burrill, S. M. Clegg, S. Collins, P. Dhami, C. Friedman, C. S. Han, S. Herrick, J. Lee, A. H. Ligon, S. Lowry, M. Morley, S. Narasimhan, K. Osoegawa, Z. Peng, I. Plajzer-Frick, B. J. Quade, D. Scott, K. Sirotkin, A. A. Thorpe, J. W. Gray, J. Hudson, D. Pinkel, T. Ried, L. Rowen, G. L. Shen-Ong, R. L. Strausberg, E. Birney, D. F. Callen, J. F. Cheng, D. R. Cox, N. A. Doggett, N. P. Carter, E. E. Eichler, D. Haussler, J. R. Korenberg, C. C. Morton, D. Albertson, G. Schuler, P. J. de Jong, B. J. Trask, and BAC Resource Consortium, “Integration of cytogenetic landmarks into the draft sequence of the human genome,” Nature409(6822), 953–958 (2001).
[CrossRef] [PubMed]

Cheung, V. G.

V. G. Cheung, N. Nowak, W. Jang, I. R. Kirsch, S. Zhao, X.-N. Chen, T. S. Furey, U.-J. Kim, W.-L. Kuo, M. Olivier, J. Conroy, A. Kasprzyk, H. Massa, R. Yonescu, S. Sait, C. Thoreen, A. Snijders, E. Lemyre, J. A. Bailey, A. Bruzel, W. D. Burrill, S. M. Clegg, S. Collins, P. Dhami, C. Friedman, C. S. Han, S. Herrick, J. Lee, A. H. Ligon, S. Lowry, M. Morley, S. Narasimhan, K. Osoegawa, Z. Peng, I. Plajzer-Frick, B. J. Quade, D. Scott, K. Sirotkin, A. A. Thorpe, J. W. Gray, J. Hudson, D. Pinkel, T. Ried, L. Rowen, G. L. Shen-Ong, R. L. Strausberg, E. Birney, D. F. Callen, J. F. Cheng, D. R. Cox, N. A. Doggett, N. P. Carter, E. E. Eichler, D. Haussler, J. R. Korenberg, C. C. Morton, D. Albertson, G. Schuler, P. J. de Jong, B. J. Trask, and BAC Resource Consortium, “Integration of cytogenetic landmarks into the draft sequence of the human genome,” Nature409(6822), 953–958 (2001).
[CrossRef] [PubMed]

Clegg, S. M.

V. G. Cheung, N. Nowak, W. Jang, I. R. Kirsch, S. Zhao, X.-N. Chen, T. S. Furey, U.-J. Kim, W.-L. Kuo, M. Olivier, J. Conroy, A. Kasprzyk, H. Massa, R. Yonescu, S. Sait, C. Thoreen, A. Snijders, E. Lemyre, J. A. Bailey, A. Bruzel, W. D. Burrill, S. M. Clegg, S. Collins, P. Dhami, C. Friedman, C. S. Han, S. Herrick, J. Lee, A. H. Ligon, S. Lowry, M. Morley, S. Narasimhan, K. Osoegawa, Z. Peng, I. Plajzer-Frick, B. J. Quade, D. Scott, K. Sirotkin, A. A. Thorpe, J. W. Gray, J. Hudson, D. Pinkel, T. Ried, L. Rowen, G. L. Shen-Ong, R. L. Strausberg, E. Birney, D. F. Callen, J. F. Cheng, D. R. Cox, N. A. Doggett, N. P. Carter, E. E. Eichler, D. Haussler, J. R. Korenberg, C. C. Morton, D. Albertson, G. Schuler, P. J. de Jong, B. J. Trask, and BAC Resource Consortium, “Integration of cytogenetic landmarks into the draft sequence of the human genome,” Nature409(6822), 953–958 (2001).
[CrossRef] [PubMed]

Collins, S.

V. G. Cheung, N. Nowak, W. Jang, I. R. Kirsch, S. Zhao, X.-N. Chen, T. S. Furey, U.-J. Kim, W.-L. Kuo, M. Olivier, J. Conroy, A. Kasprzyk, H. Massa, R. Yonescu, S. Sait, C. Thoreen, A. Snijders, E. Lemyre, J. A. Bailey, A. Bruzel, W. D. Burrill, S. M. Clegg, S. Collins, P. Dhami, C. Friedman, C. S. Han, S. Herrick, J. Lee, A. H. Ligon, S. Lowry, M. Morley, S. Narasimhan, K. Osoegawa, Z. Peng, I. Plajzer-Frick, B. J. Quade, D. Scott, K. Sirotkin, A. A. Thorpe, J. W. Gray, J. Hudson, D. Pinkel, T. Ried, L. Rowen, G. L. Shen-Ong, R. L. Strausberg, E. Birney, D. F. Callen, J. F. Cheng, D. R. Cox, N. A. Doggett, N. P. Carter, E. E. Eichler, D. Haussler, J. R. Korenberg, C. C. Morton, D. Albertson, G. Schuler, P. J. de Jong, B. J. Trask, and BAC Resource Consortium, “Integration of cytogenetic landmarks into the draft sequence of the human genome,” Nature409(6822), 953–958 (2001).
[CrossRef] [PubMed]

Conroy, J.

V. G. Cheung, N. Nowak, W. Jang, I. R. Kirsch, S. Zhao, X.-N. Chen, T. S. Furey, U.-J. Kim, W.-L. Kuo, M. Olivier, J. Conroy, A. Kasprzyk, H. Massa, R. Yonescu, S. Sait, C. Thoreen, A. Snijders, E. Lemyre, J. A. Bailey, A. Bruzel, W. D. Burrill, S. M. Clegg, S. Collins, P. Dhami, C. Friedman, C. S. Han, S. Herrick, J. Lee, A. H. Ligon, S. Lowry, M. Morley, S. Narasimhan, K. Osoegawa, Z. Peng, I. Plajzer-Frick, B. J. Quade, D. Scott, K. Sirotkin, A. A. Thorpe, J. W. Gray, J. Hudson, D. Pinkel, T. Ried, L. Rowen, G. L. Shen-Ong, R. L. Strausberg, E. Birney, D. F. Callen, J. F. Cheng, D. R. Cox, N. A. Doggett, N. P. Carter, E. E. Eichler, D. Haussler, J. R. Korenberg, C. C. Morton, D. Albertson, G. Schuler, P. J. de Jong, B. J. Trask, and BAC Resource Consortium, “Integration of cytogenetic landmarks into the draft sequence of the human genome,” Nature409(6822), 953–958 (2001).
[CrossRef] [PubMed]

Cox, D. R.

V. G. Cheung, N. Nowak, W. Jang, I. R. Kirsch, S. Zhao, X.-N. Chen, T. S. Furey, U.-J. Kim, W.-L. Kuo, M. Olivier, J. Conroy, A. Kasprzyk, H. Massa, R. Yonescu, S. Sait, C. Thoreen, A. Snijders, E. Lemyre, J. A. Bailey, A. Bruzel, W. D. Burrill, S. M. Clegg, S. Collins, P. Dhami, C. Friedman, C. S. Han, S. Herrick, J. Lee, A. H. Ligon, S. Lowry, M. Morley, S. Narasimhan, K. Osoegawa, Z. Peng, I. Plajzer-Frick, B. J. Quade, D. Scott, K. Sirotkin, A. A. Thorpe, J. W. Gray, J. Hudson, D. Pinkel, T. Ried, L. Rowen, G. L. Shen-Ong, R. L. Strausberg, E. Birney, D. F. Callen, J. F. Cheng, D. R. Cox, N. A. Doggett, N. P. Carter, E. E. Eichler, D. Haussler, J. R. Korenberg, C. C. Morton, D. Albertson, G. Schuler, P. J. de Jong, B. J. Trask, and BAC Resource Consortium, “Integration of cytogenetic landmarks into the draft sequence of the human genome,” Nature409(6822), 953–958 (2001).
[CrossRef] [PubMed]

Crawford, G. P.

S. J. Woltman, G. D. Jay, and G. P. Crawford, “Liquid-crystal materials find a new order in biomedical applications,” Nat. Mater.6(12), 929–938 (2007).
[CrossRef] [PubMed]

de Jong, P. J.

V. G. Cheung, N. Nowak, W. Jang, I. R. Kirsch, S. Zhao, X.-N. Chen, T. S. Furey, U.-J. Kim, W.-L. Kuo, M. Olivier, J. Conroy, A. Kasprzyk, H. Massa, R. Yonescu, S. Sait, C. Thoreen, A. Snijders, E. Lemyre, J. A. Bailey, A. Bruzel, W. D. Burrill, S. M. Clegg, S. Collins, P. Dhami, C. Friedman, C. S. Han, S. Herrick, J. Lee, A. H. Ligon, S. Lowry, M. Morley, S. Narasimhan, K. Osoegawa, Z. Peng, I. Plajzer-Frick, B. J. Quade, D. Scott, K. Sirotkin, A. A. Thorpe, J. W. Gray, J. Hudson, D. Pinkel, T. Ried, L. Rowen, G. L. Shen-Ong, R. L. Strausberg, E. Birney, D. F. Callen, J. F. Cheng, D. R. Cox, N. A. Doggett, N. P. Carter, E. E. Eichler, D. Haussler, J. R. Korenberg, C. C. Morton, D. Albertson, G. Schuler, P. J. de Jong, B. J. Trask, and BAC Resource Consortium, “Integration of cytogenetic landmarks into the draft sequence of the human genome,” Nature409(6822), 953–958 (2001).
[CrossRef] [PubMed]

Dhami, P.

V. G. Cheung, N. Nowak, W. Jang, I. R. Kirsch, S. Zhao, X.-N. Chen, T. S. Furey, U.-J. Kim, W.-L. Kuo, M. Olivier, J. Conroy, A. Kasprzyk, H. Massa, R. Yonescu, S. Sait, C. Thoreen, A. Snijders, E. Lemyre, J. A. Bailey, A. Bruzel, W. D. Burrill, S. M. Clegg, S. Collins, P. Dhami, C. Friedman, C. S. Han, S. Herrick, J. Lee, A. H. Ligon, S. Lowry, M. Morley, S. Narasimhan, K. Osoegawa, Z. Peng, I. Plajzer-Frick, B. J. Quade, D. Scott, K. Sirotkin, A. A. Thorpe, J. W. Gray, J. Hudson, D. Pinkel, T. Ried, L. Rowen, G. L. Shen-Ong, R. L. Strausberg, E. Birney, D. F. Callen, J. F. Cheng, D. R. Cox, N. A. Doggett, N. P. Carter, E. E. Eichler, D. Haussler, J. R. Korenberg, C. C. Morton, D. Albertson, G. Schuler, P. J. de Jong, B. J. Trask, and BAC Resource Consortium, “Integration of cytogenetic landmarks into the draft sequence of the human genome,” Nature409(6822), 953–958 (2001).
[CrossRef] [PubMed]

Ding, D. Q.

T. Haraguchi, D. Q. Ding, A. Yamamoto, T. Kaneda, T. Koujin, and Y. Hiraoka, “Multiple-color fluorescence imaging of chromosomes and microtubules in living cells,” Cell Struct. Funct.24(5), 291–298 (1999).
[CrossRef] [PubMed]

Doggett, N. A.

V. G. Cheung, N. Nowak, W. Jang, I. R. Kirsch, S. Zhao, X.-N. Chen, T. S. Furey, U.-J. Kim, W.-L. Kuo, M. Olivier, J. Conroy, A. Kasprzyk, H. Massa, R. Yonescu, S. Sait, C. Thoreen, A. Snijders, E. Lemyre, J. A. Bailey, A. Bruzel, W. D. Burrill, S. M. Clegg, S. Collins, P. Dhami, C. Friedman, C. S. Han, S. Herrick, J. Lee, A. H. Ligon, S. Lowry, M. Morley, S. Narasimhan, K. Osoegawa, Z. Peng, I. Plajzer-Frick, B. J. Quade, D. Scott, K. Sirotkin, A. A. Thorpe, J. W. Gray, J. Hudson, D. Pinkel, T. Ried, L. Rowen, G. L. Shen-Ong, R. L. Strausberg, E. Birney, D. F. Callen, J. F. Cheng, D. R. Cox, N. A. Doggett, N. P. Carter, E. E. Eichler, D. Haussler, J. R. Korenberg, C. C. Morton, D. Albertson, G. Schuler, P. J. de Jong, B. J. Trask, and BAC Resource Consortium, “Integration of cytogenetic landmarks into the draft sequence of the human genome,” Nature409(6822), 953–958 (2001).
[CrossRef] [PubMed]

Eichler, E. E.

V. G. Cheung, N. Nowak, W. Jang, I. R. Kirsch, S. Zhao, X.-N. Chen, T. S. Furey, U.-J. Kim, W.-L. Kuo, M. Olivier, J. Conroy, A. Kasprzyk, H. Massa, R. Yonescu, S. Sait, C. Thoreen, A. Snijders, E. Lemyre, J. A. Bailey, A. Bruzel, W. D. Burrill, S. M. Clegg, S. Collins, P. Dhami, C. Friedman, C. S. Han, S. Herrick, J. Lee, A. H. Ligon, S. Lowry, M. Morley, S. Narasimhan, K. Osoegawa, Z. Peng, I. Plajzer-Frick, B. J. Quade, D. Scott, K. Sirotkin, A. A. Thorpe, J. W. Gray, J. Hudson, D. Pinkel, T. Ried, L. Rowen, G. L. Shen-Ong, R. L. Strausberg, E. Birney, D. F. Callen, J. F. Cheng, D. R. Cox, N. A. Doggett, N. P. Carter, E. E. Eichler, D. Haussler, J. R. Korenberg, C. C. Morton, D. Albertson, G. Schuler, P. J. de Jong, B. J. Trask, and BAC Resource Consortium, “Integration of cytogenetic landmarks into the draft sequence of the human genome,” Nature409(6822), 953–958 (2001).
[CrossRef] [PubMed]

Farinas, J.

M. Kneen, J. Farinas, Y. Li, and A. S. Verkman, “Green fluorescent protein as a noninvasive intracellular pH indicator,” Biophys. J.74(3), 1591–1599 (1998).
[CrossRef] [PubMed]

Friedman, C.

V. G. Cheung, N. Nowak, W. Jang, I. R. Kirsch, S. Zhao, X.-N. Chen, T. S. Furey, U.-J. Kim, W.-L. Kuo, M. Olivier, J. Conroy, A. Kasprzyk, H. Massa, R. Yonescu, S. Sait, C. Thoreen, A. Snijders, E. Lemyre, J. A. Bailey, A. Bruzel, W. D. Burrill, S. M. Clegg, S. Collins, P. Dhami, C. Friedman, C. S. Han, S. Herrick, J. Lee, A. H. Ligon, S. Lowry, M. Morley, S. Narasimhan, K. Osoegawa, Z. Peng, I. Plajzer-Frick, B. J. Quade, D. Scott, K. Sirotkin, A. A. Thorpe, J. W. Gray, J. Hudson, D. Pinkel, T. Ried, L. Rowen, G. L. Shen-Ong, R. L. Strausberg, E. Birney, D. F. Callen, J. F. Cheng, D. R. Cox, N. A. Doggett, N. P. Carter, E. E. Eichler, D. Haussler, J. R. Korenberg, C. C. Morton, D. Albertson, G. Schuler, P. J. de Jong, B. J. Trask, and BAC Resource Consortium, “Integration of cytogenetic landmarks into the draft sequence of the human genome,” Nature409(6822), 953–958 (2001).
[CrossRef] [PubMed]

Furey, T. S.

V. G. Cheung, N. Nowak, W. Jang, I. R. Kirsch, S. Zhao, X.-N. Chen, T. S. Furey, U.-J. Kim, W.-L. Kuo, M. Olivier, J. Conroy, A. Kasprzyk, H. Massa, R. Yonescu, S. Sait, C. Thoreen, A. Snijders, E. Lemyre, J. A. Bailey, A. Bruzel, W. D. Burrill, S. M. Clegg, S. Collins, P. Dhami, C. Friedman, C. S. Han, S. Herrick, J. Lee, A. H. Ligon, S. Lowry, M. Morley, S. Narasimhan, K. Osoegawa, Z. Peng, I. Plajzer-Frick, B. J. Quade, D. Scott, K. Sirotkin, A. A. Thorpe, J. W. Gray, J. Hudson, D. Pinkel, T. Ried, L. Rowen, G. L. Shen-Ong, R. L. Strausberg, E. Birney, D. F. Callen, J. F. Cheng, D. R. Cox, N. A. Doggett, N. P. Carter, E. E. Eichler, D. Haussler, J. R. Korenberg, C. C. Morton, D. Albertson, G. Schuler, P. J. de Jong, B. J. Trask, and BAC Resource Consortium, “Integration of cytogenetic landmarks into the draft sequence of the human genome,” Nature409(6822), 953–958 (2001).
[CrossRef] [PubMed]

Gao, L.

Gaus, K.

D. M. Owen, D. J. Williamson, A. Magenau, and K. Gaus, “Sub-resolution lipid domains exist in the plasma membrane and regulate protein diffusion and distribution,” Nat Commun3, 1256 (2012).
[CrossRef] [PubMed]

Gorthi, S. S.

S. S. Gorthi and E. Schonbrun, “Phase imaging flow cytometry using a focus-stack collecting microscope,” Opt. Lett.37(4), 707–709 (2012).
[CrossRef] [PubMed]

E. Schonbrun, S. S. Gorthi, and D. Schaak, “Microfabricated multiple field of view imaging flow cytometry,” Lab Chip12(2), 268–273 (2011).
[CrossRef] [PubMed]

Gray, J. W.

V. G. Cheung, N. Nowak, W. Jang, I. R. Kirsch, S. Zhao, X.-N. Chen, T. S. Furey, U.-J. Kim, W.-L. Kuo, M. Olivier, J. Conroy, A. Kasprzyk, H. Massa, R. Yonescu, S. Sait, C. Thoreen, A. Snijders, E. Lemyre, J. A. Bailey, A. Bruzel, W. D. Burrill, S. M. Clegg, S. Collins, P. Dhami, C. Friedman, C. S. Han, S. Herrick, J. Lee, A. H. Ligon, S. Lowry, M. Morley, S. Narasimhan, K. Osoegawa, Z. Peng, I. Plajzer-Frick, B. J. Quade, D. Scott, K. Sirotkin, A. A. Thorpe, J. W. Gray, J. Hudson, D. Pinkel, T. Ried, L. Rowen, G. L. Shen-Ong, R. L. Strausberg, E. Birney, D. F. Callen, J. F. Cheng, D. R. Cox, N. A. Doggett, N. P. Carter, E. E. Eichler, D. Haussler, J. R. Korenberg, C. C. Morton, D. Albertson, G. Schuler, P. J. de Jong, B. J. Trask, and BAC Resource Consortium, “Integration of cytogenetic landmarks into the draft sequence of the human genome,” Nature409(6822), 953–958 (2001).
[CrossRef] [PubMed]

Grégori, G.

G. Grégori, V. Patsekin, B. Rajwa, J. Jones, K. Ragheb, C. Holdman, and J. P. Robinson, “Hyperspectral cytometry at the single-cell level using a 32-channel photodetector,” Cytometry A81(1), 35–44 (2012).
[CrossRef] [PubMed]

Haaland, D. M.

Hagen, N.

Han, C. S.

V. G. Cheung, N. Nowak, W. Jang, I. R. Kirsch, S. Zhao, X.-N. Chen, T. S. Furey, U.-J. Kim, W.-L. Kuo, M. Olivier, J. Conroy, A. Kasprzyk, H. Massa, R. Yonescu, S. Sait, C. Thoreen, A. Snijders, E. Lemyre, J. A. Bailey, A. Bruzel, W. D. Burrill, S. M. Clegg, S. Collins, P. Dhami, C. Friedman, C. S. Han, S. Herrick, J. Lee, A. H. Ligon, S. Lowry, M. Morley, S. Narasimhan, K. Osoegawa, Z. Peng, I. Plajzer-Frick, B. J. Quade, D. Scott, K. Sirotkin, A. A. Thorpe, J. W. Gray, J. Hudson, D. Pinkel, T. Ried, L. Rowen, G. L. Shen-Ong, R. L. Strausberg, E. Birney, D. F. Callen, J. F. Cheng, D. R. Cox, N. A. Doggett, N. P. Carter, E. E. Eichler, D. Haussler, J. R. Korenberg, C. C. Morton, D. Albertson, G. Schuler, P. J. de Jong, B. J. Trask, and BAC Resource Consortium, “Integration of cytogenetic landmarks into the draft sequence of the human genome,” Nature409(6822), 953–958 (2001).
[CrossRef] [PubMed]

Haraguchi, T.

T. Haraguchi, D. Q. Ding, A. Yamamoto, T. Kaneda, T. Koujin, and Y. Hiraoka, “Multiple-color fluorescence imaging of chromosomes and microtubules in living cells,” Cell Struct. Funct.24(5), 291–298 (1999).
[CrossRef] [PubMed]

Haussler, D.

V. G. Cheung, N. Nowak, W. Jang, I. R. Kirsch, S. Zhao, X.-N. Chen, T. S. Furey, U.-J. Kim, W.-L. Kuo, M. Olivier, J. Conroy, A. Kasprzyk, H. Massa, R. Yonescu, S. Sait, C. Thoreen, A. Snijders, E. Lemyre, J. A. Bailey, A. Bruzel, W. D. Burrill, S. M. Clegg, S. Collins, P. Dhami, C. Friedman, C. S. Han, S. Herrick, J. Lee, A. H. Ligon, S. Lowry, M. Morley, S. Narasimhan, K. Osoegawa, Z. Peng, I. Plajzer-Frick, B. J. Quade, D. Scott, K. Sirotkin, A. A. Thorpe, J. W. Gray, J. Hudson, D. Pinkel, T. Ried, L. Rowen, G. L. Shen-Ong, R. L. Strausberg, E. Birney, D. F. Callen, J. F. Cheng, D. R. Cox, N. A. Doggett, N. P. Carter, E. E. Eichler, D. Haussler, J. R. Korenberg, C. C. Morton, D. Albertson, G. Schuler, P. J. de Jong, B. J. Trask, and BAC Resource Consortium, “Integration of cytogenetic landmarks into the draft sequence of the human genome,” Nature409(6822), 953–958 (2001).
[CrossRef] [PubMed]

Herrick, S.

V. G. Cheung, N. Nowak, W. Jang, I. R. Kirsch, S. Zhao, X.-N. Chen, T. S. Furey, U.-J. Kim, W.-L. Kuo, M. Olivier, J. Conroy, A. Kasprzyk, H. Massa, R. Yonescu, S. Sait, C. Thoreen, A. Snijders, E. Lemyre, J. A. Bailey, A. Bruzel, W. D. Burrill, S. M. Clegg, S. Collins, P. Dhami, C. Friedman, C. S. Han, S. Herrick, J. Lee, A. H. Ligon, S. Lowry, M. Morley, S. Narasimhan, K. Osoegawa, Z. Peng, I. Plajzer-Frick, B. J. Quade, D. Scott, K. Sirotkin, A. A. Thorpe, J. W. Gray, J. Hudson, D. Pinkel, T. Ried, L. Rowen, G. L. Shen-Ong, R. L. Strausberg, E. Birney, D. F. Callen, J. F. Cheng, D. R. Cox, N. A. Doggett, N. P. Carter, E. E. Eichler, D. Haussler, J. R. Korenberg, C. C. Morton, D. Albertson, G. Schuler, P. J. de Jong, B. J. Trask, and BAC Resource Consortium, “Integration of cytogenetic landmarks into the draft sequence of the human genome,” Nature409(6822), 953–958 (2001).
[CrossRef] [PubMed]

Hiraoka, Y.

T. Haraguchi, D. Q. Ding, A. Yamamoto, T. Kaneda, T. Koujin, and Y. Hiraoka, “Multiple-color fluorescence imaging of chromosomes and microtubules in living cells,” Cell Struct. Funct.24(5), 291–298 (1999).
[CrossRef] [PubMed]

Holdman, C.

G. Grégori, V. Patsekin, B. Rajwa, J. Jones, K. Ragheb, C. Holdman, and J. P. Robinson, “Hyperspectral cytometry at the single-cell level using a 32-channel photodetector,” Cytometry A81(1), 35–44 (2012).
[CrossRef] [PubMed]

Hudson, J.

V. G. Cheung, N. Nowak, W. Jang, I. R. Kirsch, S. Zhao, X.-N. Chen, T. S. Furey, U.-J. Kim, W.-L. Kuo, M. Olivier, J. Conroy, A. Kasprzyk, H. Massa, R. Yonescu, S. Sait, C. Thoreen, A. Snijders, E. Lemyre, J. A. Bailey, A. Bruzel, W. D. Burrill, S. M. Clegg, S. Collins, P. Dhami, C. Friedman, C. S. Han, S. Herrick, J. Lee, A. H. Ligon, S. Lowry, M. Morley, S. Narasimhan, K. Osoegawa, Z. Peng, I. Plajzer-Frick, B. J. Quade, D. Scott, K. Sirotkin, A. A. Thorpe, J. W. Gray, J. Hudson, D. Pinkel, T. Ried, L. Rowen, G. L. Shen-Ong, R. L. Strausberg, E. Birney, D. F. Callen, J. F. Cheng, D. R. Cox, N. A. Doggett, N. P. Carter, E. E. Eichler, D. Haussler, J. R. Korenberg, C. C. Morton, D. Albertson, G. Schuler, P. J. de Jong, B. J. Trask, and BAC Resource Consortium, “Integration of cytogenetic landmarks into the draft sequence of the human genome,” Nature409(6822), 953–958 (2001).
[CrossRef] [PubMed]

Jang, W.

V. G. Cheung, N. Nowak, W. Jang, I. R. Kirsch, S. Zhao, X.-N. Chen, T. S. Furey, U.-J. Kim, W.-L. Kuo, M. Olivier, J. Conroy, A. Kasprzyk, H. Massa, R. Yonescu, S. Sait, C. Thoreen, A. Snijders, E. Lemyre, J. A. Bailey, A. Bruzel, W. D. Burrill, S. M. Clegg, S. Collins, P. Dhami, C. Friedman, C. S. Han, S. Herrick, J. Lee, A. H. Ligon, S. Lowry, M. Morley, S. Narasimhan, K. Osoegawa, Z. Peng, I. Plajzer-Frick, B. J. Quade, D. Scott, K. Sirotkin, A. A. Thorpe, J. W. Gray, J. Hudson, D. Pinkel, T. Ried, L. Rowen, G. L. Shen-Ong, R. L. Strausberg, E. Birney, D. F. Callen, J. F. Cheng, D. R. Cox, N. A. Doggett, N. P. Carter, E. E. Eichler, D. Haussler, J. R. Korenberg, C. C. Morton, D. Albertson, G. Schuler, P. J. de Jong, B. J. Trask, and BAC Resource Consortium, “Integration of cytogenetic landmarks into the draft sequence of the human genome,” Nature409(6822), 953–958 (2001).
[CrossRef] [PubMed]

Jay, G. D.

S. J. Woltman, G. D. Jay, and G. P. Crawford, “Liquid-crystal materials find a new order in biomedical applications,” Nat. Mater.6(12), 929–938 (2007).
[CrossRef] [PubMed]

Johnson, N.

O. Schmidt, M. Bassler, P. Kiesel, C. Knollenberg, and N. Johnson, “Fluorescence spectrometer-on-a-fluidic-chip,” Lab Chip7(5), 626–629 (2007).
[CrossRef] [PubMed]

Jones, H. D.

Jones, J.

G. Grégori, V. Patsekin, B. Rajwa, J. Jones, K. Ragheb, C. Holdman, and J. P. Robinson, “Hyperspectral cytometry at the single-cell level using a 32-channel photodetector,” Cytometry A81(1), 35–44 (2012).
[CrossRef] [PubMed]

Kaneda, T.

T. Haraguchi, D. Q. Ding, A. Yamamoto, T. Kaneda, T. Koujin, and Y. Hiraoka, “Multiple-color fluorescence imaging of chromosomes and microtubules in living cells,” Cell Struct. Funct.24(5), 291–298 (1999).
[CrossRef] [PubMed]

Kao, J. P.

A. Minta, J. P. Kao, and R. Y. Tsien, “Fluorescent indicators for cytosolic calcium based on rhodamine and fluorescein chromophores,” J. Biol. Chem.264(14), 8171–8178 (1989).
[PubMed]

Kasprzyk, A.

V. G. Cheung, N. Nowak, W. Jang, I. R. Kirsch, S. Zhao, X.-N. Chen, T. S. Furey, U.-J. Kim, W.-L. Kuo, M. Olivier, J. Conroy, A. Kasprzyk, H. Massa, R. Yonescu, S. Sait, C. Thoreen, A. Snijders, E. Lemyre, J. A. Bailey, A. Bruzel, W. D. Burrill, S. M. Clegg, S. Collins, P. Dhami, C. Friedman, C. S. Han, S. Herrick, J. Lee, A. H. Ligon, S. Lowry, M. Morley, S. Narasimhan, K. Osoegawa, Z. Peng, I. Plajzer-Frick, B. J. Quade, D. Scott, K. Sirotkin, A. A. Thorpe, J. W. Gray, J. Hudson, D. Pinkel, T. Ried, L. Rowen, G. L. Shen-Ong, R. L. Strausberg, E. Birney, D. F. Callen, J. F. Cheng, D. R. Cox, N. A. Doggett, N. P. Carter, E. E. Eichler, D. Haussler, J. R. Korenberg, C. C. Morton, D. Albertson, G. Schuler, P. J. de Jong, B. J. Trask, and BAC Resource Consortium, “Integration of cytogenetic landmarks into the draft sequence of the human genome,” Nature409(6822), 953–958 (2001).
[CrossRef] [PubMed]

Kester, R. T.

Kiesel, P.

O. Schmidt, M. Bassler, P. Kiesel, C. Knollenberg, and N. Johnson, “Fluorescence spectrometer-on-a-fluidic-chip,” Lab Chip7(5), 626–629 (2007).
[CrossRef] [PubMed]

Kim, U.-J.

V. G. Cheung, N. Nowak, W. Jang, I. R. Kirsch, S. Zhao, X.-N. Chen, T. S. Furey, U.-J. Kim, W.-L. Kuo, M. Olivier, J. Conroy, A. Kasprzyk, H. Massa, R. Yonescu, S. Sait, C. Thoreen, A. Snijders, E. Lemyre, J. A. Bailey, A. Bruzel, W. D. Burrill, S. M. Clegg, S. Collins, P. Dhami, C. Friedman, C. S. Han, S. Herrick, J. Lee, A. H. Ligon, S. Lowry, M. Morley, S. Narasimhan, K. Osoegawa, Z. Peng, I. Plajzer-Frick, B. J. Quade, D. Scott, K. Sirotkin, A. A. Thorpe, J. W. Gray, J. Hudson, D. Pinkel, T. Ried, L. Rowen, G. L. Shen-Ong, R. L. Strausberg, E. Birney, D. F. Callen, J. F. Cheng, D. R. Cox, N. A. Doggett, N. P. Carter, E. E. Eichler, D. Haussler, J. R. Korenberg, C. C. Morton, D. Albertson, G. Schuler, P. J. de Jong, B. J. Trask, and BAC Resource Consortium, “Integration of cytogenetic landmarks into the draft sequence of the human genome,” Nature409(6822), 953–958 (2001).
[CrossRef] [PubMed]

Kirsch, I. R.

V. G. Cheung, N. Nowak, W. Jang, I. R. Kirsch, S. Zhao, X.-N. Chen, T. S. Furey, U.-J. Kim, W.-L. Kuo, M. Olivier, J. Conroy, A. Kasprzyk, H. Massa, R. Yonescu, S. Sait, C. Thoreen, A. Snijders, E. Lemyre, J. A. Bailey, A. Bruzel, W. D. Burrill, S. M. Clegg, S. Collins, P. Dhami, C. Friedman, C. S. Han, S. Herrick, J. Lee, A. H. Ligon, S. Lowry, M. Morley, S. Narasimhan, K. Osoegawa, Z. Peng, I. Plajzer-Frick, B. J. Quade, D. Scott, K. Sirotkin, A. A. Thorpe, J. W. Gray, J. Hudson, D. Pinkel, T. Ried, L. Rowen, G. L. Shen-Ong, R. L. Strausberg, E. Birney, D. F. Callen, J. F. Cheng, D. R. Cox, N. A. Doggett, N. P. Carter, E. E. Eichler, D. Haussler, J. R. Korenberg, C. C. Morton, D. Albertson, G. Schuler, P. J. de Jong, B. J. Trask, and BAC Resource Consortium, “Integration of cytogenetic landmarks into the draft sequence of the human genome,” Nature409(6822), 953–958 (2001).
[CrossRef] [PubMed]

Kneen, M.

M. Kneen, J. Farinas, Y. Li, and A. S. Verkman, “Green fluorescent protein as a noninvasive intracellular pH indicator,” Biophys. J.74(3), 1591–1599 (1998).
[CrossRef] [PubMed]

Knollenberg, C.

O. Schmidt, M. Bassler, P. Kiesel, C. Knollenberg, and N. Johnson, “Fluorescence spectrometer-on-a-fluidic-chip,” Lab Chip7(5), 626–629 (2007).
[CrossRef] [PubMed]

Korenberg, J. R.

V. G. Cheung, N. Nowak, W. Jang, I. R. Kirsch, S. Zhao, X.-N. Chen, T. S. Furey, U.-J. Kim, W.-L. Kuo, M. Olivier, J. Conroy, A. Kasprzyk, H. Massa, R. Yonescu, S. Sait, C. Thoreen, A. Snijders, E. Lemyre, J. A. Bailey, A. Bruzel, W. D. Burrill, S. M. Clegg, S. Collins, P. Dhami, C. Friedman, C. S. Han, S. Herrick, J. Lee, A. H. Ligon, S. Lowry, M. Morley, S. Narasimhan, K. Osoegawa, Z. Peng, I. Plajzer-Frick, B. J. Quade, D. Scott, K. Sirotkin, A. A. Thorpe, J. W. Gray, J. Hudson, D. Pinkel, T. Ried, L. Rowen, G. L. Shen-Ong, R. L. Strausberg, E. Birney, D. F. Callen, J. F. Cheng, D. R. Cox, N. A. Doggett, N. P. Carter, E. E. Eichler, D. Haussler, J. R. Korenberg, C. C. Morton, D. Albertson, G. Schuler, P. J. de Jong, B. J. Trask, and BAC Resource Consortium, “Integration of cytogenetic landmarks into the draft sequence of the human genome,” Nature409(6822), 953–958 (2001).
[CrossRef] [PubMed]

Kosai, Y.

H. Matsuoka, Y. Kosai, M. Saito, N. Takeyama, and H. Suto, “Single-cell viability assessment with a novel spectro-imaging system,” J. Biotechnol.94(3), 299–308 (2002).
[CrossRef] [PubMed]

Koujin, T.

T. Haraguchi, D. Q. Ding, A. Yamamoto, T. Kaneda, T. Koujin, and Y. Hiraoka, “Multiple-color fluorescence imaging of chromosomes and microtubules in living cells,” Cell Struct. Funct.24(5), 291–298 (1999).
[CrossRef] [PubMed]

Kuo, W.-L.

V. G. Cheung, N. Nowak, W. Jang, I. R. Kirsch, S. Zhao, X.-N. Chen, T. S. Furey, U.-J. Kim, W.-L. Kuo, M. Olivier, J. Conroy, A. Kasprzyk, H. Massa, R. Yonescu, S. Sait, C. Thoreen, A. Snijders, E. Lemyre, J. A. Bailey, A. Bruzel, W. D. Burrill, S. M. Clegg, S. Collins, P. Dhami, C. Friedman, C. S. Han, S. Herrick, J. Lee, A. H. Ligon, S. Lowry, M. Morley, S. Narasimhan, K. Osoegawa, Z. Peng, I. Plajzer-Frick, B. J. Quade, D. Scott, K. Sirotkin, A. A. Thorpe, J. W. Gray, J. Hudson, D. Pinkel, T. Ried, L. Rowen, G. L. Shen-Ong, R. L. Strausberg, E. Birney, D. F. Callen, J. F. Cheng, D. R. Cox, N. A. Doggett, N. P. Carter, E. E. Eichler, D. Haussler, J. R. Korenberg, C. C. Morton, D. Albertson, G. Schuler, P. J. de Jong, B. J. Trask, and BAC Resource Consortium, “Integration of cytogenetic landmarks into the draft sequence of the human genome,” Nature409(6822), 953–958 (2001).
[CrossRef] [PubMed]

Lee, J.

V. G. Cheung, N. Nowak, W. Jang, I. R. Kirsch, S. Zhao, X.-N. Chen, T. S. Furey, U.-J. Kim, W.-L. Kuo, M. Olivier, J. Conroy, A. Kasprzyk, H. Massa, R. Yonescu, S. Sait, C. Thoreen, A. Snijders, E. Lemyre, J. A. Bailey, A. Bruzel, W. D. Burrill, S. M. Clegg, S. Collins, P. Dhami, C. Friedman, C. S. Han, S. Herrick, J. Lee, A. H. Ligon, S. Lowry, M. Morley, S. Narasimhan, K. Osoegawa, Z. Peng, I. Plajzer-Frick, B. J. Quade, D. Scott, K. Sirotkin, A. A. Thorpe, J. W. Gray, J. Hudson, D. Pinkel, T. Ried, L. Rowen, G. L. Shen-Ong, R. L. Strausberg, E. Birney, D. F. Callen, J. F. Cheng, D. R. Cox, N. A. Doggett, N. P. Carter, E. E. Eichler, D. Haussler, J. R. Korenberg, C. C. Morton, D. Albertson, G. Schuler, P. J. de Jong, B. J. Trask, and BAC Resource Consortium, “Integration of cytogenetic landmarks into the draft sequence of the human genome,” Nature409(6822), 953–958 (2001).
[CrossRef] [PubMed]

Lemyre, E.

V. G. Cheung, N. Nowak, W. Jang, I. R. Kirsch, S. Zhao, X.-N. Chen, T. S. Furey, U.-J. Kim, W.-L. Kuo, M. Olivier, J. Conroy, A. Kasprzyk, H. Massa, R. Yonescu, S. Sait, C. Thoreen, A. Snijders, E. Lemyre, J. A. Bailey, A. Bruzel, W. D. Burrill, S. M. Clegg, S. Collins, P. Dhami, C. Friedman, C. S. Han, S. Herrick, J. Lee, A. H. Ligon, S. Lowry, M. Morley, S. Narasimhan, K. Osoegawa, Z. Peng, I. Plajzer-Frick, B. J. Quade, D. Scott, K. Sirotkin, A. A. Thorpe, J. W. Gray, J. Hudson, D. Pinkel, T. Ried, L. Rowen, G. L. Shen-Ong, R. L. Strausberg, E. Birney, D. F. Callen, J. F. Cheng, D. R. Cox, N. A. Doggett, N. P. Carter, E. E. Eichler, D. Haussler, J. R. Korenberg, C. C. Morton, D. Albertson, G. Schuler, P. J. de Jong, B. J. Trask, and BAC Resource Consortium, “Integration of cytogenetic landmarks into the draft sequence of the human genome,” Nature409(6822), 953–958 (2001).
[CrossRef] [PubMed]

Levenson, R. M.

R. M. Levenson, “Spectral imaging perspective on cytomics,” Cytometry A69(7), 592–600 (2006).
[CrossRef] [PubMed]

Li, Y.

M. Kneen, J. Farinas, Y. Li, and A. S. Verkman, “Green fluorescent protein as a noninvasive intracellular pH indicator,” Biophys. J.74(3), 1591–1599 (1998).
[CrossRef] [PubMed]

Liang, L.

D. A. Basiji, W. E. Ortyn, L. Liang, V. Venkatachalam, and P. Morrissey, “Cellular image analysis and imaging by flow cytometry,” Clin. Lab. Med.27(3), 653–670, viii (2007).
[CrossRef] [PubMed]

Ligon, A. H.

V. G. Cheung, N. Nowak, W. Jang, I. R. Kirsch, S. Zhao, X.-N. Chen, T. S. Furey, U.-J. Kim, W.-L. Kuo, M. Olivier, J. Conroy, A. Kasprzyk, H. Massa, R. Yonescu, S. Sait, C. Thoreen, A. Snijders, E. Lemyre, J. A. Bailey, A. Bruzel, W. D. Burrill, S. M. Clegg, S. Collins, P. Dhami, C. Friedman, C. S. Han, S. Herrick, J. Lee, A. H. Ligon, S. Lowry, M. Morley, S. Narasimhan, K. Osoegawa, Z. Peng, I. Plajzer-Frick, B. J. Quade, D. Scott, K. Sirotkin, A. A. Thorpe, J. W. Gray, J. Hudson, D. Pinkel, T. Ried, L. Rowen, G. L. Shen-Ong, R. L. Strausberg, E. Birney, D. F. Callen, J. F. Cheng, D. R. Cox, N. A. Doggett, N. P. Carter, E. E. Eichler, D. Haussler, J. R. Korenberg, C. C. Morton, D. Albertson, G. Schuler, P. J. de Jong, B. J. Trask, and BAC Resource Consortium, “Integration of cytogenetic landmarks into the draft sequence of the human genome,” Nature409(6822), 953–958 (2001).
[CrossRef] [PubMed]

Lippincott-Schwartz, J.

J. Lippincott-Schwartz and G. H. Patterson, “Development and use of fluorescent protein markers in living cells,” Science300(5616), 87–91 (2003).
[CrossRef] [PubMed]

Lowry, S.

V. G. Cheung, N. Nowak, W. Jang, I. R. Kirsch, S. Zhao, X.-N. Chen, T. S. Furey, U.-J. Kim, W.-L. Kuo, M. Olivier, J. Conroy, A. Kasprzyk, H. Massa, R. Yonescu, S. Sait, C. Thoreen, A. Snijders, E. Lemyre, J. A. Bailey, A. Bruzel, W. D. Burrill, S. M. Clegg, S. Collins, P. Dhami, C. Friedman, C. S. Han, S. Herrick, J. Lee, A. H. Ligon, S. Lowry, M. Morley, S. Narasimhan, K. Osoegawa, Z. Peng, I. Plajzer-Frick, B. J. Quade, D. Scott, K. Sirotkin, A. A. Thorpe, J. W. Gray, J. Hudson, D. Pinkel, T. Ried, L. Rowen, G. L. Shen-Ong, R. L. Strausberg, E. Birney, D. F. Callen, J. F. Cheng, D. R. Cox, N. A. Doggett, N. P. Carter, E. E. Eichler, D. Haussler, J. R. Korenberg, C. C. Morton, D. Albertson, G. Schuler, P. J. de Jong, B. J. Trask, and BAC Resource Consortium, “Integration of cytogenetic landmarks into the draft sequence of the human genome,” Nature409(6822), 953–958 (2001).
[CrossRef] [PubMed]

Magenau, A.

D. M. Owen, D. J. Williamson, A. Magenau, and K. Gaus, “Sub-resolution lipid domains exist in the plasma membrane and regulate protein diffusion and distribution,” Nat Commun3, 1256 (2012).
[CrossRef] [PubMed]

Massa, H.

V. G. Cheung, N. Nowak, W. Jang, I. R. Kirsch, S. Zhao, X.-N. Chen, T. S. Furey, U.-J. Kim, W.-L. Kuo, M. Olivier, J. Conroy, A. Kasprzyk, H. Massa, R. Yonescu, S. Sait, C. Thoreen, A. Snijders, E. Lemyre, J. A. Bailey, A. Bruzel, W. D. Burrill, S. M. Clegg, S. Collins, P. Dhami, C. Friedman, C. S. Han, S. Herrick, J. Lee, A. H. Ligon, S. Lowry, M. Morley, S. Narasimhan, K. Osoegawa, Z. Peng, I. Plajzer-Frick, B. J. Quade, D. Scott, K. Sirotkin, A. A. Thorpe, J. W. Gray, J. Hudson, D. Pinkel, T. Ried, L. Rowen, G. L. Shen-Ong, R. L. Strausberg, E. Birney, D. F. Callen, J. F. Cheng, D. R. Cox, N. A. Doggett, N. P. Carter, E. E. Eichler, D. Haussler, J. R. Korenberg, C. C. Morton, D. Albertson, G. Schuler, P. J. de Jong, B. J. Trask, and BAC Resource Consortium, “Integration of cytogenetic landmarks into the draft sequence of the human genome,” Nature409(6822), 953–958 (2001).
[CrossRef] [PubMed]

Matsuoka, H.

H. Matsuoka, Y. Kosai, M. Saito, N. Takeyama, and H. Suto, “Single-cell viability assessment with a novel spectro-imaging system,” J. Biotechnol.94(3), 299–308 (2002).
[CrossRef] [PubMed]

Minta, A.

A. Minta, J. P. Kao, and R. Y. Tsien, “Fluorescent indicators for cytosolic calcium based on rhodamine and fluorescein chromophores,” J. Biol. Chem.264(14), 8171–8178 (1989).
[PubMed]

Morley, M.

V. G. Cheung, N. Nowak, W. Jang, I. R. Kirsch, S. Zhao, X.-N. Chen, T. S. Furey, U.-J. Kim, W.-L. Kuo, M. Olivier, J. Conroy, A. Kasprzyk, H. Massa, R. Yonescu, S. Sait, C. Thoreen, A. Snijders, E. Lemyre, J. A. Bailey, A. Bruzel, W. D. Burrill, S. M. Clegg, S. Collins, P. Dhami, C. Friedman, C. S. Han, S. Herrick, J. Lee, A. H. Ligon, S. Lowry, M. Morley, S. Narasimhan, K. Osoegawa, Z. Peng, I. Plajzer-Frick, B. J. Quade, D. Scott, K. Sirotkin, A. A. Thorpe, J. W. Gray, J. Hudson, D. Pinkel, T. Ried, L. Rowen, G. L. Shen-Ong, R. L. Strausberg, E. Birney, D. F. Callen, J. F. Cheng, D. R. Cox, N. A. Doggett, N. P. Carter, E. E. Eichler, D. Haussler, J. R. Korenberg, C. C. Morton, D. Albertson, G. Schuler, P. J. de Jong, B. J. Trask, and BAC Resource Consortium, “Integration of cytogenetic landmarks into the draft sequence of the human genome,” Nature409(6822), 953–958 (2001).
[CrossRef] [PubMed]

Morrissey, P.

D. A. Basiji, W. E. Ortyn, L. Liang, V. Venkatachalam, and P. Morrissey, “Cellular image analysis and imaging by flow cytometry,” Clin. Lab. Med.27(3), 653–670, viii (2007).
[CrossRef] [PubMed]

Morton, C. C.

V. G. Cheung, N. Nowak, W. Jang, I. R. Kirsch, S. Zhao, X.-N. Chen, T. S. Furey, U.-J. Kim, W.-L. Kuo, M. Olivier, J. Conroy, A. Kasprzyk, H. Massa, R. Yonescu, S. Sait, C. Thoreen, A. Snijders, E. Lemyre, J. A. Bailey, A. Bruzel, W. D. Burrill, S. M. Clegg, S. Collins, P. Dhami, C. Friedman, C. S. Han, S. Herrick, J. Lee, A. H. Ligon, S. Lowry, M. Morley, S. Narasimhan, K. Osoegawa, Z. Peng, I. Plajzer-Frick, B. J. Quade, D. Scott, K. Sirotkin, A. A. Thorpe, J. W. Gray, J. Hudson, D. Pinkel, T. Ried, L. Rowen, G. L. Shen-Ong, R. L. Strausberg, E. Birney, D. F. Callen, J. F. Cheng, D. R. Cox, N. A. Doggett, N. P. Carter, E. E. Eichler, D. Haussler, J. R. Korenberg, C. C. Morton, D. Albertson, G. Schuler, P. J. de Jong, B. J. Trask, and BAC Resource Consortium, “Integration of cytogenetic landmarks into the draft sequence of the human genome,” Nature409(6822), 953–958 (2001).
[CrossRef] [PubMed]

Narasimhan, S.

V. G. Cheung, N. Nowak, W. Jang, I. R. Kirsch, S. Zhao, X.-N. Chen, T. S. Furey, U.-J. Kim, W.-L. Kuo, M. Olivier, J. Conroy, A. Kasprzyk, H. Massa, R. Yonescu, S. Sait, C. Thoreen, A. Snijders, E. Lemyre, J. A. Bailey, A. Bruzel, W. D. Burrill, S. M. Clegg, S. Collins, P. Dhami, C. Friedman, C. S. Han, S. Herrick, J. Lee, A. H. Ligon, S. Lowry, M. Morley, S. Narasimhan, K. Osoegawa, Z. Peng, I. Plajzer-Frick, B. J. Quade, D. Scott, K. Sirotkin, A. A. Thorpe, J. W. Gray, J. Hudson, D. Pinkel, T. Ried, L. Rowen, G. L. Shen-Ong, R. L. Strausberg, E. Birney, D. F. Callen, J. F. Cheng, D. R. Cox, N. A. Doggett, N. P. Carter, E. E. Eichler, D. Haussler, J. R. Korenberg, C. C. Morton, D. Albertson, G. Schuler, P. J. de Jong, B. J. Trask, and BAC Resource Consortium, “Integration of cytogenetic landmarks into the draft sequence of the human genome,” Nature409(6822), 953–958 (2001).
[CrossRef] [PubMed]

Nowak, N.

V. G. Cheung, N. Nowak, W. Jang, I. R. Kirsch, S. Zhao, X.-N. Chen, T. S. Furey, U.-J. Kim, W.-L. Kuo, M. Olivier, J. Conroy, A. Kasprzyk, H. Massa, R. Yonescu, S. Sait, C. Thoreen, A. Snijders, E. Lemyre, J. A. Bailey, A. Bruzel, W. D. Burrill, S. M. Clegg, S. Collins, P. Dhami, C. Friedman, C. S. Han, S. Herrick, J. Lee, A. H. Ligon, S. Lowry, M. Morley, S. Narasimhan, K. Osoegawa, Z. Peng, I. Plajzer-Frick, B. J. Quade, D. Scott, K. Sirotkin, A. A. Thorpe, J. W. Gray, J. Hudson, D. Pinkel, T. Ried, L. Rowen, G. L. Shen-Ong, R. L. Strausberg, E. Birney, D. F. Callen, J. F. Cheng, D. R. Cox, N. A. Doggett, N. P. Carter, E. E. Eichler, D. Haussler, J. R. Korenberg, C. C. Morton, D. Albertson, G. Schuler, P. J. de Jong, B. J. Trask, and BAC Resource Consortium, “Integration of cytogenetic landmarks into the draft sequence of the human genome,” Nature409(6822), 953–958 (2001).
[CrossRef] [PubMed]

Olivier, M.

V. G. Cheung, N. Nowak, W. Jang, I. R. Kirsch, S. Zhao, X.-N. Chen, T. S. Furey, U.-J. Kim, W.-L. Kuo, M. Olivier, J. Conroy, A. Kasprzyk, H. Massa, R. Yonescu, S. Sait, C. Thoreen, A. Snijders, E. Lemyre, J. A. Bailey, A. Bruzel, W. D. Burrill, S. M. Clegg, S. Collins, P. Dhami, C. Friedman, C. S. Han, S. Herrick, J. Lee, A. H. Ligon, S. Lowry, M. Morley, S. Narasimhan, K. Osoegawa, Z. Peng, I. Plajzer-Frick, B. J. Quade, D. Scott, K. Sirotkin, A. A. Thorpe, J. W. Gray, J. Hudson, D. Pinkel, T. Ried, L. Rowen, G. L. Shen-Ong, R. L. Strausberg, E. Birney, D. F. Callen, J. F. Cheng, D. R. Cox, N. A. Doggett, N. P. Carter, E. E. Eichler, D. Haussler, J. R. Korenberg, C. C. Morton, D. Albertson, G. Schuler, P. J. de Jong, B. J. Trask, and BAC Resource Consortium, “Integration of cytogenetic landmarks into the draft sequence of the human genome,” Nature409(6822), 953–958 (2001).
[CrossRef] [PubMed]

Ortyn, W. E.

D. A. Basiji, W. E. Ortyn, L. Liang, V. Venkatachalam, and P. Morrissey, “Cellular image analysis and imaging by flow cytometry,” Clin. Lab. Med.27(3), 653–670, viii (2007).
[CrossRef] [PubMed]

Osoegawa, K.

V. G. Cheung, N. Nowak, W. Jang, I. R. Kirsch, S. Zhao, X.-N. Chen, T. S. Furey, U.-J. Kim, W.-L. Kuo, M. Olivier, J. Conroy, A. Kasprzyk, H. Massa, R. Yonescu, S. Sait, C. Thoreen, A. Snijders, E. Lemyre, J. A. Bailey, A. Bruzel, W. D. Burrill, S. M. Clegg, S. Collins, P. Dhami, C. Friedman, C. S. Han, S. Herrick, J. Lee, A. H. Ligon, S. Lowry, M. Morley, S. Narasimhan, K. Osoegawa, Z. Peng, I. Plajzer-Frick, B. J. Quade, D. Scott, K. Sirotkin, A. A. Thorpe, J. W. Gray, J. Hudson, D. Pinkel, T. Ried, L. Rowen, G. L. Shen-Ong, R. L. Strausberg, E. Birney, D. F. Callen, J. F. Cheng, D. R. Cox, N. A. Doggett, N. P. Carter, E. E. Eichler, D. Haussler, J. R. Korenberg, C. C. Morton, D. Albertson, G. Schuler, P. J. de Jong, B. J. Trask, and BAC Resource Consortium, “Integration of cytogenetic landmarks into the draft sequence of the human genome,” Nature409(6822), 953–958 (2001).
[CrossRef] [PubMed]

Owen, D. M.

D. M. Owen, D. J. Williamson, A. Magenau, and K. Gaus, “Sub-resolution lipid domains exist in the plasma membrane and regulate protein diffusion and distribution,” Nat Commun3, 1256 (2012).
[CrossRef] [PubMed]

Patsekin, V.

G. Grégori, V. Patsekin, B. Rajwa, J. Jones, K. Ragheb, C. Holdman, and J. P. Robinson, “Hyperspectral cytometry at the single-cell level using a 32-channel photodetector,” Cytometry A81(1), 35–44 (2012).
[CrossRef] [PubMed]

Patterson, G. H.

J. Lippincott-Schwartz and G. H. Patterson, “Development and use of fluorescent protein markers in living cells,” Science300(5616), 87–91 (2003).
[CrossRef] [PubMed]

Peng, Z.

V. G. Cheung, N. Nowak, W. Jang, I. R. Kirsch, S. Zhao, X.-N. Chen, T. S. Furey, U.-J. Kim, W.-L. Kuo, M. Olivier, J. Conroy, A. Kasprzyk, H. Massa, R. Yonescu, S. Sait, C. Thoreen, A. Snijders, E. Lemyre, J. A. Bailey, A. Bruzel, W. D. Burrill, S. M. Clegg, S. Collins, P. Dhami, C. Friedman, C. S. Han, S. Herrick, J. Lee, A. H. Ligon, S. Lowry, M. Morley, S. Narasimhan, K. Osoegawa, Z. Peng, I. Plajzer-Frick, B. J. Quade, D. Scott, K. Sirotkin, A. A. Thorpe, J. W. Gray, J. Hudson, D. Pinkel, T. Ried, L. Rowen, G. L. Shen-Ong, R. L. Strausberg, E. Birney, D. F. Callen, J. F. Cheng, D. R. Cox, N. A. Doggett, N. P. Carter, E. E. Eichler, D. Haussler, J. R. Korenberg, C. C. Morton, D. Albertson, G. Schuler, P. J. de Jong, B. J. Trask, and BAC Resource Consortium, “Integration of cytogenetic landmarks into the draft sequence of the human genome,” Nature409(6822), 953–958 (2001).
[CrossRef] [PubMed]

Perfetto, S. P.

S. P. Perfetto, P. K. Chattopadhyay, and M. Roederer, “Seventeen-colour flow cytometry: unravelling the immune system,” Nat. Rev. Immunol.4(8), 648–655 (2004).
[CrossRef] [PubMed]

Pinkel, D.

V. G. Cheung, N. Nowak, W. Jang, I. R. Kirsch, S. Zhao, X.-N. Chen, T. S. Furey, U.-J. Kim, W.-L. Kuo, M. Olivier, J. Conroy, A. Kasprzyk, H. Massa, R. Yonescu, S. Sait, C. Thoreen, A. Snijders, E. Lemyre, J. A. Bailey, A. Bruzel, W. D. Burrill, S. M. Clegg, S. Collins, P. Dhami, C. Friedman, C. S. Han, S. Herrick, J. Lee, A. H. Ligon, S. Lowry, M. Morley, S. Narasimhan, K. Osoegawa, Z. Peng, I. Plajzer-Frick, B. J. Quade, D. Scott, K. Sirotkin, A. A. Thorpe, J. W. Gray, J. Hudson, D. Pinkel, T. Ried, L. Rowen, G. L. Shen-Ong, R. L. Strausberg, E. Birney, D. F. Callen, J. F. Cheng, D. R. Cox, N. A. Doggett, N. P. Carter, E. E. Eichler, D. Haussler, J. R. Korenberg, C. C. Morton, D. Albertson, G. Schuler, P. J. de Jong, B. J. Trask, and BAC Resource Consortium, “Integration of cytogenetic landmarks into the draft sequence of the human genome,” Nature409(6822), 953–958 (2001).
[CrossRef] [PubMed]

Plajzer-Frick, I.

V. G. Cheung, N. Nowak, W. Jang, I. R. Kirsch, S. Zhao, X.-N. Chen, T. S. Furey, U.-J. Kim, W.-L. Kuo, M. Olivier, J. Conroy, A. Kasprzyk, H. Massa, R. Yonescu, S. Sait, C. Thoreen, A. Snijders, E. Lemyre, J. A. Bailey, A. Bruzel, W. D. Burrill, S. M. Clegg, S. Collins, P. Dhami, C. Friedman, C. S. Han, S. Herrick, J. Lee, A. H. Ligon, S. Lowry, M. Morley, S. Narasimhan, K. Osoegawa, Z. Peng, I. Plajzer-Frick, B. J. Quade, D. Scott, K. Sirotkin, A. A. Thorpe, J. W. Gray, J. Hudson, D. Pinkel, T. Ried, L. Rowen, G. L. Shen-Ong, R. L. Strausberg, E. Birney, D. F. Callen, J. F. Cheng, D. R. Cox, N. A. Doggett, N. P. Carter, E. E. Eichler, D. Haussler, J. R. Korenberg, C. C. Morton, D. Albertson, G. Schuler, P. J. de Jong, B. J. Trask, and BAC Resource Consortium, “Integration of cytogenetic landmarks into the draft sequence of the human genome,” Nature409(6822), 953–958 (2001).
[CrossRef] [PubMed]

Quade, B. J.

V. G. Cheung, N. Nowak, W. Jang, I. R. Kirsch, S. Zhao, X.-N. Chen, T. S. Furey, U.-J. Kim, W.-L. Kuo, M. Olivier, J. Conroy, A. Kasprzyk, H. Massa, R. Yonescu, S. Sait, C. Thoreen, A. Snijders, E. Lemyre, J. A. Bailey, A. Bruzel, W. D. Burrill, S. M. Clegg, S. Collins, P. Dhami, C. Friedman, C. S. Han, S. Herrick, J. Lee, A. H. Ligon, S. Lowry, M. Morley, S. Narasimhan, K. Osoegawa, Z. Peng, I. Plajzer-Frick, B. J. Quade, D. Scott, K. Sirotkin, A. A. Thorpe, J. W. Gray, J. Hudson, D. Pinkel, T. Ried, L. Rowen, G. L. Shen-Ong, R. L. Strausberg, E. Birney, D. F. Callen, J. F. Cheng, D. R. Cox, N. A. Doggett, N. P. Carter, E. E. Eichler, D. Haussler, J. R. Korenberg, C. C. Morton, D. Albertson, G. Schuler, P. J. de Jong, B. J. Trask, and BAC Resource Consortium, “Integration of cytogenetic landmarks into the draft sequence of the human genome,” Nature409(6822), 953–958 (2001).
[CrossRef] [PubMed]

Ragheb, K.

G. Grégori, V. Patsekin, B. Rajwa, J. Jones, K. Ragheb, C. Holdman, and J. P. Robinson, “Hyperspectral cytometry at the single-cell level using a 32-channel photodetector,” Cytometry A81(1), 35–44 (2012).
[CrossRef] [PubMed]

Rajwa, B.

G. Grégori, V. Patsekin, B. Rajwa, J. Jones, K. Ragheb, C. Holdman, and J. P. Robinson, “Hyperspectral cytometry at the single-cell level using a 32-channel photodetector,” Cytometry A81(1), 35–44 (2012).
[CrossRef] [PubMed]

Ried, T.

V. G. Cheung, N. Nowak, W. Jang, I. R. Kirsch, S. Zhao, X.-N. Chen, T. S. Furey, U.-J. Kim, W.-L. Kuo, M. Olivier, J. Conroy, A. Kasprzyk, H. Massa, R. Yonescu, S. Sait, C. Thoreen, A. Snijders, E. Lemyre, J. A. Bailey, A. Bruzel, W. D. Burrill, S. M. Clegg, S. Collins, P. Dhami, C. Friedman, C. S. Han, S. Herrick, J. Lee, A. H. Ligon, S. Lowry, M. Morley, S. Narasimhan, K. Osoegawa, Z. Peng, I. Plajzer-Frick, B. J. Quade, D. Scott, K. Sirotkin, A. A. Thorpe, J. W. Gray, J. Hudson, D. Pinkel, T. Ried, L. Rowen, G. L. Shen-Ong, R. L. Strausberg, E. Birney, D. F. Callen, J. F. Cheng, D. R. Cox, N. A. Doggett, N. P. Carter, E. E. Eichler, D. Haussler, J. R. Korenberg, C. C. Morton, D. Albertson, G. Schuler, P. J. de Jong, B. J. Trask, and BAC Resource Consortium, “Integration of cytogenetic landmarks into the draft sequence of the human genome,” Nature409(6822), 953–958 (2001).
[CrossRef] [PubMed]

Robinson, J. P.

G. Grégori, V. Patsekin, B. Rajwa, J. Jones, K. Ragheb, C. Holdman, and J. P. Robinson, “Hyperspectral cytometry at the single-cell level using a 32-channel photodetector,” Cytometry A81(1), 35–44 (2012).
[CrossRef] [PubMed]

Roederer, M.

S. P. Perfetto, P. K. Chattopadhyay, and M. Roederer, “Seventeen-colour flow cytometry: unravelling the immune system,” Nat. Rev. Immunol.4(8), 648–655 (2004).
[CrossRef] [PubMed]

Rowen, L.

V. G. Cheung, N. Nowak, W. Jang, I. R. Kirsch, S. Zhao, X.-N. Chen, T. S. Furey, U.-J. Kim, W.-L. Kuo, M. Olivier, J. Conroy, A. Kasprzyk, H. Massa, R. Yonescu, S. Sait, C. Thoreen, A. Snijders, E. Lemyre, J. A. Bailey, A. Bruzel, W. D. Burrill, S. M. Clegg, S. Collins, P. Dhami, C. Friedman, C. S. Han, S. Herrick, J. Lee, A. H. Ligon, S. Lowry, M. Morley, S. Narasimhan, K. Osoegawa, Z. Peng, I. Plajzer-Frick, B. J. Quade, D. Scott, K. Sirotkin, A. A. Thorpe, J. W. Gray, J. Hudson, D. Pinkel, T. Ried, L. Rowen, G. L. Shen-Ong, R. L. Strausberg, E. Birney, D. F. Callen, J. F. Cheng, D. R. Cox, N. A. Doggett, N. P. Carter, E. E. Eichler, D. Haussler, J. R. Korenberg, C. C. Morton, D. Albertson, G. Schuler, P. J. de Jong, B. J. Trask, and BAC Resource Consortium, “Integration of cytogenetic landmarks into the draft sequence of the human genome,” Nature409(6822), 953–958 (2001).
[CrossRef] [PubMed]

Sait, S.

V. G. Cheung, N. Nowak, W. Jang, I. R. Kirsch, S. Zhao, X.-N. Chen, T. S. Furey, U.-J. Kim, W.-L. Kuo, M. Olivier, J. Conroy, A. Kasprzyk, H. Massa, R. Yonescu, S. Sait, C. Thoreen, A. Snijders, E. Lemyre, J. A. Bailey, A. Bruzel, W. D. Burrill, S. M. Clegg, S. Collins, P. Dhami, C. Friedman, C. S. Han, S. Herrick, J. Lee, A. H. Ligon, S. Lowry, M. Morley, S. Narasimhan, K. Osoegawa, Z. Peng, I. Plajzer-Frick, B. J. Quade, D. Scott, K. Sirotkin, A. A. Thorpe, J. W. Gray, J. Hudson, D. Pinkel, T. Ried, L. Rowen, G. L. Shen-Ong, R. L. Strausberg, E. Birney, D. F. Callen, J. F. Cheng, D. R. Cox, N. A. Doggett, N. P. Carter, E. E. Eichler, D. Haussler, J. R. Korenberg, C. C. Morton, D. Albertson, G. Schuler, P. J. de Jong, B. J. Trask, and BAC Resource Consortium, “Integration of cytogenetic landmarks into the draft sequence of the human genome,” Nature409(6822), 953–958 (2001).
[CrossRef] [PubMed]

Saito, M.

H. Matsuoka, Y. Kosai, M. Saito, N. Takeyama, and H. Suto, “Single-cell viability assessment with a novel spectro-imaging system,” J. Biotechnol.94(3), 299–308 (2002).
[CrossRef] [PubMed]

Schaak, D.

E. Schonbrun, S. S. Gorthi, and D. Schaak, “Microfabricated multiple field of view imaging flow cytometry,” Lab Chip12(2), 268–273 (2011).
[CrossRef] [PubMed]

Schmidt, O.

O. Schmidt, M. Bassler, P. Kiesel, C. Knollenberg, and N. Johnson, “Fluorescence spectrometer-on-a-fluidic-chip,” Lab Chip7(5), 626–629 (2007).
[CrossRef] [PubMed]

Schonbrun, E.

S. S. Gorthi and E. Schonbrun, “Phase imaging flow cytometry using a focus-stack collecting microscope,” Opt. Lett.37(4), 707–709 (2012).
[CrossRef] [PubMed]

E. Schonbrun, S. S. Gorthi, and D. Schaak, “Microfabricated multiple field of view imaging flow cytometry,” Lab Chip12(2), 268–273 (2011).
[CrossRef] [PubMed]

Schuler, G.

V. G. Cheung, N. Nowak, W. Jang, I. R. Kirsch, S. Zhao, X.-N. Chen, T. S. Furey, U.-J. Kim, W.-L. Kuo, M. Olivier, J. Conroy, A. Kasprzyk, H. Massa, R. Yonescu, S. Sait, C. Thoreen, A. Snijders, E. Lemyre, J. A. Bailey, A. Bruzel, W. D. Burrill, S. M. Clegg, S. Collins, P. Dhami, C. Friedman, C. S. Han, S. Herrick, J. Lee, A. H. Ligon, S. Lowry, M. Morley, S. Narasimhan, K. Osoegawa, Z. Peng, I. Plajzer-Frick, B. J. Quade, D. Scott, K. Sirotkin, A. A. Thorpe, J. W. Gray, J. Hudson, D. Pinkel, T. Ried, L. Rowen, G. L. Shen-Ong, R. L. Strausberg, E. Birney, D. F. Callen, J. F. Cheng, D. R. Cox, N. A. Doggett, N. P. Carter, E. E. Eichler, D. Haussler, J. R. Korenberg, C. C. Morton, D. Albertson, G. Schuler, P. J. de Jong, B. J. Trask, and BAC Resource Consortium, “Integration of cytogenetic landmarks into the draft sequence of the human genome,” Nature409(6822), 953–958 (2001).
[CrossRef] [PubMed]

Scott, D.

V. G. Cheung, N. Nowak, W. Jang, I. R. Kirsch, S. Zhao, X.-N. Chen, T. S. Furey, U.-J. Kim, W.-L. Kuo, M. Olivier, J. Conroy, A. Kasprzyk, H. Massa, R. Yonescu, S. Sait, C. Thoreen, A. Snijders, E. Lemyre, J. A. Bailey, A. Bruzel, W. D. Burrill, S. M. Clegg, S. Collins, P. Dhami, C. Friedman, C. S. Han, S. Herrick, J. Lee, A. H. Ligon, S. Lowry, M. Morley, S. Narasimhan, K. Osoegawa, Z. Peng, I. Plajzer-Frick, B. J. Quade, D. Scott, K. Sirotkin, A. A. Thorpe, J. W. Gray, J. Hudson, D. Pinkel, T. Ried, L. Rowen, G. L. Shen-Ong, R. L. Strausberg, E. Birney, D. F. Callen, J. F. Cheng, D. R. Cox, N. A. Doggett, N. P. Carter, E. E. Eichler, D. Haussler, J. R. Korenberg, C. C. Morton, D. Albertson, G. Schuler, P. J. de Jong, B. J. Trask, and BAC Resource Consortium, “Integration of cytogenetic landmarks into the draft sequence of the human genome,” Nature409(6822), 953–958 (2001).
[CrossRef] [PubMed]

Shen-Ong, G. L.

V. G. Cheung, N. Nowak, W. Jang, I. R. Kirsch, S. Zhao, X.-N. Chen, T. S. Furey, U.-J. Kim, W.-L. Kuo, M. Olivier, J. Conroy, A. Kasprzyk, H. Massa, R. Yonescu, S. Sait, C. Thoreen, A. Snijders, E. Lemyre, J. A. Bailey, A. Bruzel, W. D. Burrill, S. M. Clegg, S. Collins, P. Dhami, C. Friedman, C. S. Han, S. Herrick, J. Lee, A. H. Ligon, S. Lowry, M. Morley, S. Narasimhan, K. Osoegawa, Z. Peng, I. Plajzer-Frick, B. J. Quade, D. Scott, K. Sirotkin, A. A. Thorpe, J. W. Gray, J. Hudson, D. Pinkel, T. Ried, L. Rowen, G. L. Shen-Ong, R. L. Strausberg, E. Birney, D. F. Callen, J. F. Cheng, D. R. Cox, N. A. Doggett, N. P. Carter, E. E. Eichler, D. Haussler, J. R. Korenberg, C. C. Morton, D. Albertson, G. Schuler, P. J. de Jong, B. J. Trask, and BAC Resource Consortium, “Integration of cytogenetic landmarks into the draft sequence of the human genome,” Nature409(6822), 953–958 (2001).
[CrossRef] [PubMed]

Sinclair, M. B.

Sirotkin, K.

V. G. Cheung, N. Nowak, W. Jang, I. R. Kirsch, S. Zhao, X.-N. Chen, T. S. Furey, U.-J. Kim, W.-L. Kuo, M. Olivier, J. Conroy, A. Kasprzyk, H. Massa, R. Yonescu, S. Sait, C. Thoreen, A. Snijders, E. Lemyre, J. A. Bailey, A. Bruzel, W. D. Burrill, S. M. Clegg, S. Collins, P. Dhami, C. Friedman, C. S. Han, S. Herrick, J. Lee, A. H. Ligon, S. Lowry, M. Morley, S. Narasimhan, K. Osoegawa, Z. Peng, I. Plajzer-Frick, B. J. Quade, D. Scott, K. Sirotkin, A. A. Thorpe, J. W. Gray, J. Hudson, D. Pinkel, T. Ried, L. Rowen, G. L. Shen-Ong, R. L. Strausberg, E. Birney, D. F. Callen, J. F. Cheng, D. R. Cox, N. A. Doggett, N. P. Carter, E. E. Eichler, D. Haussler, J. R. Korenberg, C. C. Morton, D. Albertson, G. Schuler, P. J. de Jong, B. J. Trask, and BAC Resource Consortium, “Integration of cytogenetic landmarks into the draft sequence of the human genome,” Nature409(6822), 953–958 (2001).
[CrossRef] [PubMed]

Snijders, A.

V. G. Cheung, N. Nowak, W. Jang, I. R. Kirsch, S. Zhao, X.-N. Chen, T. S. Furey, U.-J. Kim, W.-L. Kuo, M. Olivier, J. Conroy, A. Kasprzyk, H. Massa, R. Yonescu, S. Sait, C. Thoreen, A. Snijders, E. Lemyre, J. A. Bailey, A. Bruzel, W. D. Burrill, S. M. Clegg, S. Collins, P. Dhami, C. Friedman, C. S. Han, S. Herrick, J. Lee, A. H. Ligon, S. Lowry, M. Morley, S. Narasimhan, K. Osoegawa, Z. Peng, I. Plajzer-Frick, B. J. Quade, D. Scott, K. Sirotkin, A. A. Thorpe, J. W. Gray, J. Hudson, D. Pinkel, T. Ried, L. Rowen, G. L. Shen-Ong, R. L. Strausberg, E. Birney, D. F. Callen, J. F. Cheng, D. R. Cox, N. A. Doggett, N. P. Carter, E. E. Eichler, D. Haussler, J. R. Korenberg, C. C. Morton, D. Albertson, G. Schuler, P. J. de Jong, B. J. Trask, and BAC Resource Consortium, “Integration of cytogenetic landmarks into the draft sequence of the human genome,” Nature409(6822), 953–958 (2001).
[CrossRef] [PubMed]

Stephens, D. J.

D. J. Stephens and V. J. Allan, “Light microscopy techniques for live cell imaging,” Science300(5616), 82–86 (2003).
[CrossRef] [PubMed]

Strausberg, R. L.

V. G. Cheung, N. Nowak, W. Jang, I. R. Kirsch, S. Zhao, X.-N. Chen, T. S. Furey, U.-J. Kim, W.-L. Kuo, M. Olivier, J. Conroy, A. Kasprzyk, H. Massa, R. Yonescu, S. Sait, C. Thoreen, A. Snijders, E. Lemyre, J. A. Bailey, A. Bruzel, W. D. Burrill, S. M. Clegg, S. Collins, P. Dhami, C. Friedman, C. S. Han, S. Herrick, J. Lee, A. H. Ligon, S. Lowry, M. Morley, S. Narasimhan, K. Osoegawa, Z. Peng, I. Plajzer-Frick, B. J. Quade, D. Scott, K. Sirotkin, A. A. Thorpe, J. W. Gray, J. Hudson, D. Pinkel, T. Ried, L. Rowen, G. L. Shen-Ong, R. L. Strausberg, E. Birney, D. F. Callen, J. F. Cheng, D. R. Cox, N. A. Doggett, N. P. Carter, E. E. Eichler, D. Haussler, J. R. Korenberg, C. C. Morton, D. Albertson, G. Schuler, P. J. de Jong, B. J. Trask, and BAC Resource Consortium, “Integration of cytogenetic landmarks into the draft sequence of the human genome,” Nature409(6822), 953–958 (2001).
[CrossRef] [PubMed]

Suto, H.

H. Matsuoka, Y. Kosai, M. Saito, N. Takeyama, and H. Suto, “Single-cell viability assessment with a novel spectro-imaging system,” J. Biotechnol.94(3), 299–308 (2002).
[CrossRef] [PubMed]

Takeyama, N.

H. Matsuoka, Y. Kosai, M. Saito, N. Takeyama, and H. Suto, “Single-cell viability assessment with a novel spectro-imaging system,” J. Biotechnol.94(3), 299–308 (2002).
[CrossRef] [PubMed]

Thoreen, C.

V. G. Cheung, N. Nowak, W. Jang, I. R. Kirsch, S. Zhao, X.-N. Chen, T. S. Furey, U.-J. Kim, W.-L. Kuo, M. Olivier, J. Conroy, A. Kasprzyk, H. Massa, R. Yonescu, S. Sait, C. Thoreen, A. Snijders, E. Lemyre, J. A. Bailey, A. Bruzel, W. D. Burrill, S. M. Clegg, S. Collins, P. Dhami, C. Friedman, C. S. Han, S. Herrick, J. Lee, A. H. Ligon, S. Lowry, M. Morley, S. Narasimhan, K. Osoegawa, Z. Peng, I. Plajzer-Frick, B. J. Quade, D. Scott, K. Sirotkin, A. A. Thorpe, J. W. Gray, J. Hudson, D. Pinkel, T. Ried, L. Rowen, G. L. Shen-Ong, R. L. Strausberg, E. Birney, D. F. Callen, J. F. Cheng, D. R. Cox, N. A. Doggett, N. P. Carter, E. E. Eichler, D. Haussler, J. R. Korenberg, C. C. Morton, D. Albertson, G. Schuler, P. J. de Jong, B. J. Trask, and BAC Resource Consortium, “Integration of cytogenetic landmarks into the draft sequence of the human genome,” Nature409(6822), 953–958 (2001).
[CrossRef] [PubMed]

Thorpe, A. A.

V. G. Cheung, N. Nowak, W. Jang, I. R. Kirsch, S. Zhao, X.-N. Chen, T. S. Furey, U.-J. Kim, W.-L. Kuo, M. Olivier, J. Conroy, A. Kasprzyk, H. Massa, R. Yonescu, S. Sait, C. Thoreen, A. Snijders, E. Lemyre, J. A. Bailey, A. Bruzel, W. D. Burrill, S. M. Clegg, S. Collins, P. Dhami, C. Friedman, C. S. Han, S. Herrick, J. Lee, A. H. Ligon, S. Lowry, M. Morley, S. Narasimhan, K. Osoegawa, Z. Peng, I. Plajzer-Frick, B. J. Quade, D. Scott, K. Sirotkin, A. A. Thorpe, J. W. Gray, J. Hudson, D. Pinkel, T. Ried, L. Rowen, G. L. Shen-Ong, R. L. Strausberg, E. Birney, D. F. Callen, J. F. Cheng, D. R. Cox, N. A. Doggett, N. P. Carter, E. E. Eichler, D. Haussler, J. R. Korenberg, C. C. Morton, D. Albertson, G. Schuler, P. J. de Jong, B. J. Trask, and BAC Resource Consortium, “Integration of cytogenetic landmarks into the draft sequence of the human genome,” Nature409(6822), 953–958 (2001).
[CrossRef] [PubMed]

Timlin, J. A.

Tkaczyk, T. S.

Trask, B. J.

V. G. Cheung, N. Nowak, W. Jang, I. R. Kirsch, S. Zhao, X.-N. Chen, T. S. Furey, U.-J. Kim, W.-L. Kuo, M. Olivier, J. Conroy, A. Kasprzyk, H. Massa, R. Yonescu, S. Sait, C. Thoreen, A. Snijders, E. Lemyre, J. A. Bailey, A. Bruzel, W. D. Burrill, S. M. Clegg, S. Collins, P. Dhami, C. Friedman, C. S. Han, S. Herrick, J. Lee, A. H. Ligon, S. Lowry, M. Morley, S. Narasimhan, K. Osoegawa, Z. Peng, I. Plajzer-Frick, B. J. Quade, D. Scott, K. Sirotkin, A. A. Thorpe, J. W. Gray, J. Hudson, D. Pinkel, T. Ried, L. Rowen, G. L. Shen-Ong, R. L. Strausberg, E. Birney, D. F. Callen, J. F. Cheng, D. R. Cox, N. A. Doggett, N. P. Carter, E. E. Eichler, D. Haussler, J. R. Korenberg, C. C. Morton, D. Albertson, G. Schuler, P. J. de Jong, B. J. Trask, and BAC Resource Consortium, “Integration of cytogenetic landmarks into the draft sequence of the human genome,” Nature409(6822), 953–958 (2001).
[CrossRef] [PubMed]

Tsien, R. Y.

A. Minta, J. P. Kao, and R. Y. Tsien, “Fluorescent indicators for cytosolic calcium based on rhodamine and fluorescein chromophores,” J. Biol. Chem.264(14), 8171–8178 (1989).
[PubMed]

Venkatachalam, V.

D. A. Basiji, W. E. Ortyn, L. Liang, V. Venkatachalam, and P. Morrissey, “Cellular image analysis and imaging by flow cytometry,” Clin. Lab. Med.27(3), 653–670, viii (2007).
[CrossRef] [PubMed]

Verkman, A. S.

M. Kneen, J. Farinas, Y. Li, and A. S. Verkman, “Green fluorescent protein as a noninvasive intracellular pH indicator,” Biophys. J.74(3), 1591–1599 (1998).
[CrossRef] [PubMed]

Williamson, D. J.

D. M. Owen, D. J. Williamson, A. Magenau, and K. Gaus, “Sub-resolution lipid domains exist in the plasma membrane and regulate protein diffusion and distribution,” Nat Commun3, 1256 (2012).
[CrossRef] [PubMed]

Woltman, S. J.

S. J. Woltman, G. D. Jay, and G. P. Crawford, “Liquid-crystal materials find a new order in biomedical applications,” Nat. Mater.6(12), 929–938 (2007).
[CrossRef] [PubMed]

Yamamoto, A.

T. Haraguchi, D. Q. Ding, A. Yamamoto, T. Kaneda, T. Koujin, and Y. Hiraoka, “Multiple-color fluorescence imaging of chromosomes and microtubules in living cells,” Cell Struct. Funct.24(5), 291–298 (1999).
[CrossRef] [PubMed]

Yonescu, R.

V. G. Cheung, N. Nowak, W. Jang, I. R. Kirsch, S. Zhao, X.-N. Chen, T. S. Furey, U.-J. Kim, W.-L. Kuo, M. Olivier, J. Conroy, A. Kasprzyk, H. Massa, R. Yonescu, S. Sait, C. Thoreen, A. Snijders, E. Lemyre, J. A. Bailey, A. Bruzel, W. D. Burrill, S. M. Clegg, S. Collins, P. Dhami, C. Friedman, C. S. Han, S. Herrick, J. Lee, A. H. Ligon, S. Lowry, M. Morley, S. Narasimhan, K. Osoegawa, Z. Peng, I. Plajzer-Frick, B. J. Quade, D. Scott, K. Sirotkin, A. A. Thorpe, J. W. Gray, J. Hudson, D. Pinkel, T. Ried, L. Rowen, G. L. Shen-Ong, R. L. Strausberg, E. Birney, D. F. Callen, J. F. Cheng, D. R. Cox, N. A. Doggett, N. P. Carter, E. E. Eichler, D. Haussler, J. R. Korenberg, C. C. Morton, D. Albertson, G. Schuler, P. J. de Jong, B. J. Trask, and BAC Resource Consortium, “Integration of cytogenetic landmarks into the draft sequence of the human genome,” Nature409(6822), 953–958 (2001).
[CrossRef] [PubMed]

Zhao, S.

V. G. Cheung, N. Nowak, W. Jang, I. R. Kirsch, S. Zhao, X.-N. Chen, T. S. Furey, U.-J. Kim, W.-L. Kuo, M. Olivier, J. Conroy, A. Kasprzyk, H. Massa, R. Yonescu, S. Sait, C. Thoreen, A. Snijders, E. Lemyre, J. A. Bailey, A. Bruzel, W. D. Burrill, S. M. Clegg, S. Collins, P. Dhami, C. Friedman, C. S. Han, S. Herrick, J. Lee, A. H. Ligon, S. Lowry, M. Morley, S. Narasimhan, K. Osoegawa, Z. Peng, I. Plajzer-Frick, B. J. Quade, D. Scott, K. Sirotkin, A. A. Thorpe, J. W. Gray, J. Hudson, D. Pinkel, T. Ried, L. Rowen, G. L. Shen-Ong, R. L. Strausberg, E. Birney, D. F. Callen, J. F. Cheng, D. R. Cox, N. A. Doggett, N. P. Carter, E. E. Eichler, D. Haussler, J. R. Korenberg, C. C. Morton, D. Albertson, G. Schuler, P. J. de Jong, B. J. Trask, and BAC Resource Consortium, “Integration of cytogenetic landmarks into the draft sequence of the human genome,” Nature409(6822), 953–958 (2001).
[CrossRef] [PubMed]

Zimmermann, T.

T. Zimmermann, “Spectral imaging and linear unmixing in light microscopy,” Adv. Biochem. Eng. Biotechnol.95, 245–265 (2005).
[CrossRef] [PubMed]

Adv. Biochem. Eng. Biotechnol.

T. Zimmermann, “Spectral imaging and linear unmixing in light microscopy,” Adv. Biochem. Eng. Biotechnol.95, 245–265 (2005).
[CrossRef] [PubMed]

Appl. Opt.

Biophys. J.

M. Kneen, J. Farinas, Y. Li, and A. S. Verkman, “Green fluorescent protein as a noninvasive intracellular pH indicator,” Biophys. J.74(3), 1591–1599 (1998).
[CrossRef] [PubMed]

Cell Struct. Funct.

T. Haraguchi, D. Q. Ding, A. Yamamoto, T. Kaneda, T. Koujin, and Y. Hiraoka, “Multiple-color fluorescence imaging of chromosomes and microtubules in living cells,” Cell Struct. Funct.24(5), 291–298 (1999).
[CrossRef] [PubMed]

Clin. Lab. Med.

D. A. Basiji, W. E. Ortyn, L. Liang, V. Venkatachalam, and P. Morrissey, “Cellular image analysis and imaging by flow cytometry,” Clin. Lab. Med.27(3), 653–670, viii (2007).
[CrossRef] [PubMed]

Cytometry A

G. Grégori, V. Patsekin, B. Rajwa, J. Jones, K. Ragheb, C. Holdman, and J. P. Robinson, “Hyperspectral cytometry at the single-cell level using a 32-channel photodetector,” Cytometry A81(1), 35–44 (2012).
[CrossRef] [PubMed]

R. M. Levenson, “Spectral imaging perspective on cytomics,” Cytometry A69(7), 592–600 (2006).
[CrossRef] [PubMed]

J. Biol. Chem.

A. Minta, J. P. Kao, and R. Y. Tsien, “Fluorescent indicators for cytosolic calcium based on rhodamine and fluorescein chromophores,” J. Biol. Chem.264(14), 8171–8178 (1989).
[PubMed]

J. Biotechnol.

H. Matsuoka, Y. Kosai, M. Saito, N. Takeyama, and H. Suto, “Single-cell viability assessment with a novel spectro-imaging system,” J. Biotechnol.94(3), 299–308 (2002).
[CrossRef] [PubMed]

Lab Chip

O. Schmidt, M. Bassler, P. Kiesel, C. Knollenberg, and N. Johnson, “Fluorescence spectrometer-on-a-fluidic-chip,” Lab Chip7(5), 626–629 (2007).
[CrossRef] [PubMed]

E. Schonbrun, S. S. Gorthi, and D. Schaak, “Microfabricated multiple field of view imaging flow cytometry,” Lab Chip12(2), 268–273 (2011).
[CrossRef] [PubMed]

Nat Commun

D. M. Owen, D. J. Williamson, A. Magenau, and K. Gaus, “Sub-resolution lipid domains exist in the plasma membrane and regulate protein diffusion and distribution,” Nat Commun3, 1256 (2012).
[CrossRef] [PubMed]

Nat. Mater.

S. J. Woltman, G. D. Jay, and G. P. Crawford, “Liquid-crystal materials find a new order in biomedical applications,” Nat. Mater.6(12), 929–938 (2007).
[CrossRef] [PubMed]

Nat. Rev. Immunol.

S. P. Perfetto, P. K. Chattopadhyay, and M. Roederer, “Seventeen-colour flow cytometry: unravelling the immune system,” Nat. Rev. Immunol.4(8), 648–655 (2004).
[CrossRef] [PubMed]

Nature

V. G. Cheung, N. Nowak, W. Jang, I. R. Kirsch, S. Zhao, X.-N. Chen, T. S. Furey, U.-J. Kim, W.-L. Kuo, M. Olivier, J. Conroy, A. Kasprzyk, H. Massa, R. Yonescu, S. Sait, C. Thoreen, A. Snijders, E. Lemyre, J. A. Bailey, A. Bruzel, W. D. Burrill, S. M. Clegg, S. Collins, P. Dhami, C. Friedman, C. S. Han, S. Herrick, J. Lee, A. H. Ligon, S. Lowry, M. Morley, S. Narasimhan, K. Osoegawa, Z. Peng, I. Plajzer-Frick, B. J. Quade, D. Scott, K. Sirotkin, A. A. Thorpe, J. W. Gray, J. Hudson, D. Pinkel, T. Ried, L. Rowen, G. L. Shen-Ong, R. L. Strausberg, E. Birney, D. F. Callen, J. F. Cheng, D. R. Cox, N. A. Doggett, N. P. Carter, E. E. Eichler, D. Haussler, J. R. Korenberg, C. C. Morton, D. Albertson, G. Schuler, P. J. de Jong, B. J. Trask, and BAC Resource Consortium, “Integration of cytogenetic landmarks into the draft sequence of the human genome,” Nature409(6822), 953–958 (2001).
[CrossRef] [PubMed]

Opt. Express

Opt. Lett.

Science

J. Lippincott-Schwartz and G. H. Patterson, “Development and use of fluorescent protein markers in living cells,” Science300(5616), 87–91 (2003).
[CrossRef] [PubMed]

D. J. Stephens and V. J. Allan, “Light microscopy techniques for live cell imaging,” Science300(5616), 82–86 (2003).
[CrossRef] [PubMed]

Other

Item LVF-HL, Ocean Optics, Catalogue of Products.

FluoroSpheres, Carboxylate-modified microsphere, Invitrogen.

Sigma Aldrich, Catalogue of Products.

Nucleic Acid Cell Stains, Invitrogen.

Supplementary Material (1)

» Media 1: MP4 (5046 KB)     

Cited By

OSA participates in CrossRef's Cited-By Linking service. Citing articles from OSA journals and other participating publishers are listed here.

Alert me when this article is cited.


Figures (6)

Fig. 1
Fig. 1

Experimental setup. A laser beam (LB) induces fluorescence in a cell flowing through the channel (MC) and is then blocked by the notch filter (NF). Fluorescence is filtered by the LVF and is then imaged onto the camera (CMOS) through a macro photography lens (MaL). The LED light, collimated by a condenser and an iris (C and I), is transmitted by a portion of the LVF and provides a bright field image of the cell. L1 and L2 form a telescopic system and MiO is a microscope objective followed by the tube lens TL.

Fig. 2
Fig. 2

Optical calibration. a) Fluorescence emission from a solution of fluorescein in water. Scale bar is 40 µm. b) Light from two different LEDs (505 nm and 590 nm) spatially separated by the LVF.

Fig. 3
Fig. 3

Hyperspectral imaging of fluorescent beads. a) Hyperspectral image set of the fluorescence emission from three types of beads. The false colors fit the corresponding wavelengths. Scale bar is 2 µm. b) Fluorescence intensity for the three types of beads as a function of the emitted wavelength. In the inserts, the plots relative to beads B2 and B3 are shown, where a different scale for the fluorescence intensity has been used. The black line refers to the spectrum for the beads B2 acquired with a spectrometer.

Fig. 4
Fig. 4

Scatter plot of the fluorescence peak intensity. The peak fluorescence intensity is plotted as a function of the peak wavelength for beads emitting at three different wavelengths. The intensity axis is on a log scale.

Fig. 5
Fig. 5

Organelle fluorescence spectroscopy. a) Bright field and six fluorescence images of GFP labeled peroxisomes inside K562 cells. The false colors fit the corresponding wavelengths. b) The fluorescence intensities of the three indicated organelles are plotted. Scale bars are 10 µm.

Fig. 6
Fig. 6

Multi-color fluorescence hyperspectral imaging. a) Bright field and fluorescence images at 510 and 560 nm of three HL60 cells. The false colors fit the corresponding wavelengths. Scale bars are 6 µm. b) Emitted spectra for the three cells shown in a). c) Spectra relative to the two indicated regions (Frame from Media 1).

Metrics